重组体的筛选和鉴定
重组体的筛选方法
重组体的筛选方法重组体是一种重要的生物技术手段,它可以用于改良微生物、植物和动物的基因组,从而实现对目标基因的精准编辑和调控。
在进行重组体的筛选过程中,选择合适的筛选方法对于提高筛选效率和准确性具有重要意义。
本文将介绍几种常见的重组体筛选方法,帮助读者更好地理解和应用这一技术。
1. 抗生素筛选法。
抗生素筛选法是重组体筛选中最常用的方法之一。
通过将目标基因与抗生素抗性基因连接在一起,然后转化至宿主细胞中,能够通过对抗生素的耐受性来筛选出含有目标基因的重组体细胞。
这种方法简单易行,且操作方便,适用于微生物和植物等生物体的筛选。
2. 标记基因筛选法。
标记基因筛选法是利用标记基因与目标基因共转化至宿主细胞中,通过标记基因的表达情况来筛选出含有目标基因的重组体细胞。
常用的标记基因包括荧光标记基因、抗性标记基因等,通过检测标记基因的表达情况,可以快速准确地筛选出目标基因的重组体细胞。
3. PCR筛选法。
PCR筛选法是利用聚合酶链式反应(PCR)技术来筛选重组体。
通过设计特定的引物,可以扩增出含有目标基因的DNA片段,从而实现对重组体的筛选。
PCR筛选法具有高灵敏度和高特异性的优点,能够准确地检测出目标基因的存在,是一种常用的重组体筛选方法。
4. 免疫筛选法。
免疫筛选法是利用抗体对目标蛋白的特异性识别来筛选重组体。
通过将目标蛋白与标记蛋白连接在一起,然后转化至宿主细胞中,利用抗体对标记蛋白的特异性识别来筛选出含有目标蛋白的重组体细胞。
这种方法对于筛选蛋白重组体具有重要意义,能够快速准确地筛选出目标蛋白的重组体细胞。
5. 酶标记筛选法。
酶标记筛选法是利用酶标记技术来筛选重组体。
通过将目标基因与酶标记基因连接在一起,然后转化至宿主细胞中,利用酶标记基因的表达情况来筛选出含有目标基因的重组体细胞。
这种方法操作简便,能够快速准确地筛选出目标基因的重组体细胞。
总结。
重组体的筛选方法多种多样,每种方法都有其特点和适用范围。
重组体分子的选择与鉴定方法及鉴定
电泳后的图谱
挑三个菌落 鉴定,图显 示的是三个 菌落中的质 粒双酶切的 结果
依赖于重组子结构特征分析的筛选方法三 PCR方法筛选鉴定重组子
• 基本原理: • 在载体DNA分子中,外源DNA插入位点两侧的序列多为 已知,通过与插入位点两侧已知序列互补的引物,从单 克隆中提取少量质粒DNA作为模板进行PCR扩增,琼脂 糖凝胶电泳分析确定是否为重组子。
抗药性标记法示意图
b类插入失活筛选
• 从原理上讲,当外源基因(或DNA片段)插入到某一基因内 的位点后, 使这个基因丧失了原有的功能叫插入失活 (insertional inactivation) 。插入失活法是从不同的重组 DNA分子获得的转化子中鉴定出含有目的基因的转化子 (筛选)的主要方法。
常用的抗药性选择标记
抗药性 氨苄青霉素 (Amp) 溶解剂 虑过 除菌 是 贮存温度 贮存浓度 终浓度
水
-20℃
50mg/ml
50~100µ g/ml
氯霉素(Cm) 卡那霉素 (Ka或Kan)
四环素(Tet 或Tc) 链霉素(Sm 或Str)
乙醇
否
-20℃
34mg/ml
20~17交液中,在60℃下放置6h;把同 位素标记的DNA探针于100℃变性后加入杂交溶液中,然 后放入滤膜,60℃杂交16-24h。探针的用量一般为105 -106cpm/ml。用2×SSC洗脱3次,每次30min。 • 7 放射自显影:将洗好的滤膜用吸水纸吸干,夹于两层保 鲜膜中,在暗室内放进暗盒,放好X线片,并于X线片上 作好标记,置于-70℃冰箱暴光48-72h。 • 8 洗片:在暗室内取出X线片,进行显影和定影,分析杂 交结果。
RNA水平
蛋白质水平
免疫化学检测法(放射性抗体检测法、 免疫沉淀检测法) Westhern印迹杂交法
何水林版基因工程第五章基因的转移与重组体的筛选和鉴定
带酶切位点的PCR产物 5’- GCAGAATTC
PCR产物 PCR产物
GGATCCGCG CCTAGGCGC BamH I位点
-3’
-5’
3’- CGTCTTAAG
EcoR I位点
EcoR I BamH I 5’AATTC 3’- G PCR产物 PCR产物 G -3’ CCTAG -5’
两头各有一个粘性末端!
4. DEAE-葡萄糖转染法 二乙氨乙基(DEAE)葡聚糖为多聚阳离子试剂,能 促进哺乳动物细胞摄入外源DNA。
葡聚糖
++ ++++++ ++ + + + 二乙氨乙基 + + (DEAE) ++ ++ ++++
++ ++++++ ++ + + + 二乙氨乙基 + + (DEAE) ++ ++ ++++ - - - -- - DNA - - --- -
4、在培养基中生长数小时之后,球形细胞复原并增殖。
操作步骤: 10ng 载体DNA 100L 感受态细胞 10-100L转化液 涂Amp+平板
(p140)
吸附DNA 冰浴30min
摄入DNA 42℃ 1~2min
37℃ 振荡培养1h
加入1mL LB培养基 (Amp-)
转化率:106-108/g DNA
(一)转化率的计算:
转化率 = 产生菌落的总数 / DNA的加入量
基因工程重组体克隆的筛选和鉴定
基因功能的正向遗传筛选技术
突变体库的构建
通过化学诱变、同源重组 等技术构建大规模突变体 库。
表型筛选
通过特定表型筛选出具有 特定功能的突变体。
突变基因的鉴定
通过测序等技术鉴定出突 变基因,并研究其功能。
05
克隆基因的应用前景
克隆基因在医学上的应用
疾病诊断与治疗
利用克隆技术获取特定基因,可用于疾病诊断、药物研发和个性化治疗。
基因敲入
将特定基因敲入生物体基因组,观察 生物体表型变化,以确定该基因的功 能。
基因表达干扰
通过转录因子或RNAi技术干扰特定 基因的表达,观察生物体表型变化, 以确定该基因的功能。
正向遗传筛选
通过突变体库筛选具有特定表型的突 变体,鉴定突变基因,以研究该基因 的功能。
基因敲除和敲入技术
基因敲除技术
基于测序的筛选
对转化子进行全基因组测序或目的基因片段测序,与已知序列进行比 对,判断是否含有目的基因。
蓝白筛选法
原理
步骤
利用载体上标记基因的表达产物对转化子 进行筛选,通过菌落颜色的变化判断是否 含有目的基因。
将转化子涂布在含有抗生素的培养基上, 培养后观察菌落颜色变化,蓝色菌落为阳 性克隆,白色菌落为阴性克隆。
基因表达的蛋白质印迹分析
原理
利用特异性抗体检测样品中特定蛋白质的表达情况,通过显 色反应或荧光信号对蛋白质进行定性或定量分析。
用等 方面的研究。
04
克隆基因的功能研究
基因功能研究的方法
基因敲除
通过基因工程技术将特定基因敲除, 观察生物体表型变化,以确定该基因 的功能。
Northern印迹杂交
原理
基于RNA的电泳分离和转移,将RNA 片段与标记的探针进行杂交,以检测 特异的RNA转录本。
第四章基因的转移与重组体的筛选和鉴定
第四章基因的转移与重组体的筛选和鉴定第一节转化基因片段在体外只是一段核酸分子,是化学物质,无法表现出遗传物质的生命活性。
只有当其存在于活细胞后,生命的特征才能充分展示出来。
在分子克隆实践中,在体外操作的核酸分子只有进入细胞以后才能达到克隆的目的。
一、重组DNA分子转入原核生物细胞1. 重组质粒DNA分子转化大肠杆菌转化(transformation)——重组质粒DNA分子通过与膜蛋白结合进入受体细胞,并在受体细胞内稳定维持和表达的过程。
转化不仅适合于大肠杆菌受体细胞,而且适合于枯草杆菌和蓝藻等其他原核生物以及酵母等低等真核生物受体细胞。
(1)CaCl2处理后的细菌转化或转染A、制备感受态细胞受体细胞的细菌,经一定浓度的冰冷的 CaCl2(50~100 mmol/L)溶液处理后变成。
所谓感受态细胞,处在感受态状态的菌体有摄取各种外源 DNA的能力。
转化:感受态的大肠杆菌细胞捕获和表达质粒载体DNA分子的生命过程;转染:感受态的大肠杆菌细胞捕获和表达噬菌体DNA分子的生命过程;好的感受态细胞,每微克的超螺旋质粒DNA可得5×107个转化体。
B、细胞转化(或转染)的具体操作过程:①将处于对数期的新鲜培养物于0℃4000转/分离心10分,回收细菌细胞;②将细胞用0℃的0.1mol/L CaCl2低渗溶液处理30分钟,离心回收细胞,再用适量0℃的0.1mol/L CaCl2重悬细胞,以诱导感受态产生。
③加入适量DNA,于42 ℃热处理混合物90秒,使DNA分子被细胞吸收;④将混合物快速转到冰浴中,冷却1~2分,加入适当的培养基,在37 ℃培养45分,使细胞复苏并表达质粒所携带的转化基因;⑤通过选择培养基上平板培养,选择转化体。
⑥如果用抗菌素筛选转化体,作为对照的受体菌应该在此培养基上不生长。
(2)电穿孔转化法基本原理是利用高压电脉冲作用,在大肠杆菌细胞膜上进行电穿孔(electroporation),形成可逆的瞬间通道,从而促进外源DNA的有效吸收。
重组体筛选的方法
重组体筛选的方法
重组体筛选是一种用于寻找具有特定性质或功能的重组分子的方法。
下面列举了一些常用的重组体筛选方法:
1. 亲和筛选(Affinity screening):利用目标蛋白与重组体之间的亲和力进行筛选。
可以通过将目标蛋白固定在固相材料上,然后将重组体溶液注入固相材料中,通过洗脱和分离来筛选出与目标蛋白相互作用的重组体。
2. 循环进化(Directed evolution):采用类似于自然进化的方法,通过连续的基因突变和筛选来改进重组体的性能。
通常使用基因库构建、突变(例如误配PCR、DNA shuffling等)和活性筛选(例如细胞表面显示、酶活性测定等)等方法。
3. 细胞表面显示(Cell surface display):利用细菌或酵母等微生物表面展示重组体,并通过流式细胞术(FACS)等方法筛选出具有目标性质的重组体。
4. 体外显示(In vitro display):重组体通过与其DNA或RNA编码的蛋白质、磷酸盐结合或共价耦合,以形成重组体-核酸复合物。
然后通过结合亲和柱或筛选酶活性等方法对重组体进行筛选。
5. 亲和柱筛选(Column chromatography screening):利用亲和柱固定目标蛋白,然后通过洗脱和分离来筛选具有亲和性的重组体。
6. 生物传感器筛选(Biosensor screening):利用生物传感器的敏感性和选择性来筛选具有目标性质的重组体。
常见的生物传感器包括表面等离子体共振(SPR)传感器和电化学传感器等。
上述方法可能结合使用,根据具体的研究目标和条件来选择最合适的筛选方法。
重组体的筛选方法
重组体的筛选方法1、重组体的基本筛选概念重组体(recombinant)指从不同生物系统中获取的非天然表达载体,以用于表达特定蛋白质或DNA片段,通常为了检测某种生物活性,以改良生物机理或更改特定特性。
重组体的筛选是对重组体表达的非天然蛋白质进行筛选的过程,可以用来鉴定新的蛋白质、表达具有特定生物活性的蛋白质,或确定新的重组体表达载体。
表达系统筛选通常包括利用基因工程技术在指定载体上表达特定基因编码片段,然后使用分子生物学、免疫学和生物化学方法进行在细胞水平或分子水平上进行分析和筛选,以鉴定具有特定生物活性的重组体表达系统。
2、方法(1)载体筛选。
在大多数重组体表达系统中,筛选的首要任务是识别具有最佳表达能力的载体,其中也可能涉及到大量的载体类型。
可以分别从细胞系、染色体、质粒、全基因组、融合蛋白等不同类型的载体中选择重组体。
有些载体可能会更有效地表达特定基因,而有些可能会产生低产蛋白,因此需要进行大量的筛选才能有效地识别最佳的表达系统载体。
(2)表达率筛选。
在细胞中表达的蛋白质必须具有最大的表达量才能产生最佳的活性,因此对重组蛋白质的表达量非常重要。
在大多数情况下,使用多种不同的表达系统技术来评估重组体表达质量,例如利用Western和Northern blotting、Immunoprecipitation、活性测定和流式细胞术等技术。
(3)特异性筛选。
在获得足够数量的蛋白质之后,必须进一步确定表达体的特异性,特异性不仅取决于重组蛋白质可以被正确表达和结构功能完整,而且应该是特异性,以使其产生预期的生物活性。
因而,重组体的筛选过程还必须包括一项评估表达蛋白质的特异性的步骤,释放的生物活性水平是最重要的特征,在此筛选步骤中,可以使用酶抑制试验、衍生物筛选、细胞学剂量响应性试验或免疫学、化学、物理学方法来评估重组表达体的活性。
3、结论重组体表达是一种实用技术,它旨在确定特定生物学活性的最佳表达系统,以获得有价值的蛋白质或未知活性的分子。
重组克隆的筛选与鉴定
4、 选择得过程
(1)四环素抗性插入失活
如果在Tetr上插入外源DNA,导致四环素 抗性基因失活,可用四环素﹢环丝氨酸 得平板,选择重组克隆。
Tetr插入失活得细菌,其生长可被四环素 抑制,不被环丝氨酸杀死,保留下来;
Tetr不失活得细菌,能抗四环素,正常生长, 但可被环丝氨酸杀死。
图 四环素抗性插入失活
二、利用抗生素抗性基因:pBR322
以pBR322为例,说明利用抗生素抗性基因得插 入失活得原理。
1、 原理
在pBR322上有多个单一得限制酶位点,如 BamH I位点,恰好在一个四环素抗性基因内。 如果有外源DNA插入BamH I位点,那么涉及 四环素抗性得基因就损坏,因此,带有重组 pBR322质粒得细胞,仍对氨苄青霉素有抗性, 但对四环素得抗性消失(敏感)。
pUC18/19得结构图
氨苄青霉素抗性基因 Lac Z基因:编码-半乳糖苷酶得部分肽
段。 Lac Z上有插入外源DNA得MCS位点。
4、 筛选得方法:蓝白斑法
利用蓝白斑法筛选pUC8/9重组子,就是 一种直接检测-半乳糖苷酶活性得方法。
①先将转化子涂于含有氨苄青霉素得培 养基,能合成-半乳糖苷酶。
该技术已广泛应用于基因得表达、基因 定位、克隆基因得筛选、酶切图谱得制
作、基因组中特定基因序列检测、遗传 病疾病得诊断及生物分类等方面。
一、核酸分子杂交得基础
1、 变性与退火 DNA以双链形式存在,在进行分子杂交
时,先将双链DNA分子解聚为单链,这一 过程称为变性。
两条单链通过碱基互补,聚合成稳定得 双链区得过程称为退火或复性。
图 表型筛选加酶切筛选
0
A
A
T T
TA AT
重组体的筛选方法
重组体的筛选方法重组体是指通过DNA技术将来自不同来源的DNA片段重组而构建的新的DNA 分子。
重组体技术被广泛应用于基因工程、遗传学研究和生产实践中。
重组体的筛选是确保所需目标DNA片段被正确重组的关键步骤。
以下是几种常用的重组体筛选方法。
1. 纤维素酶切筛选法纤维素酶切筛选法是一种原理简单、操作方便的筛选方法。
通过将重组体与纤维素酶一起处理,纤维素酶能够选择性地降解未重组的DNA片段,而保留重组体。
重组体可通过琼脂糖凝胶电泳分离,然后使用DNA杂交技术来确认重组体的存在。
2. 改性PCR筛选法PCR(聚合酶链式反应)是一种能够在体外扩增特定DNA片段的技术。
在重组体筛选中,可以通过设计特定引物,使得PCR只能扩增包含目标DNA片段的重组体,而无法扩增未重组的DNA片段。
PCR扩增后,可以使用琼脂糖凝胶电泳分离扩增产物,确认是否存在所需目标DNA片段。
3. 限制性内切酶和DNA连接酶筛选法限制性内切酶是能够识别特定DNA序列并在特定位置切割DNA链的酶。
在重组体筛选中,如果所需目标DNA片段被正确重组,限制性内切酶将无法切割形成的DNA链,而能够切割未重组的DNA片段。
通过对重组体和未重组DNA使用相应的限制性内切酶进行酶切反应,可以通过琼脂糖凝胶电泳分离并观察DNA片段的断裂情况,确定重组体的存在。
4. 荧光标记筛选法荧光标记筛选法利用荧光染料标记目标DNA片段,通过荧光检测的方式进行筛选。
一种常用的方法是将重组体的目标DNA片段与荧光基团结合,形成荧光标记的重组体。
然后,通过荧光检测技术,如荧光凝胶电泳、荧光显微镜观察等,可以检测到荧光信号,确认重组体的存在。
此外,还有其他一些筛选方法,如互补性DNA杂交、DNA测序、南方印迹、北方印迹等,可以根据具体实验需要选择合适的方法进行重组体的筛选。
总结起来,重组体的筛选方法多种多样,可以根据实验的目的和具体条件选择适合的方法。
需要注意的是,在筛选过程中,实验者需要仔细操作,严格控制实验条件,以确保筛选结果的准确性和可靠性。
第六章重组体的筛选与鉴定
一、根据载体表型特征的筛选 (一)抗药性标记插入失活筛选法 检测外源DNA插入作用的一种通用方法是插入失活效应。 检测外源DNA插入作用的一种通用方法是插入失活效应。 DNA插入作用的一种通用方法是插入失活效应
1.以 1.以pBR322质粒为例 质粒为例
(1)pBR322质粒的一般特性 质粒的一般特性 在pBR322质粒上有两个抗生素基因,Ampr基因内有 pBR322质粒上有两个抗生素基因, 质粒上有两个抗生素基因 一个PstⅠ限制性核酸内切酶的唯一识别位点, PstⅠ限制性核酸内切酶的唯一识别位点 一个PstⅠ限制性核酸内切酶的唯一识别位点,Tetr基 因内有BamHⅠ和SalⅠ两种限制性核酸内切酶单一识别 因内有BamHⅠ和SalⅠ两种限制性核酸内切酶单一识别 BamHⅠ 两种限制性核酸内切酶单一 位点。 位点。
如下图所示
一、根据载体表特征的筛选 (一)抗药性标记插入失活筛选法
Ampr pBR322 Tetr AmprTetr
菌落原位影印
pBR322
+
pBR322
AmprTets
Amp琼脂平板 琼脂平板
Tet琼脂平板 琼脂平板
图 应用抗生素抗性基因插入失活筛选重组体
一、根据载体表特征的筛选 (二)β-半乳糖苷酶显色反应筛选法 1.乳糖操纵子的结构 1.乳糖操纵子的结构
二、根据插入基因遗传性状的筛选 (一)原理 重组体DNA分子转化到大肠杆菌受体细胞后, DNA分子转化到大肠杆菌受体细胞后 重组体DNA分子转化到大肠杆菌受体细胞后,如果 插入在载体分子上的外源基因能够实现其功能性的表 插入在载体分子上的外源基因能够实现其功能性的表 达,而且表达的产物能与大肠杆菌菌株的营养缺陷突变 形成互补,那么就可以利用营养突变株进行筛选. 形成互补,那么就可以利用营养突变株进行筛选. 互补 (二)举例 当外源目的基因为合成亮氨酸的基因时 当外源目的基因为合成亮氨酸的基因时,将该基因 亮氨酸的基因 重组后转入缺少亮氨酸合成酶基因的菌株中,在仅仅缺 缺少亮氨酸合成酶基因的菌株中 重组后转入缺少亮氨酸合成酶基因的菌株中,在仅仅缺 亮氨酸的基本培养基上筛选,只有能利用 能利用表达产物亮 少亮氨酸的基本培养基上筛选,只有能利用表达产物亮 氨酸的细菌才能生长 因此,获得的转化子都是重组子 生长, 转化子都是重组子. 氨酸的细菌才能生长,因此,获得的转化子都是重组子.
基因工程-第8章-重组子的筛选与鉴定
2、根据插入序列的表型特征选择重
组体分子的直接选择法
转化进来的外源DNA编码的基因,能够 对大肠杆菌寄主菌株所具有的突变体发 生体内抑制或互补效应,从而使被转化 的寄主细胞表现出外源基因编码的表型 特征。
Example:
λ gt.λ B噬菌体(由于C片断的缺失而造成重 组缺陷的λ red-噬菌体),在大肠杆菌lig ts菌株上生长不能形成噬菌斑,在有连接酶功 能的大肠杆菌lig+菌株上形成噬菌斑。 将具有连接酶基因的重组体噬菌体λ gt. λ B,涂布在大肠杆菌lig ts菌株上时,通过 寄主细胞的互补作用,能够形成噬菌斑。根据 形成噬菌斑这种表型特征,直接选择具野生功 能的重组体噬菌体。
缺点: 不单要求克隆的DNA片断必须大到足 以包含一个完整的基因,而且还要求所 编码的基因能够在大肠杆菌中实现功能 表达。 (对于真核基因很难达到要求)
二、物理检测法
1、凝胶电泳检测法 从宿主细胞中提取重组子分子,利用凝胶 电泳的方法,鉴定外源片断是否插入及其 长度。 优点:简便、快速。 缺点:只能提供克隆片段大小的信息。
抗药性标记插入失活
Amp r
1)限制酶切 2)DNA重组 无DNA插入
Tc
有DNA插入
Amp r
Tcr
转化
Amp r Tc s
外源DNA
Amp r பைடு நூலகம்cr
无菌落 筛选重组子 阳性菌落
Amp r Tc s
提取DNA 电泳
筛 选 重 组 子 的 示 意 图
Amp r Tc s
重组DNA
(2)β-半乳糖苷酶显色反应选择法
外源DNA 有DNA插入
Apr
转化
Ap r
Ap r
筛选重组子 白色菌落
重组体的筛选
合成某一aa的基因 连接
酶切
重组
转化 缺少该aa合成 酶基因的菌株
载体
重组子
生长、获得
筛选
只缺少该aa的 基本培养基
二、核酸分子的物理检测法
原理: 碱基配对
杂交双方: 待测的核酸序列 插入片段基因制备的DNA或RNA探针
核酸杂交方法:
菌落印迹原位(in situ)杂交
斑点(dot)印迹杂交
Southern印迹杂交
实验原理与步骤
提取
点样
加热
RNA或DNA
变性
NC膜
碱溶液
放射性探针
固定
杂交
X-底片
放射自显影
一定条件
显影、定影
标记斑点
检测
3、Southern 印迹杂交
★1975年,英国Southern创建 ★ DNA与DNA的杂交,即将DNA电泳、 转印到固相支持物上,用探针进行检测的 方法。
限制性酶切割
第一节 核酸分子的遗传学与物理检测法 一、遗传学检测法
1、根据载体表型特征的筛选
(1)抗药性标记插入失活筛选法
Kan
克 隆
抗 性 基 因
(2)β -半乳糖苷酶显色反应筛选法
蓝 白 菌 落
蓝白菌落
筛选白色菌落
2、根据插入基因遗传性状的筛选
重组体DNA分子转化到大肠杆菌受体细胞 之后,如果插入在载体分子上的外源基因能够 实现其功能性的表达,而且表达的产物能与大 肠杆菌菌株的营养缺陷突变形成互补,那么就 可以利用营养突变株进行筛选。
限制片段
DNA分子
琼脂糖电泳
带有DNA片段的凝胶
实 验
用缓冲液转移DNA 至膜(尼龙膜或硝酸 纤维素滤膜)上
重组子的筛选与鉴定
一、遗传学检测法
无环丝氨酸培养基
一、遗传学检测法
(一)载体表型选择法 1.抗药性标记及其插入失活选择法 pBR322 选择过程 (2)氨苄青霉素抗性插入失活选择过程
如果Ampr上插入外源DNA,导致氨苄青霉素抗性基
因失活,可用碘-青霉素指示液选择。
一、遗传学检测法
(一)载体表型选择法 2. -半乳糖苷酶显色反应选择法
一、遗传学检测法
(一)载体表型选择法 2. -半乳糖苷酶显色反应选择法 (2) 选择过程
假阳性: 如果插入的外源DNA正好是3的倍数并且没有终止密码子;
(不破坏 肽)。
一、遗传学检测法
(一)载体表型选择法 2. -半乳糖苷酶显色反应选择法
-半乳糖苷酶使Xgal分解成兰色产物。
一、遗传学检测法
(二)根据插入基因的遗传性状的选择 利用插入的外源基因的表达产物特性进行直接选择。
(只在特定条件下)。 1.原理 (1)弥补缺陷 转化进来的外源基因产物能够弥补受体菌株的突变型
缺陷。
受体菌: his
-
外源基因: his
+
阳性克隆才能在不 含组氨酸的培养基 中生长
一、遗传学检测法
(二)根据插入基因的遗传性状的选择 1.原理
(2)增加新性状 使被转化的受体菌表现出外源基因的表型。 例:小鼠的二轻叶酸还原酶(DHFR)对三甲氧苄二
优点:简便、快速,结果较可靠。
缺点:基因必须表达并具有合适的受体细胞。 (一) 根据载体表型特征选择重组体分子的直接选择法
1. 抗药性标记插入失活选择法 2. β-半乳糖苷酶显色反应选择法 (二)根据插入序列的表型特征选择重组体分子的直接选择法 转化进来的外源DNA编码的基因,能够对大肠杆菌寄主菌株所 具有的突变体发生体内抑制或互补效应,从而使被转化的寄主细胞表 现出外源基因编码的表型特征。
实验17-重组体筛选与鉴定
无环丝氨酸培养基
(2源DNA,导致氨苄 青霉素抗性基因失活,可用碘-青霉素 指示液选择。
二 根据插入基因的表型选择
利用插入的外源基因的表达产物特性进行直 接选择。(只在特定条件下)。
一、原理:
1.弥补缺陷
转化进来的外源基因产物能够弥补受 体菌株的突变型缺陷。
五 免疫化学检测法
对表达产物的检测。蛋白——蛋白“杂交” 利用抗体作为“探针”来检测转入受体 菌并且表达出相应的蛋白质的外源基因。 一、放射性抗体检测法
1. 抗体与产物的结合方式 根据第一抗体(一抗)和第二抗体(二抗) 的性质可分为几种作用方式:
固相支 持滤膜
一抗
待测基因 产物蛋白
125I标记的二抗
DNA(cccDNA)。一般情况下,DNA溶液的体积不应超过感受 态细胞体积的5%。 3. 试剂的质量: 所用的试剂,如CaCl2 等均需是最高纯度的(GR. 或AR.),并用超纯水配制,最好分装保存于干燥的冷暗处。 4. 防止杂菌和杂DNA的污染:整个操作过程均应在无菌条件下 进行。
克隆的筛选与鉴定
在70%甲酰胺中,把DNA双链变性,复 性的时候,DNA-RNA杂交分子比DNADNA双链更稳定。电镜下可见一种R-环 形结构。
缺点:需要电镜!
2. Northern blotting
用DNA(或RNA) 探针检测RNA样 品。
主要检测插入片 断是否被转录。
从宿主细胞中提 取RNA,再用探 针杂交。
试剂:
1.LB固体和液体培养基。
2.含特定抗生素的LB固体培养基。
3.100mM CaCl2溶液。
4.含15%甘油的0.05mol/L CaCl2: 称取0.28g CaCl2(无水,分析纯),溶于50ml重蒸水中,加入15ml 甘油,定容至100ml,高压灭菌。
重组体的筛选和鉴定
1975年,英国Southern创建
针对DNA的杂交,即将DNA电泳、转印到固相支持物上,用探 针进行检测的方法。
原理:将重组菌的基因组或质粒DNA提取出来,经合适的限制
性内切酶酶切后,进行琼脂糖凝胶电泳分离,把定位在凝胶 中的DNA碱变性处理,使其双链DNA分开,再将凝胶中变性的 DNA转移到硝酸纤维素膜上,用制备的标记探针与其充分混合, 进行同源性DNA杂交。
为Tcr表型.而质粒为Tcs表型。
转化菌涂在Tc平板上,只有含有外源DNA插入片段
的阳性重组子的转化菌能生长成菌落。
16
(3)显色反应筛选:蓝白斑筛选
乳糖 -半乳糖苷酶 X-gal 半乳糖 + 葡萄糖 + 5-溴-4-氯靛蓝 α-互补 深蓝色 (酶活)
半乳糖
β—半乳 糖苷酶
α链(lacZα) :四聚体装配
A
T T
表型筛选加酶切筛选
T A A T
38
二、目的克隆的鉴定
(一)核酸分子杂交(nucleic acid hybridization) 原理
具有一定同源性的两条核酸单链在一定条件下(适宜的温 度和离子强度)可按碱基互补的原则退火形成双链.
杂交分子可在DNA和DNA、DNA和RNA、RNA和RNA以及人工合
18
19
20
pUC18/19
5’
lacZ’
EcoRI SacI
EcoRI SacI
KpnI SmalI BamHI XbaI SalI
pUC18
PstI
SphI Hind III
ATGACCATGATTACGAATTCGAGCTCGGTACCCGGGGATCCTCTAGAGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTTGGCACTG
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GFP 老鼠
GFP- Kac的狗
GFP Alba 發青綠光 芒的 兔子
①新霉素磷酸转移酶基因(NPTⅡ)抗新霉素、卡 那霉素、庆大霉素和G418等抗生素,成为筛选动 植物转化子的选择标记基因。 ②潮霉素磷酸转移酶基因(HPT)赋予转化子能抗 潮霉素,作为选择标记基因主要用于筛选动植物 转化子。潮霉素是致癌物质,操作时应慎重。 ③氯霉素乙酰转移酶基因(CAT)也被用于筛选动 植物转化子的标记基因。
缺点:需要电镜!
2. Northern blotting
用DNA(或RNA) 探针检测RNA样 品。 主要检测插入片 断是否被转录。 从宿主细胞中提 取RNA,再用探 针杂交。
Northern Blotting
Western Blotting
Southern和Western印迹法
32P-labled
8 重组体的筛选和鉴定
筛选(Screening)
遗传表型(phenotype):是生物体遗传组成同环境 相互作用所产生的外观或其他特征。
本章教学目的和要求:
掌握常用的抗生素抗性筛选、蓝白斑筛选、酶切筛选、酶 联免疫吸附测定(ELISA)和免疫印迹(Western blotting)法的原理;了解转译筛选法和真核生物的报道 基因筛选法。
DNA Electrophoresis frangment
Transfer of DNA by blotting
DNA probe
Autoradiography
Agarrose gel
Nitrocellulose sheet
Add radiolabled spesfic antibody , Wash to remove unboud antibody
8.1
遗传学检测法
一、利用载体提供的表型特征筛选重组体 1 抗药性标记及其插入失活选择法 原理: pBR322质粒上有两个抗生素抗性基因: Tetr和Ampr。 Tetr上有插入位点BamH I和Sal I;
Ampr上有插入位点Pst I。
pBR322
因插入外源DNA而导致基因失活的现象称之为插入失活效应。
复印至硝酸 纤维素膜上
细菌菌落
用NaOH菌体裂解 DNA变性
单链DNA结 合到膜上
32P-cDNA
杂交
放射自显影
原位杂交筛选 DNA重组体图解
与放射性cDNA杂 交的菌落的斑点
(2)R-环检测法 1)原理: DNA-RNA杂交
2)选择过程 用外源基因的mRNA与重组载体杂交。 在70%甲酰胺中,把DNA双链变性,复 性的时候,DNA-RNA杂交分子比DNADNA双链更稳定。电镜下可见一种R-环 形结构。
无环丝氨酸培养基
氨苄青霉素抗性插入失活选择过程 如果Ampr上插入外源DNA,导致氨苄 青霉素抗性基因失活,可用碘-青霉素 指示液选择。
2.蓝白斑筛选法
乳糖
-半乳糖苷酶
半乳糖
Xgal
半乳糖
+ +
葡萄糖
5-溴-4-氯靛蓝
深蓝色
原理:
载体上有一段-半乳糖苷酶基因(Lac Z)的片段 (氨基端),其上有外源DNA的插入位点。 受体菌 基因组中有突变的-半乳糖苷酶基因( 片段缺 失)。可以被IPTG诱导表达。 载体和受体菌基因 组可以互补形成完整有功能的-半乳糖苷酶。
筛选植物转化细胞常用的报告基因 报告基因(reporter gene):系指其编码产物能 够被快速地测定,常用来判断外源基因是否已经 成功地导入寄主细胞(器官或组织)并检测其表 达活性的一类特殊用途的基因。
报道基因(reporter gene) (1)大肠杆菌的β-D-葡萄糖苷酸酶 (β-D-glucuronidase,GUS); (2)细菌和萤火虫的荧光素酶 (luciferase); (3)水母绿色荧光蛋白(GFP)基因 (Green Fluorescent Protein)。 (4)其它
(3)环丝氨酸:
杀死生长的细菌,但不杀死停止生长的细菌。
选择过程:
(1)四环素抗性插入失活 如果在Tetr上插入外源DNA,导致四 环素抗性基因失活,可用四环素加环 丝氨酸平板培养基选择重组克隆。 Tetr失活的菌生长被四环素抑制,不被环 丝氨酸杀死,保留下来; Tetr不失活的菌抗四环素,能分裂生长, 反而被环丝氨酸杀死。
重 组 分子量 克 Marker 隆
载体
二、酶切电泳筛选法-物理检测法 1. 原理: 根据已知的外源DNA序列的限制性酶切 图谱,选择一两种内切酶切割质粒,电 泳后比较电泳结果(DNA带数和长度)。
或用合适的内切酶切下插入片断,再用 其它酶切这个片断,电泳后比较结果是 否符合预计的结果。
A
B
A或B
⑥抗除草剂bar基因
bar基因编码磷化乙酰转移酶(PAT),使转化子 对含有磷化麦黄酮(PPT)成分的除草剂具有抗性。
⑦冠瘿碱合成酶基因
主要包括胭脂碱合成酶基因和章鱼碱合成基因两 类,存在于土壤农杆菌Ti质粒的T-DNA区段。 冠瘿碱合成酶基因在植物细胞中的表达产物可以 催化一些特殊反应,通过电泳分离及菲醌荧光染 料染色,方便地观察,据此作为报告基因用于转 植物基因细胞的筛选。 冠瘿碱合成酶基因在植物基因工程早期应用较多, 现已逐渐被其他更为理想的报告基因所取代。
筛选哺乳动物转基因细胞常用的报告基因
在植物转基因研究中采用的氯霉素乙酰转移酶 (Cat) 基因和新霉素磷酸转移酶(NptⅡ)基因也可用于哺乳 动物转基因细胞的筛选。 常用的标记基因还有: -- 胸腺核苷激酶基因(TK) -- 二氢叶酸还原酶基因(DHFR) -- 黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶基因(XGPRT)
二、利用插入序列提供的表型特征筛选
利用插入的外源基因的表达产物特性进行直 接选择。(只在特定条件下)。 一、原理: 1.弥补缺陷 转化进来的外源基因产物能够弥补受 体菌株的突变型缺陷。 受体菌: his外源基因: his+
在不含组氨酸的 培养基中生长
2. 增加新性状 使被转化的受体菌表现出外源基因的表型。
Autoradiogram
Transfer prຫໍສະໝຸດ teinAutoradiography
Protein band detected by specific antibody
SDS-Polyacrylamide gel
Polymer sheet
Autoradiogram
8.4 免疫化学类检测法
对表达产物的检测。蛋白—蛋白“杂交” 利用抗体作为“探针”来检测转入受体 菌并且表达出相应的蛋白质的外源基因。
限制片段
琼脂糖电泳
DNA分子
Southern Blotting
带有DNA片 段的凝胶
用缓冲液 转移DNA
转移至硝酸纤维素膜上
凝胶 滤膜 与放射性标记 DNA探针杂交
吸附有DNA 片段的膜
放射自显影
Southern blot
-
+
探针
(1)原位杂交筛选 特点: 对应的菌斑或噬菌斑位置不变, 可以直接找出阳性菌落。
重点:
常用的抗菌素抗性筛选、蓝白斑筛选、酶切筛选、酶联免 疫吸附测定(ELISA)
难点:
免疫印迹(Western Blotting)法的原理
转化子:接纳载体或重组分子的转化细胞。 非转化子:未接纳载体或重组分子的转化细胞。 重组子:含有重组DNA分子的转化子。 非重组子:仅含有空载载体分子的转化子。 期望重组子:含有目的基因的重组子。 非期望重组子:不含有目的基因的重组子。
例: 小鼠的二氢叶酸还原酶(DHFR)对三甲氧 苄二氨嘧啶有抗性。
DHFR 转化受 体菌
连接
载体
三甲氧苄二氨嘧 啶培养基平板
含DHFR的克隆才能生长
8.2 DNA电泳检测法
利用有插入片段的重组载体的分子量比 野生型载体分子量大。 一、直接电泳检测法 从转化后的菌体克隆 中分离质粒,电泳、 比较其分子量。
几种报道基因的作用原理
紫外光照 GFP 发绿色荧光 GUS 荧光产物
4-甲-β-D-葡萄糖苷酸
5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-葡萄糖醛酸 GUS
蓝色水解产物
Fireflies emit light catalyzed by luciferase with ATP
转入萤火虫 的luciferase 的烟草
⑤萤火虫荧光素酶基因(LUC)
LUC表达产物萤火虫荧光素酶(LUC)在Mg2+的作
用下,可以与荧光素和ATP底物发生反应,形成与 酶结合的腺苷酸荧光素酰化复合物,经过氧化脱 羧作用后,该复合物转变成为处于激活状态的氧 化荧光素,可以用荧光测定仪快速灵敏地检测出 产生的荧光,是目前研究动植物转基因很好用的 一种报告基因。 Luc基因检测十分迅速,灵敏度高,成本低,不存 在放射性同位素检测对人体健康和环境生态所造 成的危害,也没有内源荧光产生的背景干扰,因 此,Luc是一种理想的报告基因。
32P
重组克隆与探针杂交
或 125I 。
荧光素、生物素 地高辛
二、核酸杂交检测方法 1. Southern blotting
用DNA (或RNA)探针检测DNA样品。 从宿主细胞中提取DNA(或质粒 载体),再用探针杂交。
只有带有插入片断的重组载体才能 与探针杂交,在底片上曝光显示。
限制性酶切割
PstI酶切
外源DNA 黏性末端 连接酶 PstI酶切
pBR322 4363
重组子(ampstetr) 空载体(amprtetr) 插入子(ampstets)
导 入