2.1 酶促反应动力学
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k+1 k1
ES
k+2
E+P
其中:k+1,k1,k+2——反应速度常数 E,S,ES,P——酶,底物,酶-底物复合物, 产物 根据Michaelis、Menten的单一底物的酶反应模 型,其假设条件为: (1 )在反应过程中,限制反应速度的反应是 ES到 E+P这一步反应; ( 2 ) E+S 到 ES 的反应在整个过程中始终处于动态 平衡; ( 3 )酶以酶游离状态E和酶- 底物复合物ES 的形式 存在,酶在反应过程中总浓度不变; (4)底物浓度比酶-底物络合物浓度要大得多。
k 3 KI k 3
(1-20)
V max 无抑制剂 有竞争性抑制剂
V
Km
CS
对有竞争性抑制的酶促反应动力学方程(119)式取倒数得到
1 1 Km CI 1 (1 ) V Vmax Vmax K I CS 1 Vmax K mI 1 Vmax CS
(1-21)
000010 000009 000008 000007 000006 000005 000004 000003 000002 000001 000000 -0.1 -0.05
-0.1
-0.05
0
0.05 1/C S (L/mmol)
0.1
0.15
0.2
采用Hanes-Woolf法,对实验数据回归,有
C S / V0 22.725 2.007C S
则
1 Vmax 0.498 (mmol/L min) 2.007
K m 22.725 0.498 11.323 (mmol/L)
得
C ES C E 0CS K m CS
(1-4)
(1-10)
将(1-10)式代入(1-1)式,有
k 2C E 0C S VmaxC S V K m CS K m CS
(1-11)
1.1.3 Michaelis-Menten方程的参数估计 对特定的酶促反应,其动力学的M-M方程中 的Vmax和Km是该酶促反应的特征参数。对Vmax和 Km的确定的方法有Lineweaver-Burk法 ;HanesWoolf法 ;Eadie-Hofstee法 ;积分法 等 (1) Lineweaver-Burk法(简称L-B法) 对M-M方程(1-11)式取倒数,得到
k 1C E C S k 1C ES
(1-2)
即:
k 1C ES C ES CE Km k 1CS CS
(1-3)
——酶—底物复合物的解离常数 Km 式中:
k 1 Km k 1
根据假设(3),有:总酶量:
C E 0 C E C ES
联立(1-1)、(1-2)、(1-3)、有
Km 1 1 1 V Vmax Vmax C S
(1-12)
(2) Hanes-Woolf法(简称H-W法) 对L-B法的(1-12)式的等式两端同乘CS , 此种方法减少了CS值过大或过小所带来的测量误 差。 CS Km CS (1-13) V Vmax Vmax (3)Eadie-Hofstee法(简称E-H法) 将M-M方程重排得到 :
非竞争性抑制的作用机理为: E+S
E+I EI+S ES+I k+1
k1
k+3
ES
EI SEI SEI
k+2
E+P
k3
k+4
k4
k+5 k5
其中:k+4,k-4,k+5,k-5,—反应速度常数 I,EI—抑制剂,酶-抑制剂复合物 IES—底物、酶-抑制剂三元复合物 基于稳定态理论,有
dC ES dC EI dC IE S 0 dt dt dt
根据反应的假设条件,可以看出Michaelis、 Menten所建立的酶促反应模型式建立在平衡的基 础之上的,因而称之为“平衡态理论”。
根据假设(1),有单一底物的酶催化反应 的反应速度:
dCS dCP V k2CES dt dt
(1-1)
式中:CP,CS——产物,底物的浓度 t——时间 根据假设(2)有
(3) 当CS介于上述两者之间时 ,为0至1级反应
0.7 0.6 0.5 0.4
V max/2 V max
零级反应
M-M反应
一级反应
V
0.3 0.2 0.1 0 0Km 50 100 150 CS 200 250 300
1.2 有抑制作用的酶促反应动力学 1.2.1 竞争性抑制的酶促反应动力学 当反应物系中存在与底物的结构相似的物质, 这一物质也可能与酶的活性部位结合,形成非活 性的复合物,阻碍了酶与底物的结合,从而影响 酶促反应,这种抑制作用称为竞争性抑制。
第二章 酶促 反应动力学
第一节 酶催化反应的基本特征
• 酶是生物提高其生化反应效率而产生的 生物催化剂,其化学本质是蛋白质。 • 在生物体内,所有的反应均在酶的催化 作用下完成,几乎所有生物的生理现象 都与酶的作用紧密联系。 • 生物酶分为六大类:氧化还原酶、转移 酶、水解酶、裂合酶、异构酶、合成酶。
90 80
CS /V 0 (1/ min)
70 60 50 40 30 20 10 0 -5 5 15 25 35
斜率=1/V max =2.007 截距=K m /V max =22.725
-K m =-11.323
-15
C S (mmol/L)
采用Eadie-Hofstee法,对实验数据回归,有
1/V (mmol/Lh)
-1
有竞争性抑制剂 斜率=K mI /V max
无抑制剂 斜率=K m /V max 截距=1/V max
0 1/C S 0.05 0.1 (mmol/L)-1
0.15
0.2
1.2.2 非竞争性抑制的酶促反应动力学 当反应物系中存在与酶的活性部位以外相结 合,且这一结合与底物的结合无竞争性关系的抑 制作用称为非竞争性抑制。与竞争性抑制相比较, 当有非竞争性抑制剂时,无论如何提高底物的浓 度也不会消除其抑制作用。
V0 V0 0.503 11.583 CS
则
K m 11.583 (mmol/ L) Vmax 0.503 (mmol/ L min)
0.6 0.5
V 0 (mmol/Lmin)
截距=V max =0.503
0.4 0.3 0.2 0.1 0 0 0.01 0.02 0.03 0.04 0.05 V 0/C S (1/min)
V Vmax V Km CS
(1-14)
(4)积分法 用不同的酶促反应的时间t与其反应过 程相对应的底物浓度之间的函数关系通过 作图或回归的方法确定酶促反应动力学参 数。
CS0 ln CS Vmax 1 t CS0 CS Km K m CS0 CS
(1-15)
例:在 pH5.1 、 15℃下所测定的用葡萄糖淀粉酶水解麦芽 糖的反应初速度V0如表所示。求这一酶促反应的动力学参 数Vmax和Km 。 表1-1 葡萄糖淀粉酶水解麦芽糖的反应初速度与底物浓度
dCES k 1C E C S k 1C ES k 2 C ES 0 dt (1-7)
则
C ES k 1 k 2 C ES CE Km k 1 CS CS
(1-8) Hale Waihona Puke Baidu中
k 1 k 2 Km k 1
(1-9)
称作M-M常数
代入总酶量
C E 0 C E C ES
竞争性抑制的机理为:
E+S E+I k+1
k1
k+3
ES EI
k+2
E+P
k3
其中:k+3,k+3—反应速度常数 I,EI—抑制剂,酶-抑制剂复合物
基于稳定态理论,有
dCES k 1C E CS k 1C ES k 2 C ES 0 dt (1-16) dCEI k 3C E C I k 3C EI 0 dt
则
1 Vmax 0.505 (mmol/L min) 1.981
K m 23.100 0.505 11.661 (mmol/L)
7
1/V 0 (L•min/ mmol)
6 5 4 3 2 1 0
截距=1/V max =1.981 斜率=K m /V max =23.100
-1/K m =-0.0858
k 2C E 0C S VmaxC S V CS CS Km Km
(1-4)
(1-5)
式中: Vmax——最大的酶促反应速度。
Vmax k 2 C E 0
(1-6)
1.1.2 Briggs-Haldane对M-M方程的修正 1925年 Briggs和Haldane认为在酶促反应过程 中,反应的中间体ES(酶-底物复合物)的浓度 不随反应时间而变化,即在酶促反应过程中,反 应的中间体ES的浓度处于稳定的状态,基于这一 假设所得到的酶促反应的模型称之为“稳定态理 论”。即
CS(mmol/L) 5.55 8.33 11.11 13.89 16.66 22.22 27.77 V0(mmol/ L· min) 0.163 0.211 0.241 0.276 0.301 0.339 0.347
解:采用Lineweaver-Burk法,对实验数据回归,
有
1 1 1.981 23.100 V0 CS
(1-17) 总酶量为
(1-18)
C E 0 C E C ES C EI
联立(1-4)、(1-16)、(1-17)、(1-18)式, 有
Vmax C S Vmax C S V CI K m I CS K m (1 ) CS KI
(1-19) 式中:KmI—竞争性抑制的表观M-M常数 KI—抑制剂的解离常数
斜率=- K m=-11.583
1.1.4 酶促反应的反应级数 (1) 当CS远小于Km时 ,为一级反应
dC S VmaxC S Vmax V CS dt K m CS Km
(2) 当CS远大于Km时,为零级反应。
dC S VmaxC S V Vmax dt K m CS
0~37 0~37 0~37 0~37
化学催化剂 硅胶-氧化铝 硅胶-氧化铝 二氧化钒 二氧化钒
异丙基苯裂解 异丙基苯裂解 环己烷脱氢 环己烷脱氢
3×10-8 2×104 7×10-11 1×102
25 420 25 350
酶活力表示方法
1 酶的分子活力:在最适宜条件下,每 1mol 酶在单位时间内所能催化底物的最大量 (mol) 2 酶的催化中心活力:在单位时间内,每一个 酶的催化中心所催化底物的量(mol) 3 酶活力:在特定条件下,每1min能催化1mol 底物转化为产物时所需要的酶量,称为一个 酶单位,或称为国际单位,用U表示。酶活 力还可用比活力表示。比活力系指每1mg酶 所具有的酶单位数,用U/mg表示。
酶催化反应和化学催化反应的转换数大小的比较
催化剂 酶催化剂 菠萝蛋白酶 木瓜蛋白酶 胰蛋白酶 碳酸肝酶 反应 转换数 mol/(中心点· S ) 4×10-3~5×10-1 8×10-2~1×10 3×10-3~1×102 8×10-1~6×105 温度℃
肽的水解 肽的水解 肽的水解 羰基化合物的 可逆反应
(1-22)
总酶量为
C E 0 C E C ES C EI C IES
(1-23)
有非竞争性抑制的酶促反应动力学方程
VmaxI CS V CI ( K m CS )(1 ) K m CS KI Vmax CS
(1-24)
V max
无抑制剂 V max I
第二节
均相的酶促 反应动力学
1.1. 酶促反应的Michaelis-Menten方程 1.1.1. 酶促反应的Michaelis-Menten方程
Michaelis、Menten(1913)提出了单一底 物的酶反应模型,基本内容是:酶E的底物S首 先形成酶—底物复合物ES,在酶—底物复合物 ES的基础上反应生成产物P和酶E。反应式如下: E+S
• 绝对专一性 :一种酶只能催化一种化合物进行一 种反应 • 相对专一性:一种酶能够催化一类具有相同化学键 或基团的物质进行某种类型的反应
• 反应专一性:一种酶只能催化某化合物在热力学上 可能进行的许多反应中的一种反应 • 底物专一性 :一种酶只能催化一种底物
• 立体专一性:一种酶只能作用于所有立体异构体中 的一种
ES
k+2
E+P
其中:k+1,k1,k+2——反应速度常数 E,S,ES,P——酶,底物,酶-底物复合物, 产物 根据Michaelis、Menten的单一底物的酶反应模 型,其假设条件为: (1 )在反应过程中,限制反应速度的反应是 ES到 E+P这一步反应; ( 2 ) E+S 到 ES 的反应在整个过程中始终处于动态 平衡; ( 3 )酶以酶游离状态E和酶- 底物复合物ES 的形式 存在,酶在反应过程中总浓度不变; (4)底物浓度比酶-底物络合物浓度要大得多。
k 3 KI k 3
(1-20)
V max 无抑制剂 有竞争性抑制剂
V
Km
CS
对有竞争性抑制的酶促反应动力学方程(119)式取倒数得到
1 1 Km CI 1 (1 ) V Vmax Vmax K I CS 1 Vmax K mI 1 Vmax CS
(1-21)
000010 000009 000008 000007 000006 000005 000004 000003 000002 000001 000000 -0.1 -0.05
-0.1
-0.05
0
0.05 1/C S (L/mmol)
0.1
0.15
0.2
采用Hanes-Woolf法,对实验数据回归,有
C S / V0 22.725 2.007C S
则
1 Vmax 0.498 (mmol/L min) 2.007
K m 22.725 0.498 11.323 (mmol/L)
得
C ES C E 0CS K m CS
(1-4)
(1-10)
将(1-10)式代入(1-1)式,有
k 2C E 0C S VmaxC S V K m CS K m CS
(1-11)
1.1.3 Michaelis-Menten方程的参数估计 对特定的酶促反应,其动力学的M-M方程中 的Vmax和Km是该酶促反应的特征参数。对Vmax和 Km的确定的方法有Lineweaver-Burk法 ;HanesWoolf法 ;Eadie-Hofstee法 ;积分法 等 (1) Lineweaver-Burk法(简称L-B法) 对M-M方程(1-11)式取倒数,得到
k 1C E C S k 1C ES
(1-2)
即:
k 1C ES C ES CE Km k 1CS CS
(1-3)
——酶—底物复合物的解离常数 Km 式中:
k 1 Km k 1
根据假设(3),有:总酶量:
C E 0 C E C ES
联立(1-1)、(1-2)、(1-3)、有
Km 1 1 1 V Vmax Vmax C S
(1-12)
(2) Hanes-Woolf法(简称H-W法) 对L-B法的(1-12)式的等式两端同乘CS , 此种方法减少了CS值过大或过小所带来的测量误 差。 CS Km CS (1-13) V Vmax Vmax (3)Eadie-Hofstee法(简称E-H法) 将M-M方程重排得到 :
非竞争性抑制的作用机理为: E+S
E+I EI+S ES+I k+1
k1
k+3
ES
EI SEI SEI
k+2
E+P
k3
k+4
k4
k+5 k5
其中:k+4,k-4,k+5,k-5,—反应速度常数 I,EI—抑制剂,酶-抑制剂复合物 IES—底物、酶-抑制剂三元复合物 基于稳定态理论,有
dC ES dC EI dC IE S 0 dt dt dt
根据反应的假设条件,可以看出Michaelis、 Menten所建立的酶促反应模型式建立在平衡的基 础之上的,因而称之为“平衡态理论”。
根据假设(1),有单一底物的酶催化反应 的反应速度:
dCS dCP V k2CES dt dt
(1-1)
式中:CP,CS——产物,底物的浓度 t——时间 根据假设(2)有
(3) 当CS介于上述两者之间时 ,为0至1级反应
0.7 0.6 0.5 0.4
V max/2 V max
零级反应
M-M反应
一级反应
V
0.3 0.2 0.1 0 0Km 50 100 150 CS 200 250 300
1.2 有抑制作用的酶促反应动力学 1.2.1 竞争性抑制的酶促反应动力学 当反应物系中存在与底物的结构相似的物质, 这一物质也可能与酶的活性部位结合,形成非活 性的复合物,阻碍了酶与底物的结合,从而影响 酶促反应,这种抑制作用称为竞争性抑制。
第二章 酶促 反应动力学
第一节 酶催化反应的基本特征
• 酶是生物提高其生化反应效率而产生的 生物催化剂,其化学本质是蛋白质。 • 在生物体内,所有的反应均在酶的催化 作用下完成,几乎所有生物的生理现象 都与酶的作用紧密联系。 • 生物酶分为六大类:氧化还原酶、转移 酶、水解酶、裂合酶、异构酶、合成酶。
90 80
CS /V 0 (1/ min)
70 60 50 40 30 20 10 0 -5 5 15 25 35
斜率=1/V max =2.007 截距=K m /V max =22.725
-K m =-11.323
-15
C S (mmol/L)
采用Eadie-Hofstee法,对实验数据回归,有
1/V (mmol/Lh)
-1
有竞争性抑制剂 斜率=K mI /V max
无抑制剂 斜率=K m /V max 截距=1/V max
0 1/C S 0.05 0.1 (mmol/L)-1
0.15
0.2
1.2.2 非竞争性抑制的酶促反应动力学 当反应物系中存在与酶的活性部位以外相结 合,且这一结合与底物的结合无竞争性关系的抑 制作用称为非竞争性抑制。与竞争性抑制相比较, 当有非竞争性抑制剂时,无论如何提高底物的浓 度也不会消除其抑制作用。
V0 V0 0.503 11.583 CS
则
K m 11.583 (mmol/ L) Vmax 0.503 (mmol/ L min)
0.6 0.5
V 0 (mmol/Lmin)
截距=V max =0.503
0.4 0.3 0.2 0.1 0 0 0.01 0.02 0.03 0.04 0.05 V 0/C S (1/min)
V Vmax V Km CS
(1-14)
(4)积分法 用不同的酶促反应的时间t与其反应过 程相对应的底物浓度之间的函数关系通过 作图或回归的方法确定酶促反应动力学参 数。
CS0 ln CS Vmax 1 t CS0 CS Km K m CS0 CS
(1-15)
例:在 pH5.1 、 15℃下所测定的用葡萄糖淀粉酶水解麦芽 糖的反应初速度V0如表所示。求这一酶促反应的动力学参 数Vmax和Km 。 表1-1 葡萄糖淀粉酶水解麦芽糖的反应初速度与底物浓度
dCES k 1C E C S k 1C ES k 2 C ES 0 dt (1-7)
则
C ES k 1 k 2 C ES CE Km k 1 CS CS
(1-8) Hale Waihona Puke Baidu中
k 1 k 2 Km k 1
(1-9)
称作M-M常数
代入总酶量
C E 0 C E C ES
竞争性抑制的机理为:
E+S E+I k+1
k1
k+3
ES EI
k+2
E+P
k3
其中:k+3,k+3—反应速度常数 I,EI—抑制剂,酶-抑制剂复合物
基于稳定态理论,有
dCES k 1C E CS k 1C ES k 2 C ES 0 dt (1-16) dCEI k 3C E C I k 3C EI 0 dt
则
1 Vmax 0.505 (mmol/L min) 1.981
K m 23.100 0.505 11.661 (mmol/L)
7
1/V 0 (L•min/ mmol)
6 5 4 3 2 1 0
截距=1/V max =1.981 斜率=K m /V max =23.100
-1/K m =-0.0858
k 2C E 0C S VmaxC S V CS CS Km Km
(1-4)
(1-5)
式中: Vmax——最大的酶促反应速度。
Vmax k 2 C E 0
(1-6)
1.1.2 Briggs-Haldane对M-M方程的修正 1925年 Briggs和Haldane认为在酶促反应过程 中,反应的中间体ES(酶-底物复合物)的浓度 不随反应时间而变化,即在酶促反应过程中,反 应的中间体ES的浓度处于稳定的状态,基于这一 假设所得到的酶促反应的模型称之为“稳定态理 论”。即
CS(mmol/L) 5.55 8.33 11.11 13.89 16.66 22.22 27.77 V0(mmol/ L· min) 0.163 0.211 0.241 0.276 0.301 0.339 0.347
解:采用Lineweaver-Burk法,对实验数据回归,
有
1 1 1.981 23.100 V0 CS
(1-17) 总酶量为
(1-18)
C E 0 C E C ES C EI
联立(1-4)、(1-16)、(1-17)、(1-18)式, 有
Vmax C S Vmax C S V CI K m I CS K m (1 ) CS KI
(1-19) 式中:KmI—竞争性抑制的表观M-M常数 KI—抑制剂的解离常数
斜率=- K m=-11.583
1.1.4 酶促反应的反应级数 (1) 当CS远小于Km时 ,为一级反应
dC S VmaxC S Vmax V CS dt K m CS Km
(2) 当CS远大于Km时,为零级反应。
dC S VmaxC S V Vmax dt K m CS
0~37 0~37 0~37 0~37
化学催化剂 硅胶-氧化铝 硅胶-氧化铝 二氧化钒 二氧化钒
异丙基苯裂解 异丙基苯裂解 环己烷脱氢 环己烷脱氢
3×10-8 2×104 7×10-11 1×102
25 420 25 350
酶活力表示方法
1 酶的分子活力:在最适宜条件下,每 1mol 酶在单位时间内所能催化底物的最大量 (mol) 2 酶的催化中心活力:在单位时间内,每一个 酶的催化中心所催化底物的量(mol) 3 酶活力:在特定条件下,每1min能催化1mol 底物转化为产物时所需要的酶量,称为一个 酶单位,或称为国际单位,用U表示。酶活 力还可用比活力表示。比活力系指每1mg酶 所具有的酶单位数,用U/mg表示。
酶催化反应和化学催化反应的转换数大小的比较
催化剂 酶催化剂 菠萝蛋白酶 木瓜蛋白酶 胰蛋白酶 碳酸肝酶 反应 转换数 mol/(中心点· S ) 4×10-3~5×10-1 8×10-2~1×10 3×10-3~1×102 8×10-1~6×105 温度℃
肽的水解 肽的水解 肽的水解 羰基化合物的 可逆反应
(1-22)
总酶量为
C E 0 C E C ES C EI C IES
(1-23)
有非竞争性抑制的酶促反应动力学方程
VmaxI CS V CI ( K m CS )(1 ) K m CS KI Vmax CS
(1-24)
V max
无抑制剂 V max I
第二节
均相的酶促 反应动力学
1.1. 酶促反应的Michaelis-Menten方程 1.1.1. 酶促反应的Michaelis-Menten方程
Michaelis、Menten(1913)提出了单一底 物的酶反应模型,基本内容是:酶E的底物S首 先形成酶—底物复合物ES,在酶—底物复合物 ES的基础上反应生成产物P和酶E。反应式如下: E+S
• 绝对专一性 :一种酶只能催化一种化合物进行一 种反应 • 相对专一性:一种酶能够催化一类具有相同化学键 或基团的物质进行某种类型的反应
• 反应专一性:一种酶只能催化某化合物在热力学上 可能进行的许多反应中的一种反应 • 底物专一性 :一种酶只能催化一种底物
• 立体专一性:一种酶只能作用于所有立体异构体中 的一种