生物化学名词解释
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生物化学
1. 蛋白质折叠:蛋白质由所含氨基酸残基的亲水性、疏水性、带正电、带负电等特性通过残基间的相互作用而折叠成一个立体的三级结构。
2. 锌指结构:许多转录因子所共有的DNA结合结构域,具有很强的保守性。它由4个氨基酸(4个Cys残基,或2个Cys残基和2和His残基)和一个锌原子组成一个形似指状的三级结构。
3. 冈崎片段:复制叉上新合成的短的DNA片段,即DNA不连续合成的产物。细菌的冈崎片段约为1000~2000个核苷酸,真核细胞的约为100~200个核苷酸。
4. 尿素循环:又称“鸟氨酸循环”。机体对氨的一种解毒方式。肝脏是鸟氨酸循环的重要器官。包括三个阶段,①氨、二氧化碳和鸟氨酸缩合生成瓜氨酸;②瓜氨酸再与一分子氨结合脱去水,生成精氨酸;③精氨酸在肝脏精氨酸酶的催化下,水解生成尿素,并重新变为鸟氨酸。
5. 柠檬酸-丙酮酸穿梭系统:线粒体内产生的乙酰 CoA,与草酰乙酸缩合生成柠檬酸,穿过线粒体内膜进入胞液,裂解后重新生成乙酰 CoA,产生的草酰乙酸转变为丙酮酸后重新进入线粒体。
6. 别构效应:一种分子可以通过分子内某一部分的结构改变,而导致激活部分活性改变的现象,即别构效应,也可称为变构效应。经常研究的例子是酶的别构效应,然而除了酶以外,如血红蛋白等也有别构效应。
7. 氧化磷酸化:指在代谢物脱氢氧化经呼吸链传递给氧生成水的过程中,既消耗了氧,消耗了无机磷酸,使ADP磷酸化生成ATP的过程,称为电子传递水平磷酸化,通常称之氧化磷酸化。常发生在线粒体内膜上。
8. 分子杂交:不同来源或不同种类生物分子间相互特异识别而发生的结合。如核酸(DNA、RNA)之间、蛋白质分子之间、核酸与蛋白质分子之间、以及自组装单分子膜之间的特异性结合。
9. 结构域:也指功能域,在较大的蛋白质分子或亚基中,多肽链往往由两个或两个以上相对独立的三维实体,缔合而成三级结构,三维实体之间靠松散的肽链连接,这种相对独立的三维实体称为结构域。例如免疫球蛋白就含有12个结构域,每条重链上含有4个结构域,每条轻链上含有两个结构域。
10. Isoelectric Point:对某一种蛋白质而言,当在某一pH时,其所带正负电荷恰好相等(净电荷为零),这一pH值称为该蛋白质的等电点。蛋白质在等电点时的溶解度最小。
11. 透析:利用蛋白质不能通过半透膜的性质除去样品中小分子的非蛋白质物质。具体操作是将样品装在透析袋,放在无离子水中进行,在透析期间要更换无离子水,直到完成。
12. 蛋白质四级结构:具有三级结构的亚基借助非共价力彼此缔合成寡聚或多聚蛋白质。
13. Chargaff's rules:① DNA的腺嘌呤和胸腺嘧啶摩尔数相等,即A=T;②鸟嘌呤和胞嘧啶的摩尔数也相等,即G=C;③含6-氨基酸的碱基数等于含6-酮基的碱基数,即A+C=G+T;④嘌呤的总数等于嘧啶的总数,即A+G=C+T。
14. 退火(annealing):使热变性DNA缓慢冷却,则可发生复性,此过程称为退火。
15. 限制酶图谱(restriction map):核酸经限制性内切酶消化成片段,用电泳等方法分离,不同的核酸形成的各自独特的条带图谱。
16. 结合糖:糖类和其他类型生物分子以共价键结合而形成的化合物。包括糖蛋白、蛋白聚糖、肽聚糖、糖脂、脂多糖等,又称糖缀合物。
17. 酶的活性中心:指在一级结构上可能相距甚远,甚至位于不同肽链上的少数几个氨基酸残基或这些残基上的基团通过肽链的盘绕折叠而在三维结构上相互靠近,形成一个能与底物结合并催化其形成产物的位于酶蛋白表面的特化的空间区域。对需要辅酶的酶来说,辅酶分子或其上的某一部分结构常是活性中心的组成部分。
18. 三碳循环:又称卡尔文循环。是20世纪50年代卡尔文等人提出的高等植物及各种光合有机体中二氧化碳同化的循环过程。由核酮糖-1,5-双磷酸羧化酶/加氧酶催化核酮糖-1,5-双磷酸的羧化而形成甘油酸-3-磷酸的循环,产生的磷酸果糖可在叶绿体中产生淀粉。
19. 氨化作用:有机氮化物在微生物作用下释放出氨的过程。
20. 核心酶:大肠杆菌的RNA聚合酶相对分子质量465 000,由五个亚基(α2ββ'σ )组成,还含有两个金属离子,它们与β' 亚基相结合。没有σ 亚基的酶(α2ββ' )叫核心酶。
21. 必需氨基酸:人和其他动物不具备合成蛋白质中全部氨基酸的途径,因此他们必须从食物中获得不能合成氨基酸。这些不能自己合成,必须从食物中获得的氨基酸称为必需氨基酸。人类和大鼠的必需氨基酸是相同的,共有10种即Phe、Val、Trp、Leu、Ile、Thr、Met、Lys、His、Arg(对幼小动物需要)。
22. 转化(作用):指细菌品系由于吸收了外源DNA(转化因子)而发生遗传性状的改变现象。
23. 衰减作用:通过操纵子前导区内类似终止子的一段DNA序列(衰减子)实现的细菌辅助阻遏作用的一种精细调控。
24. 第二信使:是指由于胞外信使(也称第一信使)与质膜上受体的结合而产生或增加的靶细胞胞内物质,它们起着从质膜到胞内生化机构的信息传递者的作用。已知的第二信使有cAMP、cGMP、Ca2+以及从膜磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸(PIP2)衍生而来的肌醇-1,4,5-三磷酸(IP3)和1,2-二酰基-sn -甘油(DAG)。
25. SD序列(Shine-Dalgarno sequence):原核生物起始密码子上游为核糖体结合位点,与核糖体小亚基16S rRNA的3'端序列互补。
26. 构象:由于分子中单键自由旋转以及键角有一定的柔性,具有统一结构式和同一构型的分子在空间中可有多种形态,这些形态称为构象。
27. 蛋白质变性:蛋白质为生物大分子物质,有一定空间结构和生物学功能。在各种物理和化学因素作用下蛋白质生物活性丧失,溶解度降低不对称性增高以及其他的物理化学常数发生改变,这种过程称为蛋白质变性。
28. 等电聚焦电泳:是一种高分辨率分析分离技术。它用于蛋白质的等电点测定。利用这种技术分离蛋白质混合物是在具有pH梯度的介质(如聚丙烯酰胺凝胶)中进行的。在外电场作用下各种蛋白质将移向并聚焦(停留)在等于其等电点的pH梯度处,形成一个很窄的区带。
29. 同源异构体:由来自一个基因的mRNA前体因选择性剪接而产生多种mRNA,并翻译出多种多肽链,这些多肽链即为同源异构体。
30. 解偶联剂:不抑制呼吸链的递氢或递电子过程,但能使氧化产生的能量不能用于ADP的磷酸化的试剂称为解偶联剂。其机理是增大了线粒体内膜对H+的通透性,使H+的跨膜梯度消除,从而使氧化过程释放的能量不能用于ATP的合成反应。主要的解偶联剂有2,4-二硝基酚。
31. 反竞争性抑制作用:抑制剂不能与游离酶结合,但可与ES复合物结合并阻止产物生成,使酶的催化活性降低,称酶的反竞争性抑制。
32. 肽键:由一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基除去一分子水缩合而成的。
33. 别构效应:同第6个。
34. 活化能:一般分子转变为活化分子所吸收的最小平均平动能,代表分子进行有效碰撞所需的起码的额外能量要求。
35. 质粒:是一种在细菌染色体以外的遗传因子,由环形双DNA构成,根据染色体对质粒的复制控制程度严格与否,可将质粒分为松弛型控制质粒和严紧型控制的质粒,前者已选作基因工程的载体。质粒主要存在于原核工业生物细菌中,在真核生物酵母中也有。
36. 糖酵解:指葡萄糖或糖原在缺氧情况下(或氧气不足条件下),经过一系列反应分解为乳酸和少量ATP的过程。
37. DNA半保留复制:DNA复制是以DNA的两条链为模板,以dNTP为原料,在DNA聚合酶作用下按照碱基互补配对规律合成新的互补链,这样形成的两个子代DNA分子与原来的DNA分子完全相同,故称之为复制。又因子代DNA分子的双链一条来自亲代,另一条是新合成的,故名半保留复制。
38. 操纵子:转录的功能单位。很多功能上相关的基因前后相连成串,由一个共同的控制区进行转录的控制,包括结构基因以及调节基因的整个DNA序列。主要见于原核生物的转录调控,如乳糖操纵子、阿拉伯糖操纵子、组氨酸操纵子、色氨酸操纵子等。
39. 信号肽序列:每一需要运输的蛋白质都含有一段氨基酸序列,称为信号肽或导肽序列。
40. 无义突变:当氨基酸密码子变为终止密码子时,称为无义突变。
41. 光合作用:植物、藻类和某些细菌利用叶绿素,在光的照射下将水和二氧化碳转变为糖类,并释放氧的复杂过程。