NCBI查基因 编码区 启动子区 外显子
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问题:NCBI中怎样查找编码区/非编码区、起始密码子、启动子、外显子/内含子。
启动子
一般定义启动子,都是upstream 1000bp,downstream1000bp的那段序列。或者根据你的实验。
你去ensemble,输入基因,找到exon,点开,在configuration里面选好flank多少bp 的序列,选好之后自动刷新,就出来了。在序列里面,ensemble用不同的颜色标出来不同区域,5‘UTR之类的,还有exon,intron,转录起始位点等等,flank的区域就是你选的promoter 了。
开放阅读框
在分子生物学中,开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)从起始密码子开始,是DNA序列中具有编码蛋白质潜能,一段无终止密码子打断的碱基序列。