Western Blot实验(蛋白质印迹法)

10ml（两块胶的量）
作用：使蛋白样品分离 对于分离胶来说，pH8.8与甘氨酸的pka接近，从而使不同分子量的蛋白产生不 同的泳动速度，从而使不同分子量的蛋白分开。
二：聚丙烯酰胺凝胶电泳（配胶）
• 浓缩胶
浓缩胶浓度 试剂 5% 水（ml） 30％丙烯酰胺（ml） 1.0MTris－HCl（PH6.8）(ml) 10％SDS（ml） 10％AP（ml） TEMED（ul） 2 0.5 0.38 0.03 0.03 0.03
一：蛋白定量（原理）
• 在碱性环境下蛋白质与Cu2+络合并将Cu2+还原成Cu1+。BCA 与Cu1+结合形成稳定的紫蓝色复合物，在562 nm处有高的 光吸收值并与蛋白质浓度成正比，据此制作标准曲线做对 比，即可计算待测蛋白的浓度。
一：蛋白定量（实验过程）
• 加标样+水（共10ul） 样品5ul+水5ul
加入200ul（A+B)工作液，A液：B液=50:1
• 混匀放置37℃培养30min,测OD值，562nm
标样 (ul)
水(ul)
Baidu Nhomakorabea
0 10
1 9
2 8
4 6
6 4
8 2
10 0
一：蛋白定量（数据处理）
OD
蛋白浓度（ug/ul）
最大上样量为35ul
蛋白浓度30ug
保证每个孔蛋白量相同
二：聚丙烯酰胺凝胶电泳（配胶）
二：聚丙烯酰胺凝胶电泳（电泳）
• 将电极插头与电源上对应的电极连接，电流应流向正极； • 将电压调至80V，预计20min后待染料迁移至分离胶时， 将电压调至100V，60min待溴酚蓝到达凝胶底部时，停止 电泳，关闭电源，从电源上拔掉电极插头，从平板中取出 凝胶。 • 电压可以根据具体情况作适当调整，但是不能电压过大， 电压过大易导致内槽因电泳液温度过高出现胶融或条带变 形。
• 分离胶
分离胶浓度 试剂 6% 分子量（kDa) 去离子水（ml） 30％丙烯酰胺（ml） 1.5MTris－HCl （PH8.8）（ml） 10％SDS（ml） 10％AP（ml） TEMED（ul） 总体积（ml） ≥94 5.3 2 2.5 0.1 0.1 0.008 8% 70-94 4.6 2.7 2.5 0.1 0.1 0.006 10% 55-70 4.0 3.3 2.5 0.1 0.1 0.004 12% 20-55 3.3 4.0 2.5 0.1 0.1 0.004 15% 10-20 2.3 5.0 2.5 0.1 0.1 0.004 18% ≤10 1.3 6.0 2.5 0.1 0.1 0.004
甲醇能使SDS与蛋白分离，使蛋白充分转到膜上，甲醇浓度越高SDS 与蛋白分离越快，但高浓度的甲醇对蛋白会有固定作用，不利于蛋白 从胶里跑出来。一般来说甲醇的浓度为20% 甲醇的另一个作用是降温，电转液由于电解质的消耗和甲醇的挥发， 电转时电流或电压变化更快、温度升高也更快
三：转膜（PVDF膜）
• PVDF膜是用来吸附从各种凝胶中转印的蛋白质 的最佳用膜。这种疏水膜呈均一控制的孔结构， 具有极强的吸附生物分子的能力。与硝酸纤维素 膜相比，PVDF膜具有易于操作，染色性能好、 抗溶剂能力强和信噪比高的特点，提高了检测的 灵敏度。其开放的孔结构使其容易接近被吸收的 蛋白质，并去除背景上没有吸附的探针。可以说， 它是免疫检测理想的印迹膜。
PMSF（苯甲基磺酰氟）是一种蛋白酶抑制剂，可抑制丝氨酸蛋白酶（如胰蛋白酶，胰凝
配方
作用
PMSF在水液体溶液中不稳定，见水易分解，需使用前加入。 NaCl 150mM 让蛋白处于正常条件下，避免蛋白构象改变
保持蛋白天然构象，提高细胞膜的通透性 裂解细胞，溶解蛋白（尤其是难溶于水的膜蛋 白） 破坏蛋白分子的二、三级结构使分子被解聚成 多肽链，解聚后的氨基酸侧链和SDS结合成蛋 白- SDS胶束，所带的负电荷大大超过了蛋白 原有的电荷量，这样就消除了不同分子间的电 荷差异和结构差异。
• 转膜完成后用镊子取出PVDF膜放入容器中用
丽春红浸没 • 1-2分钟后待有明显条带将丽春红回收，用清水 漂洗多次直至滤去液体无明显红色 • 将膜放入容器中准备封闭
五：封闭（原理）
• 惰性蛋白质或非离子去污剂可以结合膜上的未结合位点从 而降低抗体的非特异性结合。 • 封闭剂应该封闭所有未结合位点而不替换膜上的靶蛋白、 不结合靶蛋白的标位、也不与抗体或检测试剂有交叉反应。 • 最常见的封闭剂是BSA、脱脂奶粉、酪蛋白、明胶和 Tween-20（0.05 - 0.1%）稀溶液。
二：聚丙烯酰胺凝胶电泳（装胶）
• 取凝固好的SDS-PAGE胶，将凝胶放入电泳槽内，将电泳 缓冲液加入内外电泳槽中，使凝胶的上下端均能浸泡在缓 冲液中，小心拔出加样梳。
二：聚丙烯酰胺凝胶电泳（上样）
• 将处理好的蛋白样品按照预定的顺序用移液器加到SDS-PAGE胶上样 孔内，最后记得点上预染蛋白质分子量Marker。 • 对于10孔梳子1mm厚度凝胶，每孔上样量（蛋白质混合物）约30ug。
10xTBS配方：Tris:24.2g
Nacl 80g PH调至7.6 配制成1* TBST时 100ml 10*TBS定容至1L加3ml Tween 20
四：丽春红染色（原理）
• 丽春红带负电荷，可以与带正电荷的氨基酸残基 结合，同时丽春红也可以与蛋白的非极区相结合， 从而形成红色的条带。 • 丽春红对蛋白的染色是可逆的，染色后可以用蒸 馏水，PBS或其它适当溶液洗去。 • 立春红随时间变长液体内会出现黑色沉淀，多个 月后需重新配置
四：丽春红染色（过程）
一：蛋白定量（裂解液详述）
裂解液使用时加入 PMSF：1ml裂解液加 1ulPMSF （ 100ml体系） RIPA 裂解液：
试剂名称
Tris 乳蛋白酶，凝血酶）和巯基蛋白酶（如木瓜蛋白酶） (pH 7.4) 50mM 生物缓冲液 Triton X-100中性去垢剂 sodium deoxycholate（脱 氧胆酸钠）阴离子去垢剂 SDS阴离子去垢剂 1% 1% 0.1%
三：转膜（操作过程）
• 剥胶：用切胶板切去浓缩胶和多余的分离胶 • 准备滤纸和硝酸纤维素膜，切滤纸和膜时一定要戴手套，大小与胶一 致 • 镊子、切胶板、浸泡胶、滤纸和海绵垫用1x转膜液浸泡，PVDF膜用甲 醇浸泡开门通风 • 三明治的制作：按顺序在转移夹内放置海绵、3层滤纸、胶、膜、3层 滤纸、海绵，保证每层之间没有气泡。组装顺序：转膜夹黑色面（负 极）－海绵垫－滤纸－胶－膜－滤纸－海绵垫－红色面（正极）。 切记：每层之间将其中的气泡全部赶出，组装顺序和电极正确。 • 转膜：100v 60min （冰上电转） 转膜时间：根据目的蛋白的大小来调整转膜时间（1KD/1min）
WB实验细节详述
时间：2016-05-07
一：蛋白定量（实验前处理）
• 组织：到手的组织状态：冰袋快递：组织腐烂，蛋白含量减少 干冰快递：基本无影响 甲醛处理：石蜡包埋组织蛋白提取试剂盒 需用匀浆器，液氮等方法加入1*PBS充分研磨 裂解液量：组织（g）：裂解液（ml）=1:10 细胞：一般为细胞悬液实验前需确定细胞大概浓度 裂解液量： 107数量细胞加入1ml裂解液
二：聚丙烯酰胺凝胶电泳（原理）
在SDS－PAGE不连续电泳中，制胶缓冲液使用的是Tris－HCL缓冲系统，浓缩胶是 pH6.8，分离胶pH8.8；而电泳缓冲液使用的Tris－甘氨酸缓冲系统。
• 在浓缩胶中：在进入分离胶前由于等速电泳现象而被浓缩。这是由于 当甘氨酸到达分离胶后，由于分离胶的pH 8.8，甘氨酸离解度加大， 在电泳缓冲液中主要存在三种阴离子， 电泳迁移速度变大超过蛋白质－ SDS 复合物，甘氨酸和 Cl离子、甘氨酸阴离子以及蛋 Cl离子的界面 白质－SDS 复合物，在浓缩胶的 很快超过蛋白质－ SDS 复合物。这时蛋白质－ pH 6.8下，甘氨酸只有少量的电离， SDS 复合物在分离胶 所以其电泳迁移率最小，而Cl离子的电泳迁移率最大。在电场的作用 中以本身的电泳迁移速度进行电泳，向正极移动。由于蛋白质－ SDS 下，Cl离子最初的迁移速度最快，这样在Cl离子后面形成低离子浓度 复合物在单位长度上带有相等的电荷，所以它们以相等的迁移速度从 区域，即低电导区，而低电导区会产生较高的电场强度，因此Cl离子 浓缩胶进入分离胶，进入分离胶后，由于聚丙烯酰胺的分子筛作用， 后面的离子在较高的电场强度作用下会加速移动。达到稳定状态后， 小分子的蛋白质可以容易的通过凝胶孔径，阻力小，迁移速度快；大 Cl离子和甘氨酸之间形成稳定移动的界面。而蛋白质－SDS 复合物由 分子蛋白质则受到较大的阻力而被滞后，这样蛋白质在电泳过程中就 于相对量较少，聚集在甘氨酸和Cl离子的界面附近而被浓缩成很窄的 会根据其各自分子量的大小而被分离。 Cl离子是快离子（前导 • 区带（可以被浓缩三百倍），所以在浓缩胶中 溴酚蓝指示剂是一个较小的分子，可以自由通过凝胶孔径，所以它显 离子），甘氨酸是慢离子（尾随离子）。 示着电泳的前沿位置。当指示剂到达凝胶底部时，停止电泳，从平板 中取出凝胶。
作用：使蛋白样品浓缩 对于浓缩胶来说，pH6.8可以 通过甘氨酸和和氯离子的作 用产生压缩，从而使蛋白条 带压细。
总体积（ml）
3（两块胶的量）
二：聚丙烯酰胺凝胶电泳（配胶）
配胶过程要点： 灌制浓缩胶
插入梳子
• 制分离胶时10%AP加入后迅速混匀再加TEMED制胶，沿壁灌注，灌 注时尽量不要产生气泡，如有气泡，用移液器将气泡吸出，留出浓缩 胶所需空间（梳齿长再加1cm）。 • 覆盖水层于分离胶溶液上，夏天将制胶器放室温20min，冬天放37度 灌制分离胶 培养箱 20min-30min 隔绝空气 • 待分离胶和水层之间会出现清晰界面，表明分离胶充分聚合（可微微 倾斜模具，检测凝胶是否聚合），倒掉并用滤纸吸干水 • 在已聚合分离胶上直接灌注浓缩胶液体，立即插入加样梳（缓慢插入， 避免产生气泡）。将凝胶在室温或者37℃静置20-30min（视具体情 况而定），直到浓缩胶完全凝固。
三：转膜（原理）
• Western blotting转膜一般采用“滤纸-凝胶-膜-滤纸”夹心法，凝胶 靠近负极，膜靠近正极。因为蛋白上结合有SDS，因而带负电，在电 流的作用下会从负极向正极运动，从而转移到膜上。 • 10x转膜缓冲液： Tris 30.3g Gly 151.1g 加超纯水至1L（使用前进行冷却） • 1x转膜缓冲液（4度保存） 200ml 甲醇 720ml水 80ml10x转膜缓冲液
二：聚丙烯酰胺凝胶电泳（原理）
• 聚丙烯酰胺凝胶由单体丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰 主要依据蛋白质的分子量对其进行分离 • 胺聚合而成，聚合过程由自由基催化完成。催化 SDS与蛋白质的疏水部分相结合，破坏其折叠结 聚合的常用方法有两种：化学聚合法和光聚合法。 构，并使其稳定地存在于一个广泛均一的溶液中。 化学聚合以过硫酸铵（ AP）为催化剂，以四甲基 SDS蛋白质复合物的长度与其分子量成正比。由 乙二胺（ TEMED）为加速剂。在聚合过程中， 于在样品介质和聚丙烯酰胺凝胶中加入离子去污 TEMED 催化过硫酸铵产生自由基，后者引发丙烯 剂和强还原剂后，蛋白质亚基的电泳迁移率主要 酰胺单体聚合，同时甲叉双丙烯酰胺与丙烯酰胺 取决于亚基分子量的大小，而电荷因素可以被忽 链间产生甲叉键交联，从而形成三维网状结构。 略。
五：封闭（过程）
• 丽春红染色漂洗完成后。 • 清洗干净的膜放入盛有5%BSA的容器中，室温 封闭60-90min，或者4度过夜。
• 5%BSA：秤取2gBSA
加40ml 1xPBS(或TBST)
六：一抗孵育（查询抗体）
决定二抗属性 条带大小
适用实验
一抗稀释比例
六：一抗孵育（过程）
• 封闭完成前，参照说明书将一抗用5%BSA稀释到足够实验 需求的量（无特殊要求，一抗稀释液用封闭液）。 • 封闭完成后，从膜上剪下宽度为1.5cm左右相应蛋白大小 条带，倒掉封闭液，加入稀释好的一抗溶液，摇床上平缓 摇动，室温孵育120min或4℃孵育过夜。 • 一抗孵育完成后，倒掉一抗溶液（有回收要求的抗体，回 收一抗溶液4℃保存），用TBST漂洗膜4次，第一次漂洗 主要漂洗BSA，冲刷后便可倒去，TBST可以加至膜漂浮在 液体中，每次10min。