饲料中阪崎肠杆菌活菌的检测EMA-PCR法-编制说明
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《饲料中阪崎肠杆菌活菌的检测 EMA-PCR法》河南省地方标准编制说明
一、编制的目的和意义
阪崎肠杆菌(Enterobacter sakazaii)是一种革兰氏阴性、周生鞭毛、能运动、无芽孢的兼性厌氧细菌,属条件性致病菌。自1961年,英国首次报道2例由阪崎肠杆菌引起的脑膜炎病例以来,相继在美国、加拿大、比利时等国家报道了新生儿阪崎肠杆菌感染事件。国际食品微生物标准委员会(ICMSF)在2002年将阪崎肠杆菌列为“严重危害特定人群生命、引起长期慢性实质性后遗症的一种致病菌”。阪崎肠杆菌能引起严重的新生儿脑膜炎、小肠结肠炎和菌血症,并且可能引起神经系统后遗症和死亡,在某些情况下,由阪崎肠杆菌引发疾病而导致的死亡率可达40%~80%。因此,对阪崎肠杆菌活菌建立快速、特异、灵敏的检测标准对于该菌的早期发现及传播的有效控制至关重要。
目前阪崎肠杆菌的检测方法较多,主要有传统培养方法和分子生物学方法。我国目前采用传统的细菌学方法,检测时间需要一周左右,费时费力;分子生物学方法虽然快速,灵敏,但不能区分死菌与活菌,而死菌DNA的存在容易导致假阳性问题。本研究以阪崎肠杆菌16S rDNA保守序列为靶基因设计一对特异性引物,采用EMA与PCR结合的方法进行检测,能够有效地区分阪崎肠杆菌的死菌与活菌,避免了因死菌DNA存在造成的假阳性结果,
同时减去了传统培养方法中目标菌分离纯化的步骤,节约了大量检测时间。本次研究结果显示,PCR检测阪崎肠杆菌的灵敏度在1.0×102cfu/mL左右,从样品处理、预增菌、PCR扩增、凝胶电泳只需要48h左右,与传统培养方法相比,稳定性好、灵敏度高、特异性强,可用于检测饲料中阪崎肠杆菌的污染状况,对饲料的安全监测具有重大意义。
二、任务来源及编制原则和依据
1、任务来源
根据河南省质量技术监督局文件《河南省质量技术监督局关于下达2017年第一批河南省地方标准制修订计划的通知》(豫质监标发〔2017〕104号)的要求,由河南省兽药饲料监察所负责对河南省地方标准《饲料中阪崎肠杆菌活菌的检测EMA-PCR法》(立项编号:20171210482)的起草、制定工作。
2、编制原则
符合国家法律、法规和政策,本着严格遵循科学依据,与国际水平接轨,并且准确、实用、快速的原则,开展了本次研究工作。
3、编制依据
主要依据以下标准:GB 4789.40-2016 食品微生物学检验克罗诺杆菌属(阪崎肠杆菌)检验;GB 19489 实验室生物安全通
用要求;GB 4789.28 食品微生物学检验培养基和试剂的质量要求。
三、编制过程
标准的编制过程分三个阶段进行:
第一阶段:阪崎肠杆菌活菌EMA-PCR检测方法的建立
1.引物设计
根据阪崎肠杆菌16S rDNA设计一对特异性引物。根据该基因中的保守且特异性序列,设计扩增932 bp大小的特异性引物对。
表1 引物序列
2. EMA-PCR方法参数的优化
首先是探索阪崎肠杆菌培养物的最佳致死方法和EMA最佳终浓度,分别采用煮沸裂解、紫外照射及化学方法对培养物进行处理,再分别加入EMA,制备成EMA终浓度成梯度变化的菌悬液,采用卤素灯进行光照交联。然后通过离心收集上清液,进行PCR 扩增,观察凝胶电泳结果,选出最优的致死方法和最佳EMA添加终浓度。
其次是最佳曝光时间的确定,在上述试验的结果上,选出最
优组合,采用卤素灯下分别照射0、1、2、4、6、8、10min,离
心收集上清液,进行PCR扩增。
3.确定方法的灵敏度和特异性。
4. 用建立的阪崎肠杆菌EMA-PCR方法检测饲料及饲料原料
样品,并与GB 4789.40克罗诺杆菌属(阪崎肠杆菌)检验比对,以验证该方法的实用性和准确性。
第二阶段:阪崎肠杆菌EMA-PCR检测方法应用实验
本阶段主要进行阪崎肠杆菌EMA-PCR检测方法在河南省范围
内的应用实验。为了进一步验证所建立的诊断方法的特异性、敏
感性和实用性,由河南省兽药饲料监察所进行饲料样品检测应用
试验。共对来自全国4个省(大部分样品来自河南省)共计216批
饲料及饲料原料样品进行了应用检测;共检测出1批阪崎肠杆菌
阳性样品,并对阪崎肠杆菌进行了分离鉴定。同时与GB 4789.40 《克罗诺杆菌属(阪崎肠杆菌)检验》进行了对比,检测结果显示,EMA-PCR方法检测结果与传统培养法GB 4789.40检测结果完
全一致,但检测时间比传统培养法缩短了2-3天的时间。
通过对比发现,EMA-PCR方法具有准确、快速的特点,在应
用推广方面具有一定的优势。
第三阶段:标准的起草、修改与制定
根据以上实验资料及所有参与实验人员意见,在系统统计、
科学分析的基础上,组织有关专家起草了《饲料中阪崎肠杆菌活
菌的检测 EMA-PCR法》河南省地方标准草案,规定了适用范围、样品处理方法、实验操作方法、结果判定等,并将标准草案送微生物有关方面专家征求意见,按照专家意见对标准草案进行多次修改完善,制定了当前的《饲料中阪崎肠杆菌活菌的检测EMA-PCR法(草案)》。
项目主持人:吴志明,河南省兽药饲料监察所,主持本项地方标准的制定与编写。
主要起草人:
高延玲:河南省兽药饲料监察所,负责标准的制定和技术推广。
方忠意:河南省兽药饲料监察所,负责标准的制定和检测方法的优化。
董鹏:河南省兽药饲料监察所,负责标准的制定、校订和检测方法的建立。
李金磊:河南省兽药饲料监察所,负责标准的制定、校订和检测方法的建立。
狄元冉:河南省兽药饲料监察所,负责标准的制定、校订和优化。
四、主要内容的确定
1. 检测方法基本原理
EMA能够穿过死细菌的细胞膜,在强光照射下可与其基因组