美国《医学索引》、Medline数据库
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Medline的由来最早可追溯到1879年 Medline的由来最早可追溯到1879年NLM 出版的医学文献检索刊物Index 出版的医学文献检索刊物Index Medicus (IM)。为了实现IM的自动化编辑,1964 IM)。为了实现IM的自动化编辑,1964 年NLM开发了MEDLARS(Medical NLM开发了MEDLARS(Medical Literature Analysis and Retrieval System, System, 医学文献分析与检索系统),1971年正式 医学文献分析与检索系统),1971年正式 建成并投入联机检索服务。自此Medline一 建成并投入联机检索服务。自此Medline一 直成为MEDLARS40余个数据库种数据量 直成为MEDLARS40余个数据库种数据量 最大、使用频率最高的数据库。
4.PubMed数据库 PubMed数据库
Pubmed是由NLM的生物技术信息中心建立的生 物医学文献检索系统,1997年6月在Internet上向 用户提供免费检索服务,它包括Medline数据库、 PRE Medline(即进入Medline数据库以前未经标引 的数据)和Publisher Supplied Citation(即出版 商直接向PubMed提供的电子文献记录)。
MeSH词表由字顺表和树状结构表组成。 MeSH词表由字顺表和树状结构表组成。
1. 字顺表(Alphabetic List) 收词种类:主题词、款目词、类目词和副主题词 (1)主题词:又称叙词,是构成词表的主体, 由生物医学领域的经过规范化的名词术语所构 成,有独立的检索意义。如“青霉素G”、“心 脏”、“脊髓灰质炎”等等。
PubMed具有智能检索功能,不仅能准确 PubMed具有智能检索功能,不仅能准确 拆分词,而且能对MeSH词转换的检索词 拆分词,而且能对MeSH词转换的检索词 同时进行主题词检索和自由词检索,有效 地保证了文献的查全和查准。
例如:检索Kamada A发表的有关哮喘(asthma) 的文献
例如:肺癌的药物疗法
主题词检索
点 击 主 页 左 侧 栏 命 令 菜 单 的 MeSH Database,进入主题词检索界面,输入检 索词后,系统将显示该词的定义、树状 结构,并进一步显示可组配的副主题词。 若输入的词是一个非主题词,或意思上 和某一主题词较相近,系统会自动将其 转换为规范化主题词。
5.练习题 5.练习题
主题词可以是单个词,如lung,也可以是词组,如lung neoplasms。 词组形式的主题词一般按自然语序,但当一组主题词具有某些 相同的概念时,采用倒置的主题词形式把同一概念的词排列在 前,而起修饰、限定作用的形容词放在后面,并用“,”隔开。 如: anemia, aplastic 再生障碍性贫血 anemia, dyserythropoietic,congenital 先天异常红系造血性贫血 anemia, hemolytic 溶血性贫血 anemia, hemolytic, autoimmune 自身免疫溶血性贫血 anemia, hemolytic, congenital 先天溶血性贫血
检索原理:PubMed具有对检索词的自动转换和 匹配检索功能 PubMed按照一定的顺序将所输入的检索词分别 与MeSH转换表、期刊转换表、短语表和作者索引中 进行对照匹配。
PubMed数据库的网址: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
基础检索
由于PubMed系统具有词汇自动转换匹配 功能,检索时可不用考虑所输入检索词 之间的逻辑关系,也不用考虑词的类型, 无论是主题词,人名、期刊名,还是 ISSN号,只要是具有实质意义的词都行。 在检索提问框中输入要查找的词后,点 击“Go”按纽,系统即执行检索。
利用PubMed检索下列课题的文献:
1.
维生素C(Vitamin C)对哮喘 ( Asthma) 的治疗作用
2.
夏家辉(Xia Jia Hui)关于神经性耳 聋(Deafness)的遗传(Genetics)研究
20世纪80年代, Medline光盘数据库 20世纪80年代, Medline光盘数据库 问世,国内曾主要购买的是银盘公司 的Medline on CD。20世纪90年代, CD。20世纪90年代, Medline纳入许多基于因特网的信息检 Medline纳入许多基于因特网的信息检 索中,如PubMed、 索中,如PubMed、NLM Gateway、 Gateway、 OVID、Dialog、 OVID、Dialog、ISI Web of Knowledge EBSCO 等。
Medline收录内容对应于以下3 Medline收录内容对应于以下3种印刷 型检索工具: Index Medicus (医学索引) 医学索引) Index to Dental Literature (牙科文献索引) 牙科文献索引) International Nursing Index (国际护理索引) 国际护理索引)
(4)副主题词:对文献主题起限定作用,构成主题 的一些通用性概念,本身无独立检索意义。 在MeSH中提供了83个副主题词,按英文字顺排序, 同时给予每个词词义解释,还限定每个副主题词允 许组配的主题词范畴,即在其后的括号内标示该词 可以组配的主题词类号。如: Diagnosis 诊断(C1-23, F3)DI
有的主题词可能同属于2个或多个子类目,则同时列出多个树 状结构号,并分别排列在其所归属的类目中。如: 唐氏综合征可分属于 C16新生儿疾病和畸形;C10 神经系统疾 病:F3 精神疾病 新生儿疾病和畸形 C16 畸形 C16.131 畸形,多发性 C16.131.77 基底细胞癌综合征 C16.131.77.130 Bloom综合征 C16.131.77.137 猫叫综合征 C16.131.77.262 C16.131.77.327 唐氏综合征
IM收录世界上70多个国家和地区、40多个语 种的近4000种生物医学及其相关学科期刊,内容涉 及生物医学的各个领域,其中70%为英文文献,文 献类型包括期刊论文、编者述评、综述、会议论文、 著名人物传记及讣告等。
特点:收录文献范围广泛,报道文献信息量 大,能适时反映生物医学学科领域的发展动态。 编辑文献的力量强大,文献标引的质量较高 。NLM聘请了著名医学专家、医学编辑及医学图书 馆学专家,对IM的编辑工作进行指导,收录有价值 的文献,编制医学主题词表等以保证质量的绝对优 势。
Diagnosis 诊断(C,F3):与疾病主题词 诊断(C,F3):与疾病主题词 组配,表明诊断的各个方面,包括检查、 鉴别诊断及预后。(DI) 鉴别诊断及预后。(DI) Pathogenicity 致病力(B2-5,B7,B8)与 致病力(B2B7,B8)与 微生物、病毒和寄生虫主题词组配,表明 其对人或动物致病能力的研究。(PY) 其对人或动物致病能力的研究。(PY)
3.Medline数据库 Medline数据库
Medline由美国国立医学图书馆创建和维护, Medline由美国国立医学图书馆创建和维护, 是世界上权威性的生物医学书目数据库。它收录了 80多个国家和地区的5000多种期刊,累积了1950年 80多个国家和地区的5000多种期刊,累积了1950年 至今的1600多万篇文献,年收录文献约40 至今的1600多万篇文献,年收录文献约40万篇, 1600 40万篇, 90%为英文文献,约79%含文摘。 90%为英文文献,约79%含文摘。 Medline的内容涉及基础医学、临床医学、药理 Medline的内容涉及基础医学、临床医学、药理 学、预防医学、护理学、口腔医学、兽医学、生物 学、环境科学和情报科学等。
(2)类目词:是为保证分类表体系的完 整性而设立的一类词汇,通常都是一些 学科范围很大的词,它们不作为主题词 使用。 如:肌骨骼畸形(类目词)、身体部位 (类目词)等等
(3)款目词:也称入口词,其作用是将自 由词引见到主题词。如: 弓形足 见 足畸形 lung cancer see lung neoplasms
树状结构表
树形结构 1 – 肿瘤 肿瘤, 各部位 胸部肿瘤 呼吸道肿瘤 肺肿瘤 癌, 支气管原 癌, 非小细胞肺 癌, 小细胞 硬币病变, 肺 Pancoast综合征 肺胚细胞瘤 肺硬化性血管瘤
树形结构 2 – 呼吸道疾病 肺疾病 肺肿瘤 癌, 支气管原 癌, 非小细胞肺 癌, 小细胞 硬币病变, 肺 Pancoast综合征 肺硬化性血管瘤
MeSH主要由字顺表和树状结构表两大部分组 成。 字顺表反映主题词之间的横向关系,适于特性 检索; 树状结构表揭示词与词之间的纵向隶属关系, 是IM的主题分类表,适于族性检索; 字顺表和树状结构表通过树状结构号联系起来 ,形成一个功能完善的科学的检索体系。
主题词,是经过严格规范化处理 的自然语言语词,与自由词相比具有 以下优势:主题词检索克服了同一概 念由于拼法不同而导致的漏检和误检; 主题词检索具有下位词扩展检索功能; 主题词检索支持副主题词限定功能, 使检索更专指。
报道文献速度快,时差短。1964年NLM建 立了MEDLARS(医学文献分析和检索系统), 实现了文献资料加工、索引编制和检索的计算 机管理,大大加快了文献报道的速度。 索引编制规范,检索方便。若选词得当可 一次查到文献提录内容,检索迅速方便。
2.《医学主题词表》
《医学主题词表》(Medical Subject Headings) 简称MeSH词表,是美国国立医学图书馆(NLM) 编制的,用于对生物医学文献进行标引和检索的权 威性术语控制工具。 著名中外医学数据库PubMed、Medline、CBMdisc 等都采用该词表来做主题词检索。 了解MeSH词表的结构,掌握其使用方法,是进行 医学文献检索的基础。
美国《医学索引》、Medline数据 美国《医学索引》、Medline数据 库与PubMed数据库 库与PubMed数据库
杨 志
一、美国《医学索引》
1.概况 பைடு நூலகம்.概况
美国《医学索引》(Index Medicus, IM),是目前世界上使用最广、影响最 大的一种医学文献检索工具,由美国国 立医学图书馆(National Library of Medicine,NLM)编辑出版,创刊于1879 年,已有百多年的历史,其刊名、出版 机构及编排体例等曾多次变更,于1960 年恢复Index Medicus至今,现为月刊, 每年1卷。
主题词款目结构:是指一个主题词的完整记录。在字顺表的 每一个主题词下均注以三种注释:即树状结构号、历史注释 和参照注释。如: DOWN SYNDROME 唐氏综合征 C10.496.250 C16.131.77.327 F3.709.346.200 75, 63-64; was MONGOLISM 1965-1974 see related AMYLOID BATE-PROTEIN β淀粉样蛋白 AMYLOID BATE-PROTEIN PRECURSOR β淀粉样蛋白前体 X MONGOLISM 蒙古症 X TRISOMY21 21三体综合征
2. 树状结构表(Tree Structures),它是字顺表的姊妹篇,是 从学科分类角度对所有主题词进行编排而成的等级制分类 表。 根据每个主题词的词义范畴和学科属性,将全部主题词分 门别类地归入15个大类,再细分出114个二级类目,各子类 目下又层层划分,逐级展开,使同一概念范围的主题词成 族展示它们之间的并列、隶属等概念相互关系,最多可达 11级,形成主题词的树状结构体系。