食品科学里的代谢组学分析综述
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
食品科学里的代谢组学分析综述
学号:2011201373 姓名:杨海源
摘要
代谢组学在许多学科已成为重要的分析工具,比如人类疾病学、营养学、药物研发、植物生理学等其他学科。在食品科学学科中代谢组学已成为热门的分析原材料和产品质量、加工处理、安全性评价的方法。这篇文章从代谢物识别、数据预测、信息处理方法讨论了代谢组学的最新进展及代谢组学分析在每个阶段的特殊方法。
引言
代谢组学使一个体系中许多小分子代谢物研究成为可能。在许多研究领域已成为重要的研究工具,最近验证并发现代谢组学在人类疾病研究、药物研发、植物分析、人类营养及其他领域发展迅速、影响广泛。代谢组学分析大体上分为代谢物靶标分析和代谢物非靶标分析。靶标分析针对目标代谢组中某一个特组的组分分析、大多情况下要求识别和量化组中的代谢物。靶标分析在未确定条件下对于混合代谢组中反应评估很重要。靶标代谢组学分析特殊要求样品高纯度和单一选择性提取。相反,非靶标代谢组学分析主要探测代谢分子群组,尽可能获取代谢模式及代谢物指纹,对特殊代谢物无识别和定量分析要求。非靶标分析已被用于生物学的可识别指纹分析,如植物病。基于特殊目标物的分析和数据处理,多数代谢物组学研究也被分为代谢物识别、信息获取、可预测性研究(见图.1)。
图1: 代谢组学一般分类
标记物识别分析主要在于发现样品数量的不同,没有必要创建统计模型或评估可能的路径来说明这些差异。葡萄酒的分类常通过葡萄品种和生产区及发酵代谢技术来区分。通常用多元数据分析技术获得代谢物的识别与最大化的分类,此方法在主成分分析中成为应用最多。主成分分析与其他多元数据分析在其他领域也广泛谈到。相反,信息代谢组学分析主要对目标物的定性、定量分析,或对非靶标代谢物分子获取内在信息。代谢物数据库应用不断发展和更新,如人类代谢物数据库。通过信息代谢组学可以进行对可能的代谢路径分析、新生物活性物的发现、生物标记物的发现、特殊代谢数据库的创建、代谢物的功能研究。一些代谢组学报告提出,基于代谢物轮廓的统计模型大
量被创建,它可用于其它方法很难定量的可预测变量。如对绿茶感官质量的预测代谢数据模型已被开发。这些模式产生通常通过偏最小二乘法实现,本文在数据处理部分将会讨论。
在食品科学中代谢组学被用于食品研究、解决主要问题方面应用很广泛,很具有潜力。如植物健康、甚至物种起源,而且代谢组学被认为是未来一项解决农业和人类营养最有用的工具。
代谢物识别、信息获取、可预测代谢组学近期已被联合应用于食品质量、营养分析、组分分析,并在其他领域应用不断普及。本文从代谢物提取、分离、检测、数据处理及在食品质量、安全性、规范性、微生物、加工处理方面深入讨论代谢组学在食品中的应用前景。
代谢组学分析过程
代谢组学分析过程包括依次为样品准备、代谢物提取、衍生化处理、代谢物分离、检测、数据处理(图.2)。但每步并不是总要做,仅检测和数据处理在所有代谢组学研究报告中是必不可少的。这些步骤的选择取决于研究对象特殊性(非靶标\靶标分析)、样品类型(固体\液体)、所用分离设备(GC \LC)、检测方法(MS\NMR)。表1总结了近期代谢组学研究在食品分析中的应用。
图.2:代谢组学分析示意图
样品准备
如固体样品苹果皮和土豆样品制备是典型的一组需在液氮冷冻或冷冻干燥后保存。在提取时适当的研磨样品。可提高代谢组分的释放。由于样品水分含量不同,冷冻干燥法作为一种浓缩步骤,需尽可能最大限度减少代谢物差异。类似蜂蜜这类浓缩液样品在处理初始阶段需先进行稀释,而大量信息最大化的收集,在浓缩阶段比较合适。对于酒中代谢物和橄榄油中挥发性成分的浓缩分别用冻干法、固相微萃取。
提取
最初提取目的是数量上最大化和目标化合物浓缩。由于这个原因,提取是在代谢组学分析中最关键的一步。非靶标代谢组学分析中所涉及的自然化合物大多是未知的。因此,许多提取溶剂和提取方法应该
测试、对比。许多报告在非靶标样品分析中并未提及最初的萃取溶剂比较。然而,萃取方法在食品分析中的应用大都类似,并经对比分析研究选出最佳方法。如非食品植物代谢组学,例如:甲醇—水—三氯甲烷不同比例溶剂显示要更利于其它溶剂对植物非靶标物的研究。此法在拟南芥亲水性和疏水性化合物的提取中得以应用。因此,甲醇—水—三氯甲烷用于绿茶、土豆及其它食品的可预测研究中。对于非靶标分析中连续提取溶剂的选择可根据所要提取代谢物分析结果来预测。最初在实验中对疏水物提取(典型的有甲醇—水)是通过离心和疏水性提取颗粒(典型的有三氯甲烷)来完成。Capanoglu,Beekwilder, Boyacioglu等人从番茄酱亲水部和疏水部中连续提取出大量的不同化合物。相反,在其他食品分析如土豆、蘑菇中类似情况很少或疏水部无样品识别,并且在其他领域也有类似现象。如植物叶片分析中提出代谢组学识别多为亲水性提取物。疏水提取主要用于非靶标食品分析中,如苹果和西兰花分析中常用甲醇或甲醇/水进行分析,有些代谢物萃取利用重水通过NMR分析也比较常见。Chen, Wortman等人提出对冷冻肉代谢物的提取有更新颖的方法,主要在肉表面解析气体目标物后进一步提取代谢物进行电离和检测。McDougall, Martinussen 等人提出对于靶标分析物的提取最先可依据常识或经验。他们使用水和醋酸混合从果酱中提取多酚物,并用热水对西兰花和芥菜籽中的目标物芥子油甙进行了分析。超声处理通常可同时进行对非靶标物和靶标物的部分提取。此方法提取效果可被最大化、大量代谢物被获得,减少了提取时间及干扰因素。
衍生化处理
在食品代谢组学中,衍生化普遍被用于GC分析前,主要为了增加分析结果的波动性。Gullberg等人对样品肟的衍生化处理,、分为两个过程:醛基转化和酮类转化为肟类化合物,主要是为了减少互变异构化(特别是单糖),其后通过甲硅烷基化以减少挥发性、并减少OH、SH、NH功能团的亲水性。目前几种肟化和甲硅烷基化试剂已曾被测试,根据对衍生化反应间的对比研究发现,有报告提到在对肟化反应和甲基烷基化中吡啶环酸苷和N-甲基-N-三甲基甲醇甲硅基三氟乙酰胺分别是最适合的试剂。
在食品分析中,Beckmann, Enot, Overy等人通过实验已证明这些试剂可提高从土豆及其他产品中代谢物的GC分离。Ma, Wang等人研究发现反应开始后各个代谢物随衍生化次数和温度影响而改变。因此,为获得被测物可靠数据,在实验开始时应先确定最佳的衍生次数和温度。Beckmann等人在食品代谢组学分析中,进行多次甲硅烷基化反应发现在37℃进行90分钟其结果较好。
分析与检测
在代谢组学轮廓(谱)分析中代谢物的分离与检测认为最关键的步骤,特别注意已有的分离技术。如LC中的HPLC的高性能和UPLC 的超高性能模式、气相色谱(GC)、毛细管电泳(CE),也有这些设备联用的检测技术,如Bedair、Sumner、Rochfort、Wishart等人已对MS、NMR、NIR这些仪器的工作原理和联合应用技术在代谢组学中的适用性做过广泛讨论。