医学图象配准
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一、图象配准概述
1、医学图象配准的概念
医学图象配准:对于一幅医学图象寻求一种 医学图象配准:对于一幅医学图象寻求一种 (或—系列)空间变换,使它与另一幅医学图象 系列) 上的对应点达到空间上的一致。 上的对应点达到空间上的一致。 这种一致是指人体上的同一解剖点在两张匹配 这种一致是指人体上的同一解剖点在两张匹配 图象上有相同的空间位置。 配准的结果应使两幅图象上所有的解剖点,或 至少是所有具有诊断意义的点及手术感兴趣的 点都达到匹配。
其中, 是刚体变换参数;定义 θ 为顺时针旋转方向; θ
1、刚体变换
(1)二维刚体变换
性质1 对于变换矩阵,不同的变换顺序,其变换结果也不同。 性质1:对于变换矩阵,不同的变换顺序,其变换结果也不同。 变换顺序1:先x轴后y轴再旋转
x′ cosθ sin θ 0 1 0 0 1 0 p x y ′ = − sin θ cosθ 0 0 1 q 0 1 0 y 0 1 0 0 1 0 0 1 1 1 0 p cosθ + q sin θ x cosθ sin θ = − sin θ cosθ − p cosθ + q sin θ y 0 1 0 1
x' a11 = y' a 21
a12 x Tx + a22 y Ty
一、图象配准概述
2、医学图象基本变换:刚体、仿射、投影、非线性 医学图象基本变换:刚体、仿射、投影、
(3)投影变换(Projective transformation) 投影变换(
2、医学图象基本变换:刚体、仿射、投影、非线性 医学图象基本变换:刚体、仿射、投影、
刚体变换 ⊂仿射变换 ⊂投影变换 ⊂非线性变换
全局变换 局部变换
常用的空间几何变换的图示:
一、图象配准概述
3、图象配准类型
(1)同一对象 (intra—subject) 的图象配准 intra—
不同 MR 加权像间的配准 图象序列的配准
主要配准方法
相关法
对图象序列采用使图象间相似性最大化的原理进行 配准; 通过优化两幅图象间相似性准则来估计变换参数, 主要是刚体的平移和旋转; 主要限于单模图象的配准
最大互信息配准法
用互信息作为多模医学图象配准的测度,如果两幅 图象几何上对齐的话,它们对应体素对的强度值的 互信息量最大; 广泛应用于CT/MR,PET/MR的配准
x′ = x cosθ + y sin θ y ′ = − x sin θ + y cosθ
x′ cosθ y ′ = − sin θ 1 0
sin θ cosθ 0
0 x 0 y 1 1
主要配准方法
曲线法(Curve Method) :边界曲线的匹配
用人工方法在两幅配准图象中寻找对应的开曲线, 再在两条开曲线局部曲率最佳拟合的线段用相同的 采样率找出一组对应点 对这组对应点使用点法匹配两幅图象
主要配准方法
表面法(Surface Method) :又称头帽法 (Head
and Hat method)
1、刚体变换
(1)二维刚体变换
三个变换参数:两个方向的平移和绕坐标原点的旋转 三个变换参数:两个方向的平移和绕坐标原点的旋转 平移和绕坐标原点的 轴方向的平移: 矩阵形式: 沿x轴方向的平移
x′ = x + p y′ = y
其中,P是刚体变换参数。
x′ 1 0 p x y ′ = 0 1 0 y 1 0 0 1 1
一、图象配准概述
3、图象配准类型
(2)不同对象间 (inter—subject) 的图象配准 inter— 将被试的图象与典型正常人相同部位的图象对 比,以确定被试者是否正常。如果异常,也许还 要与一些疾病的典型图象对比,确定患者是否属 于同类 (3)图象与图形(图谱)配准或与物理空间的图象 配准
x′ 1 0 0 x y ′ = 0 1 q y 1 0 0 1 1
定义y轴为垂直方向轴,正方向:从下到上;
Baidu Nhomakorabea
1、刚体变换
(1)二维刚体变换
三个变换参数:两个方向的平移和绕坐标原点的旋转 三个变换参数:两个方向的平移和绕坐标原点的旋转 平移和绕坐标原点的 绕坐标原点的旋转: 矩阵形式: 绕坐标原点的旋转
headmethod)是由Pelizzari Chen Pelizzari和Chen “头帽法”(head-hat method ” head Pelizzari Chen提出 的一个典型算法。 从一幅图像轮廓中提取的点集称作“帽子”(hat hat),从另 “ ” hat 一幅图像轮廓提取的表面模型叫做“头”(head head),用刚体变 “ ” head 换将“帽”的点集变换到“头”上。 “ ” “ ” 一般用体积较大的病人图像,或在图像体积大小差不多时用 分辨率较高的图像来产生头表面模型。 Powell Powell搜索算法被用来寻求所需的几何变换,即使帽点和头 表面间的距离平均平方值最小。 许多学者对该算法做了改进,例如用多分辨金字塔技术克服 局部极值问题;用距离变换拟合两幅图像的边缘点等等。
x' a11 y' = a21 1 a 31 a12 a22 a32 a13 x a23 y a33 1
(4)非线性变换(Nonlinear transformation) 非线性变换(
x' = a00 + a10x + a01y + a20x2 + a11xy + a02 y2 +... y' = b00 + b x + b01y + b20x2 + b xy + b02 y2 +... 10 11
第6章 医学图象配准 图像配准: 解决几幅图的对齐问题。
本章研究内容
图像配准的概述
图像配准与融合的概念 图像基本空间变换:刚体、仿射、透视、非线性 配准类型:同一对象、不同对象; 主要配准方法:点法、曲线法、表面法、矩和主轴法、相 关法、最大互信息法、图谱法、非线性变换技术;
图像基本空间变换模型 基于基准点的配准法 倒角匹配图像配准法 基于最大互信息的多模医学图像配准法
单模(monomodality) 单模(
fMRI图象序列的配准 fMRI图象序列的配准 胸、腹部脏器的图象配准 同一部位, 同一部位,不同时间图象的配准 CT和MRI图象 CT和MRI图象
多模( 多模(multimodality)
CT(或MRI)与SPECT(或PET)配准 CT(或MRI)与SPECT(或PET)配准 SPECT/ECT与CT/MRI/DSA配准 SPECT/ECT与CT/MRI/DSA配准 CT、MRI速度、 CT、MRI速度、C-Arm 与定位装置的配准 速度
一、图象配准概述
图象配准必要性:
1.两种模式的医学图象各有所长: X-Ray; DSA X-CT MRI; MRA Ultrasound SPECT PET f MRI EEG MRS
描述生理形态的解剖成像 描述生理形态的解剖成像
描述人体功能或代谢的功能成像 描述人体功能或代谢的功能成像
基于多种原因,临床上通常需要对同一个病人进 行多种模式或同种模式的多次成像。即同时从几幅图 像获得信息,进行综合分析 。
一、图象配准概述
4、主要配准方法
点法( Method)- 点法(Point Method)-界标配对 曲线法( 曲线法(Curve Method) - 边界曲线的匹配 表面法(Surface Method),如“头帽法”(Head and Hat Method), 头帽法” 表面法( method) 矩和主轴法( 矩和主轴法(Moment and Principal Axes Method) 交叉相关方法( 交叉相关方法(Correlation Method) 最大互信息配准法( 最大互信息配准法(Maximization of Mutual Information) 图谱法( Method)与非线性变换技术 图谱法(Atlos Method)与非线性变换技术
定义x轴为水平方向轴,正方向:从左到右;
1、刚体变换
(1)二维刚体变换
三个变换参数:两个方向的平移和绕坐标原点的旋转 三个变换参数:两个方向的平移和绕坐标原点的旋转 平移和绕坐标原点的 轴方向的平移: 矩阵形式: 沿y轴方向的平移
x′ = x y′ = y + q
其中,q是刚体变换参数。
主要配准方法
点法( Method) 点法(Point Method) :分为内部点法与外部点法。
标志点一旦确定,图象配准问题就归结为求解对应点 集的刚体变换;对准了这些标志点,图象也就配准 外部点: 外部点: 内部点:解剖标志点; 内部点:解剖标志点; 在受试着颅骨嵌入的螺钉; 在受试着颅骨嵌入的螺钉; 耳蜗尖端拐点处; 耳蜗尖端拐点处; 在皮肤上作记号; 在皮肤上作记号; 两个线性结构的交点; 两个线性结构的交点; 血管的分叉或相交处等; 血管的分叉或相交处等; 其他在两幅图像都可以检测 到的附加标记物: 到的附加标记物:如充有硫 酸铜的管子、玻璃珠、铬合 酸铜的管子、玻璃珠、 金球、明胶球等。 金球、明胶球等。 优点:对受试者友好; 优点:对受试者友好; 优点:容易识别; 优点:容易识别; 缺点:难以识别, 缺点:难以识别,需要一 缺点: 缺点:受试者在扫描装置内 定的经验。 定的经验。 要求严格不动; 要求严格不动;
主要配准方法
矩和主轴法(Moment
and Principal Axes Method)
根据力学中物理质量分布的概念: 先计算两幅图象象素点的质心和主轴; 再通过平移和旋转使两幅图象的质心和主轴对齐, 从而达到配准。 缺点:对数据缺失敏感; 对神经医生感兴趣的某些病案效果不佳。
应用:粗配准;初步对齐;
主要配准方法
图谱法
针对不同人脑的解剖结构的大小与形状方面具有的 共性,使我们有可能构造一个解剖图谱; 利用脑图谱进行配准,就可以利用图谱所包含的先 验知识对病人或其他人的图象进行自动识别和正确 的分割
非线性变换
基于物理模型的配准方法 基于空间变换的配准方法
二、基本空间变换模型
1、刚体变换
医学图象配准中常采用刚体变换模型, 该模型假定图象内部的距离和角度在配准 过程中保持不变。 二维刚体变换 三维刚体变换
一、图象配准概述
2、医学图象基本变换:刚体、仿射、投影、非线性 医学图象基本变换:刚体、仿射、投影、
刚体变换指物体内部任意两点之间的距离保持 不变,可以分解成旋转与平移; 仿射变换将直线映射为直线,并保持平行性; 投影变换将直线映射为直线,但不再保持平行 性质; 非线性变换将直线映射为曲线;
一、图象配准概述
医学图象配准示意图
一、图象配准概述
2、医学图象基本变换:刚体、仿射、投影、非线性 医学图象基本变换:刚体、仿射、投影、
(1)刚体变换(Rigid body transformation) 刚体变换(
± sin α x Tx x' cosα = + y' m sin α cosα y Ty 仿射变换( (2)仿射变换(Affine transformation)
2. 对于一个病人群的统计研究,或对于某个病人不同时期的评估研究的需要。 对于一个病人群的统计研究,或对于某个病人不同时期的评估研究的需要。
一、图象配准概述
图象配准与融合的概念: 图象配准与融合的概念:
图象的配准 图象的配准 (image registration): registration): 对几幅不同的图象作定量分析,首先要将图象转 换到一个公共的坐标框架内研究,解决图象的严 换到一个公共的坐标框架内研究,解决图象的严 格对齐问题,这就是图像配准。 格对齐问题,这就是图像配准。 图象的融合( 图象的融合(image fusion): fusion): 几幅图象信息综合的结果。