氨基酸的生物合成整理版
氨基酸的分类和生物合成途径
氨基酸的分类和生物合成途径氨基酸是构成蛋白质的基本化学物质单位。
它们在生物体内扮演着重要的角色,不仅是蛋白质的组成部分,还参与许多生物活动。
本文将探讨氨基酸的分类和生物合成途径。
一、氨基酸的分类根据氨基酸的化学结构,可以将其分为以下几类。
1. 根据侧链的极性:氨基酸可以分为极性氨基酸和非极性氨基酸。
极性氨基酸的侧链中含有带电的氨基或羧基,使其具有极性。
非极性氨基酸则不含这些带电基团。
2. 根据侧链的酸碱特性:氨基酸可以分为酸性、碱性和中性氨基酸。
酸性氨基酸的侧链具有酸性,可以失去氢离子。
碱性氨基酸的侧链则具有碱性,可以接受额外的氢离子。
3. 根据侧链的结构:氨基酸可以分为疏水性氨基酸和亲水性氨基酸。
疏水性氨基酸的侧链主要由非极性或低极性氨基酸组成,不与水相互作用。
亲水性氨基酸则具有极性侧链,可以与水形成氢键。
二、氨基酸的生物合成途径氨基酸的生物合成途径可以分为多个步骤,下面以蛋氨酸为例进行说明。
1. 脱羧酶反应:通过脱羧酶作用,将天冬酰胺酸转化为半胱氨酸。
该反应需要维生素B6作为辅酶。
2. 羟基酸转移酶反应:通过羟基酸转移酶作用,将半胱氨酸转化为丙硫氨酸。
该反应需要维生素B6作为辅酶。
3. 磷酸化反应:通过磷酸转移酶作用,将丙硫氨酸转化为磷酸丙硫氨酸。
该反应需要ATP参与。
4. 磷酸酸化反应:通过磷酸转移酶作用,将磷酸丙硫氨酸转化为磷酸胞嘧啶酸。
该反应需要ATP参与。
5. 含硫酸转氨酶反应:通过含硫酸转氨酶作用,将磷酸胞嘧啶酸转化为蛋氨酸。
以上仅是举例说明一个氨基酸的生物合成途径,其他氨基酸的生物合成也涉及各种酶的参与和辅酶的作用。
总结:本文论述了氨基酸的分类和生物合成途径。
根据氨基酸的化学结构和侧链特性,我们可以将其分类为不同的类型。
氨基酸的生物合成途径是复杂而精细的,在生物体内通过多个步骤和多种酶的参与完成。
对于深入理解氨基酸的功能和作用,研究其分类和合成途径十分重要。
氨基酸的生物化学特性和生物合成途径
氨基酸的生物化学特性和生物合成途径氨基酸是构成蛋白质的基本单位,对生命体起着至关重要的作用。
它不仅可以作为代谢产物参与生物化学反应,还可以作为合成其他生化物质的前体。
本文将介绍氨基酸的生物化学特性以及生物合成途径。
一、氨基酸的生物化学特性1. 化学结构:氨基酸一般由一个氨基(-NH2)、一个羧基(-COOH)和一个侧链基团组成。
侧链基团的不同决定了氨基酸的特性和功能。
2. 光学活性:除了丙氨酸外,其他氨基酸都存在手性中心,存在两种光学异构体,即L-和D-型。
在自然界中,生物体主要合成和利用L-型氨基酸。
3. 酸碱特性:由于存在氨基和羧基,氨基酸显示酸碱特性。
在中性pH条件下,氨基酸呈现出等电点(pI),即其电荷净值为0。
4. 缓冲作用:由于氨基酸具有酸碱特性,它们可以在生物体内起到缓冲作用,维持体内pH的稳定。
5. 水溶性:氨基酸具有不同的水溶性,与侧链基团的性质有关。
极性侧链的氨基酸溶解度较高,非极性氨基酸溶解度较低。
二、氨基酸的生物合成途径氨基酸的生物合成途径主要包括脱氨酶途径、反应序列途径和转氨基酸途径。
1. 脱氨酶途径:脱氨酶途径是氨基酸合成的主要途径,通过脱氨酶酶的作用,从酮酸骨架上去除氨基团,形成氨基酸。
例如,谷氨酸脱氨酶催化谷氨酸转化为α-酮戊二酸和游离氨。
2. 反应序列途径:反应序列途径是通过多个酶催化氨基酸的合成,其中每个酶只催化整个反应序列中的一步。
例如,鸟氨酸的生物合成途径就包括丝氨酸合成酶、半胱氨酸合成酶等多个酶的催化。
3. 转氨基酸途径:转氨基酸途径是通过转氨酶的作用,在不同的氨基酸之间进行转化。
例如,天冬酰-丙酰谷氨酸转氨酶催化谷氨酸和苹果酸转化为天冬氨酸和α-酮戊二酸。
除了通过合成途径合成氨基酸,细菌和植物还可以通过自养合成氨基酸,这些生物体内拥有完整的氨基酸生物合成途径。
综上所述,氨基酸具有多种生物化学特性,其生物合成途径丰富多样。
了解氨基酸的特性和合成途径,对于进一步理解蛋白质合成和生物代谢过程具有重要意义。
氨基酸的生物合成途径
氨基酸的生物合成途径氨基酸是构成蛋白质的基本组成单位,对于维持生命活动至关重要。
生物体通过一系列的生化反应将无机物质转化为氨基酸,进而合成蛋白质。
本文将介绍氨基酸的生物合成途径及其在生命过程中的重要性。
I. 氨基酸的总体合成途径氨基酸的合成可以归纳为两种主要途径:共轭途径和独立途径。
A. 共轭途径共轭途径是指一部分氨基酸的合成途径与其他代谢通路相互关联。
例如,苹果酸途径是氨基酸合成的一个重要共轭途径。
由于共轭途径的存在,氨基酸的生物合成与其他代谢过程形成了网络结构,相互影响。
B. 独立途径独立途径是指一部分氨基酸通过特定的酶催化作用逐步合成。
氨基酸合成的独立途径比较简单,其中一些氨基酸可以直接由无机物合成,而另一些则需要通过其他氨基酸转化而来。
II. 氨基酸的重要性氨基酸在生命活动中具有多种重要功能。
A. 构建蛋白质氨基酸是构建蛋白质的基本单位,通过氨基酸的连接,可以形成多肽链,进而折叠成具有特定功能的蛋白质。
不同的氨基酸序列和折叠方式决定了蛋白质的种类和功能。
B. 提供能量某些氨基酸在代谢过程中可以转化为葡萄糖或酮体,为生物提供能量。
当身体缺乏碳水化合物或脂肪时,氨基酸可以代替其作为能量来源。
C. 参与代谢途径氨基酸不仅可以在蛋白质合成中参与代谢途径,还可以转化为其他重要物质。
例如,一些氨基酸可以被转化为神经递质,参与神经传导;另一些氨基酸则可以转化为嘌呤和嘧啶,参与核酸的合成。
III. 氨基酸的生物合成途径不同的氨基酸具有不同的合成途径,以下将介绍几种常见氨基酸的生物合成途径。
A. 谷氨酸合成途径谷氨酸是一种非必需氨基酸,它由α-酮戊二酸合成。
α-酮戊二酸可以由糖酵解产生,也可以由其他氨基酸通过转化得到。
谷氨酸在生物体内起到调节酸碱平衡、转运氮和转移碳的重要作用。
B. 天冬氨酸合成途径天冬氨酸是一种非必需氨基酸,它可以通过α-酮戊二酸在酶的催化下合成。
天冬氨酸是蛋白质合成中的重要组成部分,同时也参与酮体的合成。
生物化学笔记氨基酸的合成代谢
一、概述20种基本氨基酸的生物合成途径已基本阐明,其中人类不能合成的10种氨基酸,即苯丙氨酸、甲硫氨酸、苏氨酸、色氨酸、赖氨酸、精氨酸、组氨酸、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸称为必须氨基酸。
氨基酸的合成途径主要有以下5类:1. 谷氨酸类型,由a-酮戊二酸衍生而来,有谷氨酸、谷氨酰胺、脯氨酸和精氨酸,蕈类和眼虫还可合成赖氨酸。
2. 天冬氨酸类型,由草酰乙酸合成,包括天冬氨酸、天冬酰胺、甲硫氨酸、苏氨酸和异亮氨酸,细菌和植物还合成赖氨酸。
3. 丙酮酸衍生类型,包括丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸,为异亮氨酸和赖氨酸提供部分碳原子。
4. 丝氨酸类型,由3-磷酸甘油酸合成,包括丝氨酸、甘氨酸和半胱氨酸。
5. 其他,包括苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸和组氨酸。
二、脂肪族氨基酸的合成(一)谷氨酸类型1. 谷氨酸:由a-酮戊二酸与氨经谷氨酸脱氢酶催化合成,消耗NADPH,而脱氨时则生成NADH。
2. 谷氨酰胺:谷氨酰胺合成酶可催化谷氨酸与氨形成谷氨酰胺,消耗一个ATP,是氨合成含氮有机物的主要方式。
此酶受8种含氮物质反馈抑制,如丙氨酸、甘氨酸等,因为其氨基来自谷氨酰胺。
谷氨酰胺可在谷氨酸合成酶催化下与a-酮戊二酸形成2个谷氨酸,这也是合成谷氨酸的途径,比较耗费能量,但谷氨酰胺合成酶Km小,可在较低的氨浓度下反应,所以常用。
3. 脯氨酸:谷氨酸先还原成谷氨酸g-半醛,自发环化,再还原生成脯氨酸。
可看作分解的逆转,但酶不同,如生成半醛时需ATP活化。
4. 精氨酸:谷氨酸先N-乙酰化,在还原成半醛,以防止环化。
半醛转氨后将乙酰基转给另一个谷氨酸,生成鸟氨酸,然后与尿素循环相同,生成精氨酸。
5. 赖氨酸:蕈类和眼虫以a-酮戊二酸合成赖氨酸,先与乙酰辅酶A缩合成高柠檬酸,异构、脱氢、脱羧生成a-酮己二酸,转氨,末端羧基还原成半醛,经酵母氨酸转氨生成赖氨酸。
(二)天冬氨酸类型1. 天冬氨酸:由谷草转氨酶催化合成。
2. 天冬酰胺:由天冬酰胺合成酶催化,谷氨酰胺提供氨基,消耗一个ATP 的两个高能键。
氨基酸代谢—氨基酸的生物合成(生物化学课件)
二、转氨基作用
(一)天冬氨酸的生物合成
葡萄糖经酵解途径生成丙酮酸,丙酮酸经CO2的固定和氧化脱 羧进入三羧酸循环,生成草酰乙酸,草酰乙酸接受由谷氨酸转来 的氨基形成L-天冬氨酸。
(二)天冬酰胺的生物合成
天冬氨酸的β-羧基上转移一个谷氨酰胺的酰胺 基而生成天冬酰胺。
三、氨基酸间的相互转化
除了通过氨基化作用和转氨基作用生成其他氨基酸外,生物体还可以在 由α-酮酸还原氨基酸生成的氨基酸的基础上,通过碳链上的变化直接合成另 外一些氨基酸。
由于氨基酸在代谢过程中的相互转化,使
生物体内时,可以通过转 化来重新达到平衡。
一、α-酮戊二酸衍生类型:谷氨酸族
TCA循环 -酮戊二酸
谷氨酸
谷氨酰胺 脯氨酸 精氨酸
α-酮戊二酸衍生型可合成谷氨酸、谷氨酰胺、脯氨酸和精 氨酸等非必需氨基酸。
二、草酰乙酸衍生类型:天冬氨酸族
TCA循环
草酰乙酸 天冬氨酸
天冬酰胺 甲硫氨酸 苏氨酸 赖氨酸
异亮氨酸
天冬氨酸族 草酰乙酸衍生型可合成L-天冬氨酸、天冬酰胺、甲硫氨酸、 苏氨酸、赖氨酸、异亮氨酸。
三、丙酮酸衍生类型:丙酮酸族
糖酵解
丙酮酸
丙氨酸 缬氨酸
亮氨酸
丙酮酸族 以丙酮酸为起始物可合成L-丙氨酸、L-缬氨酸、L-亮氨酸。
四、甘油酸-3-磷酸衍生类型:丝氨酸族
糖酵解
甘油酸-3-磷酸
丝氨酸
甘氨酸
半胱氨酸
丝氨酸族 由甘油酸-3-磷酸为起始物,可合成丝氨酸、甘氨酸、半胱氨酸。
五、赤藓糖-4-磷酸和烯醇丙酮酸磷酸衍生类型:芳香族
氨基酸生物 合成的类型
氨基酸的生物合成
N2 NH3
反硝化作用
异化作用 分解代谢
NO3-
绝大多数植 物及微生物
氨基酸 核苷酸 叶绿素
生物合成
分解代谢
有机界
蛋白质 DNA、RNA 多糖 脂类
生物体利用3种反应途径把氨转化为有机 化合物,这些有机物进一步合成氨基酸。
1、氨甲酰磷酸合成酶催化CO2(以HCO3-的形式) 及ATP合成氨甲酰磷酸,通过尿素循环合成精氨酸。 2、谷氨酸脱氢酶催化-酮戊二酸还原、氨化,生 成谷氨酸。
从谷氨酸经转氨作用而来
氨基酸的生物合成的碳架来源
(1)非必需氨基酸的生物合成
a、由α-酮酸氨基化生成 b、由某些非必需氨基酸转化而来 c、由某些必需氨基酸转变而来
(2)各族氨基酸的前体及相互关系
非 必 需 氨 基 酸 的 生 物 合 成
种 氨 基 酸 的 前 体 及 相 互 关 系
丝氨 酸族
His 和 芳香族
α-酮戊二酸
转氨酶
α-酮酸
氨基酸
谷氨酰胺合成酶是催化氨转变为有机含氮物的主要酶
(普遍) 由α-酮戊二酸形成谷氨酰胺和谷氨酸的关系图
3、由谷AA
精AA
4、由谷AA
脯AA
5、L-赖氨酸的生物合成
L赖氨酸的生物合成在不同生物有完全不同的
两条途径。覃类(和眼虫)L-赖氨酸的合成
以-酮戊二酸为起始物。细菌和绿色植物则是
丙氨 酸族
天冬氨 酸族 谷氨酸族
三、氨基酸生物合成的调节
(一)通过终端产物对氨基酸生物合成的抑制
1、简单的终端产物抑制
2、不同终端产物对共经合成途径的协同抑制
3、不同分支产物对多个同工酶的特殊抑制——酶的多重性抑制
氨基酸生物合成汇总
★在谷氨酰胺合成酶催化下,谷氨酸合成谷氨酰胺.
1、氨甲酰磷酸的合成
= NH3+CO2+2ATP+H2O - =
氨甲酰磷酸合成酶I Mg2+
O O N2H-C-O-P-O- +2ADP+Pi O
2、α-酮戊二酸还原、氨基化为谷氨酸
在谷氨酸脱氢酶催化下,将α-酮戊二酸还原、氨化为谷氨酸 COO氨 │ NAD(P)H+H+ NAD(P)+ C=O │ CH2 │ 谷氨酸脱氢酶 CH2 │ COOCOO│ H3N— C—H │ CH2 │ CH2 │ COO-
2、脂肪酸家族氨基酸的合成途径:
3、芳香族氨基酸合成途径
1)赤藓糖-4-磷酸和烯醇式丙酮酸磷酸衍生类型 2)组氨酸生物合成
1.氨基酸生物合成的分族情况
2.二十种氨基酸的生物合成概况
二、脂肪族氨基酸的生物合成
◇ (一)谷氨酸族氨基酸的生物合成
◇ (二)天冬氨酸族的生物合成
◇ (三)丙酮酸族的生物合成
氨基酸及其重要衍生物 的生物合成
◇ 一、概论 ◇ 二、脂肪族氨基酸的生物合成
◇ 三、芳香族氨基酸的生物合成
◇ 四、氨基酸生物合成的调节 ◇ 五、氨基酸转化为其他氨基酸及其代谢物
一、氨的同化作用 通过生物固氮把N2转变为氨,氨是合成氨基酸所需氨基的 主要来源,氨也可用于合成其他含氮的生物分子.生物体 把氨转变为有机含氮化合物有3条途径.分别是: ★在氨甲酰磷酸合成酶催化下,利用氨和CO2合成氨甲酰磷 酸. ★在谷氨酸脱氢酶催化下,α-酮戊二酸还原氨基化为谷氨酸.
(二)按碳骨架的来源氨基酸的合成可分为:
1、α-酮戊二酸衍生物型(谷氨酸型)
生物环境中氨基酸的生物合成和合成途径
生物环境中氨基酸的生物合成和合成途径生物界中,氨基酸是一种重要的营养物质,是构成蛋白质的基本单位。
氨基酸的生物合成过程,既涉及到物质的转化也涉及到能量的转移,是非常复杂的生物化学反应过程。
本文将简要介绍氨基酸的生物合成和合成途径。
1. 氨基酸的生物合成氨基酸是人体必需的营养物质,除了必需氨基酸外,其他氨基酸可以通过转化合成生成。
氨基酸的合成通常是在蛋白质降解和代谢途径中完成,而氨基酸的合成通常是由其他代谢物质经过途径杂合生成。
在真核生物体内,氨基酸代谢是一个复杂的途径网络,包含氨基酸的合成、降解、转化和转运等过程。
氨基酸合成主要有两种途径,即格林-紫杉醇途径和逆转录糖途径。
2. 格林-紫杉醇途径格林-紫杉醇途径是通向氨基酸生物合成的主途径之一,也是氨基酸生物合成的主要途径之一。
该途径产生的氨基酸是非必需氨基酸,包括丝氨酸、蘖氨酸、甘氨酸、谷氨酸和组氨酸等。
该途径的过程包括多种酶催化反应,其中主要的反应包括:(1)磷酸巴塞吡啶转移酶催化磷酸核糖清除酶和5-磷酸核糖转移酶转化成5-磷酸巴塞吡啶核苷酸。
(2)5-磷酸巴塞吡啶转换成L-核糖-5-磷酸巴塞吡啶。
该步骤由多种酶催化,包括PrtM催化将ATP转换成AMP和PPi,以及GlnBMT催化ATP和L-谷氨酰胺形成L-谷氨酰胺羧甲基酯。
(3)L-核糖-5-磷酸巴塞吡啶将L-组氨酸分别转化成L-组氨酸和L-蘖氨酸,通过分别形成2-氨基-3-酮丙酸和3-氨基-2-羟丁酸。
3. 逆转录糖途径逆转录糖途径是另一种通向氨基酸生物合成的途径,也是氨基酸合成的主要途径之一。
逆转录糖途径产生的氨基酸是非必需氨基酸,包括丙氨酸、酪氨酸和色氨酸等。
该途径的过程包括多种酶催化反应,其中主要的反应包括:(1)第一步是L-糖基酮酸转换成L-谷氨酰胺。
该步骤由多种酶催化,包括Dao和PhnY等催化酶。
(2)第二步是L-谷氨酰胺分别将赖氨酸、蛋氨酸和色氨酸等转化成对应的氨基酸。
4. 结论氨基酸生物合成是一项复杂的生物化学反应过程,在生物体内通过多种途径和酶催化完成。
最新氨基酸的生物合成知识讲解
站”, Glu
其它AA。
{ ❖ 氨基酸的合成 有C架( α-酮酸) 有AA提供氨基(最主要为谷AA)
(一) 谷氨酸族氨基酸的合成
▪ 包括:谷AA(Glu)、谷氨酰胺(Gln)、脯(Pro)、 羟脯(Hyp)、精(Arg) 赖氨酸(lys)
▪ 共同碳架:TCA中的α-酮戊二酸
1、由α-酮戊二酸形成谷氨酸
COOH CHO
乙醛酸
COOH
+ CH2
CH2 CHNNH2
+
CH2 CH2
甘AA
C=O
COOH
α-酮戊二酸
2
-
-
COOH H2O
CH NH 甘氨酸脱羟酶
2
2 丝氨酸羟甲基转移酶
甘AA
COOH CHNH2 CH2OH
+NH3+CO2
+2H+
+
2e-
丝AA
NH3
同化作用 生物合成
氨基酸
核苷酸
叶绿素
反硝化作用
异化作用 分解代谢
NO3-
绝大多数植 物及微生物
生物合成
有机界
蛋白质 DNA、RNA 多糖 脂类
分解代谢
生物体利用3种反应途径把氨转化为有机 化合物,这些有机物进一步合成氨基酸。
1、氨甲酰磷酸合成酶催化CO2(以HCO3-的形式) 及ATP合成氨甲酰磷酸,通过尿素循环合成精氨酸。 2、谷氨酸脱氢酶催化-酮戊二酸还原、氨化,生 成谷氨酸。 3、谷氨酰胺合成酶催化谷氨酸,转化为谷氨酰胺。
(谷氨酸族)
(天冬氨酸族)
糖酵解
甘油酸-3-磷酸
丙酮酸
丝氨酸
半胱氨酸
甘氨酸
13氨基酸合成共44页
L-谷氨酸的生物合成
L-谷氨酰胺的生物合成
谷氨酰胺合成酶的共价修饰,12个 单体可以被逐步腺苷酸化而失活。
细菌谷氨酰胺 合成酶的结构: (a) 十二聚体由 两个六聚体组 成。 (b)谷氨酰 胺合成酶的分 子结构。
循环串联系统调控谷氨 酰胺合成酶的共价修饰
谷氨酰胺合成酶的 反馈抑制别购调控
L-脯氨酸的生物合成
豆科植物的早期结瘤素基因与根瘤的早期形成有关,晚期 结瘤素基因表达多种酶和一些功能不清的结瘤素。
(六) 生物固氮的基因工程
1.使非豆科植物转变为固氮作物 (1)将豆科植物的结瘤基因导入其它作物,使其能够感染固
氮菌。 (2)改变根瘤菌的遗传结构,使其能够感染其它作物。 (3)将固氮基因导入非豆科植物。 由于固氮酶复合体对氧的抑制作用十分敏感,消耗大量的
胍基乙酸
(四) 卟啉,血红 素(Heme)的生物 合成
δ-aminolevulinate
synthase (main control target for heme biosynthesis)
α-氨基-β-酮基己二酸
胆色素原
δ-氨基-γ-酮戊酸
原卟啉
α-氨基-β-酮基己二酸
δ-氨基-γ-酮戊酸
谷氨酸半醛
细菌合成鸟氨酸的途径
氨基移换酶的作用机制
ห้องสมุดไป่ตู้ 氨甲酰磷酸合成酶 ,即NH3-依赖的 线粒体CPS同工酶
的作用机制。
鸟氨酸经 过尿素循 环生成瓜 氨酸和精 氨酸
高柠檬酸
顺-高乌头 酸
高异柠檬酸
α-氨基己酸-δ-半醛 6-腺苷基α-氨基己酸 酵母氨酸
α-氨基己二酸
α-酮己二酸
蕈类和眼虫L-赖氨 酸的生物合成途径
氨基酸生物合成分为6组
氨基酸生物合成分为6组
氨基酸生物合成是指生物体中氨基酸的合成过程,它为生物体提供了有机分子的重要原料。
此外,氨基酸生物合成也对其他生物体如蚕、昆虫、非离子表面活性剂等有所帮助。
根据氨基酸生物合成的特性,可以将它分为6组:
一、碱基异构化:碱基异构化是氨基酸生物合成的重要步骤,它是从碱基的异构形式转变成氨基酸的过程。
在该过程中,碱基被分解为不同的异构形式,然后经过组装而成氨基酸。
二、羧基异构化:羧基异构化是指从羧基的异构形式转变成氨基酸的过程。
在该过程中,羧基会被分解为不同的异构形式,然后再经过组装而成氨基酸。
三、氨基酸合成:氨基酸合成是指从氨基酸的异构形式转变成氨基酸的过程。
在该过程中,氨基酸会被分解为不同的异构形式,然后再经过组装而成氨基酸。
四、舌根酸转移反应:舌根酸转移反应是指将一种氨基酸转化为另一种氨基酸的过程。
在该过程中,舌根酸会被移动到一种氨基酸上,使得这种氨基酸发生变化,从而产生另一种氨基酸。
五、酶促反应:酶促反应是指通过酶的作用将一种物质转化为另一种物质的过程。
在氨基酸生物合成中,酶可以将一种氨基酸转化为另一种氨基酸。
六、烷基化反应:烷基化反应是指通过加入烷基来调整氨基酸的反应活性的过程。
在该过程中,一种氨基酸会被烷基化,从而使之产生另一种氨基酸。
以上就是氨基酸生物合成分为6组的详细介绍,氨基酸生物合成是一个复杂的过程,各个步骤都相互关联,只有当它们良好协作时,才能保证合成氨基酸的质量。
所以,在进行氨基酸生物合成时,应该遵循正确的步骤,并注意控制反应的条件,以确保合成的氨基酸质量达到最佳。
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氨基酸的生物合成[整理版]第九章氨基酸的生物合成第一节氮循环氮是组成生物体的重要元素。
自然界中的不同氮化物相互转化形成氮循环。
生物界的氮代谢是自然界氮循环的主要因素。
第一步:固氮作用,将氮气还原为氨。
可工业固氮和生物固氮完成,自然界中由固氮生物固氮酶完成的分子氮向氨的转化约占总固氮的三分之二,由工业合成氨或其他途径合成的氨只有三分之一。
第二步:硝化作用,将氨转化为硝酸盐。
在土壤中含量丰富的硝化细菌进行着氧化氨形成硝酸盐的过程,因此土壤中几乎所有氨都转化成了硝酸盐。
第三步:成氨作用,将硝态氮转化为氨态氮。
植物体所需要的氮除了来自生物固氮外,绝大部分还是来自土壤中的氮,它们通过根系进入植物细胞。
然而硝态氮并不能直接被植物体利用来合成各种氨基酸和其他有机氮化物,必须先转变成为氨态氮。
第四步:同化作用,氨经谷氨酰胺合成酶和谷氨酸合成酶同化为谷氨酸。
这些有机氮化合物可随食物或饲料进入动物体内,转变为动物体的含氮化合物。
第五步:分解作用,各种动植物遗体及排泄物中的有机氮经微生物分解作用,形成无机氮。
这样,在生物界,总有机氮和总无机氮形成了一个平衡。
第二节固氮作用1、大气固氮:闪电和紫外辐射固定氮约占总固氮量的15%。
2、工业固氮:氮气中的氮氮三键十分稳定,1910年提出的作用条件在工业氮肥生产中一直沿用至今。
500?高温和30MPa条件下,用铁做催化剂使氢气还原氮气成氨。
约占总固氮量的25%。
3、生物固氮:是微生物、藻类和与高等植物共生的微生物通过自身的固氮酶复合物把分子变成氨的过程。
自然界通过生物固氮的量可达每年100亿公斤。
约占地球上的固氮量的60%。
固氮生物的类型有自生固氮微生物和共生固氮微生物。
前者如鱼腥藻、念球藻,利用光能还原氮气,好气性固氮菌利用化学能固氮;后者如与豆科植物共生固氮的根瘤菌,其专一性强,不同的菌株只能感染一定的植物,形成共生的根瘤。
在根瘤中植物为固氮菌提供碳源,而细菌利用植物提供的能源固氮,为植物提供氮源,形成一个很好的互利共生体系。
生物固氮所需条件:一是有充分的ATP供应,二是需要很强的还原剂,三是需要厌氧环境。
第三节氨基酸的生物合成1、丙氨酸族包括丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸。
它们共同碳架来源是糖酵解生成的丙酮酸。
2、丝氨酸族包括丝氨酸、甘氨酸、半胱氨酸。
3、谷氨酸族包括谷氨酸、谷氨酰胺、脯氨酸、精氨酸。
它们的碳架都是来自三羧酸循环的中间产物ɑ,酮戊二酸。
4、天冬氨酸族包括天冬氨酸、天冬酰胺、赖氨酸、苏氨酸、异亮氨酸和蛋氨酸。
它们的碳架都三羧酸循环的中间产物草酰乙酸或延胡索酸。
5、组氨酸和芳香氨基酸族包括组氨酸、酪氨酸、色氨酸和苯丙氨酸。
第四节个别氨基酸的代谢由于每一个氨基酸的碳链部分的结构不同,因此除上述一般代谢途径外,尚有其特殊的代谢途径,一般讲,非必需氨基酸较简单,而必需氨基酸较复杂。
现分四类加以讨论:一碳单位、含硫氨基酸、支链氨基酸、芳香族氨基酸。
一、碳单位的代谢(一) 概念机体在合成嘌呤、嘧啶、肌酸、胆碱等化合物时,需要某些氨基酸的参这些氨基酸可提供含一个碳原子的有机基团,称为一碳单位与,(one carbon group)或一碳基团。
体内的一碳单位有五种:甲基(-CH,methyl), 甲烯基3 (-CH-,methylene), 甲炔基(-C=,methemyl), 甲酰基(-CHO,formyl)和亚氨甲2 基(-CH=NH,forminino)。
凡是这种涉及到一个碳原子有机基团的转移和代谢的反应,统称为一碳单位代谢。
一碳单位不能以游离形式存在,常与四氢叶酸(tetrahydrofolic acid,FH)结合在一起转运,参与代谢。
因此,FH是一碳单位的载体,也可44 以看作是一碳单位代谢的辅酶。
一碳单位与FH结合后成为活性一碳单位,参4 与代谢,尤其在核酸的生物合成中占重要地位。
一碳单位与FH结合的位点在4 510FH的N和N上。
4(二) 来源及互变一碳单位来自丝氨酸、甘氨酸、甲硫氨酸、色氨酸和组氨酸的分解代谢。
510甘氨酸在甘氨酸裂解酶系催化下裂解生成N,N-甲烯四氢叶酸、NH和3CO 等。
25甲硫氨酸的甲基可以转移到FH上生成N-CHFH,不过FH并非活性甲基4344的惟一载体,体内更重要的活性甲基载体是S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosyl-methionine,SAM)。
一碳单位不仅是甲硫氨酸合成时甲基的供给者,更重要的是合成嘌呤的原料之一。
故一碳单位在核酸生物合成中占有重要地位。
正如乙酰辅酶A在联系糖、脂和蛋白质代谢中所起的枢纽作用一样,一碳单位在氨基酸和核酸代谢方面起重要的联接作用。
二、含硫氨基酸的代谢(一) 甲硫氮酸和转甲基作用甲硫氨酸是体内重要的甲基供体,但必须先转变成它的活性形式SAM,才能供给甲基。
已知体内约有50多种物质需要SAM提供甲基,生成甲基化合物,如;SAM 在体内参与合成许多重要的甲基化合物肌酸、肾上腺素、胆碱等。
核酸或蛋白质通过甲基化进行修饰,可以影响它们的功能。
此外,一些活性物质经甲基化后,又可消除其活性或毒性,是生物转化的一种重要反应,因此,甲基化作用不仅是重要的代谢反应,更具有广泛的生理意义,而SAM则是体内最重要的甲基直接供体。
5甲硫氨酸是必需氨基酸,虽然在体内同型半胱氨酸得到从N—甲基FH4所携带的甲基后可以生成甲硫氨酸,但体内并不能合成同型半胱氨酸,它只能由甲硫氨酸转变而来,故甲硫氨酸必须由食物供给。
不过通过甲硫氨酸循环可以使甲硫氨酸在供给甲基时得以重复利用,起了节约一部分甲硫氨酸的5作用。
从甲硫氨酸循环可见,N-甲基FH可看成是体内甲基的间接供体。
4 5甲硫氨酸循环的生理意义是甲硫氨酸的再利用。
在此反应中,因N-甲基5FH同型半胱氨酸转甲基酶的辅酶是甲基维生素B,故维生素B缺乏时,N-41212甲基FH的甲基不能转移,不仅影响了甲硫氨酸的合成,同时由于已结合了甲4基的FH不能游离出来,无法重新利用以转运一碳单位,如此,可导致DNA合4 成障碍,影响细胞分裂,最终可能引起巨幼红细胞贫血。
在体内, 甲硫氨酸还参与了肌酸的合成, 后者和ATP反应生成的磷酸肌酸是体内ATP 的储存形式。
(二) 半胱氨酸及胱氨酸的代谢1、半胱氨酸含巯基(-SH),胱氨酸含二硫键(-S-S-)。
两分子半胱氨酸可氧化生成胱氨酸,胱氨酸亦可还原成半胱氨酸。
两个半胱氨酸分子间所形成的二硫键在维持蛋白质构象中起着很重要的作用。
在蛋白质化学一章中已述及,体内许多重要的酶,如乳酸脱氢酶、琥珀酸脱氢酶等都有赖于分子中半胱氨酸残基上的巯基以表现其活性,故有巯基酶之称,某些毒物,如重金2+2+属离子Pb、Hg等均能和酶分子上的巯基结合而抑制酶活性,从而发挥其毒性作用。
二硫基丙醇可使已被毒物结合的巯基恢复原状,具有解毒功能。
2、半胱氨酸可经氧化、脱羧生成牛磺酸,是结合胆汁酸的组成成分。
3、谷胱甘肽(glutathione,GSH)是由谷氨酸分子中的 -羧基与半胱氨酸及甘氨酸在体内合成的三肽,它的活性基团是半胱氨酸残基上的巯基。
GSH有还原型和氧化型两种形式可以互变。
GSH在维持细胞内巯基酶的活性和使某些物质处于还原状态(例如使高铁血红蛋白还原成血红蛋白)时本身被氧化成GS-SG,后者可由细胞内存在的谷胱甘肽还原酶使之再还原成GSH,NADPH为其辅酶。
此外,红细胞中的GSH还和维持红细胞膜结构的完整性有关,若GSH显著降低则红细胞易破裂。
在细胞内,GSH,GS-SG的比例一般维持在100,1左右。
4、半胱氨酸在体内进行分解代谢可以直接脱去巯基和氨基,产生丙酮酸、氨和硫化氢,硫化氢被迅速氧化成硫酸根。
在体内生成的硫酸根,一部分可以无机硫酸盐形式随尿排出,一小部分则可经活化转变成“活性硫酸根”,即3'-磷酸腺苷5'-磷(3'—phosphoadenosine-5'phosphosulfate,PAPS),这一转变过程需要ATP 的参与。
PAPS性质活泼,可以提供硫酸根与某些物质合成硫酸酯,例如;类固醇激素可形成硫酸酯形式而被灭活。
PAPS还可参与硫酸软骨素的合成。
三、支链氨基酸的代谢支链氨基酸包括缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸,它们都是必需氨基酸,均主要在肌肉、脂肪、肾、脑等组织中降解。
因为在这些肝外组织中有一种作用于此三个支链氨基酸的转氨酶,而肝中却缺乏。
在摄入富含蛋白质的食物后,肌肉组织大量摄取氨基酸,最明显的就是摄取支链氨基酸。
支链氨基酸在氮的代谢中起着特殊的作用,如在禁食状态下,它们可给大脑提供能源。
支链氨基酸降解的第一步是转氨基, -酮戊二酸是氨基的受体。
缬、亮、异亮氨基酸转氨后各生成相应的,-酮酸,此后,在支链,-酮酸脱氢酶系的催化下氧化脱羧生成各自相应的酰基CoA的衍生物,反应类似于丙酮酸和,-酮戊二酸的氧化脱羧。
肌肉组织中的,-酮戊二酸在接受支链氨基酸的氨基后转变成谷氨酸,然后谷氨酸又可与肌肉中的丙酮酸经转氨作用又回复生成,-酮戊二酸和丙氨酸,丙氨酸经血液运送至肝脏参与尿素合成和糖异生作用,即参加葡萄糖-丙氨酸循环。
四、芳香族氨基酸的代谢芳香族氨基酸包括苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸。
(一)苯丙氨酸及酪氨酸的代谢苯丙氨酸和酪氨酸的结构相似。
苯丙氨酸在体内经苯丙氨酸羟化酶(phenylalanine hydroxylase)催化生成酪氨酸,然后再生成一系列代谢产物。
苯丙氨酸羟化酶存在于肝脏,是一种混合功能氧化酶,该酶催化苯丙氨酸氧化生成酪氨酸,反应不可逆,亦即酪氨酸不能还原生成苯丙氨酸,因此,苯丙氨酸是必需氨基酸而酪氨酸是非必需氨基酸。
若苯丙氨酸羟化酶先天性缺失,则苯丙氨酸羟化生成酪氨酸这一主要代谢途径受阻,于是大量的苯丙氨酸走次要代谢途径,即转氨生成苯丙酮酸,导致血中苯丙酮酸含量增高,并从尿中大量排出,这即是苯丙酮酸尿症(phenylketonuria,PKU),苯丙酮酸的堆积对中枢神经系统有毒性,使患儿智力发育受障碍,这是氨基酸代谢中最常见的一种遗传疾病,其发病率约为8,10,10万,患儿应及早用低苯丙氨酸膳食治疗。
PKU现在已可进行产前基因诊断。
酪氨酸的进一步代谢涉及到某些神经递质、激素及黑色素的合成。
如酪氨酸是合成儿茶酚胺类激素(去甲肾上腺素和肾上腺素)及甲状腺素的原料。
酪氨酸在体内可以合成黑色素,若合成过程中的酶系先天性缺失则不能合成黑色素,黑色素合成障碍,皮肤、毛发等发白,称为白化病(albnism),发病率约为3,10万。
酪氨酸还可转氨生成对羟苯丙酮酸,再转变成尿黑酸,最后氧化分解生成乙酰乙酸和延胡索酸,所以酪氨酸和苯丙氨酸都是生糖兼生酮氨基酸。
若有关尿黑酸氧化的酶系先天性缺失,则尿黑酸堆积,使排出的尿迅速变黑,出现尿黑酸症(alkaptonuria),此遗传疾病较罕见,发病率约仅为0(4,10万。