酶学理论基础

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注:有些球蛋白具有四级结构,这类球蛋白的分子中含两条 或多条多肽链,这些多肽链彼此以非共价键相连,每一条肽 链都有自己的二、三级结构。
(2)转移酶类
作用:催化基团转移反应 通式: 种类:酮醛基转移酶、酰基转移酶、
糖苷基转移酶、含氮基转移酶等; 例如谷丙转氨酶(EC2.6.1.2)反应式:
(3)水解酶类
作用:催化底物的加水分解反应 通式: 种类:淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。
例如磷酸二酯酶(EC3.1.4.1)催化脂的水解反应:
★Systematic name
Each enzyme is now classified and named according to the type of chemical reaction it catalyzes. So an enzyme is assigned a four-number classification and a two-part name. In addition recommended name is suggested by IUB for everyday use.
蛋白质功能决定于其结构,不仅与其氨基酸 组成(一级结构)有关,而且还与其空间结 构有关(二级结构、三级结构、四级结构)。
酶蛋白空间结构的基本结构单位: 螺旋结构、折叠结构、转角结构、卷曲结构
1、维持酶蛋白分子构象作用力
①盐键 ②氢键 ③疏水作用 ④范德华力 ⑤二硫键
2、具有酶活性的蛋白质都是球蛋白, 结构特征如下:
注:酶的催化专一性主要决定于酶蛋白部分;
辅因子通常作为电子、原子或某些化学基团的载体。
★辅助因子
无机辅助因子:
Mg2+、Zn2+、Fe2+、Cu2+、Mn2+、Ca2+、 Ni2+
有机辅助因子:
NAD、FAD、CoQ、CoA、硫辛酸、TPP、生 物素、铁卟啉、磷酸吡哆醛、四氢叶酸
★其它重要概念
➢ 对于蛋白类酶现在普遍接受的是国际酶学委员会1961年制定 的酶分类与命名法。
➢ 对于核酸类酶由于其研究历史不长,对于分类和命名还没有 统一的原则和规定。
★酶学委员会建议,在发表论文时,与论题有关的主要酶在第一 次提到时应写出它的编号、系统命名、习惯命名和来源,然后再 用系统命名或习惯命名叙述。
一、蛋白类酶的系统名、惯用名
(1) 肽链往往是通过一部分α-螺旋、一部分β-折叠、一部 分β-转角和一部分无规卷曲形成紧密的球状构象;
(2)大多数非极性侧链总是埋藏在分子内部形成疏水内核, 而大多数极性侧链总是暴露在小分子的表面上,形成一些 亲水区;
(3)分子表面往往有一个内陷的空穴,往往是疏水区,对酶 分子而言,此空穴正好容纳一个或两个小分子底物或大分 子底物的一部分,即酶活性部位;
EC. X.X.X.X
乳酸脱氢酶 EC 1. 1. 1. 27
第1大类,氧化还原酶
第1亚类,氧化基团CHOH 第1亚亚类,H受体为NAD+
该酶在亚亚类中的流水编号
(1)氧化还原酶类
作用:催化氧化-还原反应 通式: 种类:脱氢酶(dehydrogenase)和氧化还原酶(Oxidase) 例如乳酸脱氢酶(EC1.1.1.27)反应式:
(6)连接酶类
作用:催化C-C、C-O、C-N 以及C-S 键的形成
通式:
A + B + ATP ===AB + ADP +Pi
A + B + ATP ===AB + AMP +Pi
种类:羧化酶
例如丙酮酸羧化酶(EC 6.4.1.1)催化反应:
二、核酸类酶
核酸酶是唯一的非蛋白酶,是一类特殊的RNA,能够 催化RNA分子中的磷酸酯键的水解及其逆反应和一些 其它反应。
寡聚酶 (oligomeric enzyme):
由几个或多个亚基组成,亚基之间以非 共价键结合牢固地联在一起,单个亚基没有 催化活性,所有的亚基都有四级结构。
多酶复合物 (multienzyme system):
几个酶镶嵌而成的复合物,这些酶催化 将底物转化为产物的一系列顺序反应。
1.2.2、酶的空间结构
酶学理论基础
第二章 酶学理论基础
教学目标:
➢ 了解酶的分类、组成和结构特点 ➢ 理解酶催化作用的机制 ➢ 掌握酶促反应动力学和影响因素以及酶活力测定方法
教学重点:
酶的分类、组成和结构特点、催化机制、酶促反应动力学 、酶活力及其测定
教学难点:
酶催化作用的机制及特点、酶促反应动力学及影响因素
★已知酶历年增长统计图
★核酸类酶的分类
自我剪切酶
分子内催化
自我剪接酶
R酶
分子间催化
RNA剪切酶 DNA剪切酶 多肽剪切酶 多糖剪接酶 多功能R酶
1.2、酶的组成和结构特点
1.2.1、酶的组成 酶
单纯酶(单体酶) 结合酶(全酶)
辅酶 :与酶蛋白结合得比较松的小分子有机物
辅因子
辅基 :与膜蛋白结合得紧密的小分子有机物
金属激活剂 :金属离子作为辅助因子
酶种类
4000 3500 3000 2500 2000 1500
1770
2122
2477
3702 3169 2966
1000 500
874 712
0 1955
1960
1965
1970 1975 年份
1980
1985
1990
1995
Baidu Nhomakorabea
2000
1.1.1、酶的分类命名原则
按照分子中起催化作用的主要组分不同,酶可以分为蛋 白类酶(proteozyme,P酶)和核酸类酶(ribozyme,R酶, 核酶)两大类。因而采取分类命名:
系统名:包括所有底物的名称和反应类型。
乳酸 + NAD+
丙酮酸 + NADH + H+
乳酸:NAD+氧化还原酶
惯用名:只取一个较重要的底物名称和反应类型。
乳酸:NAD+氧化还原酶
乳酸脱氢酶
注:对于催化水解反应的酶一般在名称上省去反应类型!
1961年国际酶学委员会(Enzyme Committee,EC) 根据酶所催化反应类型和机理分为6类:
(4)裂合酶类
作用:催化从底物分子中移去一个基团或原 子形成双键的反应及其逆反应
通式: 种类:醛缩酶、水化酶、脱氨酶等 例如醛缩酶(EC4.1.2.7)催化反应:
(5)异构酶类
作用:催化各种同分异构体的相互转变 通式: 种类:异构酶 例如葡萄糖-6-磷酸异构酶(EC5.3.1.9)催化反应:
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