蛋白质芯片

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蛋白质芯片的综述

蛋白质芯片的综述

蛋白质芯片的综述摘要蛋白质芯片技术是一种高通量、微型化和自动化的蛋白质分析技术,已在多个领域得到应用,如蛋白质组学研究、新药的开发、酶与底物的相互作用和疾病检测等。

论文详细介绍了蛋白质芯片技术的原理、芯片介质及蛋白质的固定技术,论述了蛋白质芯片在肿瘤研究,食品检验的应用以及传染病检测中的研究概况。

分析了蛋白质芯片的问题以及应用前景。

关键词蛋白质芯片,肿瘤,食品检验,传染病检测,应用蛋白质芯片的研究工作起始于20世纪80年代,到90年代技术日趋成熟。

蛋白质芯片(protein chip)技术因具有高通量平行分析、信噪比较高、所需样品量少,以及可直接关联DNA序列和蛋白质信息等优点,自问世以来,已广泛应用于蛋白质组学、医学诊断学等领域研究,具有广阔的发展。

1.蛋白质芯片介绍1.1 技术原理蛋白质芯片是由固定于不同介质上的蛋白微阵列组成,这些蛋白包括抗原、抗体及标志蛋白,然后用标记的或未经标记的另外一个蛋白,如抗原、抗体或配体进行反应,有的需要经洗涤后再加入标记的二抗进行反应,从而达到放大抗原抗体反应的目的。

所用的标记物有荧光物质,如Cy3(青色素,一种荧光染料)和Cy5等;酶,如辣根过氧化物酶,化学发光物质等;其他分子,如免疫金标记,然后再进行银染对反应结果显色。

反应结果用扫描装置进行检测或用肉眼直接进行观察。

1.2 蛋白质芯片的介质目前作为蛋白芯片的介质有滤膜类、凝胶类和玻璃片类,前2种介质的优点是能够保持所固定的蛋白的三维结构,但缺点是由于其质地较软,所以不能满足机械点样的强度,同时凝胶类的蛋白质芯片所点样品容易发生扩散。

玻璃片的优点是成本低和性能稳定,可满足高强度的机械点样。

此外,20世纪90年代中期发展的液相芯片技术使蛋白芯片技术得到进一步提高。

其被喻为后基因组时代的芯片技术,也可称为灵活的多种被分析物质的检测( flexible multi-analyte profiling,xMAP)技术,xMAP技术是集流式技术、荧光微球、激光、数字信号处理和传统化学技术为一体的一种新型生物分子高通量检测技术,这种技术将流式检测与芯片技术有机地结合在一起,使生物芯片反应体系由固相反应改变为接近生物系统内部环境的完全液相反应体系,因此也被称为液相芯片技术[1]。

蛋白质芯片的研究与应用

蛋白质芯片的研究与应用

维普资讯
5 0
临 沂 师 范 学 院 学 报
第 2 9卷
的发 展 ,蛋 白质 组 学 的研 究 范 围 也在 不 断完 善 和 已成 为蛋 白质 组 研 究 中 的重要 部 分 和 巨大挑 战 ,蛋 白质 问相 互作 用 的研 究 也 已被 纳 入 蛋 白质 组 学 的研 究 范畴 [. 5 1
维普资讯
第2 9卷 第 3期
Vl . 2 0 1 9 NO. 3
临 沂 师 范 学 院 学 报
J u n l fLi y o m a nv riy o r a n i r l o N U ie st
20 0 7年 6月
J n. 2 07 u 0
1 . 统技 术 的 改造 和 新 技术 的产 生 . 3传 1
蛋 白质 研 究技 术 远 比单纯 基 因技 术 复 杂 和 困难 .不 仅 仅 是 因为 氨 基 酸残 基 种 类 远 多于 核 苷 酸 残 基 (04 ,而 且 蛋 白质 有 着 复 杂 的翻 译 后修 饰 , 磷 酸 化 和 糖 基 化 等 才 能 成 为有 功 能活 性 的蛋 白质 , 2/) 如 而 且 蛋 白质 的变 化 多 ,使 分离 和 分析 蛋 白质 的难 度 增 大 .此 外 ,通 过 表达 载 体 进 行 蛋 白质 的体 外 扩 增 和 纯 化 制 备大 量 的蛋 白质 并 非 易事 . 因此 , 展 高 通 量 、 灵 敏度 、 发 高 高准 确 性 的研 究 技 术平 台是 现
(ici ) 术 . bohp 技 1. . 2蛋 白质 组学 的发 展 1
蛋 白质 本 身有 其特 殊 的 活 动 规 律 ,随 着 生 命 活 动 的进 程 表 现 出动 态 的紧 密 协 调 变 化 ;蛋 白质 在 合 成 后 具有 相对 独 立 的修 饰 、运 转 和 相 互 作 用 能力 ;同时 还 具 有 对 外 界 因素 发 生 反 应 的能 力 .况 且 基 因 的主 要 功 能 也 是通 过其 表 达 产 物 一 蛋 白质 来 实现 的 . 传 统 的 对 单个 蛋 白质进 行 研 究 的 方 式 已经 无 法 满 足 后 基 因组 时 代 的要 求 .这 是 因为 :① 生物 现

蛋白质芯片在临床中的应用

蛋白质芯片在临床中的应用

一蛋白质芯片技术的原理蛋白质芯片定义蛋白质芯片又可以称为蛋白质微阵列,是指高密度的蛋白质阵列,是蛋白质阵列的发展,通常在几平方厘米的面积上可以包含几万个不同的蛋白质质点,用于蛋白质特定分析。

蛋白质芯片的原理蛋白质芯片是根据实验的目的选择特定的蛋白质按照有序的顺序固定在玻片、凝胶、微孔板等各种载体上形成的密集蛋白质阵列,就好比现在军人按照某种战斗序列列成的方阵。

然后利用芯片上蛋白质与特定蛋白质抗体或其他成分相互作用,经过漂洗等一系列处理得到所需的结果,然后利用荧光分析或激光聚焦扫描等手段对结果进行分析,得到所需要的数据。

蛋白质芯片的发展历史当人们对生物分子的研究进入基因水平阶段后,人们迫切的需要知道基因的特定排列及此种排列会长生何种作用结果、生命活性,很多新的技术应运而生,生物芯片技术就是其一,其起步阶段有很大不方便及缺点,但是随着进入后基因组时代后,生物芯片技术不断完善,已经被运用到生命科学的各个领域,然而对基因的研究不能很好的实现对细胞功能的了解,众所周知,细胞的生命活动的主要体现着及执行者是各种功能结构蛋白,因此对蛋白质序列功能的分析变成了最重要的研究方向。

人们根据对基因芯片的发展提出了蛋白质芯片的概念及尝试,进而出现的蛋白质芯片技术。

蛋白质芯片的分类根据用途的不同蛋白质芯片可以分为蛋白质功能芯片,进行蛋白质-蛋白质,蛋白质-DNA,蛋白质-RNA,蛋白质-酶等功能的研究;蛋白质检测芯片,识别检测样品中目标多肽、蛋白质、抗原。

根据芯片表面化学成分不同可以分为化学表面芯片:疏水芯片、亲水芯片、弱阳离子交换芯片、强阴离子交换芯片等;生物表面芯片:抗体-抗原芯片、受体-配体芯片、DNA-蛋白质芯片等。

根据载体不同可以分为玻璃载体芯片、多孔凝胶覆盖芯片、微孔芯片。

蛋白质芯片的特点可以直接用于粗生物样品进行分析,不需要像基因芯片那样进行序列分析;可以发现多个生物标记,因为蛋白质微阵列排列紧密,可以同时进行多个目的的测定;特异性高,具有较强的针对性等。

蛋白质芯片技术介绍

蛋白质芯片技术介绍

principle is make various proteins orderly fixed on all
kinds of medium carrier(介质载体) as a test
chip.And then, using the tag antibodies(抗体) that
are specified by the fluorescent(荧光) substance
在同一系统中集发现和检测为一体——利用单克隆抗体芯片,鉴定未知抗 原/蛋白质,以减少测定蛋白质序列的工作量。
8.It can quantitatively use monoclonal antibody chip,.As a result of that the combination to chip antibody is quantitative, it can be used to measure quantity of antigen.
Then comes the protein chip
The protein chip(蛋白芯片) technology is
quickly developed
in recent years in chemical
biology as a high and new technology.It is the basic
Functional protein microarrays (also known as target protein arrays) are constructed by immobilising large numbers of purified proteins and are used to ideantify protein-protein, protein-DNA, protein-RNA, protein-phospholipid, and proteinsmall molecule interactions, to assay enzymatic activity and to detect antibodies and demonstrate their specificity. They differ from analytical arrays in that functional protein arrays are composed of arrays containing full-length functional proteins or protein domains. These protein chips are used to study the biochemical activities of the entire proteome in a single experiment.

蛋白芯片法igg

蛋白芯片法igg

蛋白芯片法(IgG)1. 引言蛋白芯片法(IgG)是一种用于检测和研究蛋白质相互作用的技术。

在生物医学研究和临床诊断中,蛋白质相互作用扮演着重要的角色。

蛋白芯片法(IgG)通过将多种蛋白质固定在芯片上,并利用抗体与特定蛋白质相互作用的原理,实现对蛋白质相互作用的高通量分析。

本文将详细介绍蛋白芯片法(IgG)的原理、应用、优势和局限性,并展望其未来的发展方向。

2. 原理蛋白芯片法(IgG)的原理基于蛋白质的特异性相互作用。

首先,在芯片上固定多种蛋白质,可以使用不同的方法,如化学交联、光化学固定等。

然后,将待测的样品(如血清或细胞提取物)与芯片上的蛋白质相互作用。

最后,使用特异性的抗体来检测与待测样品中的蛋白质结合的蛋白质。

具体而言,蛋白芯片法(IgG)通常分为两个步骤:蛋白芯片制备和蛋白质检测。

•蛋白芯片制备:选择需要固定在芯片上的蛋白质,将其固定在芯片上的特定位置。

可以使用化学交联、光化学固定等方法实现蛋白质的固定。

•蛋白质检测:将待测样品与固定在芯片上的蛋白质相互作用,使待测样品中的蛋白质与芯片上的蛋白质结合。

然后,使用特异性的抗体来检测与待测样品中的蛋白质结合的蛋白质。

最常用的检测方法是荧光标记的二抗法,其中荧光标记的二抗与特异性抗体结合,形成荧光信号。

通过检测荧光信号的强度,可以确定蛋白质的相互作用。

3. 应用蛋白芯片法(IgG)在生物医学研究和临床诊断中具有广泛的应用。

以下是蛋白芯片法(IgG)的一些主要应用领域:3.1 蛋白质相互作用研究蛋白质相互作用是生物体内许多重要生物过程的基础。

蛋白芯片法(IgG)可以高通量地检测和分析蛋白质相互作用,帮助研究人员深入了解蛋白质的功能和调控机制。

通过蛋白芯片法(IgG),可以筛选出与特定蛋白质相互作用的潜在配体或抑制剂,为新药开发提供重要线索。

3.2 疾病标志物筛选蛋白芯片法(IgG)可以用于筛选疾病标志物,即与特定疾病相关的蛋白质。

通过比较正常样品和疾病样品中蛋白质的相互作用模式和强度,可以鉴定出与疾病相关的蛋白质。

蛋白质芯片研究进展

蛋白质芯片研究进展

蛋白质芯片研究进展蛋白质芯片概述:蛋白质芯片的定义:蛋白质芯片, 又称蛋白质阵列或蛋白质微阵列,是指以蛋白质分子作为配基,将其有序地固定在固相载体的表面形成微阵列;用标记了荧光的蛋白质或其他它分子与之作用,洗去未结合的成分,经荧光扫描等检测方式测定芯片上各点的荧光强度,来分析蛋白之间或蛋白与其它分子之间的相互作用关系。

Telechem International Inc ArrayIt生物芯片的设想最早起始于80年代中期, 90年代美国Affymetrix公司实现了DNA探针分子的高密度集成,这是一项融微电子、微机械、化学、物理、计算机技术等于一体,是生物学技术与其它学科相互交叉和渗透的产物.生物芯片(B iochip)是指通过微电子、微加工技术在芯片表面构建的微型生物化学分析系统,以实现对细胞、DNA、蛋白质、组织、糖类及其他生物组分进行快速、敏感、高效的处理和分析DNA芯片与蛋白芯片最大的区别是靶分子和探针分子的结构差异相对于DNA 芯片, 蛋白质芯片技术面临更多困难。

第一, 相对于DNA 的碱基配对杂交机制, 蛋白质之间的相互作用呈现出更强的变化性。

而且, 蛋白质的活性以及相互作用的性质可能需要其它蛋白质的作用和翻译后修饰。

第二, 相对于PCR 技术这样可以大量扩增DNA 的技术, 尚未有可以大量扩增蛋白质的成熟技术。

第三, 蛋白质的表达和纯化工作十分艰巨, 而且经常不能保持蛋白质的完整功能。

最后, 许多蛋白质很不稳定, 给阵列制作本身带来很大的困难。

多数蛋白芯片通过接触印记合成,大于30 000 点的高密度阵列可以通过已有的DNA 的点样设备来实点间距为4. 5mm,点的直径250um,可以检测250nmol或l0Pg的待测蛋白质研究蛋白质芯片的意义1、蛋白质是基因表达的最终产物, 接近生命活动的物质层面;2、探针蛋白特异性高、亲和力强, 可简化样品前处理,甚至可直接利用生物材料(血样、尿样、细胞及组织等)进行检测;3、适合高通量筛选与靶蛋白作用的化合物;4、有助于了解药物或毒物与其效应相关蛋白质的相互作用。

蛋白质谱芯片

蛋白质谱芯片

蛋白质谱芯片
蛋白质谱芯片
一、介绍
随着科技的不断进步,人们对蛋白质的研究也变得更加深入。

作为生
命体中重要的组成部分,蛋白质的研究有着广泛的应用前景。

因此,
研究蛋白质的分析方法也是科学家们一直关注的重点方向。

而蛋白质
谱芯片也因此应运而生。

二、蛋白质谱芯片基础
蛋白质谱芯片是一种高通量蛋白质分析工具,被广泛应用于蛋白质组
分析、生物标志物筛选和药物筛选等方面。

该技术的核心是将多个蛋
白质分析分区固定在芯片上,并通过质谱技术进行快速且高效的分析。

蛋白质谱芯片技术基于微流控技术,具有高通量、快速、高灵敏度和
高精度的优势。

三、蛋白质谱芯片的应用
蛋白质谱芯片技术广泛应用于蛋白质组分析、蛋白质定量和筛选生物
标志物等领域。

它可以在很短的时间内完成大量蛋白质分析和筛选,
同时具有高通量和高灵敏度等优点,可以解决传统蛋白质分析存在的
一些问题,如低通量、低灵敏度和复杂样品分析等。

四、蛋白质谱芯片的优势和挑战
蛋白质谱芯片技术具有高通量、快速、高灵敏度和高精度等优势。


传统蛋白质分析方法相比,蛋白质谱芯片技术更快速、精准,同时还可以完成大量的蛋白质分析和筛选。

但是,蛋白质谱芯片技术的应用还面临着一些挑战,如制备技术和样品预处理等方面的问题。

五、结论
蛋白质谱芯片技术是一种高通量、快速、高灵敏度和高精度的蛋白质分析工具。

它被广泛应用于蛋白质组分析、生物标志物筛选和药物筛选等领域。

尽管蛋白质谱芯片技术还面临着一些挑战,但随着技术的不断提升和改进,相信它将会在未来的蛋白质研究中发挥更加重要的作用。

c12蛋白芯片

c12蛋白芯片

c12蛋白芯片
C12蛋白芯片是一种用于蛋白质分析和研究的高通量技术。


利用生物芯片上的微阵列技术,可以同时检测上千种蛋白质的表达水平和互作关系。

下面将介绍C12蛋白芯片的原理、优
势和应用。

C12蛋白芯片的原理是基于蛋白质组学技术,通过将不同的蛋
白质样本分别标记,然后将其与芯片上的探针反应,通过荧光或质谱等方法,可以定量检测蛋白质的表达水平。

C12蛋白芯片的优势主要体现在高通量、高灵敏度和高选择性
方面。

首先,C12蛋白芯片可以同时检测上千种蛋白质,大大
提高了实验效率。

其次,C12蛋白芯片具有很高的灵敏度,可
以检测到非常低浓度的蛋白质。

最后,C12蛋白芯片的探针设
计非常精准,可以选择性地检测目标蛋白质。

这些优势使得
C12蛋白芯片成为蛋白质组学研究的重要工具。

C12蛋白芯片的应用非常广泛,包括蛋白质表达分析、蛋白质
互作研究、疾病标志物筛查等。

首先,C12蛋白芯片可以用于
研究蛋白质表达的变化,比如在不同生理状态下或者不同疾病中蛋白质的表达水平变化。

其次,C12蛋白芯片可以用于研究
蛋白质间的相互作用关系,比如蛋白质复合物的分析和互作网络的构建。

最后,C12蛋白芯片还可以用于疾病标志物的筛查,通过检测特定蛋白质的表达水平,来诊断和监测疾病。

总之,C12蛋白芯片是一种高通量的蛋白质分析技术,具有高
灵敏度和高选择性的优点,广泛应用于蛋白质组学研究中。


可以用于蛋白质表达分析、蛋白质互作研究和疾病标志物筛查等领域,对于深入了解蛋白质功能和疾病机制具有重要意义。

蛋白质芯片技术综述

蛋白质芯片技术综述

题目:新技术专题讲座姓名:胡斌学院:数理信息工程学院专业:电气工程及其自动化班级:112班学号:1609110208蛋白质芯片技术综述【摘要】蛋白质芯片是近年来发展起来的新的生物检测技术,本文综述了该技术的发展情况及从其分类、构成到应用,并重点介绍了SELDI-TOF-MS这一技术。

最后阐述了蛋白质芯片的前景及存在不足。

【关键词】蛋白质芯片 SELDI-TOF-MS 生物检测技术人类基因组计划已经进入后基因组时代(post genome era)—功能基因组时代,而作为基因功能的直接体现者-蛋白质及其之间的相互作用越来越引起科学家们的关注,因为要彻底了解生命的本质,就必须要了解蛋白质在生物生长、发育、衰老整个生命过程中的功能、不同蛋白质之间的相互作用以及它们与发生、发展和转化的规律,从而诞生了一门新的学科———蛋白质组学。

蛋白质芯片技术则是继基因芯片之后发展起来的生物检验技术,它高度并行性、高通量、微型化和自动化的特点成为研究蛋白质组学的有力工具。

它的出现对于生物学、临床检验医学、遗传学、药理学等很多学科的进步具有很大的意义。

一、蛋白质芯片的分类及基本构成1.1 蛋白质芯片的分类蛋白质芯片又称蛋白质微阵列,属于生物芯片的一种,根据制作方法和应用的不同将蛋白质芯片分为两种:一种是蛋白质检测芯片,类似于较早出现的基因芯片,即在固相支持物表面高度密集排列的探针蛋白点阵,当待测靶蛋白与其反应时,可特异性的捕获样品中的靶蛋白,然后通过检测系统进行分析,如表面增强激光解析离子化—飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)将靶蛋白离子化,直接对其进行定性、定量分析;第二种是蛋白质功能芯片,本质说就是微行化凝胶电泳板,即样品中的待测蛋白在电场作用下通过芯片上的微孔道进行分离,然后经喷射进入质谱仪中来检测待测蛋白质。

目前应用较多的是第一种芯片。

1.2 探针蛋白的制备蛋白质检测芯片上的探针蛋白可根据研究目的的不同,选用抗体、抗原、受体、酶等具有生物活性的蛋白质。

蛋白质芯片

蛋白质芯片

亲和结合 亲和结合
Agarose thin film 3D gel pad
扩散
蛋白连接强度高、特异和高密度,低背景 蛋白需生物素化
蛋白连接强度高、特异和高密度,低背景 蛋白需His x6标记
表面蛋白分布均一容量
无需蛋白修饰过程,高结合容量
制作难,未商品化
蛋白质芯片的应用
疾病诊断和预警 药物开发 蛋白质组学
疾病诊断
定量检测组织提取液中的肿瘤标记物
孵育后的微阵列荧光图 A 含抗原 B 无抗原
uPA 尿激酶型纤溶酶原激活因子 PAI-1血浆纤溶酶原激活因子抑制因子 VEGT 血管内皮生长因子
微阵列方法与ELISA方法检出结果比较
药物开发
高通量筛选蛋白-蛋白作用抑制剂
His6-RB/GST-E7相互作用抑 制剂筛选微阵列图
蛋白质芯片的分类
➢ 蛋白质检测芯片 ➢ 蛋白质功能芯片
Methods for Protein Analysis
Gel electrophoresis, northern/western blot (fluorescence/radio active label) X-ray crystallography 2D - mass spectrometry Protein microarrays SELDI MS protein chips
加入His6-RB 加入含 PepC抑制剂的 His6-RB A 1500 个点阵的微阵列 B 局部点阵放大图及SPR信号 Jung SO, et al., Proteomics 2005, 5, 4427–4431.
蛋白质组学 人动脉平滑肌细胞蛋白谱
4.7% 抗原(一组细胞-细胞间相 互作用分子)表达上调; 13.4%抗原(结构蛋白,体液响 应蛋白)表达下降

蛋白质芯片

蛋白质芯片

亲和结合 亲和结合
扩散
制作难,未商品化 无需蛋白修饰过程,高结合容量
蛋白质芯片的构建
蛋白质芯片主要包括5个基本要点:
固体芯片的构建
探针的制备
点制微阵列
生物分子反应
信号的检测及分析
1,固体芯片的构建
目前已用于制作蛋白质芯片的固相介质主要有:
① 化学膜 ② 聚丙烯酞胺凝胶
③ 微孔板
④ 玻片
化学膜:
蛋白质芯片
在基因组学提出后,1994年Wilkin和Williams首次 提出了蛋白质组学的概念。它的研究对象不再只是 针对一种或几种蛋白质,而是着眼于全面性和整体 性来研究体系内所有蛋白质的性质与功能。这就需 要建立一种高通量、快速、直接、高质量的微阵列 方法来研究蛋白质。蛋白质芯片(protein chips)或称蛋 白质微阵列(protein mi—croarrays)技术就是顺应这一需 要而发。
3.点制微阵列
在选定适当的载体并进行表面处理后,需要将 探针蛋白质溶液转移到载体上,以便探针蛋白与玻 片表面的化学基团发生化学反应而使蛋白质最终连 接到玻片上成为蛋白质芯片。目前转移蛋白质的方 法基本分三种: ① 手工点样制备低密度蛋白质阵列 ② 是接触式点样制备蛋白质芯片 ③ 是非接触式点样制备蛋白芯片
成本过高, 需一系列昂贵的尖端仪器 芯片的标准化问题
提高芯片的特异性、简化样品制备和标记操作程序、
增加信号检测的灵敏度和消除芯片背景对于结果分析 的影响 ……
蛋白质芯片的展望
建立快速、廉价、高通量的蛋白质表达和纯化方法,
高通量制备抗体并定义每种抗体的亲和特异性。
改进基质材料的表面处理技术以减少蛋白质的非特异
制作蛋白质芯片的化学膜有尼龙膜、硝酸纤维素膜、 聚苯乙烯膜和聚偏二氟乙烯膜等。化学膜的优点在于不 需要做点样前复杂的表面处理,直接可以进行点样,但 容易造成较高的背景,降低检测的灵敏性。

o-link蛋白芯片

o-link蛋白芯片

o-link蛋白芯片O-Link蛋白芯片是一种新型的蛋白质分析技术,它可以同时检测数千种蛋白质,具有高灵敏度、高通量、高精度和高可重复性的特点。

下面我们来了解一下O-Link蛋白芯片的历史背景、原理和应用。

一、历史背景O-Link蛋白芯片是由瑞典Uppsala大学的研究人员发明的。

2002年,瑞典Uppsala大学的研究人员开发了一种名为Proximity Extension Assay(PEA)的技术,该技术可以将两个亲和性较高的抗体连接在一起,形成一种新的双抗体,然后将这种双抗体与待检测的蛋白质反应,最终通过荧光信号检测蛋白质的存在。

这种技术具有高灵敏度、高特异性和高通量的特点,被广泛应用于蛋白质组学研究领域。

二、原理O-Link蛋白芯片的原理是基于Proximity Extension Assay(PEA)技术的。

首先,将两个亲和性较高的抗体连接在一起,形成一种新的双抗体。

然后,将这种双抗体与待检测的蛋白质反应,形成一种新的复合物。

接下来,将这种复合物与一种名为OL INK® Detection Reagents的试剂盒反应,该试剂盒包含了一系列的DNA引物和荧光标记的探针。

在PCR扩增的过程中,引物与探针结合,形成一种新的DNA复合物,荧光信号随之产生。

最终,通过荧光信号检测蛋白质的存在。

三、应用O-Link蛋白芯片可以广泛应用于生命科学研究领域,如疾病诊断、药物研发、生物标志物鉴定等。

具体应用包括:1. 疾病诊断:O-Link蛋白芯片可以检测数千种蛋白质,可以用于疾病的早期诊断和预测。

2. 药物研发:O-Link蛋白芯片可以用于药物的靶点鉴定和药效评估。

3. 生物标志物鉴定:O-Link蛋白芯片可以用于生物标志物的鉴定和筛选,有助于疾病的早期诊断和治疗。

总之,O-Link蛋白芯片是一种新型的蛋白质分析技术,具有高灵敏度、高通量、高精度和高可重复性的特点,可以广泛应用于生命科学研究领域。

蛋白质芯片

蛋白质芯片

蛋白质芯片蛋白质芯片是一种新型的生物芯片,用于蛋白质的检测和研究。

它以固定在芯片上的蛋白质为靶点,利用蛋白质与其他分子之间的相互作用来进行分析和测量。

蛋白质芯片在生物医学研究、新药开发和临床诊断等领域具有广阔的应用前景。

首先,蛋白质芯片可以用来研究蛋白质的结构和功能。

蛋白质是生物体内的重要分子,参与了几乎所有生物过程,如代谢、信号传递和免疫反应等。

通过蛋白质芯片的高通量分析,可以快速筛选出与特定生物过程相关的蛋白质,进而揭示其结构和功能的特点。

这对于深入理解生物学机制、寻找新的药物靶点和开发新的治疗方法具有重要意义。

其次,蛋白质芯片可以用来研究蛋白质的相互作用网络。

蛋白质通过相互作用形成复杂的网络,参与了细胞内的信号传递、代谢调控和细胞活动的协调等生物过程。

通过蛋白质芯片的高通量筛选,可以研究蛋白质与其他分子之间的相互作用,构建蛋白质相互作用网络,进一步揭示生物过程的复杂性,为研究疾病的发生机制和寻找治疗方法提供重要信息。

另外,蛋白质芯片还可以用于疾病的早期诊断和治疗监测。

许多疾病的发生和发展都与蛋白质的异常表达和功能异常有关。

通过蛋白质芯片的高通量筛选,可以检测血液、尿液和组织样本中的蛋白质表达水平的变化,从而实现对疾病的诊断和监测。

此外,蛋白质芯片还可以用于药物治疗的个体化监测,通过监测患者在药物治疗后的蛋白质表达变化,可以评估药物的疗效,指导个体化的治疗方案。

然而,蛋白质芯片在应用中还面临着一些挑战。

首先,蛋白质的复杂性使得蛋白质芯片的设计和制备变得复杂。

蛋白质的结构多样性和功能多样性,使得设计和制备具有代表性的蛋白质芯片成为一个难题。

其次,蛋白质芯片的靶点识别和特异性识别也是一个重要的问题。

蛋白质之间的相互作用非常复杂,如何准确地识别出靶点和判断相互作用的特异性是一个困难的问题。

最后,蛋白质芯片的检测技术也需要进一步改进。

目前,常用的蛋白质检测技术主要包括质谱法、免疫测定和互补DNA杂交等,但这些方法在灵敏度、专一性和高通量性等方面还存在一定的局限性。

蛋白质芯片(proteinchip) - 复旦大学精品课程

蛋白质芯片(proteinchip) - 复旦大学精品课程

蛋白质芯片(protein chip)肖仔婧14301050266蛋白质芯片,又称为蛋白质微矩阵(protein micro array),是大量的蛋白质分子,例如抗体或抗原分子,或肽链有序排列固定在载体薄片上形成的。

基本原理将各种蛋白质有序地固定于滴定板、滤膜和载玻片等各种载体上,然后,用标记了特定荧光的蛋白质或其他成分与芯片作用,经漂洗将未能与芯片上的蛋白质互补结合的成分洗去,再利用荧光扫描仪或激光共聚焦扫描技术,测定芯片上各点的荧光强度,通过荧光强度分析蛋白质与蛋白质之间相互作用的关系,由此达到测定各种蛋白质的目的。

固定在芯片上的蛋白可以是:抗原、抗体、小肽、受体和配体、蛋白质-DNA 和蛋白质-RNA复合物等。

而抗体芯片是蛋白质芯片的主要类型,它的称谓来源于免疫学角度,由于其在微生物感染检测中巨大的潜在应用价值而引起人们广泛的兴趣,是蛋白质芯片研究中进展速度较快的一个分支。

其主要检测方法有双抗体夹心法,样品标记法。

双抗体夹心法:捕获抗体排列于膜或玻片上,加入样品孵育,再加入目标蛋白的生物素标记抗体,最后,HRP-链霉亲和素或荧光素-链霉亲和素用于检测芯片信号。

样品标记法:样品中的蛋白用生物素标记,然后与捕获抗体一起孵育,对照蛋白加入到样品中来监测整个反应过程,包括生物素标记和标准化。

结合在芯片上的蛋白利用HRP-链霉亲和素来检测,最后采用化学光或者HiLyte™Fluor 555-链霉亲和素来检测信号。

在疾病治疗方面的应用药物筛选:疾病的发生发展与某些蛋白质的变化有关,如果以这些蛋白质构筑芯片,对众多候选化学药物进行筛选,直接筛选出与靶蛋白作用的化学药物,将大大推进药物的开发。

蛋白质芯片有助于了解药物与其效应蛋白的相互作用,并可以在对化学药物作用机制不甚了解的情况下直接研究蛋白质谱。

还可以将化学药物作用与疾病联系起来,以及药物是否具有毒副作用、判定药物的治疗效果,为指导临床用药提供实验依据。

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蛋白质芯片
马晶 DNA DAY 2010-06-30
内容提要
蛋白质芯片概述
蛋白质芯片的关键技术 蛋白质芯片的应用 展望
Methods for Protein Analysis
• Gel electrophoresis, northern/western blot (fluorescence/radio active label)
Aldehyde-coated Epoxy-activated
PDMS nanowell Gold coated silicon
分布随机,表面有吸附
共价 偶联
高密度,适合复杂的生化分析 高密度,低背景,易与SPR或MS 联用 分布随机,制作难,未商品化
Avidin coated Ni-NTA coated
表面
PVDF Nitrocellulose
蛋白固定方式
吸附 吸附
优点
无需蛋白修饰过程,高结合容量 无需蛋白修饰过程,高结合容量
缺点
非特异吸附,分布随机 非特异吸附,高背景,低密度
Poly-lysine coated
吸附,共
价偶联
无需蛋白修饰过程,高密度, 高分辨检测 高密度,高分辨检测
非特异吸附,分布随机
蛋白质组学
疾病诊断
定量检测组织提取液中的肿瘤标记物
孵育后的微阵列荧光图 A 含抗原 B 无抗原
uPA 尿激酶型纤溶酶原激活因子 PAI-1血浆纤溶酶原激活因子抑制因子
VEGT 血管内皮生长因子
微阵列方法与ELISA方法检出结果比较
药物开发
高通量筛选蛋白-蛋白作用抑制剂
His6-RB/GST-E7相互作用抑 制剂筛选微阵列图
X-ray crystallography 2D - mass spectrometry Protein microarrays
• • •

SELDI MS protein chips
蛋白质芯片的定义
生 物 芯 片
基因芯片
蛋白质芯片, 又称蛋白质阵列
蛋白质芯片
或蛋白质微阵列,是指以蛋白质
分子作为配基,将其有序地固定
在固相载体的表面形成微阵列; 用标记了荧光的蛋白质或其他它 分子与之作用,洗去未结合的成 分,经荧光扫描等检测方式测定 芯片上各点的荧光强度,来分析 蛋白之间或蛋白与其它分子之间 的相互作用关系。
微流控芯片
蛋白质芯片的分类
蛋白质检测芯片
蛋白质功能芯片
蛋白质芯片的关键技术
1
提出生物学问题
(实验目的)
2
蛋白质芯片制备
6
数据分析和建模
(图象量化,标准化,
采集蛋白信息,建立模型)
样品预处理
(重组蛋白,制备一、二级抗体,
荧光标记,配蛋白印记缓冲液)
3
检测
(荧光和比色扫描或拍照, 参数设置)
生化反应
化学偶合,加底物, 反应温度和时间, 冲洗条件
5
4
蛋白质芯片的制备
1. 固相载体及其处理
载体(滴定板、滤膜、凝胶、载 玻片)
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4.固定微阵列上的蛋 白样点
膜为载体:芯片放入湿盒, 37°C 1h 载玻片为载体:化学修饰产生醛 基固定蛋白
2. 蛋白质的预处理
选择具有较高纯度和完好生物活 性的蛋白进行溶解
3. 点制微阵列
可使用点制基因微阵列的商品化 点样仪或喷墨法等
5.微阵列的封闭
主要封闭试剂:BSA或Gly
蛋白质芯片比较
加入His6-RB 加入含 PepC抑制剂的 His6-RB A 1500 个点阵的微阵列
B 局部点阵放大图及SPR信号
Jung SO, et al., Proteomics 2005, 5, 4427–4431.
蛋白质组学
人动脉平滑肌细胞蛋白谱
4.7% 抗原(一组细胞-细胞间相 互作用分子)表达上调; 13.4%抗原(结构蛋白,体液响 应蛋白)表达下降
亲和结合 亲和结合
蛋白连接强度高、特异和高密度,低背景 蛋白连接强度高、特异和高密度,低背景 表面蛋白分布均一容量
蛋白需生物素化 蛋白需His x6标记
Agarose thin film 3D gel pad 扩散 无需蛋白修饰过程,高结合容量
制作难,未商品化
蛋白质芯片的应用
疾病诊断和预警
药物开发
展望—蛋白质芯片未来的发展重点
建立快速、廉价、高通量的蛋白质表达和纯化方法, 高通量制备抗体并定义每种抗体的亲和特异性。
改进基质材料的表面处理技术以减少蛋白质的非特异 性结合。 提高芯片制作的点阵速度;提供合适的温度和湿度以 保持芯片表面蛋白质的稳定性及生物活性。 研究通用的高灵敏度、高分辨率检测方法,实现成像 与数据分析一体化。
细胞经oxidized low density lipoprotein作用后的蛋白谱 揭示了oxidized low density lipoprotein 诱导人动脉平滑肌细胞的作用模式
存在的问题
成本过高, 需一系列昂贵的尖端仪器
芯片的标准化问题 提高芯片的特异性、简化样品制备和标记 操作程序、增加信号检测的灵敏度和消除 芯片背景对于结果分析的影响等等
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