实习九 近交系数与亲缘系数的计算
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13 13 1+ 0 1 1 R(289)(16) = [( ) + ( ) ] = = 23.25% 2 2 1+ 0.156 4 1.156
号公羊与祖先16号公羊之间的亲缘系 即289号公羊与祖先 号公羊之间的亲缘系 号公羊与祖先 数是23.25%。 数是 。
育种学实验考试 选择指数的制订
289
示例:仍用上例系谱,计算289号公与 其祖先16号之间的亲缘系数。 从上例系谱可看出,289号与16号之间的亲 289 16 缘关系,有两条通径路线,每条通径的代数 都是3,即: 289←135←90←16 135 90 108 16 289←181←49←16
181 49
另外, 号公羊还是近交后代, 另外,289号公羊还是近交后代,其近交系 号公羊还是近交后代 数是15.63%,代入公式后则得: 数是 ,代入公式后则得:
p(135)
= ( 1 ) 2 + ( 1 )4 = 0.25 + 0.0625 = 0.3125 = 31.25% (181) 2 2
(2)直系亲缘间的亲缘系数,计算公式为:
1 N 1 + FA RxA = ∑ ( ) 2 1+F x
如果共同祖先A和个体X都不是近交所 生,则公式可简化成:
1 N RxA = ∑ ( ) 2
实习九 近交系数与亲缘系 数的计算
一、实验目的
Βιβλιοθήκη Baidu
掌握近交系数与亲缘系数的计算方法。 掌握近交系数与亲缘系数的计算方法。
二、实习内容
1、近交系数的计算: 、近交系数的计算:
1 n1+n2 +1 Fx = ∑ ( ) · (1 + FA ) 2
(1)
1 1 N Fx = ∑ ( ) · (1 + FA ) 2 2
示例:现在 号公羊的横式系谱如下, 示例:现在289号公羊的横式系谱如下,可 号公羊的横式系谱如下 先将其改制成箭头式系谱,然后计算135号和 先将其改制成箭头式系谱,然后计算 号和 181号间的亲缘系数。 号间的亲缘系数。 号间的亲缘系数 从系谱可看出, 号和181号之间,有108号和 号 号之间, 号和16号 从系谱可看出,135号和 号和 号之间 号和 108 两个共同祖先,其通径路线为: 两个共同祖先,其通径路线为: 135 135←108→181 ← → 90 16 289 135←90→16→49→191 ← → → →
R SD
1 N ∑ [( 2 ) · (1 + FA )] = (1 + FS )(1 + FD )
N=n1+n2,FS为父亲的近接系数,FD为母亲的近接系数, , 为父亲的近接系数 为父亲的近接系数, 为母亲的近接系数 为母亲的近接系数, 如果个体S、D和A都不是近交个体,则公式可简化为: 都不是近交个体, 如果个体 、 和 都不是近交个体 则公式可简化为:
181
49
135 289 181
108 90 16 108 49 16
从上面系谱可看出, 号和181号之间,有 号之间, 从上面系谱可看出,135号和 号和 号之间 108号和 号两个共同祖先,其通径路线为: 号和16号两个共同祖先 号和 号两个共同祖先,其通径路线为: 135←108→181 ← → 135 90 135←90→16→49→181 289 ← → → → 108 16 代入公式后则得: 代入公式后则得: 181 49
1N RSD = ∑[( ) ] 2
示例:现在 号公羊的横式系谱如下, 示例:现在289号公羊的横式系谱如下,可先将其改制 号公羊的横式系谱如下 成箭头式系谱,然后计算135号和 号和181号间的亲缘系数。 号间的亲缘系数。 成箭头式系谱,然后计算 号和 号间的亲缘系数
135 90
289
108
16
Fx =
(2)
∑
1 ( 2
n1 + n 2 + 1
)
(3)
为父亲到祖先的代数, 为母亲到祖先的代数 为母亲到祖先的代数, 为祖先的近接系数 为祖先的近接系数)。 (n1为父亲到祖先的代数,n2为母亲到祖先的代数,FA为祖先的近接系数)。 为父亲到祖先的代数
上列(1)式和(2)式,算法结果完全相 同,均可运用。(1)式中的n1+n2,也就等 1 n1+n2 于(2)式中的N;(1)式括号左上方的1, 也就等(2)式括号前的。计算时,首先通过 系谱,把所给系谱划为箭头式系谱,然后通过 此系谱找出父、母到祖先的代数,然后代入公 式,即可计算。
135 289 181 90 108 49 16
F(289) = {( )
1 2+2+1 2
181
+( )
1 1+1+1 2
108 49 16
}× (1 + 0)
2、亲缘系数的计算: 亲缘系数的计算: 亲缘系数的计算
(1)旁系亲属间的亲缘系数,计算公式为: )旁系亲属间的亲缘系数,计算公式为:
号公羊与祖先16号公羊之间的亲缘系 即289号公羊与祖先 号公羊之间的亲缘系 号公羊与祖先 数是23.25%。 数是 。
育种学实验考试 选择指数的制订
289
示例:仍用上例系谱,计算289号公与 其祖先16号之间的亲缘系数。 从上例系谱可看出,289号与16号之间的亲 289 16 缘关系,有两条通径路线,每条通径的代数 都是3,即: 289←135←90←16 135 90 108 16 289←181←49←16
181 49
另外, 号公羊还是近交后代, 另外,289号公羊还是近交后代,其近交系 号公羊还是近交后代 数是15.63%,代入公式后则得: 数是 ,代入公式后则得:
p(135)
= ( 1 ) 2 + ( 1 )4 = 0.25 + 0.0625 = 0.3125 = 31.25% (181) 2 2
(2)直系亲缘间的亲缘系数,计算公式为:
1 N 1 + FA RxA = ∑ ( ) 2 1+F x
如果共同祖先A和个体X都不是近交所 生,则公式可简化成:
1 N RxA = ∑ ( ) 2
实习九 近交系数与亲缘系 数的计算
一、实验目的
Βιβλιοθήκη Baidu
掌握近交系数与亲缘系数的计算方法。 掌握近交系数与亲缘系数的计算方法。
二、实习内容
1、近交系数的计算: 、近交系数的计算:
1 n1+n2 +1 Fx = ∑ ( ) · (1 + FA ) 2
(1)
1 1 N Fx = ∑ ( ) · (1 + FA ) 2 2
示例:现在 号公羊的横式系谱如下, 示例:现在289号公羊的横式系谱如下,可 号公羊的横式系谱如下 先将其改制成箭头式系谱,然后计算135号和 先将其改制成箭头式系谱,然后计算 号和 181号间的亲缘系数。 号间的亲缘系数。 号间的亲缘系数 从系谱可看出, 号和181号之间,有108号和 号 号之间, 号和16号 从系谱可看出,135号和 号和 号之间 号和 108 两个共同祖先,其通径路线为: 两个共同祖先,其通径路线为: 135 135←108→181 ← → 90 16 289 135←90→16→49→191 ← → → →
R SD
1 N ∑ [( 2 ) · (1 + FA )] = (1 + FS )(1 + FD )
N=n1+n2,FS为父亲的近接系数,FD为母亲的近接系数, , 为父亲的近接系数 为父亲的近接系数, 为母亲的近接系数 为母亲的近接系数, 如果个体S、D和A都不是近交个体,则公式可简化为: 都不是近交个体, 如果个体 、 和 都不是近交个体 则公式可简化为:
181
49
135 289 181
108 90 16 108 49 16
从上面系谱可看出, 号和181号之间,有 号之间, 从上面系谱可看出,135号和 号和 号之间 108号和 号两个共同祖先,其通径路线为: 号和16号两个共同祖先 号和 号两个共同祖先,其通径路线为: 135←108→181 ← → 135 90 135←90→16→49→181 289 ← → → → 108 16 代入公式后则得: 代入公式后则得: 181 49
1N RSD = ∑[( ) ] 2
示例:现在 号公羊的横式系谱如下, 示例:现在289号公羊的横式系谱如下,可先将其改制 号公羊的横式系谱如下 成箭头式系谱,然后计算135号和 号和181号间的亲缘系数。 号间的亲缘系数。 成箭头式系谱,然后计算 号和 号间的亲缘系数
135 90
289
108
16
Fx =
(2)
∑
1 ( 2
n1 + n 2 + 1
)
(3)
为父亲到祖先的代数, 为母亲到祖先的代数 为母亲到祖先的代数, 为祖先的近接系数 为祖先的近接系数)。 (n1为父亲到祖先的代数,n2为母亲到祖先的代数,FA为祖先的近接系数)。 为父亲到祖先的代数
上列(1)式和(2)式,算法结果完全相 同,均可运用。(1)式中的n1+n2,也就等 1 n1+n2 于(2)式中的N;(1)式括号左上方的1, 也就等(2)式括号前的。计算时,首先通过 系谱,把所给系谱划为箭头式系谱,然后通过 此系谱找出父、母到祖先的代数,然后代入公 式,即可计算。
135 289 181 90 108 49 16
F(289) = {( )
1 2+2+1 2
181
+( )
1 1+1+1 2
108 49 16
}× (1 + 0)
2、亲缘系数的计算: 亲缘系数的计算: 亲缘系数的计算
(1)旁系亲属间的亲缘系数,计算公式为: )旁系亲属间的亲缘系数,计算公式为: