基因工程-第三章-基因工程的载体
基因工程-载体
常用的质粒载体 pUC系列
University of California的J. Messing和J. Vieria于1978年,在pBR322的基础上改造 而成。属正选择载体。如pUC7、pUC8、pUC9、pUC10、pUC11、pUC18、pUC19。 1、元件来源 复制起点ori---pBR322的 ori Ampr 基因---pBR322的Ampr基因 大肠杆菌β-半乳糖基因(lacZ’基因) 多克隆位点(MCS)区段---位于lacZ’基因 中的靠近5`-端。 2、长度 约2.7kb
Apr转化子 Tcr转化子
影印到Tc平板上 影印到Ap平板上
Apr TcS为重组子 ApS Tcr为重组子
Apr Tcr为原载体
即为非重组子
Ampr
1)限 制 酶 切 2)DNA重 组
无 DNA插 入
Ampr Tcr
转化
Ampr Tcr
Tc
有 DNA插 入 外 源 DNA
Ampr Tcs Ampr Tcs
2、非接合型质粒(不能自我转移):虽然带有自我复制所必需的遗传信息, 但失去了控制细菌配对和质粒接合转移的基因,因此不能从一个细胞转移到另一
个细胞。如R质粒(抗生素抗性质粒)和Col质粒(大肠杆菌素colicin )。符合 基因工程的安全要求。
大肠杆菌素是大肠杆菌分泌的一类细菌素(bacteriocin),对于其他不能分泌特异性大肠 杆菌素免疫蛋白(Immunity protein)的细菌具有杀灭作用,现在一般认为有调节菌群数 量的作用。 大部分大肠杆菌素由质粒编码,其中最著名的没过于pColE1 。
第一节 质粒载体
质粒(plasmid):是独立于染色体以外的能自主复制的双链闭合环状DNA分子。 广泛存在于细菌、霉菌、蓝藻、酵母等细胞中。
第三章基因工程载体
3个会导致Ampr基因失活
9个导致Tetr基因失活
氨苄青霉素和四环素抗性 24个单一克隆位点。
pBR322的优点
① 双抗生素抗性选择标记
抗生素抗性基因的插入失活效应是检测重 组体质粒的有效方法,分两次先后选择: 没有获得载体的寄主细胞 在Amp或Tet中都死亡。 获得重组载体的寄主细胞 在Aplasmid ):在整个细胞
周期中随时可以复制,每个细胞中有许多拷贝, 一般10-60 拷贝,如Col E1质粒。
氯霉素扩增:在抑制蛋白合成并阻断细菌染色体
复制的氯霉素存在时,松弛型质粒可继续扩增, 其拷贝数可达2000-3000个,称氯霉素扩增效应
严紧型复制质粒 (stringent plasmid ):
plasmid 接合型质粒(自我转移的 质粒):质粒可从一个细胞自发转移到另一个细胞。
Non
Conjugative plasmid 非接合型质粒
(不能自我转移的质粒):由于失去控制细菌配 对和自我转移的基因,质粒不能从一个细胞自发 的转移到另一个细胞。
结合型质粒:相对分子质量大、拷贝数小、 严紧型复制 非结合型质粒:相对分子质量小、拷贝数多、松弛型复制
① colicin E1基因的结构 cea imm 免疫基因 kil 溶菌基因
结构基因
② 杀死不含有ColE1细菌的原因 cea + kil基因产物 ③ 不被其他细菌的colicin E1所杀死的原因 imm基因
克隆位点
EcoR I
EcoR I位于E1内部,插入外源DNA导致E1 失活,使受体菌不能合成E(ColE1-),但 仍表现出对E1免疫型(ImmE1+)。
外源DNA
Colicin E1
基因工程的载体
常用抗生素的作用方式及抗性机理
抗生素名称 氨苄青霉素 (Amp) 氯霉素 (Cm) 卡那霉素 (Kan) 链霉素 (Sm) 四环素 (Tet) 作用方式 抗性机理 一种青霉素的衍生物,通过干扰 bla抗性基因编码的一种周质酶,即β-内 细菌胞壁合成之末端反应,而杀 酰胺酶,可特异的切割amp的β-内酰胺 死生长细胞。 环,从而失去杀菌效力。 一种抑菌剂,通过同核糖体50S 亚基的结合作用,干扰细胞蛋白 质的合成,并阻止肽键的形成。 cat抗性基因编码乙酰转移酶,特异地使 氯霉素乙酰化而失活
λ噬菌体载体
结构特点: ①线性双链DNA分子 ②具非必需区(约1/3长度) ③两端具12个核苷酸单链互补粘性末端 ④可在E.coli中大量繁殖 ⑤可克隆15Kb左右的外源DNA
(2)质粒的基本特性
1) 2) 3) 4) 5) 自主复制性 不相容性 可扩增性 可转移性 携带遗传标记 野生型的质粒DNA上往往携带一个或多个遗传 标记基因,这使得寄主生物产生正常生长非必需 的附加性状,包括:抗生素、抗抗生素、抗重金 属、产生细菌毒素等。对DNA重组分子的筛选具有 重要意义。
(3)质粒DNA的转移
质粒自主转移
导入
+
自主转移
+
无DNA转移
donor
H H
H
+
辅助转移
H
+
质粒的辅助转移
H
H
+
Notransfer
质粒的重组转移
R-重组DNA分子
重组
+
DNA 转移
R
+ R
(4)质粒的命名
人工组建的质粒 第一个字母是质粒的英文名字(Plasmid)的第一 个字符p, 用小写。后面有两个字母是大写,代表质 粒的发现者和实验室名称,再后面是质粒的编号。
《基因工程》第三章 载体2
Such as ultraviolet light
Cell division
Assembled or packaged Lysis of cell and release of mature phage particles
2.λ噬菌体作为克隆载体的依据
①λ噬菌体温和噬菌体,感染性高,易操作。
β—半乳糖苷酶基因(lacZ 和lacZα) β—半乳糖苷酶基因有1021 AAs,基因产物不具酶活性,装配 为四聚体后才有酶活。该蛋白质可分为两部分:α链和β链。前 者负责四聚体装配,后者具β—半乳糖苷酶活性;只有当两者都 存在时,才会表现出酶活性,该作用称之为α-互补作用。这两个 部分可独立存在, 分别由两个基因编码。为α链编码的基因称之 为lacZα(编码145 AAs)。这两个基因(LacZ和LacZα)均可作为 标记基因。 β—半乳糖苷酶基因的优点: a. 酶催化X-Gal水解为兰色产物,检测直观 b. lacZα编码5'-端可容许很大的变化而不影响酶活性 c. lacZα和β链基因的分别表达可使载体小而容量大
荧光素酶基因 荧光素酶或由萤火虫产生的可催化蜜蜂荧光素氧化的酶,并 产生荧光,若在反应中加入CoA,可使灵敏度提高10倍;或由发 光细菌(Photobacterium fischeri)产生的荧光素酶,它与 FMN-氧化还原酶联用,通过NAD(P)H的变化测定酶活。
发光蛋白质基因 发光蛋白是由水母产生的一种可发光的蛋白质,该蛋白质可 使大肠杆菌菌落呈蓝色。
Polylinker or multiple cloning site [MCS]
pUC family
pUCm-T载体(pUCm-T Vector): 1 线性化的载体, 2 载体每条链的3’端带有 一个突出的T。
第三章 第一节 基因工程(基因表达载体的构建)
4.为了增加菊花花色类型,研究者从其他植物中克隆出花色基因C (图1),拟将其与质粒(图2)重组,再借助农杆菌导入菊花中。下列 操作与实验目的不符的是( C )
A.用限制性核酸内切酶EcoR Ⅰ和连接酶构建重组质粒 B.用含C基因的农杆菌侵染菊花愈伤组织,将C基因导入细胞 C.在培养基中添加卡那霉素,筛选被转化的菊花细胞 D.用DNA分子杂交方法检测C基因是否整合到菊花染色体上
三、目的基因及其表达产物的检测鉴定
1.检测与鉴定的内容、方法
阅读教材98~99页的内容,根据表格提示的项目填写表格中缺 少的内容。
检测水平
分子水 DNA 平的检 RNA
测 蛋白质 个体水平的检测
检测内容
方法
结果显示
1.检测与鉴定的内容、方法
检测水平
检测内容
方法
结果显示
检测转基因生物的染色体 DNA分子杂交法(基因探针
3.对于动物来说,受体细胞一般是受精卵,因为受精卵的全 能性高,而高度分化的动物体细胞的全能性受到限制。
4.大肠杆菌和酵母菌在基因工程中都可以作为受体细胞,但 又有所不同。大肠杆菌为原核生物,而酵母菌为真核生物(具有 多种细胞器),所以酵母菌在用于生产需要加工和分泌的蛋白质 时比大肠杆菌有优势。 有内质网和高尔基体
2.病毒感染法 用病毒DNA与目的基因一起构建的载体,去感染受体动物细胞, 也能使目的基因导入动物细胞内。
(三)将目的基因导入微生物细胞 1.感受态细胞 经过适当的处理(如用Ca2+处理)后,细胞质膜对DNA的通透性会
发生改变,细胞变得容易接受外来的DNA,处于这种状态的细胞称为 感受态细胞。
2.过程
Ca2+处理微生物细胞
感受态细胞
基因工程原理与技术-3
pBV221
rrnB
制备RNA探针的载体
两条链RNA 探针的制备程序
简化外源蛋白纯化的载体(标签载体) pBAD/His
常用的标签: 多聚组氨酸残基、 结合麦芽糖蛋白、 谷胱甘肽-s-转移 酶。
亲和层析法纯 化外源蛋白。
pBAD/His的三种变体(3种读码框)
BglII site of the MCS.
表达载体
(根据受体细胞)
原核细胞表达载体 真核细胞表达载体
表达载体
(根据表达蛋白的转运)
分泌型表达载体 非分泌型表达载体
表达载体
(根据表达蛋白的组成)
融合型表达载体 非融合型表达载体
大肠杆菌表达载体的特征(与克隆载体相比):①强启动
子;如Lac、Trp、Tac、PL、PR、T7启动子。②SD序列; ③强终止子。如rrnB。
大多数)、双链线形 DNA、RNA(酵母的 杀伤质粒)。
提取的质粒有三 种构型:①闭合环形 DNA(超螺旋构型), ②开环形DNA,③线 形DNA。
2、质粒的复制类型 严紧型:严格受宿主控制,1~3拷贝
松弛型:不严格受宿主控制,10~200拷贝
质粒的复制类型与宿主有关,如R1质粒在大肠杆菌中 是严紧型,而在奇异变形杆菌是松弛型;ColE1-K30质粒与 R1质粒正好相反。
起点和选择标记、可在两种不同的宿主细胞中存活和复制 的质粒载体。
如:大肠杆菌-土壤农杆菌穿梭质粒载体(植物转化载 体)、大肠杆菌-酿酒酵母穿梭质粒载体(见下图)、大肠杆菌枯草芽孢杆菌穿梭质粒载体(pHV14、pEB10)、大肠杆菌-动 物细胞穿梭质粒载体(pBPV-BV1),但还没有大肠杆菌-植物 细胞穿梭质粒载体。
例如,将λ噬菌体在EcoRI限制-修饰的宿主和EcoRI限制-修 饰缺陷型宿主之间反复地循环生长,筛选到完全失去了 EcoRI酶切位点的λ噬菌体。然后将突变体同野生型λ噬菌体 在体内进行重组,选择得到仅在非必需区段具有1~2个 EcoRI酶切位点的重组体噬菌体。
基因工程基因工程的载体
2020/4/4
苏州科技学院生物系
叶亚新
第三章 基因工程的载体
作为基因工程载体的基本功能
1. 运送外源基因高效转入受体细胞 2. 为外源基因提供复制能力或整合能力 3. 为外源基因的扩增或表达提供条件
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第三章 基因工程的载体
作为基因工程载体必须具备的基本条件
1)标记基因与宿主细胞 2)标记基因产物的作用机制: Apr 3)标记基因的结构与适用范围: 基因启动子, 翻译起始
序列, 密码子偏爱性
4)标记基因的结构变化对功能的影响: LacZ, GUS
4. 常用的遗传标记基因
1) 四环素抗性基因(Tcr)
Tetracycline 可结合在核糖体30s亚基中的一种蛋白 质分子上,抑制核糖体的转位过程。四环素抗性基因编码 一种399 AAs蛋白质,与细菌细胞膜结合,阻止四环素分 子进入细菌细胞。
第三章 基因工程的载体
载体:携带外源基因进入受体细胞的工具 用于基因工程的载体
•细菌质粒载体 •噬菌体λ衍生载体 •Cosmid载体 •Phagemid载体
•酵母质粒载体 •真核病毒载体 •Bacmid载体 •YAC载体
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发展概况
1. 第一阶段(1977年前):天然质粒和重组质粒的利用,
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2) 氨苄青霉素抗性基因(Apr)
Ampicillin可抑制细菌细胞膜上参与细胞壁合成酶类的活性。Apr 抗性基因编码一种分泌到细菌细胞周间质的酶,催化β—内酰胺环的 水解,使氨苄青霉素失活。
3) 氯霉素抗性基因(Cmr)
基因工程第三章基因工程的载体
基因工程载体的种类
质粒载体
质粒是一种裸露的、独立于细菌 拟核DNA之外的DNA分子,具有 自我复制能力,可携带外源DNA 片段。
病毒载体
病毒载体是指能够将外源DNA片 段插入到病毒基因组中,并利用 病毒的复制机制将外源DNA片段 导入到受体细胞中的媒介。
基因工程载体的作用
基因转移
基因工程载体能够将外源DNA片 段导入到受体细胞中,实现基因 的转移和表达。
通过优化载体结构,提高其在宿主细胞内的稳定性,降低丢失和突变 的风险。
开发NA的载体,提高基因工 程的效率和安全性。
拓展载体功能
通过基因工程技术对载体进行改造,赋予其新的功能,如表达调控、 靶向输送等。
智能化载体
利用合成生物学和纳米技术,开发具有智能响应能力的基因工程载体, 实现基因治疗的精准化和个性化。
利用基因工程载体生产食品添加剂、 酶制剂等,提高生产效率和产品质量。
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此外,噬菌体载体还可以用于疫苗研 发和生物治疗等领域。
04 人工染色体载体
人工染色体的概念与特性
人工染色体是一种通过基因工程技术 构建的染色体,具有与天然染色体相 似的结构和功能。
人工染色体具有高容量、可定制和可 调控等特性,能够承载和表达大量的 外源基因,为基因治疗、生物制药等 领域提供了新的工具。
质粒载体的应用
总结词
质粒载体在基因工程中广泛应用于基因克隆、表达和基因治疗等领域。
详细描述
质粒载体此外,质粒载体还可以用于基因治疗和疫苗研制等领域, 为疾病治疗和预防提供了新的手段。
03 噬菌体载体
噬菌体的生物学特性
基因克隆
基因工程载体可作为基因克隆的 工具,将外源DNA片段插入到载 体中,通过复制和扩增实现基因 克隆。
基因工程载体
第三章基因工程载体体外获得的任一DNA片段,必须插入到可以自我复制的载体内,再转入宿主细胞,才能得到复制和进行表达。
基因工程载体(Vectors)就是携带外源基因进入受体细胞进行繁殖和表达的一种工具。
载体的功能运送外源基因高效转入受体细胞为外源基因提供复制能力或整合能力为外源基因的扩增或表达提供必要的条件基因工程中3种主要类型的载体:1.质粒载体2.噬菌体载体3.柯斯质粒(cosmid)载体基因工程对载体的要求(1)在宿主细胞内能独立复制。
(2)有选择性标记。
(3)有一段多克隆位点。
外源DNA插入其中不影响载体的复制。
(4)分子量小,拷贝数多。
(5)容易从宿主细胞中分离纯化。
第一节质粒(plasmid)载体质粒是一种独立于染色体外的双链闭环的DNA分子,具有自主复制和转录能力,能在子代细胞中保持恒定的拷贝数,并表达所携带的遗传信息。
质粒的复制和转录要依赖于宿主细胞编码的某些酶和蛋白质,如离开宿主细胞则不能存活,而宿主即使没有它们也可以正常存活。
(一)质粒的构形环形双链的质粒DNA在提取过程中通常出现三种不同的构型:①共价闭合环形DNA(cccDNA)②开环DNA(open circular,ocDNA)③线形DNA(linear,lDNA)(二)质粒的转移性指质粒从一个细胞转移到另一个细胞的特性。
接合型质粒:除了带有自我复制所必需的遗传信息外,还带有一套控制细菌配对和质粒接合转移的基因。
如:F质粒(性质粒或F因子)甚至能使寄主染色体上的基因随其一道转移到原先不存在该质粒的受体菌中。
不符合基因工程的安全要求。
非接合型质粒:带有自我复制所必需的遗传信息,但失去了控制细菌配对和质粒接合转移的基因,因而不能从一个细胞转移到另一个细胞。
如R质粒(抗性质粒)、Col质粒(细菌素质粒)。
符合基因工程的安全要求。
R质粒:带有一种或数种抗生素抗性基因,使寄主获得同样的抗生素抗性性状(resistance)。
Col质粒:细菌素通过与敏感细菌细胞壁的结合作用,抑制一种或数种细胞生命过程。
基因工程载体(质粒-3章)幻灯片(1)
非接合型质粒的寄主细胞中同时存在一 种接合型质粒,那么它们通常也是可以 被转移的。这种由共存的接合型质粒引 发的非接合型质粒的转移过程,叫质粒 的迁移作用(mobiligation)又叫质粒 的诱动。
带有大肠杆菌素基因的Col质粒和带有抗菌素抗性基因的R 质粒既有属于接合型的,也有属于非接合型的。
如果在非接合型质粒的寄主细胞中同时存在一种接合 型质粒,那么它们通常也是可以被转移的。这种由共存的 接合型质粒引发的非接合型质粒的转移过程,叫质粒的迁 移作用(mobilization)又叫质粒的诱动。ColE1是一种可以 迁移但属于非接合型质粒。
2)F 因子
F因子是最有代表性的接合型质粒,又称致育因子 (fertility factor)或性质粒(Sex plasmid)。它在寄主细胞中有 三种存在方式:①独立于染色体之外,闭环双链DNA形式 存在。这种细胞称F+细胞。②独立于染色体之外,闭环双 链DNA形式存在,但其DNA上还携带有寄主菌染色体基因 或DNA区段。这种细胞称之为F-细胞。③以线性DNA形式, 从不同位点整合到寄主菌染色体上,这种细胞称为Hfr细胞 (高频重组细胞)。
如加入不同启动子序列,用于生产单链 DNA或RNA,外源基因的大量表达。又加 入COS位点,使载体能容纳更大的DNA片 段等等。
质粒载体的选择标记:
外源DNA片段与质粒载体DNA连接,再转化入 宿主菌,经培养后需筛选鉴定转化子。这就需 要利用质粒载体的可选择标记。
质粒载体的选择标记
抗生素抗性基因选择标记
蓝-白斑实验
构建的质粒人工载体,应用最广的是 PBR322,分子量为2.6×106,含46332bp。 含有选择标记抗氨苄青霉素(Apr)基因来 自天然质粒RSF2124和抗四环素(Ter)基因 来自PSC101质粒。复制子部分来自PMB9 (一类Co1E1质粒)。多克隆限制性内节切 酶位点有9个
第三章载体ppt课件
2. 质粒载体必须具备的基本条件
(1)具有复制起点(ORI) (2)具有抗菌素抗性基因:是筛选的标志。理想的
载体应该有两种抗菌素抗性基因。 (3)若干限制性内切酶的单一位点:用来插入外源
DNA片断。且插入后不影响复制功能。 (4)具有较小的分子量和较高的拷贝数。
3. 质粒的选择标记及其工作原理:
(2)长度: 约2.7kb (3)克隆位点: 10个连续的单一限制酶切位点,位于lacZ’基因的
5’端。
(4)选择标记:Ampicillin 抗性和 lacZ的肽 互补(蓝白斑)相结合。
蓝白斑选择原理: ① Xgal ② -半乳糖苷酶Xgal显色反应:-半乳糖苷
酶能把无色的化合物Xgal分解成半乳糖和一 个深蓝色的物质5-溴-4-氯靛蓝。 ③ lacZ的肽互补
加到1000个以上。
(4) 插入失活型质粒载体
载体的克隆位点位于其某一个选择性标记基因内 部。如pDF41、pDF42、pBR329。
(5) 表达型质粒载体
主要用来使外源基因表达出蛋白质产物。注意启动子的 性质,终止子、起始密码、终止密码的阅读正确。如果在大 肠杆菌里表达,必须把所克隆的真核生物的基因置于大肠杆 菌的转录—翻译信号控制之下。
六、其它质粒载体
1. pGEM-3Z
由pUC派生而来。与pUC的主要区别是 在MCS的两侧分别加了一个噬菌体启动子 T7和SP6。可被T7和SP6的RNA聚合酶识 别转录。
2. 穿梭质粒载体(shuttle plasmid vectors)
(1)穿梭质粒载体的结构
人工构建的具有两种不同复制起点和选 择标记、可以在两种不同的寄主细胞中存 活和复制的质粒载体。
1)-肽( lacZ’ ): -半乳糖苷酶N端的一段氨基酸片断(11-41氨
基因工程第3章 基因克隆载体(1质粒载体)
诱导物:IPTG
• IPTG是乳糖的类似物。能诱导lac操纵 子的启动转录,使受体菌基因组中的 lacZ 的C端部分和载体的lacZ’肽都 表达。从而互补。 • 但载体MCS上插入外源DNA后,不能 产生肽!
lacZ的肽互补
• -肽( lacZ’ 基因编码):-半乳糖苷酶N端 的一段氨基酸片断(11-41氨基酸)。 • lacZ只有在4聚体的状态下才有功能。 • pUC质粒载体上的lacZ’ 编码的肽与这个缺 失突变的-半乳糖苷酶“互补”,使它能形 成4聚体,又能分解Xgal,产生蓝色物质。
• pBR322质粒是按照标准的质粒载体命 名法则命名的。
• “p”表示它是一种质粒; • “BR”则是分别取自该质粒的两位主 要构建者F.Bo1ivar和 R.L.Rodriguez姓氏的头一个字母, • “322'’系指实验室编号,以与其他质 粒载体如pBR325,pBR327, pBR328等相区别。
合适的启动子
• 真核生物基因在原核生物中表达,改 用原核生物或病毒(噬菌体)基因的 启动子。
• 原核生物基因在真核生物中表达,仍 用原核生物基因的启动子。 • 选用外界条件诱导的启动子。
(1) 质粒克隆载体pBR322
• pBR322是经人 工改造的一种较 为理想的大肠杆 菌质粒载体,应 用广泛。现在已 经被许多更优良 的新型克隆载体 所替代。 (P40)
• (1)分子量大,拷贝数低
• 第一个用于基因克隆的天然质粒pSC101,分子 长 9.1 kb。但只有一个EcoR I切点充当克隆位点, Tetr 作为筛选标志。
(2)筛选标志不理想
• ColE1质粒的筛选标志是大肠杆菌素E1 (colicin E1)。 • colicin E1能杀死不含ColE1 质粒的菌,形 成“噬菌斑”。 • 唯一的克隆位点 EcoR I 正好位于这个基因 的内部。因此可通过插入失活筛选。但细 菌群体容易自发突变出抗colicin E1的细 胞…….
第三节 载体
B:流程
2.碱变性法
A:原理: (1)pH 12.0-12.6:线性DNA变性,质粒DNA为
自然状态; (2)pH中性,高浓度盐:线性DNA交联成不溶网
3、载体的分类
根据来源:质粒载体、噬菌体载体、病毒载体 根据用途:克隆载体、表达载体 常用的载体: 质粒(plasmid)、单链DNA噬菌体 M13 、噬菌体的衍生物、柯斯质粒(cosmid)、 动物病毒(virus)
常见载体的种类和特征
质粒*
受体细胞 结构
E.coli
环状
λ 噬菌体
E.coli
(三 ) 质粒DNA的分离与纯化
1、氯化铯密度梯度离心法; 2、碱变性法; 3、沸水浴法
细菌DNA提取的步骤
• 1) 细菌培养物的生长和收集 • 2) 细胞破碎以获得细胞提取物 • 3) 从细胞提取物中纯化DNA • 4) DNA浓缩
1.氯化铯密度梯度离心法
A:原理 (1)质粒占总DNA1%~2%; (2)在细胞裂解及DNA分离过程中,大分子量的
醇沉淀收集质粒DNA。
3、沸水浴法
用含有EDTA和Triton X-100的缓冲液悬浮菌体
加溶菌酶裂解细菌细胞壁 沸水浴40秒钟 离心,取上清,加异丙醇,离心 乙醇沉淀质粒DNA
三 、噬菌体载体
(Bacteriophage,简称phage)
状结构,SDS作用下形成沉淀;质粒DNA仍为可 溶状态。离心,上清质粒DNA (3)纯化:乙醇沉淀
B:步骤
(1)菌体培养与提取; (2)裂解细胞:煮沸法、碱性SDS法,非离子型去污
第三章 基因工程载体
表达载体与克隆载体的区别
Hale Waihona Puke 强启动子,一个可诱导的强启动子可使外源基因 有效的转录 在启动子下游区和ATG(起始密码子)上游区有 一个好的核糖体结合位点序列(SD序列),促进 蛋白质翻译 在外源基因插入序列的下游区要有一个强转录终 止序列,保证外源基因的有效转录和mRNA的稳 定性
表达型载体(expression vector)
Apr TcS为重组子 Apr Tcr为原载体 ApS Tcr为重组子 即为非重组子
pUC系列的质粒载体
pBR322质粒的复制起点 Amp抗性基因,但核苷酸序列不含有原来限制 性核酸内切酶的单一酶切位点 大肠杆菌β-半乳糖酶基因(lacZ)的启动子及其 编码α-肽链的DNA序列,此结构特称为lacZ‘基 因 位于lacZ'基因中的靠近5”端的一段多克隆位点 (MCS ,multiple cloning sites)区,但它 并不破坏该基因的功能
4、
去除两 个PstI
pBR318 (6.3Kb)
酶切 体外重组 酶切
pBR313
EcoRII片 断去掉
pBR322 (4.3Kb)
pBR320 (2.8Kb)
四、常用质粒载体类型
1、克隆质粒载体
2、表达质粒载体
3、多功能质粒载体
4、穿梭质粒载体
1、克隆质粒载体
克隆质粒载体是指专用于基因或DNA片断无性繁
pBR322插入失活效应
筛 选 重 组 子 的 示 意 图
Amp r
1)限制酶切 2)DNA重组 无DNA插入
Tc
有DNA插入
Amp r Tcr
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2013-9-23
苏州科技学院生物系
叶亚新
2) 氨苄青霉素抗性基因(Apr)
Ampicillin可抑制细菌细胞膜上参与细胞壁合成酶类的活性。 Apr抗性基因编码一种分泌到细菌细胞周间质的酶,催化β—内酰胺 环的水解,使氨苄青霉素失活。
3) 氯霉素抗性基因(Cmr)
Chlorophenicol可结合在核糖体50 S亚基上,阻止蛋白质合 成。Cmr基因编码氯霉素乙酰转移酶,使氯霉素乙酰化,导致乙酰化 的氯霉素不能结合在核糖体上。
2013-9-23
苏州科技学院生物系
叶亚新
第一节
E.coli 质粒载体
二、质粒(plasmid)载体的构建 2、质粒人工构建的目的
天然质粒往往存在着这样或那样的缺陷,因而不适合用 作基因工程的载体必须对之进行改造构建:
(1)加入合适的选择标记基因,如两个以上,易于用作选择 (2)增加或减少合适的酶切位点,便于重组 (3)缩短长度,切去不必要的片段,提高导入效率,增加装载量 (4)改变复制子,变严紧为松弛,变少拷贝为多拷贝 (5)根据基因工程的特殊要求加装特殊的基因元件 方法就是重组,拼拼接接,挖肉补疮。
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2. 标记基因的种类
1)抗性标记基因(可直接用于选择转化子)
a. 抗生素抗性基因: Apr ,Tcr ,Cmr,Kanr,G418r, Hygr ,Neor b. 重金属抗性基因: Cur ,Znr ,Cd r c. 代谢抗性基因: TK,抗除草剂基因
2)营养标记基因(可直接用于选择转化子)
主要是参与氨基酸,核苷酸及其他必需营养物合成酶 类的基因, 这类基因在酵母转化中使用最频繁,如TRP1, URA3,LEU2,HIS4等。
3)生化标记基因
其表达产物可催化某些易检测的生化反应,如lacZ, GUS, CAT
4) 噬菌斑
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3. 使用标记基因注意要点
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第一节
E.coli 质粒载体
一、质粒(plasmid)的一般性质 2、特征
可扩增性
pMB1或ColEI类质粒在蛋白质合成中断时,质 粒复制能持续合成,这样当用氯霉素抑制蛋白 质合成并阻断细菌染色体复制时,带有pMB1或 ColEI复制子的质粒将利用丰富的原料大量复 制,最后每个细胞可以积聚2000-3000个拷贝, 这叫做氯霉素扩增。
7)萦光素酶基因
萦光素酶或由萤火虫产生的可催化蜜蜂萦光素氧化的酶,并产 生萦光,若在反应中加入CoA,可使灵敏度提高10倍;或由发光细 菌(Photobacterium fischeri)产生的萦光素酶,它与FMN-氧化 还原酶联用,通过NAD(P)H的变化测定酶活。
8)发光蛋白质基因
发光蛋白是由水母产生的一种可发光的蛋白质,该蛋白质可使 大肠杆菌菌落呈蓝色。
如pSC101, colE1, pCR, pBR313和pBR322 (1977, Bolivar
et al)
2. 第二阶段:增大载体容量(降低载体长度),建立多克
隆位点区和新的遗传标记基因。如pUC系列载体。
3.第三阶段:进一步完善载体功能以满足基因工程克隆中的不
同要求,如M13mp系列载体,含T3,T7,sp6启动子载体,表
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人工构建的质粒根据其功能及用途分为:
1.
2.
3.
4.
5.
6.
多拷贝质粒 经过人工突变,除去控制拷贝数负调节基因,使质粒拷 贝数达到每个细胞数千,用于扩增外源基因。 测序质粒 拷贝数高,加装测定顺序所必需的序列,如多切口接头, 便于各种片段方便克隆 整合质粒 装有整合促进基因及整合特异序列,便于外源基因准确 重组整合入受体细胞的染色体上 穿梭质粒 含有两个不同的复制子,能在两种不同的受体细胞中复 制 表达质粒 装有强的启动基因,合适的顺序以及有效的终止子,以便 任何外源基因在受体细胞内的高效表达 探针质粒 筛选克隆或寻找基因元件,他通常装有一个可以定量测 定其表达的标记基因,如抗性基因。筛选启动基因、终止子等。
分子克隆载体的转化频率和稳定性
1. 影响转化频率的因素
1) 复制起点类型:尽可能选择高拷贝复制起点 2) 标记基因:尽可能选择高效表达的标记基因
2. 影响稳定性的因素
1) 复制起点类型—低拷贝载体稳定,高拷贝载体稳定性 差 2) 选择压力 3) 载体在宿主细胞中的状态—自主复制型和整合型 宿主细胞的遗传特性和生理特性
2. 标记基因与拷贝数的关系
若标记基因表达效率高,宿主细胞可能不大量产生标记基 因以满足选择压力要求,因而载体拷贝数会降低。对于不同标记 基因,可采取相应方法提高其拷贝数。 如:对于药物抗性标记基因,可提高药物浓度。 对于营养标记基因,可降低该基因的表达效率或更换其他低 效率的标记基因
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第一节
E.coli 质粒载体
一、质粒(plasmid)的一般性质 1、定义
质粒是存在于细菌细胞质中独立于染色体而 自主复制的共价、封闭、环状双链DNA分子 (Covalently closed Circular DNA, ccc DNA)
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分子克隆载体的复制起点与种类
1. 复制起点的种类
1) 核内复制起点 a. 染色体复制起点—原核生物(环状)和真核生物(线状)染色体 b. 染色体外复制起点 原核与真核生物 i. 质粒—DNA,RNA,线状,环状,单链,双链 ii. 病毒—同上, 细胞内和病毒颗粒内 2) 核外复制起点 两种质体中亦可能含有质粒 a. 线粒体—所有真核细胞 b. 叶绿体—所有绿色植物细胞
苏州科技学院生物系叶亚新 Nhomakorabea 第一节
E.coli 质粒载体
一、质粒(plasmid)的一般性质 2、特征
自主复制性
质粒DNA携带有自己的复制起始区(ori)以及一个控 制质粒拷贝数的基因,因此它能独立于宿主细胞的染 色体DNA而自主复制
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第一节
E.coli 质粒载体
β—半乳糖苷酶基因的优点:
a. 酶催化X-Gal水解为兰色产物,检测直观 b. lacZα编码5'-端可容许很大的变化而不影响酶活性 c. lacZα和β链基因的分别表达可使载体小而容量大
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6)葡萄糖苷酸酶基因(GUS)
该基因编码一种可分解各种β-葡萄糖苷酸酶基因衍生物的水 解酶。该标记基因除具有上述lacZ基因的优点外,它的适用范围十 分广泛,因为许多生物中没有这种基因。
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第一节
2、特征
E.coli 质粒载体
一、质粒(plasmid)的一般性质
携带遗传标记
在实验室中将质粒通过物理方法导入受体细胞,但是 即使在最佳条件下,受体细胞中也只有少数细胞能稳 定地接受质粒,要想找到这些进入了质粒的受体细胞, 就要利用载体质粒上的遗传标记,天然质粒上碰巧携 带许多功能基因,它们便可被用作选择标记。
质粒(2μ)复制起点,又含有ARS片段
b. 不同生物复制起点混合—穿梭载体(shuttle vector)两种
生物中均以质粒形式存在;在一种生物中以质粒形式存在,在另一种
生物中以质粒或病毒形式存在
*
穿梭载体范围:细菌—细菌(放线菌),细菌—酵母菌,
细菌—真菌,细菌—动物
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1)标记基因与宿主细胞 2)标记基因产物的作用机制: Apr 3)标记基因的结构与适用范围: 基因启动子, 翻译起 始序列, 密码子偏爱性 4)标记基因的结构变化对功能的影响: LacZ, GUS
4. 常用的遗传标记基因
1) 四环素抗性基因(Tcr)
Tetracycline 可结合在核糖体30s亚基中的一 种蛋白质分子上,抑制核糖体的转位过程。四环素抗性基 因编码一种399 AAs蛋白质,与细菌细胞膜结合,阻止四 环素分子进入细菌细胞。
这种指示可以是选择性的(Apr ,Tcr ,Kanr),也可 以是非选择性的(如lacZ)
2)指示外源DNA分子是否插入载体分子形成了重组子。
* 这种指示也可以是选择性的(如TcS),也可以是非选 择性的(如TcS, lacZα, GUS),绝大多数为后者。 **有的遗传标记基因可以完成上述两项作用。当充任第一 作用时,最好是选择性标记基因;当完成第二作用时,目前 多采用非选择性的—检测性标记基因。有的基因是不能用作 选择性标记基因(lacZ,GUS等)。
第三章 基因工程的载体
载体:携带外源基因进入受体细胞的工具 用于基因工程的载体
•细菌质粒载体 •噬菌体λ衍生载体 •Cosmid载体 •Phagemid载体 •酵母质粒载体 •真核病毒载体 •Bacmid载体 •YAC载体
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发展概况
1. 第一阶段(1977年前):天然质粒和重组质粒的利用,
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第一节 E.coli 质粒载体
一、质粒(plasmid)的一般性质 3、分类 接合型和非接合型 严紧性和松弛型 在基因工程中使用的质粒都是松弛型质粒
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第一节
E.coli 质粒载体
二、质粒(plasmid)载体的构建 1、理想质粒载体所具备的条件 质粒较小 质粒带有可供选择的标记 带有尽可能多的单一限制酶切位点 应有较高的基因表达能力