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细菌分类表
细菌分类表本表以LPSN网站原核生物分类的权威杂志IJSEM的分类系统，同时参考NCBI Taxonomy，但目前其它中文维基分类表可能依照其它标准，请注意其区别。
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参见：细菌。
目录[隐藏]1 酸杆菌门(Acidobacteria)1.1 酸杆菌纲(Acidobacteria)1.2 全噬菌纲(Holophagae)2 放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌）2.1 放线菌纲(Actinobacteria)3 产水菌门(Aquificae)3.1 产水菌纲(Aquificae)4 拟杆菌门(Bacteroidetes)4.1 拟杆菌纲(Bacteroidetes)4.2 黄杆菌纲(Flavobacteria)4.3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)4.4 纲未定5 衣原体门(Chlamydiae)5.1 衣原体纲(Chlamydiae)6 绿菌门(Chlorobi)6.1 绿菌纲(Chlorobia)7 绿弯菌门(Chloroflexi)7.1 厌氧绳菌纲(Anaerolineae)7.2 暖绳菌纲(Caldilineae)7.3 绿弯菌纲(Chloroflexi)8 产金菌门(Chrysiogenetes)8.1 产金菌纲(Chrysiogenetes)9 蓝藻门(Cyanobacteria)9.1 蓝藻纲(Cyanobacteria)10 脱铁杆菌门(Deferribacteres)10.1 脱铁杆菌纲(Deferribacteres)11 异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus)11.1 异常球菌纲(Deinococci)12 网团菌门(Dictyoglomi)12.1 网团菌纲(Dictyoglomi)13 纤维杆菌门(Fibrobacteres)13.1 纤维杆菌纲(Fibrobacteres)14 厚壁菌门(Firmicutes)（低G+C革兰氏阳性菌）14.1 芽孢杆菌纲(Bacilli)14.2 梭菌纲(Clostridia)14.3 热石杆菌纲(Thermolithobacteria)15 梭杆菌门(Fusobacteria)15.1 梭杆菌纲(Fusobacteria)16 芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)16.1 芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes)17 黏胶球形菌门(Lentisphaerae)17.1 黏胶球形菌纲(Lentisphaerae)18 硝化螺旋菌门(Nitrospirae)18.1 硝化螺旋菌纲(Nitrospira)19 浮霉菌门(Planctomycetes)19.1 浮霉菌纲(Planctomycetacia)20 海绵杆菌门(Poribacteria)*21 变形菌门(Proteobacteria)21.1 α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)21.2 β-变形菌纲(Betaproteobacteria)21.3 δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)21.4 ε-变形菌纲(Epsilonproteobacteria)21.5 γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)22 螺旋体门(Spirochaetes)22.1 螺旋体纲(Spirochaetes)23 柔膜菌门(Tenericutes)23.1 柔膜菌纲(Mollicutes)24 热脱硫杆菌门(Thermodesulfobacteria)24.1 热脱硫杆菌纲(Thermodesulfobacteria)25 热微菌门(Thermomicrobia)25.1 热微菌纲(Thermomicrobia)26 热袍菌门(Thermotogae)26.1 热袍菌纲(Thermotogae)27 疣微菌门(Verrucomicrobia)27.1 丰祐菌纲(Opitutae)27.2 疣微菌纲(Verrucomicrobiae)28 门未定28.1 纤线杆菌纲(Ktedonobacteria)[编辑] 酸杆菌门(Acidobacteria)[编辑] 酸杆菌纲(Acidobacteria)1. 酸杆菌目(Acidobacteriales)1. 酸杆菌科(Acidobacteriaceae)1. 酸杆菌属(Acidobacterium)2. (Edaphobacter)3. (Terriglobus)[编辑] 全噬菌纲(Holophagae)1. 石鳖杆菌目(Acanthopleuribacterales)1. 石鳖杆菌科(Acanthopleuribacteraceae)1. 石鳖杆菌属(Acanthopleuribacter)2. 全噬菌目(Holophagales)1. 全噬菌科(Holophagaceae)1. 地发菌属(Geothrix)2. 全噬菌属(Holophaga)[编辑] 放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌）[编辑] 放线菌纲(Actinobacteria)1. 酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)1. 酸微菌目(Acidimicrobiales)1. 酸微菌亚目(Acidimicrobineae)1. 酸微菌科(Acidimicrobiaceae)1. 酸微菌属(Acidimicrobium)2. (Iamiaceae)1. (Iamia)2. 放线菌亚纲(Actinobacteridae)1. 放线菌目(Actinomycetales)1. 放线菌亚目(Actinomycineae)1. 放线菌科(Actinomycetaceae)1. 放线棒菌属(Actinobaculum)2. 放线菌属(Actinomyces)3. 隐秘杆菌属(Arcanobacterium)4. (Falcivibrio)5. 动弯杆菌属(Mobiluncus)6. (Varibaculum)2. (Actinopolysporineae)1. (Actinopolysporaceae)1. (Actinopolyspora)3. (Catenulisporineae)1. (Actinospicaceae)1. (Actinospica)2. (Catenulisporaceae)1. (Catenulispora)4. 棒杆菌亚目(Corynebacterineae)1. 棒杆菌科(Corynebacteriaceae)1. (Bacterionema)2. (Caseobacter)3. 棒杆菌属(Corynebacterium)4. (Turicella)2. 迪茨氏菌科(Dietziaceae)1. 迪茨氏菌属(Dietzia)3. 分枝杆菌科(Mycobacteriaceae)1. 分枝杆菌属(Mycobacterium) （含结核杆菌）4. 诺卡氏菌科(Nocardiaceae)1. 戈登氏菌属(Gordonia)2. (Micropolyspora)3. (Millisia)4. 诺卡氏菌属(Nocardia)5. 红球菌属(Rhodococcus)6. 斯科曼氏菌属(Skermania)7. (Williamsia)8. (Smaragdicoccus)5. (Segniliparaceae)1. (Segniliparus)6. 束村氏菌科(Tsukamurellaceae)1. 束村氏菌属(Tsukamurella)5. 弗兰克氏菌亚目(Frankineae)1. 酸热菌科(Acidothermaceae)1. 酸热菌属(Acidothermus)2. 弗兰克氏菌科(Frankiaceae)1. 弗兰克氏菌属(Frankia)3. 地嗜皮菌科(Geodermatophilaceae)1. 芽球菌属(Blastococcus)2. 地嗜皮菌属(Geodermatophilus)3. (Modestobacter)4. (Kineosporiaceae)1. (Cryptosporangium)2. (Kineococcus)3. (Kineosporia)5. (Nakamurellaceae)1. (Humicoccus)2. (Nakamurella)3. (Quadrisphaera)6. 孢鱼菌科(Sporichthyaceae)1. 孢鱼菌属(Sporichthya)6. 糖霉菌亚目(Glycomycineae)1. 糖霉菌科(Glycomycetaceae)1. 糖霉菌属(Glycomyces)2. (Stackerbrandtia)7. 微球菌亚目(Micrococcineae)1. 获山氏菌科(Beutenbergiaceae)1. 获山氏菌属(Beutenbergia)2. 乔治菌属(Georgenia)3. 萨勒河菌属(Salana)2. 博戈里亚湖菌科(Bogoriellaceae)1. 博戈里亚湖菌属(Bogoriella)3. 短杆菌科(Brevibacteriaceae)1. 短杆菌属(Brevibacterium)4. 纤维素单胞菌科(Cellulomonadaceae)1. 纤维素单胞菌属(Cellulomonas)2. 厄氏菌属(Oerskovia)3. (Tropheryma)5. (Dermabacteraceae)1. (Brachybacterium)2. (Dermabacter)6. (Dermacoccaceae)1. (Demetria)2. (Dermacoccus)3. (Kytococcus)7. (Dermatophilaceae)1. (Dermatophilus)2. (Kineosphaera)8. (Intrasporangiaceae)1. (Arsenicicoccus)2. (Humihabitans)3. (Intrasporangium)4. (Janibacter)5. (Knoellia)6. (Kribbia)7. (Lapillicoccus)8. (Ornithinicoccus)9. (Ornithinimicrobium)10. (Oryzihumus)11. (Serinicoccus)12. (Terrabacter)13. (Terracoccus)14. (Tetrasphaera)9. (Jonesiaceae)1. (Jonesia)10. (Microbacteriaceae)1. (Agreia)2. (Agrococcus)3. (Agromyces)4. (Aureobacterium)5. (Clavibacter)6. (Cryobacterium)7. (Curtobacterium)8. (Frigoribacterium)9. (Frondicola)10. (Gulosibacter)11. (Labedella)12. (Leifsonia)13. (Leucobacter)14. (Microbacterium)15. (Microcella)16. (Mycetocola)17. (Okibacterium)18. (Plantibacter)19. (Pseudoclavibacter)20. (Rathayibacter)21. (Rhodoglobus)22. (Salinibacterium)23. (Subtercola)24. (Yonghaparkia)25. (Zimmermannella)11. 微球菌科(Micrococcaceae)1. (Acaricomes)2. 节杆菌属(Arthrobacter)3. (Citricoccus)4. (Kocuria)5. 微球菌属(Micrococcus)6. (Nesterenkonia)7. (Renibacterium)8. 罗氏菌属(Rothia)9. 口腔球菌属(Stomatococcus)10. 刘志恒菌属(Zhihengliuella)12. (Promicromonosporaceae)1. (Cellulosimicrobium)2. (Isoptericola)3. (Myceligenerans)4. (Promicromonospora)5. (Xylanibacterium)6. (Xylanimonas)13. (Rarobacteraceae)1. (Rarobacter)14. (Sanguibacteraceae)1. 血杆菌属(Sanguibacter)15. (Yaniaceae)1. (Yania)16. 科未定1. (Actinotalea)2. (Demequina)3. (Phycicoccus)4. (Ruania)8. 微单孢菌亚目(Micromonosporineae)1. 微单孢菌科(Micromonosporaceae)1. (Actinocatenispora)2. (Actinoplanes)3. (Amorphosporangium)4. (Ampullariella)5. (Asanoa)6. (Catellatospora)7. (Catenuloplanes)8. (Couchiolanes)9. (Dactylosporangium)10. (Krasilnikovia)11. (Longispora)12. (Luedemannella)13. 微单孢菌属(Micromonospora)14. (Pilimelia)15. (Planopolyspora)16. (Polymorphospora)17. (Salinispora)18. (Spirilliplanes)19. (Verrucosispora)20. (Virgisporangium)9. 丙酸杆菌亚目(Propionibacterineae)1. (Nocardioidaceae)1. (Actinopolymorpha)2. (Aeromicrobium)3. (Friedmanniella)4. (Hongia)5. (Kribbella)6. (Marmoricola)7. (Micropruina)8. (Nocardioides)9. (Pimelobacter)10. (Propionicicella)11. (Propionicimonas)2. 丙酸杆菌科(Propionibacteriaceae)1. 河口微菌属(Aestuariimicrobium)2. (Arachnia)3. (Brooklawnia)4. (Granulicoccus)5. 江氏菌属(Jiangella)6. (Luteococcus)7. (Microlunatus)8. 丙酸杆菌属(Propionibacterium)9. (Propioniferax)10. (Propionimicrobium)11. (Tessaracocccus)10. (Pseudonocardineae)1. (Actinosynnemataceae)1. (Actinokineospora)2. (Actinosynnema)3. (Lechevalieria)4. (Lentzea)5. (Saccharothrix)6. (Umezawaea)2. (Pseudonocardiaceae)1. (Actinoalloteichus)2. (Actinobispora)3. (Amycolata)4. (Amycolatopsis)5. (Crossiella)6. (Faenia)7. (Goodfellowia)8. (Kibdelosporangium)9. (Kutzneria)10. (Prauserella)11. (Pseudoamycolata)12. (Pseudonocardia)13. (Saccharomonospora)14. (Saccharopolyspora)15. (Streptoalloteichus)16. (Thermobispora)17. (Thermocrispum)11. 链霉菌亚目(Streptomycineae)1. 链霉菌科(Sterptomycetaceae)1. (Actinopycnidium)2. (Actinosporangium)3. (Chainia)4. (Elytrosporangium)5. 北里菌属(Kitasatoa)6. 北里孢菌属(Kitasatospora)7. (Microellobosporia)8. (Streptacidiphilus)9. 链霉菌属(Streptomyces)10. (Streptoverticillium)12. (Streptosporangineae)1. (Nocardiopsaceae)1. (Nocardiopsis)2. (Streptomonospora)3. (Thermobifida)2. (Streptosporangiaceae)1. (Acrocarpospora)2. (Herbidospora)3. (Microbispora)4. (Microtetraspora)5. (Nonomuraea)6. (Planobispora)7. (Planomonospora)8. (Planotetraspora)9. (Sphaerisporangium)10. (Streptosporangium)11. (Thermopolyspora)3. (Thermomonosporaceae)1. 珊瑚状放线菌属(Actinocorallia)2. (Actinomadura)3. (Excellospora)4. (Spirillospora)5. (Thermomonospora)2. 双歧杆菌目(Bifidobacteriales)1. 双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)1. (Aeriscardovia)2. (Alloscardovia)3. 双歧杆菌属(Bifidobacterium)4. (Gardnerella)5. (Metascardovia)6. (Parascardovia)7. (Scardovia)2. 科未定3. (Coriobacteridae)1. (Coriobacteriales)1. (Coriobacterineae)1. (Coriobacteriaceae)1. 奇异菌属(Atopobium)2. (Collinsella)3. (Coriobacterium)4. (Cryptobacterium)5. (Denitrobacterium)6. (Eggerthella)7. (Olsenella)8. (Slackia)4. 红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)1. 红色杆菌目(Rubrobacterales)1. 红色杆菌亚目(Rubrobacterineae)1. (Conexibacteraceae)1. (Conexibacter)2. (Patulibacteraceae)1. (Patulibacter)3. 红色杆菌科(Rubrobacteraceae)1. 红色杆菌属(Rubrobacter)4. (Solirubrobacteraceae)1. (Solirubrobacter)5. (Thermoleophilaceae)1. (Thermoleophilum)5. 球形杆菌亚纲(Sphaerobacteridae)1. 球形杆菌目(Sphaerobacterales)1. 球形杆菌亚目(Sphaerobacterineae)1. 球形杆菌科(Sphaerobacteraceae)1. 球形杆菌属(Sphaerobacter) [编辑] 产水菌门(Aquificae)[编辑] 产水菌纲(Aquificae)1. 产水菌目(Aquificales)1. 产水菌科(Aquificaceae)1. 产水菌属(Aquifex)2. (Calderobacterium)3. (Hydrogenivirga)4. (Hydrogenobacter)5. (Hydrogenobaculum)6. (Thermocrinis)2. 除硫杆菌科(Desulfurobacteriaceae)1. (Balnearium)2. 除硫杆菌属(Desulfurobacterium)3. 热弧菌属(Thermovibrio)3. (Hydrogenothermaceae)1. (Hydrogenothermus)2. (Persephonella)3. (Sulfurihydrogenibium)[编辑] 拟杆菌门(Bacteroidetes)[编辑] 拟杆菌纲(Bacteroidetes)1. 拟杆菌目(Bacteroidales)1. 拟杆菌科(Bacteroidaceae)1. (Acetomicrobium)2. (Anaerophaga)3. (Anaerorhabdus)4. 拟杆菌属(Bacteroides)5. (Pontibacter)2. 紫单胞菌科(Porphyromonadaceae)1. (Barnesiella)2. (Capsularis)3. (Dysgonomonas)4. (Hallella)5. (Odoribacter)6. (Oribaculum)7. (Paludibacter)8. (Parabacteroides)9. 紫单胞菌属(Porphyromonas) （多译作“卟啉单胞菌”，但porphyro-应来源于希腊语“紫色”）10. (Proteiniphilum)11. (Tannerella)12. (Xylanibacter)3. 普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)1. 普雷沃氏菌属(Prevotella) （或译作“普氏菌”）4. 理研菌科(Rikenellaceae)1. (Alistipes)2. (Alkaliflexus)3. (Marinilabilia)4. (Petrimonas)5. 理研菌属(Rikenella) （注：Riken是日语“理化学研究所”简称）5. 科未定1. (Acetofilamentum)2. (Acetothermus)[编辑] 黄杆菌纲(Flavobacteria)1. 黄杆菌目(Flavobacteriales)1. 蟑螂杆状体科(Blattabacteriaceae)1. 蟑螂杆状体属(Blattabacterium)2. (Cryomorphaceae)1. (Algoriphagus)2. (Brumimicrobium)3. (Crocinitomix)4. (Cryomorpha)5. (Fluviicola)6. 李时珍菌属(Lishizhenia)7. (Owenweeksia)3. 黄杆菌科(Flavobacteriaceae)1. (Actibacter)2. (Aequorivita)3. (Algibacter)4. (Aquimarina)5. (Arenibacter)6. 伯杰菌属(Bergeyella)7. (Bizionia)8. 碳酸噬胞菌属(Capnocytophaga) （注：多译作“二氧化碳噬纤维菌属”）9. 噬纤维素菌属(Cellulophaga)10. 金黄杆菌属(Chryseobacterium)11. (Cloacibacterium)12. (Coenonia)13. (Costertonia)14. (Croceibacter)15. 独岛菌属(Dokdonia)16. 东海菌属(Donghaeana)17. (Elizabethkingia)18. (Empedobacter)19. (Epilithonimonas)20. (Flaviramulus)21. 黄杆菌属(Flavobacterium)22. (Formosa)23. 泥滩杆菌属(Gaetbulibacter)24. 泥滩微菌属(Gaetbulimicrobium)25. (Galbibacter)26. (Gelidibacter)27. (Gillisia)28. (Gilvibacter)29. 革兰菌属(Gramella)30. (Kaistella)31. (Kordia)32. (Krokinobacter)33. (Lacinutrix)34. 列文虎克菌属(Leeuwenhoekiella)35. (Lutibacter)36. (Maribacter)37. (Mariniflexile)38. (Marixanthomonas)39. (Mesonia)40. (Muricauda)41. (Myroides)42. (Nonlabens)43. (Olleya)44. (Ornithobacterium)45. (Persicivirga)46. (Pibocella)47. 极地杆菌属(Polaribacter)48. 冷弯菌属(Psychroflexus)49. (Psychroserpens)50. (Riemerella)51. (Robiginitalea)52. (Salegentibacter)53. (Sandarakinotalea)54. (Sediminibacter)55. (Sediminicola)56. 世宗菌属(Sejongia)57. (Stanierella)58. (Stenothermobacter)59. (Subsaxibacter)60. (Subsaximicrobium)61. (Tamlana)62. (Tenacibaculum)63. (Ulvibacter)64. (Vitellibacter)65. (Wautersiella)66. (Weeksella)67. (Winogradskyella)68. 丽水菌属(Yeosuana)69. (Zeaxanthinibacter)70. 周氏菌属(Zhouia)71. (Zobellia)72. 王祖农菌属(Zunongwangia) [编辑] 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)1. 鞘脂杆菌目(Sphingobacteriales)1. 泉发菌科(Crenotrichaceae)1. (Balneola)2. (Chitinophaga)3. 泉发菌属(Crenothrix)4. (Rhodothermus)5. (Salinibacter)7. (Toxothrix)2. (Flammeovirgaceae)1. (Flammeovirga)2. (Flexithrix)3. (Perexilibacter)4. (Persicobacter)5. (Rapidithrix)6. (Sediminitomix)7. (Thermonema)3. 屈挠杆菌科(Flexibacteraceae)1. (Adhaeribacter)2. (Aquiflexum)3. (Arcicella)4. (Belliella)5. (Chimaereicella)6. (Cyclobacterium)7. 噬胞菌属(Cytophaga) （注：目前多称此属为“噬纤维菌属”，此处依拉丁文）8. (Dyadobacter)9. (Echinicola)10. (Effluviibacter)11. (Emticicia)12. (Fabibacter)13. (Flectobacillus)14. 屈挠杆菌属(Flexibacter)15. (Hongiella)16. (Hymenobacter)17. (Larkinella)18. (Leadbetterella)19. (Marinicola)20. (Meniscus)21. (Microscilla)22. (Niastella)23. (Persicitalea)24. (Reichenbachiella)25. (Rhodonellum)27. (Runella)28. (Spirosoma)29. 生孢噬胞菌属(Sporocytophaga)4. 腐螺旋菌科(Saprospiraceae)1. (Aureispira)2. (Haliscomenobacter)3. (Lewinella)4. 腐螺旋菌属(Saprospira)5. 鞘脂杆菌科(Sphingobacteriaceae)1. (Mucilaginibacter)2. (Olivibacter)3. (Parapedobacter)4. (Pedobacter)5. (Pseudosphingobacterium)6. 鞘脂杆菌属(Sphingobacterium)6. 科未定1. (Niabella)[编辑] 纲未定1. (Flavisolibacter)2. (Fulvivirga)3. (Prolixibacter)4. (Segetibacter)[编辑] 衣原体门(Chlamydiae)[编辑] 衣原体纲(Chlamydiae)1. 衣原体目(Chlamydiales)1. 衣原体科(Chlamydiaceae)1. 衣原体属(Chlamydia)2. 嗜衣体属(Chlamydophila)2. 副衣原体属(Parachlamydiaceae)1. 新衣原体属(Neochlamydia)2. 副衣原体属(Parachlamydia)3. 芯卡体科(Simkaniaceae)1. 芯卡体属(Simkania) （注：人名缩写简称，此处用音译）2. 棍衣原体属(Rhabdochlamydia)*4. 华诊体科(Waddliaceae)1. 华诊体属(Waddlia) （注：WADDL为“华盛顿动物病诊断实验室”缩写）[编辑] 绿菌门(Chlorobi)[编辑] 绿菌纲(Chlorobia)1. 绿菌目(Chlorobiales)1. 绿菌科(Chlorobiaceae)1. 臂绿菌属(Ancalochloris)2. 绿棒菌属(Chlorobaculum)3. 绿菌属(Chlorobium)4. 绿爬菌属(Chloroherpeton)5. 暗网菌属(Pelodictyon)6. 突柄绿菌属(Prosthecochloris)[编辑] 绿弯菌门(Chloroflexi)[编辑] 厌氧绳菌纲(Anaerolineae)1. 厌氧绳菌目(Anaerolineales)1. 厌氧绳菌科(Anaerolineaceae)1. 厌氧绳菌属(Anaerolinea)2. (Bellilinea)3. 纤绳菌属(Leptolinea)4. (Levilinea)5. 长绳菌属(Longilinea)[编辑] 暖绳菌纲(Caldilineae)1. 暖绳菌目(Caldilineales)1. 暖绳菌科(Caldilineaceae)1. 暖绳菌属(Caldilinea)[编辑] 绿弯菌纲(Chloroflexi)1. 绿弯菌目(Chloroflexales)1. 绿弯菌科(Chloroflexaceae)1. 绿弯菌属(Chloroflexus)2. 绿线菌属(Chloronema)3. 太阳发菌属(Heliothrix)4. 玫瑰弯菌属(Roseiflexus)2. 颤绿菌科(Oscillochloridaceae)1. 颤绿菌属(Oscillochloris)2. 爬管菌目(Herpetosiphonales)1. 爬管菌科(Herpetosiphonaceae)1. 爬管菌属(Herpetosiphon)[编辑] 产金菌门(Chrysiogenetes)[编辑] 产金菌纲(Chrysiogenetes)1. 产金菌目(Chrysiogenales)1. 产金菌科(Chrysiogenaceae)1. 产金菌属(Chrysiogenes)[编辑] 蓝藻门(Cyanobacteria)[编辑] 蓝藻纲(Cyanobacteria)注：目前有三套蓝藻分类系统，分别为NCBI、Bergey's手册及Cavalier-Smith（2002年，仅分至目)。
细菌分类
细菌分类表（按“界门纲目科属种”分类）生物分类总表生物病毒分类表古菌分类表细菌分类表原生生物分类表藻类分类表 (NCBI)真菌分类表植物分类表植物分类表 (NCBI)APG I、II、III克朗奎斯特分类动物分类表软体动物分类表环节动物分类表昆虫分类表鱼类分类表两栖动物分类表爬行动物分类表鸟类传统分类系统鸟类DNA分类系统鹦形目分类表哺乳动物分类表翼手目分类表• 1 酸杆菌门(Acidobacteria)o 1.1 酸杆菌纲(Acidobacteria)o 1.2 全噬菌纲(Holophagae)• 2 放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌）o 2.1 放线菌纲(Actinobacteria)• 3 产水菌门(Aquificae)o 3.1 产水菌纲(Aquificae)• 4 拟杆菌门(Bacteroidetes)o 4.1 拟杆菌纲(Bacteroidetes)o 4.2 黄杆菌纲(Flavobacteria)o 4.3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)o 4.4 纲未定• 5 衣原体门(Chlamydiae)o 5.1 衣原体纲(Chlamydiae)• 6 绿菌门(Chlorobi)o 6.1 绿菌纲(Chlorobia)•7 绿弯菌门(Chloroflexi)o7.1 厌氧绳菌纲(Anaerolineae)o7.2 暖绳菌纲(Caldilineae)o7.3 绿弯菌纲(Chloroflexi)•8 产金菌门(Chrysiogenetes)o8.1 产金菌纲(Chrysiogenetes)•9 蓝藻门(Cyanobacteria)o9.1 蓝藻纲(Cyanobacteria)•10 脱铁杆菌门(Deferribacteres)o10.1 脱铁杆菌纲(Deferribacteres)•11 异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus) o11.1 异常球菌纲(Deinococci)•12 网团菌门(Dictyoglomi)o12.1 网团菌纲(Dictyoglomi)•13 纤维杆菌门(Fibrobacteres)o13.1 纤维杆菌纲(Fibrobacteres)•14 厚壁菌门(Firmicutes)（低G+C革兰氏阳性菌）o14.1 芽孢杆菌纲(Bacilli)o14.2 梭菌纲(Clostridia)o14.3 热石杆菌纲(Thermolithobacteria)•15 梭杆菌门(Fusobacteria)o15.1 梭杆菌纲(Fusobacteria)•16 芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)o16.1 芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes)•17 黏胶球形菌门(Lentisphaerae)o17.1 黏胶球形菌纲(Lentisphaerae)•18 硝化螺旋菌门(Nitrospirae)o18.1 硝化螺旋菌纲(Nitrospira)•19 浮霉菌门(Planctomycetes)o19.1 浮霉菌纲(Planctomycetacia)•20 海绵杆菌门(Poribacteria)*•21 变形菌门(Proteobacteria)o21.1 α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)o21.2 β-变形菌纲(Betaproteobacteria)o21.3 δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)o21.4 ε-变形菌纲(Epsilonproteobacteria)o21.5 γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)•22 螺旋体门(Spirochaetes)o22.1 螺旋体纲(Spirochaetes)•23 柔膜菌门(Tenericutes)o23.1 柔膜菌纲(Mollicutes)•24 热脱硫杆菌门(Thermodesulfobacteria)o24.1 热脱硫杆菌纲(Thermodesulfobacteria)•25 热微菌门(Thermomicrobia)o25.1 热微菌纲(Thermomicrobia)•26 热袍菌门(Thermotogae)o26.1 热袍菌纲(Thermotogae)•27 疣微菌门(Verrucomicrobia)o27.1 丰祐菌纲(Opitutae)o27.2 疣微菌纲(Verrucomicrobiae)•28 门未定o28.1 纤线杆菌纲(Ktedonobacteria)酸杆菌门(Acidobacteria)酸杆菌纲(Acidobacteria)1.酸杆菌目(Acidobacteriales)1.酸杆菌科(Acidobacteriaceae)1.酸杆菌属(Acidobacterium)2.(Edaphobacter)3.(Terriglobus)全噬菌纲(Holophagae)1.石鳖杆菌目(Acanthopleuribacterales)1.石鳖杆菌科(Acanthopleuribacteraceae)1.石鳖杆菌属(Acanthopleuribacter)2.全噬菌目(Holophagales)1.全噬菌科(Holophagaceae)1.地发菌属(Geothrix)2.全噬菌属(Holophaga)放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌）放线菌纲(Actinobacteria)1.酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)1.酸微菌目(Acidimicrobiales)1.酸微菌亚目(Acidimicrobineae)1.酸微菌科(Acidimicrobiaceae)1.酸微菌属(Acidimicrobium)2.(Iamiaceae)1.(Iamia)2.放线菌亚纲(Actinobacteridae)1.放线菌目(Actinomycetales)1.放线菌亚目(Actinomycineae)1.放线菌科(Actinomycetaceae)1.放线棒菌属(Actinobaculum)2.放线菌属(Actinomyces)3.隐秘杆菌属(Arcanobacterium)4.(Falcivibrio)5.动弯杆菌属(Mobiluncus)6.(Varibaculum)2.(Actinopolysporineae)1.(Actinopolysporaceae)1.(Actinopolyspora)3.(Catenulisporineae)1.(Actinospicaceae)1.(Actinospica)2.(Catenulisporaceae)1.(Catenulispora)4.棒杆菌亚目(Corynebacterineae)1.棒杆菌科(Corynebacteriaceae)1.(Bacterionema)2.(Caseobacter)3.棒杆菌属(Corynebacterium)4.(Turicella)2.迪茨氏菌科(Dietziaceae)1.迪茨氏菌属(Dietzia)3.分枝杆菌科(Mycobacteriaceae)1.分枝杆菌属(Mycobacterium) （含结核杆菌）4.诺卡氏菌科(Nocardiaceae)1.戈登氏菌属(Gordonia)2.(Micropolyspora)3.(Millisia)4.诺卡氏菌属(Nocardia)5.红球菌属(Rhodococcus)6.斯科曼氏菌属(Skermania)7.(Williamsia)8.(Smaragdicoccus)5.(Segniliparaceae)1.(Segniliparus)6.束村氏菌科(Tsukamurellaceae)1.束村氏菌属(Tsukamurella)5.弗兰克氏菌亚目(Frankineae)1.酸热菌科(Acidothermaceae)1.酸热菌属(Acidothermus)2.弗兰克氏菌科(Frankiaceae)1.弗兰克氏菌属(Frankia)3.地嗜皮菌科(Geodermatophilaceae)1.芽球菌属(Blastococcus)2.地嗜皮菌属(Geodermatophilus)3.(Modestobacter)4.(Kineosporiaceae)1.(Cryptosporangium)2.(Kineococcus)3.(Kineosporia)5.(Nakamurellaceae)1.(Humicoccus)2.(Nakamurella)3.(Quadrisphaera)6.孢鱼菌科(Sporichthyaceae)1.孢鱼菌属(Sporichthya)6.糖霉菌亚目(Glycomycineae)1.糖霉菌科(Glycomycetaceae)1.糖霉菌属(Glycomyces)2.(Stackerbrandtia)7.微球菌亚目(Micrococcineae)1.获山氏菌科(Beutenbergiaceae)1.获山氏菌属(Beutenbergia)2.乔治菌属(Georgenia)3.萨勒河菌属(Salana)2.博戈里亚湖菌科(Bogoriellaceae)1.博戈里亚湖菌属(Bogoriella)3.短杆菌科(Brevibacteriaceae)1.短杆菌属(Brevibacterium)4.纤维素单胞菌科(Cellulomonadaceae)1.纤维素单胞菌属(Cellulomonas)2.厄氏菌属(Oerskovia)3.(Tropheryma)5.(Dermabacteraceae)1.(Brachybacterium)2.(Dermabacter)6.(Dermacoccaceae)1.(Demetria)2.(Dermacoccus)3.(Kytococcus)7.(Dermatophilaceae)1.(Dermatophilus)2.(Kineosphaera)8.(Intrasporangiaceae)1.(Arsenicicoccus)2.(Humihabitans)3.(Intrasporangium)4.(Janibacter)5.(Knoellia)6.(Kribbia)7.(Lapillicoccus)8.(Ornithinicoccus)9.(Ornithinimicrobium)10.(Oryzihumus)11.(Serinicoccus)12.(Terrabacter)13.(Terracoccus)14.(Tetrasphaera)9.(Jonesiaceae)1.(Jonesia)10.(Microbacteriaceae)1.(Agreia)2.(Agrococcus)3.(Agromyces)4.(Aureobacterium)5.(Clavibacter)6.(Cryobacterium)7.(Curtobacterium)8.(Frigoribacterium)9.(Frondicola)10.(Gulosibacter)11.(Labedella)12.(Leifsonia)13.(Leucobacter)14.(Microbacterium)15.(Microcella)16.(Mycetocola)17.(Okibacterium)18.(Plantibacter)19.(Pseudoclavibacter)20.(Rathayibacter)21.(Rhodoglobus)22.(Salinibacterium)23.(Subtercola)24.(Yonghaparkia)25.(Zimmermannella)11.微球菌科(Micrococcaceae)1.(Acaricomes)2.节杆菌属(Arthrobacter)3.(Citricoccus)4.(Kocuria)5.微球菌属(Micrococcus)6.(Nesterenkonia)7.(Renibacterium)8.罗氏菌属(Rothia)9.口腔球菌属(Stomatococcus)10.刘志恒菌属(Zhihengliuella)12.(Promicromonosporaceae)1.(Cellulosimicrobium)2.(Isoptericola)3.(Myceligenerans)4.(Promicromonospora)5.(Xylanibacterium)6.(Xylanimonas)13.(Rarobacteraceae)1.(Rarobacter)14.(Sanguibacteraceae)1.血杆菌属(Sanguibacter)15.(Yaniaceae)1.(Yania)16.科未定1.(Actinotalea)2.(Demequina)3.(Phycicoccus)4.(Ruania)8.微单孢菌亚目(Micromonosporineae)1.微单孢菌科(Micromonosporaceae)1.(Actinocatenispora)2.(Actinoplanes)3.(Amorphosporangium)4.(Ampullariella)5.(Asanoa)6.(Catellatospora)7.(Catenuloplanes)8.(Couchiolanes)9.(Dactylosporangium)10.(Krasilnikovia)11.(Longispora)12.(Luedemannella)13.微单孢菌属(Micromonospora)14.(Pilimelia)15.(Planopolyspora)16.(Polymorphospora)17.(Salinispora)18.(Spirilliplanes)19.(Verrucosispora)20.(Virgisporangium)9.丙酸杆菌亚目(Propionibacterineae)1.(Nocardioidaceae)1.(Actinopolymorpha)2.(Aeromicrobium)3.(Friedmanniella)4.(Hongia)5.(Kribbella)6.(Marmoricola)7.(Micropruina)8.(Nocardioides)9.(Pimelobacter)10.(Propionicicella)11.(Propionicimonas)2.丙酸杆菌科(Propionibacteriaceae)1.河口微菌属(Aestuariimicrobium)2.(Arachnia)3.(Brooklawnia)4.(Granulicoccus)5.江氏菌属(Jiangella)6.(Luteococcus)7.(Microlunatus)8.丙酸杆菌属(Propionibacterium)9.(Propioniferax)10.(Propionimicrobium)11.(Tessaracocccus)10.(Pseudonocardineae)1.(Actinosynnemataceae)1.(Actinokineospora)2.(Actinosynnema)3.(Lechevalieria)4.(Lentzea)5.(Saccharothrix)6.(Umezawaea)2.(Pseudonocardiaceae)1.(Actinoalloteichus)2.(Actinobispora)3.(Amycolata)4.(Amycolatopsis)5.(Crossiella)6.(Faenia)7.(Goodfellowia)8.(Kibdelosporangium)9.(Kutzneria)10.(Prauserella)11.(Pseudoamycolata)12.(Pseudonocardia)13.(Saccharomonospora)14.(Saccharopolyspora)15.(Streptoalloteichus)16.(Thermobispora)17.(Thermocrispum)11.链霉菌亚目(Streptomycineae)1.链霉菌科(Sterptomycetaceae)1.(Actinopycnidium)2.(Actinosporangium)3.(Chainia)4.(Elytrosporangium)5.北里菌属(Kitasatoa)6.北里孢菌属(Kitasatospora)7.(Microellobosporia)8.(Streptacidiphilus)9.链霉菌属(Streptomyces)10.(Streptoverticillium) 12.(Streptosporangineae)1.(Nocardiopsaceae)1.(Nocardiopsis)2.(Streptomonospora)3.(Thermobifida)2.(Streptosporangiaceae)1.(Acrocarpospora)2.(Herbidospora)3.(Microbispora)4.(Microtetraspora)5.(Nonomuraea)6.(Planobispora)7.(Planomonospora)8.(Planotetraspora)9.(Sphaerisporangium)10.(Streptosporangium)11.(Thermopolyspora)3.(Thermomonosporaceae)1.珊瑚状放线菌属(Actinocorallia)2.(Actinomadura)3.(Excellospora)4.(Spirillospora)5.(Thermomonospora)2.双歧杆菌目(Bifidobacteriales)1.双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)1.(Aeriscardovia)2.(Alloscardovia)3.双歧杆菌属(Bifidobacterium)4.(Gardnerella)5.(Metascardovia)6.(Parascardovia)7.(Scardovia)2.科未定3.(Coriobacteridae)1.(Coriobacteriales)1.(Coriobacterineae)1.(Coriobacteriaceae)1.奇异菌属(Atopobium)2.(Collinsella)3.(Coriobacterium)4.(Cryptobacterium)5.(Denitrobacterium)6.(Eggerthella)7.(Olsenella)8.(Slackia)4.红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)1.红色杆菌目(Rubrobacterales)1.红色杆菌亚目(Rubrobacterineae)1.(Conexibacteraceae)1.(Conexibacter)2.(Patulibacteraceae)1.(Patulibacter)3.红色杆菌科(Rubrobacteraceae)1.红色杆菌属(Rubrobacter)4.(Solirubrobacteraceae)1.(Solirubrobacter)5.(Thermoleophilaceae)1.(Thermoleophilum)5.球形杆菌亚纲(Sphaerobacteridae)1.球形杆菌目(Sphaerobacterales)1.球形杆菌亚目(Sphaerobacterineae)1.球形杆菌科(Sphaerobacteraceae)1.球形杆菌属(Sphaerobacter) 产水菌门(Aquificae)产水菌纲(Aquificae)1.产水菌目(Aquificales)1.产水菌科(Aquificaceae)1.产水菌属(Aquifex)2.(Calderobacterium)3.(Hydrogenivirga)4.(Hydrogenobacter)5.(Hydrogenobaculum)6.(Thermocrinis)2.除硫杆菌科(Desulfurobacteriaceae)1.(Balnearium)2.除硫杆菌属(Desulfurobacterium)3.热弧菌属(Thermovibrio)3.(Hydrogenothermaceae)1.(Hydrogenothermus)2.(Persephonella)3.(Sulfurihydrogenibium)拟杆菌门(Bacteroidetes)拟杆菌纲(Bacteroidetes)1.拟杆菌目(Bacteroidales)1.拟杆菌科(Bacteroidaceae)1.(Acetomicrobium)2.(Anaerophaga)3.(Anaerorhabdus)4.拟杆菌属(Bacteroides)5.(Pontibacter)2.紫单胞菌科(Porphyromonadaceae)1.(Barnesiella)2.(Capsularis)3.(Dysgonomonas)4.(Hallella)5.(Odoribacter)6.(Oribaculum)7.(Paludibacter)8.(Parabacteroides)9.紫单胞菌属(Porphyromonas) （多译作“卟啉单胞菌”，但porphyro-应来源于希腊语“紫色”）10.(Proteiniphilum)11.(Tannerella)12.(Xylanibacter)3.普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)1.普雷沃氏菌属(Prevotella) （或译作“普氏菌”）4.理研菌科(Rikenellaceae)1.(Alistipes)2.(Alkaliflexus)3.(Marinilabilia)4.(Petrimonas)5.理研菌属(Rikenella) （注：Riken是日语“理化学研究所”简称）5.科未定1.(Acetofilamentum)2.(Acetothermus)黄杆菌纲(Flavobacteria)1.黄杆菌目(Flavobacteriales)1.蟑螂杆状体科(Blattabacteriaceae)1.蟑螂杆状体属(Blattabacterium)2.(Cryomorphaceae)1.(Algoriphagus)2.(Brumimicrobium)3.(Crocinitomix)4.(Cryomorpha)5.(Fluviicola)6.李时珍菌属(Lishizhenia)7.(Owenweeksia)3.黄杆菌科(Flavobacteriaceae)1.(Actibacter)2.(Aequorivita)3.(Algibacter)4.(Aquimarina)5.(Arenibacter)6.伯杰菌属(Bergeyella)7.(Bizionia)8.碳酸噬胞菌属(Capnocytophaga) （注：多译作“二氧化碳噬纤维菌属”）9.噬纤维素菌属(Cellulophaga)10.金黄杆菌属(Chryseobacterium)11.(Cloacibacterium)12.(Coenonia)13.(Costertonia)14.(Croceibacter)15.独岛菌属(Dokdonia)16.东海菌属(Donghaeana)17.(Elizabethkingia)18.(Empedobacter)19.(Epilithonimonas)20.(Flaviramulus)21.黄杆菌属(Flavobacterium)22.(Formosa)23.泥滩杆菌属(Gaetbulibacter)24.泥滩微菌属(Gaetbulimicrobium)25.(Galbibacter)26.(Gelidibacter)27.(Gillisia)28.(Gilvibacter)29.革兰菌属(Gramella)30.(Kaistella)31.(Kordia)32.(Krokinobacter)33.(Lacinutrix)34.列文虎克菌属(Leeuwenhoekiella)35.(Lutibacter)36.(Maribacter)37.(Mariniflexile)38.(Marixanthomonas)39.(Mesonia)40.(Muricauda)41.(Myroides)42.(Nonlabens)43.(Olleya)44.(Ornithobacterium)45.(Persicivirga)46.(Pibocella)47.极地杆菌属(Polaribacter)48.冷弯菌属(Psychroflexus)49.(Psychroserpens)50.(Riemerella)51.(Robiginitalea)52.(Salegentibacter)53.(Sandarakinotalea)54.(Sediminibacter)55.(Sediminicola)56.世宗菌属(Sejongia)57.(Stanierella)58.(Stenothermobacter)59.(Subsaxibacter)60.(Subsaximicrobium)61.(Tamlana)62.(Tenacibaculum)63.(Ulvibacter)64.(Vitellibacter)65.(Wautersiella)66.(Weeksella)67.(Winogradskyella)68.丽水菌属(Yeosuana)69.(Zeaxanthinibacter)70.周氏菌属(Zhouia)71.(Zobellia)72.王祖农菌属(Zunongwangia) 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)1.鞘脂杆菌目(Sphingobacteriales)1.泉发菌科(Crenotrichaceae)1.(Balneola)2.(Chitinophaga)3.泉发菌属(Crenothrix)4.(Rhodothermus)5.(Salinibacter)6.(Terrimonas)7.(Toxothrix)2.(Flammeovirgaceae)1.(Flammeovirga)2.(Flexithrix)3.(Perexilibacter)4.(Persicobacter)5.(Rapidithrix)6.(Sediminitomix)7.(Thermonema)3.屈挠杆菌科(Flexibacteraceae)1.(Adhaeribacter)2.(Aquiflexum)3.(Arcicella)4.(Belliella)5.(Chimaereicella)6.(Cyclobacterium)7.噬胞菌属(Cytophaga) （注：目前多称此属为“噬纤维菌属”，此处依拉丁文）8.(Dyadobacter)9.(Echinicola)10.(Effluviibacter)11.(Emticicia)12.(Fabibacter)13.(Flectobacillus)14.屈挠杆菌属(Flexibacter)15.(Hongiella)16.(Hymenobacter)17.(Larkinella)18.(Leadbetterella)19.(Marinicola)20.(Meniscus)21.(Microscilla)22.(Niastella)23.(Persicitalea)24.(Reichenbachiella)25.(Rhodonellum)26.(Roseivirga)27.(Runella)28.(Spirosoma)29.生孢噬胞菌属(Sporocytophaga)4.腐螺旋菌科(Saprospiraceae)1.(Aureispira)2.(Haliscomenobacter)3.(Lewinella)4.腐螺旋菌属(Saprospira)5.鞘脂杆菌科(Sphingobacteriaceae)1.(Mucilaginibacter)2.(Olivibacter)3.(Parapedobacter)4.(Pedobacter)5.(Pseudosphingobacterium)6.鞘脂杆菌属(Sphingobacterium)6.科未定1.(Niabella)纲未定1.(Flavisolibacter)2.(Fulvivirga)3.(Prolixibacter)4.(Segetibacter)衣原体门(Chlamydiae)衣原体纲(Chlamydiae)1.衣原体目(Chlamydiales)1.衣原体科(Chlamydiaceae)1.衣原体属(Chlamydia)2.嗜衣体属(Chlamydophila)2.副衣原体属(Parachlamydiaceae)1.新衣原体属(Neochlamydia)2.副衣原体属(Parachlamydia)3.芯卡体科(Simkaniaceae)1.芯卡体属(Simkania) （注：人名缩写简称，此处用音译）2.棍衣原体属(Rhabdochlamydia)*4.华诊体科(Waddliaceae)1.华诊体属(Waddlia) （注：WADDL为“华盛顿动物病诊断实验室”缩写）绿菌门(Chlorobi)绿菌纲(Chlorobia)1.绿菌目(Chlorobiales)1.绿菌科(Chlorobiaceae)1.臂绿菌属(Ancalochloris)2.绿棒菌属(Chlorobaculum)3.绿菌属(Chlorobium)4.绿爬菌属(Chloroherpeton)5.暗网菌属(Pelodictyon)6.突柄绿菌属(Prosthecochloris)绿弯菌门(Chloroflexi)厌氧绳菌纲(Anaerolineae)1.厌氧绳菌目(Anaerolineales)1.厌氧绳菌科(Anaerolineaceae)1.厌氧绳菌属(Anaerolinea)2.(Bellilinea)3.纤绳菌属(Leptolinea)4.(Levilinea)5.长绳菌属(Longilinea)暖绳菌纲(Caldilineae)1.暖绳菌目(Caldilineales)1.暖绳菌科(Caldilineaceae)1.暖绳菌属(Caldilinea)绿弯菌纲(Chloroflexi)1.绿弯菌目(Chloroflexales)1.绿弯菌科(Chloroflexaceae)1.绿弯菌属(Chloroflexus)2.绿线菌属(Chloronema)3.太阳发菌属(Heliothrix)4.玫瑰弯菌属(Roseiflexus)2.颤绿菌科(Oscillochloridaceae)1.颤绿菌属(Oscillochloris)2.爬管菌目(Herpetosiphonales)1.爬管菌科(Herpetosiphonaceae)1.爬管菌属(Herpetosiphon) 产金菌门(Chrysiogenetes) 产金菌纲(Chrysiogenetes)1.产金菌目(Chrysiogenales)1.产金菌科(Chrysiogenaceae)1.产金菌属(Chrysiogenes)蓝藻门(Cyanobacteria)蓝藻纲(Cyanobacteria)1.第一目（色球藻目(Chroococcales)）@1.第一科@1.管孢藻属(Chamaesiphon)@2.色球藻属(Chroococcus)@3.(Cyanobacterium)@4.(Cyanobium)@5.(Cyanothece)@6.蓝纤维藻属(Dactylococcopsis)@7.(Gloeobacter)@8.黏球藻属(Gloeocapsa)@9.黏杆藻属(Gloeothece)@10.微囊藻属(Microcystis)@11.原绿球藻属(Prochlorococcus)@12.原绿藻属(Prochloron)@13.聚球藻属(Synechococcus)@14.集胞藻属(Synechocystis)@2.第二目（宽球藻目(Pleurocapsales)）@1.第一科@1.(Cyanocystis)@2.(Dermocarpella)@3.(Stanieria)@4.异球藻属(Xenococcus)@2.第二科@1.拟色球藻属(Chroococcidiopsis)@2.黏囊藻属(Myxosarcina)@3.宽球藻属(Pleurocapsa)@3.第三目（颤藻目(Oscillatoriales)）@1.第一科@1.节螺藻属(Arthrospira)@ （包含商业化螺旋藻）2.(Borzia)@3.(Crinalium)@4.(Geitlerinema)@5.盐螺旋藻属(Halospirulina)6.(Leptolyngbya)@7.(Limnothrix)@8.鞘丝藻属(Lyngbya)@9.微鞘藻属(Microcoleus)@10.颤藻属(Oscillatoria)@11.(Planktothrix)@12.原绿发藻属(Prochlorothrix)@13.(Pseudanabaena)@14.螺旋藻属(Spirulina)@15.(Starria)@16.束藻属(Symploca)@17.束毛藻属(Trichodesmium)18.(Tychonema)@4.第四目（念珠藻目(Nostocales)）@1.第一科@1.鱼腥藻属(Anabaena)@2.项圈藻属(Anabaenopsis)@3.束丝藻属(Aphanizomenon)@4.(Cyanospira)@5.(Cylindrospermopsis)@6.筒孢藻属(Cylindrospermum)@7.节球藻属(Nodularia)@8.念珠藻属(Nostoc)@9.伪枝藻属(Scytonema)@2.第二科@1.眉藻属(Calothrix)@2.胶须藻属(Rivularia)@3.单歧藻属(Tolypothrix)@5.第五目（真枝藻目(Stigonematales)）@1.第一科@1.(Chlorogloeopsis)@2.费氏藻属(Fischerella)@3.(Geitleria)@4.(Iyengariella)@5.拟念珠藻属(Nostochopsis)@6.真枝藻属(Stigonema)@脱铁杆菌门(Deferribacteres) 脱铁杆菌纲(Deferribacteres)1.脱铁杆菌目(Deferribacterales)1.脱铁杆菌科(Deferribacteraceae)1.脱铁杆菌属(Deferribacter)2.(Denitrovibrio)3.(Flexistipes)4.地弧菌属(Geovibrio)5.(Mucispirillum)2.科未定1.暖发菌属(Caldithrix)2.(Synergistes)异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus)异常球菌纲(Deinococci)1.异常球菌目(Deinococcales)1.异常球菌科(Deinococcaceae)1.异常杆菌属(Deinobacter)2.异常球菌属(Deinococcus)2.特吕珀菌科(Trueperaceae)1.特吕珀菌属(Truepera)2.栖热菌目(Thermales)1.栖热菌科(Thermaceae)1.海栖热菌属(Marinithermus)2.亚栖热菌属(Meiothermus)3.海洋栖热菌属(Oceanithermus)4.栖热菌属(Thermus)5.火山栖热菌属(Vulcanithermus)网团菌门(Dictyoglomi)网团菌纲(Dictyoglomi)1.网团菌目(Dictyoglomales)1.网团菌科(Dictyoglomaceae)1.网团菌属(Dictyoglomus)纤维杆菌门(Fibrobacteres)纤维杆菌纲(Fibrobacteres)1.纤维杆菌目(Fibrobacterales)1.纤维杆菌科(Fibrobacteraceae)1.纤维杆菌属(Fibrobacter)厚壁菌门(Firmicutes)（低G+C革兰氏阳性菌）芽孢杆菌纲(Bacilli)1.芽孢杆菌目(Bacillales)1.(Alicyclobacillaceae)1.(Alicyclobacillus)2.(Pasteuria)3.(Sulfobacillus)2.芽孢杆菌科(Bacillaceae)1.(Alkalibacillus)2.(Amphibacillus)3.(Anoxybacillus)4.芽孢杆菌属(Bacillus)5.(Caldalkalibacillus)6.(Cerasibacillus)7.(Exiguobacterium)8.(Filobacillus)9.(Geobacillus)10.(Gracilibacillus)11.(Halalkalibacillus)12.(Halobacillus)13.(Haloactibacillus)14.(Jeotgalibacillus)15.(Lentibacillus)16.(Lysinibacillus)17.(Marinibacillus)18.(Oceanobacillus)19.(Ornithinibacillus)20.(Paraliobacillus)21.(Paucisalibacillus)22.(Pelagibacillus)23.(Piscibacillus)24.(Pontibacillus)25.糖球菌属(Saccharococcus)26.(Salibacillus)27.(Salimicrobium)28.(Salinibacillus)29.(Salirhabdus)30.(Sasuginibacillus)31.(Tenuibacillus)32.(Terribacillus)33.(Thalassobacillus)34.(Ureibacillus)35.(Virgibacillus)36.(Vulcanibacillus)3.(Caryophanaceae)1.(Caryophanon)4.李斯特氏菌科(Listeriaceae)1.环丝菌属(Brochothrix)2.李斯特氏菌属(Listeria)5.(Paenibacillaceae)1.(Ammoniphilus)2.(Aneurinibacillus)3.(Brevibacillus)4.(Cohnella)5.(Oxalophagus)6.(Paenibacillus)7.(Thermicanus)8.(Thermobacillus)6.(Planococcaceae)1.(Filibacter)2.(Kurthia)3.(Planococcus)4.(Planomicrobium)5.(Sporosarcina)7.芽孢乳杆菌科(Sporolactobacillaceae)1.(Marinococcus)2.(Sinococcus)3.芽孢乳杆菌属(Sporolactobacillus)4.(Tuberibacillus)8.葡萄球菌科(Staphylococcaceae)1.孪生菌属(Gemella)2.(Joetgalicoccus)3.(Macrococcus)4.(Salinicoccus)5.葡萄球菌属(Staphylococcus)9.(Thermoactinomycetaceae)1.(Laceyella)2.(Mechercharimyces)3.(Planifilum)4.(Seinonella)5.(Shimazuella)6.(Thermoactinomyces)7.(Thermoflavimicrobium)10.(Turicibacteraceae)1.(Turicibacter)11.科未定1.(Pullulanibacillus)2.乳杆菌目(Lactobacillales)1.气球菌科(Aerococcaceae)1.(Abiotrophia)2.气球菌属(Aerococcus)3.(Dolosicoccus)4.(Eremococcus)5.(Facklamia)6.(Globicatella)7.(Ignavigranum)2.肉杆菌科(Carnobacteriaceae)1.(Agitococcus)2.(Alkalibacterium)3.(Allofustis)4.(Alloiococcus)5.(Atopococcus)6.(Atopostipes)7.肉杆菌属(Carnobacterium)8.德库菌属(Desemzia) （DSMZ，德国微生物与细胞保藏中心）9.(Dolosigranulum)10.(Granulicatella)11.(Isobaculum)12.(Lactosphaera)13.(Marinilactibacillus)14.(Trichococcus)3.肠球菌科(Enterococcaceae)1.(Atopobacter)2.(Catellicoccus)3.肠球菌属(Enterococcus)4.(Melissococcus)5.(Pilibacter)6.(Tetragenococcus)7.漫游球菌属(Vagococcus)4.乳杆菌科(Lactobacillaceae)1.乳杆菌属(Lactobacillus)2.(Paralactobacillus)3.片球菌属(Pediococcus)5.明串珠菌科(Leuconostocaceae)1.明串珠菌属(Leuconostoc)2.(Oenococcus)3.(Weissella)6.颤螺旋菌科(Oscillospiraceae)1.颤杆菌克(Oscillibacter)2.颤螺旋菌属(Oscillospira)7.链球菌科(Streptococcaceae)1.乳球菌属(Lactococcus)2.(Lactovum)3.链球菌属(Streptococcus)8.科未定1.(Acetoanaerobium)2.互营球菌属(Syntrophococcus) 梭菌纲(Clostridia)1.梭菌目(Clostridiales)1.梭菌科(Clostridiaceae)1.(Acetanaerobacterium)2.(Acetivibrio)3.(Acidaminobacter)4.(Alkaliphilus)5.(Anaerobacter)6.(Anaerotruncus)7.(Anoxynatronum)8.(Bryantella)9.(Caloramator)10.(Caloranaerobacter)11.(Caminicella)12.(Clostridiisalibacter)13.梭菌属(Clostridium)14.(Coprobacillus)15.(Dorea)16.(Ethanoligenens)17.(Faecalibacterium)18.(Fastidiosipila)19.(Garciella)20.(Gracilibacter)21.(Guggenheimella)22.(Hespellia)23.(Natronincola)24.(Oxobacter)25.(Parasporobacterium)26.八叠球菌属(Sarcina)27.(Soehngenia)28.(Sporacetigenium)29.(Sporobacter)30.(Subdoligranulum)31.(Tepidibacter)32.(Tepidimicrobium)33.(Thermobrachium)34.(Thermohalobacter)35.(Tindallia)2.优杆菌科(Eubacteriaceae)1.醋杆菌属(Acetobacterium)2.(Alkalibacter)3.(Anaerofustis)4.(Anaerovorax)5.优杆菌属(Eubacterium)6.(Mogibacterium)7.(Pseudoramibacter)3.太阳杆菌科(Heliobacteriaceae)1.太阳杆状菌属(Heliobacillus)2.太阳杆菌属(Heliobacterium)3.嗜日菌属(Heliophilum)4.(Heliorestis)4.毛螺旋菌科(Lachnospiraceae)1.(Acetitomaculum)2.(Anaerofilum)3.(Anaerostipes)4.丁酸弧菌属(Butyrivibrio)5.(Catenibacterium)6.(Catonella)7.粪球菌属(Coprococcus)8.(Johnsonella)9.(Lachnobacterium)10.毛螺旋菌属(Lachnospira)11.(Moryella)12.(Oribacterium)13.假丁酸弧菌属(Pseudobutyrivibrio)14.(Roseburia)15.瘤胃球菌属(Ruminococcus)16.(Shuttleworthia)17.(Sporobacterium)5.消化球菌科(Peptococcaceae)1.(Carboxydothermus)2.(Cryptanaerobacter)3.(Dehalobacter)4.(Desulfitobacterium)5.(Desulfonispora)6.(Desulfosporosinus)7.(Desulfotomaculum)8.(Pelotomaculum)9.消化球菌属(Peptococcus)10.(Syntrophobotulus)11.(Thermincola)12.(Thermoterrabacterium)6.消化链球菌科(Peptostreptococcaceae)1.(Anaerococcus)2.(Filifactor)3.(Finegoldia)4.(Fusibacter)5.(Gallicola)6.(Helcococcus)7.微单胞菌属(Parvimonas) （原名Micromonas）8.(Peptoniphilus)9.消化链球菌属(Peptostreptococcus)10.(Sedimentibacter)11.(Sporanaerobacter)12.(Tissierella)7.互营单胞菌科(Syntrophomonadaceae)1.(Aminiphilus)2.(Aminobacterium)3.(Aminomonas)4.(Anaerobaculum)5.(Anaerobranca)6.(Caldicellulosiruptor)7.(Carboxydocella)8.(Dethiosulfovibrio)9.(Pelospora)10.互营单胞菌属(Syntrophomonas)11.(Syntrophospora)12.互营热菌属(Syntrophothermus)13.(Thermaerobacter)14.(Thermanaerovibrio)15.(Thermohydrogenium)16.(Thermosyntropha)17.(Thermovirga)8.韦荣氏菌科(Veillonellaceae)1.(Acetonema)2.氨基酸球菌属(Acidaminococcus)3.(Allisonella)4.(Anaeroarcus)5.(Anaeroglobus)6.(Anaeromusa)7.(Anaerosinus)8.(Anaerovibrio)9.(Centipeda)10.(Dendrosporobacter)11.(Dialister)12.(Megamonas)13.(Megasphaera)14.光冈菌属(Mitsuokella)15.(Papillibacter)16.(Pectinatus)17.(Pelosinus)18.(Phascolarctobacterium)19.(Propionispira)20.(Propionispora)21.(Quinella)22.(Schwartzia)23.新月形单胞菌属(Selenomonas)24.鼠孢菌属(Sporomusa)25.(Sporotalea)26.(Succiniclasticum)27.(Succinispira)28.(Thermosinus)29.韦荣氏菌属(Veillonella)30.(Zymophilus)9.科未定1.(Anaerovirgula)2.(Dethiosulfatibacter)3.(Geosporobacter)4.(Howardella)5.(Proteiniborus)2.盐厌氧菌目(Halanaerobiales)1.盐厌氧菌科(Halanaerobiaceae)1.盐厌氧菌属(Halanaerobium)2.(Halocella)3.(Haloincola)4.(Halothermothrix)2.盐拟杆菌科(Halobacteroidaceae)1.(Acetohalobium)2.(Halanaerobacter)3.盐拟杆菌属(Halobacteroides)4.(Halonatronum)5.(Natroniella)6.(Orenia)7.(Selenihalanaerobacter)8.(Sporohalobacter)3.盐碱厌氧菌目(Natranaerobiales)1.盐碱厌氧菌科(Natranaerobiaceae)1.盐碱厌氧菌属(Natranaerobius)4.热厌氧杆菌目(Thermoanaerobacteriales)1.热厌氧杆菌科(Thermoanaerobacteriaceae)1.(Acetogenium)2.(Ammonifex)3.(Caldanaerobacter)4.(Carboxydibrachium)5.(Coprothermobacter)6.(Desulfovirgula)7.(Gelria)8.(Mahella)9.(Moorella)10.(Sporotomaculum)11.(Tepidanaerobacter)12.(Thermacetogenium)13.热厌氧单胞菌属(Thermanaeromonas)14.(Thermoanaerobacter)15.(Thermoanaerobium)16.(Thermoanaerobacterium)17.热厌氧菌属(Thermoanaerobium)18.(Thermobacteroides)19.(Thermosediminibacter)20.(Thermovenabulum)2.热脱硫菌科(Thermodesulfobiaceae)1.热脱硫菌属(Thermodesulfobium) 5.目未定1.(Desulfitibacter)2.(Symbiobacterium)热石杆菌纲(Thermolithobacteria)1.热石杆菌目(Thermolithobacterales)1.热石杆菌科(Thermolithobacteraceae)1.热石杆菌属(Thermolithobacter) 梭杆菌门(Fusobacteria)梭杆菌纲(Fusobacteria)1.梭杆菌目(Fusobacteriales)1.梭杆菌科(Fusobacteriaceae)1.梭杆菌属(Fusobacterium)2.(Ilyobacter)3.纤毛菌属(Leptotrichia)4.(Propionigenium)5.(Sebaldella)6.(Sneathia)7.(Streptobacillus)2.科未定1.(Cetobacterium)芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes)1.芽单胞菌目(Gemmatimonadales)1.芽单胞菌科(Gemmatimonadaceae)1.芽单胞菌属(Gemmatimonas)黏胶球形菌门(Lentisphaerae)黏胶球形菌纲(Lentisphaerae)1.黏胶球形菌目(Lentisphaerales)1.黏胶球形菌科(Lentisphaeraceae)1.黏胶球形菌属(Lentisphaera)2.食物谷菌目(Victivallales)1.食物谷菌科(Victivallaceae)1.食物谷菌属(Victivallis)硝化螺旋菌门(Nitrospirae)硝化螺旋菌纲(Nitrospira)1.硝化螺旋菌目(Nitrospirales)1.硝化螺旋菌科(Nitrospiraceae)1.钩端螺菌属(Leptospirillum)2.硝化螺旋菌属(Nitrospira)3.磁杆菌属(Magnetobacterium)*4.热脱硫弧菌属(Thermodesulfovibrio) 浮霉菌门(Planctomycetes)浮霉菌纲(Planctomycetacia)1.浮霉菌目(Planctomycetales)1.浮霉菌科(Planctomycetaceae)1.(Blastopirellula)2.(Gemmata)3.(Isosphaera)4.小梨形菌属(Pirellula)5.浮霉菌属(Planctomycetes)6.红小梨形菌属(Rhodopirellula)7.(Schlesneria)2.科未定（均未能分离培养，见厌氧氨氧化菌）1.(Brocadia)*2.(Kuenenia)*3.(Scalindua)*海绵杆菌门(Poribacteria)*变形菌门(Proteobacteria)α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)1.柄杆菌目(Caulobacterales)1.柄杆菌科(Caulobacteraceae)1.(Asticcacaulis)2.短波单胞菌属(Brevundimonas)3.柄杆菌属(Caulobacter)4.苯基杆菌属(Phenylobacterium)2.(Kordiimonadales)1.(Kordiimonadaceae)1.(Kordiimonas)3.短小盒菌目(Parvularculales)1.短小盒菌科(Parvularculaceae)1.短小盒菌属(Parvularcula)4.根瘤菌目(Rhizobiales)1.橙单胞菌科(Aurantimonadaceae)1.橙单胞菌属(Aurantimonas)2.(Fulvimarina)3.(Martelella)2.巴通体科(Bartonellaceae)1.巴通体属(Bartonella)3.(Rochalimaea)3.拜叶林克氏菌科(Beijerinckiaceae)1.拜叶林克氏菌属(Beijerinckia)2.(Chelatococcus)3.(Methylocapsa)4.(Methylocella)4.慢生根瘤菌科(Bradyrhizobiaceae)1.阿菲波菌属(Afipia)2.农单胞菌属(Agromonas)3.(Balneimonas)4.芽生杆菌属(Blastobacter)5.(Bosea)6.慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)7.硝化杆菌属(Nitrobacter)8.(Oligotropha)9.(Rhodoblastus)10.红假单胞菌属(Rhodopseudomonas) 5.布鲁氏菌科(Brucellaceae)1.布鲁氏菌属(Brucella)2.(Crabtreella)3.(Daeguia)4.支动菌属(Mycoplana)5.苍白杆菌属(Ochrobactrum)6.(Pseudochrobactrum)6.黏着杆菌科(Cohaesibacteraceae)1.黏着杆菌属(Cohaesibacter)7.生丝微菌科(Hyphomicrobiaceae)1.(Ancalomicrobium)2.(Angulomicrobium)3.水杆菌属(Aquabacter)4.芽绿菌属(Blastochloris)5.(Devosia)6.(Dichotomicrobium)7.(Filomicrobium)8.(Gemmiger)9.生丝微菌属(Hyphomicrobium)10.(Methylorhabdus)11.土微菌属(Pedomicrobium)12.突柄微菌属(Prosthecomicrobium)13.红微菌属(Rhodomicrobium)14.(Rhodoplanes)15.(Seliberia)8.甲基杆菌科(Methylobacteriaceae)。
细菌分类表
细菌分类表细菌分类表1 酸杆菌门(Acidobacteria)o 1.1 酸杆菌纲(Acidobacteria)o 1.2 全噬菌纲(Holophagae)2 放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌）o 2.1 放线菌纲(Actinobacteria)3 产水菌门(Aquificae)o 3.1 产水菌纲(Aquificae)4 拟杆菌门(Bacteroidetes)o 4.1 拟杆菌纲(Bacteroidetes)o 4.2 黄杆菌纲(Flavobacteria)o 4.3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)o 4.4 纲未定5 衣原体门(Chlamydiae)o 5.1 衣原体纲(Chlamydiae)6 绿菌门(Chlorobi)o 6.1 绿菌纲(Chlorobia)7 绿弯菌门(Chloroflexi)o7.1 厌氧绳菌纲(Anaerolineae)o7.2 暖绳菌纲(Caldilineae)o7.3 绿弯菌纲(Chloroflexi)8 产金菌门(Chrysiogenetes)o8.1 产金菌纲(Chrysiogenetes)9 蓝藻门(Cyanobacteria)o9.1 蓝藻纲(Cyanobacteria)10 脱铁杆菌门(Deferribacteres)o10.1 脱铁杆菌纲(Deferribacteres)11 异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus)o11.1 异常球菌纲(Deinococci)12 网团菌门(Dictyoglomi)o12.1 网团菌纲(Dictyoglomi)13 纤维杆菌门(Fibrobacteres)o13.1 纤维杆菌纲(Fibrobacteres)14 厚壁菌门(Firmicutes)（低G+C革兰氏阳性菌）o14.1 芽孢杆菌纲(Bacilli)o14.2 梭菌纲(Clostridia)o14.3 热石杆菌纲(Thermolithobacteria) ?15 梭杆菌门(Fusobacteria)o15.1 梭杆菌纲(Fusobacteria)16 芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)o16.1 芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes) ?17 黏胶球形菌门(Lentisphaerae)o17.1 黏胶球形菌纲(Lentisphaerae)18 硝化螺旋菌门(Nitrospirae)o18.1 硝化螺旋菌纲(Nitrospira)19 浮霉菌门(Planctomycetes)o19.1 浮霉菌纲(Planctomycetacia)20 海绵杆菌门(Poribacteria)21 变形菌门(Proteobacteria)o21.1 α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)o21.2 β-变形菌纲(Betaproteobacteria)o21.3 δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)o21.4 ε-变形菌纲(Epsilonproteobacteria)o21.5 γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)22 螺旋体门(Spirochaetes)o22.1 螺旋体纲(Spirochaetes)23 柔膜菌门(Tenericutes)o23.1 柔膜菌纲(Mollicutes)24 热脱硫杆菌门(Thermodesulfobacteria)o24.1 热脱硫杆菌纲(Thermodesulfobacteria) ?25 热微菌门(Thermomicrobia)o25.1 热微菌纲(Thermomicrobia)26 热袍菌门(Thermotogae)o26.1 热袍菌纲(Thermotogae)27 疣微菌门(Verrucomicrobia)o27.1 丰祐菌纲(Opitutae)o27.2 疣微菌纲(Verrucomicrobiae)28 门未定o纤线杆菌纲(Ktedonobacteria)o纲未定1.酸杆菌门(Acidobacteria)1.1 酸杆菌纲(Acidobacteria)1.酸杆菌目(Acidobacteriales)1.酸杆菌科(Acidobacteriaceae)1.酸杆菌属(Acidobacterium)2.(Edaphobacter)3.(Terriglobus)1.2 全噬菌纲(Holophagae)1.石鳖杆菌目(Acanthopleuribacterales)1.石鳖杆菌科(Acanthopleuribacteraceae)1.石鳖杆菌属(Acanthopleuribacter)2.全噬菌目(Holophagales)1.全噬菌科(Holophagaceae)1.地发菌属(Geothrix)2.全噬菌属(Holophaga)2.放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌）2.1 放线菌纲(Actinobacteria)1.酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)1.酸微菌目(Acidimicrobiales) 1.酸微菌亚目(Acidimicrobineae) 1.酸微菌科(Acidimicrobiaceae)1.酸微菌属(Acidimicrobium)2.(Iamiaceae)1.(Iamia)2.放线菌亚纲(Actinobacteridae) 1.放线菌目(Actinomycetales) 1.放线菌亚目(Actinomycineae) 1.放线菌科(Actinomycetaceae)1.放线棒菌属(Actinobaculum)2.放线菌属(Actinomyces)3.隐秘杆菌属(Arcanobacterium)4.(Falcivibrio)5.动弯杆菌属(Mobiluncus)6.(Varibaculum)2.(Actinopolysporineae)1.(Actinopolysporaceae)1.(Actinopolyspora)3.(Catenulisporineae)1.(Actinospicaceae)1.(Actinospica)2.(Catenulisporaceae)1.(Catenulispora)4.棒杆菌亚目(Corynebacterineae) 1.棒杆菌科(Corynebacteriaceae)1.(Bacterionema)2.(Caseobacter)3.棒杆菌属(Corynebacterium)4.(Turicella)2.迪茨氏菌科(Dietziaceae)1.迪茨氏菌属(Dietzia)3.分枝杆菌科(Mycobacteriaceae) 1.分枝杆菌属(Mycobacterium)4.诺卡氏菌科(Nocardiaceae)1.戈登氏菌属(Gordonia)2.(Micropolyspora)3.(Millisia)4.诺卡氏菌属(Nocardia)5.红球菌属(Rhodococcus)6.斯科曼氏菌属(Skermania)7.(Williamsia)8.(Smaragdicoccus)5.(Segniliparaceae)1.(Segniliparus)6.束村氏菌科(Tsukamurellaceae) 1.束村氏菌属(Tsukamurella)5.弗兰克氏菌亚目(Frankineae)1.酸热菌科(Acidothermaceae)1.酸热菌属(Acidothermus)2.弗兰克氏菌科(Frankiaceae)1.弗兰克氏菌属(Frankia)3.地嗜皮菌科(Geodermatophilaceae)1.芽球菌属(Blastococcus)2.地嗜皮菌属(Geodermatophilus)3.(Modestobacter)4.(Kineosporiaceae)1.(Cryptosporangium)2.(Kineococcus)3.(Kineosporia)5.(Nakamurellaceae)1.(Humicoccus)2.(Nakamurella)3.(Quadrisphaera)6.孢鱼菌科(Sporichthyaceae)1.孢鱼菌属(Sporichthya)6.糖霉菌亚目(Glycomycineae)1.糖霉菌科(Glycomycetaceae)1.糖霉菌属(Glycomyces)2.(Stackerbrandtia)7.微球菌亚目(Micrococcineae)1.获山氏菌科(Beutenbergiaceae)1.获山氏菌属(Beutenbergia)2.乔治菌属(Georgenia)3.萨勒河菌属(Salana)2.博戈里亚湖菌科(Bogoriellaceae)1.博戈里亚湖菌属(Bogoriella)3.短杆菌科(Brevibacteriaceae)1.短杆菌属(Brevibacterium)4.纤维素单胞菌科(Cellulomonadaceae)1.纤维素单胞菌属(Cellulomonas)2.厄氏菌属(Oerskovia)3.(Tropheryma)5.(Dermabacteraceae)1.(Brachybacterium)2.(Dermabacter)6.(Dermacoccaceae)1.(Demetria)2.(Dermacoccus)3.(Kytococcus)7.(Dermatophilaceae)1.(Dermatophilus)2.(Kineosphaera)8.(Intrasporangiaceae)1.(Arsenicicoccus)2.(Humihabitans)3.(Intrasporangium)4.(Janibacter)5.(Knoellia)6.(Kribbia)7.(Lapillicoccus)8.(Ornithinicoccus)9.(Ornithinimicrobium)10.(Oryzihumus)11.(Serinicoccus)12.(Terrabacter)13.(Terracoccus)14.(Tetrasphaera)9.(Jonesiaceae)1.(Jonesia)10.(Microbacteriaceae)1.(Agreia)2.(Agrococcus)3.(Agromyces)4.(Aureobacterium)5.(Clavibacter)6.(Cryobacterium)7.(Curtobacterium)8.(Frigoribacterium)9.(Frondicola)10.(Gulosibacter)11.(Labedella)12.(Leifsonia)13.(Leucobacter)14.(Microbacterium)15.(Microcella)16.(Mycetocola)17.(Okibacterium)18.(Plantibacter)19.(Pseudoclavibacter)20.(Rathayibacter)21.(Rhodoglobus)22.(Salinibacterium)23.(Subtercola)24.(Yonghaparkia)25.(Zimmermannella)11.微球菌科(Micrococcaceae)1.(Acaricomes)2.节杆菌属(Arthrobacter)3.(Citricoccus)4.(Kocuria)5.微球菌属(Micrococcus)6.(Nesterenkonia)7.(Renibacterium)8.罗氏菌属(Rothia)9.口腔球菌属(Stomatococcus)10.刘志恒菌属(Zhihengliuella) 12.(Promicromonosporaceae)1.(Cellulosimicrobium)2.(Isoptericola)3.(Myceligenerans)4.(Promicromonospora)5.(Xylanibacterium)6.(Xylanimonas)13.(Rarobacteraceae)1.(Rarobacter)14.(Sanguibacteraceae)1.血杆菌属(Sanguibacter)15.(Yaniaceae)1.(Yania)16.科未定1.(Actinotalea)2.(Demequina)3.(Phycicoccus)4.(Ruania)8.微单孢菌亚目(Micromonosporineae) 1.微单孢菌科(Micromonosporaceae)1.(Actinocatenispora)2.(Actinoplanes)3.(Amorphosporangium)4.(Ampullariella)5.(Asanoa)6.(Catellatospora)7.(Catenuloplanes)8.(Couchiolanes)9.(Dactylosporangium)10.(Krasilnikovia)11.(Longispora)12.(Luedemannella)13.微单孢菌属(Micromonospora)14.(Pilimelia)15.(Planopolyspora)16.(Polymorphospora)17.(Salinispora)18.(Spirilliplanes)19.(Verrucosispora)20.(Virgisporangium)9.丙酸杆菌亚目(Propionibacterineae) 1.(Nocardioidaceae)1.(Actinopolymorpha)2.(Aeromicrobium)3.(Friedmanniella)4.(Hongia)5.(Kribbella)6.(Marmoricola)7.(Micropruina)8.(Nocardioides)9.(Pimelobacter)10.(Propionicicella)11.(Propionicimonas)2.丙酸杆菌科(Propionibacteriaceae)1.河口微菌属(Aestuariimicrobium)2.(Arachnia)3.(Brooklawnia)4.(Granulicoccus)5.江氏菌属(Jiangella)6.(Luteococcus)7.(Microlunatus)8.丙酸杆菌属(Propionibacterium)9.(Propioniferax)10.(Propionimicrobium)11.(Tessaracocccus)10.(Pseudonocardineae)1.(Actinosynnemataceae)1.(Actinokineospora)2.(Actinosynnema)3.(Lechevalieria)4.(Lentzea)5.(Saccharothrix)6.(Umezawaea)2.(Pseudonocardiaceae)1.(Actinoalloteichus)2.(Actinobispora)3.(Amycolata)4.(Amycolatopsis)5.(Crossiella)6.(Faenia)7.(Goodfellowia)8.(Kibdelosporangium)9.(Kutzneria)10.(Prauserella)11.(Pseudoamycolata)12.(Pseudonocardia)13.(Saccharomonospora)14.(Saccharopolyspora)15.(Streptoalloteichus)16.(Thermobispora)17.(Thermocrispum)11.链霉菌亚目(Streptomycineae) 1.链霉菌科(Sterptomycetaceae)1.(Actinopycnidium)2.(Actinosporangium)3.(Chainia)4.(Elytrosporangium)5.北里菌属(Kitasatoa)6.北里孢菌属(Kitasatospora)7.(Microellobosporia)8.(Streptacidiphilus)9.链霉菌属(Streptomyces)10.(Streptoverticillium)12.(Streptosporangineae)1.(Nocardiopsaceae)1.(Nocardiopsis)2.(Streptomonospora)3.(Thermobifida)2.(Streptosporangiaceae)1.(Acrocarpospora)2.(Herbidospora)3.(Microbispora)4.(Microtetraspora)5.(Nonomuraea)6.(Planobispora)7.(Planomonospora)8.(Planotetraspora)9.(Sphaerisporangium)10.(Streptosporangium)11.(Thermopolyspora)3.(Thermomonosporaceae)1.珊瑚状放线菌属(Actinocorallia)2.(Actinomadura)3.(Excellospora)4.(Spirillospora)5.(Thermomonospora)2.双歧杆菌目(Bifidobacteriales) 1.双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)1.(Aeriscardovia)2.(Alloscardovia)3.双歧杆菌属(Bifidobacterium)4.(Gardnerella)5.(Metascardovia)6.(Parascardovia)7.(Scardovia)2.科未定3.(Coriobacteridae)1.(Coriobacteriales)1.(Coriobacterineae)1.(Coriobacteriaceae)1.奇异菌属(Atopobium)2.(Collinsella)3.(Coriobacterium)4.(Cryptobacterium)5.(Denitrobacterium)6.(Eggerthella)7.(Olsenella)8.(Slackia)4.红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae) 1.红色杆菌目(Rubrobacterales) 1.红色杆菌亚目(Rubrobacterineae) 1.(Conexibacteraceae)1.(Conexibacter)2.(Patulibacteraceae)1.(Patulibacter)3.红色杆菌科(Rubrobacteraceae)1.红色杆菌属(Rubrobacter)4.(Solirubrobacteraceae)1.(Solirubrobacter)5.(Thermoleophilaceae)1.(Thermoleophilum)5.球形杆菌亚纲(Sphaerobacteridae)1.球形杆菌目(Sphaerobacterales)1.球形杆菌亚目(Sphaerobacterineae)1.球形杆菌科(Sphaerobacteraceae)1.球形杆菌属(Sphaerobacter) 3.产水菌门(Aquificae) 3.1 产水菌纲(Aquificae)1.产水菌目(Aquificales)1.产水菌科(Aquificaceae)1.产水菌属(Aquifex)2.(Calderobacterium)3.(Hydrogenivirga)4.(Hydrogenobacter)5.(Hydrogenobaculum)6.(Thermocrinis)2.除硫杆菌科(Desulfurobacteriaceae)1.(Balnearium)2.除硫杆菌属(Desulfurobacterium)3.热弧菌属(Thermovibrio)3.(Hydrogenothermaceae)1.(Hydrogenothermus)2.(Persephonella)3.(Sulfurihydrogenibium)4.拟杆菌门(Bacteroidetes)4.1 拟杆菌纲(Bacteroidetes)1.拟杆菌目(Bacteroidales)1.拟杆菌科(Bacteroidaceae)1.(Acetomicrobium)2.(Anaerophaga)3.(Anaerorhabdus)4.拟杆菌属(Bacteroides)5.(Pontibacter)2.紫单胞菌科(Porphyromonadaceae)1.(Barnesiella)2.(Capsularis)3.(Dysgonomonas)4.(Hallella)5.(Odoribacter)6.(Oribaculum)7.(Paludibacter)8.(Parabacteroides)9.紫单胞菌属(Porphyromonas)10.(Proteiniphilum)11.(Tannerella)12.(Xylanibacter)3.普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)1.普雷沃氏菌属(Prevotella)4.理研菌科(Rikenellaceae)1.(Alistipes)2.(Alkaliflexus)3.(Marinilabilia)4.(Petrimonas)5.理研菌属(Rikenella)5.科未定1.(Acetofilamentum)2.(Acetothermus)4.2 黄杆菌纲(Flavobacteria)1.黄杆菌目(Flavobacteriales)1.蟑螂杆状体科(Blattabacteriaceae)1.蟑螂杆状体属(Blattabacterium)2.(Cryomorphaceae)1.(Algoriphagus)2.(Brumimicrobium)3.(Crocinitomix)4.(Cryomorpha)5.(Fluviicola)6.李时珍菌属(Lishizhenia)7.(Owenweeksia)3.黄杆菌科(Flavobacteriaceae)1.(Actibacter)2.(Aequorivita)3.(Algibacter)4.(Aquimarina)5.(Arenibacter)6.伯杰菌属(Bergeyella)7.(Bizionia)8.碳酸噬胞菌属(Capnocytophaga)9.噬纤维素菌属(Cellulophaga)10.金黄杆菌属(Chryseobacterium)11.(Cloacibacterium)12.(Coenonia)13.(Costertonia)14.(Croceibacter)15.独岛菌属(Dokdonia)16.东海菌属(Donghaeana)17.(Elizabethkingia)18.(Empedobacter)19.(Epilithonimonas)20.(Flaviramulus)21.黄杆菌属(Flavobacterium)22.(Formosa)23.泥滩杆菌属(Gaetbulibacter)24.泥滩微菌属(Gaetbulimicrobium)25.(Galbibacter)26.(Gelidibacter)27.(Gillisia)28.(Gilvibacter)29.革兰菌属(Gramella)30.(Kaistella)31.(Kordia)32.(Krokinobacter)33.(Lacinutrix)34.列文虎克菌属(Leeuwenhoekiella)35.(Lutibacter)36.(Maribacter)37.(Mariniflexile)38.(Marixanthomonas)39.(Mesonia)40.(Muricauda)41.(Myroides)42.(Nonlabens)43.(Olleya)44.(Ornithobacterium)45.(Persicivirga)46.(Pibocella)47.极地杆菌属(Polaribacter)48.冷弯菌属(Psychroflexus)49.(Psychroserpens)50.(Riemerella)51.(Robiginitalea)52.(Salegentibacter)53.(Sandarakinotalea)54.(Sediminibacter)55.(Sediminicola)56.世宗菌属(Sejongia)57.(Stanierella)58.(Stenothermobacter)59.(Subsaxibacter)60.(Subsaximicrobium)61.(Tamlana)62.(Tenacibaculum)63.(Ulvibacter)64.(Vitellibacter)65.(Wautersiella)66.(Weeksella)67.(Winogradskyella)68.丽水菌属(Yeosuana)69.(Zeaxanthinibacter)70.周氏菌属(Zhouia)71.(Zobellia)72.王祖农菌属(Zunongwangia) 4.3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)1.鞘脂杆菌目(Sphingobacteriales)1.泉发菌科(Crenotrichaceae)1.(Balneola)2.(Chitinophaga)3.泉发菌属(Crenothrix)4.(Rhodothermus)5.(Salinibacter)6.(Terrimonas)7.(Toxothrix)2.(Flammeovirgaceae)1.(Flammeovirga)2.(Flexithrix)3.(Perexilibacter)4.(Persicobacter)5.(Rapidithrix)6.(Sediminitomix)7.(Thermonema)3.屈挠杆菌科(Flexibacteraceae)1.(Adhaeribacter)2.(Aquiflexum)3.(Arcicella)4.(Belliella)5.(Chimaereicella)6.(Cyclobacterium)7.噬胞菌属(Cytophaga)8.(Dyadobacter)9.(Echinicola)10.(Effluviibacter)11.(Emticicia)12.(Fabibacter)13.(Flectobacillus)14.屈挠杆菌属(Flexibacter)15.(Hongiella)16.(Hymenobacter)17.(Larkinella)18.(Leadbetterella)19.(Marinicola)20.(Meniscus)21.(Microscilla)22.(Niastella)23.(Persicitalea)24.(Reichenbachiella)25.(Rhodonellum)26.(Roseivirga)27.(Runella)28.(Spirosoma)29.生孢噬胞菌属(Sporocytophaga) 4.腐螺旋菌科(Saprospiraceae)1.(Aureispira)2.(Haliscomenobacter)3.(Lewinella)4.腐螺旋菌属(Saprospira)5.鞘脂杆菌科(Sphingobacteriaceae)1.(Mucilaginibacter)2.(Olivibacter)3.(Parapedobacter)4.(Pedobacter)5.(Pseudosphingobacterium)6.鞘脂杆菌属(Sphingobacterium) 6.科未定1.(Niabella)4.4 纲未定1.(Flavisolibacter)2.(Fulvivirga)3.(Prolixibacter)5.衣原体门(Chlamydiae)5.1 衣原体纲(Chlamydiae)1.衣原体目(Chlamydiales)1.衣原体科(Chlamydiaceae)1.衣原体属(Chlamydia)2.嗜衣体属(Chlamydophila)2.副衣原体属(Parachlamydiaceae)1.新衣原体属(Neochlamydia)2.副衣原体属(Parachlamydia)3.芯卡体科(Simkaniaceae)1.芯卡体属(Simkania)2.棍衣原体属(Rhabdochlamydia)* 4.华诊体科(Waddliaceae)1.华诊体属(Waddlia)6.绿菌门(Chlorobi)6.1 绿菌纲(Chlorobia)1.绿菌目(Chlorobiales)1.绿菌科(Chlorobiaceae)1.臂绿菌属(Ancalochloris)2.绿棒菌属(Chlorobaculum)3.绿菌属(Chlorobium)4.绿爬菌属(Chloroherpeton)5.暗网菌属(Pelodictyon)6.突柄绿菌属(Prosthecochloris)7.绿弯菌门(Chloroflexi)7.1 厌氧绳菌纲(Anaerolineae)1.厌氧绳菌目(Anaerolineales)1.厌氧绳菌科(Anaerolineaceae)1.厌氧绳菌属(Anaerolinea)2.(Bellilinea)3.纤绳菌属(Leptolinea)4.(Levilinea)5.长绳菌属(Longilinea)7.2 暖绳菌纲(Caldilineae)1.暖绳菌目(Caldilineales)1.暖绳菌科(Caldilineaceae)1.暖绳菌属(Caldilinea)7.3 绿弯菌纲(Chloroflexi)1.绿弯菌目(Chloroflexales)1.绿弯菌科(Chloroflexaceae)1.绿弯菌属(Chloroflexus)2.绿线菌属(Chloronema)3.太阳发菌属(Heliothrix)4.玫瑰弯菌属(Roseiflexus)2.颤绿菌科(Oscillochloridaceae)1.颤绿菌属(Oscillochloris)2.爬管菌目(Herpetosiphonales)1.爬管菌科(Herpetosiphonaceae)1.爬管菌属(Herpetosiphon) 8.产金菌门(Chrysiogenetes) 8.1 产金菌纲(Chrysiogenetes)1.产金菌目(Chrysiogenales)1.产金菌科(Chrysiogenaceae)1.产金菌属(Chrysiogenes) 9.蓝藻门(Cyanobacteria)9.1 蓝藻纲(Cyanobacteria)1.色球藻目(Chroococcales)1.色球藻科(Chroococcaceae)1.管孢藻属(Chamaesiphon)2.色球藻属(Chroococcus)3.(Cyanobacterium)4.(Cyanobium)5.(Cyanothece)6.蓝纤维藻属(Dactylococcopsis)7.(Gloeobacter)8.黏球藻属(Gloeocapsa)9.黏杆藻属(Gloeothece)10.微囊藻属(Microcystis)11.原绿球藻属(Prochlorococcus)12.原绿藻属(Prochloron)13.聚球藻属(Synechococcus)14.集胞藻属(Synechocystis)2.宽球藻目(Pleurocapsales)1.蓝枝藻科(Hyellaceae)1.(Cyanocystis)2.(Dermocarpella)3.(Stanieria)4.异球藻属(Xenococcus)2.宽球藻科(Pleurocapsaceae)1.拟色球藻属(Chroococcidiopsis)2.黏囊藻属(Myxosarcina)3.宽球藻属(Pleurocapsa)3.颤藻目(Oscillatoriales)1.颤藻科(Oscillatoriaceae)1.节螺藻属(Arthrospira)2.(Borzia)3.(Crinalium)4.(Geitlerinema)5.盐螺旋藻属(Halospirulina)6.(Leptolyngbya)7.(Limnothrix)8.鞘丝藻属(Lyngbya)9.微鞘藻属(Microcoleus)10.颤藻属(Oscillatoria)11.(Planktothrix)12.原绿发藻属(Prochlorothrix)13.(Pseudanabaena)14.螺旋藻属(Spirulina15.(Starria)16.束藻属(Symploca)17.束毛藻属(Trichodesmium)18.(Tychonema)4.念珠藻目(Nostocales)1.念珠藻科(Nostocaceae)1.鱼腥藻属(Anabaena)2.项圈藻属(Anabaenopsis)3.束丝藻属(Aphanizomenon)4.(Cyanospira)5.(Cylindrospermopsis)6.筒孢藻属(Cylindrospermum)7.节球藻属(Nodularia)8.念珠藻属(Nostoc)9.伪枝藻属(Scytonema)2.胶须藻科(Rivulariaceae)1.眉藻属(Calothrix)2.胶须藻属(Rivularia)3.单歧藻属(Tolypothrix)5.真枝藻目(Stigonematales)1.真枝藻科(Stigonemataceae)1.(Chlorogloeopsis)2.费氏藻属(Fischerella)3.(Geitleria)4.(Iyengariella)5.拟念珠藻属(Nostochopsis)6.真枝藻属(Stigonema)10.脱铁杆菌门(Deferribacteres)10.1 脱铁杆菌纲(Deferribacteres)1.脱铁杆菌目(Deferribacterales)1.脱铁杆菌科(Deferribacteraceae)1.脱铁杆菌属(Deferribacter)2.(Denitrovibrio)3.(Flexistipes)4.地弧菌属(Geovibrio)5.(Mucispirillum)2.科未定1.暖发菌属(Caldithrix)2.(Synergistes)11.异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus) 11.1 异常球菌纲(Deinococci)1.异常球菌目(Deinococcales)1.异常球菌科(Deinococcaceae)1.异常杆菌属(Deinobacter)2.异常球菌属(Deinococcus)2.特吕珀菌科(Trueperaceae)1.特吕珀菌属(Truepera)2.栖热菌目(Thermales)1.栖热菌科(Thermaceae)1.海栖热菌属(Marinithermus)2.亚栖热菌属(Meiothermus)3.海洋栖热菌属(Oceanithermus)4.栖热菌属(Thermus)5.火山栖热菌属(Vulcanithermus)。
(完整版)常见细菌分类
肠杆菌1.肠杆菌属产气肠杆菌、阴沟肠杆菌、聚团肠杆菌、阿斯布肠杆菌、河生肠杆菌生物1群、河生肠杆菌生物2群、中间肠杆菌、格高非肠杆菌、阪崎肠杆菌、泰洛肠杆菌2.埃希菌属大肠埃希菌、福格森氏埃希菌、不活跃大肠埃希菌、伤口大肠埃希菌、赫尔曼氏埃希菌3.沙雷菌属粘质沙雷菌、深红沙雷菌、无花果沙雷菌、泉居沙雷菌、芳香沙雷菌1群、芳香沙雷菌2群、晋城沙雷菌、液化沙雷菌4.克雷伯菌属肺炎克雷伯菌、臭鼻克雷伯菌、鼻硬节克雷伯菌、产酸克雷伯菌、解鸟氨酸克雷伯菌5.变形杆菌属奇异变形杆菌属、普通变形杆菌、潘尼变形杆菌6.普罗威登斯菌属产碱普罗威登菌、斯图普罗威登菌、雷极普罗威登菌、拉氏普罗威登菌7.沙门菌属猪霍乱沙门菌、甲型副伤寒沙门菌、伤寒沙门菌、雏白利沙门菌8.枸橼酸杆菌弗旁地枸橼酸杆菌、异型枸橼酸杆菌、丙二酸盐阴性枸橼酸杆菌9.爱文菌属美洲爱文菌10.布特维西菌属水生布特维西菌11.爱德华菌属迟缓爱德华菌、保科爱德华菌12.巴提奥杆菌属乡间巴提奥杆菌13.哈夫尼亚菌属蜂房哈夫菌属14.西地西菌属戴氏西地西菌、拉氏西地西菌、奈氏西地西菌15.摩根菌属摩根摩根菌16志贺菌属志贺菌A，B，C 群、宋内志贺菌17.克吕沃菌属抗坏血酸克吕沃菌、栖冷克吕沃菌18．莱克勒菌属不脱羧莱克勒菌19 .默勒菌属威斯康星默勒菌20 拉恩菌属水生拉恩菌21.塔特姆菌属、痰塔特姆菌22．耶尔森菌属假结核耶尔森菌、小结肠炎耶尔森菌、中间耶尔森菌、克氏耶尔森菌、费氏耶尔森菌23．不动杆菌属洛菲不动杆菌、溶血不动杆菌、鲍曼不动杆菌、醋酸钙不动杆菌24. 寡养单胞菌属嗜麦芽窄单胞菌非发酵菌1.假单胞菌属铜绿假单胞菌、荧光假单胞菌、恶臭假单胞菌、施氏假单胞菌、门多萨假单胞菌、产碱假单胞菌、假产碱假单胞菌2.伯克霍尔德氏菌属鼻疽伯克霍尔德氏菌、假鼻疽伯克霍尔德氏菌、洋葱伯克霍尔德氏菌、唐菖蒲伯克霍尔德氏菌3.丛毛单胞菌属食酸丛毛单胞菌、睾丸酮丛毛单胞菌4.短波单胞菌属缺陷短波单胞菌、波囊短波单胞菌5.窄食单胞菌属嗜麦芽窄单胞菌6.产碱杆菌属木糖氧化产碱杆菌反硝化亚种、木糖氧化产碱杆菌木糖氧化亚种、粪产碱杆菌7. 不动杆菌属洛菲不动杆菌、醋酸钙不动杆菌、溶血不动杆菌、鲍曼不动杆菌8.黄杆菌属脑膜败血性黄杆菌、芳香黄杆菌、Ⅱb群黄杆菌、产吲哆黄杆菌9.威克斯菌属有毒威克斯菌、动物溃疡威克斯菌10.金色单胞菌属浅黄假单胞菌11.黄色单胞菌属栖稻假单胞菌12.弧菌属霍乱弧菌、副溶血弧菌、溶藻弧菌、河流弧菌、创伤弧菌13气单胞菌属嗜水气单胞菌、温和气单胞菌、杀鲑气单胞菌、舒伯特气单胞菌、豚鼠气单胞菌14邻单胞菌属类志贺邻单胞菌15巴斯德菌属多杀巴斯德菌、溶血巴斯德菌16莫拉氏菌属莫拉氏菌17谢瓦纳拉菌属腐败谢瓦纳拉菌.葡萄球菌/微球菌1．葡萄球菌属金黄色葡萄球菌，金黄色葡萄球菌厌氧亚种，表皮葡萄球菌，头葡萄球菌，解糖葡萄球菌，华纳葡萄球菌，溶血葡萄球菌，人葡萄球菌、路邓葡萄球菌、斯莱福葡萄球菌、耳葡萄球菌、腐生葡萄球菌、孔氏葡萄球菌、木糖葡萄球菌、阿莱特葡萄球菌、模仿葡萄球菌、中间葡萄球菌、猪葡萄球菌、缓慢葡萄球菌2. 微球菌属微球菌，易变微球菌，玫瑰微球菌，克里斯汀微球菌链球菌/肠球菌1肠球菌属酪黄肠球菌，粪肠球菌，屎肠球菌，鸟肠球菌，母鸡肠球菌，坚韧肠球菌2.草绿色链球菌属牛链球菌，唾液链球菌，血液链球菌，中间链球菌，缓症链球菌，变异链球菌群3.β溶血链球菌群化脓性链球菌，无乳链球菌，马链球菌，兽瘟链球菌，似马链球菌，停乳链球菌，β溶血链球菌4.咽峡炎链球菌群星座链球菌，咽峡炎链球菌5.孪生球菌属溶血孪生球菌，麻疹孪生球菌6.肺炎链球菌属肺炎链球菌7.气球菌属绿色气球菌真菌1.隐球菌属新型隐球菌，白色隐球菌，罗伦隐球菌，地生隐球菌，指甲隐球菌2.假丝酵母菌属白假丝酵母菌，白色假丝酵母菌生物变种，季也蒙假丝酵母菌，乳酒假丝酵母菌，克柔假丝酵母菌，溶脂假丝酵母菌，葡萄牙假丝酵母菌，近平滑假丝酵母菌、伪热带蒙假丝酵母菌、皱褶假丝酵母菌、热带假丝酵母菌、光滑假丝酵母菌、涏沫假丝酵母菌3.酵母属酿酒酵母菌4.丝孢酵母属白吉利丝孢酵母菌5.地霉属白地霉菌6.红酵母属粘红酵母菌，深红酵母菌7.毛孢子菌属白杰尔毛孢子菌8.地丝菌属念珠地丝菌。
(完整)细菌分类
环丝菌属（Brochothrix)李斯特氏菌属(Listeria) (Paenibacillaceae) (Ammoniphilus）（Aneurinibacillus) (Brevibacillus)(Cohnella)（Oxalophagus）（Paenibacillus)（Thermicanus)（Thermobacillus）(Planococcaceae)(Filibacter）(Kurthia）(Planococcus)（Planomicrobium)（Sporosarcina)芽孢乳杆菌科(Sporolactobacillaceae) (Marinococcus)（Sinococcus）芽孢乳杆菌属(Sporolactobacillus) （Tuberibacillus)葡萄球菌科（Staphylococcaceae）孪生菌属(Gemella)(Joetgalicoccus) （Macrococcus）(Salinicoccus）葡萄球菌属(Staphylococcus）（Thermoactinomycetaceae）(Laceyella）(Mechercharimyces) （Planifilum）(Seinonella) （Shimazuella) （Thermoactinomyces) (Thermoflavimicrobium）(Turicibacteraceae）（Turicibacter)科未定（Pullulanibacillus)乳杆菌目（Lactobacillales) 气球菌科(Aerococcaceae）（Abiotrophia）气球菌属（Aerococcus) (Dolosicoccus）（Eremococcus）（Facklamia）（Globicatella)（Ignavigranum）肉杆菌科（Carnobacteriaceae)（Agitococcus）(Alkalibacterium）(Allofustis)（Alloiococcus）(Atopococcus)（Atopostipes)肉杆菌属（Carnobacterium）德库菌属(Desemzia) （DSMZ,德国微生物与细胞保藏中心) （Dolosigranulum）（Granulicatella）（Isobaculum）(Lactosphaera)（Marinilactibacillus）（Trichococcus)肠球菌科(Enterococcaceae）（Atopobacter)（Catellicoccus)肠球菌属(Enterococcus）（Melissococcus）（Pilibacter)(Tetragenococcus)漫游球菌属（Vagococcus）乳杆菌科(Lactobacillaceae)乳杆菌属（Lactobacillus）(Paralactobacillus)片球菌属（Pediococcus)明串珠菌科（Leuconostocaceae）明串珠菌属（Leuconostoc) (Oenococcus）(Weissella)颤螺旋菌科(Oscillospiraceae）颤杆菌克（Oscillibacter)颤螺旋菌属(Oscillospira)链球菌科(Streptococcaceae）乳球菌属(Lactococcus）（Lactovum）链球菌属(Streptococcus）科未定（Acetoanaerobium）互营球菌属(Syntrophococcus）梭菌纲（Clostridia）梭菌目(Clostridiales）梭菌科(Clostridiaceae) (Acetanaerobacterium) (Acetivibrio）(Acidaminobacter)(Alkaliphilus) （Anaerobacter) （Anaerotruncus）(Anoxynatronum）(Bryantella) （Caloramator) (Caloranaerobacter) （Caminicella）(Clostridiisalibacter）梭菌属（Clostridium）(Coprobacillus）(Dorea）(Ethanoligenens）（Faecalibacterium) （Fastidiosipila) （Garciella）（Gracilibacter）(Guggenheimella）(Hespellia) (Natronincola）（Oxobacter) （Parasporobacterium）八叠球菌属（Sarcina) （Soehngenia）（Sporacetigenium）（Sporobacter) （Subdoligranulum) （Tepidibacter) (Tepidimicrobium) (Thermobrachium) (Thermohalobacter) (Tindallia）优杆菌科(Eubacteriaceae)醋杆菌属(Acetobacterium) （Alkalibacter) (Anaerofustis）（Anaerovorax)优杆菌属(Eubacterium) (Mogibacterium）（Pseudoramibacter)太阳杆菌科(Heliobacteriaceae）太阳杆状菌属（Heliobacillus) 太阳杆菌属(Heliobacterium)嗜日菌属（Heliophilum）(Heliorestis)毛螺旋菌科（Lachnospiraceae) (Acetitomaculum）(Anaerofilum）(Anaerostipes）丁酸弧菌属(Butyrivibrio）（Catenibacterium)(Catonella)粪球菌属(Coprococcus) （Johnsonella）(Lachnobacterium）毛螺旋菌属(Lachnospira) （Moryella)(Oribacterium）假丁酸弧菌属（Pseudobutyrivibrio）(Roseburia)瘤胃球菌属(Ruminococcus）(Shuttleworthia）(Sporobacterium)消化球菌科（Peptococcaceae）(Carboxydothermus）(Cryptanaerobacter）（Dehalobacter）(Desulfitobacterium）(Desulfonispora) （Desulfosporosinus) （Desulfotomaculum) (Pelotomaculum)消化球菌属（Peptococcus) (Syntrophobotulus）（Thermincola)(Thermoterrabacterium)消化链球菌科(Peptostreptococcaceae）（Anaerococcus)(Filifactor）（Finegoldia)(Fusibacter）（Gallicola)（Helcococcus）微单胞菌属（Parvimonas）（原名Micromonas）(Peptoniphilus)消化链球菌属(Peptostreptococcus）(Sedimentibacter)（Sporanaerobacter)（Tissierella）互营单胞菌科(Syntrophomonadaceae）(Aminiphilus）（Aminobacterium）（Aminomonas）（Anaerobaculum)(Anaerobranca)（Caldicellulosiruptor)（Carboxydocella) （Dethiosulfovibrio）（Pelospora）互营单胞菌属(Syntrophomonas) （Syntrophospora）互营热菌属(Syntrophothermus) （Thermaerobacter）(Thermanaerovibrio) （Thermohydrogenium）(Thermosyntropha）（Thermovirga）韦荣氏菌科(Veillonellaceae）（Acetonema）氨基酸球菌属(Acidaminococcus）(Allisonella）（Anaeroarcus) （Anaeroglobus) (Anaeromusa）(Anaerosinus) (Anaerovibrio）(Centipeda）（Dendrosporobacter) （Dialister）（Megamonas）(Megasphaera)光冈菌属(Mitsuokella) （Papillibacter）(Pectinatus）(Pelosinus) （Phascolarctobacterium) （Propionispira) (Propionispora）(Quinella)(Schwartzia）新月形单胞菌属（Selenomonas) 鼠孢菌属(Sporomusa）（Sporotalea) （Succiniclasticum）（Succinispira) (Thermosinus)韦荣氏菌属（Veillonella) （Zymophilus)科未定（Anaerovirgula）(Dethiosulfatibacter）（Geosporobacter) （Howardella) (Proteiniborus)盐厌氧菌目(Halanaerobiales）盐厌氧菌科（Halanaerobiaceae)盐厌氧菌属（Halanaerobium) (Halocella)（Haloincola)(Halothermothrix)盐拟杆菌科（Halobacteroidaceae）(Acetohalobium）（Halanaerobacter)盐拟杆菌属(Halobacteroides) (Halonatronum)（Natroniella）（Orenia）(Selenihalanaerobacter）（Sporohalobacter）盐碱厌氧菌目（Natranaerobiales）盐碱厌氧菌科（Natranaerobiaceae)盐碱厌氧菌属(Natranaerobius）热厌氧杆菌目(Thermoanaerobacteriales）热厌氧杆菌科(Thermoanaerobacteriaceae）(Acetogenium)(Ammonifex）(Caldanaerobacter）(Carboxydibrachium)（Coprothermobacter) (Desulfovirgula）(Gelria）（Mahella）(Moorella）(Sporotomaculum) （Tepidanaerobacter）（Thermacetogenium)热厌氧单胞菌属(Thermanaeromonas) （Thermoanaerobacter) (Thermoanaerobium) (Thermoanaerobacterium)热厌氧菌属（Thermoanaerobium) (Thermobacteroides）（Thermosediminibacter) （Thermovenabulum)热脱硫菌科（Thermodesulfobiaceae）热脱硫菌属（Thermodesulfobium）目未定(Desulfitibacter) （Symbiobacterium）热石杆菌纲(Thermolithobacteria)热石杆菌目（Thermolithobacterales）热石杆菌科(Thermolithobacteraceae）热石杆菌属（Thermolithobacter）梭杆菌门（Fusobacteria)梭杆菌纲（Fusobacteria）梭杆菌目（Fusobacteriales）梭杆菌科（Fusobacteriaceae)梭杆菌属(Fusobacterium）(Ilyobacter)纤毛菌属（Leptotrichia）（Propionigenium)（Sebaldella）（Sneathia)(Streptobacillus)科未定(Cetobacterium)芽单胞菌门(Gemmatimonadetes）芽单胞菌纲（Gemmatimonadetes)芽单胞菌目（Gemmatimonadales）芽单胞菌科(Gemmatimonadaceae）芽单胞菌属(Gemmatimonas）黏胶球形菌门（Lentisphaerae)黏胶球形菌纲(Lentisphaerae）黏胶球形菌目(Lentisphaerales)黏胶球形菌科（Lentisphaeraceae) 黏胶球形菌属（Lentisphaera)食物谷菌目（Victivallales）食物谷菌科（Victivallaceae）食物谷菌属(Victivallis)硝化螺旋菌门（Nitrospirae)硝化螺旋菌纲（Nitrospira)硝化螺旋菌目（Nitrospirales）硝化螺旋菌科（Nitrospiraceae）钩端螺菌属(Leptospirillum)硝化螺旋菌属(Nitrospira）磁杆菌属（Magnetobacterium）*热脱硫弧菌属(Thermodesulfovibrio）浮霉菌门（Planctomycetes）浮霉菌纲（Planctomycetacia）浮霉菌目(Planctomycetales）浮霉菌科(Planctomycetaceae) (Blastopirellula)(Gemmata)(Isosphaera）小梨形菌属(Pirellula)浮霉菌属（Planctomycetes)红小梨形菌属（Rhodopirellula）（Schlesneria）科未定（均未能分离培养，见厌氧氨氧化菌）(Brocadia)*(Kuenenia)＊(Scalindua）＊海绵杆菌门(Poribacteria)*变形菌门（Proteobacteria)α—变形菌纲（Alphaproteobacteria)柄杆菌目（Caulobacterales)柄杆菌科(Caulobacteraceae）(Asticcacaulis）短波单胞菌属(Brevundimonas)柄杆菌属（Caulobacter）苯基杆菌属(Phenylobacterium）（Kordiimonadales）（Kordiimonadaceae）（Kordiimonas）短小盒菌目（Parvularculales)短小盒菌科(Parvularculaceae）短小盒菌属(Parvularcula)根瘤菌目(Rhizobiales)橙单胞菌科（Aurantimonadaceae）橙单胞菌属（Aurantimonas）（Fulvimarina）（Martelella）巴通体科（Bartonellaceae)巴通体属(Bartonella) （Grahamella）（Rochalimaea）拜叶林克氏菌科（Beijerinckiaceae) 拜叶林克氏菌属(Beijerinckia) （Chelatococcus）(Methylocapsa)(Methylocella）慢生根瘤菌科（Bradyrhizobiaceae) 阿菲波菌属（Afipia)农单胞菌属（Agromonas) （Balneimonas)芽生杆菌属（Blastobacter）（Bosea)慢生根瘤菌属（Bradyrhizobium)硝化杆菌属(Nitrobacter）(Oligotropha）（Rhodoblastus)红假单胞菌属(Rhodopseudomonas）布鲁氏菌科（Brucellaceae）布鲁氏菌属（Brucella) （Crabtreella)（Daeguia）支动菌属(Mycoplana)苍白杆菌属（Ochrobactrum) （Pseudochrobactrum)黏着杆菌科(Cohaesibacteraceae) 黏着杆菌属（Cohaesibacter）生丝微菌科（Hyphomicrobiaceae) (Ancalomicrobium）(Angulomicrobium)水杆菌属(Aquabacter）芽绿菌属(Blastochloris）（Devosia）（Dichotomicrobium) (Filomicrobium)(Gemmiger)生丝微菌属(Hyphomicrobium）(Methylorhabdus)土微菌属（Pedomicrobium）突柄微菌属（Prosthecomicrobium) 红微菌属（Rhodomicrobium）（Rhodoplanes）（Seliberia）甲基杆菌科(Methylobacteriaceae）(Meganema)甲基杆菌属（Methylobacterium）（Microvirga）（Protomonas)甲基孢囊菌科（Methylocystaceae）(Albibacter)甲基孢囊菌属(Methylocystis) （Methylopila) （Methylosinus）（Pleomorphomonas）（Terasakiella）叶杆菌科（Phyllobacteriaceae) (Aminobacter）（Aquamicrobium）（Defluvibacter）（Hoeflea）中慢生根瘤菌属（Mesorhizobium) （Nitratireductor)叶杆菌属（Phyllobacterium) （Pseudaminobacter）根瘤菌科（Rhizobiaceae)土壤杆菌属(Agrobacterium）异根瘤菌属（Allorhizobium)嗜碳菌属(Carbophilus)螯合杆菌属(Chelatobacter)剑菌属（Ensifer)(Kaistia)韧皮杆菌属（Liberibacter)*根瘤菌属(Rhizobium）中华根瘤菌属(Sinorhizobium)红菌科(Rhodobiaceae) (Anderseniella) （Parvibaculum)红菌属(Rhodobium）玫瑰螺菌属(Roseospirillum）黄色杆菌科（Xanthobacteraceae) (Ancylobacter) (Azorhizobium)(Labrys）（Pseudolabrys）(Starkeya)黄色杆菌属（Xanthobacter)科未定（Sneathiella）红杆菌目（Rhodobacterales)生丝单胞菌科(Hyphomonadaceae) (Hirschia）生丝单胞菌属（Hyphomonas）(Maricaulis)（Oceanicaulis) （Robiginitomaculum)红杆菌科（Rhodobacteraceae）（Ahrensia）(Albidovulum）（Amaricoccus）(Antarctobacter) (Catellibacterium）（Citreicella）（Citreimonas）（Dinoroseobacter) （Donghicola）(Gemmobacter）(Haematobacter) （Jannaschia）（Ketogulonicigenium) (Labrenzia)(Leisingera）（Loktanella）（Maribius）（Marinovum) （Maritimibacter）（Methylarcula）（Nereida)（Nesiotobacter) (Oceanibulbus)海洋生菌属(Oceanicola) （Octadecabacter）（Palleronia) （Pannonibacter)副球菌属（Paracoccus) （Pelagibaca)(Phaeobacter）假红杆菌属（Pseudorhodobacter) （Pseudovibrio）（Rhodobaca）红杆菌属（Rhodobacter) (Rhodothalassium）小红卵菌属(Rhodovulum）(Roseibacterium) (Roseibium）（Roseicyclus）（Roseinatronobacter）(Roseisalinus）（Roseivivax）玫瑰杆菌属（Roseobacter）(Roseovarius）（Rubellimicrobium）(Rubrimonas）(Ruegeria)(Sagittula）(Salipiger)(Shimia)(Silicibacter）(Staleya)(Stappia）（Sulfitobacter) (Tateyamaria）（Thalassobacter) （Thalassobius）(Thalassococcus) (Thioclava)硫球形菌属（Thiosphaera) (Wenxinia)木洞菌属(Woodsholea)杨氏菌属(Yangia）红螺菌目(Rhodospirillales) 醋杆菌科(Acetobacteraceae)醋杆菌属(Acetobacter) (Acidicaldus)嗜酸菌属(Acidiphilium)酸球形菌属（Acidisphaera）酸胞菌属(Acidocella）酸单胞菌属（Acidomonas) (Asaia)(Belnapia)脆弱球菌属(Craurococcus）葡糖醋杆菌属（Gluconacetobacter) 葡糖杆菌属（Gluconobacter) (Granulibacter)(Kozakia）鼠球菌属（Muricoccus）（Neoasaia）(Paracraurococcus）红球状菌属（Rhodopila）(Rhodovarius)玫瑰球菌属(Roseococcus)玫瑰单胞菌属(Roseomonas) (Rubritepida)（Saccharibacter)(Stella)（Swaminathania）(Teichococcus) (Zavarzinia）红螺菌科（Rhodospirillaceae) 固氮螺菌属（Azospirillum) （Conglomeromonas）(Defluviicoccus）(Inquilinus）磁螺菌属(Magnetospirillum）(Phaeospirillum) (Rhodocista）红螺旋菌属（Rhodospira)红螺菌属(Rhodospirillum）红弧菌属（Rhodovibrio)玫瑰螺旋菌属（Roseospira) （Skermanella) (Telmatospirillum) （Thalassospira）（Tistrella）立克次体目(Rickettsiales）无形体科(Anaplasmataceae）(Aegyptianella)无形体属(Anaplasma) （Cowdria)埃里希体属（Ehrlichia）新立克次体属(Neorickettsia）沃巴赫体属（Wolbachia）（Xenohaliotis)*全孢菌科(Holosporaceae）全孢菌属（Holospora）立克次体科(Rickettsiaceae) (Orientia）立克次体属（Rickettsia）SAR 11群*远洋杆菌属（Pelagibacter)*科未定(Lyticum）（Odyssella)＊(Pseudocaedibacter）（Symbiotes）(Tectibacter)鞘脂单胞菌目(Sphingomonadales) 赤杆菌科（Erythrobacteraceae）（Altererythrobacter)赤杆菌属(Erythrobacter）赤微菌属（Erythromicrobium）紫杆菌属（Porphyrobacter）鞘脂单胞菌科（Sphingomonadaceae）芽单胞菌属(Blastomonas）柠檬酸微菌属（Citromicrobium）＊赤单胞菌属（Erythromonas）新鞘脂菌属（Novosphingobium）(Sandaracinobacter）(Sandaracinorhabdus）鞘脂菌属（Sphingobium）鞘脂单胞菌属（Sphingomonas) (Sphingopyxis）（Sphingosinicella）发酵单胞菌属(Zymomonas）目未定（Albimonas）(Caenispirillum）(Insolitispirillum）(Novispirillum)β-变形菌纲(Betaproteobacteria) 伯克氏菌目（Burkholderiales)产碱菌科(Alcaligenaceae)无色杆菌属（Achromobacter）(Advenella）产碱菌属(Alcaligenes) (Azohydromonas)博德氏菌属(Bordetella）(Brackiella）(Castellaniela)德克斯氏菌属（Derxia) (Kerstersia）（Oligella）(Pelistega) （Pigmentiphaga）（Pusillimonas）(Sutterella）（Taylorella）（Tetrathiobacter）伯克氏菌科（Burkholderiaceae）伯克氏菌属（Burkholderia) (Chitinimonas) (Cupriavidus）（Lautropia)(Limnobacter)(Pandoraea）(Paucimonas）（Polynucleobacter)青枯菌属（Ralstonia）(Thermothrix)沃特氏菌属（Wautersia）丛毛单胞菌科（Comamonadaceae) 食酸菌属（Acidovorax）(Alcycliphilus）（Brachymonas) (Caenibacterium) (Caldimonas）丛毛单胞菌属（Comamonas) (Curvibacter)代尔夫特菌属(Delftia) (Diaphorobacter）（Giesbergeria）噬氢菌属（Hydrogenophaga) (Hylemonella) (Lampropedia) (Macromonas）(Malikia)（Ottowia）(Pelomonas）(Polaromonas）（Ramlibacter)红育菌属（Rhodoferax）（Schlegelella）(Simplicispira）贪食菌属（Variovorax) （Xenophilus)草酸杆菌科(Oxalobacteraceae)(Collimonas) （Duganella) （Herbaspirillum）（Herminiimonas）（Janthinobacterium) (Massilia) （Naxibacter) (Oxalicibacterium）草酸杆菌属(Oxalobacter) (Telluria）(Undibacterium）科未定（Aquabacterium）（Aquincola）(Ideonella)纤发菌属（Leptothrix）（Methylibium）(Mitsuaria) （Paucibacter) (Roseateles)红长命菌属(Rubrivivax) (Sphaerotilus）(Tepidicella）（Tepidimonas）(Thiobacter)硫单胞菌属（Thiomonas) （Xylophilus）嗜氢菌目(Hydrogenophilales）嗜氢菌科（Hydrogenophilaceae）嗜氢菌属（Hydrogenophilus）(Petrobacter）（Tepidiphilus)硫杆状菌属(Thiobacillus）嗜甲基菌目(Methylophilales) 嗜甲基菌科(Methylophilaceae）(Methylobacillus）嗜甲基菌属（Methylophilus) (Methylotenera）（Methylovorus）奈瑟菌目(Neisseriales）奈瑟菌科(Neisseriaceae) （Alysiella）（Andreprevotia）水螺菌属（Aquaspirillum) （Aquitalea）(Bergeriella) (Chitinibacter) （Chitinilyticum)色杆菌属（Chromobacterium) （Conchiformibius）(Deefgea）艾肯氏菌属（Eikenella) （Formivibrio）(Gulbenkiania）(Iodobacter）金氏菌属（Kingella)鸥杆菌属(Laribacter)（Leeia）（Microvirgula）(Morococcus）奈瑟菌属（Neisseria) （Paludibacterium) （Prolinoborus）(Silvimonas）(Simonsiella）（Uruburuella）（Vitreoscilla）(Vogesella)亚硝化单胞菌目（Nitrosomonadales) 嘉利翁氏菌科（Gallionellaceae）嘉利翁氏菌属(Gallionella)亚硝化单胞菌科（Nitrosomonadaceae)亚硝化叶菌属（Nitrosolobus）亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)亚硝化螺旋菌属(Nitrosospira)螺菌科（Spirillaceae)螺菌属（Spirillum)普罗卡杆菌目（Procabacteriales)＊普罗卡杆菌科(Procabacteriaceae）＊普罗卡杆菌属（Procabacter）*红环菌目(Rhodocyclales）红环菌科(Rhodocyclaceae）固氮弓菌属(Azoarcus）(Azonexus)(Azospira）(Azovibrio)(Dechloromonas）（Dechlorosoma）（Denitratisoma）（Ferribacterium) (Methyloversatilis)丙酸杆菌属（Propionibacter）（Propionivibrio）(Quatrionicoccus）红环菌属(Rhodocyclus）(Shinella)(Sterolibacterium）陶厄氏菌属(Thauera) （Uliginosibacterium)动胶菌属（Zoogloea)δ—变形菌纲(Deltaproteobacteria）蛭弧菌目(Bdellovibrionales) (Bacteriovoracaceae) （Bacteriovorax)(Peredibacter）蛭弧菌科（Bdellovibrionaceae）蛭弧菌属（Bdellovibrio) （Micavibrio)(Vampirovibrio）脱硫盒菌目(Desulfarculales)脱硫盒菌科（Desulfarculaceae)脱硫盒菌属（Desulfarculus)脱硫杆菌目（Desulfobacterales）脱硫杆菌科(Desulfobacteraceae）(Desulfatibacillum) （Desulfatiferula）（Desulfatirhabdium)脱硫杆菌属（Desulfobacter) (Desulfobacterium) (Desulfobacula)（Desulfocella) （Desulfococcus) (Desulfofaba) (Desulfofrigus) (Desulfomusa）（Desulfonema）（Desulforegula）(Desulfosarcina）（Desulfospira）（Desulfotignum) （Desulfobulbaceae) （Desulfobulbus) (Desulfocapsa) （Desulfofustis）(Desulfopila) （Desulforhopalus）（Desulfotalea）(Nitrospinaceae) （Nitrospina)脱硫弧菌目(Desulfovibrionales) (Desulfohalobiaceae) （Desulfohalobium) （Desulfonatronovibrio)(Desulfothermus）（Desulfovermiculus) （Desulfomicrobiaceae）（Desulfomicrobium）（Desulfonatronaceae）（Desulfonatronum）脱硫弧菌科（Desulfovibrionaceae) (Bilophila）（Desulfomonas）脱硫弧菌属(Desulfovibrio) （Lawsonia）硫还原菌目（Desulfurellales)硫还原菌科（Desulfurellaceae）硫还原菌属(Desulfurella）（Hippea）除硫单胞菌目(Desulfuromonadales）除硫单胞菌科(Desulfuromonadaceae) 除硫单胞菌属（Desulfuromonas）（Desulfuromusa）(Malonomonas)(Pelobacter)地杆菌科（Geobacteraceae) （Geoalkalibacter)地杆菌属(Geobacter）（Geopsychrobacter）(Geothermobacter) (Trichlorobacter）黏球菌目(Myxococcales)孢囊杆菌亚目（Cystobacterineae) 孢囊杆菌科(Cystobacteraceae) （Anaeromyxobacter）(Archangium）孢囊杆菌属(Cystobacter）(Hyalangium)（Melittangium）(Stigmatella)黏球菌科（Myxococcaceae）(Angiococcus）(Corallococcus)黏球菌属（Myxococcus）(Pyxidicoccus)侏囊菌亚目（Nannocystineae）（Haliangiaceae) （Haliangium）(Kofleriaceae)（Kofleria）侏囊菌科(Nannocystaceae)(Enhygromyxa)侏囊菌属（Nannocystis）(Plesiocystis）堆囊菌亚目（Sorangineae）多囊菌科(Polyangiaceae) (Byssovorax）（Chondromyces) （Haploangium）*（Jahnella）多囊菌属(Polyangium）堆囊菌属(Sorangium)互营杆菌目(Syntrophobacterales) 互营菌科(Syntrophaceae) （Desulfobacca) （Desulfomonile)(Smithella)互营菌属(Syntrophus）互营杆菌科(Syntrophobacteraceae）(Desulfacinum) （Desulfoglaeba) (Desulforhabdus) （Desulfovirga)互营杆菌属（Syntrophobacter）(Thermodesulforhabdus)弯曲菌目(Campylobacterales）弯曲菌科(Campylobacteraceae）弓形杆菌属(Arcobacter）弯曲菌属（Campylobacter) (Dehalospirillum）硫磺单胞菌属(Sulfurospirillum）螺杆菌科（Helicobacteraceae）螺杆菌属(Helicobacter) （Sulfuricurvum) 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(Algicola)假交替单胞菌属（Pseudoalteromonas)冷单胞菌科(Psychromonadaceae）冷单胞菌属（Psychromonas）希万氏菌科（Shewanellaceae)希万氏菌属(Shewanella）科未定(Teredinibacter）(Endobugula）*心杆菌目(Cardiobacteriales) 心杆菌科(Cardiobacteriaceae）心杆菌属（Cardiobacterium) （Dichelobacter) （Suttonella）着色菌目(Chromatiales)着色菌科（Chromatiaceae) （Allochromatium) （Amoebobacter）着色菌属(Chromatium)盐着色菌属（Halochromatium) (Isochromatium) （Lamprobacter) (Lamprocystis）(Marichromatium)亚硝化球菌属(Nitrosococcus) 芬尼氏菌属(Pfennigia)棍着色菌属（Rhabdochromatium) (Rheinheimera)热着色菌属(Thermochromatium）硫橄榄菌属(Thiobaca）硫匣菌属(Thiocapsa)硫球菌属(Thiococcus）硫囊菌属（Thiocystis)硫网菌属（Thiodictyon)硫黄球菌属（Thioflavicoccus）硫盐匣菌属（Thiohalocapsa）(Thiolamprovum）（Thiopedia)硫红球菌属（Thiorhodococcus）硫红弧菌属（Thiorhodovibrio）硫螺菌属（Thiospirillum)外硫红螺旋菌科(Ectothiorhodospiraceae) 碱湖生菌属（Alkalilimnicola)碱螺菌属(Alkalispirillum) (Aquisalimonas）(Arhodomonas)(Ectothiorhodosinus)外硫红螺旋菌属（Ectothiorhodospira)盐红螺旋菌属(Halorhodospira）(Natronocella）硝化球菌属（Nitrococcus)硫碱螺旋菌属(Thioalkalispira）硫红螺旋菌属(Thiorhodospira)颗粒状球菌科（Granulosicoccaceae）颗粒状球菌属（Granulosicoccus)盐硫杆状菌科（Halothiobacillaceae)盐硫杆状菌属(Halothiobacillus) (Thiovirga）肠杆菌目（Enterobacteriales）肠杆菌科(Enterobacteriaceae) （Arsenophonus)（Brenneria)布赫纳氏菌属（Buchnera)(Budvicia)布丘氏菌属(Buttiauxella) (Calymmatobacterium）西地西菌属(Cedecea)柠檬酸杆菌属（Citrobacter)（Dickeya)爱德华氏菌属（Edwardsiella）肠杆菌属（Enterobacter)欧文氏菌属（Erwinia）埃希氏菌属（Escherichia）（包含大肠杆菌）(Ewingella)哈夫尼菌属(Hafnia）克雷伯氏菌属（Klebsiella）克吕沃氏菌属(Kluyvera) （Leclercia）(Leminorella）(Levinea）(Moellerella）（Morganella）（Obesumbacterium)泛菌属（Pantoea）（Pectobacterium）（Phlomobacter）* （Photorhabdus)邻单胞菌属(Plesiomonas）(Pragia)变形杆菌属(Proteus)普罗维登斯菌属（Providencia）（Rahnella)（Raoultella)糖杆菌属（Saccharobacter)沙门氏菌属(Salmonella) (Samsonia）沙雷氏菌属（Serratia)志贺氏菌属（Shigella) (Sodalis)(Tatumella）（Thorsellia)（Trabulsiella)(Wigglesworthia)致病杆菌属（Xenorhabdus）耶尔辛氏菌属（Yersinia）（包含鼠疫杆菌）（Yokenella)军团菌目(Legionellales)柯克斯体科（Coxiellaceae）（Aquicella）柯克斯体属（Coxiella）立克次小体属（Rickettsiella）军团菌科(Legionellaceae）（Fluoribacter)军团菌属(Legionella)(Sarcobium）(Tatlockia）甲基球菌目（Methylococcales)甲基球菌科(Methylococcaceae）甲基杆菌属（Methylobacter）甲基暖菌属（Methylocaldum）甲基球菌属(Methylococcus)甲基盐菌属（Methylohalobius）甲基微菌属（Methylomicrobium）甲基单胞菌属（Methylomonas)甲基八叠球菌属（Methylosarcina) (Methylosoma)甲基球形菌属(Methylosphaera)甲基热菌属（Methylothermus）海洋螺菌目(Oceanospirillales）食碱菌科（Alcanivoraceae）食碱菌属（Alcanivorax）（Fundibacter)（Kangiella）河氏菌科(Hahellaceae）（Endozoicomonas）河氏菌属(Hahella)(Halospina)（Zooshikella）盐单胞菌科(Halomonadaceae）（Carnimonas)色盐杆菌属(Chromohalobacter）(Cobetia）(Deleya）盐单胞菌属（Halomonas）（Halotalea)（Halovibrio）（Modicisalibacter)（Salicola)(Volcaniella)发酵杆菌属（Zymobacter)岸生菌科(Litoricolaceae）岸生菌属(Litoricola）海洋螺菌科(Oceanospirillaceae）(Amphritea）巴氏发菌属(Balneatrix）海单胞菌属（Marinomonas）海螺菌属(Marinospirillum）(Neptuniibacter）(Neptunomonas）(Nitrincola）海洋杆菌属（Oceanobacter)海洋螺菌属(Oceanospirillum）油螺旋菌属(Oleispira)假螺菌属(Pseudospirillum）(Reinekea)(Thalassolituus）嗜油菌科（Oleiphilaceae)嗜油菌属（Oleiphilus)糖螺菌科(Saccharospirillaceae）糖螺菌属（Saccharospirillum) 巴斯德氏菌目（Pasteurellales）巴斯德氏菌科（Pasteurellaceae）放线杆菌属(Actinobacillus）（Aggregatibacter) (Avibacterium）（Bibersteinia) (Gallibacterium)嗜血菌属（Haemophilus）（Histophilus）(Lonepinella)(Mannheimia）（Nicoletella）巴斯德氏菌属（Pasteurella）（Phocoenobacter) （Volucribacter)假单胞菌目（Pseudomonadales) 莫拉菌科(Moraxellaceae）不动杆菌属（Acinetobacter）（Alkanindiges）布兰汉氏菌（Branhamella) (Enhydrobacter)莫拉菌属（Moraxella) （Perlucidibaca）冷杆菌属（Psychrobacter)假单胞菌科(Pseudomonadaceae）（Azomonas）（Azomonotrichon）（Azorhizophilus)(Azotobacter）纤维弧菌属（Cellvibrio) （Chryseomonas)(Flavimonas）(Mesophilobacter)假单胞菌属(Pseudomonas)根瘤杆菌属(Rhizobacter)皱纹单胞菌属(Rugamonas）蛇形菌属（Serpens）咸水球形菌目（Salinisphaerales)咸水球形菌科（Salinisphaeraceae) 咸水球形菌属(Salinisphaera)硫发菌目(Thiotrichales）（Francisellaceae)(Francisella)鱼立克次体科（Piscirickettsiaceae) （Cycloclasticus）(Hydrogenovibrio) (Methylophaga)鱼立克次体属(Piscirickettsia) （Sulfurivirga）(Thioalkalimicrobium) (Thiomicrospira）硫发菌科(Thiotrichaceae) 无色菌属（Achromatium) 贝扎托菌属（Beggiatoa）亮发菌属(Leucothrix)硫杆菌属(Thiobacterium）硫珠菌属(Thiomargarita）硫辫菌属(Thioploca)硫螺旋菌属(Thiospira)硫发菌属(Thiothrix)科未定(Caedibacter)(Fangia）弧菌目(Vibrionales）弧菌科（Vibrionaceae) （Aliivibrio）异单胞菌属(Allomonas) （Beneckea)链状球菌属(Catenococcus）肠弧菌属(Enterovibrio) （Grimontia) (Listonella）（Lucibacterium）。
33种微生物细菌表格
阳性菌、凝固酶阴性菌。
MRSA 是医院感染最常见的致病菌
血浆凝固酶：鉴定致病性葡萄球菌的重要指 ⑴细胞壁成分：
标，包括游离凝血酶和结合凝血酶。
黏附素：包括脂磷壁酸和 F 蛋白
耐热核酸酶：由致病性葡萄球菌产生，耐热， M 蛋白：主要的致病因子。具有
能较强的降解 DNA 和 RNA。耐热核酸酶是
门菌产酸不产气外，其他均产酸产气。
++--。（可同沙门菌，志贺菌区别）
基上呈无色半透明菌落。
② 克氏双糖管：沙门菌斜面不发酵和底层产酸产气（但伤寒沙门菌
③ 克氏双糖管：斜面和底层均产酸产气
② 克氏双糖管：斜面不发酵，底层产酸不产气
产酸不产气）
硫化力试验阳性（可同沙门菌，志贺菌区别）
①分解葡萄糖、麦芽糖、乳糖、蔗糖， 大多数分解葡萄糖、麦芽糖，（鉴别淋病 只分解葡萄糖，产酸不产气。
气。
②链球菌一般不分解菊糖，不被胆汁 产酸不产气。
奈瑟菌），产酸不产气
氧化酶试验阳性
②致病性菌株能分解甘露醇，产酸。
溶解，可用来鉴别甲型溶血性链球菌 ②可以进行胆汁溶菌试验，菊糖分解
③触酶（过氧化氢酶）阳性，可与链球菌相区分。 和肺炎链球菌。链球菌不产生触酶。 试验
营养要求较高
营养要求较高
营养要求较高
营养要求较高
物
脂溶性色素使菌落着色
多数菌株周围易形成较宽的透明溶 在血平板上的菌落细小、形成草绿色 在 5%二氧化碳下生长更佳。培养基色似 在巧克力血琼脂平板上适宜。
血环。
α溶血环。
巧克力，故名巧克力培养基。
生化反应 ①多数能分解葡萄糖、麦芽糖、蔗糖，产酸不产 ①分解葡萄糖，产酸不产气。
抵抗力
(完整word版)细菌分类
环丝菌属(Brochothrix)李斯特氏菌属(Listeria) (Paenibacillaceae) (Ammoniphilus)(Aneurinibacillus)(Brevibacillus)(Cohnella)(Oxalophagus)(Paenibacillus)(Thermicanus)(Thermobacillus) (Planococcaceae)(Filibacter)(Kurthia)(Planococcus)(Planomicrobium)(Sporosarcina)芽孢乳杆菌科(Sporolactobacillaceae) (Marinococcus)(Sinococcus)芽孢乳杆菌属(Sporolactobacillus) (Tuberibacillus)葡萄球菌科(Staphylococcaceae)孪生菌属(Gemella) (Joetgalicoccus)(Macrococcus)(Salinicoccus)葡萄球菌属(Staphylococcus) (Thermoactinomycetaceae) (Laceyella)(Mechercharimyces)(Planifilum)(Seinonella)(Shimazuella) (Thermoactinomyces) (Thermoflavimicrobium) (Turicibacteraceae)(Turicibacter)科未定(Pullulanibacillus)乳杆菌目(Lactobacillales)气球菌科(Aerococcaceae) (Abiotrophia)气球菌属(Aerococcus)(Dolosicoccus)(Eremococcus)(Facklamia)(Globicatella)(Ignavigranum)肉杆菌科(Carnobacteriaceae)(Agitococcus)(Alkalibacterium)(Allofustis)(Alloiococcus)(Atopococcus)(Atopostipes)肉杆菌属(Carnobacterium)德库菌属(Desemzia) （DSMZ，德国微生物与细胞保藏中心）(Dolosigranulum)(Granulicatella)(Isobaculum)(Lactosphaera)(Marinilactibacillus)(Trichococcus)肠球菌科(Enterococcaceae)(Atopobacter)(Catellicoccus)肠球菌属(Enterococcus)(Melissococcus)(Pilibacter)(Tetragenococcus)漫游球菌属(Vagococcus)乳杆菌科(Lactobacillaceae)乳杆菌属(Lactobacillus)(Paralactobacillus)片球菌属(Pediococcus)明串珠菌科(Leuconostocaceae)明串珠菌属(Leuconostoc)(Oenococcus)(Weissella)颤螺旋菌科(Oscillospiraceae)颤杆菌克(Oscillibacter)颤螺旋菌属(Oscillospira)链球菌科(Streptococcaceae)乳球菌属(Lactococcus)(Lactovum)链球菌属(Streptococcus)科未定(Acetoanaerobium)互营球菌属(Syntrophococcus)梭菌纲(Clostridia)梭菌目(Clostridiales)梭菌科(Clostridiaceae) (Acetanaerobacterium) (Acetivibrio) (Acidaminobacter) (Alkaliphilus) (Anaerobacter) (Anaerotruncus) (Anoxynatronum) (Bryantella) (Caloramator) (Caloranaerobacter) (Caminicella) (Clostridiisalibacter)梭菌属(Clostridium) (Coprobacillus)(Dorea)(Ethanoligenens) (Faecalibacterium) (Fastidiosipila) (Garciella)(Gracilibacter) (Guggenheimella) (Hespellia)(Natronincola) (Oxobacter) (Parasporobacterium)八叠球菌属(Sarcina) (Soehngenia) (Sporacetigenium) (Sporobacter) (Subdoligranulum) (Tepidibacter) (Tepidimicrobium) (Thermobrachium) (Thermohalobacter) (Tindallia)优杆菌科(Eubacteriaceae)醋杆菌属(Acetobacterium) (Alkalibacter)(Anaerofustis)(Anaerovorax)优杆菌属(Eubacterium) (Mogibacterium) (Pseudoramibacter)太阳杆菌科(Heliobacteriaceae)太阳杆状菌属(Heliobacillus)太阳杆菌属(Heliobacterium)嗜日菌属(Heliophilum) (Heliorestis)毛螺旋菌科(Lachnospiraceae) (Acetitomaculum)(Anaerofilum)(Anaerostipes)丁酸弧菌属(Butyrivibrio) (Catenibacterium)(Catonella)粪球菌属(Coprococcus) (Johnsonella)(Lachnobacterium)毛螺旋菌属(Lachnospira) (Moryella)(Oribacterium)假丁酸弧菌属(Pseudobutyrivibrio) (Roseburia)瘤胃球菌属(Ruminococcus) (Shuttleworthia) (Sporobacterium)消化球菌科(Peptococcaceae) (Carboxydothermus) (Cryptanaerobacter) (Dehalobacter) (Desulfitobacterium) (Desulfonispora) (Desulfosporosinus) (Desulfotomaculum) (Pelotomaculum)消化球菌属(Peptococcus) (Syntrophobotulus)(Thermincola) (Thermoterrabacterium)消化链球菌科(Peptostreptococcaceae) (Anaerococcus)(Filifactor)(Finegoldia)(Fusibacter)(Gallicola)(Helcococcus)微单胞菌属(Parvimonas) （原名Micromonas）(Peptoniphilus)消化链球菌属(Peptostreptococcus) (Sedimentibacter)(Sporanaerobacter)(Tissierella)互营单胞菌科(Syntrophomonadaceae) (Aminiphilus)(Aminobacterium)(Aminomonas)(Anaerobaculum)(Anaerobranca)(Caldicellulosiruptor) (Carboxydocella)(Dethiosulfovibrio)(Pelospora)互营单胞菌属(Syntrophomonas) (Syntrophospora)互营热菌属(Syntrophothermus) (Thermaerobacter)(Thermanaerovibrio) (Thermohydrogenium)(Thermosyntropha)(Thermovirga)韦荣氏菌科(Veillonellaceae) (Acetonema)氨基酸球菌属(Acidaminococcus) (Allisonella)(Anaeroarcus)(Anaeroglobus)(Anaeromusa)(Anaerosinus)(Anaerovibrio)(Centipeda)(Dendrosporobacter)(Dialister)(Megamonas)(Megasphaera)光冈菌属(Mitsuokella)(Papillibacter)(Pectinatus)(Pelosinus)(Phascolarctobacterium) (Propionispira)(Propionispora)(Quinella)(Schwartzia)新月形单胞菌属(Selenomonas)鼠孢菌属(Sporomusa)(Sporotalea)(Succiniclasticum)(Succinispira)(Thermosinus)韦荣氏菌属(Veillonella) (Zymophilus)科未定(Anaerovirgula)(Dethiosulfatibacter) (Geosporobacter)(Howardella)(Proteiniborus)盐厌氧菌目(Halanaerobiales)盐厌氧菌科(Halanaerobiaceae)盐厌氧菌属(Halanaerobium) (Halocella)(Haloincola)(Halothermothrix)盐拟杆菌科(Halobacteroidaceae) (Acetohalobium)(Halanaerobacter)盐拟杆菌属(Halobacteroides) (Halonatronum)(Natroniella)(Orenia)(Selenihalanaerobacter) (Sporohalobacter)盐碱厌氧菌目(Natranaerobiales)盐碱厌氧菌科(Natranaerobiaceae)盐碱厌氧菌属(Natranaerobius)热厌氧杆菌目(Thermoanaerobacteriales) 热厌氧杆菌科(Thermoanaerobacteriaceae) (Acetogenium)(Ammonifex)(Caldanaerobacter)(Carboxydibrachium) (Coprothermobacter) (Desulfovirgula)(Gelria)(Mahella)(Moorella)(Sporotomaculum) (Tepidanaerobacter) (Thermacetogenium)热厌氧单胞菌属(Thermanaeromonas) (Thermoanaerobacter) (Thermoanaerobium) (Thermoanaerobacterium)热厌氧菌属(Thermoanaerobium) (Thermobacteroides) (Thermosediminibacter) (Thermovenabulum)热脱硫菌科(Thermodesulfobiaceae) 热脱硫菌属(Thermodesulfobium)目未定(Desulfitibacter) (Symbiobacterium)热石杆菌纲(Thermolithobacteria)热石杆菌目(Thermolithobacterales) 热石杆菌科(Thermolithobacteraceae) 热石杆菌属(Thermolithobacter)梭杆菌门(Fusobacteria)梭杆菌纲(Fusobacteria)梭杆菌目(Fusobacteriales)梭杆菌科(Fusobacteriaceae)梭杆菌属(Fusobacterium) (Ilyobacter)纤毛菌属(Leptotrichia) (Propionigenium)(Sebaldella)(Sneathia)(Streptobacillus)科未定(Cetobacterium)芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes)芽单胞菌目(Gemmatimonadales)芽单胞菌科(Gemmatimonadaceae)芽单胞菌属(Gemmatimonas)黏胶球形菌门(Lentisphaerae)黏胶球形菌纲(Lentisphaerae)黏胶球形菌目(Lentisphaerales)黏胶球形菌科(Lentisphaeraceae)黏胶球形菌属(Lentisphaera)食物谷菌目(Victivallales)食物谷菌科(Victivallaceae)食物谷菌属(Victivallis)硝化螺旋菌门(Nitrospirae)硝化螺旋菌纲(Nitrospira)硝化螺旋菌目(Nitrospirales)硝化螺旋菌科(Nitrospiraceae)钩端螺菌属(Leptospirillum)硝化螺旋菌属(Nitrospira)磁杆菌属(Magnetobacterium)*热脱硫弧菌属(Thermodesulfovibrio)浮霉菌门(Planctomycetes)浮霉菌纲(Planctomycetacia)浮霉菌目(Planctomycetales)浮霉菌科(Planctomycetaceae) (Blastopirellula)(Gemmata)(Isosphaera)小梨形菌属(Pirellula)浮霉菌属(Planctomycetes)红小梨形菌属(Rhodopirellula) (Schlesneria)科未定（均未能分离培养，见厌氧氨氧化菌）(Brocadia)*(Kuenenia)*(Scalindua)*海绵杆菌门(Poribacteria)*变形菌门(Proteobacteria)α-变形菌纲(Alphaproteobacteria) 柄杆菌目(Caulobacterales)柄杆菌科(Caulobacteraceae) (Asticcacaulis)短波单胞菌属(Brevundimonas)柄杆菌属(Caulobacter)苯基杆菌属(Phenylobacterium) (Kordiimonadales) (Kordiimonadaceae) (Kordiimonas)短小盒菌目(Parvularculales)短小盒菌科(Parvularculaceae)短小盒菌属(Parvularcula)根瘤菌目(Rhizobiales)橙单胞菌科(Aurantimonadaceae)橙单胞菌属(Aurantimonas) (Fulvimarina)(Martelella)巴通体科(Bartonellaceae)巴通体属(Bartonella) (Grahamella)(Rochalimaea)拜叶林克氏菌科(Beijerinckiaceae) 拜叶林克氏菌属(Beijerinckia) (Chelatococcus) (Methylocapsa)(Methylocella)慢生根瘤菌科(Bradyrhizobiaceae) 阿菲波菌属(Afipia)农单胞菌属(Agromonas) (Balneimonas)芽生杆菌属(Blastobacter) (Bosea)慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)硝化杆菌属(Nitrobacter) (Oligotropha)(Rhodoblastus)红假单胞菌属(Rhodopseudomonas) 布鲁氏菌科(Brucellaceae)布鲁氏菌属(Brucella) (Crabtreella)(Daeguia)支动菌属(Mycoplana)苍白杆菌属(Ochrobactrum)(Pseudochrobactrum)黏着杆菌科(Cohaesibacteraceae) 黏着杆菌属(Cohaesibacter)生丝微菌科(Hyphomicrobiaceae) (Ancalomicrobium) (Angulomicrobium)水杆菌属(Aquabacter)芽绿菌属(Blastochloris) (Devosia)(Dichotomicrobium) (Filomicrobium)(Gemmiger)生丝微菌属(Hyphomicrobium) (Methylorhabdus)土微菌属(Pedomicrobium)突柄微菌属(Prosthecomicrobium) 红微菌属(Rhodomicrobium) (Rhodoplanes)(Seliberia)甲基杆菌科(Methylobacteriaceae) (Meganema)甲基杆菌属(Methylobacterium) (Microvirga)(Protomonas)甲基孢囊菌科(Methylocystaceae) (Albibacter)甲基孢囊菌属(Methylocystis) (Methylopila)(Methylosinus) (Pleomorphomonas) (Terasakiella)叶杆菌科(Phyllobacteriaceae) (Aminobacter) (Aquamicrobium) (Defluvibacter)(Hoeflea)中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium) (Nitratireductor)叶杆菌属(Phyllobacterium) (Pseudaminobacter)根瘤菌科(Rhizobiaceae)土壤杆菌属(Agrobacterium)异根瘤菌属(Allorhizobium)嗜碳菌属(Carbophilus)螯合杆菌属(Chelatobacter)剑菌属(Ensifer)(Kaistia)韧皮杆菌属(Liberibacter)*根瘤菌属(Rhizobium)中华根瘤菌属(Sinorhizobium) 红菌科(Rhodobiaceae) (Anderseniella) (Parvibaculum)红菌属(Rhodobium)玫瑰螺菌属(Roseospirillum)黄色杆菌科(Xanthobacteraceae) (Ancylobacter) (Azorhizobium)(Labrys)(Pseudolabrys)(Starkeya)黄色杆菌属(Xanthobacter)科未定(Sneathiella)红杆菌目(Rhodobacterales)生丝单胞菌科(Hyphomonadaceae) (Hirschia)生丝单胞菌属(Hyphomonas) (Maricaulis)(Oceanicaulis) (Robiginitomaculum)红杆菌科(Rhodobacteraceae) (Ahrensia)(Albidovulum) (Amaricoccus) (Antarctobacter) (Catellibacterium) (Citreicella)(Citreimonas) (Dinoroseobacter) (Donghicola) (Gemmobacter) (Haematobacter) (Jannaschia) (Ketogulonicigenium) (Labrenzia)(Leisingera)(Loktanella)(Maribius)(Marinovum) (Maritimibacter) (Methylarcula)(Nereida)(Nesiotobacter) (Oceanibulbus)海洋生菌属(Oceanicola) (Octadecabacter) (Palleronia) (Pannonibacter)副球菌属(Paracoccus) (Pelagibaca)(Phaeobacter)假红杆菌属(Pseudorhodobacter) (Pseudovibrio) (Rhodobaca)红杆菌属(Rhodobacter) (Rhodothalassium)小红卵菌属(Rhodovulum) (Roseibacterium) (Roseibium)(Roseicyclus) (Roseinatronobacter) (Roseisalinus)(Roseivivax)玫瑰杆菌属(Roseobacter) (Roseovarius) (Rubellimicrobium) (Rubrimonas)(Ruegeria)(Sagittula)(Salipiger)(Shimia)(Silicibacter)(Staleya)(Stappia)(Sulfitobacter) (Tateyamaria) (Thalassobacter) (Thalassobius) (Thalassococcus) (Thioclava)硫球形菌属(Thiosphaera)(Wenxinia)木洞菌属(Woodsholea)杨氏菌属(Yangia)红螺菌目(Rhodospirillales)醋杆菌科(Acetobacteraceae)醋杆菌属(Acetobacter) (Acidicaldus)嗜酸菌属(Acidiphilium)酸球形菌属(Acidisphaera)酸胞菌属(Acidocella)酸单胞菌属(Acidomonas) (Asaia)(Belnapia)脆弱球菌属(Craurococcus)葡糖醋杆菌属(Gluconacetobacter) 葡糖杆菌属(Gluconobacter) (Granulibacter)(Kozakia)鼠球菌属(Muricoccus) (Neoasaia) (Paracraurococcus)红球状菌属(Rhodopila) (Rhodovarius)玫瑰球菌属(Roseococcus)玫瑰单胞菌属(Roseomonas) (Rubritepida) (Saccharibacter)(Stella)(Swaminathania) (Teichococcus)(Zavarzinia)红螺菌科(Rhodospirillaceae)固氮螺菌属(Azospirillum) (Conglomeromonas) (Defluviicoccus)(Inquilinus)磁螺菌属(Magnetospirillum) (Phaeospirillum) (Rhodocista)红螺旋菌属(Rhodospira)红螺菌属(Rhodospirillum)红弧菌属(Rhodovibrio)玫瑰螺旋菌属(Roseospira) (Skermanella)(Telmatospirillum) (Thalassospira)(Tistrella)立克次体目(Rickettsiales)无形体科(Anaplasmataceae) (Aegyptianella)无形体属(Anaplasma) (Cowdria)埃里希体属(Ehrlichia)新立克次体属(Neorickettsia)沃巴赫体属(Wolbachia) (Xenohaliotis)*全孢菌科(Holosporaceae)全孢菌属(Holospora)立克次体科(Rickettsiaceae) (Orientia)立克次体属(Rickettsia)SAR 11群*远洋杆菌属(Pelagibacter)*科未定(Lyticum)(Odyssella)* (Pseudocaedibacter) (Symbiotes)(Tectibacter)鞘脂单胞菌目(Sphingomonadales) 赤杆菌科(Erythrobacteraceae) (Altererythrobacter)赤杆菌属(Erythrobacter)赤微菌属(Erythromicrobium)紫杆菌属(Porphyrobacter)鞘脂单胞菌科(Sphingomonadaceae) 芽单胞菌属(Blastomonas)柠檬酸微菌属(Citromicrobium)* 赤单胞菌属(Erythromonas)新鞘脂菌属(Novosphingobium) (Sandaracinobacter) (Sandaracinorhabdus）鞘脂菌属(Sphingobium)鞘脂单胞菌属(Sphingomonas) (Sphingopyxis) (Sphingosinicella)发酵单胞菌属(Zymomonas)目未定(Albimonas)(Caenispirillum) (Insolitispirillum) (Novispirillum)β-变形菌纲(Betaproteobacteria) 伯克氏菌目(Burkholderiales)产碱菌科(Alcaligenaceae)无色杆菌属(Achromobacter) (Advenella)产碱菌属(Alcaligenes) (Azohydromonas)博德氏菌属(Bordetella) (Brackiella)(Castellaniela)德克斯氏菌属(Derxia) (Kerstersia)(Oligella)(Pelistega)(Pigmentiphaga) (Pusillimonas)(Sutterella)(Taylorella) (Tetrathiobacter)伯克氏菌科(Burkholderiaceae)伯克氏菌属(Burkholderia) (Chitinimonas)(Cupriavidus)(Lautropia)(Limnobacter)(Pandoraea)(Paucimonas) (Polynucleobacter)青枯菌属(Ralstonia) (Thermothrix)沃特氏菌属(Wautersia)丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)食酸菌属(Acidovorax) (Alcycliphilus) (Brachymonas) (Caenibacterium) (Caldimonas)丛毛单胞菌属(Comamonas) (Curvibacter)代尔夫特菌属(Delftia) (Diaphorobacter) (Giesbergeria)噬氢菌属(Hydrogenophaga) (Hylemonella) (Lampropedia) (Macromonas)(Malikia)(Ottowia)(Pelomonas) (Polaromonas) (Ramlibacter)红育菌属(Rhodoferax) (Schlegelella) (Simplicispira)贪食菌属(Variovorax) (Xenophilus)草酸杆菌科(Oxalobacteraceae) (Collimonas)(Duganella) (Herbaspirillum) (Herminiimonas) (Janthinobacterium) (Massilia)(Naxibacter) (Oxalicibacterium)草酸杆菌属(Oxalobacter) (Telluria) (Undibacterium)科未定(Aquabacterium) (Aquincola)(Ideonella)纤发菌属(Leptothrix) (Methylibium)(Mitsuaria)(Paucibacter) (Roseateles)红长命菌属(Rubrivivax) (Sphaerotilus) (Tepidicella) (Tepidimonas)(Thiobacter)硫单胞菌属(Thiomonas)(Xylophilus)嗜氢菌目(Hydrogenophilales)嗜氢菌科(Hydrogenophilaceae)嗜氢菌属(Hydrogenophilus) (Petrobacter)(Tepidiphilus)硫杆状菌属(Thiobacillus)嗜甲基菌目(Methylophilales)嗜甲基菌科(Methylophilaceae) (Methylobacillus)嗜甲基菌属(Methylophilus) (Methylotenera) (Methylovorus)奈瑟菌目(Neisseriales)奈瑟菌科(Neisseriaceae) (Alysiella)(Andreprevotia)水螺菌属(Aquaspirillum) (Aquitalea)(Bergeriella)(Chitinibacter) (Chitinilyticum)色杆菌属(Chromobacterium) (Conchiformibius)(Deefgea)艾肯氏菌属(Eikenella) (Formivibrio)(Gulbenkiania)(Iodobacter)金氏菌属(Kingella)鸥杆菌属(Laribacter)(Leeia)(Microvirgula)(Morococcus)奈瑟菌属(Neisseria) (Paludibacterium) (Prolinoborus)(Silvimonas)(Simonsiella)(Uruburuella)(Vitreoscilla)(Vogesella)亚硝化单胞菌目(Nitrosomonadales) 嘉利翁氏菌科(Gallionellaceae)嘉利翁氏菌属(Gallionella)亚硝化单胞菌科(Nitrosomonadaceae) 亚硝化叶菌属(Nitrosolobus)亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)亚硝化螺旋菌属(Nitrosospira)螺菌科(Spirillaceae)螺菌属(Spirillum)普罗卡杆菌目(Procabacteriales)* 普罗卡杆菌科(Procabacteriaceae)* 普罗卡杆菌属(Procabacter)*红环菌目(Rhodocyclales)红环菌科(Rhodocyclaceae)固氮弓菌属(Azoarcus) (Azonexus)(Azospira)(Azovibrio)(Dechloromonas) (Dechlorosoma)(Denitratisoma) (Ferribacterium) (Methyloversatilis)丙酸杆菌属(Propionibacter) (Propionivibrio) (Quatrionicoccus)红环菌属(Rhodocyclus) (Shinella)(Sterolibacterium)陶厄氏菌属(Thauera) (Uliginosibacterium)动胶菌属(Zoogloea)δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria) 蛭弧菌目(Bdellovibrionales) (Bacteriovoracaceae) (Bacteriovorax)(Peredibacter)蛭弧菌科(Bdellovibrionaceae)蛭弧菌属(Bdellovibrio) (Micavibrio)(Vampirovibrio)脱硫盒菌目(Desulfarculales)脱硫盒菌科(Desulfarculaceae)脱硫盒菌属(Desulfarculus)脱硫杆菌目(Desulfobacterales)(Desulfatibacillum) (Desulfatiferula) (Desulfatirhabdium)脱硫杆菌属(Desulfobacter) (Desulfobacterium) (Desulfobacula) (Desulfobotulus)* (Desulfocella) (Desulfococcus)(Desulfofaba)(Desulfofrigus) (Desulfomusa)(Desulfonema)(Desulforegula) (Desulfosarcina) (Desulfospira) (Desulfotignum) (Desulfobulbaceae) (Desulfobulbus) (Desulfocapsa)(Desulfofustis)(Desulfopila) (Desulforhopalus) (Desulfotalea) (Nitrospinaceae)(Nitrospina)脱硫弧菌目(Desulfovibrionales) (Desulfohalobiaceae) (Desulfohalobium) (Desulfonatronovibrio) (Desulfonauticus) (Desulfothermus) (Desulfovermiculus) (Desulfomicrobiaceae) (Desulfomicrobium) (Desulfonatronaceae) (Desulfonatronum)脱硫弧菌科(Desulfovibrionaceae) (Bilophila)(Desulfomonas)脱硫弧菌属(Desulfovibrio) (Lawsonia)硫还原菌目(Desulfurellales)硫还原菌属(Desulfurella) (Hippea)除硫单胞菌目(Desulfuromonadales) 除硫单胞菌科(Desulfuromonadaceae) 除硫单胞菌属(Desulfuromonas) (Desulfuromusa) (Malonomonas)(Pelobacter)地杆菌科(Geobacteraceae) (Geoalkalibacter)地杆菌属(Geobacter) (Geopsychrobacter) (Geothermobacter) (Trichlorobacter)黏球菌目(Myxococcales)孢囊杆菌亚目(Cystobacterineae)孢囊杆菌科(Cystobacteraceae) (Anaeromyxobacter) (Archangium)孢囊杆菌属(Cystobacter) (Hyalangium)(Melittangium)(Stigmatella)黏球菌科(Myxococcaceae) (Angiococcus)(Corallococcus)黏球菌属(Myxococcus) (Pyxidicoccus)侏囊菌亚目(Nannocystineae) (Haliangiaceae)(Haliangium)(Kofleriaceae)(Kofleria)侏囊菌科(Nannocystaceae) (Enhygromyxa)侏囊菌属(Nannocystis) (Plesiocystis)堆囊菌亚目(Sorangineae)多囊菌科(Polyangiaceae) (Byssovorax)(Chondromyces)(Haploangium)*(Jahnella)多囊菌属(Polyangium)堆囊菌属(Sorangium)互营杆菌目(Syntrophobacterales)互营菌科(Syntrophaceae) (Desulfobacca)(Desulfomonile)(Smithella)互营菌属(Syntrophus)互营杆菌科(Syntrophobacteraceae) (Desulfacinum)(Desulfoglaeba) (Desulforhabdus)(Desulfovirga)互营杆菌属(Syntrophobacter) (Thermodesulforhabdus)ε-变形菌纲(Epsilonproteobacteria) 弯曲菌目(Campylobacterales)弯曲菌科(Campylobacteraceae)弓形杆菌属(Arcobacter)弯曲菌属(Campylobacter) (Dehalospirillum)硫磺单胞菌属(Sulfurospirillum)螺杆菌科(Helicobacteraceae)螺杆菌属(Helicobacter) (Sulfuricurvum)(Sulfurimonas)(Sulfurovum)(Thiovulum)沃林氏菌属(Wolinella)氢单胞菌科(Hydrogenimonadaceae)氢单胞菌属(Hydrogenimonas) (Nautiliales)(Nautiliaceae)(Caminibacter)(Lebetimonas)(Nautilia)(Nitratifractor)(Nitratiruptor)(Thioreductor)γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria) 酸硫杆状菌目(Acidithiobacillales) 酸硫杆状菌科(Acidithiobacillaceae)酸硫杆状菌属(Acidithiobacillus)热硫杆状菌科(Thermithiobacillaceae)热硫杆状菌属(Thermithiobacillus)气单胞菌目(Aeromonadales)气单胞菌科(Aeromonadaceae)气单胞菌属(Aeromonas) (Oceanimonas)(Oceanisphaera)(Tolumonas)(Zobellella)琥珀酸弧菌科(Succinivibrionaceae)厌氧螺菌属(Anaerobiospirillum)反刍杆菌属(Ruminobacter)琥珀酸单胞菌属(Succinimonas)琥珀酸弧菌属(Succinivibrio)交替单胞菌目(Alteromonadales)交替单胞菌科(Alteromonadaceae) (Aestuariibacter)(Agarivorans)(Alishewanella)交替单胞菌属(Alteromonas) (Glaciecola)(Marinimicrobium)海杆菌属(Marinobacter)海细菌属(Marinobacterium)产微球茎菌属(Microbulbifer) (Saccharophagus)(Salinimonas)(Colwelliaceae)(Colwellia)(Thalassomonas)(Ferrimonadaceae)(Ferrimonas)(Paraferrimonas)(Idiomarinaceae)(Idiomarina)(Pseudidiomarina)(Moritellaceae)(Moritella)假交替单胞菌科(Pseudoalteromonadaceae) (Algicola)假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas)冷单胞菌科(Psychromonadaceae)冷单胞菌属(Psychromonas)希万氏菌科(Shewanellaceae)希万氏菌属(Shewanella)科未定(Teredinibacter)(Endobugula)*心杆菌目(Cardiobacteriales)心杆菌科(Cardiobacteriaceae)心杆菌属(Cardiobacterium) (Dichelobacter)(Suttonella)着色菌目(Chromatiales)着色菌科(Chromatiaceae) (Allochromatium)(Amoebobacter)着色菌属(Chromatium)盐着色菌属(Halochromatium) (Isochromatium)(Lamprobacter)(Lamprocystis)(Marichromatium)亚硝化球菌属(Nitrosococcus)芬尼氏菌属(Pfennigia)棍着色菌属(Rhabdochromatium) (Rheinheimera)热着色菌属(Thermochromatium)硫碱球菌属(Thioalkalicoccus)硫橄榄菌属(Thiobaca)硫匣菌属(Thiocapsa)硫球菌属(Thiococcus)硫囊菌属(Thiocystis)硫网菌属(Thiodictyon)硫黄球菌属(Thioflavicoccus)硫盐匣菌属(Thiohalocapsa) (Thiolamprovum)(Thiopedia)硫红球菌属(Thiorhodococcus)硫红弧菌属(Thiorhodovibrio)硫螺菌属(Thiospirillum)外硫红螺旋菌科(Ectothiorhodospiraceae) 碱湖生菌属(Alkalilimnicola)碱螺菌属(Alkalispirillum) (Aquisalimonas)(Arhodomonas)(Ectothiorhodosinus)外硫红螺旋菌属(Ectothiorhodospira)盐红螺旋菌属(Halorhodospira) (Natronocella)硝化球菌属(Nitrococcus)硫碱螺旋菌属(Thioalkalispira)硫碱弧菌属(Thialkalivibrio)硫红螺旋菌属(Thiorhodospira)颗粒状球菌科(Granulosicoccaceae)颗粒状球菌属(Granulosicoccus)盐硫杆状菌科(Halothiobacillaceae)盐硫杆状菌属(Halothiobacillus) (Thiovirga)肠杆菌目(Enterobacteriales)肠杆菌科(Enterobacteriaceae) (Arsenophonus)(Brenneria)布赫纳氏菌属(Buchnera)(Budvicia)布丘氏菌属(Buttiauxella) (Calymmatobacterium)西地西菌属(Cedecea)柠檬酸杆菌属(Citrobacter)(Dickeya)爱德华氏菌属(Edwardsiella)肠杆菌属(Enterobacter)欧文氏菌属(Erwinia)埃希氏菌属(Escherichia) （包含大肠杆菌）(Ewingella)哈夫尼菌属(Hafnia)克雷伯氏菌属(Klebsiella)克吕沃氏菌属(Kluyvera)(Leclercia)(Leminorella)(Levinea)(Moellerella)(Morganella)(Obesumbacterium)泛菌属(Pantoea)(Pectobacterium)(Phlomobacter)*(Photorhabdus)邻单胞菌属(Plesiomonas)(Pragia)变形杆菌属(Proteus)普罗维登斯菌属(Providencia) (Rahnella)(Raoultella)糖杆菌属(Saccharobacter)沙门氏菌属(Salmonella)(Samsonia)沙雷氏菌属(Serratia)志贺氏菌属(Shigella)(Sodalis)(Tatumella)(Thorsellia)(Trabulsiella)(Wigglesworthia)致病杆菌属(Xenorhabdus)耶尔辛氏菌属(Yersinia) （包含鼠疫杆菌）(Yokenella)军团菌目(Legionellales)柯克斯体科(Coxiellaceae)(Aquicella)柯克斯体属(Coxiella)立克次小体属(Rickettsiella)军团菌科(Legionellaceae) (Fluoribacter)军团菌属(Legionella)(Sarcobium)(Tatlockia)甲基球菌目(Methylococcales)甲基球菌科(Methylococcaceae)甲基杆菌属(Methylobacter)甲基暖菌属(Methylocaldum)甲基球菌属(Methylococcus)甲基盐菌属(Methylohalobius)甲基微菌属(Methylomicrobium)甲基单胞菌属(Methylomonas)甲基八叠球菌属(Methylosarcina) (Methylosoma)甲基球形菌属(Methylosphaera)甲基热菌属(Methylothermus)海洋螺菌目(Oceanospirillales)食碱菌科(Alcanivoraceae)食碱菌属(Alcanivorax)(Fundibacter)(Kangiella)河氏菌科(Hahellaceae)(Endozoicomonas)河氏菌属(Hahella) (Halospina)(Zooshikella)盐单胞菌科(Halomonadaceae) (Carnimonas)色盐杆菌属(Chromohalobacter) (Cobetia)(Deleya)盐单胞菌属(Halomonas) (Halotalea)(Halovibrio) (Modicisalibacter)(Salicola)(Volcaniella)发酵杆菌属(Zymobacter)岸生菌科(Litoricolaceae)岸生菌属(Litoricola)海洋螺菌科(Oceanospirillaceae) (Amphritea)巴氏发菌属(Balneatrix)海单胞菌属(Marinomonas)海螺菌属(Marinospirillum) (Neptuniibacter) (Neptunomonas)(Nitrincola)海洋杆菌属(Oceanobacter)海洋螺菌属(Oceanospirillum)油螺旋菌属(Oleispira)假螺菌属(Pseudospirillum) (Reinekea)(Thalassolituus)嗜油菌科(Oleiphilaceae)嗜油菌属(Oleiphilus)糖螺菌科(Saccharospirillaceae) 糖螺菌属(Saccharospirillum)巴斯德氏菌目(Pasteurellales) 巴斯德氏菌科(Pasteurellaceae) 放线杆菌属(Actinobacillus) (Aggregatibacter) (Avibacterium)(Bibersteinia) (Gallibacterium)嗜血菌属(Haemophilus)(Histophilus)(Lonepinella)(Mannheimia)(Nicoletella)巴斯德氏菌属(Pasteurella) (Phocoenobacter) (Volucribacter)假单胞菌目(Pseudomonadales)莫拉菌科(Moraxellaceae)不动杆菌属(Acinetobacter) (Alkanindiges)布兰汉氏菌(Branhamella) (Enhydrobacter)莫拉菌属(Moraxella) (Perlucidibaca)冷杆菌属(Psychrobacter)假单胞菌科(Pseudomonadaceae) (Azomonas)(Azomonotrichon) (Azorhizophilus)(Azotobacter)纤维弧菌属(Cellvibrio) (Chryseomonas)(Flavimonas)(Mesophilobacter)假单胞菌属(Pseudomonas)根瘤杆菌属(Rhizobacter)皱纹单胞菌属(Rugamonas)蛇形菌属(Serpens)咸水球形菌目(Salinisphaerales)咸水球形菌科(Salinisphaeraceae) 咸水球形菌属(Salinisphaera)硫发菌目(Thiotrichales) (Francisellaceae)(Francisella)鱼立克次体科(Piscirickettsiaceae) (Cycloclasticus) (Hydrogenovibrio) (Methylophaga)鱼立克次体属(Piscirickettsia) (Sulfurivirga) (Thioalkalimicrobium) (Thiomicrospira)硫发菌科(Thiotrichaceae)无色菌属(Achromatium)贝扎托菌属(Beggiatoa)亮发菌属(Leucothrix)硫杆菌属(Thiobacterium)硫珠菌属(Thiomargarita)硫辫菌属(Thioploca)硫螺旋菌属(Thiospira)硫发菌属(Thiothrix)科未定(Caedibacter)(Fangia)弧菌目(Vibrionales)弧菌科(Vibrionaceae)(Aliivibrio)异单胞菌属(Allomonas) (Beneckea)链状球菌属(Catenococcus)肠弧菌属(Enterovibrio) (Grimontia)(Listonella)(Lucibacterium)发光杆菌属(Photobacterium) (Salinivibrio)弧菌属(Vibrio)黄色单胞菌目(Xanthomonadales)华杆菌科(Sinobacteraceae) (Hydrocarboniphaga)(Nevskia)华杆菌属(Sinobacter)黄色单胞菌科(Xanthomonadaceae)水单胞菌属(Aquimonas) (Arenimonas)(Aspromonas)(Dokdonella)(Dyella)(Frateuria)(Fulvimonas)(Ignatzschineria)(Luteibacter)(Luteimonas)(Lysobacter)假黄色单胞菌属(Pseudoxanthomonas) (Rhodanobacter)(Silanimonas) (Stenotrophomonas)热单胞菌属(Thermomonas)黄色单胞菌属(Xanthomonas) (Xylella)目未定碱单胞菌属(Alkalimonas) (Bowmanella)聚集杆菌属(Congregibacter)* (Methylohalomonas) (Methylonatrum) (Sedimenticola)(Solimonas)(Thiohalomonas) (Thiohalophilus)螺旋体门(Spirochaetes)螺旋体纲(Spirochaetes)螺旋体目(Spirochaetales)短螺旋体科(Brachyspiraceae)短螺旋体属(Brachyspira)小蛇菌属(Serpulina)钩端螺旋体科(Leptospiraceae)纤线菌属(Leptonema)钩端螺旋体属(Leptospira) (Turneriella)螺旋体科(Spirochaetaceae)疏螺旋体属(Borrelia) (Brevinema)(Clevelandina)(Cristispira)(Diplocalyx)(Hollandina)(Pillotina)螺旋体属(Spirochaeta)密螺旋体属(Treponema)柔膜菌门(Tenericutes)柔膜菌纲(Mollicutes)无胆甾原体目(Acholeplasmatales) 无胆甾原体科(Acholeplasmataceae) 无胆甾原体属(Acholeplasma)植原体属(Phytoplasma)*厌氧原体目(Anaeroplasmatales)厌氧原体科(Anaeroplasmataceae)厌氧原体属(Anaeroplasma)无甾醇原体属(Asteroleplasma)虫原体目(Entomoplasmatales)虫原体科(Entomoplasmataceae)虫原体属(Entomoplasma)中间原体属(Mesoplasma)螺原体科(Spiroplasmataceae)螺原体属(Spiroplasma)支原体目(Mycoplasmatales)支原体科(Mycoplasmataceae) (Allobaculum)(Eperythrozoon)(Haemobartonella)支原体属(Mycoplasma)脲原体属(Ureaplasma)目未定丹毒丝菌科(Erysipelothrichaceae) (Bulleidia)丹毒丝菌属(Erysipelothrix) (Holdemania)(Solobacterium)热脱硫杆菌门(Thermodesulfobacteria)热脱硫杆菌纲(Thermodesulfobacteria)热脱硫杆菌目(Thermodesulfobacteriales) 热脱硫杆菌科(Thermodesulfobacteriaceae) (Thermodesulfatator)热脱硫杆菌属(Thermodesulfobacterium)热微菌门(Thermomicrobia)热微菌纲(Thermomicrobia)热微菌目(Thermomicrobiales)热微菌科(Thermomicrobiaceae)热微菌属(Thermomicrobium)热袍菌门(Thermotogae)热袍菌纲(Thermotogae)热袍菌目(Thermotogales)热袍菌科(Thermotogaceae)(Fervidobacterium) (Geotoga)(Marinitoga)(Petrotoga)(Thermosipho)热袍菌属(Thermotoga)疣微菌门(Verrucomicrobia)丰祐菌纲(Opitutae)（注：正确形式似应为Opituti）丰祐菌目(Opitutales)丰祐菌科(Opitutaceae)交替球菌属(Alterococcus)丰祐菌属(Opitutus)紫红球菌目(Puniceicoccales)紫红球菌科(Puniceicoccaceae) (Cerasicoccus) (Coraliomargarita) (Pelagicoccus)紫红球菌属(Puniceicoccus)疣微菌纲(Verrucomicrobiae)疣微菌目(Verrucomicrobiales) 疣微菌科(Verrucomicrobiaceae) (Akkermansia)突柄杆菌属(Prosthecobacter) (Rubritalea)疣微菌属(Verrucomicrobium) (Xiphinematobacteraceae)* (Xiphinematobacter)*门未定(Jonquetella)纤线杆菌纲(Ktedonobacteria)纤线杆菌目(Ktedonobacterales) 纤线杆菌科(Ktedonobacteraceae) 纤线杆菌属(Ktedonobacter)。
细菌分类表(按ldquo界门纲目科属种rdquo分类)041019130354
5 衣原体门(Chlamydiae)
o 5.1 衣原体纲(Chlamydiae) 6 绿菌门(Chlorobi)
27 疣微菌门(Verrucomicrobia) o 27.1 丰祐菌纲(Opitutae) o 27.2 疣微菌纲(Verrucomicrobiae)
28 门未定 o 28.1 纤线杆菌纲(Ktedonobacteria)
酸杆菌门(Acidobacteria)
酸杆菌纲(Acidobacteria)
7. 微球菌亚目(Micrococcineae) 1. 获山氏菌科(Beutenbergiaceae) 1. 获山氏菌属(Beutenbergia) 2. 乔治菌属(Georgenia) 3. 萨勒河菌属(Salana) 2. 博戈里亚湖菌科(Bogoriellaceae) 1. 博戈里亚湖菌属(Bogoriella) 3. 短杆菌科(Brevibacteriaceae) 1. 短杆菌属(Brevibacterium) 4. 纤维素单胞菌科(Cellulomonadaceae) 1. 纤维素单胞菌属(Cellulomonas) 2. 厄氏菌属(Oerskovia) 3. (Tropheryma) 5. (Dermabacteraceae) 1. (Brachybacterium) 2. (Dermabacter) 6. (Dermacoccaceae) 1. (Demetria)
2. (Dermacoccus) 3. (Kytococcus) 7. (Dermatophilaceae) 1. (Dermatophilus) 2. (Kineosphaera) 8. (Intrasporangiaceae) 1. (Arsenicicoccus) 2. (Humihabitans) 3. (Intrasporangium) 4. (Janibacter) 5. (Knoellia) 6. (Kribbia) 7. (Lapillicoccus) 8. (Ornithinicoccus) 9. (Ornithinimicrobium) 10.(Oryzihumus) 11.(Serinicoccus) 12.(Terrabacter) 13.(Terracoccus) 14.(Tetrasphaera) 9. (Jonesiaceae) 1. (Jonesia) 10.(Microbacteriaceae) 1. (Agreia) 2. (Agrococcus) 3. (Agromyces) 4. (Aureobacterium) 5. (Clavibacter) 6. (Cryobacterium) 7. (Curtobacterium) 8. (Frigoribacterium) 9. (Frondicola) 10.(Gulosibacter) 11.(Labedella) 12.(Leifsonia) 13.(Leucobacter) 14.(Microbacterium) 15.(Microcella) 16.(Mycetocola) 17.(Okibacterium) 18.(Plantibacter) 19.(Pseudoclavibacter) 20.(Rathayibacter) 21.(Rhodoglobus)
最新医学微生物学各个细菌
1葡萄球菌属链球菌属肺炎球菌属脑膜炎奈瑟球菌形状球球矛头状肾形排列葡萄状链状成双成双染色G-特殊结构无幼龄有荚膜有荚膜有荚膜及菌毛营养普通培养基需含血液、葡萄糖、血清等需含血巧克力色培养基（血液经过加热变色）气体需氧或兼性厌氧需氧或兼性厌氧兼性厌氧专性需氧，但初次培养要5%的CO2 温度37最适合（28—38）37最适合37 37PH 7.4最适7.4-7.6 7.4-7.8 7.4-7.6菌落有色素，血琼脂板上出现全透明的溶血环（β溶血），环中红细胞全溶甲(草绿色溶血环)、乙（无色溶血环（β溶血））、无溶血环溶血环(草绿色溶血环) 露滴状变异耐药性，90%耐青霉素耐药菌株少见耐药菌株少见抗原葡萄球菌抗原（SPA）c抗原，表面抗原（含M蛋白）M蛋白为型特异性抗原，与毒力无关荚膜多糖群特异性抗原、外膜蛋白型特异性抗原、LPS抗原、核蛋白抗原分类金黄色、表皮、腐生葡萄球菌甲型、乙型溶血性链球菌（据溶血现象）、丙型链球菌；19个血清型（根据C抗原）90个血清型13个血清型抵抗力较强，耐药较弱，首选青霉素较弱极弱，耐药致病物质（血浆）凝固酶，葡萄球菌溶血素（α），杀白细胞素，肠毒素，表皮剥脱毒素，毒性休克综合征-1脂磷壁酸（LPA），M蛋白（抗吞噬），侵袭性酶，链球菌溶血素（SLO，SLS）.致热外毒素荚膜（最主要，抗吞噬），肺炎链球菌溶血素O可夺取细胞膜上的胆固醇，脂磷壁酸（黏附），神经氨酸酶（定植扩散）菌毛，荚膜，内毒素疾病化脓性炎症，食物中毒，葡萄球菌烫伤样皮肤综合征（ssss），毒性休克综合征（tss），葡萄球菌性肠炎多为A型链球菌致病：①化脓性感染:淋巴管炎、蜂窝组织炎、中耳；②中毒性疾病：猩红热(外毒素)；③变态反应性疾病：肾小球肾炎，风湿热。
大叶性肺炎，支气管肺炎；肺炎可引发中耳炎，脑膜炎流行性脑脊髓炎血症败血症，脓毒血症新生儿败血症肺炎引起败血症菌血症免疫不强虽然人体血清中有多种抗体，但各型间无交叉免疫力，仍可反复感染可建立牢固特异性免疫体液免疫为主生化反应致病菌株能分解甘露醇，有触酶（触酶又称过氧化氢酶）无触酶（区别于葡萄球菌），（不分解菊糖，不被胆汁溶解，这两种特性用来区分甲型溶血性链球菌和肺炎链球菌）分解菊糖，可被胆汁溶解。
细菌分类表
细菌分类表∙ 1 酸杆菌门(Acidobacteria)o 1.1 酸杆菌纲(Acidobacteria)o 1.2 全噬菌纲(Holophagae)∙ 2 放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌）o 2.1 放线菌纲(Actinobacteria)∙ 3 产水菌门(Aquificae)o 3.1 产水菌纲(Aquificae)∙ 4 拟杆菌门(Bacteroidetes)o 4.1 拟杆菌纲(Bacteroidetes)o 4.2 黄杆菌纲(Flavobacteria)o 4.3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)o 4.4 纲未定∙ 5 衣原体门(Chlamydiae)o 5.1 衣原体纲(Chlamydiae)∙ 6 绿菌门(Chlorobi)o 6.1 绿菌纲(Chlorobia)∙7 绿弯菌门(Chloroflexi)o7.1 厌氧绳菌纲(Anaerolineae)o7.2 暖绳菌纲(Caldilineae)o7.3 绿弯菌纲(Chloroflexi)∙8 产金菌门(Chrysiogenetes)o8.1 产金菌纲(Chrysiogenetes)∙9 蓝藻门(Cyanobacteria)o9.1 蓝藻纲(Cyanobacteria)∙10 脱铁杆菌门(Deferribacteres)o10.1 脱铁杆菌纲(Deferribacteres)∙11 异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus)o11.1 异常球菌纲(Deinococci)∙12 网团菌门(Dictyoglomi)o12.1 网团菌纲(Dictyoglomi)∙13 纤维杆菌门(Fibrobacteres)o13.1 纤维杆菌纲(Fibrobacteres)∙14 厚壁菌门(Firmicutes)（低G+C革兰氏阳性菌）o14.1 芽孢杆菌纲(Bacilli)o14.2 梭菌纲(Clostridia)o14.3 热石杆菌纲(Thermolithobacteria) ∙15 梭杆菌门(Fusobacteria)o15.1 梭杆菌纲(Fusobacteria)∙16 芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)o16.1 芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes) ∙17 黏胶球形菌门(Lentisphaerae)o17.1 黏胶球形菌纲(Lentisphaerae)∙18 硝化螺旋菌门(Nitrospirae)o18.1 硝化螺旋菌纲(Nitrospira)∙19 浮霉菌门(Planctomycetes)o19.1 浮霉菌纲(Planctomycetacia)∙20 海绵杆菌门(Poribacteria)∙21 变形菌门(Proteobacteria)o21.1 α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)o21.2 β-变形菌纲(Betaproteobacteria)o21.3 δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)o21.4 ε-变形菌纲(Epsilonproteobacteria)o21.5 γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)∙22 螺旋体门(Spirochaetes)o22.1 螺旋体纲(Spirochaetes)∙23 柔膜菌门(Tenericutes)o23.1 柔膜菌纲(Mollicutes)∙24 热脱硫杆菌门(Thermodesulfobacteria)o24.1 热脱硫杆菌纲(Thermodesulfobacteria) ∙25 热微菌门(Thermomicrobia)o25.1 热微菌纲(Thermomicrobia)∙26 热袍菌门(Thermotogae)o26.1 热袍菌纲(Thermotogae)∙27 疣微菌门(Verrucomicrobia)o27.1 丰祐菌纲(Opitutae)o27.2 疣微菌纲(Verrucomicrobiae)∙28 门未定o纤线杆菌纲(Ktedonobacteria)o纲未定1.酸杆菌门(Acidobacteria)1.1 酸杆菌纲(Acidobacteria)1.酸杆菌目(Acidobacteriales)1.酸杆菌科(Acidobacteriaceae)1.酸杆菌属(Acidobacterium)2.(Edaphobacter)3.(Terriglobus)1.2 全噬菌纲(Holophagae)1.石鳖杆菌目(Acanthopleuribacterales)1.石鳖杆菌科(Acanthopleuribacteraceae)1.石鳖杆菌属(Acanthopleuribacter)2.全噬菌目(Holophagales)1.全噬菌科(Holophagaceae)1.地发菌属(Geothrix)2.全噬菌属(Holophaga)2.放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌）2.1 放线菌纲(Actinobacteria)1.酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)1.酸微菌目(Acidimicrobiales)1.酸微菌亚目(Acidimicrobineae)1.酸微菌科(Acidimicrobiaceae)1.酸微菌属(Acidimicrobium)2.(Iamiaceae)1.(Iamia)2.放线菌亚纲(Actinobacteridae)1.放线菌目(Actinomycetales)1.放线菌亚目(Actinomycineae)1.放线菌科(Actinomycetaceae)1.放线棒菌属(Actinobaculum)2.放线菌属(Actinomyces)3.隐秘杆菌属(Arcanobacterium)4.(Falcivibrio)5.动弯杆菌属(Mobiluncus)6.(Varibaculum)2.(Actinopolysporineae)1.(Actinopolysporaceae)1.(Actinopolyspora)3.(Catenulisporineae)1.(Actinospicaceae)1.(Actinospica)2.(Catenulisporaceae)1.(Catenulispora)4.棒杆菌亚目(Corynebacterineae)1.棒杆菌科(Corynebacteriaceae)1.(Bacterionema)2.(Caseobacter)3.棒杆菌属(Corynebacterium)4.(Turicella)2.迪茨氏菌科(Dietziaceae)1.迪茨氏菌属(Dietzia)3.分枝杆菌科(Mycobacteriaceae)1.分枝杆菌属(Mycobacterium)4.诺卡氏菌科(Nocardiaceae)1.戈登氏菌属(Gordonia)2.(Micropolyspora)3.(Millisia)4.诺卡氏菌属(Nocardia)5.红球菌属(Rhodococcus)6.斯科曼氏菌属(Skermania)7.(Williamsia)8.(Smaragdicoccus)5.(Segniliparaceae)1.(Segniliparus)6.束村氏菌科(Tsukamurellaceae)1.束村氏菌属(Tsukamurella)5.弗兰克氏菌亚目(Frankineae)1.酸热菌科(Acidothermaceae)1.酸热菌属(Acidothermus)2.弗兰克氏菌科(Frankiaceae)1.弗兰克氏菌属(Frankia)3.地嗜皮菌科(Geodermatophilaceae)1.芽球菌属(Blastococcus)2.地嗜皮菌属(Geodermatophilus)3.(Modestobacter)4.(Kineosporiaceae)1.(Cryptosporangium)2.(Kineococcus)3.(Kineosporia)5.(Nakamurellaceae)1.(Humicoccus)2.(Nakamurella)3.(Quadrisphaera)6.孢鱼菌科(Sporichthyaceae)1.孢鱼菌属(Sporichthya)6.糖霉菌亚目(Glycomycineae)1.糖霉菌科(Glycomycetaceae)1.糖霉菌属(Glycomyces)2.(Stackerbrandtia)7.微球菌亚目(Micrococcineae)1.获山氏菌科(Beutenbergiaceae)1.获山氏菌属(Beutenbergia)2.乔治菌属(Georgenia)3.萨勒河菌属(Salana)2.博戈里亚湖菌科(Bogoriellaceae)1.博戈里亚湖菌属(Bogoriella)3.短杆菌科(Brevibacteriaceae)1.短杆菌属(Brevibacterium)4.纤维素单胞菌科(Cellulomonadaceae)1.纤维素单胞菌属(Cellulomonas)2.厄氏菌属(Oerskovia)3.(Tropheryma)5.(Dermabacteraceae)1.(Brachybacterium)2.(Dermabacter)6.(Dermacoccaceae)1.(Demetria)2.(Dermacoccus)3.(Kytococcus)7.(Dermatophilaceae)1.(Dermatophilus)2.(Kineosphaera)8.(Intrasporangiaceae)1.(Arsenicicoccus)2.(Humihabitans)3.(Intrasporangium)4.(Janibacter)5.(Knoellia)6.(Kribbia)7.(Lapillicoccus)8.(Ornithinicoccus)9.(Ornithinimicrobium)10.(Oryzihumus)11.(Serinicoccus)12.(Terrabacter)13.(Terracoccus)14.(Tetrasphaera)9.(Jonesiaceae)1.(Jonesia)10.(Microbacteriaceae)1.(Agreia)2.(Agrococcus)3.(Agromyces)4.(Aureobacterium)5.(Clavibacter)6.(Cryobacterium)7.(Curtobacterium)8.(Frigoribacterium)9.(Frondicola)10.(Gulosibacter)11.(Labedella)12.(Leifsonia)13.(Leucobacter)14.(Microbacterium)15.(Microcella)16.(Mycetocola)17.(Okibacterium)18.(Plantibacter)19.(Pseudoclavibacter)20.(Rathayibacter)21.(Rhodoglobus)22.(Salinibacterium)23.(Subtercola)24.(Yonghaparkia)25.(Zimmermannella)11.微球菌科(Micrococcaceae)1.(Acaricomes)2.节杆菌属(Arthrobacter)3.(Citricoccus)4.(Kocuria)5.微球菌属(Micrococcus)6.(Nesterenkonia)7.(Renibacterium)8.罗氏菌属(Rothia)9.口腔球菌属(Stomatococcus)10.刘志恒菌属(Zhihengliuella)12.(Promicromonosporaceae)1.(Cellulosimicrobium)2.(Isoptericola)3.(Myceligenerans)4.(Promicromonospora)5.(Xylanibacterium)6.(Xylanimonas)13.(Rarobacteraceae)1.(Rarobacter)14.(Sanguibacteraceae)1.血杆菌属(Sanguibacter)15.(Yaniaceae)1.(Yania)16.科未定1.(Actinotalea)2.(Demequina)3.(Phycicoccus)4.(Ruania)8.微单孢菌亚目(Micromonosporineae)1.微单孢菌科(Micromonosporaceae)1.(Actinocatenispora)2.(Actinoplanes)3.(Amorphosporangium)4.(Ampullariella)5.(Asanoa)6.(Catellatospora)7.(Catenuloplanes)8.(Couchiolanes)9.(Dactylosporangium)10.(Krasilnikovia)11.(Longispora)12.(Luedemannella)13.微单孢菌属(Micromonospora)14.(Pilimelia)15.(Planopolyspora)16.(Polymorphospora)17.(Salinispora)18.(Spirilliplanes)19.(Verrucosispora)20.(Virgisporangium)9.丙酸杆菌亚目(Propionibacterineae)1.(Nocardioidaceae)1.(Actinopolymorpha)2.(Aeromicrobium)3.(Friedmanniella)4.(Hongia)5.(Kribbella)6.(Marmoricola)7.(Micropruina)8.(Nocardioides)9.(Pimelobacter)10.(Propionicicella)11.(Propionicimonas)2.丙酸杆菌科(Propionibacteriaceae)1.河口微菌属(Aestuariimicrobium)2.(Arachnia)3.(Brooklawnia)4.(Granulicoccus)5.江氏菌属(Jiangella)6.(Luteococcus)7.(Microlunatus)8.丙酸杆菌属(Propionibacterium)9.(Propioniferax)10.(Propionimicrobium)11.(Tessaracocccus)10.(Pseudonocardineae)1.(Actinosynnemataceae)1.(Actinokineospora)2.(Actinosynnema)3.(Lechevalieria)4.(Lentzea)5.(Saccharothrix)6.(Umezawaea)2.(Pseudonocardiaceae)1.(Actinoalloteichus)2.(Actinobispora)3.(Amycolata)4.(Amycolatopsis)5.(Crossiella)6.(Faenia)7.(Goodfellowia)8.(Kibdelosporangium)9.(Kutzneria)10.(Prauserella)11.(Pseudoamycolata)12.(Pseudonocardia)13.(Saccharomonospora)14.(Saccharopolyspora)15.(Streptoalloteichus)16.(Thermobispora)17.(Thermocrispum)11.链霉菌亚目(Streptomycineae)1.链霉菌科(Sterptomycetaceae)1.(Actinopycnidium)2.(Actinosporangium)3.(Chainia)4.(Elytrosporangium)5.北里菌属(Kitasatoa)6.北里孢菌属(Kitasatospora)7.(Microellobosporia)8.(Streptacidiphilus)9.链霉菌属(Streptomyces)10.(Streptoverticillium)12.(Streptosporangineae)1.(Nocardiopsaceae)1.(Nocardiopsis)2.(Streptomonospora)3.(Thermobifida)2.(Streptosporangiaceae)1.(Acrocarpospora)2.(Herbidospora)3.(Microbispora)4.(Microtetraspora)5.(Nonomuraea)6.(Planobispora)7.(Planomonospora)8.(Planotetraspora)9.(Sphaerisporangium)10.(Streptosporangium)11.(Thermopolyspora)3.(Thermomonosporaceae)1.珊瑚状放线菌属(Actinocorallia)2.(Actinomadura)3.(Excellospora)4.(Spirillospora)5.(Thermomonospora)2.双歧杆菌目(Bifidobacteriales)1.双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)1.(Aeriscardovia)2.(Alloscardovia)3.双歧杆菌属(Bifidobacterium)4.(Gardnerella)5.(Metascardovia)6.(Parascardovia)7.(Scardovia)2.科未定3.(Coriobacteridae)1.(Coriobacteriales)1.(Coriobacterineae)1.(Coriobacteriaceae)1.奇异菌属(Atopobium)2.(Collinsella)3.(Coriobacterium)4.(Cryptobacterium)5.(Denitrobacterium)6.(Eggerthella)7.(Olsenella)8.(Slackia)4.红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)1.红色杆菌目(Rubrobacterales)1.红色杆菌亚目(Rubrobacterineae)1.(Conexibacteraceae)1.(Conexibacter)2.(Patulibacteraceae)1.(Patulibacter)3.红色杆菌科(Rubrobacteraceae)1.红色杆菌属(Rubrobacter)4.(Solirubrobacteraceae)1.(Solirubrobacter)5.(Thermoleophilaceae)1.(Thermoleophilum)5.球形杆菌亚纲(Sphaerobacteridae)1.球形杆菌目(Sphaerobacterales)1.球形杆菌亚目(Sphaerobacterineae)1.球形杆菌科(Sphaerobacteraceae)1.球形杆菌属(Sphaerobacter) 3.产水菌门(Aquificae)3.1 产水菌纲(Aquificae)1.产水菌目(Aquificales)1.产水菌科(Aquificaceae)1.产水菌属(Aquifex)2.(Calderobacterium)3.(Hydrogenivirga)4.(Hydrogenobacter)5.(Hydrogenobaculum)6.(Thermocrinis)2.除硫杆菌科(Desulfurobacteriaceae)1.(Balnearium)2.除硫杆菌属(Desulfurobacterium)3.热弧菌属(Thermovibrio)3.(Hydrogenothermaceae)1.(Hydrogenothermus)2.(Persephonella)3.(Sulfurihydrogenibium)4.拟杆菌门(Bacteroidetes)4.1 拟杆菌纲(Bacteroidetes)1.拟杆菌目(Bacteroidales)1.拟杆菌科(Bacteroidaceae)1.(Acetomicrobium)2.(Anaerophaga)3.(Anaerorhabdus)4.拟杆菌属(Bacteroides)5.(Pontibacter)2.紫单胞菌科(Porphyromonadaceae)1.(Barnesiella)2.(Capsularis)3.(Dysgonomonas)4.(Hallella)5.(Odoribacter)6.(Oribaculum)7.(Paludibacter)8.(Parabacteroides)9.紫单胞菌属(Porphyromonas)10.(Proteiniphilum)11.(Tannerella)12.(Xylanibacter)3.普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)1.普雷沃氏菌属(Prevotella)4.理研菌科(Rikenellaceae)1.(Alistipes)2.(Alkaliflexus)3.(Marinilabilia)4.(Petrimonas)5.理研菌属(Rikenella)5.科未定1.(Acetofilamentum)2.(Acetothermus)4.2 黄杆菌纲(Flavobacteria)1.黄杆菌目(Flavobacteriales)1.蟑螂杆状体科(Blattabacteriaceae)1.蟑螂杆状体属(Blattabacterium)2.(Cryomorphaceae)1.(Algoriphagus)2.(Brumimicrobium)3.(Crocinitomix)4.(Cryomorpha)5.(Fluviicola)6.李时珍菌属(Lishizhenia)7.(Owenweeksia)3.黄杆菌科(Flavobacteriaceae)1.(Actibacter)2.(Aequorivita)3.(Algibacter)4.(Aquimarina)5.(Arenibacter)6.伯杰菌属(Bergeyella)7.(Bizionia)8.碳酸噬胞菌属(Capnocytophaga)9.噬纤维素菌属(Cellulophaga)10.金黄杆菌属(Chryseobacterium)11.(Cloacibacterium)12.(Coenonia)13.(Costertonia)14.(Croceibacter)15.独岛菌属(Dokdonia)16.东海菌属(Donghaeana)17.(Elizabethkingia)18.(Empedobacter)19.(Epilithonimonas)20.(Flaviramulus)21.黄杆菌属(Flavobacterium)22.(Formosa)23.泥滩杆菌属(Gaetbulibacter)24.泥滩微菌属(Gaetbulimicrobium)25.(Galbibacter)26.(Gelidibacter)27.(Gillisia)28.(Gilvibacter)29.革兰菌属(Gramella)30.(Kaistella)31.(Kordia)32.(Krokinobacter)33.(Lacinutrix)34.列文虎克菌属(Leeuwenhoekiella)35.(Lutibacter)36.(Maribacter)37.(Mariniflexile)38.(Marixanthomonas)39.(Mesonia)40.(Muricauda)41.(Myroides)42.(Nonlabens)43.(Olleya)44.(Ornithobacterium)45.(Persicivirga)46.(Pibocella)47.极地杆菌属(Polaribacter)48.冷弯菌属(Psychroflexus)49.(Psychroserpens)50.(Riemerella)51.(Robiginitalea)52.(Salegentibacter)53.(Sandarakinotalea)54.(Sediminibacter)55.(Sediminicola)56.世宗菌属(Sejongia)57.(Stanierella)58.(Stenothermobacter)59.(Subsaxibacter)60.(Subsaximicrobium)61.(Tamlana)62.(Tenacibaculum)63.(Ulvibacter)64.(Vitellibacter)65.(Wautersiella)66.(Weeksella)67.(Winogradskyella)68.丽水菌属(Yeosuana)69.(Zeaxanthinibacter)70.周氏菌属(Zhouia)71.(Zobellia)72.王祖农菌属(Zunongwangia) 4.3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)1.鞘脂杆菌目(Sphingobacteriales)1.泉发菌科(Crenotrichaceae)1.(Balneola)2.(Chitinophaga)3.泉发菌属(Crenothrix)4.(Rhodothermus)5.(Salinibacter)6.(Terrimonas)7.(Toxothrix)2.(Flammeovirgaceae)1.(Flammeovirga)2.(Flexithrix)3.(Perexilibacter)4.(Persicobacter)5.(Rapidithrix)6.(Sediminitomix)7.(Thermonema)3.屈挠杆菌科(Flexibacteraceae)1.(Adhaeribacter)2.(Aquiflexum)3.(Arcicella)4.(Belliella)5.(Chimaereicella)6.(Cyclobacterium)7.噬胞菌属(Cytophaga)8.(Dyadobacter)9.(Echinicola)10.(Effluviibacter)11.(Emticicia)12.(Fabibacter)13.(Flectobacillus)14.屈挠杆菌属(Flexibacter)15.(Hongiella)16.(Hymenobacter)17.(Larkinella)18.(Leadbetterella)19.(Marinicola)20.(Meniscus)21.(Microscilla)22.(Niastella)23.(Persicitalea)24.(Reichenbachiella)25.(Rhodonellum)26.(Roseivirga)27.(Runella)28.(Spirosoma)29.生孢噬胞菌属(Sporocytophaga)4.腐螺旋菌科(Saprospiraceae)1.(Aureispira)2.(Haliscomenobacter)3.(Lewinella)4.腐螺旋菌属(Saprospira)5.鞘脂杆菌科(Sphingobacteriaceae)1.(Mucilaginibacter)2.(Olivibacter)3.(Parapedobacter)4.(Pedobacter)5.(Pseudosphingobacterium)6.鞘脂杆菌属(Sphingobacterium)6.科未定1.(Niabella)4.4 纲未定1.(Flavisolibacter)2.(Fulvivirga)3.(Prolixibacter)5.衣原体门(Chlamydiae)5.1 衣原体纲(Chlamydiae)1.衣原体目(Chlamydiales)1.衣原体科(Chlamydiaceae)1.衣原体属(Chlamydia)2.嗜衣体属(Chlamydophila)2.副衣原体属(Parachlamydiaceae)1.新衣原体属(Neochlamydia)2.副衣原体属(Parachlamydia)3.芯卡体科(Simkaniaceae)1.芯卡体属(Simkania)2.棍衣原体属(Rhabdochlamydia)*4.华诊体科(Waddliaceae)1.华诊体属(Waddlia)6.绿菌门(Chlorobi)6.1 绿菌纲(Chlorobia)1.绿菌目(Chlorobiales)1.绿菌科(Chlorobiaceae)1.臂绿菌属(Ancalochloris)2.绿棒菌属(Chlorobaculum)3.绿菌属(Chlorobium)4.绿爬菌属(Chloroherpeton)5.暗网菌属(Pelodictyon)6.突柄绿菌属(Prosthecochloris)7.绿弯菌门(Chloroflexi)7.1 厌氧绳菌纲(Anaerolineae)1.厌氧绳菌目(Anaerolineales)1.厌氧绳菌科(Anaerolineaceae)1.厌氧绳菌属(Anaerolinea)2.(Bellilinea)3.纤绳菌属(Leptolinea)4.(Levilinea)5.长绳菌属(Longilinea)7.2 暖绳菌纲(Caldilineae)1.暖绳菌目(Caldilineales)1.暖绳菌科(Caldilineaceae)1.暖绳菌属(Caldilinea)7.3 绿弯菌纲(Chloroflexi)1.绿弯菌目(Chloroflexales)1.绿弯菌科(Chloroflexaceae)1.绿弯菌属(Chloroflexus)2.绿线菌属(Chloronema)3.太阳发菌属(Heliothrix)4.玫瑰弯菌属(Roseiflexus)2.颤绿菌科(Oscillochloridaceae)1.颤绿菌属(Oscillochloris)2.爬管菌目(Herpetosiphonales)1.爬管菌科(Herpetosiphonaceae)1.爬管菌属(Herpetosiphon) 8.产金菌门(Chrysiogenetes)8.1 产金菌纲(Chrysiogenetes)1.产金菌目(Chrysiogenales)1.产金菌科(Chrysiogenaceae)1.产金菌属(Chrysiogenes) 9.蓝藻门(Cyanobacteria)9.1 蓝藻纲(Cyanobacteria)1.色球藻目(Chroococcales)1.色球藻科(Chroococcaceae)1.管孢藻属(Chamaesiphon)2.色球藻属(Chroococcus)3.(Cyanobacterium)4.(Cyanobium)5.(Cyanothece)6.蓝纤维藻属(Dactylococcopsis)7.(Gloeobacter)8.黏球藻属(Gloeocapsa)9.黏杆藻属(Gloeothece)10.微囊藻属(Microcystis)11.原绿球藻属(Prochlorococcus)12.原绿藻属(Prochloron)13.聚球藻属(Synechococcus)14.集胞藻属(Synechocystis)2.宽球藻目(Pleurocapsales)1.蓝枝藻科(Hyellaceae)1.(Cyanocystis)2.(Dermocarpella)3.(Stanieria)4.异球藻属(Xenococcus)2.宽球藻科(Pleurocapsaceae)1.拟色球藻属(Chroococcidiopsis)2.黏囊藻属(Myxosarcina)3.宽球藻属(Pleurocapsa)3.颤藻目(Oscillatoriales)1.颤藻科(Oscillatoriaceae)1.节螺藻属(Arthrospira)2.(Borzia)3.(Crinalium)4.(Geitlerinema)5.盐螺旋藻属(Halospirulina)6.(Leptolyngbya)7.(Limnothrix)8.鞘丝藻属(Lyngbya)9.微鞘藻属(Microcoleus)10.颤藻属(Oscillatoria)11.(Planktothrix)12.原绿发藻属(Prochlorothrix)13.(Pseudanabaena)14.螺旋藻属(Spirulina15.(Starria)16.束藻属(Symploca)17.束毛藻属(Trichodesmium)18.(Tychonema)4.念珠藻目(Nostocales)1.念珠藻科(Nostocaceae)1.鱼腥藻属(Anabaena)2.项圈藻属(Anabaenopsis)3.束丝藻属(Aphanizomenon)4.(Cyanospira)5.(Cylindrospermopsis)6.筒孢藻属(Cylindrospermum)7.节球藻属(Nodularia)8.念珠藻属(Nostoc)9.伪枝藻属(Scytonema)2.胶须藻科(Rivulariaceae)1.眉藻属(Calothrix)2.胶须藻属(Rivularia)3.单歧藻属(Tolypothrix)5.真枝藻目(Stigonematales)1.真枝藻科(Stigonemataceae)1.(Chlorogloeopsis)2.费氏藻属(Fischerella)3.(Geitleria)4.(Iyengariella)5.拟念珠藻属(Nostochopsis)6.真枝藻属(Stigonema)10.脱铁杆菌门(Deferribacteres)10.1 脱铁杆菌纲(Deferribacteres)1.脱铁杆菌目(Deferribacterales)1.脱铁杆菌科(Deferribacteraceae)1.脱铁杆菌属(Deferribacter)2.(Denitrovibrio)3.(Flexistipes)4.地弧菌属(Geovibrio)5.(Mucispirillum)2.科未定1.暖发菌属(Caldithrix)2.(Synergistes)11.异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus) 11.1 异常球菌纲(Deinococci)1.异常球菌目(Deinococcales)1.异常球菌科(Deinococcaceae)1.异常杆菌属(Deinobacter)2.异常球菌属(Deinococcus)2.特吕珀菌科(Trueperaceae)1.特吕珀菌属(Truepera)2.栖热菌目(Thermales)1.栖热菌科(Thermaceae)1.海栖热菌属(Marinithermus)2.亚栖热菌属(Meiothermus)3.海洋栖热菌属(Oceanithermus)4.栖热菌属(Thermus)5.火山栖热菌属(Vulcanithermus)12.网团菌门(Dictyoglomi)12.1 网团菌纲(Dictyoglomi)1.网团菌目(Dictyoglomales)1.网团菌科(Dictyoglomaceae)1.网团菌属(Dictyoglomus)13.纤维杆菌门(Fibrobacteres)13.1 纤维杆菌纲(Fibrobacteres)1.纤维杆菌目(Fibrobacterales)1.纤维杆菌科(Fibrobacteraceae)1.纤维杆菌属(Fibrobacter)14.厚壁菌门(Firmicutes)（低G+C革兰氏阳性菌）14.1 芽孢杆菌纲(Bacilli)1.芽孢杆菌目(Bacillales)1.(Alicyclobacillaceae)1.(Alicyclobacillus)2.(Pasteuria)3.(Sulfobacillus)2.芽孢杆菌科(Bacillaceae)1.(Alkalibacillus)2.(Amphibacillus)3.(Anoxybacillus)4.芽孢杆菌属(Bacillus)5.(Caldalkalibacillus)6.(Cerasibacillus)7.(Exiguobacterium)8.(Filobacillus)9.(Geobacillus)10.(Gracilibacillus)11.(Halalkalibacillus)12.(Halobacillus)13.(Haloactibacillus)14.(Jeotgalibacillus)15.(Lentibacillus)16.(Lysinibacillus)17.(Marinibacillus)18.(Oceanobacillus)19.(Ornithinibacillus)20.(Paraliobacillus)21.(Paucisalibacillus)22.(Pelagibacillus)23.(Piscibacillus)24.(Pontibacillus)25.糖球菌属(Saccharococcus)26.(Salibacillus)27.(Salimicrobium)28.(Salinibacillus)29.(Salirhabdus)30.(Sasuginibacillus)31.(Tenuibacillus)32.(Terribacillus)33.(Thalassobacillus)34.(Ureibacillus)35.(Virgibacillus)36.(Vulcanibacillus)3.(Caryophanaceae)1.(Caryophanon)4.李斯特氏菌科(Listeriaceae)1.环丝菌属(Brochothrix)2.李斯特氏菌属(Listeria)5.(Paenibacillaceae)1.(Ammoniphilus)2.(Aneurinibacillus)3.(Brevibacillus)4.(Cohnella)5.(Oxalophagus)6.(Paenibacillus)7.(Thermicanus)8.(Thermobacillus)6.(Planococcaceae)1.(Filibacter)2.(Kurthia)3.(Planococcus)4.(Planomicrobium)5.(Sporosarcina)7.芽孢乳杆菌科(Sporolactobacillaceae)1.(Marinococcus)2.(Sinococcus)3.芽孢乳杆菌属(Sporolactobacillus)4.(Tuberibacillus)8.葡萄球菌科(Staphylococcaceae)1.孪生菌属(Gemella)2.(Joetgalicoccus)3.(Macrococcus)4.(Salinicoccus)5.葡萄球菌属(Staphylococcus)9.(Thermoactinomycetaceae)1.(Laceyella)2.(Mechercharimyces)3.(Planifilum)4.(Seinonella)5.(Shimazuella)6.(Thermoactinomyces)7.(Thermoflavimicrobium)10.(Turicibacteraceae)1.(Turicibacter)11.科未定1.(Pullulanibacillus)2.乳杆菌目(Lactobacillales)1.气球菌科(Aerococcaceae)1.(Abiotrophia)2.气球菌属(Aerococcus)3.(Dolosicoccus)4.(Eremococcus)5.(Facklamia)6.(Globicatella)7.(Ignavigranum)2.肉杆菌科(Carnobacteriaceae)1.(Agitococcus)2.(Alkalibacterium)3.(Allofustis)4.(Alloiococcus)5.(Atopococcus)6.(Atopostipes)7.肉杆菌属(Carnobacterium)8.德库菌属(Desemzia)9.(Dolosigranulum)10.(Granulicatella)11.(Isobaculum)12.(Lactosphaera)13.(Marinilactibacillus)14.(Trichococcus)3.肠球菌科(Enterococcaceae)1.(Atopobacter)2.(Catellicoccus)3.肠球菌属(Enterococcus)4.(Melissococcus)5.(Pilibacter)6.(Tetragenococcus)7.漫游球菌属(Vagococcus)4.乳杆菌科(Lactobacillaceae)1.乳杆菌属(Lactobacillus)2.(Paralactobacillus)3.片球菌属(Pediococcus)5.明串珠菌科(Leuconostocaceae)1.明串珠菌属(Leuconostoc)2.(Oenococcus)3.(Weissella)6.颤螺旋菌科(Oscillospiraceae)1.颤杆菌克(Oscillibacter)2.颤螺旋菌属(Oscillospira)7.链球菌科(Streptococcaceae)1.乳球菌属(Lactococcus)2.(Lactovum)3.链球菌属(Streptococcus)8.科未定1.(Acetoanaerobium)2.互营球菌属(Syntrophococcus) 14.2 梭菌纲(Clostridia)1.梭菌目(Clostridiales)1.梭菌科(Clostridiaceae)1.(Acetanaerobacterium)2.(Acetivibrio)3.(Acidaminobacter)4.(Alkaliphilus)5.(Anaerobacter)6.(Anaerotruncus)7.(Anoxynatronum)8.(Bryantella)9.(Caloramator)10.(Caloranaerobacter)12.(Clostridiisalibacter)13.梭菌属(Clostridium)14.(Coprobacillus)15.(Dorea)16.(Ethanoligenens)17.(Faecalibacterium)18.(Fastidiosipila)19.(Garciella)20.(Gracilibacter)21.(Guggenheimella)22.(Hespellia)23.(Natronincola)24.(Oxobacter)25.(Parasporobacterium)26.八叠球菌属(Sarcina)27.(Soehngenia)28.(Sporacetigenium)29.(Sporobacter)30.(Subdoligranulum)31.(Tepidibacter)32.(Tepidimicrobium)33.(Thermobrachium)34.(Thermohalobacter)35.(Tindallia)2.优杆菌科(Eubacteriaceae)1.醋杆菌属(Acetobacterium)2.(Alkalibacter)3.(Anaerofustis)4.(Anaerovorax)5.优杆菌属(Eubacterium)6.(Mogibacterium)7.(Pseudoramibacter)3.太阳杆菌科(Heliobacteriaceae)1.太阳杆状菌属(Heliobacillus)2.太阳杆菌属(Heliobacterium)3.嗜日菌属(Heliophilum)4.(Heliorestis)4.毛螺旋菌科(Lachnospiraceae)1.(Acetitomaculum)2.(Anaerofilum)3.(Anaerostipes)4.丁酸弧菌属(Butyrivibrio)5.(Catenibacterium)7.粪球菌属(Coprococcus)8.(Johnsonella)9.(Lachnobacterium)10.毛螺旋菌属(Lachnospira)11.(Moryella)12.(Oribacterium)13.假丁酸弧菌属(Pseudobutyrivibrio)14.(Roseburia)15.瘤胃球菌属(Ruminococcus)16.(Shuttleworthia)17.(Sporobacterium)5.消化球菌科(Peptococcaceae)1.(Carboxydothermus)2.(Cryptanaerobacter)3.(Dehalobacter)4.(Desulfitobacterium)5.(Desulfonispora)6.(Desulfosporosinus)7.(Desulfotomaculum)8.(Pelotomaculum)9.消化球菌属(Peptococcus)10.(Syntrophobotulus)11.(Thermincola)12.(Thermoterrabacterium)6.消化链球菌科(Peptostreptococcaceae)1.(Anaerococcus)2.(Filifactor)3.(Finegoldia)4.(Fusibacter)5.(Gallicola)6.(Helcococcus)7.微单胞菌属(Parvimonas)8.(Peptoniphilus)9.消化链球菌属(Peptostreptococcus)10.(Sedimentibacter)11.(Sporanaerobacter)12.(Tissierella)7.互营单胞菌科(Syntrophomonadaceae)1.(Aminiphilus)2.(Aminobacterium)3.(Aminomonas)4.(Anaerobaculum)5.(Anaerobranca)6.(Caldicellulosiruptor)7.(Carboxydocella)8.(Dethiosulfovibrio)9.(Pelospora)10.互营单胞菌属(Syntrophomonas)11.(Syntrophospora)12.互营热菌属(Syntrophothermus)13.(Thermaerobacter)14.(Thermanaerovibrio)15.(Thermohydrogenium)16.(Thermosyntropha)17.(Thermovirga)8.韦荣氏菌科(Veillonellaceae)1.(Acetonema)2.氨基酸球菌属(Acidaminococcus)3.(Allisonella)4.(Anaeroarcus)5.(Anaeroglobus)6.(Anaeromusa)7.(Anaerosinus)8.(Anaerovibrio)9.(Centipeda)10.(Dendrosporobacter)11.(Dialister)12.(Megamonas)13.(Megasphaera)14.光冈菌属(Mitsuokella)15.(Papillibacter)16.(Pectinatus)17.(Pelosinus)18.(Phascolarctobacterium)19.(Propionispira)20.(Propionispora)21.(Quinella)22.(Schwartzia)23.新月形单胞菌属(Selenomonas)24.鼠孢菌属(Sporomusa)25.(Sporotalea)26.(Succiniclasticum)27.(Succinispira)28.(Thermosinus)29.韦荣氏菌属(Veillonella)30.(Zymophilus)9.科未定1.(Anaerovirgula)2.(Dethiosulfatibacter)3.(Geosporobacter)4.(Howardella)5.(Proteiniborus)2.盐厌氧菌目(Halanaerobiales)1.盐厌氧菌科(Halanaerobiaceae)1.盐厌氧菌属(Halanaerobium)2.(Halocella)3.(Haloincola)4.(Halothermothrix)2.盐拟杆菌科(Halobacteroidaceae)1.(Acetohalobium)2.(Halanaerobacter)3.盐拟杆菌属(Halobacteroides)4.(Halonatronum)5.(Natroniella)6.(Orenia)7.(Selenihalanaerobacter)8.(Sporohalobacter)3.盐碱厌氧菌目(Natranaerobiales)1.盐碱厌氧菌科(Natranaerobiaceae)1.盐碱厌氧菌属(Natranaerobius)4.热厌氧杆菌目(Thermoanaerobacteriales)1.热厌氧杆菌科(Thermoanaerobacteriaceae)1.(Acetogenium)2.(Ammonifex)3.(Caldanaerobacter)4.(Carboxydibrachium)5.(Coprothermobacter)6.(Desulfovirgula)7.(Gelria)8.(Mahella)9.(Moorella)10.(Sporotomaculum)11.(Tepidanaerobacter)12.(Thermacetogenium)13.热厌氧单胞菌属(Thermanaeromonas)14.(Thermoanaerobacter)15.(Thermoanaerobium)16.(Thermoanaerobacterium)17.热厌氧菌属(Thermoanaerobium)18.(Thermobacteroides)19.(Thermosediminibacter)20.(Thermovenabulum)2.热脱硫菌科(Thermodesulfobiaceae)1.热脱硫菌属(Thermodesulfobium)5.目未定1.(Desulfitibacter)2.(Symbiobacterium)14.3 热石杆菌纲(Thermolithobacteria)1.热石杆菌目(Thermolithobacterales)1.热石杆菌科(Thermolithobacteraceae)1.热石杆菌属(Thermolithobacter) 15.梭杆菌门(Fusobacteria)15.1 梭杆菌纲(Fusobacteria)1.梭杆菌目(Fusobacteriales)1.梭杆菌科(Fusobacteriaceae)1.梭杆菌属(Fusobacterium)2.(Ilyobacter)3.纤毛菌属(Leptotrichia)4.(Propionigenium)5.(Sebaldella)6.(Sneathia)7.(Streptobacillus)2.科未定1.(Cetobacterium)16.芽单胞菌门(Gemmatimonadetes) 16.1 芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes)1.芽单胞菌目(Gemmatimonadales)1.芽单胞菌科(Gemmatimonadaceae)1.芽单胞菌属(Gemmatimonas) 17.黏胶球形菌门(Lentisphaerae)17.1 黏胶球形菌纲(Lentisphaerae)1.黏胶球形菌目(Lentisphaerales)1.黏胶球形菌科(Lentisphaeraceae)1.黏胶球形菌属(Lentisphaera)2.食物谷菌目(Victivallales)1.食物谷菌科(Victivallaceae)1.食物谷菌属(Victivallis)18.硝化螺旋菌门(Nitrospirae)18.1 硝化螺旋菌纲(Nitrospira)1.硝化螺旋菌目(Nitrospirales)1.硝化螺旋菌科(Nitrospiraceae)1.钩端螺菌属(Leptospirillum)2.硝化螺旋菌属(Nitrospira)3.磁杆菌属(Magnetobacterium)4.热脱硫弧菌属(Thermodesulfovibrio) 19.浮霉菌门(Planctomycetes)19.1 浮霉菌纲(Planctomycetacia)1.浮霉菌目(Planctomycetales)1.浮霉菌科(Planctomycetaceae)1.(Blastopirellula)2.(Gemmata)3.(Isosphaera)4.小梨形菌属(Pirellula)5.浮霉菌属(Planctomycetes)6.红小梨形菌属(Rhodopirellula)7.(Schlesneria)2.科未定1.(Brocadia)2.(Kuenenia)3.(Scalindua)20.海绵杆菌门(Poribacteria)21.变形菌门(Proteobacteria)21.1 α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)1.柄杆菌目(Caulobacterales)1.柄杆菌科(Caulobacteraceae)1.(Asticcacaulis)2.短波单胞菌属(Brevundimonas)3.柄杆菌属(Caulobacter)4.苯基杆菌属(Phenylobacterium)2.(Kordiimonadales)1.(Kordiimonadaceae)1.(Kordiimonas)3.短小盒菌目(Parvularculales)1.短小盒菌科(Parvularculaceae)1.短小盒菌属(Parvularcula)4.根瘤菌目(Rhizobiales)1.橙单胞菌科(Aurantimonadaceae)1.橙单胞菌属(Aurantimonas)2.(Fulvimarina)3.(Martelella)2.巴通体科(Bartonellaceae)1.巴通体属(Bartonella)2.(Grahamella)3.(Rochalimaea)3.拜叶林克氏菌科(Beijerinckiaceae)1.拜叶林克氏菌属(Beijerinckia)2.(Chelatococcus)3.(Methylocapsa)4.(Methylocella)4.慢生根瘤菌科(Bradyrhizobiaceae)1.阿菲波菌属(Afipia)2.农单胞菌属(Agromonas)3.(Balneimonas)4.芽生杆菌属(Blastobacter)5.(Bosea)6.慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)7.硝化杆菌属(Nitrobacter)8.(Oligotropha)9.(Rhodoblastus)10.红假单胞菌属(Rhodopseudomonas)5.布鲁氏菌科(Brucellaceae)1.布鲁氏菌属(Brucella)2.(Crabtreella)3.(Daeguia)4.支动菌属(Mycoplana)5.苍白杆菌属(Ochrobactrum)6.(Pseudochrobactrum)6.黏着杆菌科(Cohaesibacteraceae)1.黏着杆菌属(Cohaesibacter)7.生丝微菌科(Hyphomicrobiaceae)1.(Ancalomicrobium)2.(Angulomicrobium)3.水杆菌属(Aquabacter)4.芽绿菌属(Blastochloris)5.(Devosia)6.(Dichotomicrobium)7.(Filomicrobium)8.(Gemmiger)9.生丝微菌属(Hyphomicrobium)10.(Methylorhabdus)11.土微菌属(Pedomicrobium)12.突柄微菌属(Prosthecomicrobium)13.红微菌属(Rhodomicrobium)14.(Rhodoplanes)15.(Seliberia)8.甲基杆菌科(Methylobacteriaceae)1.(Meganema)2.甲基杆菌属(Methylobacterium)3.(Microvirga)4.(Protomonas)9.甲基孢囊菌科(Methylocystaceae)1.(Albibacter)2.甲基孢囊菌属(Methylocystis)3.(Methylopila)4.(Methylosinus)5.(Pleomorphomonas)6.(Terasakiella)10.叶杆菌科(Phyllobacteriaceae)1.(Aminobacter)2.(Aquamicrobium)3.(Defluvibacter)4.(Hoeflea)5.中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)6.(Nitratireductor)7.叶杆菌属(Phyllobacterium)。
细菌分类表(按ldquo界门纲目科属种rdquo分类)041019130354
衣原体纲(Chlamydiae) 6 绿菌门(Chlorobi) o 6.1 绿菌纲(Chlorobia) 7 绿弯菌门(Chloroflexi) o 7.1 厌氧绳菌纲(Anaerolineae) o 7.2 暖绳菌纲(Caldilineae) o 7.3 绿弯菌纲(Chloroflexi) 8 产金菌门(Chrysiogenetes) o 8.1 产金菌纲(Chrysiogenetes) 9 蓝藻门(Cyanobacteria) o 9.1 蓝藻纲(Cyanobacteria) 10 脱铁杆菌门(Deferribacteres) o 10.1 脱铁杆菌纲(Deferribacteres) 11 异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus) o 11.1 异常球菌纲(Deinococci) 12 网团菌门(Dictyoglomi) o 12.1 网团菌纲(Dictyoglomi) 13 纤维杆菌门(Fibrobacteres) o 13.1 纤维杆菌纲(Fibrobacteres) 14 厚壁菌门(Firmicutes)（低 G+C革兰氏阳性菌） o 14.1 芽孢杆菌纲(Bacilli) o 14.2 梭菌纲(Clostridia) o 14.3 热石杆菌纲(Thermolithobacteria) 15 梭杆菌门(Fusobacteria) o 15.1 梭杆菌纲(Fusobacteria) 16 芽单胞菌门(Gemmatimonadetes) o 16.1 芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes) 17 黏胶球形菌门(Lentisphaerae) o 17.1 黏胶球形菌纲(Lentisphaerae) 18 硝化螺旋菌门(Nitrospirae) o 18.1 硝化螺旋菌纲(Nitrospira) 19 浮霉菌门(Planctomycetes) o 19.1 浮霉菌纲(Planctomycetacia) 20 海绵杆菌门(Poribacteria)* 21 变形菌门(Proteobacteria) o 21.1 α -变形菌纲(Alphaproteobacteria) o 21.2 β -变形菌纲(Betaproteobacteria) o 21.3 δ -变形菌纲(Deltaproteobacteria) o 21.4 ε -变形菌纲(Epsilonproteobacteria) o 21.5 γ -变形菌纲(Gammaproteobacteria) 22 螺旋体门(Spirochaetes) o 22.1 螺旋体纲(Spirochaetes) 23 柔膜菌门(Tenericutes) o 23.1 柔膜菌纲(Mollicutes)
细菌分类表按界门纲目科属种分类
细菌分类表（按“界门纲目科属种”分类）生物分类总表生物病毒分类表古菌分类表细菌分类表原生生物分类表藻类分类表 (NCBI)真菌分类表植物分类表植物分类表 (NCBI)APG I、II、III克朗奎斯特分类动物分类表软体动物分类表环节动物分类表昆虫分类表鱼类分类表两栖动物分类表爬行动物分类表鸟类传统分类系统鸟类DNA分类系统鹦形目分类表哺乳动物分类表翼手目分类表• 1 酸杆菌门(Acidobacteria)o 1.1 酸杆菌纲(Acidobacteria)o 1.2 全噬菌纲(Holophagae)• 2 放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌）o 2.1 放线菌纲(Actinobacteria)• 3 产水菌门(Aquificae)o 3.1 产水菌纲(Aquificae)• 4 拟杆菌门(Bacteroidetes)o 4.1 拟杆菌纲(Bacteroidetes)o 4.2 黄杆菌纲(Flavobacteria)o 4.3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)o 4.4 纲未定• 5 衣原体门(Chlamydiae)o 5.1 衣原体纲(Chlamydiae)• 6 绿菌门(Chlorobi)o 6.1 绿菌纲(Chlorobia)•7 绿弯菌门(Chloroflexi)o7.1 厌氧绳菌纲(Anaerolineae)o7.2 暖绳菌纲(Caldilineae)o7.3 绿弯菌纲(Chloroflexi)•8 产金菌门(Chrysiogenetes)o8.1 产金菌纲(Chrysiogenetes)•9 蓝藻门(Cyanobacteria)o9.1 蓝藻纲(Cyanobacteria)•10 脱铁杆菌门(Deferribacteres)o10.1 脱铁杆菌纲(Deferribacteres)•11 异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus) o11.1 异常球菌纲(Deinococci)•12 网团菌门(Dictyoglomi)o12.1 网团菌纲(Dictyoglomi)•13 纤维杆菌门(Fibrobacteres)o13.1 纤维杆菌纲(Fibrobacteres)•14 厚壁菌门(Firmicutes)（低G+C革兰氏阳性菌）o14.1 芽孢杆菌纲(Bacilli)o14.2 梭菌纲(Clostridia)o14.3 热石杆菌纲(Thermolithobacteria)•15 梭杆菌门(Fusobacteria)o15.1 梭杆菌纲(Fusobacteria)•16 芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)o16.1 芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes)•17 黏胶球形菌门(Lentisphaerae)o17.1 黏胶球形菌纲(Lentisphaerae)•18 硝化螺旋菌门(Nitrospirae)o18.1 硝化螺旋菌纲(Nitrospira)•19 浮霉菌门(Planctomycetes)o19.1 浮霉菌纲(Planctomycetacia)•20 海绵杆菌门(Poribacteria)*•21 变形菌门(Proteobacteria)o21.1 α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)o21.2 β-变形菌纲(Betaproteobacteria)o21.3 δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)o21.4 ε-变形菌纲(Epsilonproteobacteria)o21.5 γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)•22 螺旋体门(Spirochaetes)o22.1 螺旋体纲(Spirochaetes)•23 柔膜菌门(Tenericutes)o23.1 柔膜菌纲(Mollicutes)•24 热脱硫杆菌门(Thermodesulfobacteria)o24.1 热脱硫杆菌纲(Thermodesulfobacteria)•25 热微菌门(Thermomicrobia)o25.1 热微菌纲(Thermomicrobia)•26 热袍菌门(Thermotogae)o26.1 热袍菌纲(Thermotogae)•27 疣微菌门(Verrucomicrobia)o27.1 丰祐菌纲(Opitutae)o27.2 疣微菌纲(Verrucomicrobiae)•28 门未定o28.1 纤线杆菌纲(Ktedonobacteria)酸杆菌门(Acidobacteria)酸杆菌纲(Acidobacteria)1.酸杆菌目(Acidobacteriales)1.酸杆菌科(Acidobacteriaceae)1.酸杆菌属(Acidobacterium)2.(Edaphobacter)3.(Terriglobus)全噬菌纲(Holophagae)1.石鳖杆菌目(Acanthopleuribacterales)1.石鳖杆菌科(Acanthopleuribacteraceae)1.石鳖杆菌属(Acanthopleuribacter)2.全噬菌目(Holophagales)1.全噬菌科(Holophagaceae)1.地发菌属(Geothrix)2.全噬菌属(Holophaga)放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌）放线菌纲(Actinobacteria)1.酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)1.酸微菌目(Acidimicrobiales)1.酸微菌亚目(Acidimicrobineae)1.酸微菌科(Acidimicrobiaceae)1.酸微菌属(Acidimicrobium)2.(Iamiaceae)1.(Iamia)2.放线菌亚纲(Actinobacteridae)1.放线菌目(Actinomycetales)1.放线菌亚目(Actinomycineae)1.放线菌科(Actinomycetaceae)1.放线棒菌属(Actinobaculum)2.放线菌属(Actinomyces)3.隐秘杆菌属(Arcanobacterium)4.(Falcivibrio)5.动弯杆菌属(Mobiluncus)6.(Varibaculum)2.(Actinopolysporineae)1.(Actinopolysporaceae)1.(Actinopolyspora)3.(Catenulisporineae)1.(Actinospicaceae)1.(Actinospica)2.(Catenulisporaceae)1.(Catenulispora)4.棒杆菌亚目(Corynebacterineae)1.棒杆菌科(Corynebacteriaceae)1.(Bacterionema)2.(Caseobacter)3.棒杆菌属(Corynebacterium)4.(Turicella)2.迪茨氏菌科(Dietziaceae)1.迪茨氏菌属(Dietzia)3.分枝杆菌科(Mycobacteriaceae)1.分枝杆菌属(Mycobacterium) （含结核杆菌）4.诺卡氏菌科(Nocardiaceae)1.戈登氏菌属(Gordonia)2.(Micropolyspora)3.(Millisia)4.诺卡氏菌属(Nocardia)5.红球菌属(Rhodococcus)6.斯科曼氏菌属(Skermania)7.(Williamsia)8.(Smaragdicoccus)5.(Segniliparaceae)1.(Segniliparus)6.束村氏菌科(Tsukamurellaceae)1.束村氏菌属(Tsukamurella)5.弗兰克氏菌亚目(Frankineae)1.酸热菌科(Acidothermaceae)1.酸热菌属(Acidothermus)2.弗兰克氏菌科(Frankiaceae)1.弗兰克氏菌属(Frankia)3.地嗜皮菌科(Geodermatophilaceae)1.芽球菌属(Blastococcus)2.地嗜皮菌属(Geodermatophilus)3.(Modestobacter)4.(Kineosporiaceae)1.(Cryptosporangium)2.(Kineococcus)3.(Kineosporia)5.(Nakamurellaceae)1.(Humicoccus)2.(Nakamurella)3.(Quadrisphaera)6.孢鱼菌科(Sporichthyaceae)1.孢鱼菌属(Sporichthya)6.糖霉菌亚目(Glycomycineae)1.糖霉菌科(Glycomycetaceae)1.糖霉菌属(Glycomyces)2.(Stackerbrandtia)7.微球菌亚目(Micrococcineae)1.获山氏菌科(Beutenbergiaceae)1.获山氏菌属(Beutenbergia)2.乔治菌属(Georgenia)3.萨勒河菌属(Salana)2.博戈里亚湖菌科(Bogoriellaceae)1.博戈里亚湖菌属(Bogoriella)3.短杆菌科(Brevibacteriaceae)1.短杆菌属(Brevibacterium)4.纤维素单胞菌科(Cellulomonadaceae)1.纤维素单胞菌属(Cellulomonas)2.厄氏菌属(Oerskovia)3.(Tropheryma)5.(Dermabacteraceae)1.(Brachybacterium)2.(Dermabacter)6.(Dermacoccaceae)1.(Demetria)2.(Dermacoccus)3.(Kytococcus)7.(Dermatophilaceae)1.(Dermatophilus)2.(Kineosphaera)8.(Intrasporangiaceae)1.(Arsenicicoccus)2.(Humihabitans)3.(Intrasporangium)4.(Janibacter)5.(Knoellia)6.(Kribbia)7.(Lapillicoccus)8.(Ornithinicoccus)9.(Ornithinimicrobium)10.(Oryzihumus)11.(Serinicoccus)12.(Terrabacter)13.(Terracoccus)14.(Tetrasphaera)9.(Jonesiaceae)1.(Jonesia)10.(Microbacteriaceae)1.(Agreia)2.(Agrococcus)3.(Agromyces)4.(Aureobacterium)5.(Clavibacter)6.(Cryobacterium)7.(Curtobacterium)8.(Frigoribacterium)9.(Frondicola)10.(Gulosibacter)11.(Labedella)12.(Leifsonia)13.(Leucobacter)14.(Microbacterium)15.(Microcella)16.(Mycetocola)17.(Okibacterium)18.(Plantibacter)19.(Pseudoclavibacter)20.(Rathayibacter)21.(Rhodoglobus)22.(Salinibacterium)23.(Subtercola)24.(Yonghaparkia)25.(Zimmermannella)11.微球菌科(Micrococcaceae)1.(Acaricomes)2.节杆菌属(Arthrobacter)3.(Citricoccus)4.(Kocuria)5.微球菌属(Micrococcus)6.(Nesterenkonia)7.(Renibacterium)8.罗氏菌属(Rothia)9.口腔球菌属(Stomatococcus)10.刘志恒菌属(Zhihengliuella)12.(Promicromonosporaceae)1.(Cellulosimicrobium)2.(Isoptericola)3.(Myceligenerans)4.(Promicromonospora)5.(Xylanibacterium)6.(Xylanimonas)13.(Rarobacteraceae)1.(Rarobacter)14.(Sanguibacteraceae)1.血杆菌属(Sanguibacter)15.(Yaniaceae)1.(Yania)16.科未定1.(Actinotalea)2.(Demequina)3.(Phycicoccus)4.(Ruania)8.微单孢菌亚目(Micromonosporineae)1.微单孢菌科(Micromonosporaceae)1.(Actinocatenispora)2.(Actinoplanes)3.(Amorphosporangium)4.(Ampullariella)5.(Asanoa)6.(Catellatospora)7.(Catenuloplanes)8.(Couchiolanes)9.(Dactylosporangium)10.(Krasilnikovia)11.(Longispora)12.(Luedemannella)13.微单孢菌属(Micromonospora)14.(Pilimelia)15.(Planopolyspora)16.(Polymorphospora)17.(Salinispora)18.(Spirilliplanes)19.(Verrucosispora)20.(Virgisporangium)9.丙酸杆菌亚目(Propionibacterineae)1.(Nocardioidaceae)1.(Actinopolymorpha)2.(Aeromicrobium)3.(Friedmanniella)4.(Hongia)5.(Kribbella)6.(Marmoricola)7.(Micropruina)8.(Nocardioides)9.(Pimelobacter)10.(Propionicicella)11.(Propionicimonas)2.丙酸杆菌科(Propionibacteriaceae)1.河口微菌属(Aestuariimicrobium)2.(Arachnia)3.(Brooklawnia)4.(Granulicoccus)5.江氏菌属(Jiangella)6.(Luteococcus)7.(Microlunatus)8.丙酸杆菌属(Propionibacterium)9.(Propioniferax)10.(Propionimicrobium)11.(Tessaracocccus)10.(Pseudonocardineae)1.(Actinosynnemataceae)1.(Actinokineospora)2.(Actinosynnema)3.(Lechevalieria)4.(Lentzea)5.(Saccharothrix)6.(Umezawaea)2.(Pseudonocardiaceae)1.(Actinoalloteichus)2.(Actinobispora)3.(Amycolata)4.(Amycolatopsis)5.(Crossiella)6.(Faenia)7.(Goodfellowia)8.(Kibdelosporangium)9.(Kutzneria)10.(Prauserella)11.(Pseudoamycolata)12.(Pseudonocardia)13.(Saccharomonospora)14.(Saccharopolyspora)15.(Streptoalloteichus)16.(Thermobispora)17.(Thermocrispum)11.链霉菌亚目(Streptomycineae)1.链霉菌科(Sterptomycetaceae)1.(Actinopycnidium)2.(Actinosporangium)3.(Chainia)4.(Elytrosporangium)5.北里菌属(Kitasatoa)6.北里孢菌属(Kitasatospora)7.(Microellobosporia)8.(Streptacidiphilus)9.链霉菌属(Streptomyces)10.(Streptoverticillium) 12.(Streptosporangineae)1.(Nocardiopsaceae)1.(Nocardiopsis)2.(Streptomonospora)3.(Thermobifida)2.(Streptosporangiaceae)1.(Acrocarpospora)2.(Herbidospora)3.(Microbispora)4.(Microtetraspora)5.(Nonomuraea)6.(Planobispora)7.(Planomonospora)8.(Planotetraspora)9.(Sphaerisporangium)10.(Streptosporangium)11.(Thermopolyspora)3.(Thermomonosporaceae)1.珊瑚状放线菌属(Actinocorallia)2.(Actinomadura)3.(Excellospora)4.(Spirillospora)5.(Thermomonospora)2.双歧杆菌目(Bifidobacteriales)1.双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)1.(Aeriscardovia)2.(Alloscardovia)3.双歧杆菌属(Bifidobacterium)4.(Gardnerella)5.(Metascardovia)6.(Parascardovia)7.(Scardovia)2.科未定3.(Coriobacteridae)1.(Coriobacteriales)1.(Coriobacterineae)1.(Coriobacteriaceae)1.奇异菌属(Atopobium)2.(Collinsella)3.(Coriobacterium)4.(Cryptobacterium)5.(Denitrobacterium)6.(Eggerthella)7.(Olsenella)8.(Slackia)4.红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)1.红色杆菌目(Rubrobacterales)1.红色杆菌亚目(Rubrobacterineae)1.(Conexibacteraceae)1.(Conexibacter)2.(Patulibacteraceae)1.(Patulibacter)3.红色杆菌科(Rubrobacteraceae)1.红色杆菌属(Rubrobacter)4.(Solirubrobacteraceae)1.(Solirubrobacter)5.(Thermoleophilaceae)1.(Thermoleophilum)5.球形杆菌亚纲(Sphaerobacteridae)1.球形杆菌目(Sphaerobacterales)1.球形杆菌亚目(Sphaerobacterineae)1.球形杆菌科(Sphaerobacteraceae)1.球形杆菌属(Sphaerobacter) 产水菌门(Aquificae)产水菌纲(Aquificae)1.产水菌目(Aquificales)1.产水菌科(Aquificaceae)1.产水菌属(Aquifex)2.(Calderobacterium)3.(Hydrogenivirga)4.(Hydrogenobacter)5.(Hydrogenobaculum)6.(Thermocrinis)2.除硫杆菌科(Desulfurobacteriaceae)1.(Balnearium)2.除硫杆菌属(Desulfurobacterium)3.热弧菌属(Thermovibrio)3.(Hydrogenothermaceae)1.(Hydrogenothermus)2.(Persephonella)3.(Sulfurihydrogenibium)拟杆菌门(Bacteroidetes)拟杆菌纲(Bacteroidetes)1.拟杆菌目(Bacteroidales)1.拟杆菌科(Bacteroidaceae)1.(Acetomicrobium)2.(Anaerophaga)3.(Anaerorhabdus)4.拟杆菌属(Bacteroides)5.(Pontibacter)2.紫单胞菌科(Porphyromonadaceae)1.(Barnesiella)2.(Capsularis)3.(Dysgonomonas)4.(Hallella)5.(Odoribacter)6.(Oribaculum)7.(Paludibacter)8.(Parabacteroides)9.紫单胞菌属(Porphyromonas) （多译作“卟啉单胞菌”，但porphyro-应来源于希腊语“紫色”）10.(Proteiniphilum)11.(Tannerella)12.(Xylanibacter)3.普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)1.普雷沃氏菌属(Prevotella) （或译作“普氏菌”）4.理研菌科(Rikenellaceae)1.(Alistipes)2.(Alkaliflexus)3.(Marinilabilia)4.(Petrimonas)5.理研菌属(Rikenella) （注：Riken是日语“理化学研究所”简称）5.科未定1.(Acetofilamentum)2.(Acetothermus)黄杆菌纲(Flavobacteria)1.黄杆菌目(Flavobacteriales)1.蟑螂杆状体科(Blattabacteriaceae)1.蟑螂杆状体属(Blattabacterium)2.(Cryomorphaceae)1.(Algoriphagus)2.(Brumimicrobium)3.(Crocinitomix)4.(Cryomorpha)5.(Fluviicola)6.李时珍菌属(Lishizhenia)7.(Owenweeksia)3.黄杆菌科(Flavobacteriaceae)1.(Actibacter)2.(Aequorivita)3.(Algibacter)4.(Aquimarina)5.(Arenibacter)6.伯杰菌属(Bergeyella)7.(Bizionia)8.碳酸噬胞菌属(Capnocytophaga) （注：多译作“二氧化碳噬纤维菌属”）9.噬纤维素菌属(Cellulophaga)10.金黄杆菌属(Chryseobacterium)11.(Cloacibacterium)12.(Coenonia)13.(Costertonia)14.(Croceibacter)15.独岛菌属(Dokdonia)16.东海菌属(Donghaeana)17.(Elizabethkingia)18.(Empedobacter)19.(Epilithonimonas)20.(Flaviramulus)21.黄杆菌属(Flavobacterium)22.(Formosa)23.泥滩杆菌属(Gaetbulibacter)24.泥滩微菌属(Gaetbulimicrobium)25.(Galbibacter)26.(Gelidibacter)27.(Gillisia)28.(Gilvibacter)29.革兰菌属(Gramella)30.(Kaistella)31.(Kordia)32.(Krokinobacter)33.(Lacinutrix)34.列文虎克菌属(Leeuwenhoekiella)35.(Lutibacter)36.(Maribacter)37.(Mariniflexile)38.(Marixanthomonas)39.(Mesonia)40.(Muricauda)41.(Myroides)42.(Nonlabens)43.(Olleya)44.(Ornithobacterium)45.(Persicivirga)46.(Pibocella)47.极地杆菌属(Polaribacter)48.冷弯菌属(Psychroflexus)49.(Psychroserpens)50.(Riemerella)51.(Robiginitalea)52.(Salegentibacter)53.(Sandarakinotalea)54.(Sediminibacter)55.(Sediminicola)56.世宗菌属(Sejongia)57.(Stanierella)58.(Stenothermobacter)59.(Subsaxibacter)60.(Subsaximicrobium)61.(Tamlana)62.(Tenacibaculum)63.(Ulvibacter)64.(Vitellibacter)65.(Wautersiella)66.(Weeksella)67.(Winogradskyella)68.丽水菌属(Yeosuana)69.(Zeaxanthinibacter)70.周氏菌属(Zhouia)71.(Zobellia)72.王祖农菌属(Zunongwangia) 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)1.鞘脂杆菌目(Sphingobacteriales)1.泉发菌科(Crenotrichaceae)1.(Balneola)2.(Chitinophaga)3.泉发菌属(Crenothrix)4.(Rhodothermus)5.(Salinibacter)6.(Terrimonas)7.(Toxothrix)2.(Flammeovirgaceae)1.(Flammeovirga)2.(Flexithrix)3.(Perexilibacter)4.(Persicobacter)5.(Rapidithrix)6.(Sediminitomix)7.(Thermonema)3.屈挠杆菌科(Flexibacteraceae)1.(Adhaeribacter)2.(Aquiflexum)3.(Arcicella)4.(Belliella)5.(Chimaereicella)6.(Cyclobacterium)7.噬胞菌属(Cytophaga) （注：目前多称此属为“噬纤维菌属”，此处依拉丁文）8.(Dyadobacter)9.(Echinicola)10.(Effluviibacter)11.(Emticicia)12.(Fabibacter)13.(Flectobacillus)14.屈挠杆菌属(Flexibacter)15.(Hongiella)16.(Hymenobacter)17.(Larkinella)18.(Leadbetterella)19.(Marinicola)20.(Meniscus)21.(Microscilla)22.(Niastella)23.(Persicitalea)24.(Reichenbachiella)25.(Rhodonellum)26.(Roseivirga)27.(Runella)28.(Spirosoma)29.生孢噬胞菌属(Sporocytophaga)4.腐螺旋菌科(Saprospiraceae)1.(Aureispira)2.(Haliscomenobacter)3.(Lewinella)4.腐螺旋菌属(Saprospira)5.鞘脂杆菌科(Sphingobacteriaceae)1.(Mucilaginibacter)2.(Olivibacter)3.(Parapedobacter)4.(Pedobacter)5.(Pseudosphingobacterium)6.鞘脂杆菌属(Sphingobacterium)6.科未定1.(Niabella)纲未定1.(Flavisolibacter)2.(Fulvivirga)3.(Prolixibacter)4.(Segetibacter)衣原体门(Chlamydiae)衣原体纲(Chlamydiae)1.衣原体目(Chlamydiales)1.衣原体科(Chlamydiaceae)1.衣原体属(Chlamydia)2.嗜衣体属(Chlamydophila)2.副衣原体属(Parachlamydiaceae)1.新衣原体属(Neochlamydia)2.副衣原体属(Parachlamydia)3.芯卡体科(Simkaniaceae)1.芯卡体属(Simkania) （注：人名缩写简称，此处用音译）2.棍衣原体属(Rhabdochlamydia)*4.华诊体科(Waddliaceae)1.华诊体属(Waddlia) （注：WADDL为“华盛顿动物病诊断实验室”缩写）绿菌门(Chlorobi)绿菌纲(Chlorobia)1.绿菌目(Chlorobiales)1.绿菌科(Chlorobiaceae)1.臂绿菌属(Ancalochloris)2.绿棒菌属(Chlorobaculum)3.绿菌属(Chlorobium)4.绿爬菌属(Chloroherpeton)5.暗网菌属(Pelodictyon)6.突柄绿菌属(Prosthecochloris)绿弯菌门(Chloroflexi)厌氧绳菌纲(Anaerolineae)1.厌氧绳菌目(Anaerolineales)1.厌氧绳菌科(Anaerolineaceae)1.厌氧绳菌属(Anaerolinea)2.(Bellilinea)3.纤绳菌属(Leptolinea)4.(Levilinea)5.长绳菌属(Longilinea)暖绳菌纲(Caldilineae)1.暖绳菌目(Caldilineales)1.暖绳菌科(Caldilineaceae)1.暖绳菌属(Caldilinea)绿弯菌纲(Chloroflexi)1.绿弯菌目(Chloroflexales)1.绿弯菌科(Chloroflexaceae)1.绿弯菌属(Chloroflexus)2.绿线菌属(Chloronema)3.太阳发菌属(Heliothrix)4.玫瑰弯菌属(Roseiflexus)2.颤绿菌科(Oscillochloridaceae)1.颤绿菌属(Oscillochloris)2.爬管菌目(Herpetosiphonales)1.爬管菌科(Herpetosiphonaceae)1.爬管菌属(Herpetosiphon) 产金菌门(Chrysiogenetes) 产金菌纲(Chrysiogenetes)1.产金菌目(Chrysiogenales)1.产金菌科(Chrysiogenaceae)1.产金菌属(Chrysiogenes)蓝藻门(Cyanobacteria)蓝藻纲(Cyanobacteria)1.第一目（色球藻目(Chroococcales)）@1.第一科@1.管孢藻属(Chamaesiphon)@2.色球藻属(Chroococcus)@3.(Cyanobacterium)@4.(Cyanobium)@5.(Cyanothece)@6.蓝纤维藻属(Dactylococcopsis)@7.(Gloeobacter)@8.黏球藻属(Gloeocapsa)@9.黏杆藻属(Gloeothece)@10.微囊藻属(Microcystis)@11.原绿球藻属(Prochlorococcus)@12.原绿藻属(Prochloron)@13.聚球藻属(Synechococcus)@14.集胞藻属(Synechocystis)@2.第二目（宽球藻目(Pleurocapsales)）@1.第一科@1.(Cyanocystis)@2.(Dermocarpella)@3.(Stanieria)@4.异球藻属(Xenococcus)@2.第二科@1.拟色球藻属(Chroococcidiopsis)@2.黏囊藻属(Myxosarcina)@3.宽球藻属(Pleurocapsa)@3.第三目（颤藻目(Oscillatoriales)）@1.第一科@1.节螺藻属(Arthrospira)@ （包含商业化螺旋藻）2.(Borzia)@3.(Crinalium)@4.(Geitlerinema)@5.盐螺旋藻属(Halospirulina)6.(Leptolyngbya)@7.(Limnothrix)@8.鞘丝藻属(Lyngbya)@9.微鞘藻属(Microcoleus)@10.颤藻属(Oscillatoria)@11.(Planktothrix)@12.原绿发藻属(Prochlorothrix)@13.(Pseudanabaena)@14.螺旋藻属(Spirulina)@15.(Starria)@16.束藻属(Symploca)@17.束毛藻属(Trichodesmium)18.(Tychonema)@4.第四目（念珠藻目(Nostocales)）@1.第一科@1.鱼腥藻属(Anabaena)@2.项圈藻属(Anabaenopsis)@3.束丝藻属(Aphanizomenon)@4.(Cyanospira)@5.(Cylindrospermopsis)@6.筒孢藻属(Cylindrospermum)@7.节球藻属(Nodularia)@8.念珠藻属(Nostoc)@9.伪枝藻属(Scytonema)@2.第二科@1.眉藻属(Calothrix)@2.胶须藻属(Rivularia)@3.单歧藻属(Tolypothrix)@5.第五目（真枝藻目(Stigonematales)）@1.第一科@1.(Chlorogloeopsis)@2.费氏藻属(Fischerella)@3.(Geitleria)@4.(Iyengariella)@5.拟念珠藻属(Nostochopsis)@6.真枝藻属(Stigonema)@脱铁杆菌门(Deferribacteres) 脱铁杆菌纲(Deferribacteres)1.脱铁杆菌目(Deferribacterales)1.脱铁杆菌科(Deferribacteraceae)1.脱铁杆菌属(Deferribacter)2.(Denitrovibrio)3.(Flexistipes)4.地弧菌属(Geovibrio)5.(Mucispirillum)2.科未定1.暖发菌属(Caldithrix)2.(Synergistes)异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus)异常球菌纲(Deinococci)1.异常球菌目(Deinococcales)1.异常球菌科(Deinococcaceae)1.异常杆菌属(Deinobacter)2.异常球菌属(Deinococcus)2.特吕珀菌科(Trueperaceae)1.特吕珀菌属(Truepera)2.栖热菌目(Thermales)1.栖热菌科(Thermaceae)1.海栖热菌属(Marinithermus)2.亚栖热菌属(Meiothermus)3.海洋栖热菌属(Oceanithermus)4.栖热菌属(Thermus)5.火山栖热菌属(Vulcanithermus)网团菌门(Dictyoglomi)网团菌纲(Dictyoglomi)1.网团菌目(Dictyoglomales)1.网团菌科(Dictyoglomaceae)1.网团菌属(Dictyoglomus)纤维杆菌门(Fibrobacteres)纤维杆菌纲(Fibrobacteres)1.纤维杆菌目(Fibrobacterales)1.纤维杆菌科(Fibrobacteraceae)1.纤维杆菌属(Fibrobacter)厚壁菌门(Firmicutes)（低G+C革兰氏阳性菌）芽孢杆菌纲(Bacilli)1.芽孢杆菌目(Bacillales)1.(Alicyclobacillaceae)1.(Alicyclobacillus)2.(Pasteuria)3.(Sulfobacillus)2.芽孢杆菌科(Bacillaceae)1.(Alkalibacillus)2.(Amphibacillus)3.(Anoxybacillus)4.芽孢杆菌属(Bacillus)5.(Caldalkalibacillus)6.(Cerasibacillus)7.(Exiguobacterium)8.(Filobacillus)9.(Geobacillus)10.(Gracilibacillus)11.(Halalkalibacillus)12.(Halobacillus)13.(Haloactibacillus)14.(Jeotgalibacillus)15.(Lentibacillus)16.(Lysinibacillus)17.(Marinibacillus)18.(Oceanobacillus)19.(Ornithinibacillus)20.(Paraliobacillus)21.(Paucisalibacillus)22.(Pelagibacillus)23.(Piscibacillus)24.(Pontibacillus)25.糖球菌属(Saccharococcus)26.(Salibacillus)27.(Salimicrobium)28.(Salinibacillus)29.(Salirhabdus)30.(Sasuginibacillus)31.(Tenuibacillus)32.(Terribacillus)33.(Thalassobacillus)34.(Ureibacillus)35.(Virgibacillus)36.(Vulcanibacillus)3.(Caryophanaceae)1.(Caryophanon)4.李斯特氏菌科(Listeriaceae)1.环丝菌属(Brochothrix)2.李斯特氏菌属(Listeria)5.(Paenibacillaceae)1.(Ammoniphilus)2.(Aneurinibacillus)3.(Brevibacillus)4.(Cohnella)5.(Oxalophagus)6.(Paenibacillus)7.(Thermicanus)8.(Thermobacillus)6.(Planococcaceae)1.(Filibacter)2.(Kurthia)3.(Planococcus)4.(Planomicrobium)5.(Sporosarcina)7.芽孢乳杆菌科(Sporolactobacillaceae)1.(Marinococcus)2.(Sinococcus)3.芽孢乳杆菌属(Sporolactobacillus)4.(Tuberibacillus)8.葡萄球菌科(Staphylococcaceae)1.孪生菌属(Gemella)2.(Joetgalicoccus)3.(Macrococcus)4.(Salinicoccus)5.葡萄球菌属(Staphylococcus)9.(Thermoactinomycetaceae)1.(Laceyella)2.(Mechercharimyces)3.(Planifilum)4.(Seinonella)5.(Shimazuella)6.(Thermoactinomyces)7.(Thermoflavimicrobium)10.(Turicibacteraceae)1.(Turicibacter)11.科未定1.(Pullulanibacillus)2.乳杆菌目(Lactobacillales)1.气球菌科(Aerococcaceae)1.(Abiotrophia)2.气球菌属(Aerococcus)3.(Dolosicoccus)4.(Eremococcus)5.(Facklamia)6.(Globicatella)7.(Ignavigranum)2.肉杆菌科(Carnobacteriaceae)1.(Agitococcus)2.(Alkalibacterium)3.(Allofustis)4.(Alloiococcus)5.(Atopococcus)6.(Atopostipes)7.肉杆菌属(Carnobacterium)8.德库菌属(Desemzia) （DSMZ，德国微生物与细胞保藏中心）9.(Dolosigranulum)10.(Granulicatella)11.(Isobaculum)12.(Lactosphaera)13.(Marinilactibacillus)14.(Trichococcus)3.肠球菌科(Enterococcaceae)1.(Atopobacter)2.(Catellicoccus)3.肠球菌属(Enterococcus)4.(Melissococcus)5.(Pilibacter)6.(Tetragenococcus)7.漫游球菌属(Vagococcus)4.乳杆菌科(Lactobacillaceae)1.乳杆菌属(Lactobacillus)2.(Paralactobacillus)3.片球菌属(Pediococcus)5.明串珠菌科(Leuconostocaceae)1.明串珠菌属(Leuconostoc)2.(Oenococcus)3.(Weissella)6.颤螺旋菌科(Oscillospiraceae)1.颤杆菌克(Oscillibacter)2.颤螺旋菌属(Oscillospira)7.链球菌科(Streptococcaceae)1.乳球菌属(Lactococcus)2.(Lactovum)3.链球菌属(Streptococcus)8.科未定1.(Acetoanaerobium)2.互营球菌属(Syntrophococcus) 梭菌纲(Clostridia)1.梭菌目(Clostridiales)1.梭菌科(Clostridiaceae)1.(Acetanaerobacterium)2.(Acetivibrio)3.(Acidaminobacter)4.(Alkaliphilus)5.(Anaerobacter)6.(Anaerotruncus)7.(Anoxynatronum)8.(Bryantella)9.(Caloramator)10.(Caloranaerobacter)11.(Caminicella)12.(Clostridiisalibacter)13.梭菌属(Clostridium)14.(Coprobacillus)15.(Dorea)16.(Ethanoligenens)17.(Faecalibacterium)18.(Fastidiosipila)19.(Garciella)20.(Gracilibacter)21.(Guggenheimella)22.(Hespellia)23.(Natronincola)24.(Oxobacter)25.(Parasporobacterium)26.八叠球菌属(Sarcina)27.(Soehngenia)28.(Sporacetigenium)29.(Sporobacter)30.(Subdoligranulum)31.(Tepidibacter)32.(Tepidimicrobium)33.(Thermobrachium)34.(Thermohalobacter)35.(Tindallia)2.优杆菌科(Eubacteriaceae)1.醋杆菌属(Acetobacterium)2.(Alkalibacter)3.(Anaerofustis)4.(Anaerovorax)5.优杆菌属(Eubacterium)6.(Mogibacterium)7.(Pseudoramibacter)3.太阳杆菌科(Heliobacteriaceae)1.太阳杆状菌属(Heliobacillus)2.太阳杆菌属(Heliobacterium)3.嗜日菌属(Heliophilum)4.(Heliorestis)4.毛螺旋菌科(Lachnospiraceae)1.(Acetitomaculum)2.(Anaerofilum)3.(Anaerostipes)4.丁酸弧菌属(Butyrivibrio)5.(Catenibacterium)6.(Catonella)7.粪球菌属(Coprococcus)8.(Johnsonella)9.(Lachnobacterium)10.毛螺旋菌属(Lachnospira)11.(Moryella)12.(Oribacterium)13.假丁酸弧菌属(Pseudobutyrivibrio)14.(Roseburia)15.瘤胃球菌属(Ruminococcus)16.(Shuttleworthia)17.(Sporobacterium)5.消化球菌科(Peptococcaceae)1.(Carboxydothermus)2.(Cryptanaerobacter)3.(Dehalobacter)4.(Desulfitobacterium)5.(Desulfonispora)6.(Desulfosporosinus)7.(Desulfotomaculum)8.(Pelotomaculum)9.消化球菌属(Peptococcus)10.(Syntrophobotulus)11.(Thermincola)12.(Thermoterrabacterium)6.消化链球菌科(Peptostreptococcaceae)1.(Anaerococcus)2.(Filifactor)3.(Finegoldia)4.(Fusibacter)5.(Gallicola)6.(Helcococcus)7.微单胞菌属(Parvimonas) （原名Micromonas）8.(Peptoniphilus)9.消化链球菌属(Peptostreptococcus)10.(Sedimentibacter)11.(Sporanaerobacter)12.(Tissierella)7.互营单胞菌科(Syntrophomonadaceae)1.(Aminiphilus)2.(Aminobacterium)3.(Aminomonas)4.(Anaerobaculum)5.(Anaerobranca)6.(Caldicellulosiruptor)7.(Carboxydocella)8.(Dethiosulfovibrio)9.(Pelospora)10.互营单胞菌属(Syntrophomonas)11.(Syntrophospora)12.互营热菌属(Syntrophothermus)13.(Thermaerobacter)14.(Thermanaerovibrio)15.(Thermohydrogenium)16.(Thermosyntropha)17.(Thermovirga)8.韦荣氏菌科(Veillonellaceae)1.(Acetonema)2.氨基酸球菌属(Acidaminococcus)3.(Allisonella)4.(Anaeroarcus)5.(Anaeroglobus)6.(Anaeromusa)7.(Anaerosinus)8.(Anaerovibrio)9.(Centipeda)10.(Dendrosporobacter)11.(Dialister)12.(Megamonas)13.(Megasphaera)14.光冈菌属(Mitsuokella)15.(Papillibacter)16.(Pectinatus)17.(Pelosinus)18.(Phascolarctobacterium)19.(Propionispira)20.(Propionispora)21.(Quinella)22.(Schwartzia)23.新月形单胞菌属(Selenomonas)24.鼠孢菌属(Sporomusa)25.(Sporotalea)26.(Succiniclasticum)27.(Succinispira)28.(Thermosinus)29.韦荣氏菌属(Veillonella)30.(Zymophilus)9.科未定1.(Anaerovirgula)2.(Dethiosulfatibacter)3.(Geosporobacter)4.(Howardella)5.(Proteiniborus)2.盐厌氧菌目(Halanaerobiales)1.盐厌氧菌科(Halanaerobiaceae)1.盐厌氧菌属(Halanaerobium)2.(Halocella)3.(Haloincola)4.(Halothermothrix)2.盐拟杆菌科(Halobacteroidaceae)1.(Acetohalobium)2.(Halanaerobacter)3.盐拟杆菌属(Halobacteroides)4.(Halonatronum)5.(Natroniella)6.(Orenia)7.(Selenihalanaerobacter)8.(Sporohalobacter)3.盐碱厌氧菌目(Natranaerobiales)1.盐碱厌氧菌科(Natranaerobiaceae)1.盐碱厌氧菌属(Natranaerobius)4.热厌氧杆菌目(Thermoanaerobacteriales)1.热厌氧杆菌科(Thermoanaerobacteriaceae)1.(Acetogenium)2.(Ammonifex)3.(Caldanaerobacter)4.(Carboxydibrachium)5.(Coprothermobacter)6.(Desulfovirgula)7.(Gelria)8.(Mahella)9.(Moorella)10.(Sporotomaculum)11.(Tepidanaerobacter)12.(Thermacetogenium)13.热厌氧单胞菌属(Thermanaeromonas)14.(Thermoanaerobacter)15.(Thermoanaerobium)16.(Thermoanaerobacterium)17.热厌氧菌属(Thermoanaerobium)18.(Thermobacteroides)19.(Thermosediminibacter)20.(Thermovenabulum)2.热脱硫菌科(Thermodesulfobiaceae)1.热脱硫菌属(Thermodesulfobium) 5.目未定1.(Desulfitibacter)2.(Symbiobacterium)热石杆菌纲(Thermolithobacteria)1.热石杆菌目(Thermolithobacterales)1.热石杆菌科(Thermolithobacteraceae)1.热石杆菌属(Thermolithobacter) 梭杆菌门(Fusobacteria)梭杆菌纲(Fusobacteria)1.梭杆菌目(Fusobacteriales)1.梭杆菌科(Fusobacteriaceae)1.梭杆菌属(Fusobacterium)2.(Ilyobacter)3.纤毛菌属(Leptotrichia)4.(Propionigenium)5.(Sebaldella)6.(Sneathia)7.(Streptobacillus)2.科未定1.(Cetobacterium)芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes)1.芽单胞菌目(Gemmatimonadales)1.芽单胞菌科(Gemmatimonadaceae)1.芽单胞菌属(Gemmatimonas)黏胶球形菌门(Lentisphaerae)黏胶球形菌纲(Lentisphaerae)1.黏胶球形菌目(Lentisphaerales)1.黏胶球形菌科(Lentisphaeraceae)1.黏胶球形菌属(Lentisphaera)2.食物谷菌目(Victivallales)1.食物谷菌科(Victivallaceae)1.食物谷菌属(Victivallis)硝化螺旋菌门(Nitrospirae)硝化螺旋菌纲(Nitrospira)1.硝化螺旋菌目(Nitrospirales)1.硝化螺旋菌科(Nitrospiraceae)1.钩端螺菌属(Leptospirillum)2.硝化螺旋菌属(Nitrospira)3.磁杆菌属(Magnetobacterium)*4.热脱硫弧菌属(Thermodesulfovibrio) 浮霉菌门(Planctomycetes)浮霉菌纲(Planctomycetacia)1.浮霉菌目(Planctomycetales)1.浮霉菌科(Planctomycetaceae)1.(Blastopirellula)2.(Gemmata)3.(Isosphaera)4.小梨形菌属(Pirellula)5.浮霉菌属(Planctomycetes)6.红小梨形菌属(Rhodopirellula)7.(Schlesneria)2.科未定（均未能分离培养，见厌氧氨氧化菌）1.(Brocadia)*2.(Kuenenia)*3.(Scalindua)*海绵杆菌门(Poribacteria)*变形菌门(Proteobacteria)α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)1.柄杆菌目(Caulobacterales)1.柄杆菌科(Caulobacteraceae)1.(Asticcacaulis)2.短波单胞菌属(Brevundimonas)3.柄杆菌属(Caulobacter)4.苯基杆菌属(Phenylobacterium)2.(Kordiimonadales)1.(Kordiimonadaceae)1.(Kordiimonas)3.短小盒菌目(Parvularculales)1.短小盒菌科(Parvularculaceae)1.短小盒菌属(Parvularcula)4.根瘤菌目(Rhizobiales)1.橙单胞菌科(Aurantimonadaceae)1.橙单胞菌属(Aurantimonas)2.(Fulvimarina)3.(Martelella)2.巴通体科(Bartonellaceae)1.巴通体属(Bartonella)3.(Rochalimaea)3.拜叶林克氏菌科(Beijerinckiaceae)1.拜叶林克氏菌属(Beijerinckia)2.(Chelatococcus)3.(Methylocapsa)4.(Methylocella)4.慢生根瘤菌科(Bradyrhizobiaceae)1.阿菲波菌属(Afipia)2.农单胞菌属(Agromonas)3.(Balneimonas)4.芽生杆菌属(Blastobacter)5.(Bosea)6.慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)7.硝化杆菌属(Nitrobacter)8.(Oligotropha)9.(Rhodoblastus)10.红假单胞菌属(Rhodopseudomonas) 5.布鲁氏菌科(Brucellaceae)1.布鲁氏菌属(Brucella)2.(Crabtreella)3.(Daeguia)4.支动菌属(Mycoplana)5.苍白杆菌属(Ochrobactrum)6.(Pseudochrobactrum)6.黏着杆菌科(Cohaesibacteraceae)1.黏着杆菌属(Cohaesibacter)7.生丝微菌科(Hyphomicrobiaceae)1.(Ancalomicrobium)2.(Angulomicrobium)3.水杆菌属(Aquabacter)4.芽绿菌属(Blastochloris)5.(Devosia)6.(Dichotomicrobium)7.(Filomicrobium)8.(Gemmiger)9.生丝微菌属(Hyphomicrobium)10.(Methylorhabdus)11.土微菌属(Pedomicrobium)12.突柄微菌属(Prosthecomicrobium)13.红微菌属(Rhodomicrobium)14.(Rhodoplanes)15.(Seliberia)8.甲基杆菌科(Methylobacteriaceae)。
细菌分类大全之欧阳歌谷创编
革兰氏阳性菌欧阳歌谷（2021.02.01）革兰氏阳性菌革兰氏染色法的意义就在于鉴别细菌，把众多的细菌分为两大类，革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。
大多数化脓性球菌都属于革兰氏氏阳性菌，它们能产生外毒素使人致病，而大多数肠道菌多属于革兰氏阴性菌，它们产生内毒素，靠内毒素使人致病。
常见的革兰氏阳性菌有：葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等；常见的革兰氏阴性菌有痢疾杆菌、伤寒杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、绿脓杆菌、百日咳杆菌、霍乱弧菌及脑膜炎双球菌等。
在治疗上，大多数革兰氏阳性菌都对青霉素敏感（结核杆菌对青霉素不敏感）；而革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感（但奈瑟氏菌中的流行性脑膜炎双球菌和淋病双球菌对青霉素敏感），而对链霉素、氯霉素等敏感。
所以首先区分病原菌是革兰氏阳性菌还是阴性菌，在选择抗生素方面意义重大。
革兰氏阴性菌,大多数肠道菌多属于革兰氏阴性菌，它们产生内毒素，靠内毒素使人致病.常见的革兰氏阴性菌有痢疾杆菌、伤寒杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、绿脓杆菌、百日咳杆菌、霍乱弧菌及脑膜炎双球菌等。
革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感,可以选择氟喹诺酮类药物如诺氟沙星，左氧氟沙星等，也可以选择大环内酯类比如克拉霉素、罗红霉素等。
革兰氏阳性菌，大多数化脓性球菌都属于革兰氏阳性菌，它们能产生外毒素使人致病，常见的革兰氏阳性菌有：葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等。
可以选择青霉素族，头孢曲松钠等。
革兰氏阴性菌，以[大肠杆菌]为代表。
大肠杆菌为兼气性菌种，一般生存于肠道中及厌氧的还境中。
革兰氏阴性菌细胞壁的特征为有一层outer membrane 与阳性菌种不同。
目前对大肠杆菌的研究很多，除了它是一般食物中是否有被污染的指标外，很多分子生物学方面的研究皆需要使用到大肠杆菌当作实验宿主。
除了大肠杆菌外，变形杆菌、痢疾杆菌、肺炎杆菌、布氏杆菌、产气夹膜杆菌、流感(嗜血)杆菌、副流感(嗜血)杆菌、卡他(摩拉)菌、不动杆菌属、耶尔森菌属、嗜肺军团菌、百日咳杆菌、副百日咳杆菌、志贺菌属、巴斯德菌属、霍乱弧菌、副溶血性杆菌、类志贺吡邻单胞菌等也是革兰氏阴性菌革兰氏阳性菌与阴性菌常见的革兰氏阳性菌葡萄球菌属，链球菌属，李式杆菌属，丹毒丝菌属，肾杆菌属，芽孢杆菌属，梭菌属，分支杆菌属，放线菌属，奴卡菌属，棒状杆菌属，红球菌属，炭疽杆菌丹毒杆菌破伤风杆菌李氏杆菌产气荚莫杆菌气肿疽杆菌结核杆菌。
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革兰氏阳性菌
革兰氏阳性菌
革兰氏染色法的意义就在于鉴别细菌，把众多的细菌分为两大类，革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。
大多数化脓性球菌都属于革兰氏氏阳性菌，它们能产生外毒素使人致病，而大多数肠道菌多属于革兰氏阴性菌，它们产生内毒素，靠内毒素使人致病。
常见的革兰氏阳性菌有：葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白
喉杆菌、破伤风杆菌等；常见的革兰氏阴性菌有痢疾杆菌、伤寒杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、绿脓杆菌、百日咳杆菌、霍乱弧菌及脑膜炎双球菌等。
在治疗上，大多数革兰氏阳性菌都对青霉素敏感（结核杆菌对青霉素
不敏感）；而革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感（但奈瑟氏菌中的流行性脑膜炎双球菌和淋病双球菌对青霉素敏感），而对链霉素、氯霉素等敏感。
所以首先区分病原菌是革兰氏阳性菌还是阴性菌，在选择抗生素方面意义重大。
革兰氏阴性菌,大多数肠道菌多属于革兰氏阴性菌，它们产生内毒素，靠内毒素
使人致病.常见的革兰氏阴性菌有痢疾杆菌、伤寒杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、
绿脓杆菌、百日咳杆菌、霍乱弧菌及脑膜炎双球菌等。
革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感,可以选择氟喹诺酮类药物如诺氟沙星，左氧氟沙星等，也可以选择大环
内酯类比如克拉霉素、罗红霉素等。
革兰氏阳性菌，大多数化脓性球菌都属于革兰氏阳性菌，它们能产生外毒
素使人致病，常见的革兰氏阳性菌有：葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等。
可以选择青霉素族，头孢曲松钠等。
革兰氏阴性菌，以[大肠杆菌]为代表。
大肠杆菌为兼气性菌种，一般生存
于肠道中及厌氧的还境中。
革兰氏阴性菌细胞壁的特征为有一层outer membrane 与阳性菌种不同。
目前对大肠杆菌的研究很多，除了它是一般食
物中是否有被污染的指标外，很多分子生物学方面的研究皆需要使用到大
肠杆菌当作实验宿主。
除了大肠杆菌外，变形杆菌、痢疾杆菌、肺炎杆菌、布氏杆菌、产气夹膜杆菌、流感(嗜血)杆菌、副流感(嗜血)杆菌、卡他(摩拉)菌、不动杆菌属、耶尔森菌属、嗜肺军团菌、百日咳杆菌、副百日咳杆菌、志贺
菌属、巴斯德菌属、霍乱弧菌、副溶血性杆菌、类志贺吡邻单胞菌等也是
革兰氏阴性菌
革兰氏阳性菌与阴性菌
常见的革兰氏阳性菌
葡萄球菌属，链球菌属，李式杆菌属，丹毒丝菌属，肾杆菌属，芽孢杆菌属，梭菌属，分支杆菌属，放线菌属，奴卡菌属，棒状杆菌属，红球菌属，炭疽杆菌丹毒杆菌破伤风杆菌李氏杆菌产气荚莫杆菌气肿疽杆菌结核杆菌。
当然，也少不了哪些是——
常见的革兰氏阴性菌
除了大肠杆菌外，变形杆菌、痢疾杆菌、肺炎杆菌、布氏杆菌、产气夹膜杆菌、流感（嗜血）杆菌、副流感（嗜血）杆菌、卡他（摩拉）菌、不动杆菌属、
耶尔森菌属、嗜肺军团菌、百日咳杆菌、副百日咳杆菌、志贺菌属、巴斯德菌属、霍乱弧菌、副溶血性杆菌等也是革兰氏阴性菌。
混了这么久，我要怯怯地提点意见哦。
这些细菌名字太复杂了哟！
革兰菌简表
类菌名
G+球菌金黄色葡萄球菌（葡萄球菌属）乙型溶血性链球（链球菌属）肺炎链球菌（链球菌属）
G-球菌
淋球菌
脑膜炎双球菌（奈瑟菌属）
G+杆菌白喉杆菌(棒状杆菌属)
结核杆菌(分支杆菌属) 抗酸菌麻风杆菌(分支杆菌属) 抗酸菌
G-杆菌大肠杆菌（埃希菌属）
伤寒杆菌、副伤寒杆菌、肠炎杆菌（沙门菌属）
志贺痢疾杆菌、福氏痢疾杆菌、宋内痢疾杆菌（志贺菌属）
绿脓杆菌（假单胞菌属）
百日咳杆菌（包特菌属）
嗯，非常不错。
看来只有提问题才能得到圆满解决呢，辛苦了！那么它们有什么
特征呢？
革兰氏阳/阴性菌的细胞壁的结构特点
革兰氏阳性菌细胞壁较厚，约20～80mm.肽聚糖含量丰富，有15～50层，每层厚度1nm，约占细胞壁干重的50～80%.此外，尚有大量特殊组份磷壁酸（teichoic acid）。
磷壁酸是由核糖醇（ribitol）或甘油（glyocerol）残基经由磷酸二键互相连接而成的多聚物。
磷壁酸分壁磷壁酸（wall teichoic acid）和膜磷壁酸（membrane teichoic acid）两种，前者和细胞壁中肽聚糖的n-乙酰胞壁酸连结，膜磷壁酸又称脂磷壁酸（lipteichoic acid）和细胞膜连结，另一端均游离于细胞壁外。
磷壁酸抗原性很强，是革兰氏阳性菌的重要表面抗原；在调节离子通过粘肽层中起作用；也可能与某些酶的活性有关；某些细菌的磷壁酸，能粘附在人类细胞表面，其作用类似菌毛，可能与致病性有关。
此外，某些革兰氏阳性
菌细胞壁表面还有一些特殊的表面蛋白，如a蛋白等，都与致病有关。
革兰氏阴性细菌的细胞壁中肽聚糖含量低，而脂类物质含量高，当用乙醇处理时，脂类物质溶解，细胞壁的通透性增加，使结晶紫-碘复合物易被乙醇抽出而脱色，然后又被染上了复染液（番红）的颜色，因此呈现红色。
革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌的细胞壁结构显著不同，导致这两类细菌在染色
性、抗原性、毒性、对某些药物的敏感性等方面的很大差异。
这么复杂呀，人家看到就头痛，有没有洁简明了点的呀？
革兰氏阳性菌与革兰氏阴性菌细胞壁结构的比较
革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌的细胞壁结构显著不同，导致这两类细菌在染色
性、抗原性、毒性、对某些药物的敏感性等方面的很大差异。
以下是其比较：类型革兰氏阳性菌革兰氏阴性菌
强度较坚韧较疏松
厚度厚，20～80nm 薄，5～10nm
肽聚糖层数多，15~50层，每层厚1nm 少，1～3层
肽聚糖含量多，可占胞壁干重50～80% 少，占胞壁干重10～20%
磷壁酸+ -
外膜- +
结构三维空间（立体结构）二维空间（平面结构）
还是总结一下好啊，这不一下子就明了了？嘻嘻。
说说它的实际意义吧？
革兰氏染色的实际意义
（1）鉴别细菌：用此染色法可将所有细菌分为两大类，这样可将致病菌的
范围缩小，然后再进一步鉴定。
（2）选择药物：革兰氏阳性菌与革兰氏阴性菌在细胞壁等结构上有很大差别，
因而对抗菌素等药物的敏感度不一。
例如大多数革兰氏阳性菌都对青霉素敏感；
而革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感，而对链霉素、氯霉素等敏感。
所以首先区分病原菌是革兰氏阳性菌还是阴性菌，在选择抗生素方面意义重大。
（3）与致病性的关系：大多数革兰氏阳性菌的致病物质主要为外毒素；而
大多数革兰氏阴性菌的致病物质主要为内毒素
学到了这么多，让我怎么感激才好呢？哎~哎~哎~！
关于青霉素、头孢菌素和氯霉素的记忆口诀
青霉素抗菌谱可记为：融金飞，摆摊破产，奈瑟螺旋。
分别指：溶血性链球菌、不产青霉素酶金葡菌、肺炎链球菌、白喉棒状杆菌、炭
疽杆菌、破伤风梭菌、产气荚膜梭菌、两种奈瑟菌、螺旋体。
融金在古代文学中
比喻落日，在天上飞是自然的了。
奈瑟螺旋是原话，还没想到有意思的谐音组合。
下面是论坛里多处出现的一篇文章，大家可比较一下：
《药理学教学中运用记忆法教学及体会》：
把青霉素的抗菌谱编成顺口溜：“链葡螺放白肺炭（廉颇落荒白灰滩）”。
通过说战国时期赵国名将廉颇诈败诱敌“落荒”逃到“白灰滩”一举歼敌的故事，就
可以联想记忆起青霉素的抗菌谱包括溶血性链球菌、敏感的金葡菌、螺旋体、放
线菌、白喉杆菌、肺炎球菌和炭疽杆菌等。
四代头孢菌素的名称可记为：坐林拉定安便，服刑梦多可罗，他的曲颂赛吾派头，比吾痞啰。
分别对应：一代中的头孢唑林、头孢拉定、头孢氨苄，二代中的头孢
呋辛、头孢孟多、头孢克洛，三代中的头孢他定、头孢曲松、头孢噻乌、头孢哌酮，四代中的
头孢吡乌、头孢匹罗。
氯霉素的抗菌谱可记为：老眼（昏花），（儿女）厌养，伤（心）寒（心）复伤（心）寒（心），你可知？分别指细菌性脑膜炎和脑脓肿、眼部感染、厌氧菌感染、伤寒和副伤寒、立克次体。
窦性心动多速窦性心动多缓
贫血甲亢和发热颅压增高阻黄疸
心炎心衰和休克甲低冠心心肌炎
情绪激动和运动药物影响心得安
肾上腺素心律快体质健壮心率缓
抗高血压药
利尿杯阻,
阻钙抑酶加阻a(1).
酶尿不用孕(2).
杯阻不能肺(3).
尿杯不用糖尿病(4).
心衰不用钙杯(5).
1 利尿剂,肾上腺能B受体阻滞剂,钙离子通道阻滞剂及血管紧张素转化酶抑制剂.
2 利尿剂因减少血容量,不应用于孕妇;ACE抑制剂影响胎儿也勿用.
3 B受体阻滞剂不能用于哮踹j及COPD,因可以引起支气管狭窄.
4 噻嗪类利尿剂及B受体阻滞剂不用于糖尿病,前者干扰糖耐量,后者可掩盖低血糖症状.
5 钙离子及B受体阻滞剂不能用于心衰.。