微生物的概念及分类

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微生物的概念及分类

一、微生物的概念及其在生物分类中的地位

1、微生物的概念

微生物(Microorganism, microbe)一词并非生物分类学上的专门名词,而是指大量的、极其多样的、不借助显微镜看不见的微小生物类群的总称。因此,微生物通常包括病毒、细菌、真菌、原生动物和某些藻类,它们的大小和特征见表1-1。

表1-1.微生物形态、大小和细胞类型

微生物大小近似值细胞特征

病毒0.01~0.25μm非细胞的

细菌0.1~10μm原核生物

真菌2μm~1m 真核生物

原生动物2~1000μm真核生物

藻类1μm~几米真核生物

但是有些例外。如许多真菌子实体、蘑菇等常肉眼可见;相同的,某些藻类能生长几米长。一般来说,微生物可以认为是相当简单的生物,大多数的细菌、原生动物、某些藻类和真菌是单细胞的微生物,即使为多细胞的微生物,也没有许多的细胞类型。病毒甚至没有细胞,只有蛋白质外壳包围着的遗传物质,且不能独立生活。

2、微生物在生物分类中的地位

在生物发展的历史上,曾把所有的生物分为动物界和植物界两大类。而微生物,不仅形体微小、结构简单,而且它们中间有些类型像动物,有些类型像植物,还有些类型既有动物的某些特征,又具有植物的某些特征,因而归于动物或植物都不合适。于是,1866年海克尔(Haeckel)提出区别动物界与植物界的第三界——原生生物界。它包括藻类、原生动物、真菌和细菌。

二、微生物的分类系统

这里仅简述原核微生物和真核微生物的分纲体系。

1 、原核生物界(Procaryotae)

(1)光能营养原核生物门

Ⅰ蓝绿光合细菌纲(蓝细菌类)

Ⅱ红色光合细菌纲

Ⅲ绿色光合细菌纲

(2)化能营养原核生物门

Ⅰ 细菌纲

Ⅱ立克次氏体纲

Ⅲ 柔膜体纲

Ⅳ 古细菌纲

2 、真核微生物(Eucaryotic microbes)

真核策生物主要包括各类真菌,还有粘菌等。

真菌划分各能分类单位的基本原则是以形态特征为主,生理生化、细胞化学和生态等特征为辅。丝状真菌主要根据其孢子产生的方法和孢子本身的特征,以及培养特征来划分各级的分类单位。一些病原真菌的鉴定,寄生和症状也可作为参考依据。真菌可分以下四纲:Ⅰ藻状菌纲菌丝体无分隔,含多个核。有性繁殖形成卵孢子或接合孢子。

Ⅱ子囊菌纲菌丝体有分隔,有性阶段形成子囊孢子。

Ⅲ担子菌纲菌丝体有分隔,有性阶段形成担孢子。

Ⅳ半知菌纲包括一切只发现无性世代未发现有性阶段的真菌。

粘菌也可分为四纲,即

Ⅰ网粘菌纲自细胞两端各自伸出长的粘丝并接连形成粘质的网络——假原质团。

Ⅱ集胞粘菌纲分泌集胞粘菌素,形成假原质团。

Ⅲ粘菌纲形成原质团,腐生性自由生活。

Ⅳ根肿病菌纲形成原质团,专性寄生。亦有将之归于真菌类。

三、微生物的分类依据

1. 形态特征

(1)个体形态镜检细胞形状、大小、排列,革兰氏染色反应,

运动性,鞭毛位置、数目,芽孢有无、形状和部位,荚膜,细胞内含物;放线菌和真菌的菌丝结构,孢子丝、孢子囊或孢子穗的形状和结构,孢子的形状、大小、颜色及表面特征等。

(2)培养特征

1)在固体培养基平板上的菌落(colony)和斜面上的菌苔(lawn)性状(形状、光泽、透明度、颜色、质地等);

2)在半固体培养基中穿刺接种培养的生长情况;

3)在液体培养基中混浊程度,液面有无菌膜、菌环,管底有无絮状沉淀,培养液颜色等。

2.生理生化特征

(1)能量代谢利用光能还是化学能;

(2)对O2的要求专性好氧、微需氧、兼性厌氧及专性厌氧等;

(2)营养和代谢特性所需碳源、氮源的种类,有无特殊营养需要,存在的酶的种类等。

3.生态习性

生长温度,酸碱度,嗜盐性,致病性,寄生、共生关系等。

4.血清学反应

用已知菌种、型或菌株制成抗血清,然后根据它们与待鉴定微生物是否发生特异性的血清学反应,来确定未知菌种、型或菌株。

5 噬菌反应

菌体的寄生有专一性,在有敏感菌的平板上产生噬菌斑,斑的形状和大小可作为鉴定的依据;在液体培养中,噬菌体的侵染液由混浊变为澄清。噬菌体寄生的专业性有差别,寄生范围广的谓多价噬菌体,能侵染同一属的多种细菌;单价噬菌体只侵染同一种的细菌;极端专业化的噬菌体甚至只对同一种菌的某一菌株有侵染力,故可寻找适当专化的噬菌体作为鉴定各种细菌的生物试剂。

6 细胞壁成分

革兰氏阳性细菌的细胞壁含肽聚糖多,脂类少。革兰阴性细菌与之相反。链霉菌属(Streptomyces)的细胞壁含丙氨酸、谷氨酸、甘氨酸和2,6-氨基庚二酸,而含有阿拉伯糖是诺卡氏菌属(Nocardia)

的特征。霉菌细胞壁则主要含几丁质。

7 红外吸收光谱

利用红外吸收谱技术测定微生物细胞的化学成分,了解微生物的化学性质,作为分类依据之一。

8 GC含量

生物遗传的物质基础是核酸,核酸组成上的异同反映生物之间的亲缘关系。就一种生物的DNA来说,它的碱基排列顺序是固定的。测定四种碱基中鸟嘌呤(G)和胞密啶(C)所占的摩尔百分比,就可了解各种微生物DNA分子不同源性程度。亲缘关系接近的微生物,它们的G+G含量相同或近似的两种微生物,不一定紧密相关,因为它们的DNA的四个碱基的排列顺序不一定相同。

9 DNA杂合率

要判断微生物之间的亲缘关系,须比较它们的DNA的碱基顺序,最常用的方法是DNA杂合法。其基本原理是DNA解链的可逆性和碱基配对的专一性。提取DNA并使之解链,再使互补的碱基重新配对结合成双链。根据能生成双链的情况,可测知杂合率。杂合率越高,表示两个DNA之间碱基顺序的相似越高,它们间的亲缘关系也就越近。

10 核糖体核糖酸(rRNA )相关度

在DNA相关度低的菌株之间,rRNA同源性能显示它们的亲缘关系。Rrna-DNA分子杂交试验可没定Rrna的相关度,揭示Rrna 的同源性。

11 rRNA的碱基顺序

RNA的碱基顺序由DNA转录来的,故完全具有相对应的关系。提取并分离细菌内标记的16SrRNA,以核糖核酸消化,可获得各种寡核苷酸,测定这些寡核苷酸上的碱基顺序,可作为细菌分类学的一种标记。

12 核糖体蛋白的组成分析

分离被测细菌的30S和50S核糖体蛋白亚单位,比较其中所含核糖体蛋白的种类及其含量,可将被鉴定的菌株分为若干类群,并

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