聚类分析实验课件

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聚类分析-基因芯片ppt课件

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§6.4 动态聚类法
❖ 动态聚类法的基本思想是,选择一批凝聚点或给出 一个初始的分类,让样品按某种原则向凝聚点凝聚, 对凝聚点进行不断的修改或迭代,直至分类比较合 理或迭代稳定为止。类的个数k可以事先指定,也可 以在聚类过程中确定。选择初始凝聚点(或给出初始 分类)的一种简单方法是采用随机抽选(或随机分割) 样品的方法。
❖ 聚类分析根据分类对象不同分为Q型和R型聚类分析。
§6.2 距离和相似系数
❖ 相似性度量:距离和相似系数。 ❖ 距离常用来度量样品之间的相似性,相似系数常用
来度量变量之间的相似性。 ❖ 样品之间的距离和相似系数有着各种不同的定义,
而这些定义与变量的类型有着非常密切的关系。
变量的测量尺度
❖ 通常变量按测量尺度的不同可以分为间隔、有序和 名义尺度变量三类。
2
分别为第 j

最常用的两个相似系数
❖ 相似系数除常用来度量变量之间的相似性外有时也
用来度量样品之间的相似性,同样,距离有时也用 来度量变量之间的相似性。
❖ 由距离来构造相似系数总是可能的,如令
cij
1 1 d ij
这里d i j 为第 i 个样品与第 j 个样品的距离,显然 c i j 满 足定义相似系数的三个条件,故可作为相似系数。
❖ 距离必须满足定义距离的四个条件,所以不是总能 由相似系数构造。高尔(Gower)证明,当相似系
数矩阵 c ij 为非负定时,如令
dij 21cij
则 d i j 满足距离定义的四个条件。
§6.3 系统聚类法
❖ 系统聚类法是聚类分析诸方法中用得最多的一种。 ❖ 基本思想是:开始将个样品各自作为一类,并规定
❖ (4) 对 D 1 重复上述对D 0 的两步得 D 2 ,如此下去直 至所有元素合并成一类为止。

第8章-聚类分析PPT课件

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5
XXXXXXXXX
XXX
XXXXX
XXXXX
XXX
6
XXXXXXXXX
XXX
XXXXX
XXXXX
X
X
7
X
XXXXXXX
XXX
XXXXX
XXXXX
X
X
8
X
XXXXXXX
XXX
XXX
X
XXXXX
X
X
9
X
XXXXXXX
XXX
XXX
X
X
XXXXX Nhomakorabea10
X
X
XXXXX
XXX
XXX
X
X
XXX
X
X
11
X
X
XXXXX
对于顺序变两量个:案例在变量上 值的 相取 同时S, ijk 1,取不同值 时,Sijk 0;
对于等距变量 Sijk: 1-
xik -xjk Rk
,
Rk为变量 k的全距。
-
17
8.3 聚类方法
8.3.1 层次聚类法(Hierarchical Cluster Procedures) •聚集法(Agglomerative Method) •分解法(Divisive Method)
以上几种方法,离差平方和法和平均联结法的分类效果
较好。
-
21
主要结果
•聚合进度表 •冰柱图(垂直、水平) •树状图 •案例归类表
-
22
Agglomeration Schedule
Stage Cluster First
Cluster Combined
Appears
聚 Stage Cluster 1 Cluster 2 Coefficients Cluster 1 Cluster 2 Next Stage

聚类分析及其应用实例ppt课件

聚类分析及其应用实例ppt课件
在整堂课的教学中,刘教师总是让学 生带着 问题来 学习, 而问题 的设置 具有一 定的梯 度,由 浅入深 ,所提 出的问 题也很 明确
Outlines
聚类的思想 常用的聚类方法 实例分析:层次聚类
在整堂课的教学中,刘教师总是让学 生带着 问题来 学习, 而问题 的设置 具有一 定的梯 度,由 浅入深 ,所提 出的问 题也很 明确
3. 实例分析:层次聚类算法
定义:对给定的数据进行层次的分解
第4 步

凝聚的方法(自底向上)『常用』
思想:一开始将每个对象作为单独的
第3 步
一组,然后根据同类相近,异类相异 第2步 的原则,合并对象,直到所有的组合
并成一个,或达到一个终止条件。 第1步
a, b, c, d, e c, d, e d, e
X3 Human(人) X4 Gorilla(大猩猩) X5 Chimpanzee(黑猩猩) X2 Symphalangus(合趾猿) X1 Gibbon(长臂猿)
在整堂课的教学中,刘教师总是让学 生带着 问题来 学习, 而问题 的设置 具有一 定的梯 度,由 浅入深 ,所提 出的问 题也很 明确
离差平方和法( ward method ):
各元素到类中心的欧式距离之和。
Gp
Cluster P
Cluster M
Cluster Q
D2 WM Wp Wq
G q
在整堂课的教学中,刘教师总是让学 生带着 问题来 学习, 而问题 的设置 具有一 定的梯 度,由 浅入深 ,所提 出的问 题也很 明确
凝聚的层次聚类法举例
Gp G q
Dpq max{ dij | i Gp , j Gq}
在整堂课的教学中,刘教师总是让学 生带着 问题来 学习, 而问题 的设置 具有一 定的梯 度,由 浅入深 ,所提 出的问 题也很 明确

聚类分析部分 PPT课件

聚类分析部分 PPT课件

距离
设xij 为第i个样品的第j个指标,数据矩阵表如下:
在上表中,每个样品有p个变量,故 p 每个样品都可以看成是 R 中的一个点,n p 个样品就是 R 中的n个点。在 R p中需定义 某种距离,将第i个样品与第j个样品之间 的距离记为dij ,在聚类过程冲,相距较近的 点倾向于归为一类,相距较远的点应归属 不同的类。
聚类时,比较相似的变量倾向于 归为一类,不太相似的变量归属不同 的类。
相似系数性质
变量 xi 与 x j 的相似系数用 cij 来表示,它一般应满 足如下三个条件: (1)cij 1 ,当且仅当 xi ax j b, a( 0)和b为常 数; (2) cij 1,对一切i,j; (3) cij c ji ,对一切i,j。
正因为如此,判别分析和聚类 分析往往联合起来使用,例如判别 分析是要求先知道各类总体情况才 能判断新样品的归类,当总体分类 不清楚时,可先用聚类分析对原来 的一批样品进行分类,然后再用判 别分析建立判别式以对新样品进行 判别。
聚类分析与判别分析、主成分 分析、回归分析等方法联合起来使 用,往往效果更好。
x1 y1
s11
2
x2 y2 s22
2

x
p
yp
2
1 1 所加的权是 k1 , k2 , s11 s22
1 , k p ,即用样本方差 s pp
s pp
除相应坐标。当取 y1 y2 y p 0 时,就是点P 到原点O的距离。若 s11 s22 s pp 时,为欧氏距 离。
距离的性质
距离dij 一般应满足如下四个条件: (1) dij 0,对一切i,j; dij 0,当且仅当第i个样品与第j个样品的 (2) 各变量值都相同; dij d ji ,对一切i,j; (3) dij dik dkj ,对一切i,j,k。 (4)

聚类分析 PPT课件

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(f) (f) p dij f 1 ij d (i, j) (f) p f 1 ij
f is binary or nominal: dij(f) = 0 if xif = xjf , or dij(f) = 1 otherwise f is ordinal Compute ranks rif and Treat zif as interval-scaled
x1 x2 x3 x4
x1 0 3.61 5.1 4.24
x2 0 5.1 1
x3
x4
5
0 5.39
0
第二节 相似性的量度
一 样品相似性的度量
二 变量相似性的度量
含名义变量样本相似性度量
例: 学员资料包含六个属性:性别(男或女);外语语种
(英、日或俄);专业(统计、会计或金融);职业(教师 或非教师);居住处(校内或校外);学历(本科或本科以 下) 现有两名学员: X1=(男,英,统计,非教师,校外,本科)′ X2=(女,英,金融,教师,校外,本科以下)′ 对应变量取值相同称为配合的,否则称为不配合的 记配合的变量数为m1,不配合的变量数为m2,则样本之间 的距离可定义为
第五章 聚类分析
第一节 第二节 第三节 第四节 第五节 引言 相似性的量度 系统聚类分析法 K均值聚类分析 K中心点聚类
第六节
R codes
第一节 引言
“物以类聚,人以群分” 无监督分类聚类分析 分析如何对样品(或变量)进行量化分类的 问题 Q型聚类—对样品进行分类 R型聚类—对变量进行分类
用他们的序代替xif
zif
rif 1 M f 1
10
混合型属性
A database may contain all attribute types Nominal, symmetric binary, asymmetric binary, numeric, ordinal 可以用加权法计算合并的影响

聚类分析详解ppt课件

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以上我们对例6.3.1采用了多种系统聚类法进行聚类,其结果 都是相同的,原因是该例只有很少几个样品,此时聚类的过 程不易有什么变化。一般来说,只要聚类的样品数目不是太 少,各种聚类方法所产生的聚类结果一般是不同的,甚至会 有大的差异。从下面例子中可以看到这一点。
动态聚类法(快速聚类)
(4) 对D1 重复上述对D0 的两步得 D2,如此下去 直至所有元素合并成一类为止。
如果某一步Dm中最小的元素不止一个,则称此现 象为结(tie),对应这些最小元素的类可以任选一对 合并或同时合并。
27
二、最长距离法
类与类之间的距离定义为两类最远样品间的距离, 即
DKL
max
iGK , jGL
聚类分析应注意的问题
(1)所选择的变量应符合聚类的要求
如果希望依照学校的科研情况对高校进行分类,那么可以 选择参加科研的人数、年投入经费、立项课题数、支出经 费、科研成果数、获奖数等变量,而不应选择诸如在校学 生人数、校园面积、年用水量等变量。因为它们不符合聚 类的要求,分类的结果也就无法真实地反映科研分类的情 况。
主要内容
引言 聚类分析原理 聚类分析的种类 聚类分析应注意的问题 聚类分析应用 聚类分析工具及案例分析
聚类分析的种类
(1)系统聚类法(也叫分层聚类或层次聚类) (2)动态聚类法(也叫快速聚类) (3)模糊聚类法 (4)图论聚类法
系统聚类法
对比
常用的系统聚类方法
一、最短距离法 二、最长距离法 三、中间距离法 四、类平均法 五、重心法 六、离差平方和法(Ward方法)
对比
k均值法的基本步骤
(1)选择k个样品作为初始凝聚点,或者将所有样品分成k 个初始类,然后将这k个类的重心(均值)作为初始凝聚点。

聚类分析法ppt课件全

聚类分析法ppt课件全

8/21/2024
25
1.2.2 动态聚类分析法
1.2 聚类分析的种类
(3)分类函数
按照修改原则不同,动态聚类方法有按批修改法、逐个修改法、混合法等。 这里主要介绍逐步聚类法中按批修改法。按批修改法分类的原则是,每一步修 改都将使对应的分类函数缩小,趋于合理,并且分类函数最终趋于定值,即计 算过程是收敛的。
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23
1.2.2 动态聚类分析法
1.2 聚类分析的种类
(2)初始分类 有了凝聚点以后接下来就要进行初始分类,同样获得初始分类也有不同的
方法。需要说明的是,初始分类不一定非通过凝聚点确定不可,也可以依据其 他原则分类。
以下是其他几种初始分类方法: ①人为分类,凭经验进行初始分类。 ②选择一批凝聚点后,每个样品按与其距离最近的凝聚点归类。 ③选择一批凝聚点后,每个凝聚点自成一类,将样品依次归入与其距离
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14
1.2 聚类分析的种类
(2)系统聚类分析的一般步骤 ①对数据进行变换处理; ②计算各样品之间的距离,并将距离最近的两个样品合并成一类; ③选择并计算类与类之间的距离,并将距离最ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ的两类合并,如果累的个
数大于1,则继续并类,直至所有样品归为一类为止; ④最后绘制系统聚类谱系图,按不同的分类标准,得出不同的分类结果。
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1.2 聚类分析的种类
(7)可变法
1 2 D kr
2 (8)离差平方和法
(D k 2 pD k 2 q)D p 2q
D k 2 rn n ir n n p i D i2 pn n ir n n q iD i2 qn rn in iD p 2 q
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spss聚类分析PPT课件

spss聚类分析PPT课件

G7
G3
G4
G8
G7
0
G3
3
0
G4
5
2
0
G8
7
4
2
0
30
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(3)在D(1)中最小值是D34=D48=2,由于G4与G3合并, 又与G8合并,因此G3、G4、G8合并成一个新类G9,其与其 它类的距离D(2)
G7
G9
G7
0
G9
3
0
31
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(4)最后将G7和G9合并成G10,这时所有的六个样品聚为一 类,其过程终止。 上述聚类的可视化过程如下:
1
2
3
4
5
1
0
8.062 17.804 26.907 30.414
2
8.062 0
25.456 34.655 38.21
3
17.804 25.456 0
9.22 12.806
4
26.907 34.655 9.22 0
3.606
5
30.414 38.21 12.806 3.606 0
26
10/16/2024
系统聚类过程是:假设总共有n个样品(或变量)
第一步:将每个样品(或变量)独自聚成一类,共有 n类;
第二步:根据所确定的样品(或变量)“距离”公式, 把距离较近的两个样品(或变量)聚合为一类,其 它的样品(或变量)仍各自聚为一类,共聚成n 1 类;
第三步:将“距离”最近的两个类进一步聚成一类, 共聚成n 2类;……,以上步骤一直进行下去,最后17 将所有的样品(或变量)全聚成一类。
(1)选择样品距离公式,绝对距离最简单,形成D(0)

《数据挖掘》课程PPT-聚类分析

《数据挖掘》课程PPT-聚类分析

图像处理
1 2 3
图像分割
在图像处理中,聚类分析可以用于将图像分割成 多个区域或对象,以便进行更细致的分析和处理。
特征提取
通过聚类分析,可以提取图像中的关键特征,如 颜色、形状、纹理等,以实现图像分类、识别和 检索。
图像压缩
通过聚类分析,可以将图像中的像素进行聚类, 从而减少图像数据的维度和复杂度,实现图像压 缩。
03 推荐系统
利用聚类分析对用户和物品进行分类,为用户推 荐相似或相关的物品或服务。
02
聚类分析的常用算法
K-means算法
• 概述:K-means是一种基于距离的聚类算法,通过迭代将数据划分为K个集群,使得每个数 据点与其所在集群的中心点之间的距离之和最小。
• · 概述:K-means是一种基于距离的聚类算法,通过迭代将数据划分为K个集群,使得每个数 据点与其所在集群的中心点之间的距离之和最小。
03 基于模型的聚类
根据某种模型对数据进行拟合,将数据点分配给 不同的模型,常见的算法有EM算法、高斯混合模 型等。
聚类分析的应用场景
01 客户细分
将客户按照其特征和行为划分为不同的细分市场, 以便更好地了解客户需求并提供定制化服务。
02 异常检测
通过聚类分析发现数据中的异常值或离群点,以 便及时发现潜在的问题或风险。
生物信息学
基因表达分析
在生物信息学中,聚类分析可以用于分析基因表达数据, 将相似的基因聚类在一起,以揭示基因之间的功能关联和 调控机制。
蛋白质组学分析
通过聚类分析,可以研究蛋白质之间的相互作用和功能模 块,以深入了解生物系统的复杂性和动态性。
个性化医疗
通过聚类分析,可以根据个体的基因型、表型等特征进行 分类,为个性化医疗提供依据和支持。

聚类分析法ppt课件

聚类分析法ppt课件

7
(2)计算样品的距离。
d ij xi x j yi y j
8
G1
D(0)
G2 G3
G4
G5
G1 G2 G3 G4 G5
0 0.34 1.37 1.34 1.33
0 1.03 1 1.67
0 0.63 1.3
0 0.67
0
9
(3)找出D(0)非对角线上的最小元素, 将其对应的两个类合并为一个新类。
0 0.63 1.30 0 0.67
0
19
0
D(2)
1.37 0
1.67 1.30
0
20
0 1.67
D(3)
0
21
G1 G2 G3 G4 G5
0.4
0.8 1.2 1.6 2.0
聚类距离
பைடு நூலகம்22
G1 G2 G3 G4 G5
0.2 0.4 0.6 0.8 1.0
G1 G2 G3 G4 G5
0.4
0.8
1.2
1.6
2.0
聚类距离
聚类距离
23
某村对5个地块就其土壤质地和土壤有机 质含量进行了评估,结果如下。请分别 使用最长距离法和最短距离法对这5个地 块进行聚类分析,要求分为两类。
地块 A
B
C
D
E
质地 8
3
6
6
4
有机质 5
7
4
9
7
含量
24
聚类分析法
Cluster Analysis
1
聚类分析
将具有相似(similarity)性质(或距离)的 个体(样本)聚为一类,具有不同性质 的个体聚为不同的类。

聚类分析模型ppt课件

聚类分析模型ppt课件
i1
xi
yi
2
2
3
契比雪夫距离
dX,Y
max
1i p
xi
yi
3
1
4
闵可夫斯基距离
dX,Y
p
i1
xi
yi
qq
,q
0
1
5 马氏距离 d X ,Y X Y 1X Y 2 ,其中
是所有样品的样本协差阵。
6 兰氏(Lance---William)距离
dX ,Y
1
p
xi
yi
,(适用于样品各分量皆非负的情形)
15
聚类 类间
顺序 距离
1
1.000 x2 x5
2
1.000 x2 x5 x8
3
1.414 x1 x4
4
1.414 x2 x5 x8 x9
5
1.414 x2 x5 x8 x9 x7
6
1.414 x2 x5 x8 x9 x7 x3
7
1.414 x6 x10
8
1.732 x2 x5 x8 x9 x7 x3 x6 x10
9
3.000 x1 x4 x2 x5 x8 x9 x7 x3 x6 x10
16
类间距离
最短距离法聚类图
3.5 3.0 2.5 2.0 1.5 1.0 0.5
X10 X6 X3 X7 X9 X8 X5 X2 X4 X1
17
Spss软件实现
1.运动员的聚类分析:spss 数据 :运动员三项指标 关注:数据格式、结果解读、聚类图、最短距离法、最长距离法 2.汽车的聚类分析:spss 数据 :13-01 3.湿度的聚类分析:spss 数据 :18-03 4.国别饮料产量的聚类分析:spss 数据 :18-05

聚类分析获奖课件

聚类分析获奖课件

二、常见旳相同性测度
(一)距离
设 xi xi1 , xi2 , , xip 和 xj (x ,j1 xj2 ,, xjp )
是第 i 和 j 个样品旳观察值,则两者之间旳距离
1
为:
明距离
dij ( p | xik x jk |q )q
k 1
欧氏距离
dij
(x x ) p
k 1
由此,我们旳问题是怎样来选择样品间相 同旳测度指标,怎样将有相同性旳类连接起来?
聚类分析根据一批样品旳许多观察指标,按照 一定旳规则详细地计算某些样品或某些参数(指标) 旳相同程度,把相同旳样品或指标归为一类,把 不相同旳归为一类。
例如对上市企业旳经营业绩进行分类;据经 济信息和市场行情,客观地对不同商品、不同顾 客及时地进行分类。又例如当我们对企业旳经济 效益进行评价时,建立了一种由多种指标构成旳 指标体系,因为信息旳重叠,某些指标之间存在 很强旳有关性,所以需要将相同旳指标聚为一类, 从而到达简化指标体系旳目旳。
2、 R2 统计量
总离差平方和旳分解
x11 x12 x1p
x21
x22
x2
p
xn1
xn 2
xnp
x1 x2
xp
总离差平方和 (x11 x1)2 (xn1 x1)2 (x1p xp )2 (xnp xp )2
假如着些样品被提成两类
x11 x12 x1p
x21
x22
x2
p
xn1
1
xn1 2
xn1
p
x x (1) (1)
1
2
x (1) p
x11
x21
xn2
1
x (2) 1

第十九章 聚类分析 ppt课件

第十九章 聚类分析 ppt课件

以上定义的4种距离适用于定量变量,对于定性变量和有 序变量必须在数量化后方能应用。
37
11
说明:当样品各指标的单位不同时,或各指标单位
虽相同(包括各指标都无单位),但数量级相差大
时,应先将各指标标准化,在计算距离。
标准化方法:
x
' i
xi xi si
37
12
第二节 系统聚类
系统聚类(hierarchical clustering analysis)是将相似的样品或 变量归类的最常用方法,聚类过程如下:
( 1 9 -7 )
注意距离最小即相似系数最大。 2.最小相似系数法 类间相似系数计算公式为
D p q i M G p ,a j x G q (d ij), 样 品 聚 类
r p q i G M p ,ij n G q (r ij)
,
指 标 聚 类
( 1 9 -8 )
3.重心法(仅用于样品聚类) 用 , 分别表示 的均值向量(重 心),其分量是各个指标类内均数,x p 类间x q 相似系数计G p算, G q公式为
37
6
聚类统计量
指标聚类(R型聚类)的聚类统计量:指标间的相似系 数。0≤C≤1; C越大越相似。大则同类,小则异类。
(1)定量指标:用简单相关系数定义为相似系数。(定 量指标包含定性指标转化成0,1变量和等级指标转化 成的1,2,…变量)
(2)定性指标或等级指标(包括含有定量指标转换成的
等级指标),可用列联系数定义为 x i 和 x j 指标的相似
37
பைடு நூலகம்
10
(4)马氏距离:用S 表示m个变量间的样本协方差矩阵,马氏 距离(Mahalanobis distance)的计算公式为

聚类分析clusteranaly课件

聚类分析clusteranaly课件

其中D.2. 为欧氏距离的平方
J
n.为各类中所含样品数
聚类分析clusteranaly课件 2002年11月
聚类分析clusteranaly课件 2002年11月
(六)可变类平均法
(flexible-beta method)
K
M
L
类平均法的变型
DM 2 J(1)nnM K DK 2JnnM L DL2JDK 2L J 1;SA软 S 件预置 0.25为
选项
人为固定分类数 ANOVA表,初
读写凝聚点 始凝聚点等
聚类分析clusteranaly课件 2002年11月
(二)SAS聚类分析
样品聚类:PROC CLUSTER pseudo
RSQUARE STD METHOD=(AVE, AVERAGE, CEN,
CENTROID, COM, COMPLETE, DEN, DENSITY, EML, FLE, FLEXIBLE, MCQ, MCQUITTY, MED, MEDIAN, SIN,
聚类分析clusteranaly课件
1,通常情况1下 ~0取 之- 间的数
聚类分析clusteranaly课件 2002年11月
(五)类平均法
(average linkage between group)
K
M
L SPSS作为默认方法 ,称为 between-
groups linkage
DM2 J
nK nM
DK2J
nL nM
DL2J
冰柱的方向
聚类分析clusteranaly课件 2002年11月
Method
聚类方法
亲疏关系指标
标准化变换
聚类分析clusteranaly课件

聚类分析专题教育课件

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❖ 由距离来构造相同系数总是可能旳,如令
cij
1 1 dij
这里dij为第i个样品与第j个样品旳距离,显然cij满足 定义相同系数旳三个条件,故可作为相同系数。
❖ 距离必须满足定义距离旳四个条件,所以不是总能 由相同系数构造。高尔(Gower)证明,当相同系 数矩阵(cij)为非负定时,如令
dij 2 1 cij
0
2
0
5
3
D(2) G7
0 3
G5 0 G5 0

D(3)
G6
G8
G6
0
G8
4
0
其中G6= G1∪G2
图6.3.2 最短距离法树形图
二、最长距离法
❖ 类与类之间旳距离定义为两类最远样品间旳 , jGL
dij
图6.3.3 最长距离法: DKL=d15
❖ 最长距离法与最短距离法旳并类环节完全相同,只 是类间距离旳递推公式有所不同。
注:
❖ 假如某一步D(m)中最小旳元素不止一种,相应这些 最小元素旳类能够同步合并。
❖ 因为最短距离法是用两类之间近来样本点旳距离来 聚旳,所以该措施不适合对分离得很差旳群体进行 聚类
❖ D(0)等均为对称阵 ❖ 一般距离采用绝对距离或欧氏距离
❖ 例6.3.1 设有五个样品,每个只测量了一种指标, 分别是1,2,6,8,11,试用最短距离法将它们分 类。
❖ 递推公式:
DMJ maxDKJ , DLJ
❖ 对例采用最长距离法,其树形图如图所示,它与图 有相同旳形状,但并类旳距离要比图大某些,仍提 成两类为宜。
图6.3.4 最长距离法树形图
三、中间距离法
❖ 类与类之间旳距离既不取两类近来样品间旳距离,也不取两 类最远样品间旳距离,而是取介于两者中间旳距离,称为中

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第七章 聚类分析
第一节 引言 第二节 相似性的量度 第三节 系统聚类分析法 第四节 K均值聚类分析 第五节 两步聚类分析
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第一节 引言
什么是聚类分析? ❖ 聚类分析是根据“物以类聚”的道理,对样本或指
标进行分类的一种多元统计分析方法,它们讨论的 对象是大量的样本,要求能合理地按各自的特性进 行合理的分类,没有任何模式可供参考或依循,即 在没有先验知识的情况下进行的。
1.明考夫斯基距离
p
dij (q) (
X ik X jk )q 1/ q
k 1
明考夫斯基距离简称明氏距离。
(7.1)
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按q的取值不同又可分成下面的几个式子
(1)绝对距离( q 1)
p
dij (1) X ik X jk k 1
பைடு நூலகம்
(7.2)
(2)欧氏距离( q 2)
p
dij (2) (
X ik X jk )2 1/ 2
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第三节 系统聚类分析法
一 系统聚类的基本思想 二 类间距离与系统聚类法
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一、系统聚类的基本思想
❖ 系统聚类的基本思想是:距离相近的样品(或变量)先聚成 类,距离相远的后聚成类,过程一直进行下去,每个样品( 或变量)总能聚到合适的类中。系统聚类过程是:假设总共 有n个样品(或变量),第一步将每个样品(或变量)独自 聚成一类,共有n类;第二步根据所确定的样品(或变量) “距离”公式,把距离较近的两个样品(或变量)聚合为一 类,其它的样品(或变量)仍各自聚为一类,共聚成n 1类 ;第三步将“距离”最近的两个类进一步聚成一类,共聚成 n 2类;……,以上步骤一直进行下去,最后将所有的样品 (或变量)全聚成一类。为了直观地反映以上的系统聚类过 程,可以把整个分类系统画成一张谱系图。所以有时系统聚 类也称为谱系分析。除系统聚类法外,还有有序聚类法、动 态聚类法、图论聚类法、模糊聚类法等。
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§3.7 计算步骤与上机实践
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§3.7 计算步骤与上机实践
输出结果中,表3.9表示接近度矩阵,是反映样品之间相似性 或者相异性的矩阵。本例中由于计算距离使用的是平方欧氏距 离,所以样品间距离越大,样品越相异,如果我们计算距离选 择Pearson相关系数,则接近度矩阵是相似性矩阵。由表中矩 阵可以看出,Bangladesh(孟加拉国)与Cambodia(柬埔寨) 的距离是最小的,因此它们最先聚为一类。
我们可以看出全国城镇居民得消费结构大致可以分为三个方面,一类是各 种副食、日用品及交通通信、文化教育和住房等支出,这是在消费结构中 起主导作用的方面;其次是居民购买烟、酒、饮料及着装支出;粮食和水 电燃料是两项很重要的消费指标,但目前在城镇居民的消费中占的比例较 小,可将它们归并为同一类。
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计算步骤与上机实践
在这个数据文件中,我们选择的变量(Variables(s))有 Urban(城市人口比例),Lifeexpf(女性平均寿命)、 Lifeexpm(男性平均寿命)、Literacy(有读写能力的人 所占比例)、Gdp_cap(人均国内生产总值),以Country (国家或地区)来标识(Label Cases)本例中的17个亚洲国 家或地区,并以其他5个变量进行Q型聚类分析,即对国家 进行聚类。 这里我们将原始变量标准化(在Method选项下Transform Values的Standardize空白框内,选择Z Scores),在 Statistics选项中选择Agglomeration Schedule,聚类方 法选择组内联结法(Within-group linkage),计算距离选 择平方欧氏距离,输出冰柱图和树状聚类图。得到的结果 如下:
水平居中。
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§3.7 计算步骤与上机实践
3.7.2 快速聚类法(K-means cluster)。
同样我们使用上面的数据文件World95.sav,从中筛
选出亚洲国家,试图将亚洲国家按经济和文教
水平分为3类。可以使用快速聚类法对样品进
行聚类。
我们使用的变量有Country(国家或地区)、Urban
(城市人口比例),Lifeexpf(女性平均寿
命)、Lifeexpm(男性平均寿命)、Literacy
(有读写能力的人所占比例)、Gdp_cap(人
均国内生产总值),以Country来标识本例中
的17个亚洲国家或地区,并以其他5个变量进

行Q型聚类分析,即对国家进行聚类。
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§3.8 社会经济案例研究
上面介绍的几种系统聚类方法,并类的原则和步 骤基本一致,所不同的是类与类的距离有不同的 定义。其实可以把这几种方法统一起来,有利于 在计算机上灵活地选择更有意义的谱系图。
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§3.8 社会经济案例研究
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§3.8 社会经济案例研究
表3.16中最大的相关系数为r4,8=0.837,将G4和G8并成一新类G9,然后 计算G9与各类的相关系数,再找最大的相关系数,每次缩小一类得图3- 17。
§3.8 社会经济案例研究
例3.5 城镇居民消费水平通常用表3.15中的八项 指标来描述,八项指标间存在一定的线性相关。 为研究城镇居民的消费结构,需将相关性强的指 标归并到一起,这实际就是对指标聚类。原始数 据列于表3.15。
将原始数据录入SPSS,并依次点击“Analyze”→ “Correlate” →“Bivariate”,打开Bivariate Correlations对话框,把八个变量选入Variables 栏中,单击“OK”,得到这八个指标对应的相关系 数,列于表3.16。
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§3.7 计算步骤与上机实践
图3.11是树状聚类图,从图中可以由分类个数得到 分类情况。如果我们选择分类数为3,就从距离为 10的地方往下切,得到分类结果如下。{1:孟加 拉国、柬埔寨、阿富汗、印度、巴基斯坦};{2: 香港、新加坡、日本};{3:泰国、越南、中国、 印度尼西亚、马来西亚、菲律宾、韩国、台湾和 朝鲜}。我们可以从经济发展水平和文化教育水平 来理解所作的分类。第2类应该是亚洲国家中经济 发达程度最高的国家或地区,第1类的经济水平和 文教水平都比较低,第3类国家的经济水平和文教
图3.9是冰柱图,也是反映样品聚类情况的图,如果按照设定
的类数,在那类数的行上从左到右就可以找到各类所包含的样
品。比如我们希望分为三类,最左边的类数应选3,每个样品
右边都有一列X,如果某个样品右边的X个数少于3,那么它和
前面多于3个X的样品聚为一类,如此下去,直到找到全部三类
为止。例如,Hong Kong右边的列只有两个X,那么它就与Japan
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§3.7 计算步骤与上机实践
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§3.7 计算步骤与上机实践
将表3-8的聚合系数利用Excel作出聚合系数随分类 数变化曲线,如图3-13.
和Singapore聚为一类了,而China右边的列只有一个X,那么
从Taiwan到China又被聚为一类,后面样品聚为另一类。
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§3.7 计算步骤与上机实践
表3.10是反映每一阶段聚类的结果,Coefficients表 示聚合系数,第2列和第3列表示聚合的类,比如第一 阶段时(Stage=1)第2个样品——Bangladesh(孟加 拉国)与第三个样品——Cambodia(柬埔寨)聚为一 类,注意这时有16类(17-1=16)。因此某阶段的分类 数等于总的样品数减去这个阶段的序号。 图3.10是聚合系数随分类数变化的曲线。由图可以看 出,当分类数为3或4时, 曲线变得比较平缓,这 个分类数也符合我们分类的目的。
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