1基因与基因组学资料
基因与基因组知识点资料整理总结
第一章基因与基因组1.基因的概念:基因是指合成有功能的蛋白质多肽链或RNA所必需的全部核酸序列(通常指DNA)。
2.基因的结构:①真核生物的结构基因不是连续编码的,而是由编码序列和非编码序列两部分构成,二者相互间隔排列,因此这种基因又称作割裂基因(split gene).②人类编码基因主要由外显子、内含子和侧翼序列组成.③能转录、并存在于成熟RNA中的序列称为外显子(exon)④能转录、但不存在于成熟RNA中的序列称为内含子(intron)(注:GT-AG法则:每个内含子的5’端开始的两个核苷酸都是GT,3’端末尾的两个核苷酸都是AG。
)⑤不同数目的外显子和内含子组成的各个基因大小各不相同;无内含子的基因一般较小,有较大内含子的基因一般较大。
⑥每个结构基因的第一个外显子和最后一个外显子外侧,即基因的5′端和3′端都有一段不被转录的DNA序列,对基因的转录表达及表达水平具有重要的调控作用。
包括:启动子、增强子和终止子,属顺式调控因子,称为调控序列。
(启动子 (Promoter),通常位于基因转录起点上游的100bp范围内,是RNA聚合酶的结合部位,促进转录过程,包括TATA框、Hogness框(TATA box, Hogness box)、CAAT框(CAAT box)和GC框(GC box)。
终止子 (Terminator),一段回文序列以及特定的序列,例如:5’-AATAAA-3’是RNA停止工作的信号。
增强子(Enhancer),启动子上游或下游的一段DNA序列,无明显方向性,但具有组织特异性,可增强启动子转录的效率)3.基因家族、基因簇和假基因①基因家族 (gene family):基因组中来源相同、结构相似、功能相关且常成簇存在的一组基因。
②基因簇:家族成员成簇排列在同一条染色体上,形成一个基因簇;不同成员成簇地分布在几条不同的染色体上,形成几个基因簇。
基因簇成员可能同时表达,也可能在不同发育阶段或不同部位表达。
《基因和基因组》PPT课件
3.基因组中有多种调控区,和少量重复序列,调控原件 比病毒复杂,但比真核生物简单,重复序列比真核生物少得 多。
4.功能相关的几个结构基因往往串联在一起,受它们上 游的共同调控区控制,形成操纵子结构。
5.基因组中存在与真核生物类似的可移动DNA序列(转座 子)。
蛋白质 T抗原 t抗原 VP1 VP2 VP3
合成时间 早期 早期 晚期 晚期 晚期
功能 启动DNA复制
未知 主要的病毒外壳蛋白 次要的病毒外壳蛋白 次要的病毒外壳蛋白
2.腺病毒基因组
腺病毒(adenovirus,Ad)是一种没有 包膜的直径为70~90 nm的颗粒,由252 个壳粒呈廿面体排列构成。每个壳粒的 直径为7~9 nm。其病毒壳体含有三种 主要的蛋白:240个六邻体(II),12 个五邻体基底(III)和纤突(IV), 还有多种其他的辅助蛋白VI,VIII,IX, IIIa和Iva2。衣壳里是线状双链DNA分 子,约含35 000 bp,两端各有长约100 bp的反向重复序列。由于每条DNA链的 5ˊ端同相对分子质量为55×103Da的蛋白 质分子共价结合,可以出现双链DNA的 环状结构。人体腺病毒已知有33种,分 别命名为adl~ad33,研究得最详细是 ad2。
腺病毒基因组是一个线性的双链DNA,其5ˊ端与一种 末端蛋白(TP)共价结合,5ˊ端上还具有末端反向重复序 列(LTRs)。病毒DNA与核心蛋白VII和一个称为mu的小肽 紧密结合。另一种蛋白V包被在DNA-蛋白复合物上,并且 通过蛋白VI为DNA-蛋白复合物和病毒壳体间提供了结构上 的联系。病毒含有一种病毒自身编码的蛋白酶,这种蛋白 酶对于加工某些结构蛋白从而产生成熟的具有感染性的病 毒是必需的。
基因和基因组 PPT课件
F质粒(性质粒) R质粒(抗药性质粒) (用于基因工程删
选) Col质粒(大肠杆菌素因子)
目录
•pBR322 是 E.coli 中的质粒, 长4367bp, 是分子生 物学研究 中最初常 用的质粒。 通常使用 的质粒载 体还有 pUC18/pU C19等
目录
第三节 真核基因组
目录
基因家族分类
编码RNA的:
❖rRNA 、tRNA、 snRNA等;
编码蛋白质的:
❖ 组蛋白基因 ❖ 珠蛋白基因 ❖ 生长激素
目录
rRNA 基因
>l00copy. rRNA基因簇(重复单元18S - 5.8S - 28S RNA )
8-14 kb total
IGS
5'-ETS
5'-ITS 3'-ITS
5’(TxGy)n3’ 3’(AxCy)n5’ 人的端粒是由串联的TTAGGG重复序列组 成,总长约5~15kb
目录
(II)中度重复序列
约占整个基因组的20%~30%
1.中度重复序列的特点 ① 重复单位序列相似,但不完全一样, ② 散在分布于基因组中. ③ 序列的长度和拷贝数非常不均一, ④ 中度重复序列一般具有种属特异性,可作 为DNA标记. ⑤ 中度重复序列可能是转座元件。
C值反常现象: C值一般随生物进化而增加, 但也存在某些低等生物 的C值比高等生物大, 即C值反常现象。最简单的多 细胞生物秀丽隐杆线虫8*107bp,是酵母的4倍。
目录
第二节 原核基因组
目录
根据细胞的结构和遗传物质在细胞内的 分布,生物可分为原核生物(prokaryote )和真核生物(eukaryote)两大类。
目录
基因与基因组(1)
程度的不对称性,称为N值佯谬(N value
paradox)。
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11
问题与可能的解释
• 问题:
– 既然一切生物性状都是由基因决定的,那么 生物体的DNA含量(C值)和质量(N值) 就应该与生物进化阶梯及复杂性成正相关。
• 可能的解释
– 生物体结构与功能的复杂程度不仅取决于一 定的基因数量,更重要的是在于基因功能及 其相互作用网络的复杂性和精确性。
不同生物,基因的数量、结构及组合方式不同
估计,人类约有2.6万个基因
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2
切离加尾
GCGC-CAAT-TATA..ATG
AATAAA
内含子 外显子
修饰点
翻译起始
翻译终止
真正转录 终止点
转录起始
TATA盒(Hogness box) CAAT盒 GC盒
增强子 真核生物RNA pol Ⅱ转录的基因
• 基因组大小在不同生物之间差异很大;如HBV 仅 3200 bp,而某些显花植物和两栖类动物可达1011bp。
• 基因组大小用C值(C value)表示;
• C值大小基本上反映生物进化程度的差异;
• 但这种相关性并不很精确;
• 这种生物体的进化程度与基因组大小之间不完全成比 例的现象称为C值佯谬( C value paradox );
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三、真核生物基因组特点
(一)分子量很大的DNA与蛋白质形成染色体存在 于核内。人类染色体约30亿bp
(二)转录与翻译不同步,转录产物为单顺反子,功 能相关基因分散排布,无操纵子结构
(三) 基因组存在高比例的非编码顺序(non coding sepuence, NCS), NCS可作进化标尺?
《基因与基因组》课件
基因组信息可以帮助医生制定
基因组学的发展推动了基因编
病风险、制定个性化治疗方
更好的诊断策略和治疗方案,
辑技术的出现,如CRISPR-
案,促进精准医学的发展。
提供个性化的医疗服务。
Cas9,为基因疾病的治疗提供
了新途径。
总结
基因与基因组的重要性
⭐️
未来发展方向
问题和挑战 ❓
随着技术的进步,基理解生命起
和个性化医疗将在未来发展
律和隐私等方面的问题和挑
源、进化和功能的关键,对
出更多的应用和突破。
战,需要综合考虑。
于生物学、医学和生物技术
具有重要价值。
基因组的测序方法
基因组的分析方法
基因组是一个生物体中所有基因
基因组的测序方法包括Sanger测
基因组的分析方法包括基因功能
的集合,包括编码和非编码区域。
序、高通量测序和第三代测序
注释、基因家族分析和进化比较
等。
等。
应用
基因组医学 ⚕️
个性化医疗
基因编辑技术
通过基因组分析,可以预测疾
成蛋白质。
基因突变
1
基因突变的定义
2
基因突变的类型
3
基因突变的影响
基因突变是指基因序列的
常见的基因突变类型包括
基因突变可能改变蛋白质
改变,可以包括点突变、
错义突变、无义突变和读
的结构和功能,对生物体
插入突变和缺失突变等。
框突变等。
的发育、疾病和适应环境
等产生影响。
基因组学
基因组的定义
《基因与基因组》PPT课件
基因与基因组的知识是生命科学的关键。本课程将带您了解基因的定义、结
分子生物学--基因与基因组课件
2、物理图ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ:
以特异DNA序列为界标所展示的染色体图,它能反映生物 基因组中基因或标记间的实际距离,图上界标之间的距离是以 物理长度即核苷酸对数如bp、kb、Mb等来表示的。这些特 定的DNA序列可以是多态的,如RFLPs,但主要是非多态的如 STS、STR、EST和特定的基因序列等。
作图的基本方法:
1、家系分析定位
通过分析、统计家系中有关性状的连锁 情况和重组率而进行基因定位的方法。
有用的遗传标记: 取材方便 按孟德尔方式遗传 多态性标记位点
多态性:在一个群体中,某遗传特性存在若干种类型。
家
系性
分连
析
锁 分
定析
位
外祖父法
深绿代表红绿色盲患者,浅绿代表红 绿色盲基因携带者,黄色代表正常
家常
细胞融合技术
体
鼠细胞
人细胞
细
胞
杂
交
定
位
含全套鼠染色体 , 人 1号染色体,肽酶C
3、核酸分子杂交定位
• 应用已知的核酸探针与待定位的DNA序列进行杂交 对基因进行定位的方法 •具有互补序列两条单链核酸分子在一定条件下 按碱基互补配对原则退火形成双链的过程。 • 杂交的双方是待定位的核酸和已知核酸序列,已知 核酸序列称探针。
5’、、、AGCCGACTATGTCGAAGCTT、、、、、、 GCTTGACTATAAGACA、、、3’
3‘、、、TCGGCTGATACAGCTTCTAA、、、、、、 CGAACTGATATTCTGT、、、5‘
转录调控区
贮存RNA或蛋白质结构信息区 转录终止区
原核基因的结构特点
真核基因的结构特点
(二)基因作图的方法:
1、遗传图谱:
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蛋质的合成与翻译
遗传密码
遗传密码是指mRNA上决 定一个氨基酸的三个相邻 的碱基。
翻译
翻译是指以mRNA为模板 合成蛋白质的过程,需要 核糖体、tRNA和多种酶的 参与。
氨基酸的合成
氨基酸是构成蛋白质的基 本单位,通过特定的化学 反应合成不同的氨基酸。
基因表达的调控
基因表达调控
转录因子与miRNA
的挑战和困难。
感谢您的观看
THANKS
基因编辑的应用与伦理问题
疾病治疗与预防
介绍基因编辑在遗传性疾病治疗 、传染病预防等方面的应用案例 ,以及其潜在的治疗效果和局限
性。
生物科学研究
探讨基因编辑技术在生物科学基础 研究、药物研发等领域的应用,以 及其对科学发展的推动作用。
伦理与法律问题
分析基因编辑技术应用中涉及的伦 理、法律和社会问题,如人类胚胎 基因编辑的争议、基因歧视等。
DNA的复制与转录
01
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DNA复制
DNA的复制是指以亲代 DNA分子为模板合成子代 DNA分子的过程,是生物 遗传的基础。
DNA转录
DNA转录是指以DNA的 一条链为模板合成RNA的 过程,是基因表达的第一 步。
复制与转录的酶
DNA复制和转录过程中需 要多种酶的参与,如DNA 聚合酶和RNA聚合酶等。
基因组学在医学中的应用
疾病诊断与预防
基因组学在医学中广泛应用于疾病诊断和预防,通过对个体的基因组进行分析,可以预测其对某些疾病的易感 性,从而采取针对性的预防措施。
药物研发与治疗
基因组学在药物研发和治疗中也发挥了重要作用,通过对药物的基因组反应进行研究,可以发现更有效的药物 和治疗方法,提高治疗效果和降低副作用。
基因与基因组学ppt课件
“全基因组”信息记录着一个 人有关生、老、病、死的重要信 息,它是一个人全部隐私中最重 要的隐私。
孩子的基因组图记录一个生 命的全部奥秘和隐私。是不是 一个色盲,大概会长多高,能 否秃顶、发胖等。还可准确地 告诉其父母:是什么病,可能 会要孩子的命。
这张图要交给谁保管呢?父 母?保险公司?老板?政府?
பைடு நூலகம்
三、基因组的特点
随着现代化的进程,交通的发达、传统的 改变、思想的开放,族群间的通婚势必增多, 不再成为单纯的“隔离群”,因此,国际上 有人提议要抢救这些基因资源,现在就要保 存好他们的DNA。
二、基因的商品价值
基因专利,基因资源的论战和争夺已到 了白热化,不言而喻的科学意义和经济价 值,促使大规模的竞争与合作提前再提前, 如箭上弦。
第五节 基因组与基因组学
一、基因组与基因组学 的发展
1990年人类基因组 计划正式启动
挖掘策略
“人类基因组计划”,一项改变世界的科学 计划:一项深深影响我们每个人生活的科学计 划。它将改变我们的哲学、伦理、法律等观念; 对社会、经济产生重大影响,这种影响现已显 示于世。
“基因相关论”:所有的疾病都与 人类的基因有关,都是人类基因组 与病原基因组中的有关基因的直接 或间接相互作用的结果。
基因和基因组生物学自然科学专业资料203页PPT
26、机遇对于有准备的头脑有特别的 亲和力 。 27、自信是人格的核心。
28、目标的坚定是性格中最必要ห้องสมุดไป่ตู้力 量泉源 之一, 也是成 功的利 器之一 。没有 它,天 才也会 在矛盾 无定的 迷径中 ,徒劳 无功。- -查士 德斐尔 爵士。 29、困难就是机遇。--温斯顿.丘吉 尔。 30、我奋斗,所以我快乐。--格林斯 潘。
谢谢你的阅读
❖ 知识就是财富 ❖ 丰富你的人生
71、既然我已经踏上这条道路,那么,任何东西都不应妨碍我沿着这条路走下去。——康德 72、家庭成为快乐的种子在外也不致成为障碍物但在旅行之际却是夜间的伴侣。——西塞罗 73、坚持意志伟大的事业需要始终不渝的精神。——伏尔泰 74、路漫漫其修道远,吾将上下而求索。——屈原 75、内外相应,言行相称。——韩非
4章_基因与基因组资料
• 它们可同时gene):在多基因家族中,某些 成员并不产生有功能的基因产物。
• 假基因与有功能的基因同源。
2)散布的基因家族(interspersed gene family) • 概念:一个基因家族的不同成员成簇地分布不同
2 病毒基因组可以由DNA组成,也可以由RNA组成:
3 通常有重叠基因
重叠基因(overlapping gene):同一段DNA 的编码顺序,由于阅读框架的不同或终止 早晚的不同,同时编码两个或两个以上多 肽链的基因。
4 病毒基因组的序列大部分用来编码蛋白质: 5 多顺反子mRNA(polycistroniem RNA): 6 噬菌体的基因是连续的: 7 节段性基因: 8 单拷贝
染色体上,各成员在序列上有明显差异。 • 这些不同成员编码一组功能上紧密相关的蛋白质,
如珠蛋白基因家族。
4.1.2 广义的基因家族
根据基因家族成员序列的相似程度分类:
1)经典的基因家族,家族成员序列有高度的同源性,序 列一 致,拷贝数高,非转录间隔区短而一致。
2) 基因家族各成员的编码产物保守(大段的高度保守氨基酸 序列);只是DNA序列的相似性低。
Cot1/2= 1/K 不同DNA的Cot1/2值不同,与K值相关 DNA序列的复杂性影响K值:在控制反应条件(初始浓
度、温度、离子强度、片段大小)相同的前提下, 两种 DNA分子的C0t1/2值, 取决于核苷酸的排列复杂性 。 DNA序列的复杂性(complexity) X:最长的不重复序列的 bp数
6、单拷贝单顺反子 7、可移动的DNA序列
二、真核生物基因组的结构
1、断裂基因(splitting gene)
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F.Jacob和J.Monod通过不同 的大肠杆菌乳糖代谢突变体来研究基因的作用, 提出了操纵子模型学说(operon theory)。这一学说 阐明了基因调控在乳糖利用中所起的作用。表明 人们已认识到基因的功能并不是固定不变的,而 是可以根据环境的变化进行调节。随之人们发现 无论是真核还是原核生物转录调节都是涉及到编 码蛋白的基因和DNA上的元件。这一发现获得了 1965年诺贝尔奖。
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(三)启动子(promotor)与操纵基因(operator) 前者是转录时RNA多聚酶起始与DNA结合的
部位;后者是调节基因的产物阻遏蛋白质 或激活蛋白质与DNA结合的部位,它们都 是不转录的DNA区段,确切说,它们不能 称为基因。但关系到结构基因的活化或钝 化。
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以上各类基因(或DNA区段)之间的相互关系如下图。通过这些基因的相 互作用、密切协作,调控基因有序地表达,从而使各种生命活动表现 出规律性、和谐性。
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(二)基因的概念
在初中生物学课本中,把基因定义为“染色体遗传物质中决定生物 性状的小单位”。高中生物学课本则把基因定义为“有遗传效应的 DNA片段”。在最具权威的2000年版《中国大百科全书》中,基因 的定义是“含特定遗传信息的核苷酸序列,是遗传信息的最小功能 单位”。在最近几年出版的外文版和部分中文版的分子生物学和分 子遗传学书籍中又给出了新的答案。 从上述基因研究的最新进展可以看出,基因不仅在功能上多种 多样,在结构上也是五花八门,因此,给它下一个非常准确和永远 适用的定义是相当困难的。基因的概念随着遗传学、分子生物学、 生物化学等领域的发展而不断完善。
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乳糖操纵子
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7)“跳跃基因”和“断裂基因”的发现
50年代初,美国遗传学家B.McClintock在玉米的控制因 子的研究中已经指出某些遗传因子是可以转移位置的。后 来的研究发现,在原核生物和真核生物中均发现有基因转 移的现象,并将这些可转移位置的成分称为跳跃基因 (jumping gene),亦称转座因子(transposon element)。
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(三)基因的分类
根据基因的功能和性质,可将其分为以下几类: (一)结构基因 这类基因不仅可转录(tran- scription)成mRNA,
而且可翻译(translation)成多肽链,从而构成各种 结构蛋白和催化各种生化反应的酶。 (二) rDNA和 tDNA基因 这类基因只转录产生相应的RNA,而不翻译成多 肽链。
此外,传统的观点认为,一个结构基因是一段连续的DNA 序列,70年代后期发现绝大多数真核生物基因都是不连续 的,其中被一些不编码序列所隔开,故称为断裂基因。
1978年,在噬菌体中还发现了重叠基因,一个基因序列可 被包含在另一个基因中,两个基因序列可能部分重叠。
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断裂基因的意义 (1)有利于储存较多的遗传信息量; (2)有利于变异与进化; (3)增加重组机率; (4)内含子可能是调控装置。
20世纪40年代G W.Beadle和E.L.Tatum通过对 粗糙脉孢菌营养缺陷型的研究,提出了一个基因 一个酶的假说。
1953年Watson和Crick提出了DNA双螺旋结构模型, 明确了DNA在活体内的复制方式。
1957年由Crick最早提出遗传信息在细胞内的生物 大分子间转移的基本法则,即中心法则,接着在 1961年又提出了三联遗传密码,这样将DNA分子 的结构与生物学功能有机地统一起来,也为揭示 基因的本质奠定了分子基础。
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(2)染色体是基因的载体
1910年摩尔根等通过果蝇杂交实验表明,染色体在细胞分 裂时的行为与基因行为一致,从而证明基因位于染色体上, 并呈直线排列,提出了遗传学的连锁交换规律,证明了性 别决定是受染色体支配的。
基因的连锁和交换定律的实质是:在进行减数分裂形成配 子时,位于同一条染色体上的不同基因,常常连在一起进 入配子;在减数分裂形成四分体时,位于同源染色体上的 等位基因有时会随着非姐妹染色单体的交换而发生交换, 因而产生了基因的重组。
从遗传学的角度看,基因是生物的遗传物质,是遗传的基本单位— —突变单位、重组单位和功能单位;从分子生物学的角度看,基因 是负载特定遗传信息的核酸序列,在一定条件下能够表达 某种遗传 信息(其产物为有功能的多肽链或功能RNA分子),变成特定的生 理功能。 “核酸序列”主要指DNA,对于RNA病毒来说则指染色体 RNA。 “RNA分子”主要包括tRNA和rRNA。这个定义较确切地表 述了基因的本质和功能,已经被绝大多数学者所接受。
性状的遗传是由遗传因子所控制的,性状本身是不能遗传 的,控制性状的遗传因子才是遗传的。 1909年,丹麦学者W.L.Johannsen提出了“基因”(gene) 一词,代替了孟德尔的遗传因子,并由此形成了“颗粒遗 传”学说,认为在杂种中等位基因不融合,各自保持其独 立性,这也是孟德尔遗传规律的核心。
第二讲
基因与基因组学
Gene and Genome
主讲人: 白云飞 东南大学生物科学与医学工程学院
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第一节 基因的概念与结构
一、 基因的概念
(一)基因概念的发展
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随着遗传学的发展,人类对于基因的认识逐步深入,基因 概念也随之发展。基因概念发展经过几个时期。
(1)遗传“因子” 基因的最初概念是来自孟德尔的遗传“因子”,认为生物
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(3)DNA是遗传物质
1944年Avery等人不仅在体外成功地重复了 上述实验,而且用生物化学方法证明了转 化因子(trans-forming factor)是DNA,而不是 多糖荚膜、蛋白质和RNA,而且转化频率 随着DNA纯度的提高而增加。证明了DNA 就是遗传物质。
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(4)基因是有功能的DNA片段