植物种质资源研究--多样性指数计算公式介绍
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多样性指数
多样性指数是用来描述一个群落的多样性的统计量。在生态学中,它被用来描述生态系统中的生物多样性,在经济学中可以用来描述一个地区中经济活动的分布。多样性指数经常被用来估算任何一个群落,每个成员都属于一个独特的群体或物种。在很多情况下,多样性指数的估计量是有偏的,因此相似的值之间往往不能直接比较。
一些常用多样性指数将讨论如下:
种丰富度(Species richness)
种丰富度S便是生态系统中物种的数目。这个指数无法表示相对丰度。实际上,除了一些非常贫瘠的系统之外,记录一个生态系统真实的种总丰富度是不可能的。系统中物种的观察值是其真实物种丰富度的有偏估计值,并且观察值会随着取样的增加非线性的增长。因此在表示从生态系统中观察到的物种丰富度时,S 常被称作种密度(species density)。
香农多样性指数(Shannon's diversity index)
香农多样性指数用来估算群落多样性的高低,也叫香农-维纳(Shannon-Wiener)或香农-韦弗(Shannon-Weaver)指数。公式如下:
其中S表示总的物种数,pi表示第i个种占总数的比例(Pielou 1975)。当群落中只有一个居群存在时,香农指数达最小值0;当群落中有两个以上的居群存在,且每个居群仅有一个成员时,香农指数达到最大值ln k。
物种均一度(Species Evenness)
物种均一度用来描述物种中的个体的相对丰富度或所占比例。群落的均一度可以用Pielou均一度指数J表示(Pielou's evenness index,J):
其中H'为香农指数,H'max是H'的最大值:
集中度指数(Concentration ratio)
集中度指数是一项描述一些占主导地位的物种(或公司)所占比例的粗略的指标,通常用前几个物种或公司所占份额的总和来表示。
在经济学中,一个行业的集中度是用来作为的企业与行业的相对规模作为一个整体指标。它是通过对前n个公司的市场份额百分比求和来计算的。这也可能有助于确定该行业的市场结构。四企业集中度,或称C4,是个常用的集中度指数,它由行业内四个最大的公司的市场份额和表示。
辛普森多样性指数(Simpson's diversity index)
辛普森在1949年提出过这样的问题:在无限大小的群落中,随机取样得到同样的两个标本,它们的概率是什么呢?
如在加拿大北部森林中,随机采取两株树标本,属同一个种的概率就很高。相反,如在热带雨林随机取样,两株树同一种的概率很低,他从这个想法出发得出多样性指数。用公式表示为:
辛普森多样性指数 = 随机取样的两个个体属于不同种的概率 = 1 - 随机取样的
两个个体属于同种的概率
设种i的个体数占群落中总个体数的比例为,那么,随机取种i两个个体的联合概率就为。
如果我们将群落中全部种的概率合起来,就可得到辛普森指数,即
S为物种数目。
辛普森多样性指数的最低值是0;最高值为
前一种情况出现在全部个体均属于一个种的时候,后一种情况出现在每个个体分别属于不同种的时候。
例如,甲群落中A、B两个种的个体数分别为99和1,而乙群落中A、B两个种的个体数均为50,按辛普森多样性指数计算,
甲群落的辛普森指数:
乙群落的辛普森指数:
乙群落的多样性高于甲群落。造成这两个群落多样性差异的主要原因是种的不均匀性,从丰富度来看,两个群落是一样的,但均匀度不同。
伯杰•帕克指数(Berger-Parker index)
基尼指数(Gini index)
吉尼系数(Gini coefficient),或译基尼指数,是20世纪初意大利学者吉尼根据劳伦茨曲线所定义的判断收入分配公平程度的指标。是比例数值,在0和1之间。吉尼指数(Gini index)是指吉尼系数乘100倍作百分比表示。