酵母双杂交操作步骤(中文翻译)
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(酵母菌储存在-70℃中,引物和质粒DNA储存在-20℃中)
概念:
1. 次序转化:指的是先将一种质粒转化进酵母中(常是DNA-BD/bait plasmid),在选择培养基中选择出阳性克隆,之后再将另外一个质粒(AD fusion library)转化进去。优点:就是比共转化使用更少的质粒DNA,也就是节约质粒DNA。
2. 共同转化:将两种质粒一起转化进酵母中。优点:比次序转化更容易操作。
pGBKT7----的选择物是:kanamycin(卡那霉素)?
pGADT7----的选择物是:ampicillin (氨苄西林) ?
各种SD培养基:
1)SD/-ade(腺嘌呤)/-leu(亮氨酸)/-trp(色氨酸)/-his (组氨酸)(1000 ml) (?
“四缺”)
酵母氮源(YNB):6.7g ;
-ade/-leu/-trp/-his DO supplement 0.60g (购买来就配好的) ;
葡萄糖 20g (即2%)
2)SD/-leu/-trp/-his (1000 ml)
酵母氮源(YNB):6.7g ;
-leu/-trp/-his DO supplement 0.62g ; (购买来就配好的)
葡萄糖 20g. (即2%)
3)SD/-leu/-trp (1000 ml) (?“二缺”)
酵母氮源(YNB):6.7g ;
-ade/-leu/-trp/-his DO supplement 0.64g (购买来就配好的);
葡萄糖 20g (即2%)
4)SD/-leu (1000 ml)
酵母氮源(YNB):6.7g ;
-leu DO supplement 0.69g ; (购买来就配好的)
葡萄糖 20g (即2%)
5)SD/-trp (1000 ml)
酵母氮源(YNB):6.7g ;
-ade/-leu/-trp/-his DO supplement 0.74g ; (购买来就配好的)
葡萄糖 20g (即2%)
注意:YNB有两种,一种含有硫酸胺,另外一种不含硫酸胺。我们这用的是含硫酸铵的。(买来就加进去了的)。如果不含硫酸铵,那么要在终浓度0.17%的YNB中再加入0.5%的硫酸铵,即最终在1000 ml溶液中加入总量为6.7g的YNB与硫酸铵。
实际配制的方法是:
1.配制40%的葡萄糖贮存液(贮存在4℃),过滤除菌,待高压灭菌的溶液温度降至55℃
以下时,再将50ml葡萄糖贮存液加入。(过滤即可使用)
2.酵母氮源6.7g,加DO supplement 在920ml水中溶解,调PH至5.8(大约加10M NaOH
200ul即可),之后补水至950 ml。
3.高压完后待温度降至55℃以下,加入50 ml40%葡萄糖。
YPD培养基(1000 ml)
20 g/L 蛋白胨
10 g/L 酵母提取物
20 g/L 琼脂(只有制作平板才用)
20 g/L 葡萄糖 (即2%)
1x YPDA培养基(1000 ml)
20 g/L 蛋白胨
10 g/L 酵母提取物
0.03 g/L 腺嘌呤(即终浓度为0.003%)腺嘌呤可以耐受高温
20 g/L 葡萄糖 (即2%)
实际配制的方法是:
1.配制40%的葡萄糖贮存液(贮存在4℃),过滤除菌,待高压灭菌的溶液温度降至55℃
以下时,再将50ml葡萄糖贮存液加入。(李博士经验这一步不高压,过滤即可使用)2.配制0.2%的腺嘌呤溶液,过滤除菌,待高压灭菌的溶液温度降至55℃以下时,再将15ml
腺嘌呤溶液加入。(或将腺嘌呤直接加进去,为了方便我将直接加进去一起高压)
3.(蛋白胨 20g ;酵母提取物10g ;水大约925ml)混合后,调至PH至6.5,加水至935ml,
121℃高压15min。
注意:
◆高压的温度和时间不能太长与太高,121℃高压15min即可。
◆可以在YPDA中加入20 g/L的琼脂,以配成平板。
◆需要加kanamycin时,kan终浓度是10–15 mg/L。(kanamycin可以20℃贮存一个月,
加入到平板中去可以4℃贮存一个月。)
PEG/LiAc溶液(即配即用)
用下列贮存液来配制
50% PEG 3350:用灭菌水配,如需要可以加热至50℃以助溶。
10X TE buffer:用灭菌水配,如需要可以加热至50℃以助溶。
10X LiAc:用灭菌水配,如需要可以加热至50℃以助溶。
最后配成PEG/LiAc溶液是:(以10ml为例)
终浓度为配制10mlPEG/LiAc需要加入的物质
PEG 4000 40% 8 ml of 50% PEG
TE buffer 1X 1 ml of 10X TE
LiAc 1X 1 ml of 10X LiAc
无菌1x TE/LiAc溶液(用10x已灭菌的贮存液稀释)
10x TE buffer :0.1 M Tris-HCl, 10 mM EDTA, pH 7.5(高压)
10x LiAc : 1 M 用稀醋酸调节PH至7.5 高压
For β-galactosidase 滤膜实验
Z buffer溶液:
Na2HPO4•7H2O 16.1 g/L (如换Na2HPO4•14H2O 则20.739 g/L)NaH2PO4•H2O 5.50 g/L (如换NaH2PO4•2H2O 则 6. 21g/L)
KCl 0.75 g/L
MgSO4•7H2O 0.246 g/L
最后调PH至7.0,高压,室温下可以贮存1年
X-gal 溶液:
X-GAL溶解于DMF(二甲基甲酰胺)中至浓度为20 mg/ml.,–20°C避光保存
Z buffer/X-gal 溶液:
100 ml Z buffer
0.27 ml β-mercaptoethanol (β-巯基乙醇)
1.67 ml X-gal 贮存液
ONPG 溶液:(即配即用)
ONPG溶于Z buffer中,终浓度4 mg/ml,调PH至7.0.
注意:
1.ONPG需要1~2h才能溶解
2.每次用之前新鲜制备。
带有β-巯基乙醇的Z buffer
将0.27 mlβ-巯基乙醇加入100 ml Z buffer中即可
为了转化成功的小提示:
1.用一个1~3周龄(直径2~3mm)的菌落去接种液体培养基。如果菌落直径<2mm,就用多几个菌落去接种。(也要大力涡旋使细胞团分散开来。)
2.如果过夜或者3hr之后的培养基明显成块,那么在使用之前一定要充分涡旋使培养基。
3.当通过离心收集细胞的时候,使用一个离心管即可,可以更好、更充分地收集细胞。
4.为了提高转化效率,要在1小时内准备酵母感受态细胞。如果有必要,可以在11步之后在室温条件下储存酵母感受态细胞几个小时,而活性却只有一点降低。
5.当进行通同转化的时候,诱饵(BD)质粒的量必须过度,而AD质粒的量要不足。