《生物化学》氨基酸
《生物化学》氨基酸代谢
肽酶
5-氧脯
半胱氨酸
氨酸酶
γ-谷氨酰
谷氨酸
ATP ADP+Pi
ADP+Pi
谷胱甘肽 合成酶
半胱氨酸 合成酶
ATP
ATP
γ-谷氨酰半胱氨酸
(五)未吸收的蛋白质---腐败
肠道细菌代谢。
假神经递质 H+
NH4+
臭味
胺、氨、苯酚、硫化氢、吲哚等; 脂肪酸及维生素。
二、体内蛋白质降解
(一)蛋白质降解的情况
(三)联合脱氨基作用
转氨基和氧化脱氨基偶联 转氨基和嘌呤核苷酸循环偶联
氧化脱氨基
NH2
NAD(P)H+H+ NH
CH COOH
C COOH
H2O
(CH2)2 COOH NAD(P)+ (CH2)2 COOH
L-谷氨酸 L-谷氨酸脱氢酶
O
C COOH + NH3
(CH2)2 COOH
α-酮戊二酸
反应方向:取决于底物、产物、辅酶的浓度 别构调控:GTP抑制; ADP激活。
2ATP
N-乙酰谷氨酸
2ADP+Pi
氨基甲酰磷酸
Pi
鸟氨酸
瓜氨酸
1. 代谢障碍
1. 鸟氨酸循环酶缺乏
2. 激活剂N-乙酰谷氨酸
线粒体
合成少
3. 鸟氨酸运不到线粒体
4. 肝衰竭
鸟氨酸
尿素
胞液
瓜氨酸
ATP
AMP + PPi
天冬氨酸
精氨酸
精氨酸代 琥珀酸 草酰乙酸
延胡索酸
α-酮戊 二酸
氨基酸
谷氨酸 α-酮酸
GABA缺乏:焦虑、不安、疲倦、忧虑等情绪。 亨廷顿舞蹈症:GABA能神经元变性,GABA水平降低。 帕金森病、癫痫病患者:GABA较低。
生物化学第3章 氨基酸
一、氨基酸——蛋白质的构件分子
氨基酸(amino acid) :α-氨基酸是一切蛋白质的组成单位。氨基酸是与羧酸 相邻α-碳原子上连有一个氨基,故称α-氨基酸。 利用酸水解、碱水解、酶解可把蛋白质分子水解释放氨基酸。
不变部分(除脯氨酸) 可变部分 L型 α -氨基酸
氨基酸
芳香族氨基酸 Phe、Tyr、Trp 杂环氨基酸 His、Pro
脂肪族氨基酸:一氨基一羧基(中性氨基酸)
甘氨酸
丙氨酸
缬氨酸
亮氨酸
异亮氨酸
脂肪族氨基酸:一氨基一羧基(中性氨基酸):含有羟基
丝氨酸Ser的-OH在生理条件下不解离,但是个极性基团,能与其 他基团形成氢键,常出现在酶的活性中心; 苏氨酸Thr的-OH是仲醇,具有亲水性;
水中心)
极性氨基酸侧链能与水形成氢键,易溶于水 带电荷和极性氨基酸一般位于蛋白表面 蛋白的活性中心:His,Ser,Cys
2.3氨基酸的分类——不常见蛋白质氨基酸
2.4氨基酸的分类——非蛋白质氨基酸
150 多种,不是蛋白质组成,但是有特定生理功能
(1)大多是L型α氨基酸衍生物
(2)有D型氨基酸 (3)还有β-、γ-、δ-氨基酸
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用强酸型阳离子交换树脂分离氨基酸
氨基酸与树脂的亲和力取决于:
气液层析
高效液相层析
蛋白质的水解条件及优缺点
第一章糖课后题 第6题
高碘酸及其盐可以定量的氧 化断裂邻二羟基、α-羟基醛等 的碳碳键,产生相应的羰基 化合物。该反应可以用来区 分糖苷是呋喃还是吡喃型的。 侧翼测定直连多糖的相对分 子量和支链淀粉的非还原末 端残基数,即分支数目。
生物化学第3章 氨基酸分析
180多种天然氨基酸; 20种蛋白质氨基酸
二、氨基酸的分类、性质
各种氨基酸的区别在于侧链R基的不同 20种蛋白质氨基酸按R的极性可分为非极性氨基酸、不带电荷极性氨基酸、 带正电R基氨基酸和带负电R基氨基酸
按R基的结构可分为脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸及杂环氨基酸3大类
脂肪族氨基酸:一氨基一羧基(中性氨基酸):含有硫
Cysteine Methionine (Cys,C) (Met,M)
(1) 两个半胱氨酸的巯基氧化生成二硫键,生成胱氨酸,Cys-S-SCys
(2) 蛋氨酸的甲硫基的硫原子有亲核性,容易发生极化,在生物合成
中是重要的甲基供体
脂肪族氨基酸:一氨基二羧基(酸性氨基酸)
水中心)
极性氨基酸侧链能与水形成氢键,易溶于水 带电荷和极性氨基酸一般位于蛋白表面 蛋白的活性中心:His,Ser,Cys
2.3氨基酸的分类——不常见蛋白质氨基酸
2.4氨基酸的分类——非蛋白质氨基酸
150 多种,不是蛋白质组成,但是有特定生理功能
(1)大多是L型α氨基酸衍生物
(2)有D型氨基酸 (3)还有β-、γ-、δ-氨基酸
四、氨基酸的化学反应
ɑ-氨基参与的反应: 亚硝酸、酰化试剂、烃基、 醛基氧化酶 氨基酸的 化学反应
茚三酮、肽键形成!
ɑ-羧基参与的反应: 成盐、成酯、成酰氯、脱 羧、叠氮
侧链R基参与的反应: 取决于R侧链的官能团
ɑ-氨基参与的反应:
与亚硝酸反应:
通过测定N2的量而计算氨基酸的量,可衡量蛋白质的水解程度 与酰化试剂反应: X=Cl, OH, -OCOR; 可多肽合成中保护氨基;丹磺酰氯可以与肽的N-端氨基 酸反应,生成丹磺酰-肽,水解得到有强烈荧光的丹磺酰-氨基酸,用电泳法 或层析法分析即可得知N-端是何种氨基酸,被广泛用于蛋白质N端测定。 烃基化反应:
生物化学笔记氨基酸的合成代谢
一、概述20种基本氨基酸的生物合成途径已基本阐明,其中人类不能合成的10种氨基酸,即苯丙氨酸、甲硫氨酸、苏氨酸、色氨酸、赖氨酸、精氨酸、组氨酸、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸称为必须氨基酸。
氨基酸的合成途径主要有以下5类:1. 谷氨酸类型,由a-酮戊二酸衍生而来,有谷氨酸、谷氨酰胺、脯氨酸和精氨酸,蕈类和眼虫还可合成赖氨酸。
2. 天冬氨酸类型,由草酰乙酸合成,包括天冬氨酸、天冬酰胺、甲硫氨酸、苏氨酸和异亮氨酸,细菌和植物还合成赖氨酸。
3. 丙酮酸衍生类型,包括丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸,为异亮氨酸和赖氨酸提供部分碳原子。
4. 丝氨酸类型,由3-磷酸甘油酸合成,包括丝氨酸、甘氨酸和半胱氨酸。
5. 其他,包括苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸和组氨酸。
二、脂肪族氨基酸的合成(一)谷氨酸类型1. 谷氨酸:由a-酮戊二酸与氨经谷氨酸脱氢酶催化合成,消耗NADPH,而脱氨时则生成NADH。
2. 谷氨酰胺:谷氨酰胺合成酶可催化谷氨酸与氨形成谷氨酰胺,消耗一个ATP,是氨合成含氮有机物的主要方式。
此酶受8种含氮物质反馈抑制,如丙氨酸、甘氨酸等,因为其氨基来自谷氨酰胺。
谷氨酰胺可在谷氨酸合成酶催化下与a-酮戊二酸形成2个谷氨酸,这也是合成谷氨酸的途径,比较耗费能量,但谷氨酰胺合成酶Km小,可在较低的氨浓度下反应,所以常用。
3. 脯氨酸:谷氨酸先还原成谷氨酸g-半醛,自发环化,再还原生成脯氨酸。
可看作分解的逆转,但酶不同,如生成半醛时需ATP活化。
4. 精氨酸:谷氨酸先N-乙酰化,在还原成半醛,以防止环化。
半醛转氨后将乙酰基转给另一个谷氨酸,生成鸟氨酸,然后与尿素循环相同,生成精氨酸。
5. 赖氨酸:蕈类和眼虫以a-酮戊二酸合成赖氨酸,先与乙酰辅酶A缩合成高柠檬酸,异构、脱氢、脱羧生成a-酮己二酸,转氨,末端羧基还原成半醛,经酵母氨酸转氨生成赖氨酸。
(二)天冬氨酸类型1. 天冬氨酸:由谷草转氨酶催化合成。
2. 天冬酰胺:由天冬酰胺合成酶催化,谷氨酰胺提供氨基,消耗一个ATP 的两个高能键。
生物化学 氨基酸
氨基酸的化学反应
烃基化反应
CH2 CH2 Cl S: R1
Cl CH2 CH2 S+
R2 H2N CH COO-
R1
R1SCH2NHCH(R2)COO-
用途:是鉴定多肽N-端氨基酸的重要方法。
氨基酸的化学反应
生成西佛碱的反应
COOH
CH2OPO3-
HOCH2CHNH2 + O C
+ H+
CH2OH
•酶水解
– 优点:不产生消旋,不破坏氨基酸
– 缺点:水解时间长,单一酶水解不完全
氨基酸概述
蛋白质一般结构
• 构成蛋白质的氨基酸有20种 • 均为α-氨基酸(脯氨酸例外) • 共同结构为在同一碳原子上
有羧基、氨基与氢
• 不同点为侧链R不同
赖氨酸
脯氨酸 (亚氨基酸)
氨基酸分类
非极性,脂肪族侧链氨基酸
➢氨基酸使水的介电常数增高,一般有机物如乙 醇、丙酮等使水的介电常数降低
结论
➢氨基酸主要是以两性离子形式存在
两性解离
pH1 净电荷+1
甘氨酸的解离
pH7 净电荷 0
pH13 净电荷-1
阳离子
两性离子
阴离子
等电点
等电点
甘
(等电pH,pI)
氨
酸
➢ 两性电解质净电荷为零
时溶液的pH
的
➢ 等电点时,两性电解质
H2N
R1 O CC
R2 N C COOH
H
HH
H
HH
肽键
用途:氨基酸形成多肽的反应。
氨基酸的化学反应
与茚三酮的反应
O
O
茚三酮
C CO
《生物化学》第七章氨基酸代谢
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负平衡(饥饿、消耗性疾病) <
2021/3/13
《生物化学》第七章氨基酸代谢
4
三、蛋白质的生理需要量
最低需要量:30~50g / 天
营养学会推荐:80g / 天
四、蛋白质的营养价值
必需氨基酸(essential amino acid)
概念
种类
营养价值的标准
蛋白质互补
2021/3/13
《生物化学》第七章氨基酸代谢
2021/3/13
《生物化学》第七章氨基酸代谢
16
(一)转氨基作用(transamination)
概念、基本过程
在转氨酶的催化下,某一氨基酸的氨基转移 到另一种α-酮酸的酮基上,生成相应的氨基 酸;原来的氨基酸则转变为α-酮酸
反应可逆,平衡常数接近1
大多数氨基酸都可以参与转氨基(赖氨酸、 脯氨酸、羟脯氨酸例外)
第七章 氨基酸代谢
(Amino Acid ism)
Biochemistry Department
《生物化学》 Department of Basic Medical Sciences
多媒体课件试用版
Hangzhou Normal University
Guyisheng
2 第一节 蛋白质的营养作用
主动吸收:消耗ATP
(一)氨基酸吸收载体
载体蛋白(carrier protein)
中性氨基酸载体(为主)
碱性氨基酸载体
酸性氨基酸载体
亚氨基酸和甘氨酸载体
β氨基酸载体
与氨基酸、Na+组成三联体
图示
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《生物化学》第七章氨基酸代谢
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(二)r-谷氨酰基循环( r- glutamyl cycle)
王镜岩《生物化学》第三版考研笔记(提要版本071页)
王镜岩《生物化学》第三版考研笔记(提要版本071页)内容提要:1、氨基酸与蛋白质氨基酸分类:常见蛋白质氨基酸,不常见蛋白质氨基酸,非蛋白氨基酸;氨基酸的酸碱化学,氨基酸两性解离,氨基酸的等电点;氨基酸的旋光性和紫外吸收。
蛋白质的共价结构:蛋白质的化学组成和分类,蛋白质功能,蛋白质的形状和大小,蛋白质构象和组织层次。
肽:肽键结构,肽的物理化学性质,活性多肽。
蛋白质一级结构测定:Sanger试剂,DNS及Edman降解,二硫桥位置确定。
蛋白质的三维结构:XRD原理;稳定蛋白质三维结构的作用力,肽平面和两面角;蛋白质的二级结构:α-螺旋,β-折叠片,β-转角;超二级结构和结构域;球状蛋白的三级结构;亚基缔合和四级结构。
蛋白质结构与功能的关系:肌红蛋白和血红蛋白的结构与功能,镰刀状细胞贫血病;免疫球蛋白。
蛋白质的分离、纯化和表征:蛋白质分子量测定,沉降分析及沉降系数,沉降系数单位,凝胶过滤及SDS-PAGE法测分子量;蛋白质的沉淀;电泳:区带电泳、薄膜电泳、等电聚焦电泳、毛细管电泳。
2、酶和辅酶酶催化作用特点:反应温合、高效、专一、可调节控制;酶活性调节控制:调剂酶浓度、激素调节、反馈抑制调节、抑制剂激活剂调节、别构调控、酶原激活,可逆共价修饰;酶的化学本质及其组成,辅酶和辅基,单体酶,寡聚酶和多酶复合体。
酶的命名和分类:习惯命名法;国际系统命名法及酶的编号,六大类酶的特征。
酶的专一性:“锁与钥匙”学说;诱导楔合假说;过渡态理论,过渡态类似物与医药和农药的设计,催化抗体。
酶的活力测定:酶活力单位,比活力。
酶工程:化学修饰酶,固定化酶,人工模拟酶。
酶促反应动力学:底物浓度与酶反应速度,酶促反应动力学方程式及推导,米氏常数的意义和求法。
酶的抑制作用:不可逆抑制和可逆抑制及动力学判断,一些重要的抑制剂,有机磷农药和磺胺药作用机制。
温度、PH、激活剂对酶反应影响。
酶的作用机制:酶活性部位及研究方法;影响酶催化效率的有关因素:临近和定向效应、底物形变和诱导契合、酸碱催化、共价催化、金属离子催化、多元催化和协同效应、微环境影响;溶菌酶作用机制和胰凝乳蛋白酶。
《生物化学》氨基酸
氨基酸的两性解离:
阳离子
两性离子
阴离子
以甘氨酸为例: pK1= 2.34 pK2 = 9.60
+
H3N-CH2-COOH
[Gly+]
K’1
+H3N-CH2-COO- +[ H+] [ Gly±]
pI = 5.97
[Gly±][H+]
K1’=
[Gly+]
+H3N-CH2-COO- K’2 [Gly±]
苯丙氨酸
Phenylalanine Phe F
— CH 2— CH— COO-
NHN3H+ 3+
酪氨酸
Tyrosine Tyr Y
HO —
— CH 2— CH— COO-
NH3+ NH3+
组氨酸
Histidine His H
HC C — CH 2— CH— COO-
+HN
NH
C H
咪唑基
NH3+
如图所示
H3N+
COOH CH2
(Gly+)
COO-
H3N+ CH (G2 ly±)
COO-
H2N
CH2
(Gly-)
pH 14 12 10 8
[Gly+ ] = [Gly±]
6 4 2 0
0.1
pK1=2.34
0.05
加入的H+ mol数甘Βιβλιοθήκη 氨pK2=9.60
酸
的
pI=5.97
滴
[Gly ±] = [Gly-]
[Gly±][H+] K1’
= K2’ [Gly±]
生物化学第2章 氨基酸(共77张PPT)
• Ala Arg Asp
Asn
Cys Glu Gln Gly
His
Ile
Leu
Lys
Met Phe Pro
Ser
Thr
Trp
Tyr
Val
、 20种氨基酸可按其侧链分类
• 氨基酸的侧链可以按照它们的化学结构分为 三类,即:脂肪族氨基酸;芳香族氨基酸; 杂环氨基酸。
1)脂肪族氨基酸(中性)
甘氨酸 Glycine
非极性氨基酸(八种)
不带电何的极性氨基酸(八种)
带负电荷的氨基酸(2种)
带正电荷的氨基酸(2种)
➢第21种基本氨基酸是硒代半胱氨酸(Selenocysteine, Sec) ➢第22种基本氨基酸是吡咯赖氨酸(Pyrrolysine, Pyr) ➢两种罕见基本氨基酸是在特定生物的特定调控条件下生成。
O
H 2N CH C OH
CH 2
SH
C
( α-氨基-β-巯基丙酸 )
两个半胱氨酸氧化可生成胱氨酸
人头发的电子显微镜照片与模型
烫发过程:
1、加还原剂(巯基乙醇) 打开二硫键。
2、加氧化剂(双氧水) 重新生成错位二硫键。
1)、脂肪族氨基酸(含羟基或硫)
丝氨酸 Serine 苏氨酸 Threonine 半胱氨酸 Cysteine 甲硫氨酸 Methionine
O H 2N CH C OH
CH OH CH 3
T
( α-氨基-β-羟基丁酸 )
L-Threonine D-Threonine
L-alloThreonine
D-allo-
Threonine
苏氨酸的光学异构体
1)、脂肪族氨基酸(含羟基或硫)
《生物化学》第三版课后习题答案详解上册
第三章氨基酸提要α-氨基酸是蛋白质的构件分子,当用酸、碱或蛋白酶水解蛋白质时可获得它们。
蛋白质中的氨基酸都是L型的。
但碱水解得到的氨基酸是D型和L型的消旋混合物。
参与蛋白质组成的基本氨基酸只有20种。
此外还有若干种氨基酸在某些蛋白质中存在,但它们都是在蛋白质生物合成后由相应是基本氨基酸(残基)经化学修饰而成。
除参与蛋白质组成的氨基酸外,还有很多种其他氨基酸存在与各种组织和细胞中,有的是β-、γ-或δ-氨基酸,有些是D型氨基酸。
氨基酸是两性电解质。
当pH接近1时,氨基酸的可解离基团全部质子化,当pH在13左右时,则全部去质子化。
在这中间的某一pH(因不同氨基酸而异),氨基酸以等电的兼性离子(H3N+CHRCOO-)状态存在。
某一氨基酸处于净电荷为零的兼性离子状态时的介质pH称为该氨基酸的等电点,用pI表示。
所有的α-氨基酸都能与茚三酮发生颜色反应。
α-NH2与2,4-二硝基氟苯(DNFB)作用产生相应的DNP-氨基酸(Sanger反应);α-NH2与苯乙硫氰酸酯(PITC)作用形成相应氨基酸的苯胺基硫甲酰衍生物(Edman 反应)。
胱氨酸中的二硫键可用氧化剂(如过甲酸)或还原剂(如巯基乙醇)断裂。
半胱氨酸的SH基在空气中氧化则成二硫键。
这几个反应在氨基酸荷蛋白质化学中占有重要地位。
除甘氨酸外α-氨基酸的α-碳是一个手性碳原子,因此α-氨基酸具有光学活性。
比旋是α-氨基酸的物理常数之一,它是鉴别各种氨基酸的一种根据。
参与蛋白质组成的氨基酸中色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸在紫外区有光吸收,这是紫外吸收法定量蛋白质的依据。
核磁共振(NMR)波谱技术在氨基酸和蛋白质的化学表征方面起重要作用。
氨基酸分析分离方法主要是基于氨基酸的酸碱性质和极性大小。
常用方法有离子交换柱层析、高效液相层析(HPLC)等。
习题1.写出下列氨基酸的单字母和三字母的缩写符号:精氨酸、天冬氨酸、谷氨酰氨、谷氨酸、苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸。
[见表3-1]表3-1 氨基酸的简写符号名称三字母符号单字母符号名称三字母符号单字母符号丙氨酸(alanine) Ala A 亮氨酸(leucine) Leu L精氨酸(arginine) Arg R 赖氨酸(lysine) Lys K天冬酰氨(asparagines) Asn N 甲硫氨酸(蛋氨酸)(methionine) Met M天冬氨酸(aspartic acid) Asp D 苯丙氨酸(phenylalanine) Phe FAsn和/或Asp Asx B半胱氨酸(cysteine) Cys C 脯氨酸(praline) Pro P 谷氨酰氨(glutamine) Gln Q 丝氨酸(serine) Ser S谷氨酸(glutamic acid) Glu E 苏氨酸(threonine) Thr TGln和/或Glu Gls Z甘氨酸(glycine) Gly G 色氨酸(tryptophan) Trp W组氨酸(histidine) His H 酪氨酸(tyrosine) Tyr Y 异亮氨酸(isoleucine) Ile I 缬氨酸(valine) Val V 2、计算赖氨酸的εα-NH3+20%被解离时的溶液PH。
《生物化学》名词解释总结(附参考答案)
1氨基酸(amino acids):是含有一个碱性氨基和一个酸性羧基的有机化合物,氨基一般连接在α-碳上。
氨基酸是肽和蛋白质的构件分子。
2 必需氨基酸(essential amino acids):指人(或其它脊椎动物)自己不能合成,需要从饮食中获得的氨基酸,例如赖氨酸、苏氨酸等氨基酸。
3 非必需氨基酸(nonessential amino acids):指人(或其它脊椎动物)自己能由简单的前体合成的,不需要由饮食供给的氨基酸,例如甘氨酸、丙氨酸等氨基酸。
4等电点(pI,isoelect ric point)使分子处于兼性分子状态,在电场中不迁移(分子的净电荷为零)的pH值。
5茚三酮反应(ninhydrin reaction):在加热条件下,氨基酸或肽与茚三酮反应生成紫色(与脯氨酸反应生成黄色)化合物的反应。
6肽键(peptide bond):一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的氨基缩合,除去一分子水形成的酰胺键。
7 肽(peptides):两个或两个以上氨基酸通过肽键共价连接形成的聚合物。
8蛋白质一级结构(primary structure):指蛋白质中共价连接的氨基酸残基的排列顺序。
9层析(chromatogra phy):按照在移动相(可以是气体或液体)和固定相(可以是液体或固体)之间的分配比例将混合成分分开的技术。
10离子交换层析(ion-exchange column chromatography):使用带有固定的带电基团的聚合树脂或凝胶层析柱分离离子化合物的层析方法。
11透析(dialysis):通过小分子经半透膜扩散到水(或缓冲液)的原理将小分子与生物大分子分开的一种分离纯化技术。
12凝胶过滤层析(gel filtration ch romatography):也叫做分子排阻层析(m olecular-exclusion chromatogra phy)。
一种利用带孔凝胶珠作基质,按照分子大小分离蛋白质或其它分子混合物的层析技术。
生物化学 第三章 氨基酸
+
C H R
-H pK1' +H
+
+
COO H3N
+
-
C H R
-H pK2' +H
+
+
COO R
-
H2N C H
PH 1 净电荷 +1 正离子
7 0 两性离子 等电点PI 等电点
10 -1 负离子
( ) 与 亚 硝 酸 反 应
四. 氨基酸的化学反应
1.α-氨基参与的反应 氨基参与的反应
异亮氨酸 Ileucine 脯氨酸 Proline
甲硫氨酸 Methionine 半胱氨酸 Cysteine
氨基酸的结构
芳香族氨基酸
苯丙氨酸 Phenylalanine
H 2N CH 2 O CH C OH
氨基酸的结构
芳香族氨基酸
苯丙氨酸 Phenylalanine 酪氨酸 Tyrosine
H 2N CH CH
天冬氨酸 Aspartic acid
酸性氨基酸
O H2N CH C CH2 C OH O OH
氨基酸的结构
天冬氨酸 Aspartic acid 谷氨酸 Glutamic acid
H2N
酸性氨基酸
O CH C CH2 CH2 C OH O OH
氨基酸的结构
丝氨酸 Serine
含羟基氨基酸 含羟基氨基酸
一. 氨基酸—蛋白质的构件分子 蛋白质的水解作用提供了关于 蛋白质的水解——蛋白质的水解作用提供了关于
α-氨基酸的一般结构— 氨基酸的一般结构—
20种氨基酸除脯氨酸外,其他均具如下结构通式。 20种氨基酸除脯氨酸外,其他均具如下结构通式。 种氨基酸除脯氨酸外
氨基酸代谢《生物化学》复习提要
食物蛋白质的互补作用:营养价值较低的蛋白质混合食用,则必需氨基酸可以互相补充从而提高营养价值,称之。
例如,谷类蛋白质含赖氨酸较少而含色氨酸较多,豆类蛋白质含赖氨酸较多而含色氨酸较少,两者混合食用即可提高营养价值。
(三)蛋白质的营养价值
1.营养必需氨基酸:一些体内需要而又不能自身合成,必须由食物供应的氨基酸,称之。体内有8种氨基酸是:缬氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、苏氨酸、甲硫氨酸、赖氨酸、苯丙氨酸和色氨酸。
组氨酸和精氨酸虽能在人体内合成,但合成量不多,将这两种氨基酸也归为营养必需氨基酸。
营养非必需氨基酸:体内可以合成,不一定需要由食物供应,称之。
2.转氨基作用的机制转氨酶的辅酶都是维生素B6的磷酸酯,即磷酸毗哆醛,它结合于转氨酶活性中心赖氨酸的ε-氨基上。在转氨基过程中,磷酸吡哆醛先从氨基酸接受氨基转变成磷酸吡哆胺,同时氨基酸则转变成α-酮酸。磷酸吡哆胺进一步将氨基转移给另一种。α-酮酸而生成相应的氨基酸,同时磷酸吡哆胺又变回磷酸吡哆醛。在转氨酶的催化下,磷酸吡哆醛与磷酸吡哆胺的这种相互转变,起着传递氨基的作用。
三、蛋白质的腐败作用
定义:在消化过程中,有一小部分蛋白质不被消化,也有一小部分消化产物不被吸收,肠道细菌对这部分蛋白质及其消化产物所起的作用,称之。
腐败作用是细菌本身的代谢过程,以无氧分解为主。多数产物对人体有害,但也可以产生少量脂肪酸及维生素等可被机体利用的物质。
(一)胺类的生成
肠道细菌的蛋白酶使蛋白质水解成氨基酸,再经氨基酸脱羧基作用,产生胺类。例如,组氨酸脱羧基生成组胺,赖氨酸脱羧基生成尸胺,色氨酸脱羧基生成色胺,酪氨酸脱羧基生成酪胺等。
氨基酸名词解释生物化学
氨基酸名词解释生物化学
氨基酸是构成蛋白质分子的基本单元,由一个氨基和一个羧基组成,其中棕色标识氨基,蓝色标识羧基。
氨基酸分类有20种,其中8种为人体必需氨基酸,不能由人体自己合成,需从食物中摄取。
氨基酸可以通过肽键形成多肽和蛋白质,具有多种生物学功能。
例如,亮氨酸可用于ATP生成或脂肪酸合成,色氨酸可用于神经递质合成,赖氨酸可用于胆碱合成,丝氨酸可用于血纤维蛋白生成等。
不同的氨基酸序列和构象导致蛋白质具有不同的生物学功能和特性。
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一、氨基酸---蛋白质的构件分子
(一)蛋白质的水解 (二)α-氨基酸的一般结构
(一)蛋白质的水解
蛋白质水解的主要方法: (1)酸水解 (2)碱水解 (3)酶水解
蛋白质水解生成20种游离的氨基酸
(1)酸水解
常用H2SO4或HCl进行水解。 方法:
一般用6mol/L HCl, 4mol/L H2SO4 ,回流煮沸20h左右可使蛋 白质完全水解。 优点:
氨基酸的pI可由实验测定,也可根据氨基酸羧 基和氨基的pK值(即解离常数的负对数)来确定, pK的编号通常是从酸性最强基团的解离开始,分别 用pK1,pK2……表示.
一氨基一羧基氨基酸,如丙氨酸: pK1(-COOH)=2.34, pK2(-NH3+)=9.69
pI = (pK1+pK2) / 2
H2N-CH2-COO- + [ H+ ] [Gly-]
[Gly-][H+] K2’= [Gly±]
[Gly±][H+]
K1’=
[Gly+]
[Gly-][H+] K2’= [Gly±]
[Gly+] =
[Gly±][H+] K1’
[Gly-] = K2’ [Gly±]
[H+]
∵ [Gly+] = [Gly-] ∴
不引起消旋作用,得到的是L-氨基酸。 缺点:
色氨酸完全被沸酸所破坏。羟基氨基酸有一小部分被分解, 天冬酰胺,谷氨酰胺的酰胺基被水解下来。
(2)碱水解
方法: 一般与5mol/L NaOH共煮10-20h,即可使蛋白质完全
水解。 优点:
色氨酸在碱性条件下稳定。 缺点:
水解过程中多数氨基酸遭到不同程度的破坏,并且产 生消旋现象,所得的产物是D-和L-氨基酸的混合物,称消 旋物。此外,精氨酸脱氨,生成鸟氨酸和尿素。
另外当氨基酸处于等电点时,由于静电引力的作 用,氨基酸的溶解度最小,容易沉淀,利用这一性质可 以分离制备氨基酸。
(四)氨基酸的甲醛滴定
由于氨基酸具有酸、碱两性,不能直接用酸碱进行滴 定,因为氨基酸的酸、碱滴定的等电点pH或过高或过低, 没有适当的指示剂可被选用。
而加入甲醛后,降低了氨基的碱性,因 而可以用NaOH 直接滴定,选用酚酞作指示剂。 (图)
NH3+
色氨酸
Tryptophan Try W ( Trp)
— CH 2— CH— COO-
吲哚基
N H
NH3+
NH3+
苯并吡咯环
脯氨酸
Proline Pro P
CH2-CH2-CH2-CH-COO -
H
H
+NH2
脯氨酸
Proline Pro P
CH2H-C2CH2-CCHH2-CHC-COOOO- -
(3)酶水解
优点: 不产生消旋现象,也不破坏氨基酸。
缺点: 水解不彻底,需几种酶协调作用才能彻底水解蛋白质。
常用蛋白酶: 胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶或糜蛋白酶及胃蛋白酶等。
(二)α-氨基酸的一般结构
根 识 结P-据,构arom你从通tei式所下nin可学面os的的看aac化氨出ried学基氨bm知 酸基ioolloegciuclaelsptohlaytmceornstmainadbeouthp
一氨基二羧基氨基酸,如天冬氨酸, 在不同pH值时的解离情况如下图所示:
pI = (pK1+pK2) / 2=1.88+3.65=2.77
二氨基一羧基氨基酸,如赖氨酸, 在不同PH值时的解离情况如图所示
pI = (pK2+pK3) / 2=8.95+10.53=9.74
综上所述,各种氨基酸的等电点为两性离子两侧两个 pK的平均值。
滴
[Gly ±] = [Gly-]
定 曲
线
0
0.05
0.1
加入的OH- mol数
氨基酸的甲醛滴定
PH 14 12 10 8
6 4 2 0
0.1
A
pK1=2.34
0.05
B
pK2=9.60
无甲醛
pK’2≈ 7
C 加有甲醛
0
0.05
0.1
加入的H+mol数
加入的OH - mol数
加甲醛和不加甲醛的甘氨酸滴定曲线
苯丙氨酸
Phenylalanine Phe F
— CH 2— CH— COO-
NHN3H+ 3+
酪氨酸
Tyrosine Tyr Y
HO —
— CH 2— CH— COO-
NH3+ NH3+
组氨酸
Histidine His H
HC C — CH 2— CH— COO-
+HN
NH
C H
咪唑基
NH3+
定 曲
线
0
0.05
0.1
加入的OH- mol数
H3N+
COOH
+OHCH
+H+
R
正离子
Aa+
COO-
H3N+ C H R
两性离子
+OH+H+ H2N
COO-
CH R
负离子
Aa±
Aa_
实验证明,在pI时氨基酸主要以两性离子形式 存在,但也有少量数量相等的正负离子,还有极少 量中性分子,每(—)氨基酸的兼性离子形式 (二)氨基酸的解离 (三)氨基酸的等电点 (四)氨基酸的甲醛滴定 (五)氨基酸的物理性质小结
(一)氨基酸的兼性离子形式
氨基酸的α-C上连接了一个羧基和一个氨基,在中性水 溶液中,羧基就会放出质子,而氨基接受质子,这样就使一 个中性形式的氨基酸分子变成了带正、负电荷相等的两性离 子.见下图
COOH H2N C H
R 中性分子
COO-
H3N+ C H R
两性离子
(二)氨基酸的解离
氨基酸在水中的两性离子既能像酸一样放出质子。
COO-
H3N+
CH
R 作为酸
COO-
H2N
C H + H+
R
也能像碱一样接受质子
COO-
H3N+ C R
作为碱
H + H+
COOH H3N+ C H
R
氨基酸具有酸碱性质,是一类两性电解质。
+
H H2C HCH2N+HN2H2
(2)按侧链R基的极性分
极性氨基酸
Aa
不带电荷的极性氨基酸 (7) Gly、Ser、Thr、Cys、Tyr 、 Asn、Gln
带正电荷的极性氨基酸 (3) Arg、Lys、His
带负电荷的极性氨基酸 (2) Asp、Glu、
非极性氨基酸 Phe、 Ala、Val、Leu、Ile、 Met、 Trp 、Pro (8)
半胱氨酸(半胱)
Cysteine Cys C
HS — CH 2— CH— COO-
胱氨酸的一半
NHN3H+ 3+
甲硫氨酸(蛋氨酸)
Methionine Met M
CH3 — S —CH2— CH2 — CH— COO-
NH3+ NH3+
天冬氨酸
Aspartate Asp D
-OOC — CH2— CH— COONHN3+H3+
用于测定氨基酸含量及蛋白质水解程度
H3N+
COOH CH2
(Gly+)
COO-
H3N+ CH (G2 ly±)
COO-
H2N
CH2
(Gly-)
pH 14 12 10 8
[Gly+ ] = [Gly±]
6 4 2 0
0.1
pK1=2.34
0.05
加入的H+ mol数
甘
氨
pK2=9.60
酸
的
pI=5.97
[Gly±][H+] K1’
= K2’ [Gly±]
[H+]
pH=pI = (pK1+pK2) / 2
甘氨酸的酸碱滴定曲线
从左向右是用NaOH滴定 的曲线,溶液的pH由小到大 逐渐升高;从右向左是用盐 酸滴定的曲线,溶液的pH由 大到小逐渐降低。曲线中从 左向右第一个拐点是氨基酸 羧基解离50%的状态,第二个 拐点是氨基酸的等电点,第 三个拐点是氨基酸氨基解离 50%的状态。
CH 3
NH3+
异亮氨酸(异亮)
Isoleucine Ile I
CH 3 — CH2— CH — CH— COOCH 3 NH3+
NH3+
丝氨酸(丝)
Serine Ser S
HO — CH 2— CH— COONNHH3+3+
苏氨酸(苏)
Threonine Thr T
CH3— CH — CH— COOOH NH3N+H3+
NH3+ NH3+
精氨酸(精)
Arginine Arg R
+
NH2
δ
γ
βα
NH2 – C - NH - CH2 - CH2 - CH2-CH-COO-
胍基 NH3+
NH3+
赖氨酸
Lysine Lys K
ε
+NH3 - CH2 - CH2 - CH2 - CH2 - CH - COO-
NH3+
NH3+
谷氨酸
Glutamate Glu E