第一性原理的计算方法及常用软件介绍.pdf
第一性原理计算软件
第一性原理计算软件
第一性原理计算软件是一种基于物理方程和量子力学原理的计算方法,它可以用于模拟和预测材料的性质和行为。
这种计算方法可以从原子层面上,通过求解薛定谔方程来得到材料的电子结构和能带结构等信息。
第一性原理计算软件使用的核心理论是密度泛函理论(DFT)。
DFT基于一个基本假设,即整个体系的基态性质可以通过电
子密度的泛函来决定。
通过求解波函数的薛定谔方程,可以得到材料的电荷密度分布,进而计算出各种材料性质,如能带结构、原子间力和应力等。
在计算过程中,我们需要指定一组原子的初始位置,并选择相应的计算参数和方法。
通过迭代求解薛定谔方程,我们可以得到材料的基态电子结构,从而进一步计算出材料的性质。
第一性原理计算软件通常包括一系列的计算工具和算法,如VASP、Quantum Espresso、Abinit等。
这些软件提供了一个强
大的计算平台,使得研究人员可以模拟和预测各种材料的性能和行为。
尽管第一性原理计算软件在模拟材料性质方面具有很大的优势,但由于计算量较大,需要高性能计算机的支持。
同时,计算过程中还需要事先对系统进行一定的简化和近似处理,以降低计算复杂度。
总而言之,第一性原理计算软件为研究人员提供了一种强大的
工具,可以帮助他们预测和理解材料的性质和行为。
通过使用这些软件,我们可以做到对材料进行精确计算和设计,从而为材料科学和工程领域的发展做出贡献。
第一性原理计算在新材料研究中的应用
贵金属纳米粒子团簇结构预测
贵金属团簇结构的理论研究
在各种团簇体系中,金团簇体系是目前研究得非常热门的 领域之一。 金原子由于其相对原子质量较大,内层轨道电子的速度可 以与光速相比拟,其4f、5d轨道电子又接近全充满,相对 论效应显著,使其具备很多特殊性质。 大体系金团簇结构以高对称性的富勒烯结构或管状中空笼 结构最为稳定。
VASP
优点
1. 图形界面,操作 方便 2. 建模和结果分析 容易
缺点
1. 在Windows下执 行速度较慢。 2. 可选的计算方法 较少,结果不够 精确
1. 命令行操作,且 Linux系统入门 较难。 2. 建模和结果分析 依赖其他软件。
Castep
Vasp
1. 代码稳定,执行 速度快 2. 可以使用更高级 的计算方法,使 结果更精确
Pd基Heusler合金Pd2CrGa晶体结构预测
态密度
从图中可以看出,Pd2CrGa在两种状态下均表现处很强的自旋极化,而且 在费米面附近尤为明显Cr. 原子的态密度差异是Pd2CrGa总态密度差异的 主要来源,而Pd原子、Ga原子的自旋向上和自旋向下态密度的对称性较 高,对总磁矩的贡献有限. 所以,Cr原子是Pd2CrGa磁性的主要贡献者
离子键团簇 共价键团簇 金属键团簇 (NaCl)n 、(MgO)n 静电作用 Cn 、Sin 、Gen Agn、 Nan 、Cun 共价键结合 电子结合 2-4eV 1-4eV 0.5-3eV
贵金属纳米粒子团簇结构预测
贵金属团簇
由金属Au、Ag、Cu、Pt形成的金属键团簇称为贵金属团簇 近年来,贵金属团簇和纳米颗粒由于其独特的光学、电子 学和催化性能而在生物学、医学、光学、催化和纳米电子 学等领域引起了广泛的兴趣。
第一性原理计算原理和方法
第一性原理计算原理和方法(总40页)-CAL-FENGHAI.-(YICAI)-Company One1-CAL-本页仅作为文档封面,使用请直接删除第二章 计算方法及其基本原理介绍化学反应的本质是旧键的断裂和新建的形成,参与成键原子的电子壳层重新组合是导致生成稳定多原子化学键的明显特征。
因此阐述化学键的理论应当描写电子壳层的相互作用与重排,借助求解满足适当的Schrodinger 方程的波函数描写分子中电子分布的量子力学,为解决这一问题提供了一般的方法,然而,对于一些实际的体系,不引入一些近似,就不可能求解其Schrodinger 方程。
这些近似使一般量子力学方程简化为现代电子计算机可以求解的方程。
这些近似和关于分子波函数的方程形成计算量子化学的数学基础。
2.1 SCF-MO 方法的基本原理分子轨道的自洽场计算方法(SCF-MO)是各种计算方法的理论基础和核心部分,因此在介绍本文计算工作所用方法之前,有必要对其关键的部分作一简要阐述。
2.1.1 Schrodinger 方程及一些基本近似 为了后面介绍各种具体在自洽场分子轨道(SCF MO)方法方便,这里将主要阐明用于本文量子化学计算的一些重要的基本近似,给出SCF MO 方法的一些基本方程,并对这些方程作简略说明,因为在大量的文献和教材中对这些方程已有系统的推导和阐述[1-5]。
确定任何一个分子的可能稳定状态的电子结构和性质,在非相对论近似下,须求解定态Schrodinger 方程 ''12121212122ψψT p B A q p A p pA A pq AB B A p A A A E R Z r R Z Z M =⎥⎥⎦⎤⎢⎢⎣⎡-++∇-∇-∑∑∑∑∑∑≠≠ (2.1)其中分子波函数依赖于电子和原子核的坐标,Hamilton 算符包含了电子p 的动能和电子p 与q 的静电排斥算符,图2-1分子体系的坐标∑∑≠+∇-=p q p pq p e r H 12121ˆ2 (2.2) 以及原子核的动能∑∇-=A A AN M H 2121ˆ (2.3) 和电子与核的相互作用及核排斥能 ∑∑≠+-=p A B A AB B A pAA eN R Z Z r Z H ,21ˆ (2.4) 式中Z A 和M A 是原子核A 的电荷和质量,r pq =|r p -r q |,r pA =|r p -R A |和R AB =|R A -R B |分别是电子p 和q 、核A 和电子p 及核A 和B 间的距离(均以原子单位表示之)。
第一性原理
第二章 第一性原理计算方法与软件介绍19世纪末,科学家们发现经典力学和经典电动力学在描述物质的微观系统时存在明显不足,对实验中的许多现象不能做出真正合理的解释。
鉴于此,20世纪初物理学家们在旧量子论的基础上建立了量子力学,主要研究原子、分子、凝聚态物质等内部微观粒子的结构、运动规律等性质,目前已广泛应用于物理、化学、材料等学科领域。
随着量子力学理论的不断完善,并结合日趋成熟的计算机技术,量子计算模拟成为了现代科学中必不可少的研究手段之一。
第一性原理计算(First -principles calculation),亦称为从头算(Ab -initio calculation)。
该计算方法可根据量子力学基本原理,基于密度泛函理论对材料微观体系的状态和性质进行理论上的预测,且计算过程中不需要使用任何经验参数,只需要一些基本物理量(电子电荷质量e 、电子静止质量m 0、光速c 、普朗克常数h 、波尔兹曼常数k B )。
本工作所选用的计算程序为Materials Studio 软件中的CASTEP 量子力学模块,该模块是基于密度泛函理论的从头算量子力学程序。
本章节将简要的介绍密度泛函理论和CASTEP 计算模块。
2.1密度泛函理论概述第一性原理主要的研究对象是多原子体系。
它依据量子力学原理,且在无任何实验参数引入的情况下,将多原子体系当作由自由电子和原子核组成的多粒子体系进行处理。
然而,关于量子力学中多粒子体系处理的出发点则为著名的薛定谔方程(Schrödinger Equation)。
Schrödinger 方程是量子力学的一个基本方程,也是第一性原理计算方法的核心,它是由奥地利物理学家薛定谔(Schrödinger)于1926年提出的。
该方程可用于描述微观粒子的运动规律,故亦被称为薛定谔波动方程(Schrödinger Wave Equation),其定态方程描述如下:22[()]()(,)2V r r,t i r t t ψψμ∂-∇+=∂(2-1) 式中ħ为约化普朗克(Plank)常数;μ和V(r)分别表示粒子质量和势场;r 和t 则为体系中所有电子与原子核的位置坐标;Ψ(r,t)是系统波函数,即运动的微观粒子在V(r)势场下的波函数。
第一性原理的计算方法及常用软件介绍
第二章研究方法与程序介绍§2.1 全电子法和赝势法应用于铁电体的第一性原理计算方法和工具很多,根据对势函数及内层电子的处理方法不同主要分为两大类,一种是波函数中包含了高能态和内层电子,而势函数只是原子核的贡献,这称为全电子(all electron calculation)法,另一种处理方法是势函数为原子核和内层电子联合产生的势,称为离子赝势,波函数只是高能态电子的函数,这称为赝势(pseudo-potential)法。
因为内层电子对价电子的排斥作用部分地抵消了原子核对价电子的强吸引作用,所以赝势是一种比较弱和比较平坦的势。
引入赝势的要点在于,赝势对应的薛定谔方程与真实势对应的薛定谔方程有相同的能量本征值。
在这一前提下,引入赝势的方法不是唯一的。
在第一性原理计算中,用的是所谓模守恒赝势法。
这种赝势所对应的波函数有一个特点,在离开原子核一定距离的空间,它与真实势对应的波函数不但形式相同,而且幅度相等,故称模守恒。
这种方法从原子势算起,不引入任何实验参数,所以又称为从头算起(ab initio)赝势方法。
一般来说,赝势法计算量较小,但其中消去了内层电子态,相对于全电子法多引入了一个近似。
该方法的优点是较便于计算离子受到的作用力,后者等于总能量对原胞内离子位矢导数的负数,称为Hellmann-Feynman力。
赝势法用平面波展开来表示价电子态,如果晶体中的原子有2p未满壳层(如氧)或3d未满壳层(如钛),则赝势将很“硬”,为满足模守恒,需要为数很多的平面波基函数,计算量太大。
为此发展了超软赝势(ultro-soft pseudo-potential)法。
对波函数引入一个重叠算符,使赝势变软,减少了平面波基函数。
在铁电体研究中用的赝势法通常是这种方法。
全电子法表示电子态时将空间分为两部分:一是原子核附近的球形区,称为丸盒(muffin-tin)区,二是原子核间的其它区域。
在球形区,基函数、电荷密度16和势均用径向函数展开,在其它区域,这些量用平面波或球面波展开。
第一性原理计算流程与原理公式
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第六讲第一原理计算方法简介及Materials Studio中Castep使用
高分子与介观模拟 MS.Synthia MS.Blends MS.DPD MS.MesoDyn MS.MesoPro
Visualizer:图形化建模模块 可构建计算的模型:晶胞,分子,晶体表面, 纳米结构,聚合物等
TiO2(111)
锐钛矿TiO2
Pt(110)-CO(2x1)
碳纳米管
TiO2纳米棒
密度泛函理论
Hohenberg-Kohn第一定理指出体系的基态能量仅仅是电子密度 的泛函。 Hohenberg-Kohn第二定理证明了以基态密度为变量,将体系能 量最小化之后就得到了基态能量。 根据以上两定理,将薛定谔方程转变为Kohn-Sham 方程
密度函数
电子与原子核间的库仑势
电子间的库仑势
交换关联势 (未知)
√
√
√ √
√
√ √
√
Reflex-Powder Indexing Reflex-Powder Refinement Reflex Plus
√
√ √
√
√ √
√
√
Discover
DMol3 DPD
√
√
√
√ √
√
√ √
√ Reflex QPA
√ Sorption √ Synthia
√
√ √
√
√
Equilibria
分子力学与分子动力学 MS.DISCOVER PASS MS.Amorphous Cell MS.Forcite MS.Forcite Plus MS.GULP MS.Equilibria MS.Sorption
量子力学 MS.Dmol3 MS.CASTEP MS.NMR CASTEP MS.VAMP 定量结构-性质关系 MS.QSAR MS.QSAR Plus MS.Dmol3 Descriptor
【免费下载】第三节第一性原理计算简介
对应。
直接的结果是导致任意可观察量的算符d的基态期望值与基态的电子密度存在唯一泛函:第二定理:对于为哈密顿量片的情况,基态总能的泛函M的形式如下:[p]=〈叫f + v\力+〈叫q平〉(1.67)其中Hohenberg-Kohn密度泛函[p]对任何多电子体系都适用。
Ey…[p\在厂`所对应的基态密度下达到最小值(等于基态的总能)。
以上定理思想的三个关键词为可逆性(一一对应,p<r^V找丨)、普适性和变分方法(最小值)。
下面对三个关键词进行阐述:第一,基态密度与外源的势一一对应。
很显然,对于一个给定的多电子体系存在一个对应的外源势,通过哈密顿量(1.65)和薛定愕方程得到一个唯一的基态多粒子波函数。
从该波函数出发,容易求得相应的电子密度。
因此,任一外源势都可以通过明确的方法得到一个唯一的与之对应的基态密度。
并且,基态密度中包含信息同波函数一样多,包括所有可能知道的关于原子、分子和固体的信息。
所有可观测量都能用唯一的方式从密度中得到,也就是说,均为密度的泛函。
第二,尸“^厂]的普适性。
等式(1.68)可以容易地通过密度算符写出,正印证了在得到基态密度后,外源势对总能的贡献可以精确地计算得到。
Hohenberg-Kohn泛函的表达式不能确切给出,但是,由于不含任何原子以及其位置的信息,所以对任一多电子体系均适用。
这意味着,原则上,尸的表达式适用于所有原子,分子或固体体系。
第三,第二定理使得可以通过变分法求得体系的基态密度。
能使得五`[p]最小的密度正是对应外源势厂⑶(F)的基态密度。
1.3.2.2 Kohn-Sham 方程发表于1965年的Kohn-Sham方程[8]将密度泛函理论变为了实际可操作的工具,求解基态密度成为了实际可用方法。
首先,需要重写Hohenberg-Kohn泛函。
定义关联能(correlation energy)为存在于精确解中,但不存在于Hartree-Fock解中的总能的一部分。
第一性原理计算软件
第一性原理计算软件
第一性原理计算软件是一类通过基本的物理和数学原理进行材料模拟和计算的工具。
它们利用原子尺度的基本原理,如量子力学、统计力学和热力学,以及分子动力学、密度泛函理论等方法来模拟和计算材料的性质和行为。
这些计算软件可以预测材料的电子结构、力学性质、热力学性质以及与其他物质之间的相互作用等信息。
这些计算结果对于材料设计、催化剂开发、电子器件优化等领域都具有重要的应用意义。
第一性原理计算软件的基本原理是通过求解薛定谔方程来描述材料的电子结构。
由于薛定谔方程的求解过程非常复杂,需要进行大量的计算和近似。
常见的第一性原理计算软件包括VASP、Quantum ESPRESSO、Gaussian等。
这些软件通常采用平面波基组和赝势方法进行计算。
平面波基组是一种常用的基组,它可以将波函数展开为平面波的线性组合。
赝势方法则是用一个有效的势能来代替真实的库仑势能,从而简化计算过程。
除了以上的方法,一些第一性原理计算软件还使用了模型哈密顿量、分子动力学等技术来模拟和计算材料的性质。
这些软件通常具有较高的计算效率和准确性,但对于计算资源的要求也较高。
总之,第一性原理计算软件是一种强大而广泛应用的工具,它
可以帮助科学家和工程师更好地理解材料的性质和行为,进而指导材料设计和优化。
第一性原理计算方法讲义
第⼀性原理计算⽅法讲义第⼀性原理计算⽅法引⾔前⾯讲述的有限元和有限差分等数值计算⽅法中,求解的过程中需要知道⼀些物理参量,如温度场⽅程中的热传导系数和浓度场⽅程中的扩散系数等,这些参量随着材料的不同⽽改变,需要通过实验或经验来确定,所以这些⽅法也叫做经验或者半经验⽅法。
⽽第⼀性原理计算⽅法只需要知道⼏个基本的物理参量如电⼦质量、电⼦的电量、原⼦的质量、原⼦的核电荷数、布朗克常数、波尔半径等,⽽不需要知道那些经验或半经验的参数。
第⼀性原理计算⽅法的理论基础是量⼦⼒学,即对体系薛定额⽅程的求解。
量⼦⼒学是反映微观粒⼦运动规律的理论。
量⼦⼒学的出现,使得⼈们对于物质微观结构的认识⽇益深⼊。
原则上,量⼦⼒学完全可以解释原⼦之间是如何相互作⽤从⽽构成固体的。
量⼦⼒学在物理、化学、材料、⽣物以及许多现代技术中得到了⼴泛的应⽤。
以量⼦⼒学为基础⽽发展起来的固体物理学,使⼈们搞清了“为什么物质有半导体、导体、绝缘体的区别”等⼀系列基本问题,引发了通讯技术和计算机技术的重⼤变⾰。
⽬前,结合⾼速发展的计算机技术建⽴起来的计算材料科学已经在材料设计、物性研究⽅⾯发挥着越来越重要的作⽤。
但是固体是具有~1023数量级粒⼦的多粒⼦系统,具体应⽤量⼦理论时会导致物理⽅程过于复杂以⾄于⽆法求解,所以将量⼦理论应⽤于固体系统必须采⽤⼀些近似和简化。
绝热近似(Born-Oppenheimei 近似)将电⼦的运动和原⼦核的运动分开,从⽽将多粒⼦系统简化为多电⼦系统。
Hartree-Fock 近似将多电⼦问题简化为仅与以单电⼦波函数(分⼦轨道)为基本变量的单粒⼦问题。
但是其中波函数的⾏列式表⽰使得求解需要⾮常⼤的计算量;对于研究分⼦体系,他可以作为⼀个很好的出发点,但是不适于研究固态体系。
1964年,Hohenberg 和Kohn 提出了严格的密度泛函理论(Density Functional Theory, DFT )。
它建⽴在⾮均匀电⼦⽓理论基础之上,以粒⼦数密度()r r 作为基本变量。
第一性原理计算
第一性原理计算
第一性原理计算是一种基于物理和数学原理的计算方法,用于研究物质的性质和行为。
它从基本的原子和分子相互作用出发,通过数值方法和近似算法来解决量子力学方程,从而得到材料的结构、能带结构、电子态密度等重要性质。
第一性原理计算的核心是量子力学的薛定谔方程。
这个方程描述了电子在势能场中的行为。
为了求解这个方程,需要考虑电子的波函数和势能场的相互作用。
然而,由于电子-电子相互
作用的复杂性以及多体问题的困难性,精确求解薛定谔方程是不可行的。
因此,第一性原理计算使用了一系列近似方法和数值技术,以在合理的计算复杂度下得到准确的结果。
第一性原理计算的基本步骤是将问题转化为一个离散化的体系。
首先,使用数值方法将空间划分为有限的格点,将连续的波函数表示为在这些格点上的数值。
然后,通过求解离散化的薛定谔方程,可以得到系统的电子和原子核的波函数。
接下来,利用这些波函数可以计算出材料的各种性质,如能带结构、电荷密度和振动谱等。
第一性原理计算在材料科学、物理化学和固体物理等领域有着广泛的应用。
它可以用于预测和设计新材料的性质,优化材料的性能以及研究材料的动力学行为。
通过结合实验数据和第一性原理计算的结果,科学家们可以更好地理解材料的行为,并为材料的应用提供指导和支持。
材料科学中的第一性原理计算
材料科学中的第一性原理计算AB-INITIO SIMULATIONS IN MATERIALS SCIENCEContact author: liuxl15@目录材料科学中的第一性原理计算 (i)目录..................................................................................................................................................................................................... i i 第一节计算材料科学简介 .. (1)第二节DFT简介 (8)第三节赝势(一) (16)第四节赝势(二) (22)第五节抽样布里渊区 (33)第六节离子弛豫方法 (41)第七节电子弛豫方法 (48)第八节VASP计算平台 (56)第十节精确度和结果验证 (60)第十一节PAW和US-PP数据库 (68)第十二节深入密度泛函理论——交换关联项 (75)第十三节未配对电子——磁性 (83)实践教程(I) (91)实践教程(II) (100)实践教程(III) (106)I实践教程(IV) (113)第一节 计算材料科学简介综述⚫ 材料科学中计算机模拟的分类 ⚫ 波恩-奥本海默近似解耦离子和电子赫尔曼-费恩曼(Hellmann-Feynman)定理⚫ 第一性原理电子结构方法哈特利-弗克(Hartree-Fock)和post-HF 近似 密度泛函理论(DFT) 局域密度近似(LDA)⚫ DFT 方法 - 综述密度唯一近似:托马斯-费米(Thomas-Fermi)理论按照轨道的密度参量化:孔恩-沈吕九(Kohn-Sham)理论 基组的选择:平面波和局域轨道,赝势和全电子方法解孔恩-沈吕九方程:总能量最小化:Car-Parrinello 动力学,迭代对角化材料模型的分类⚫ 第一性原理方法HF 和post-HF 方法 – 量子化学 密度泛函方法 – 材料科学⚫ 紧束缚方法 ⚫ 力场模拟分子动力学,蒙特卡罗波恩-奥本海默近似耦合的电子-离子系统的哈密顿函数:N 个离子,坐标R 1⃗⃗⃗⃗ ,…,R N ⃗⃗⃗⃗⃗ ≡R ⃗ ,动量P 1⃗⃗⃗ ,…,P N ⃗⃗⃗⃗ ≡P ⃗ ,电荷Z 1,…,Z N ,质量M 1,…,M N N e 个电子,坐标r 1⃗⃗⃗ ,…,r N ⃗⃗⃗⃗ ≡r ,p 1⃗⃗⃗⃗ ,…,p N ⃗⃗⃗⃗≡p ,质量m H =∑P →I22M I NI=1+∑P →i22m N ei=1+∑e 2|r i −r j|i>j +∑Z I Z J e 2|R ⃗ I −R ⃗ J |I>J −∑Z I e 2|R ⃗ I −r i |i,I=T N +T e +V ee (r)+V NN (R ⃗ )+V Ne (r ,R ⃗ ) (1)薛定谔方程[T N +T e +V ee (r)+V NN (R ⃗ )+V Ne (r ,R ⃗ )]Φ(x,R ⃗ )=EΦ(x,R ⃗ ) (2)其中x ≡(r ,s)为电子位置和自旋变量的全集。
第一性原理计算方法
第一性原理计算方法第一性原理计算方法是一种基于量子力学原理的计算方法,它可以用来研究原子、分子和固体的结构、性质和反应。
与传统的半经验或半经典方法不同,第一性原理计算方法不依赖于任何实验数据或经验参数,而是通过解决薛定谔方程来描述系统的基态性质。
因此,它被认为是最准确的计算方法之一,可以提供高精度的结果。
第一性原理计算方法的基本思想是将系统的哈密顿量表示为电子和原子核的运动方程,通过求解这些方程得到系统的基态能量、电子密度和波函数等性质。
在实际计算中,常用的方法包括密度泛函理论(DFT)、Hartree-Fock方法和多体微扰论等。
这些方法在处理不同类型的系统和问题时具有各自的优势和局限性,需要根据具体情况选择合适的方法。
在第一性原理计算方法中,电子的运动状态由波函数描述,而波函数又可以通过求解薛定谔方程得到。
由于薛定谔方程是一个多体耦合的偏微分方程,因此在实际计算中往往需要进行近似处理。
常用的近似方法包括平面波基组方法、赝势方法和格林函数方法等。
这些方法在描述电子结构和相互作用时具有不同的适用范围和精度,需要根据具体情况进行选择和优化。
除了电子结构的计算,第一性原理方法还可以用来研究原子、分子和固体的动力学性质,如振动频率、光谱特性和反应动力学等。
通过计算这些性质,可以为实验研究提供重要的理论指导,同时也可以揭示系统的微观机制和规律。
总的来说,第一性原理计算方法是一种强大的工具,它可以为我们提供关于原子、分子和固体的详细信息,帮助我们理解和预测物质的性质和行为。
随着计算机硬件和算法的不断进步,第一性原理计算方法将在材料科学、化学和生物科学等领域发挥越来越重要的作用,为人类社会的发展和进步提供有力支持。
第一性原理的计算方法及常用软件介绍
第二章研究方法与程序介绍§2.1 全电子法和赝势法应用于铁电体的第一性原理计算方法和工具很多,根据对势函数及内层电子的处理方法不同主要分为两大类,一种是波函数中包含了高能态和内层电子,而势函数只是原子核的贡献,这称为全电子(all electron calculation)法,另一种处理方法是势函数为原子核和内层电子联合产生的势,称为离子赝势,波函数只是高能态电子的函数,这称为赝势(pseudo-potential)法。
因为内层电子对价电子的排斥作用部分地抵消了原子核对价电子的强吸引作用,所以赝势是一种比较弱和比较平坦的势。
引入赝势的要点在于,赝势对应的薛定谔方程与真实势对应的薛定谔方程有相同的能量本征值。
在这一前提下,引入赝势的方法不是唯一的。
在第一性原理计算中,用的是所谓模守恒赝势法。
这种赝势所对应的波函数有一个特点,在离开原子核一定距离的空间,它与真实势对应的波函数不但形式相同,而且幅度相等,故称模守恒。
这种方法从原子势算起,不引入任何实验参数,所以又称为从头算起(ab initio)赝势方法。
一般来说,赝势法计算量较小,但其中消去了内层电子态,相对于全电子法多引入了一个近似。
该方法的优点是较便于计算离子受到的作用力,后者等于总能量对原胞内离子位矢导数的负数,称为Hellmann-Feynman力。
赝势法用平面波展开来表示价电子态,如果晶体中的原子有2p未满壳层(如氧)或3d未满壳层(如钛),则赝势将很“硬”,为满足模守恒,需要为数很多的平面波基函数,计算量太大。
为此发展了超软赝势(ultro-soft pseudo-potential)法。
对波函数引入一个重叠算符,使赝势变软,减少了平面波基函数。
在铁电体研究中用的赝势法通常是这种方法。
全电子法表示电子态时将空间分为两部分:一是原子核附近的球形区,称为丸盒(muffin-tin)区,二是原子核间的其它区域。
在球形区,基函数、电荷密度16和势均用径向函数展开,在其它区域,这些量用平面波或球面波展开。
VASP基于第一性原理分子动力学计算的软件包简介
VASP基于第一性原理分子动力学计算的软件包简介VASP是使用赝势和平面波基组,进行第一性原理分子动力学计算的软件包。
VASP中的方法基于有限温度下的局域密度近似(用自由能作为变量)以及对每一MD步骤用有效矩阵对角方案和有效Pulay混合求解瞬时电子基态。
这些技术可以避免原始的Car-Parrinello方法存在的一切问题,而后者是基于电子、离子运动方程同时积分的方法。
离子和电子的相互作用超缓Vanderbilt 赝势(US-PP)或投影扩充波(PAW)方法描述。
两种技术都可以相当程度地减少过渡金属或第一行元素的每个原子所必需的平面波数量.力与张量可以用VASP很容易地计算,用于把原子衰减到其瞬时基态中.主要功能Ⅰ从理论角度分析:(1). 采用周期性边界条件(或超原胞模型)处理原子、分子、团簇、纳米线(或管)、薄膜、晶体、准晶和无定性材料,以及表面体系和固体;(2). 计算材料的结构参数(键长,键角,晶格常数,原子位置等)和构型;(3)。
计算材料的状态方程和力学性质(体弹性模量和弹性常数);(4). 计算材料的电子结构(能级、电荷密度分布、能带、电子态密度和ELF);(5). 计算材料的光学性质;(6)。
计算材料的磁学性质;(7)。
计算材料的晶格动力学性质(声子谱等);(8). 表面体系的模拟(重构、表面态和STM模拟);(9). 从头分子动力学模拟;(10)。
计算材料的激发态(GW准粒子修正)等等。
Ⅱ从应用角度分析:VASP原子和分子的基态性质计算、晶体结构参数的优化、晶体的电子结构计算、晶体的磁学性质计算、分子动力学模拟。
特别是研究材料的磁学性能、固体表面性质方面有独到的功能。
应用举例:例1,高压下氢吸附在Mg中,可能形成的不同结构的状态方程.本工作发表在 Phys。
Rev. Lett。
, 89 (17), 2002. 杂志上。
Calculated unit-cell volume vs total-energy relations for MgH2 in actual and possible structural arrangements as obtained from VASP.例2,经过研究发现新的吸附方式本工作发表在Phys。
第一性原理计算软件
第一性原理计算软件第一性原理计算软件是一种基于量子力学原理的计算工具,它可以用来模拟和预测原子和分子的结构、性质和相互作用。
这种计算方法不依赖于实验数据,而是通过求解薛定谔方程来描述原子核和电子的运动,从而得到准确的物理和化学性质。
在材料科学、生物化学、纳米技术等领域,第一性原理计算软件已经成为不可或缺的工具。
第一性原理计算软件的核心是密度泛函理论(DFT),它是一种基于电子密度的量子力学理论。
DFT可以用来计算原子核和电子的相互作用能,从而得到原子和分子的结构和性质。
与传统的半经验方法相比,DFT能够提供更准确和可靠的计算结果,因此被广泛应用于材料设计、催化剂设计、药物设计等领域。
目前,市面上有许多第一性原理计算软件可供选择,例如VASP、Gaussian、Quantum ESPRESSO等。
这些软件都具有各自的特点和优势,用户可以根据自己的需求和研究方向选择合适的软件进行计算。
在选择软件之前,用户需要考虑计算精度、计算速度、易用性等因素,并且需要了解软件的使用方法和操作流程。
在使用第一性原理计算软件进行计算时,用户需要准备原子坐标、晶格参数、赝势等输入文件,并且需要对计算参数进行合理设置。
一般来说,用户需要对计算结果进行收敛性测试,以确保得到的结果是可靠和准确的。
在计算过程中,用户还需要对计算结果进行分析和解释,从而得到有意义的科学结论。
总的来说,第一性原理计算软件是一种强大的工具,它可以帮助科学家和工程师理解和预测原子和分子的性质,从而推动材料科学、生物化学、纳米技术等领域的发展。
随着计算机技术的不断进步,第一性原理计算软件将会变得更加强大和智能,为人类创造出更多的科学奇迹。
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原子壳层理论是单电子模型最简单的例子,它常当作是原子结构的严格描 述。假设单电子所在的有效场是球对称的V (rv) = V (r) (即为辏(音 còu)力场),则
严格的量子力学计算表明,原子中电子的定态相当于单电子能级组
1s,2s,2p,3s...,每一个能级相应于适当的单电子波函数或称为原子轨道(AO)。 单电子能级对磁量子数是简并的(这是辏力场的性质),但对轨道量子数却是非 简并的(因为这里的有效场不是库仑场)。在壳层模型中,多电子原子的状态由 该原子的电子组态所描述,它表明了被占据的单电子能级和其上的电子数(即 能级布居数)。
I I
II
图 2.1 Muffin-tin:将原胞分为原子球区(I)和球间区(II)
平面波法和格林函数方法有一个共同的特点,即采用 J.C. Slater 提出的所 谓的 Muffin-tin 势[5]。它是这种处理实际上是基于早先原胞法的思路,即以一 个 Wigner-Seitz 原胞中电子的能量和波函数为出发点,将晶体的波函数用原胞 中电子波函数为基函数展开,并通过晶体波函数在原胞边界上所满足的条件来 确定晶体波函数。Muffin-tin 处理进一步将晶体的原胞空间分为两类区域:以 每个原子为中心的 Muffin-tin 球形区 I 和球外的球间区 II,如图 2.1 所示。在 球形区取球对称势,在球间区外则取常数势,通常选取适当的能量零点,使此 常数为零。Muffin-tin 球半径的选取要求球落在原胞之内,各原子的 Muffin-tin 球半径可以互不相等,但彼此不能相交。显然,和原胞法中选取的势场相比, 它更接近实际情况,而且也避免了原胞法中要满足边界条件的困难。同时,可 以看到,Muffin-tin 势可以方便地推广到更加复杂的格子,即原胞中不仅含有 一个原子的情况。这时可以按各个原子为中心做各自的原子球,半径可以不等,
因为内层电子对价电子的排斥作用部分地抵消了原子核对价电子的强吸引 作用,所以赝势是一种比较弱和比较平坦的势。引入赝势的要点在于,赝势对应 的薛定谔方程与真实势对应的薛定谔方程有相同的能量本征值。在这一前提下, 引入赝势的方法不是唯一的。在第一性原理计算中,用的是所谓模守恒赝势法。 这种赝势所对应的波函数有一个特点,在离开原子核一定距离的空间,它与真实 势对应的波函数不但形式相同,而且幅度相等,故称模守恒。这种方法从原子势 算起,不引入任何实验参数,所以又称为从头算起(ab initio)赝势方法。
固体能带理论在单电子近似的基础上,进一步通过将固体抽象为具有平移
对称性的理想晶体,借助布洛赫定理,将能带问题归结为单电子在周期性势场
18
第二章 研 究 方 法 与 程 序 介 绍
中的运动。同时在密度泛函理论之下,单电子薛定谔方程(2.1)演化为著名的 Kohn-Sham 方程。LCAO 法有可能将晶体的性质与原子的性质以及原子的相互 作用联系起来,但如果这不是所期望的目的,则还可以用平面波或是发散波形 式的“基”函数与 AO 波函数一起作展开基,甚或完全替代后者。就精确度而 言,这比 LCAO 法更具优点,由此发展了另外两大类能带结构计算方法:平面 波法和散射法[3,4](或称格林函数法,又常称为 KKR 方法)。此外,根据研究对 象的物理性质对晶体势作合理有效的近似处理,比如采用一个赝势替代原子核 与芯态电子对价电子的作用,而集中地把计算重点放在价态和类价态电子上, 这样的思路即为另一类能带计算方法赝势法。
势场,可以将单电子问题求解到任何需要的精度,但实际上,对同样的
Muffin-tin 势,用不同的能带方法,计算结果会有一定的差别。随着局域交换
关联势理论的发展和应用,通过自恰能带运算,可以得到晶体基态的性质,可
以得到晶体基态的性质,如结合能、原子间距,电荷转移、磁矩等,还可以得
到单电子的激发谱。但是,APW 方法存在着以下三个计算及概念上的困难:
wave APW)。在区域 I 中有球对称势,Kohn-Sham 方程的解应有如下形式:
ϕlm ( ρ) = Ylm (ρˆ )Rl (E, ρ )
(2.2)
式中 ρˆ 是以原子为中心的矢径 ρ 的角度部分;Ylm (ρˆ ) 是球谐函数;Rl (E, ρ) 是径
向波函数,它满足如下径向 Kohn-Sham 方程:
两种十分有效的线性化方法:一是选取一套与能量无关的 Muffin-tin 轨道,使
一般来说,赝势法计算量较小,但其中消去了内层电子态,相对于全电子法 多引入了一个近似。该方法的优点是较便于计算离子受到的作用力,后者等于总 能量对原胞内离子位矢导数的负数,称为 Hellmann-Feynman 力。赝势法用平面 波展开来表示价电子态,如果晶体中的原子有 2p 未满壳层(如氧)或 3d 未满壳 层(如钛),则赝势将很“硬”,为满足模守恒,需要为数很多的平面波基函数, 计算量太大。为此发展了超软赝势(ultro-soft pseudo-potential)法。对波函数引 入一个重叠算符,使赝势变软,减少了平面波基函数。在铁电体研究中用的赝势 法通常是这种方法。
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山东大学博士学位论文 铁电体的第一性原理研究
但要互不相交。球内都有球对称势,球外的势场为零。所以这个模型更灵活,
适用性强。即使对于晶体势场不能完全用 Muffin-tin 势描述的情况,也可以按 微扰的思想进行考虑。
基于 Muffin-tin 势是选取,可以建立起一套缀加平面波(augmented plane
可以看到,在原胞法中原胞边界上存在的难处,用缀加平面波基函数以后
就避免了,各个原子附近的球对称势场所句定的波函数是借助于球间的平面波
形式的解来相互连接的。这里并没有要求波函数在球面上连续,不过这一不连
续性只是在单个基函数中存在,由这些基函数线性组合构成的晶体波函数仍可
以是一个连续性并有连续导数的函数。缀加平面波函数是基于 Muffin-tin 势建
l=0 m=−l
(2.5)
其中 kˆ , ρˆ 分别表示 k , ρ 的角度部分。 jl (kρ) 为 l 级球贝塞耳函数。在球表面
上 ρ = ρν ,根据波函数连续的条件,可以得到关于系数 alm 的方程:
alm = 4πeik⋅rν ilYlm∗ (kˆ) jl (kρ ) / Rl (E', ρν )
−
1 ρ2
d dρ
ρ 2
dRl dρ
+
l
(l + ρ2
1)
+
Vν
(
ρ
)
Rl
(
E
'
,
ρ
)
=
E' Rl (E', ρ)
(2.3)
式中Vν (ρ) 是第ν 个球内的球对称势,l 为角量子数,在第ν 个球内,缀加平面波
函数可定义为各个分波函数的线性组合:
∞ +l
∑ ∑ φν (ρ) =
almYlm (ρˆ )Rl (E', ρ )
原则上,从量子力学的基本方程薛定谔方程出发,可以计算任何分子或晶 体的性质。但是,由于所有电子彼此之间存在相互作用,数学上严格求解这种 多电子问题是不可能的。解决这一困难需采用不同的近似法,单电子近似正是 其中的一种,在分子量子化学和晶体的能带理论中它属于首选方法。
单电子近似的概念,在量子力学的前身玻尔理论中早就存在。单电子模型 的基础是假设体系的所有核以及所有其余电子对某一给定电子的作用可近似 地用一平均“有效”场的作用来代替(哈特利—福克近似,更为严格精确的处 理是后来发展的密度泛函理论)。在这个场中,电子的势能即所谓“有效单电 子势能”V = V (rr) ,而玻尔原子模型中的单电子态就是相应于量子力学中的单 电子波函数ψ =ψ (rr) ,也即单电子轨道。在求得体系单电子轨道序列{ψn}以及 相应的单电子能级序列{εn}或体系的单电子“能谱”之后,就获得了该体系的 电子结构和电子性质各个方面的信息。
与单原子不同的是,将单电子模型应用于多原子体系时,由于势能表达
式中有多个吸引中心(原子核或原子实)存在,方程(2.1)的求解将变得更为复 杂。可以设想,在任何给定原子的周围,整个体系的势能多少接近于该原子
单独产生的势能,而在这个范围内,体系薛定谔方程的解也接近于此单原子
的方程之解,即接近它的原子轨道 AO。从数学上考虑,此时单电子波函数 的一种简便形式就是体系中所有原子的 AO 的线性组合。通过将有效单电子 哈密顿算符的本征函数展开为 AO 之和来求解多原子体系薛定谔方程,这种 方法即为原子轨道线性组合法(LCAO)。在分子体系中,它被称为分子轨道的 原子轨道线性组合法(MO LCAO);在晶体的情况,此即紧束缚的单电子近似 法。
山东大学博士学位论文 铁电体的第一性原理研究
第二章 研究方法与程序介绍
§2.1 全电子法和赝势法
应用于铁电体的第一性原理计算方法和工具很多,根据对势函数及内层电子 的处理方法不同主要分为两大类,一种是波函数中包含了高能态和内层电子,而 势函数只是原子核的贡献,这称为全电子(all electron calculation)法,另一种处 理方法是势函数为原子核和内层电子联合产生的势,称为离子赝势,波函数只是 高能态电子的函数,这称为赝势(pseudo-potential)法。
l=0 m=−l
(2.4)
在球外,势场为零,解应有平面波形式。设第ν 个球心的位矢为 rν ,则 r = rν + ρ ,
所以在第ν 个球外,
eik⋅r = eik⋅rν eik⋅ρ
而后一个因子可以按球谐函数展开:
∞ +l
∑ ∑ eik⋅ρ = 4π
i l jl (kρ )Ylm∗ (k)Ylm (ρ )
§2.2 线性缀加平面波方法
固体能带理论以确定固体电子能级为主要任务,是深入研究固体物理的理 论基础。固体的许多基本物理性质,如电导率、热导率、磁有序、光学介电函 数、振动谱等,原则上都可由固体的能带理论加以阐明和解释,或需要对具体 材料能带结构的了解作为基础。近年来,由于计算机技术日新月异的发展,能 带理论在方法上的创新得以在计算中实现。实际上,能带理论已成为计算物理 的一个重要组成部分。