分子生物学思考题

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第一章

1.基因:指表达一种蛋白质或功能RNA的遗传物质的基本单位,基因是遗传物质的最小功能单位。

2.分子生物学:是在分子水平研究生命现象的科学,是现代生命科学的共同语言。它的核心内容是通过生物的物质基础-核酸--蛋白质--酶等生物大分子的结构-功能及其相互作用等的研究来阐明生命分子基础,从而探索生命的奥秘。

3.简述遗传学三大基本规律:

一.孟德尔遗传定律:包括分离定律和自由组合定律分离定律:①遗传性状是由遗传因子所控制,遗传因子在体细胞中成对存在,每对遗传因子中,一个来自母方,一个来自父方。一个单位性状由一对遗传因子控制。②遗传因子之间存在显隐性关系。③形成配子时,两个遗传因子彼此分开,分别随机进入到不同的配子中,配子只含有成对遗传因子中的一个。

自由组合定律:当具有两对或多对相对性状的亲本进行杂交,在子一代产生配子时,在等位基因分离的同时,非同源染色体上的基因表现为自由组合。

连锁互换定律:原来为同一亲本所具有的两个性状,在F2中常常有连系在一起遗传的倾向。

4.列出一种证明DNA是遗传物质的实验证据:肺炎双球菌实验中,在加热杀死的S型菌中存在一种使活的R型菌转变成S型菌的因子,用一系列的化学和酶学方法把提取液中的蛋白质,类脂,多糖,RNA去掉并不影响转化,最后发现只要把纯化的S型菌的DNA加入到R型菌培养液中就足以导致转化的发生,证明DNA 是遗传物质。

第二章

1.熟悉DNA的双螺旋结构。

2.什么是DNA的变性和复性,复性的条件是什么?

变性:在高温,酸碱,某些化学试剂的作用下,双螺旋结构区的氢键断裂,成为单链的过程。

复性:变性单链DNA在适当的条件下,使彼此分开的链自发的重新结合,成为双螺旋结构的过程。

复性的条件:1.盐浓度必须高,足以使两链之间磷酸基团上负电荷的排斥力消失,通常用0.15~0.5mol/L的Nacl; 2.温度必须适当高,足以防止链内随即形成氢键,复性的最适温度比熔炼温度低20~25度。

3.了解加减法测定DNA序列的原理。(p25)

4.蛋白质重要的结构域有哪些?简述螺旋-拐角-螺旋,亮氨酸拉链的结构。

结构域为蛋白质亚基结构中明显分开的紧密球状结构区域。包括:锌指结构,螺旋-拐角-螺旋,螺旋-环-螺旋,亮氨酸拉链等。

螺旋-拐角-螺旋:模体含有40~50个氨基酸残基,在两个两性α螺旋之间有一个长度可变的连接区。

亮氨酸拉链:是一种重要的蛋白质-蛋白质相互作用的结构域,其每七个氨基酸中的第七个氨基酸是亮氨酸,亮氨酸是疏水性氨基酸,排列在α螺旋的一侧,所有带电荷的氨基酸残基排列在另一侧。当两个蛋白质分子平行排列时,亮氨酸之间相互作用形成二聚体,形成拉链。

5.真核生物DNA是如何形成染色体的?

DNA包装成染色体需要经过三级压缩,其具体过程是:

1。首先组蛋白h1 h2a h2b h3 h4各两个组成盘装八聚体核心,而后1.75圈共146BP DNA 缠绕其上,成为核小体颗粒,两个颗粒之间经过60BP连接DNA连接,在出口和入口处再结合组蛋白H1作为稳定结构,经过不断的连接,核小体颗粒形成外径10nm的纤维状串珠,称为核小体串珠纤维,是为染色体一级结构。

2.核小体串珠纤维在酶的作用下形成每圈6个核小体,外径30nm的螺旋结构。是为染色体二级结构

3.螺旋结构再次螺旋化,形成超螺旋结构(此处有争议,我看过的书上,人卫版医学细胞生物学同意超螺旋学说,而北大版教材认为3级结构是微带,即曲折化的螺线管),此为3级结构

4.超螺线管(或者说微带),形成绊环,即线性的螺线管形成的放射状环。绊环再非组蛋白上缠绕即形成了显微镜下可见的染色体结构。

第三章第一节

DNA的半保留复制:在DNA复制过程中,子代DNA双链中,一条来自亲代,另一条链是新合成的互补链,这种复制方式称为半保留复制。

冈崎片段:是在DNA的后随链的不连续合成期间生成的片段。

前导链:与复制叉移动的方向一致,通过连续的5ˊ-3ˊ聚合合成的新的DNA 链。

后随链:与复制叉移动的方向相反,通过不连续的5ˊ-3ˊ聚合合成的新的DNA 链。又称滞后链。

2.与DNA复制的酶和蛋白质有哪些?

DNA聚合酶,DNA连接酶,拓扑异构酶,DNA解链酶,单链DNA结合蛋白,引物合成酶和RNA酶H,FEN-1,RNase H。

3.简述大肠杆菌中DNA聚合酶Ⅰ和Ⅲ的结构和功能。

4.简述原核生物DNA复制的延伸过程。

DNA的复制是一个边解旋边复制的过程。复制开始时,DNA分子首先利用细胞提供的能量,在解旋酶的作用下,把两条螺旋的双链解开,这个过程叫解旋。然后,以解开的每一段母链为模板,以周围环境中的四种脱氧核苷酸为原料,按照碱基配对互补配对原则,在DNA聚合酶的作用下,各自合成与母链互补的一段子链。随着解旋过程的进行,新合成的子链也不断地延伸,同时,每条子链与其母链盘绕成双螺旋结构,从而各形成一个新的DNA分子。这样,复制结束后,一个DNA分子,通过细胞分裂分配到两个子细胞中去。

5.DNA复制的忠实性是怎样实现的?

1.DNA复制过程中碱基配对受到双重核对:

2.DNA聚合酶(DNA pol Ⅲ)对碱基的选择作用

3.3’→5’外切核酸酶(Klenow片段)的校正作用

4.复制的修复系统(DNA损伤的修复)

6.简述端粒酶的作用机制。

端粒酶的RNA部分有一段序列与端粒TG链突出的3-末端互补,二者结合后,端粒酶以自身的RNA为模板,在端粒TG链的3-末端添加脱氧核苷酸,使端粒的TG 链延长一小段,随后,端粒酶移动位置,继续加长TG链,直到达到细胞所需要的长度。被延长的TG链可以作为合成冈崎片段的模板,使端粒形成双链也可以通过单链区的回折,合成AC链,随后对末端的发夹结构进行修剪,使端粒形成双链。

7.复制子,转座子的定义。

复制子:DNA分子上一个独立的复制单位。

转座子:原真核基因组中存在着可以从一个部位转移到另一个部位的DNA序

列。这些序列叫做转座子。

第三章第二节

1.紫外线引起的DNA损伤通过哪几种途径修复?

答:大致通过四种途径:

(1)在损伤部位就地修复—光复活;

(2)取代损伤部位—暗修复或切除修复;

(3)越过损伤部位进行修复—重组修复;

(4)紧急修复—SOS修复。

2. 简述错配修复和重组修复的过程。

答:(1)错配修复

错配修复系统通过Dam甲基化酶来识别母链DNA,根据“保存母链,修正子链”的原则,MutS蛋白识别并结合到错配碱基上,与MutL结合后形成稳定复合物,该复合体与MutH核酸内切酶结合后,未甲基化的DNA链被切开,随后切口到错配位点的这段序列也被切除,最后,由DNA聚合酶3填充这段序列空缺,DNA连接酶连接缺口完成修复。

(2)重组修复

又称“复制后修复”。当复制叉遇到受损DNA位点时先停止跳动,暂停之后又继续移动进行复制,结果在新合成的子链中留下一个对着损伤位点的缺口,之后缺口链和另一条子链DNA的同源链发生重组,即从同源DNA母链上将相应核苷酸

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