分子细胞遗传学技术(精)

荧光原位杂交技术（Fluorescence in site hybridization, FISH）的特异性DNA探针
• 基因座特异性探针：克隆扩增获得。在基因制图方面的努 力，越来越多的这方面探针可以使用 • 着丝粒重复序列探针：这些特异性的探针可在中期染色体 和间期细胞核中产生强烈信号，可以鉴别特异性染色体。 • 全染色体涂染探针：通过对来自特异性染色体分检库或仅 含一条人类染色体的杂种细胞DNA扩增制备。这种DNA 序列的混合物与一条染色体上的多个位点同源。因此在中 期核内，整条染色体得以被涂染。通过使用不同的荧光素， 在一个中期染色体涂片上可以鉴别几条不同的染色体。
基因突变形式—碱基的插入和缺失
• 碱基的插入和缺失：基因编码序列中插入或丢失一个或
几个碱基，其结果是突变点下游碱基序列发生移码，编
码氨基酸序列都发生改变，又称移码突变（ frameshift mutation），并可在突变点下游提前出现终止密码。
碱基的插入和缺失的结果：将导致移码突变
（frameshift mutation），并可在突变点下游提前出现 终止密码产生截短型蛋白
比较基因组杂交的原理
Biblioteka Baidu
• 待测DNA（肿瘤 细胞DNA，test DNA)为绿色
• 参照DNA(正常 细胞DNA， reference DNA） 为红色
• 复染为蓝色
人食管鳞癌细胞株的比较基因组杂交
A. 中期染色体的DAPI的 复染图
B. 中期染色体比较基因组杂 交（CGH）：红色区域表示
丢失，绿色区域表示扩增。
1. 无义突变和移码突变： 2. 稀有的错义突变： 60％
微小突变
20％
3. DNA大片段缺失或重复: 20％
另外：可能和疾病风险评估有关的大量的多态位点
（二）目前常用的对已知点突变的分析技术
• 限制性片段长度多态性（RFLP）
• 等位基因特异性（PCR）扩增（ASA）
• 等位基因特异性寡核苷酸杂交（ ASO）
应用15号染色体一基因特异性 探针（红色）杂交确定其是否 缺失；绿色探针鉴定15号染色 体着丝粒。
24种不同染色体涂染探针杂 交得到的彩色染色体
染色体技术的
应用－1
inv(14)(p12q24)
t(2; 11)(2q34; 11q13)
细胞遗传学研究中染色体技
术的应用—FISH技术检出
t(2; 14)
分子细胞遗传学技术 与产前诊断
南京大学医学院 王亚平
2006年11月
基因诊断的中心问题是认识 遗传变异、基因突变 及与表型之间的关系
一、分子细胞遗传学技术
荧光原位杂交技术（fluorescence
in site
hybridization, FISH）：用荧光物质标记特异性DNA探针， 与中期细胞染色体或间期细胞核杂交，鉴别和确定出生缺 陷、肿瘤细胞染色体异常，分辨率可达50－500 kb.
CGH的局限性：
• 难以检出以下异常：平衡易位，微小突变，基
因重排，倍体水平改变。 • 结果可能受到一些因素影响：正常细胞存在， 肿瘤自身的遗传异质性，系统的波动。 • 灵敏度：限于检测较大范围的缺失（10 — 30MB）
二、突变分析与分子诊断
（一）基因突变类型
• 点突变：只有一个或几个核苷酸的改变，是突
• DNA芯片
1.限制性片段长度多态性（RFLP）分析
• 当突变影响到某一限制性内切酶位点时，
可通过酶切PCR产物，电泳分析:限制性片 段长度多态性（RFLP）
2.等位基因特异性（PCR）扩增（ASA）
• 通过设计两个5’端引物，一个与正常DNA互补， 一个与突变DNA互补。分别加入这两种引物及3’ 端引物进行两个平行的PCR，分析结果。
染色体技术的
应用－2
inv(9)(p12q13)
分子细胞遗传学：DMD基因第46号外显子缺失
细胞遗传学研究中染色体技术的应用
21号染色体涂染探针FISH杂交， 显示21三体
9号染色体涂染探针杂交。 箭头示易位到10号染色体上 的来自9号染色体的片段
比较基因组杂交（comparative genomic hybridization, CGH）
变中最多见的形式。
•
•
稳定突变：传递中不改变原有的突变。
动态突变：传递中不断改变自己，多见于短重
复序列的突变，在一代代传递中重复次数发生
明显变化。
点突变的结果：
（1 ）同义突变（ samesense mutation ）：碱基替换后，虽 然密码子发生改变，但编码氨基酸没有改变（遗传密码 的兼并性），亦称静止突变。 （ 2 ）错义突变（ missense mutation ）：碱基替换，密码 子发生改变后，编码氨基酸亦发生改变，编码另一个氨 基酸。 （3）无义突变（nonsense mutation）：碱基替换后，使 编码氨基酸的密码子变成一个终止密码子。 （4）中性突变：包含两种情况，即“同义突变”和不改变 蛋白质功能的“错义突变”
缺失突变
基因突变形式
• 框内突变（ inframe mutation ）： 3 个或是的 倍数的碱基缺失或插入导致的突变，使基因丢 失或增加1个或几个氨基酸。
• DNA 大片段缺失或复制（ large deletion or
duplication) ：几百个bp至几十个kb的碱基缺
失或复制。
各种类型病理性突变的比例
CGH的优点：
• 经一次染色体原位杂交实验即可在整条染色体或染色体 区带水平对待检基因组DNA序列拷贝数改变进行检测和 定位。 • 无需进行染色体培养，对于不易制备良好分裂相的实体 瘤尤为适用。 • 所需染色体DNA可来自各种组织，如新鲜组织、福尔马 林固定的组织、石蜡包埋组织，可在很少量的基础上检 测，利于做回顾性研究。
• 近年在FISH技术基础上发展起来的一种新的分子细胞遗 传学技术（1992，Kallioniemi）。其基本原理是用不 同荧光物质分别标记肿瘤细胞DNA和正常人细胞DNA，然 后与正常人中期细胞染色体杂交。
• 通过检测染色体上两种荧光信号的相对比值，了解肿瘤 细胞DNA拷贝数的变化，并可在染色体上定位。 • 这一技术已广泛应用于肿瘤基因组不平衡的检测。
3.等位基因特异性寡核苷酸杂交（ ASO）
• 设计两段寡核苷酸探针，其中包含发生突变的 位点，一段与野生型链互补，一段与突变型链 互补。 • 杂交分析是否存在突变