高中生物 实验八动物组织和细胞中核酸的提取和测定
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实验九动物组织和细胞中核酸的提取和测定
第一部分动物组织和细胞中DNA和RNA的提取
【实验目的】
学习从组织和细胞中提取DNA和RNA的方法
【实验原理】
1.从动物组织和细胞中提取DNA
DNA存在于细胞核中。提取DNA的方法首先需要温和裂解细胞及溶解DNA的技术,接着需采用化学和酶学方法,除去杂蛋白、RNA及其他的大分子。本实验在EDTA(螯合二价阳离子以抑制Dnase)存在的情况下,用蛋白酶K消化真核细胞和组织,用去垢剂(如SDS,十二烷基磺酸钠)溶解细胞膜并使蛋白质变性。核酸通过有机溶剂抽提得以纯化,污染的RNA通过RNase消化清除。这个方法可产生十微克至数百微克的DNA,适用于标准琼脂糖凝胶上的Southern分析,可用作PCR 反应的模板,以及用于构建基因组DNA文库。
2.从动物组织和细胞中提取RNA
RNA存在于细胞质及核中,是一种极易降解的核酸分子。为了快速从细胞中分离完整的RNA,许多方法都用到了高浓度的强变性剂硫氰酸胍使细胞破裂。高浓度的硫氰酸胍还使细胞内的各种RNA酶失活,使释放出的RNA不被降解。细胞裂解后存在于裂解溶液内的有RNA,核DNA,蛋白质和细胞残片,通过酚,氯仿等有机溶剂处理,离心,使RNA最终与其它细胞组分分离开来。
【实验材料】
1.实验器材
研钵和研棒,匀浆机,橡胶刮棒,低温冷冻离心机,恒温水浴,宽口移液管,锤子,塑料袋,涡旋。
2.实验试剂
(1)裂解缓冲液:10mmol/L Tris-Cl (PH8.0),0.1mol/L EDTA (PH8.0),0.5%(m/V) SDS,20µg/mg无Dnase的胰RNase,裂解缓冲液的前三种成分可预先混合并于室温保存。RNase在用前适量加入。(2)溶液D(变性液):4 mol/L 硫氰酸胍,25mmol/L 柠檬酸钠. 2H20,0.5%(m/V)月桂基肌酸钠,0.1mol/L β-巯基乙醇,将250g硫氰酸胍、0.75mol/L(PH7.0)柠檬酸钠17.6ml和26.4ml10%(m/V )月桂基肌酸钠溶于293 ml水中.加入搅拌子于磁力搅拌器上65℃混匀,直至完全溶解。室温贮存溶液D,每次使用前加入14.4 mol/L的β-巯基乙醇,每50ml溶液D加0.36ml。溶液D可在室温下避光保存数月。
(3)平衡酚:用0.5mol/L Tris-Cl (PH8.0)平衡的苯酚
(4)TBS:在800 ml蒸馏水中溶解8gNaCl、0.2gKCl和3gTris碱、加入0.015g酚红并用HCl调节溶液的PH值至7.4,加水定容至1L,分装后在15 lbf/in2(1.034×105Pa)高压下蒸汽灭菌20分钟。保存于室温。
(5)PBS:在800 ml蒸馏水中溶解8gNaCl、0.2gKCl、1.44gNa2HPO4和0.24gKH2PO4, 用HCl调节溶液的PH值至7.4, 加水定容至1L, 在15 lbf/in2(1.034×105Pa)高压下蒸汽灭菌20分钟。保存于室温。
(6)TE(PH8.0):10mmol/L Tris.Cl(PH8.0),1 mmol/LEDTA(PH8.0)
(7) 蛋白酶K(20mg/ml),10mol/L醋酸铵,2mol/L的醋酸钠(pH4.0),0.1%DEPC(焦碳酸二乙酯)
(8)无水乙醇,70%乙醇,氯仿—异戊醇(49:1,V/V),异丙醇,酚
(9) 液氮
【实验操作】
(一) 用蛋白酶K和苯酚从哺乳动物组织和细胞中分离DNA
1.组织样品和培养细胞的裂解
(1)组织样品
①将lg新鲜切取的组织在液氮中速冻,并用液氮预冷的研钵研磨。
②液氮挥发,将组织粉末一点一点地加入盛有10倍体积裂解液的烧杯中,使其分散于裂
解液表面,后振摇烧杯使粉末浸没。
③将悬液转移至50ml三角瓶中,并于37℃温育1h,立即进行步骤1.2.。
(2)培养细胞
①单层培养细胞
i.从孵箱中取出长满单层细胞的培养皿,迅速吸去培养液,用冰冷的TBS洗2次,
加入1ml新鲜的冰冷的TBS。
ii.用橡胶刮棒将细胞刮入1ml TBS中,用吸管将细胞悬液转移到冰上的离心管中。用
0.5 ml冰冷的TBS冲洗培养皿,后并入离心管的细胞悬液。
iii.于4℃3000r/min离心10min以收集细胞。
iv.将细胞重悬于5倍~10倍体积的冰冷TBS中并再度离心。
v.用1 ml TE(PH8.0)重新悬浮细胞,转移至50 ml三角瓶中。
vi.每毫升细胞悬液加10 ml裂解缓冲液,于37℃温育1h,立即进行步骤1.2.。
②悬浮培养的细胞
i.将细胞转移至离心管,于4℃3000r/min离心10min以收集细胞,吸去上清。
ii.用1倍体积冰冷的TBS重悬细胞并再度离心,吸去上清,小心地再次重悬细胞于冰冷的TBS中,离心收集细胞。
iii.去上清,用1ml TE(PH8.0)重新悬浮细胞,转移至50 ml三角瓶中。
iv.每毫升细胞悬液加10 ml裂解缓冲液,于37℃温育1h,立即进行步骤1.2.。
2.将裂解液转移至离心管中,裂解液不能超过1/3体积。
3.加入蛋白酶K(20mg/ml)至终浓度100µg/ml。用一灭菌玻璃棒温和地将酶混入细胞裂解液
中。
4.将细胞裂解液置于50℃水浴中保温3 h,并不时振摇。
5.将溶液冷却至室温,加入等体积的平衡酚,将离心管置于涡旋器上,使离心管缓慢颠转10min
以温和地混合两相。
6.室温下,6500r/min离心15 min以分离两相。
7.用宽口移液管将黏滞的水相转移至另一离心管。
8.苯酚抽提两次,收集水相。
9.加入0.2倍体积10mol/L醋酸铵及2倍体积无水乙醇,旋转离心管直至溶液彻底混匀为止。
10.DNA随即形成沉淀,在室温下6500r/min离心5 min,收集沉淀。
11.用70%乙醇洗涤DNA沉淀2次,按步骤1.10.离心收集DNA。
12.尽可能吸去残余乙醇,于室温下,将DNA沉淀置于敞开的管内,直至乙醇挥发殆尽。
13.按每0.1m1细胞(步骤1.1)加入1ml TE溶解DNA,将DNA溶液储存于4℃。
14.用紫外分光光度法或二苯胺显色法检测DNA含量。详见本实验第二部分。
(二)酸性酚-硫氰酸胍-氯仿提取法纯化组织和细胞中的RNA
1.组织样品和培养细胞的处理
(1) 组织样品