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蛋白质的生物合成 (翻译)
Protein Biosynthesis or Translation
遗传信息的传递过程
复制
转录
DNA
翻译
RNA
蛋白质多肽链
逆转录
折叠 靶向运输
蛋白质合成体系
Protein Biosynthesis System
▼.三种RNA: mRNA(messenger RNA, 信使RNA) rRNA(ribosomal RNA, 核蛋白体RNA) tRNA(transfer RNA, 转移RNA)
起始密码子常处于-CCACCAUGG- 序列中,这段保守序列的存在能增加 翻译起始的效率,这段序列称为 Kozark序列(Marilyn Kozark) .
原核生物mRNA
5' PPP
3'
真核生物mRNA
5' mG - PPP
蛋白质
AAA 3'
蛋白质
非翻译区
核蛋白体结合位点
编码序列
起始密码子
终止密码子
①活化反应:
氨基酰-tRNA合成酶
氨基酸 + tRNA
氨基酰- tRNA
ATP
AMP+PPi
活化反应:形成酯键
氨基酰-tRNA合成酶的特点
◆.氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和tRNA都
有高度特异性。通过其活性部位实现的。
◆.氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性,将错配
的进行校正。
(2)活化过程: 第一步反应
(四)阅读方向: 5→ 3
新生肽链方向 从N → C
二、遗传密码的特性
(一)连续性(commaless) 编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密 码连续阅读,密码间既无间断也无交叉。
mRNA简图
A UGG G C A A U
5’
氨基酸
氨基酸
氨基酸
3’
每三个一组连续阅读
(二).简并性 (degeneracy)
真核生物mRNA的特点 (单顺反子)
二、蛋白质生物合成的场所
场所:核糖体(ribosome) 结构: Mg2+,蛋白质,rRNA
(一) 核蛋白体(rRNA)
蛋白质-蛋白质, rRNA-蛋白质组成 两个亚单位,称之为大小亚基.
核糖体的沉降系数(S)和亚单位
完整核糖体 原核生物 70 S
真核生物 80 S
1.tRNA ◆tRNA种类:30种
◆同工tRNA:指携带不同的密码子,但识别
相同的氨基酸的一组tRNA。
2.tRNA与氨基酸的活化:
氨基酸臂
反密码环
tRNA的三级结构示意图
核塘体活性结合位点
2.氨基酸的活化
(1)氨基酰-tRNA合成酶 (aminoacyl-tRNA synthetase)
rpL 49种
原核生物各组分的功能: 1.大亚基rRNA具有肽酰基转
移酶活性,催化肽键的合成.
2. 小亚基具有mRNA上S-D互补的序列,是 识别结合mRNA 的位点.
3.核糖体大亚基5SrRNA具有 两个保守序列,其中一个与tRNA的 Tψ互补识别序列,另一个与23SrRNA互补 识别序列,稳定核糖体结构.
第一节 遗传密码
(genetic code) 一.遗传密码及密码的破译
(一) 遗传密码(genetic code) : 指编码蛋白质氨基酸序列基因中的核苷酸体系.
三联体密码 (termination corden):
从mRNA 5端起始密码子AUG开始, 每三个核苷酸为一组决定肽链中的一种氨 基酸 ,称为三联体密码。
▼20种氨基酸(amino acid)作为原料 ▼酶及众多蛋白因子,如IF、eIF ▼ ATP、GTP、无机离子
一.生物合成的模板-mRNA
(一)原核生物mRNA的特点
1. S-D(Shine-Dalgarno )序列
原核生物mRNA的起始密码AUG 上游4~7个核苷酸以外有一段 5-UAAGGAGG- 3 的保守序列 称为S-D(Shine-Dalgarno Sequence) 该序列是核糖体识别结合的位点.
大亚基 50 S 60 S
小亚基 30 S 40 S
不同细胞核蛋白体的组成
原核生物
真核生物
核
核
S
蛋 白
小亚基
大亚基
蛋 白
小亚基
大亚基
体
体
70S
rRNA
蛋白 质
30S
16SrRNA
rpS 21 种
50S 80S
5S-rRNA 23S-rRNA
rpL 36种
40S
18SrRNA
rpS 33 种
60S
28S-rRNA 5S-rRNA 5.8S-rRNA
(二)特殊密码: (special coden)
◆ 起始密码(initiation coden ):第一个AUG
AUG 意义:编码甲硫氨酸, 原核生物为甲酰化甲硫氨酸
◆终止密码(terminatiom coden)
UAA、
UAG 、 UGA
(赭石) (琥珀) (乳白石)
(三)密码总数: 61个编码20种氨基酸
氨基酸 +ATP-E —→ 氨基酰-AMP-E + AMP + PPi
第二步反应
氨基酰-AMP-E +
tRNA
↓
氨基酰-tRNA +
AMP + E
(3ຫໍສະໝຸດ Baidu活化氨基酸的表示方法:
氨基酰-tRNA的表示方法: Ala-tRNAAla Ser-tRNASer Met-tRNAMet
3.rRNA 4.蛋白因子
(1)起始因子:
原核生物IF :IF-1,IF-2,IF-3
真核生物eIF: eIF-2.eIF -3,eIF -4 帽结合蛋白(CBP/ eIF -4) eIF-5
(2)延长因子EF:
原核生物: EF-T, EF-G 真核生物:EF-1EF-2
(3)释放因子 RF:
原核生物:RF-1, RF-2 ,RF-3, 真核生物: eRF
(二)核糖体蛋白作用
1.维系核糖体稳定结构的骨架 2.保护rRNA防止被核酸酶降解. 3.与rRNA构成功能活性区域. 如: 肽酰基转移酶活性
蛋白因子结合位点 P、A、E氨基酰- tRNA结合位点。
mRNA结合位点
核蛋白体与起始fmet-tRNAfmet的结合
三、蛋白质生物合成的机制
(一)合成元件 - tRNA、 rRNA和蛋白因子
乳糖操纵子模型
5’
3’
Z
YA
3’
转录
5’
5’ mRNA
3’ 翻译
多顺反子
乳糖操纵子结构 调控区
结构基因
DNA
P OZ YA
操纵序列
启动序列
CAP结合位点
转录
mRNA
翻译
Z: β-半乳糖苷酶 Y: 透酶 A:乙酰基转移酶
多肽链1 多肽链2 多肽链3
多顺反子
(二)真核生物mRNA的特点
1. Kozark序列 (Marilyn Kozark)
Protein Biosynthesis or Translation
遗传信息的传递过程
复制
转录
DNA
翻译
RNA
蛋白质多肽链
逆转录
折叠 靶向运输
蛋白质合成体系
Protein Biosynthesis System
▼.三种RNA: mRNA(messenger RNA, 信使RNA) rRNA(ribosomal RNA, 核蛋白体RNA) tRNA(transfer RNA, 转移RNA)
起始密码子常处于-CCACCAUGG- 序列中,这段保守序列的存在能增加 翻译起始的效率,这段序列称为 Kozark序列(Marilyn Kozark) .
原核生物mRNA
5' PPP
3'
真核生物mRNA
5' mG - PPP
蛋白质
AAA 3'
蛋白质
非翻译区
核蛋白体结合位点
编码序列
起始密码子
终止密码子
①活化反应:
氨基酰-tRNA合成酶
氨基酸 + tRNA
氨基酰- tRNA
ATP
AMP+PPi
活化反应:形成酯键
氨基酰-tRNA合成酶的特点
◆.氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和tRNA都
有高度特异性。通过其活性部位实现的。
◆.氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性,将错配
的进行校正。
(2)活化过程: 第一步反应
(四)阅读方向: 5→ 3
新生肽链方向 从N → C
二、遗传密码的特性
(一)连续性(commaless) 编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密 码连续阅读,密码间既无间断也无交叉。
mRNA简图
A UGG G C A A U
5’
氨基酸
氨基酸
氨基酸
3’
每三个一组连续阅读
(二).简并性 (degeneracy)
真核生物mRNA的特点 (单顺反子)
二、蛋白质生物合成的场所
场所:核糖体(ribosome) 结构: Mg2+,蛋白质,rRNA
(一) 核蛋白体(rRNA)
蛋白质-蛋白质, rRNA-蛋白质组成 两个亚单位,称之为大小亚基.
核糖体的沉降系数(S)和亚单位
完整核糖体 原核生物 70 S
真核生物 80 S
1.tRNA ◆tRNA种类:30种
◆同工tRNA:指携带不同的密码子,但识别
相同的氨基酸的一组tRNA。
2.tRNA与氨基酸的活化:
氨基酸臂
反密码环
tRNA的三级结构示意图
核塘体活性结合位点
2.氨基酸的活化
(1)氨基酰-tRNA合成酶 (aminoacyl-tRNA synthetase)
rpL 49种
原核生物各组分的功能: 1.大亚基rRNA具有肽酰基转
移酶活性,催化肽键的合成.
2. 小亚基具有mRNA上S-D互补的序列,是 识别结合mRNA 的位点.
3.核糖体大亚基5SrRNA具有 两个保守序列,其中一个与tRNA的 Tψ互补识别序列,另一个与23SrRNA互补 识别序列,稳定核糖体结构.
第一节 遗传密码
(genetic code) 一.遗传密码及密码的破译
(一) 遗传密码(genetic code) : 指编码蛋白质氨基酸序列基因中的核苷酸体系.
三联体密码 (termination corden):
从mRNA 5端起始密码子AUG开始, 每三个核苷酸为一组决定肽链中的一种氨 基酸 ,称为三联体密码。
▼20种氨基酸(amino acid)作为原料 ▼酶及众多蛋白因子,如IF、eIF ▼ ATP、GTP、无机离子
一.生物合成的模板-mRNA
(一)原核生物mRNA的特点
1. S-D(Shine-Dalgarno )序列
原核生物mRNA的起始密码AUG 上游4~7个核苷酸以外有一段 5-UAAGGAGG- 3 的保守序列 称为S-D(Shine-Dalgarno Sequence) 该序列是核糖体识别结合的位点.
大亚基 50 S 60 S
小亚基 30 S 40 S
不同细胞核蛋白体的组成
原核生物
真核生物
核
核
S
蛋 白
小亚基
大亚基
蛋 白
小亚基
大亚基
体
体
70S
rRNA
蛋白 质
30S
16SrRNA
rpS 21 种
50S 80S
5S-rRNA 23S-rRNA
rpL 36种
40S
18SrRNA
rpS 33 种
60S
28S-rRNA 5S-rRNA 5.8S-rRNA
(二)特殊密码: (special coden)
◆ 起始密码(initiation coden ):第一个AUG
AUG 意义:编码甲硫氨酸, 原核生物为甲酰化甲硫氨酸
◆终止密码(terminatiom coden)
UAA、
UAG 、 UGA
(赭石) (琥珀) (乳白石)
(三)密码总数: 61个编码20种氨基酸
氨基酸 +ATP-E —→ 氨基酰-AMP-E + AMP + PPi
第二步反应
氨基酰-AMP-E +
tRNA
↓
氨基酰-tRNA +
AMP + E
(3ຫໍສະໝຸດ Baidu活化氨基酸的表示方法:
氨基酰-tRNA的表示方法: Ala-tRNAAla Ser-tRNASer Met-tRNAMet
3.rRNA 4.蛋白因子
(1)起始因子:
原核生物IF :IF-1,IF-2,IF-3
真核生物eIF: eIF-2.eIF -3,eIF -4 帽结合蛋白(CBP/ eIF -4) eIF-5
(2)延长因子EF:
原核生物: EF-T, EF-G 真核生物:EF-1EF-2
(3)释放因子 RF:
原核生物:RF-1, RF-2 ,RF-3, 真核生物: eRF
(二)核糖体蛋白作用
1.维系核糖体稳定结构的骨架 2.保护rRNA防止被核酸酶降解. 3.与rRNA构成功能活性区域. 如: 肽酰基转移酶活性
蛋白因子结合位点 P、A、E氨基酰- tRNA结合位点。
mRNA结合位点
核蛋白体与起始fmet-tRNAfmet的结合
三、蛋白质生物合成的机制
(一)合成元件 - tRNA、 rRNA和蛋白因子
乳糖操纵子模型
5’
3’
Z
YA
3’
转录
5’
5’ mRNA
3’ 翻译
多顺反子
乳糖操纵子结构 调控区
结构基因
DNA
P OZ YA
操纵序列
启动序列
CAP结合位点
转录
mRNA
翻译
Z: β-半乳糖苷酶 Y: 透酶 A:乙酰基转移酶
多肽链1 多肽链2 多肽链3
多顺反子
(二)真核生物mRNA的特点
1. Kozark序列 (Marilyn Kozark)