个体育种值的估计与选种指数的制订培训讲学

后裔
同胞
全同胞 半同胞
种用价值
系谱
自身性能
祖父 父
祖母
外祖父 母
外祖母
育种值估计方法的分类
• 单性状的育种值估计(个体育种值)
– 根据单一信息来源进行估计
• 本身、同胞、后裔、系谱
– 根据多种信息来源进行估计
• 复合育种值估计 • 单性状的BLUP
• 多性状的育种值估计(综合育种值)
– 综合选择指数 – 多性状的BLUP
作业一：
• 今有下列10头母牛和其亲属的产乳量记录如 下表，为了充分利用各种资料，尽可能准确 地进行选种工作，要求通过复合育种值的计 算，选出最优秀的3头母牛留种。
• 已知：
– 该牛群的全群平均产量为4820kg – 产乳量的遗传力为0.3 – 产乳量的重复力为0.4
表1 10头母牛及其亲属的产乳量记录（单位：kg）
育种值估计的基本原理
• 利用表型值估计育种值 • 依据表型值与育种值间的回归关系：
bAP：根据提供信息的个体与估计育种值个体间 亲缘关系不同而给予不同加权的遗传力
bAP计算：
• 式中:
– 表示提供信息的个体与估计育种值个体间的亲 缘系数
– 为各测量的表型值间的表型相关
• 当信息来源是一个个体多次度量均值时， 等于多次 度量的重复率 ；
1 (n 1)rA*h2 rAnh2
1 (n 1)rp
•混合家系 的平均亲 源相关系 数：
rA d 1 4d
d为配种 并产仔的 母畜数
利用单一来源资料估计育种值
• 根据资料来源的不同，计算出bAP,然后代入
公式
，可得被估个体的估计
育种值
利用多项来源资料估计育种值
• 由于亲属间亲缘相关的差异，不同来源的 资料的重要性程度不同，要利用不同的偏 回归系数对各项资料进行加权，以求得复 合育种值
– 由于育种值是不能直接度量，只能利用统计学原理和方法，通过 表型值和个体间的亲缘关系进行估计，由此得到的估计值称为估 计育种值。
• 估计传递力(estimated transmitting ability，ETA)
– 个体育种值的一半能够传递给下一代，在遗传评估中将它定义为 估计传递力
育种值估计的信息来源
公式
h2
nh 2
1 (n 1)re 0.5nh 2
1 (n 1)re 0.5nh 2
1 (n 1)0.5h2 0.25nh 2
1 (n 1)0.25h2 rAnh2
1 (n 1)rA*h2 0.5nh 2
1 (n 1)0.5h2 0.5nh 2
1 (n 1)0.25h2 rAnh2
牛号
本身
平均 记录 乳量 次数
母亲
平均 记录 乳量 次数
半姐妹
平均 乳量
头数
001 4500 3 4800 6 5520 23
002 5520
5
5000
8
5020 37
003 6000
1
4700
4
5300 33
004 4900
2
4900
5
5300 33
005 5000
3
48wk.baidu.com0
6
5820
5
006 3750
•如果缺少某项资料，该项以零计！ •h12、 h22、 h32、 h42即不同信息来源时的bAP
简化的复合育种值计算步骤
QA1•(根那P1据种P资性)h1料状2来遗P;源传A 力2，(确P2 定PA)h122、AP;2、A3、A4分别代表 QAA 31 •((根PP 31据PP资))hh3料212来PP;;源A 的A42差((P 异P42，PP分))hh42别22计PP;算出遗传力系数(bAP) A ¶A3x•(0根P.31据A1P 公)h03式.22A ：P 2 ; 0.A34A3(P04.4AP4)h42P ¶Ax00..11(A P110P.2)hA 12200..23(A P320P.4)hQ A224A 10.3((PP 13PP )h)12h 32P ;0.4A(2P 4(PP 2 )hP 42)h22PP
个体育种值的估计与选种指数的 制订
基本概念
• 个体育种值
– 简称育种值，又称为种用价值，在决定数量性状表型值的遗传效 应中，只有基因的加性效应(A)能稳定遗传给下一代， 个体加性 效应(A)的高低反映了该个体在育种上贡献大小，因而称其为育种 值
• 估计育种值(estimated breeding value ，EBV)
性状遗传力 h2 ＜0.2 h2 ＜0.6 h2 ≥0.6
A1 亲本 亲本 亲本
A2 自身 同胞 同胞
A3 同胞 自身 后裔
A4 后裔 后裔 自身
QA1(P1P)h12P; A2(P2P)h22P; A3(P3P)h32P; A4(P4P)h42P
¶Ax0.1A10.2A20.3A30.4A4 0.1(P1P)h120.2(P2P)h220.3(P3P)h320.4(P4P)h42P
•将出0.1各各(P1个个P 体体)h的不12估同0.计来2(P 育源2种的P值表)h 22型A ¶A 3x值 0.(30、P (.31 P 3A 群1 P)体Ph03)2.均2 h32AP 2 值;00 代.4A .3(4入A P34 (，P04P.计 4)hA P算424)h42PP
• 根据估计育种值大小进行排0序.1(，P1 选P出)h12具0有.2(最P2高P估)h2计20.3( 育种值的个体留种。
• 当信息来源是n个同类个体单次度量均值时， 等于同
类个体间的亲缘系数与性状遗传力的乘积(
)。
– 表示提供信息的个体之间的亲缘系数
资料来源 本身一次记录 本身 n 次记录 父母 n 次记录 全同胞记录 半同胞记录 混合家系资料 子女记录（全同胞） 子女记录（半同胞） 子女记录（全－半同胞）
通用
bAP H2 H(n)2 H(pn)2 H(Fs)2 H(Hs)2 H(F-H)2 H(O1)2 H(O2)2 H(O3)2 \
1
5500
5
4320 72
007 4500
5
6000
8
4740 22
简化的复合育种值估计
• 计算偏回归系数的过程复杂！ • 简化处理的方法：
– 在单项育种值基础上，根据资料的重要性程度 不同给予不同的加权值，并使各项加权值之和 为1。最简单的方式：
¶ A x 0 .1 A 1 0 .2 A 2 0 .3 A 3 0 .4 A 4
– 式中的A1～A4分别代表某种信息估计的育种值 – 具体代表哪种，根据性状的遗传力决定