Gaussian 软件安装方法整理成功版

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《Gaussian培训》课件

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结果分析
对计算结果进行分析,如 能量分解、轨道分析、电 荷分布等。
结果导出
将计算结果导出为其他软 件格式,如Xyz、Pdb等, 以便在其他软件中进行进 一步分析。
03
Gaussian软件进阶使用
高级计算方法
1 2 3
MP2方法
MP2方法是基于Hartree-Fock自洽场方法的二 阶Møller-Plesset微扰理论,适用于计算相对精 确的基态能量和电子相关效应。
反应机理研究案例
总结词
利用Gaussian软件进行反应机理研究,涉及反应路径计算、过渡态寻找和动力学模拟等。
详细描述
反应机理研究对于理解化学反应的本质和过程至关重要。Gaussian软件提供了反应路径计算和过渡态 寻找的方法,可以确定反应的最低能量路径和关键中间体。动力学模拟可以帮助研究反应速率和反应 机制,为实验设计和改进提供理论支持。
计算材料性质
02
材料模拟可以计算材料的电子结构、光学性质、力学性质、热
学性质等。
模拟软件
03
常用的材料模拟软件包括VASP、Quantum ESPRESSO和
CASTEP等。
04
Gaussian软件常件计算中最常见的问题之一,通常表 现为计算无法完成或结果不准确。
1990年代
Gaussian软件不断更新和 完善,逐渐成为广泛使用 的量子化学计算软件。
2000年代至今
Gaussian软件持续发展, 不断推出新版本,支持更 多的理论方法和基组,应 用领域也不断扩大。
02
Gaussian软件基本操作
文件操作
打开文件
使用“File”菜单中的 “Open”选项打开Gaussian 输入文件(.gjf或.gjfx)或输出文

ug安装教程步骤

ug安装教程步骤

ug安装教程步骤安装UG的步骤如下:1. 下载UG软件安装包。

可以从UG官方网站或者其他可信的软件下载网站上下载UG软件的安装包,确保选择与你的操作系统相匹配的版本。

2. 解压安装包。

将下载的安装包解压到一个你想要安装UG软件的文件夹中。

3. 运行安装程序。

找到解压后的文件夹,双击运行安装程序。

4. 选择安装语言。

在安装程序运行后的第一个界面上,选择你希望使用的安装语言。

5. 选择安装类型。

在第二个界面上,你可以选择安装的类型。

通常有"Typical"(典型安装)和"Custom"(自定义安装)两种选项。

如果你不确定应该选择什么类型,建议选择典型安装。

6. 选择安装路径。

在第三个界面上,选择你想要将UG软件安装到的路径。

可以点击"Browse"按钮来选择一个自定义的安装路径。

7. 开始安装。

在确认安装路径后,点击"Next"(下一步)按钮开始安装UG软件。

8. 等待安装完成。

安装程序会开始复制文件并进行其他必要的安装过程。

请耐心等待,直到安装完成。

9. 完成安装。

安装完成后,可能会出现一个确认界面,提示你是否打开UG软件。

如果你想立即使用UG软件,可以勾选相应选项并点击"Finish"(完成)按钮。

10. 激活UG软件。

根据软件提供的激活方式,进行相应的激活操作。

这通常需要输入激活码或者登录你的账户。

以上就是UG软件的安装步骤,希望对你有帮助。

《Gaussian培训》课件

《Gaussian培训》课件

Gaussian软件的发展历程
• Gaussian软件的发展历程可以追溯到上世纪80年代,自1980年代中期以来,Gaussian软件不断推出新的版本,并逐渐实 现了从单一的量子化学计算软件到计算化学综合平台的转变。目前,Gaussian软件已经成为全球使用最广泛的计算化学软 件之一。
Gaussian软件的主要功能和应用领域
06
参考文献
参考文献
Gaussian 09, Revision A.01, Mopac 2012, and associated
tutorials and examples.
Gaussian 09, Revision A.01, Mopac 2012, and associated
tutorials and examples.
依据。
金属表面的结构和性质研究
要点一
总结词
Gaussian软件可用于金属表面结构的研究,预测表面 形貌、电子结构以及化学反应活性等性质。
要点二
详细描述
借助Gaussian软件,科研人员可以模拟金属表面的电 子云分布、能带结构以及化学反应活性等性质,为催 化剂设计、能源存储与转化等应用提供理论支持。
Gaussian培训
2023-11-12
目录
• Gaussian软件概述 • Gaussian计算方法介绍 • Gaussian软件操作流程 • Gaussian软件应用实例 • Gaussian软件的优缺点及未来发展 • 参考文献
01
Gaussian软件概述
Gaussian软件简介
• Gaussian软件是一款广泛应用于计算化学领域的软件,由美国 Gaussian公司开发。它提供了一系列的计算化学工具,包括分 子建模、量子化学计算、分子动力学模拟等,被广泛应用于药 物设计、材料科学、能源研究等领域。

关于GaussianView3

关于GaussianView3

关于GaussianView3.07的学习心得最近几个星期我钻研了一下如何使用GaussianView3.07来做计算,但是在学习过程中我遇到了不少问题。

我从邮箱中将GaussianView3.07下载下来后便开始安装该程序。

一开始,我以为这个软件的安装方法和其他普通软件的安装方法一样简单,可是在点击了几次Next之后,弹出来一个界面需要填写Serial Number,我不知道这里应该填写什么就无法再进行安装了,幸好后来老师在课堂上给我们讲了一下怎么来安装这个软件,我才知道要将记事本中的那个系列号复制到Serial Number中。

解决了这个问题之后后面的安装过程就比较容易进行了,只要一直按照它默认的路径一步步安装就能安装成功。

成功安装好了GaussianView3.07,我兴致勃勃的从程序中点击该程序,出现了这样一个提示框;我以为又出现了什么问题,但我试着点了一下OK键,程序主界面就出现在了我的眼前。

看到老师上课时给我们演示的那个界面出来了,我很开心,心想着只要照着说明书上介绍的使用步骤一步步做应该就能掌握这个软件的一些功能。

于是我开始慢慢琢磨软件中各个选项的用途。

我打算做一个苯酚的分子模型,首先就要找到苯分子的结构。

在主界面的左上角,我发现了一个苯分子的图标,点击该图标之后,原来碳原子的模型就被苯分子取代了。

然后,我按照说明书上教的打开那个小窗口,用鼠标在窗口的空白处点击了一下,小窗口中便出现了该苯环。

做完这一步,我开始思考怎样把酚羟基连接到苯环上去。

我接着阅读老师发给我们的说明书,虽然说明书是全英文的,很多地方都看不太懂,但是说明书上附带的截图给了我很大的帮助。

再加上说明书里面用一些加大加粗的字体提示我们应该选择哪个菜单以及下拉菜单中的哪一项,这就使我们操作起来比较容易了。

我很快在说明书里找到了如何调出元素周期表,只要点击主界面左上角的C6键就会弹出元素周期表,然后选择氧原子,并在周期表的左下角选择第三种构型作为酚羟基的构型就行了。

《Gaussian培训》课件

《Gaussian培训》课件
拓展应用领域
Gaussian软件将继续拓展应用领域,涉及到更多的化学领域和材料科学领域,为科研和应 用提供更广泛的服务。
THANKS
谢谢您的观看
在计算参数设置中,可以指定计 算方法、基组、优化算法等参数 ,以便进行后续计算。
在完成分子结构和计算参数设置 后,可以点击计算按钮执行计算 ,得出结果。
在结果窗口中,可以查看计算得 到的能量、构型、振动频率等结 果,并可以通过图形界面分析结 果。
03
Gaussian软件高级功能
计算多重态
多重态计算是指根据分子的电子组态计算分子 的能量或其他物理性质。
02
Gaussian软件安装及使用
软件安装步骤
准备安装文件
从官方网站下载Gaussian软件的安 装文件。
安装向导
运行安装文件,进入安装向导,选 择安装路径,点击“下一步”。
组件选择
选择需要安装的组件,如Gaussian 主程序、Lynx等,点击“下一步” 。
完成安装
等待安装程序完成安装过程,关闭 向导。
Gaussian软件基于量子力学原理,采用从头算和密度泛函理 论等方法,能够模拟分子的结构和性质,为化学科研工作者 提供重要的理论依据和工具。
软件背景
01
Gaussian软件是由美国Gaussian公司开发的一款商业软件,最初由John Gaussian在20世纪70年代创立。
02
自1970年以来,Gaussian软件已经经历了多个版本的不断更新和发展,成为了 国际上最为流行的计算化学软件之一。
和使用。 • 可定制性强:Gaussian软件支持自定义模块和功能,可根据用户的需求进行定制和扩展。 • 软件缺点 • 学习曲线较陡峭:对于初学者来说,Gaussian软件的学习曲线比较陡峭,需要一定的时间和精力来熟悉和

高斯软件-基础教程

高斯软件-基础教程

GaussView界面教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。

除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。

从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。

开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。

菜单栏▪【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件▪【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等▪【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等▪【Calculate】直接向Gaussian提交计算▪【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果▪【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等▪【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。

【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。

3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。

安装说明

安装说明

一. gauss主程序安装:1.在“gauss安装\GAUSS_7.0_Win_32”目录下安装运行setup.exe 文件注:把gauss 主程序安装在“c:\ gauss7.0”目录下即可。

2.Copy “gauss安装\crack”目录下的三个文件gauss.exe、tgauss.exe、gauss7_tbe.lic 到“c:\ gauss7.0”目录下,覆盖掉原有同名文件。

3.Copy “gauss安装\crack”目录下的文件gauss7_tbe.lic 到“c:\ gauss7.0\ flexlm”目录下。

至此三步,gauss主程序安装完毕,此时可运行gauss.exe ,实现gauss程序的基本功能。

二. datatool (gauss数据处理程序)程序安装:1.在“gauss安装\datatool\GDT_7.0_Win_32”目录下安装运行setup.exe 文件注:把datatool主程序安装在“c:\ gdt7.0”目录下即可。

2.Copy “gauss安装\datatool”目录下的三个文件gdtw.exe、gdt.exe、gauss7_tbe.lic 到“C:\gdt7.0”目录下,覆盖掉原有同名文件。

3.Copy “gauss安装\datatool”目录下的文件gauss7_tbe.lic 到“c:\ gdt7.0\ flexlm”目录下。

至此三步,gauss辅助数据处理程序安装完毕,此时可运行gdtw.exe ,实现gauss程序的数据导入功能。

主要功能:把excel的.xls 文档转成gauss 程序可用的.txt 文档格式。

三.GPE2(gauss配套的极值计算软件包)程序安装:1.在“gauss安装\ ”目录下安装运行GPE2-70.exe 文件注:把GPE目录安装在“c:\ gauss7.0”目录里面即可。

2.Copy “gauss安装\”目录下的两个文件gpe2.gcg、gpe2.fst到“C:\gauss7.0”目录下,覆盖掉原有同名文件。

G98w(Gaussian 98)程序及其应用

G98w(Gaussian 98)程序及其应用

河北师范大学计算量子化学研究所蔡新华教授量子化学在线教学http://202.206.106.100/qc/lzhx-0.htmGaussian 98程序及其应用一、Gaussian 98程序运行环境Gaussian 98程序分为工作站、微机等不同版本,作为教学示例,我们向大家介绍适用于微机运行的程序版本。

1、软件环境Windows 3.1、Wingdows 95、wingdows 98、Wingdows 2000系统。

2、硬件环境适用于486以上微机,对内存、硬盘的要求较高。

比如,内存128M、硬盘10G以上,这样可以计算较大的分子体系或进行较大基组的计算量子化学研究。

网址:3、程序安装程序安装结束后,C:盘的默认子目录为c:\g98w执行程序图标为:g98w二、程序的基本使用方法1、启动程序点击G98W图标2、设置工作环境File-Preference指定执行文件目录、输入、输出数据文件目录3、建立分子数据输入文件File-New以水分子Hartree-Fock STO-3G基组的计算为例说明直接输入分子的直角坐标数据点击开始运行程序点击图标:指出计算结果输出文件名称后,程序开始运行。

4、计算结束后,用编辑器打开输出文件,分析计算结果。

Entering Link 1 = C:\g98w\l1.exe PID= 1072.Copyright (c) 1988,1990,1992,1993,1995,1998 Gaussian, Inc.All Rights Reserved.This is part of the Gaussian(R) 98 program. It is based onthe Gaussian 94(TM) system (copyright 1995 Gaussian, Inc.),the Gaussian 92(TM) system (copyright 1992 Gaussian, Inc.),the Gaussian 90(TM) system (copyright 1990 Gaussian, Inc.),the Gaussian 88(TM) system (copyright 1988 Gaussian, Inc.),the Gaussian 86(TM) system (copyright 1986 Carnegie MellonUniversity), and the Gaussian 82(TM) system (copyright 1983Carnegie Mellon University). Gaussian is a federally registered trademark of Gaussian, Inc.This software contains proprietary and confidential information, including trade secrets, belonging to Gaussian, Inc.This software is provided under written license and may beused, copied, transmitted, or stored only in accord with thatwritten license.The following legend is applicable only to US Governmentcontracts under DFARS:RESTRICTED RIGHTS LEGENDUse, duplication or disclosure by the US Government is subject to restrictions as set forth in subparagraph (c)(1)(ii) of theRights in Technical Data and Computer Software clause at DFARS252.227-7013.Gaussian, Inc.Carnegie Office Park, Building 6, Pittsburgh, PA 15106 USAThe following legend is applicable only to US Governmentcontracts under FAR:RESTRICTED RIGHTS LEGENDUse, reproduction and disclosure by the US Government is subjectto restrictions as set forth in subparagraph (c) of theCommercial Computer Software - Restricted Rights clause at FAR52.227-19.Gaussian, Inc.Carnegie Office Park, Building 6, Pittsburgh, PA 15106 USA---------------------------------------------------------------Warning -- This program may not be used in any manner thatcompetes with the business of Gaussian, Inc. or will provideassistance to any competitor of Gaussian, Inc. The licenseeof this program is prohibited from giving any competitor ofGaussian, Inc. access to this program. By using this program,the user acknowledges that Gaussian, Inc. is engaged in thebusiness of creating and licensing software in the field ofcomputational chemistry and represents and warrants to thelicensee that it is not a competitor of Gaussian, Inc. and thatit will not use this program in any manner prohibited above.---------------------------------------------------------------Cite this work as:Gaussian 98, Revision A.3,M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria,M. A. Robb, J. R. Cheeseman, V. G. Zakrzewski, J. A. Montgomery, Jr., R. E. Stratmann, J. C. Burant, S. Dapprich, J. M. Millam,A. D. Daniels, K. N. Kudin, M. C. Strain, O. Farkas, J. Tomasi,V. Barone, M. Cossi, R. Cammi, B. Mennucci, C. Pomelli, C. Adamo,S. Clifford, J. Ochterski, G. A. Petersson, P. Y. Ayala, Q. Cui,K. Morokuma, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari,J. B. Foresman, J. Cioslowski, J. V. Ortiz, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. Gomperts, R. L. Martin,D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara,C. Gonzalez, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen,M. W. Wong, J. L. Andres, C. Gonzalez, M. Head-Gordon,E. S. Replogle, and J. A. Pople,Gaussian, Inc., Pittsburgh PA, 1998.********************************************Gaussian 98: x86-Win32-G98RevA.3 2-Sep-199801-Jun-2000********************************************----------#HF/STO-3G----------1/38=1/1;2/17=6,18=5/2;3/11=9,25=1,30=1/1,2,3;4//1;5/5=2,32=1,38=4/2;6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;99/5=1,9=1/99;------------WATER ENERGY------------Symbolic Z-matrix:Charge = 0 Multiplicity = 1O -0.46 0.18 0.H -0.46 1.14 0.H 0.44 -0.14 0.------------------------------------------------------------------------ Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES)CD Cent Atom N1 Length/X N2 Alpha/Y N3 Beta/Z J ------------------------------------------------------------------------1 1 O 0 -0.460000 0.180000 0.0000002 2 H 0 -0.460000 1.140000 0.0000003 3 H 0 0.440000 -0.140000 0.000000------------------------------------------------------------------------ Z-Matrix orientation: ---------------------------------------------------------------------Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms)Number Number Type X Y Z---------------------------------------------------------------------1 8 0 -0.460000 0.180000 0.0000002 1 0 -0.460000 1.140000 0.0000003 1 0 0.440000 -0.140000 0.000000---------------------------------------------------------------------Distance matrix (angstroms):1 2 31 O 0.0000002 H 0.960000 0.0000003 H 0.955196 1.564736 0.000000Interatomic angles:H2-O1-H3=109.5731Stoichiometry H2O======================================================================= Framework group CS[SG(H2O)]Deg. of freedom 3Full point group CS NOp 2Largest Abelian subgroup CS NOp 2Largest concise Abelian subgroup C1 NOp 1Standard orientation:---------------------------------------------------------------------Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms)Number Number Type X Y Z---------------------------------------------------------------------1 8 0 0.000000 0.110436 0.0000002 1 0 0.782357 -0.445907 0.0000003 1 0 -0.782357 -0.437577 0.000000---------------------------------------------------------------------Rotational constants (GHZ): 926.0025221 409.6094525 283.9892074Isotopes: O-16,H-1,H-1Standard basis: STO-3G (5D, 7F)There are 6 symmetry adapted basis functions of A' symmetry.There are 1 symmetry adapted basis functions of A" symmetry.Crude estimate of integral set expansion from redundant integrals=1.000.Integral buffers will be 262144 words long.Raffenetti 1 integral format.Two-electron integral symmetry is turned on.7 basis functions 21 primitive gaussians5 alpha electrons 5 beta electronsnuclear repulsion energy 9.1799871566 Hartrees.One-electron integrals computed using PRISM.NBasis= 7 RedAO= T NBF= 6 1NBsUse= 7 1.00D-04 NBFU= 6 1Projected INDO Guess.Initial guess orbital symmetries:Occupied (A') (A') (A') (A') (A")Virtual (A') (A')Warning! Cutoffs for single-point calculations used.Requested convergence on RMS density matrix=1.00D-04 within 64 cycles.Requested convergence on MAX density matrix=1.00D-02.Requested convergence on energy=5.00D-05.Keep R1 integrals in memory in canonical form, NReq= 406338.Convergence on energy, delta-E=4.15D-05SCF Done: E(RHF) = -74.9603312992 A.U. after 4 cyclesConvg = 0.7155D-03 -V/T = 2.0050S**2 = 0.0000**********************************************************************Population analysis using the SCF density.**********************************************************************Orbital Symmetries:Occupied (A') (A') (A') (A') (A")Virtual (A') (A')The electronic state is 1-A'.Alpha occ. eigenvalues -- -20.23442 -1.26198 -0.62554 -0.44059 -0.38721Alpha virt. eigenvalues -- 0.59512 0.75717Condensed to atoms (all electrons):1 2 31 O 7.840531 0.267076 0.2673092 H 0.267076 0.591156 -0.0447433 H 0.267309 -0.044743 0.589028Total atomic charges:11 O -0.3749172 H 0.1865113 H 0.188406Sum of Mulliken charges= 0.00000Atomic charges with hydrogens summed into heavy atoms:11 O 0.0000002 H 0.0000003 H 0.000000Sum of Mulliken charges= 0.00000Electronic spatial extent (au): <R**2>= 17.8206Charge= 0.0000 electronsDipole moment (Debye):X= -0.0081 Y= -1.6911 Z= 0.0000 Tot= 1.6911Quadrupole moment (Debye-Ang):XX= -4.1948 YY= -5.4615 ZZ= -6.0900XY= -0.0077 XZ= 0.0000 YZ= 0.0000Octapole moment (Debye-Ang**2):XXX= -0.0061 YYY= -0.1783 ZZZ= 0.0000 XYY= 0.0045XXY= -0.5878 XXZ= 0.0000 XZZ= -0.0015 YZZ= -0.0071YYZ= 0.0000 XYZ= 0.0000Hexadecapole moment (Debye-Ang**3):XXXX= -6.5371 YYYY= -4.6977 ZZZZ= -3.2271 XXXY= 0.0086XXXZ= 0.0000 YYYX= 0.0075 YYYZ= 0.0000 ZZZX= 0.0000ZZZY= 0.0000 XXYY= -1.6959 XXZZ= -1.8089 YYZZ= -1.3490XXYZ= 0.0000 YYXZ= 0.0000 ZZXY= 0.0044N-N= 9.179987156624D+00 E-N=-1.969725142722D+02 KE= 7.458977663622D+01 Symmetry A' KE= 6.953231418420D+01Symmetry A" KE= 5.0574********D+001|1|UNPC-UNK|SP|RHF|STO-3G|H2O1|PCUSER|01-Jun-2000|0||#HF/STO-3G||WATER ENERGY||0,1|O,0,-0.46,0.18,0.|H,0,-0.46,1.14,0.|H,0,0.44,-0.14,0.||Version=x86-Win32-G98RevA.3|State=1-A'|HF=-74.9603313|RMSD=7.155e-004|Dipole=0.5440589,0.3829736,0.|PG=CS [SG(H2O1)]||@EDUCATION DOESN'T COST... IT PAYS!-- POSTMARK, UNIV. OF MISSISSIPPI, DEC 78Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 28.0 seconds.File lengths (MBytes): RWF= 10 Int= 0 D2E= 0 Chk= 5 Scr= 1 Normal termination of Gaussian 98.5、直接读入由其它程序建立的数据文件。

高斯使用指南.总结

高斯使用指南.总结

2014年下学期城南中学人防应急疏散演练方案为增强中学生人民防空意识和国防观念,进一步加强师生安全教育,提高广大师生应对突发事件的能力,保障战时人民防空和平时应急救灾的组织指挥能力,避免在火灾、地震等突发事件来临时学生惊慌失措、盲目逃生。

由市人防办统一部署,结合10月31日防空警报试鸣,组织我校师生应急疏散演练。

一、指导思想为提高学校师生安全应急能力,增强师生安全防范意识,提高师生自我保护能力,确保师生人身安全,避免安全事故的发生,同时检验学校应急疏散意外事故处置能力,特制定本演练方案。

二、演练目的(一)、使师生进一步掌握在应急突发事件中疏散撤离的基本常识。

(二)、使师生熟悉疏散撤离的路线、方法,通过演练缩短疏散时间。

(三)、检验学校制定的“应急疏散预案”是否科学合理、具备可行性;检验学校在应急突发事件中的指挥、疏散、安保、救护工作是否及时迅速,准确到位。

三、演练时间:2014年10月31日上午10时,开始疏散, 10时20分演练结束。

四、演练集结地点:学校大操场五、组织机构和职责(一)、疏散安全工作领导小组组长:林庆根副组长:兰志雄成员:凌运秀钟竹年程国贵丁红来张志辉杨华辉成波勇张雄勇刘劲松各班班主任(二)、各疏散点指挥责任人:1、大操场:林庆根钟竹年成波勇张雄勇2、教学楼各楼层:各班班主任各下班老师(如教师在他班上课,可就地指挥学生疏散)各班主任和各下班老师应控制班级与班级之间撤离的时间,维持秩序,,防拥挤、防踩踏。

4、楼梯口:各楼梯口负责人需要控制学生通过速度,维持秩序,,防拥挤、防踩踏。

5、总协调:林庆根6、有关机构负责人(1)、指挥员(负责现场指挥并计时):成波勇(指挥)、张雄勇(计时,协助指挥)(2)、与有关部门紧急联系或寻求救援负责人:张志辉(3)、临时救护负责人:刘劲松(4)、人数清点负责人:钟竹年六、疏散方案(一)、疏散具体步骤10时,预先警报信号响起,全体师生紧急疏散到操场等空旷地带;10时8分,空袭警报信号响起,全体师生隐蔽在操场等场所;10时21分,解除警报信号响起,演练结束,全体师生结束隐蔽恢复正常教学秩序。

高斯安装流程

高斯安装流程

Linux系统Gaussian高斯的安装与出错信息以下安装方法在32位或64位的Red Hat Enterprise Linux操作系统测试过,适用的高斯版本为Gaussian 03 C02 for PC-Linux-IA32 以及g03e01-em64t 等。

一.将g03d02.tar.gz解压到 /home/userid/ 下,得到/home/userid/g03文件夹(其中userid为当前用户名)。

解压缩的命令为:tar zxvf g03_c02_lin.taz二.在Linux系统中安装Gaussian031.在/home/userid/g03/下建立scratch文件夹作为保存临时文件的目录。

2.打开bashrc文件。

方法为:打开终端,输入命令为vi /home/userid/.bashrc3.在.bashrc文件末尾加入以下语句并保存:# for Gaussian.03.C02G03ROOT=/home/userid/g03GAUSS_EXEDIR=$G03ROOTGAUSS_SCRDIR=/tmp/userid/g03LD_LIBRARY_PATH=$G03ROOT/:$LD_LIBRARY_PATHPATH=$G03ROOT/:$PATHexport G03ROOT GAUSS_EXEDIR GAUSS_SCRDIR LD_LIBRARY_PATH PATH说明:G03ROOT定义为g03解压缩后的根目录,也就是g03、l502.exe等一大堆可执行程序所在的目录;GAUSS_EXEDIR为gaussian可执行程序的路径,通常和G03ROOT相同;GAUSS_SCRDIR为存放临时文件的目录,所在的硬盘空间应当比较大,一般需要在根目录tmp或scratch下创建自己的子目录,故也可设置为/home/userid/g03/scratch;LD_LIBRARY_PATH定义gaussian运行需要的一些库函数所在的位置,一般同G03ROOT;PATH也是gaussian可执行程序的路径,但功能和GAUSS_EXEDIR变量不同。

Gaussian09的安装

Gaussian09的安装

Gaussian09的安装Gaussian09的安装基本上跟Gaussian03没有区别1.解压2.将解压出来的g09文件夹copy到你想要的地方,比如/usr/local/3.进入/usr/local,更改g09文件夹的权限。

最好是将需要使用g09的用户划分到一个组,然后将g09文件夹的所属用户组改成这个组4.进入g09文件夹,建立一个名为scratch的文件夹,并且将其权限改为777。

(你要建立在别的地方也可以,需要修改相应配置)5.进入/etc,修改bash.bashrc或者bash.bashrc.local什么的(总之就是设置环境变量)。

加入以下几行:#gaussian09export PATH=/usr/local/g09:$PATHexport g09root=/usr/local/g09source $g09root/g09/bsd/g09.profile #我以前配g03的时候没这句也行export GAUSS_EXEDIR=$g09rootexport GAUSS_SCRDIR=$g09root/scratch #取决于你新建目录的位置,如果是/tmp就改成/tmpexport LD_LIBRARY_PATH=$g09root/6.保存退出之后,source该文件之后就OK了可能遇到的问题:1.运行g09后出错,查看log文件,信息如下:Entering Gaussian System, Link 0=g09Input=Output=1.logFiles in the Gaussian directory are world accessible.This must be fixed.原因是g09文件夹权限太高,如果整个改成777就有可能出这个问题。

解决办法是除了scratch目录以外,均用755或者750等。

(所以之前建议用更改用户组的办法来实现权限)2.著名问题:Erroneous write during file extend. write -1 instead of 4096 Probably out of disk space.Write error in NtrExt1: Bad addressSegmentation fault解决办法:sudo echo 0 > /proc/sys/kernel/randomize_va_space最好写进/etc/rc.local文件(ubuntu系统,其他系统写进相应文件),令其开机自动加载该命令,省时省力。

gaussian03教程版本[整理版]

gaussian03教程版本[整理版]

找所得的Excel表格,得到如图18所示界面 酶
。在工具栏中选择Analyze—Regression— linear,如图19,选择相应的自变量和因变量 ,采用Stepwise方法即可得到相关方程,如
鲤 杉
图20和图21。


轿






谢谢!






猎 踌 禄 铲 撂 伯 蠢 鸯 湿 霄 戚
据,见图10. 在Total atomic charges下面,找取
最负电荷,即q-,和氢电荷中最正
冯 陕 损 素 蔽 哟 矾

数据查找


二.查找数据

C. 查找关键词zero, 如图14所示,即为ZPE值。 如图15, Sum of electronic and thermal Enthalpies后为H值,
紧 巢 理 丸 聂 席 缓 雕 蹲 期 殴
继 墩 缄 予 沁 娄 蚤 务 壤 漾 或
戚 酱 腰 戚 炸 咸 托 兄 唐 俏 侧
溶 运 茅 益 捣 堡 恶 匀 嫌 篡 嘿
灭 少 把 烙 顶 春 以 便 荔 诬 梨
税 越 询 羌 篱 瞧 淫 氯 谁 稀 残
些 尸 佩 灶 审 既 厂 粤 扯 长 围
PCPT为例), 如129.cdx.



绘制构型


二.空间坐标


采用chemoffice2004 中的 江
chem3D 程序打开129.cdx文件, 缕
得到化合物分子的立体构型,见 惰
图2 。保存上述文件格式为*.gjc, 远
如129.gjc.

高斯linux使用方法

高斯linux使用方法

高斯linux使用方法高斯Linux使用方法高斯Linux是一款基于Ubuntu系统的操作系统,特别适用于高性能计算领域。

其主要特点是集成了大量的科学计算软件,因此常常被用于科学计算、数值模拟、机器学习等领域。

本文将为读者介绍高斯Linux的基础使用方法。

一、安装高斯Linux高斯Linux的安装并不复杂,只需要从官网上下载镜像文件,然后将其刻录成光盘或者USB启动盘,即可进行安装。

安装过程中,需要进行一些系统配置,例如选择分区、设置用户等。

对于有经验的Linux用户来说,这些步骤都较为简单。

二、登录高斯Linux安装完高斯Linux后,便可使用用户名和密码登录系统。

高斯Linux默认使用命令行界面,用户需要输入命令行来操作系统。

但是,用户也可以选择安装图形界面,使操作更加方便。

可以使用以下命令来安装桌面界面:sudo apt-get install ubuntu-desktop三、基本命令高斯Linux的基本操作和其他Linux系统类似,需要掌握一些基本命令。

1. ls命令:用于列出当前目录下的文件。

2. cd命令:用于切换目录,例如cd /home/user表示切换到用户的主目录。

3. pwd命令:用于显示当前所在的目录路径。

4. cp命令:用于复制文件或者目录,例如cp file1 file2表示将file1复制到file2。

5. mv命令:用于移动文件或者目录,例如mv file1 /home/user表示将file1移动到用户的主目录。

6. rm命令:用于删除文件或者目录,例如rm file1表示删除file1文件。

7. mkdir命令:用于创建目录,例如mkdir mydir表示在当前目录下创建mydir目录。

8. rmdir命令:用于删除空目录,例如rmdir mydir 表示删除mydir目录。

9. tar命令:用于压缩和解压文件,例如tar -czvf mytar.tar.gz mydir表示将mydir目录压缩成mytar.tar.gz文件。

gaussian16程序 运行案例

gaussian16程序 运行案例

gaussian16程序运行案例问题背景和目标:如何使用Gaussian16程序运行案例?Gaussian16是一款广泛用于计算化学领域的软件,在分子模拟、化学计算、反应机理研究等方面都有较高的应用价值。

本文将以中括号内的内容为主题,一步一步回答如何使用Gaussian16程序运行案例。

第一步:安装与配置首先,需要下载并安装Gaussian16程序。

访问Gaussian公司的官方网站,并按照网站上提供的指引进行下载和安装。

安装完成后,打开终端或命令提示符窗口,并确认Gaussian16的路径已经添加到系统的环境变量PATH中。

可以使用以下命令来测试是否配置成功:bashg16如果配置成功,会出现Gaussian16的命令行界面。

第二步:准备输入文件在运行Gaussian16程序之前,需要准备一个输入文件,该文件描述了要进行计算的分子结构和计算设置。

输入文件通常以.gjf为扩展名。

可以使用文本编辑器创建输入文件,并按照Gaussian16的输入文件格式编写内容。

输入文件的格式可以在Gaussian16的官方文档中找到。

以下是一个输入文件的示例:%chk=example.chk#P HF/6-31G(d) OptExample0 1C 0.000000 0.000000 0.000000H 1.089000 0.000000 0.000000H -0.363000 1.027000 0.000000H -0.363000 -0.512000 -0.889000H -0.363000 -0.512000 0.889000以上示例中,第一行指定了计算过程中的中间结果文件,第二行设置了进行优化计算所使用的方法和基组。

其余部分描述了一个分子的结构,其中每一行代表了一个原子的坐标。

第三步:运行计算准备好输入文件后,可以使用以下命令来运行Gaussian16程序进行计算:bashg16 example.gjf以上命令中,example.gjf为你的输入文件名。

1._Gausian_09_Windows_GaussView_5_Windows_安装

1._Gausian_09_Windows_GaussView_5_Windows_安装
读入光盘 • 在本地磁盘建立一个新文件夹,例如:Gaussian 09W。然后 把光盘中相关安装文件拷贝到新建文件夹 (此为推荐安装方 式,但您也可以直接使用光盘安装) 双击Gaussian 09W文件夹里的setup.exe 输入用户名、公司名及序列号(光盘上) 选择安装模块(Program, Help, Tests)
GaussView 5W 安装步骤
读入光盘。 • 在本地磁盘建立一个新文件夹,例如:GaussView 5W。然后 把光盘中相关安装文件拷贝到新建文件夹 (此为推荐安装方 式,但您也可以直接使用光盘安装)。
双击GaussView 5W文件夹里的setup.exe
输入用户名、公司名及序列号(光盘上) 选择安装路径,例如D:\G09W

2014-9-13 11
Gaussian 09W 安装示例
2014-9-13
12
GaussView 5W 安装示例
2014-9-13
13
源资科技概况
源资信息科技(上海)有限公司成立于2008年5月, 目前公司主要经营和研发生命 科学类学术专业软件,并提供从药物发现到药物开发的完整解决方案。
生物信息学
GeneData公司 GeneGo 公司 IDBS公司


药物开发与信息化管理
Labware公司 Oracle公司 IMS公司 自主研发

化学信息学
ACD/Labs公司
ChemAxon公司 PerkinElmer公司
2014-9-13


药物发现与分子模拟
Gaussian 公司 Tripos 公司 MultiCase公司
李宏平 hp-li@
2014-9-13

linux下Gaussian安装与运行

linux下Gaussian安装与运行

一:Linux版高斯03的安装方法安装g03有以下几步:例如我要安装到/home/xiaoyuan下用如下命令解压tar -zxvf filename2、解压得到g03文件夹后,cd进入g03文件然后进入其bsd文件夹,运行./install3、修改你用户路径下的.bashrc文件,比如你的用户名为xiaoyuan,则vi /home/xiaoyuan/.bashrc在最后的test -s ~/.alias && . ~/.alias || true下面添加以下几行:g03root=/home/xiaoyuan/GaussianGAUSS_SCRDIR=/home/xiaoyuan/Gaussian/g03/scratchexport g03root GAUSS_SCRDIR. $g03root/g03/bsd/g03.profile其中第一行为高斯安装目录,第二行为高斯临时文件夹目录。

4、保存修改(按Esc建回到一般模式(左下角插入标志消失),然后打入:wq回车进行保存)退出.bashrc。

然后运行source /home/xiaoyuan/.bashrc 如不提示错误就好了。

注:若要在进去bashrc修改,则按下Esc,然后按A键就可以编辑了.5. 在/home/xiaoyuan/Gaussian/g03/下建立scratch文件夹。

6.可以放个小分子的ch4.gjf文件到scratch里面,然后cd到scratch这个目录,运行命令g03 ch4.gjf& 运行,正常运行说明安装成功二:下面是我用的,你把你的改成相应的路径。

1)建立一个gauss.sh文件如下。

#! /bin/shg03root=/cluster3/gaussianGAUSS_SCRDIR=.export g03root GAUSS_SCRDIR#LD_LIBRARY_PATH=${LD_LIBRARY_PATH}:/cluster3/gaussian/g03if [ -z "${LD_LIBRARY_PATH}" ]thenLD_LIBRARY_PATH="/cluster3/gaussian/g03"; export LD_LIBRARY_PATHelseLD_LIBRARY_PATH="/cluster3/gaussian/g03:${LD_LIBRARY_PATH}"; exportLD_LIBRARY_PATHfisource $g03root/g03/bsd/g03.profil2)然后在~/.bash_profile文件中source 这个文件source gauss.sh三:2 编辑.bashrc文件。

Gaussian中文用户参考手册

Gaussian中文用户参考手册

Æleen FrischMichael J. FrischGary W. TrucksZork 译(spectroscopy@) 2004年5月目录第1章 绪论................................................................................................................................- 7 - 官方Gaussian 03文献的引用............................................................................................- 9 - 推荐的附加引用........................................................................................................- 10 - Gaussian 03的功能...........................................................................................................- 10 - 基本算法....................................................................................................................- 11 -能量............................................................................................................................- 11 -梯度和几何优化........................................................................................................- 12 -频率和二阶导数........................................................................................................- 12 -分子性质....................................................................................................................- 12 -溶解模型....................................................................................................................- 13 - 手册概要............................................................................................................................- 13 - Gaussian 03文档集...........................................................................................................- 14 - 第2章 运行Gaussian............................................................................................................- 15 - 指定scratch文件的操作和位置......................................................................................- 17 - 跨磁盘分割scratch文件.........................................................................................- 18 -保存和删除scratch文件.........................................................................................- 18 -初始化文件................................................................................................................- 18 - 控制内存使用....................................................................................................................- 19 - 在UNIX系统中运行Gaussian........................................................................................- 19 - 脚本与Gaussian......................................................................................................- 20 -用NQS批处理.........................................................................................................- 21 - Gaussian 03的链接...........................................................................................................- 21 - 第3章 Gaussian 03的输入..................................................................................................- 25 - Gaussian 03输入概述.......................................................................................................- 27 - Gaussian 03输入部分分类....................................................................................- 28 - 输入语法............................................................................................................................- 29 - Gaussian 03任务类型............................................................................................- 30 - 模型化学............................................................................................................................- 31 - 基组....................................................................................................................................- 32 - 添加极化和弥散函数................................................................................................- 34 -附加的基组有关关键字............................................................................................- 35 -纯基函数与笛卡尔基函数相比较产生的问题........................................................- 35 - 密度拟合基组....................................................................................................................- 36 - 任务的标题部分................................................................................................................- 36 - 分子说明概述....................................................................................................................- 36 - 指定周期体系............................................................................................................- 38 -指定同位素以及其它核参数....................................................................................- 39 -分子力学的原子类型................................................................................................- 39 -指定空原子................................................................................................................- 40 - 多步任务............................................................................................................................- 40 - Gaussian 03关键字...........................................................................................................- 40 - #.................................................................................................................................- 41 -- 1 -AM1...........................................................................................................................- 44 -Amber........................................................................................................................- 44 -Archive......................................................................................................................- 44 -B3LYP.......................................................................................................................- 45 -BD..............................................................................................................................- 45 -BOMD........................................................................................................................- 46 -CASSCF...................................................................................................................- 50 -CBS-4M,CBS-Lq,CBS-Q,CBS-QB3和CBS-APNO..................................- 56 -CBSExtrapolate.......................................................................................................- 58 -CCD和CCSD..........................................................................................................- 59 -Charge......................................................................................................................- 59 -ChkBasis...................................................................................................................- 60 -CID和CISD.............................................................................................................- 61 -CIS和CIS(D)...........................................................................................................- 62 -CNDO........................................................................................................................- 64 -Complex....................................................................................................................- 64 -Constants..................................................................................................................- 65 -Counterpoise............................................................................................................- 66 -CPHF.........................................................................................................................- 67 -Density......................................................................................................................- 68 -DensityFit..................................................................................................................- 69 -密度泛函(DFT)方法.................................................................................................- 70 -Dreiding.....................................................................................................................- 74 -ExtendedHuckel.......................................................................................................- 74 -External.....................................................................................................................- 74 -ExtraBasis和ExtraDensityBasis..........................................................................- 75 -Field...........................................................................................................................- 76 -FMM..........................................................................................................................- 78 -Force.........................................................................................................................- 78 -Freq...........................................................................................................................- 79 -冻结核选项................................................................................................................- 85 -G1,G2,G2MP2,G3,G3MP2,G3B3和G3MP2B3..................................- 86 -Gen和GenECP......................................................................................................- 88 -Geom.........................................................................................................................- 93 -GFInput.....................................................................................................................- 96 -GFPrint......................................................................................................................- 96 -Guess........................................................................................................................- 97 -GVB.........................................................................................................................- 101 -HF............................................................................................................................- 103 -Huckel.....................................................................................................................- 104 -INDO........................................................................................................................- 104 -Integral....................................................................................................................- 105 -IOp...........................................................................................................................- 108 - - 2 -IRCMax...................................................................................................................- 111 - LSDA.......................................................................................................................- 112 - MaxDisk..................................................................................................................- 112 - MINDO3..................................................................................................................- 113 - 分子力学方法..........................................................................................................- 114 - MNDO.....................................................................................................................- 121 - MP2,MP3,MP4和MP5方法..........................................................................- 121 - Name.......................................................................................................................- 123 - NMR........................................................................................................................- 123 - ONIOM....................................................................................................................- 124 - Opt...........................................................................................................................- 129 - Output......................................................................................................................- 145 - OVGF......................................................................................................................- 145 - PBC.........................................................................................................................- 146 - PM3和PM3MM.....................................................................................................- 147 - Polar........................................................................................................................- 147 - Population...............................................................................................................- 149 - Pressure..................................................................................................................- 151 - Prop.........................................................................................................................- 151 - Pseudo....................................................................................................................- 152 - Punch......................................................................................................................- 157 - QCISD.....................................................................................................................- 158 - ReArchive...............................................................................................................- 158 - SAC-CI....................................................................................................................- 159 - Scale........................................................................................................................- 163 - Scan........................................................................................................................- 163 - SCF..........................................................................................................................- 164 - SCRF.......................................................................................................................- 167 - SP............................................................................................................................- 173 - Sparse.....................................................................................................................- 174 - Stable......................................................................................................................- 174 - Symmetry................................................................................................................- 175 - TD............................................................................................................................- 176 - Temperature...........................................................................................................- 177 - Test..........................................................................................................................- 178 - TestMO....................................................................................................................- 178 - TrackIO....................................................................................................................- 178 - Transformation.......................................................................................................- 178 - UFF..........................................................................................................................- 179 - Units.........................................................................................................................- 179 - Volume....................................................................................................................- 179 - W1U和W1BD.......................................................................................................- 180 - ZINDO.....................................................................................................................- 181 -- 3 -定义非标准的计算执行路径..................................................................................- 183 - 第4章 效率的考虑................................................................................................................- 187 - 估计计算的内存需求......................................................................................................- 189 - 并行计算的内存需求..............................................................................................- 190 - 积分的存储,转换和验算..............................................................................................- 190 - SCF能量和梯度..............................................................................................................- 190 - 积分的存储..............................................................................................................- 191 -直接SCF方法........................................................................................................- 191 -单点直接SCF收敛................................................................................................- 191 -收敛的问题..............................................................................................................- 192 -SCF频率.................................................................................................................- 193 - MP2能量.........................................................................................................................- 193 - MP2梯度.........................................................................................................................- 194 - MP2频率.........................................................................................................................- 195 - 更高级的相关能方法......................................................................................................- 195 - 激发态的能量和梯度......................................................................................................- 195 - 积分的存储..............................................................................................................- 196 -重新开始任务和波函的再使用..............................................................................- 196 -CIS激发态密度......................................................................................................- 196 -开壳层激发态的缺陷..............................................................................................- 197 - 稳定性计算......................................................................................................................- 197 - CASSCF的效率..............................................................................................................- 197 - CASSCF频率........................................................................................................- 197 - 第5章 实用程序....................................................................................................................- 199 - GAUSS_MEMDEF环境变量.........................................................................................- 201 - c8603................................................................................................................................- 201 - chkchk..............................................................................................................................- 202 - cubegen............................................................................................................................- 202 - cubman.............................................................................................................................- 203 - formchk............................................................................................................................- 205 - freqchk.............................................................................................................................- 206 - freqmem...........................................................................................................................- 207 - gauopt...............................................................................................................................- 208 - ghelp.................................................................................................................................- 209 - mm...................................................................................................................................- 210 - newzmat...........................................................................................................................- 210 - testrt..................................................................................................................................- 214 - unfchk..............................................................................................................................- 215 - 第6章 安装与配置Gaussian..............................................................................................- 217 - 系统需求..........................................................................................................................- 219 - 设置Gaussian运行环境.................................................................................................- 219 - scratch文件的考虑事项........................................................................................- 219 - 站内定制:Default.Route文件......................................................................................- 220 -- 4 -Default.Route的限制............................................................................................- 220 -默认内存..................................................................................................................- 220 -处理器数量..............................................................................................................- 221 -站点名称..................................................................................................................- 221 -典型的默认设置......................................................................................................- 221 -用户默认文件..........................................................................................................- 221 - 运行Gaussian测试任务.................................................................................................- 221 - 运行测试文件前,重命名已存在的Default.Route文件....................................- 222 -例子..........................................................................................................................- 222 - 附录A.G03和G98之间变化的总结.................................................................................- 223 - 新方法和新功能..............................................................................................................- 225 - 效率的改进......................................................................................................................- 225 - Gaussian 03和Gaussian 98功能的差别........................................................................- 226 - 在Gaussian 98最后一个版本中引进的修改.....................................................- 226 - 对工具程序的增强..........................................................................................................- 226 - 附录B. 程序的限制...............................................................................................................- 227 - Z-矩阵的限制..................................................................................................................- 229 - 基组的限制......................................................................................................................- 229 - 积分程序的限制..............................................................................................................- 229 - SCF和后SCF-计算的限制............................................................................................- 229 - NBO的大小....................................................................................................................- 230 - 附录C. 构建Z-矩阵..............................................................................................................- 231 - 使用内坐标......................................................................................................................- 233 - 混合内坐标和笛卡尔坐标......................................................................................- 234 -另一种Z-矩阵格式.................................................................................................- 235 -使用虚原子..............................................................................................................- 235 - 几何结构构造模块..........................................................................................................- 237 - 附录D. 补充的关键字...........................................................................................................- 239 - 废弃的关键字..................................................................................................................- 241 - 废弃的工具..............................................................................................................- 242 - 不赞成使用的功能..........................................................................................................- 242 - Cube的说明...........................................................................................................- 244 -Massage的说明....................................................................................................- 247 - 程序开发有关的关键字..................................................................................................- 249 - 参考文献..................................................................................................................................- 251 -- 5 -- 6 -Chapter第1章 绪论这本手册讲述Gaussian 03。

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Gaussian 软件安装方法整理成功版
2011-05-10 15:06:37| 分类:Gaussian | 标签:gaussian install |字号订阅
GAUSSIAN 09
1. Obtain Gaussian 09
Gaussian 09 is a commercial software product and must be purchased from Gaussian, Inc. Both source code and pre-compiled binary versions of Gaussian 09 are available.
2. Setup gaussian group and add authorized users to this group
$ su
# cd /etc
# cp -p group group.bak
# cp -p gshadow gshadow.bak
# grep 499 group
# groupadd -g 499 gaussian
# usermod -a -G gaussian webmo
# usermod -a -G gaussian smith
# usermod -a -G gaussian jones
3. Copy binary distribution from CD-ROM
# mount /mnt/cdrom
# cd /usr/local
# cp -p /mnt/cdom/tar/*.TGZ .
# umount /mnt/cdrom
4. Extract files
# tar xzvf *.TGZ
# chown -R :gaussian g09
# exit
5. setup the envirmental parameters for G09 in /etc/bashrc file
vi /etc/bashrc file
## Gaussian 09 setup
export g09root=/usr/local
export GAUSS_SCRDIR=/usr/local/g09/scratch
export GAUSS_EXEDIR=/usr/local/g09
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/g09
export PATH=/usr/local/g09:$PATH
source $g09root/g09/bsd/g09.profile
6. Setup the properties for some important files:
chmod -R 710 ./g09
chmod -R 777 ./g09/scratch/
chmod -R 755 ./g09/bsd/g09.profile
$ source /etc/bashrc
7. Run a test job from the command line
$ cd ~
$ mkdir g09
$ cd g09
$ cp -p /usr/local/g09/tests/com/
$ cp -p /usr/local/g09/tests/ia64/test001.log test001.log.ia64
$ g09 < > test001.log.linux
$ tail test001.log.ia64
$ tail test001.log.linux
8. 安装完高斯gaussian运行后的错误提示及可能的解决方法
8.1.出现“cannot execute binary file”的错误提示
很有可能安装的高斯版本与当前linux系统的位数不符合,比如64位的高斯装在32位系统上就会出这样的错误提示。

也有可能是安装文件错误或操作系统缺少某些库。

查看当前redhat Linux版本是32位还是64位的命令:
用getconf LONG_BIT,而非getconf WORD_BIT。

32位模型下,一般是ILP32,即int,long,pointer都是32位长;64位模型下,一般是LP64,即long,pointer是64位,而int可能还是32位,也可能是64。

此外,也可以使用命令“uname -a”或“uname -m”,若结果里有i386或者i686则表示当前Linux系统是是32位的,若结果中有x86_64则表示是64位的。

8.2.“Probably out of disk space”错误提示
具体为:
Erroneous write during file extend. write 448 instead of 4096
Probably out of disk space.
Write error in NtrExt1: No such file or director
有可能是GAUSS_SCRDIR部分对应的临时文件夹的权限有问题,用chmod 777 -R foldername 命令可以解决权限为题。

另外,如果是Red Hat 的话,在root权限下输入以下语句或者在/etc/rc.local文件末尾加入:
echo 0 > /proc/sys/kernel/randomize_va_space
8.3.no such file or directory
安装完毕运行g03时出现了“bash:./userid/g03/g03/bsd/g03.profile:no such file or directriy”或者“g03 :commands is not found”的错误提示,有可能是没有正确设置Gaussian的路径。

对照着重新设置,最后再重新source一下bash或csh文件。

另外,我还遭遇过这种情况:无法在/tmp/文件里创建文件,原因是不知什么时候被我把/tmp/userid/这个目录删除了。

这是只要在/tmp/下新建一个具有读写删除权限的名为userid的目录即可解决问题。

注意,这里userid泛指当前登录计算机的用户名。

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