斑马鱼胚胎整体原位免疫荧光实验
斑马鱼相关实验操作
斑马鱼人工繁殖、受精和胚胎发育一、实验目的了解斑马鱼的生活和繁殖习性，掌握斑马鱼人工繁殖技术，了解斑马鱼受精、胚胎发育过程和形态模式形成的特点。
二、斑马鱼的生活和繁殖习性斑马鱼（Danio rerio）为热带鱼类，可在一年内多次产卵。
在合适的养殖条件下，4月龄的斑马鱼即性成熟；性成熟后每1-2周可以产卵一次，一条雌鱼一次可以产出数百颗卵子。
斑马鱼产卵受温度和光照长度的调节。
最适产卵水温为28.5℃，产卵的光调节周期为光照14小时，黑暗10小时。
为防止自然产卵，性成熟的雌、雄斑马鱼必须分开养殖。
斑马鱼具有下列特点：1、繁殖周期短，不受季节限制，容易获得所需要的精子、卵子和胚胎材料。
2、小型鱼类，可在实验室高密度养殖，饲养成本低。
3、是脊椎动物，具有和人类相似的器官和组织。
4、体外受精、体外发育，胚胎培养条件简单。
5、胚胎透明，可以在活体上直接观察器官的发育。
6、发育周期短，在28.5℃温度下培养，受精后24小时即可以形成个体的基本结构。
因此，斑马鱼现在选择作为发育生物学研究的模式动物。
三、实验器材和材料斑马鱼养殖系统，大塑料盆（直径约58cm）两个，塑料筛框（直径约36cm）一个，中号塑料盆（直径约36cm）1个，加热棒，加气泵，12cm培养皿若干，9cm培养皿若干，数个胶头滴管。
曝气水10L。
性成熟雌、雄性斑马鱼。
四、实验内容和程序实验前一天的准备：1、在实验前一天的早上向2个大塑料盆中放大半盆干净的自来水，放入气泵和加热棒，将加热棒温度调整至28℃（每个加热棒都有差异，需要放入温度计，根据温度计指示的实际温度调节和校准温度计），以供斑马鱼催产繁殖时使用。
2、曝气水将干净的自来水烧开后冷却，将气泵放入其中进行曝气，以为培养胚胎之用。
3、斑马鱼的选取和催产雌雄鱼的鉴别：性成熟的雄鱼体型修长，腹部较小，而雌鱼腹部较大。
选鱼的时间在实验前一天的晚上，在选取斑马鱼之前需要喂食红虫，喂食后1小时才开始选鱼。
敲低胎盘特异性蛋白8(PLAC8)抑制人胚胎干细胞增殖并促进其凋亡
细胞与分子免疫学杂志(Chin J Cell Mol Immunol)2020, 36(12)1089•论著• 文章编号：1007 - 8738(2020)12 -1089 -06敲低胎盘特异性蛋白8(PLAC8)抑制人胚胎干细胞增殖并促进其凋亡李如梅"2,李敏2,陈蕾Z **收稿日期：2020 - 03 - 06；接受日期：2020 -11 -03基金项目：国家自然科学基金(8170060984)；海军“十二五”项目(CHJ11J015)作者简介：李如梅(1994 -),女，安徽蚌埠人，医师，硕士研究生Tel ： 188****1524； E-mail ： 1596876521 @qq. com* 通讯作者，陈蕾，E-mail : 3313400243@ qq. com('安徽医科大学海军临床学院妇产科，安徽合肥230032；'解放军总医院第六医学中心妇产科，北京100048)［摘要］目的 探讨胎盘特异性蛋白8(PLAC8)对人胚胎干细胞(hESC)增殖和凋亡的影响。
方法 实时荧光定量PCR 和Western blot 法检测空载体组、PLAC8短发夹RNA(shPLAC8)组、过表达PLAC8(PLAC8-OE)组感染hESC 的效率；以及各组细胞增殖细胞核抗原(PCNA)和细胞周期蛋白Dl(CCNDl)的mRNA 和蛋白水平。
流式细胞术检测敲低和过表达PLAC8对hESC 凋亡的影响。
结果PLAC8敲低组的CCND1、PCNA 的mRNA 和蛋白水平降低，细胞凋亡增加；PLAC8过表达组CCND1和PCNA 的mRNA 和蛋白表达略上调，细胞凋亡略有下降，但差异均无统计学意义。
结论 敲低PLAC8的表达会抑制hESC 增殖并促进其凋亡。
［关键词］人胚胎干细胞(hESC)；胎盘特异性蛋白8(PLAC8)；细胞增殖；细胞凋亡［中图分类号］R392-33, Q813.7, Q25［文献标志码］A体外受精-胚胎移植(in vitro fertilization-embryo transfer, IVF-ET )是现代最常用的辅助生殖技术 (assisted reproductive technology , ART),其诞生至今经历了飞速的发展，为广大不孕不育患者带来了福 音⑴。
斑马鱼原位杂交实验方案
斑马鱼全胚胎原位杂交技术Form Dr. Kevin第一节原位杂交技术的历史Joseph G. Gall被誉为现代细胞生物学的一位奠基人，他在染色体结构和功能领域作出了杰出贡献，并发明了原位杂交技术（in situ hybridization，ISH）。
自Gall同他的研究生Mary Lou Paudue和Susan Gerbi在1969年利用放射性标记DNA在爪蟾组织切片中检测基因表达后，原位杂交技术逐渐发展为一种能使研究人员在一个染色体上定位并确定出基因和特殊的DNA序列的强大方法，推动了分子生物学的巨大进步。
Kathleen H. Cox于1984年发明了用单链RNA探针进行原位杂交的技术。
ISH技术在斑马鱼中的应用始于Westerfield等利用该技术在斑马鱼切片中检测基因的表达。
同年, Nusslein-Volhard 等将Cox 建立的RNA 原位杂交技术进行了改进, 用地高辛（digoxin）标记的RNA 在斑马鱼胚胎中检测基因表达。
2008 年, Bernard Thisse 等将该技术进一步优化, 使之更敏感, 也提高了基因表达检测的分辨率，我们在这里介绍的整胚原位杂交技术主要参照Thisse实验室2008年版本（Thisse, C. and Thisse, B., 2008, High resolution in situ hybridization on whole-mount zebrafish embryo. Nat. protoc. 3 : 59 –69）。
第二节原位杂交技术的原理原位杂交能在成分复杂的组织中进行单一细胞的研究而不受同一组织中其他成分的影响，因此对于那些细胞数量少且散在于其他组织中的细胞内DNA或RNA研究更为方便；同时由于原位杂交不需要从组织中提取核酸，对于组织中含量极低的靶序列有极高的敏感性，并可完整地保持组织与细胞的形态，更能准确地反映出组织细胞的相互关系及功能状态。
斑马鱼-全胚胎免疫组织化学染色
斑马鱼-全胚胎免疫组织化学染色斑马鱼胚胎的全组织免疫化学染色被广泛应用，这一技术需要额外的步骤来固定和通透以确保卵膜能够完全被溶液渗透。
固定、封闭、抗体孵育、洗脱、通透以及底物显色过程都需要比正常的免疫细胞化学/免疫组化更长的时间，以使得溶液可以渗透到达样品的中心。
实验步骤：1. 将胚胎置于5ml的器皿中固定1h。
固定液的选择要谨慎，取决于两点：一是对于同一种抗体，在冰冻切片中成功使用的固定液，可用来做全胚胎染色实验，二是根据目的蛋白。
可用4%的多聚甲醛或者预混合的固定液来固定，预混合的固定液十分适合于神经蛋白。
使用Pasteur移液管来移动胚胎、吸取溶液，这有利于防止来自于移液管窄末端对胚胎的损坏。
2. 用含1%Triton的PBS清洗胚胎至少四次，每次5分钟。
3. 将胚胎置于冰丙酮/PBS混合液中8分钟。
丙酮可用帮助通透坚固的卵膜，对于其他样品如鸡和鼠这一步可省略。
4. 用含1%Triton的PBS清洗胚胎至少四次，每次5分钟。
5. 用封闭液（含1%Triton、10%胎牛血清的PBS）室温孵育胚胎1h。
6. 阻断过氧化物酶：将胚胎置于含0.1%H2O2的封闭液中4°C过夜。
7. 用封闭液清洗胚胎2次。
8. 将Pasteur移液管末端剪掉形成2ml的管子，用其转移胚胎。
加入合适浓度的一抗。
一般在全胚胎染色中抗体孵育的时间比较久，为了防止微生物的生长，在稀释一抗的封闭液中会加入0.02%的叠氮化钠。
9. 样品在混合器上4°C缓慢旋转孵育1-4天。
根据不同的抗体以及胚胎的大小，孵育的时间需要进行一些优化。
10. 用含1%Triton、10%胎牛血清的PBS清洗胚胎3次，每次1h。
11. 用含1%Triton的PBS清洗3次，每次10分钟。
12. 用DAB底物室温孵育胚胎2-3h。
13. 将胚胎转移到一个碟子中，加入新鲜的配制的显示底物（每1mlDAB加5ul的过氧化氢）。
14. 用PBS清洗3次，使得样品达到理想的染色强度。
转基因斑马鱼胚胎养殖技巧
转基因斑马鱼胚胎养殖技巧引言：转基因技术是现代生物技术的重要组成部分，通过改变生物体的基因组，使其具有新的特性或功能。
斑马鱼作为一种常见的实验动物模型，被广泛应用于生物学研究中。
本文将介绍转基因斑马鱼胚胎养殖技巧，帮助研究者顺利进行相关实验。
一、斑马鱼胚胎的获取斑马鱼胚胎的获取是进行转基因实验的第一步。
通常情况下，斑马鱼胚胎可以通过自然产卵或人工授精获得。
为了提高产卵的效率，可以将斑马鱼置于特定的环境条件下，如适宜的水温和光照条件。
此外，还可以使用药物刺激促进斑马鱼产卵。
对于人工授精，可以将雄性和雌性斑马鱼分别放入相同的容器中，利用它们的自然产卵和受精过程来获得胚胎。
二、胚胎的培养获得斑马鱼胚胎后，需要进行胚胎的培养。
首先，将胚胎转移到培养皿中，添加适宜的培养液，如E3培养液。
E3培养液中含有必需的营养物质，可以为斑马鱼胚胎提供所需的营养。
同时，保持培养皿中的水温和光照条件也非常重要，通常将其保持在28-30摄氏度，并提供适量的光照。
三、转基因技术的应用在斑马鱼胚胎培养的基础上，可以进行转基因技术的应用。
目前，常用的转基因技术包括转基因敲除和转基因过表达。
转基因敲除是通过将外源基因导入斑马鱼胚胎，使其失去特定基因的功能。
而转基因过表达是将外源基因导入斑马鱼胚胎，使其在特定生理条件下过度表达。
这些转基因技术可以帮助研究者研究特定基因的功能和调控机制。
四、转基因斑马鱼胚胎的鉴定进行转基因实验后，需要对转基因斑马鱼胚胎进行鉴定。
常用的鉴定方法包括PCR、荧光显微镜观察和基因测序等。
PCR是一种常用的分子生物学技术，可以通过检测特定基因的存在来鉴定转基因斑马鱼胚胎。
荧光显微镜观察则是通过检测转基因斑马鱼是否发出特定颜色的荧光来鉴定。
基因测序则可以直接确定转基因斑马鱼胚胎中特定基因的序列，从而进行准确的鉴定。
五、转基因斑马鱼胚胎的进一步研究鉴定转基因斑马鱼胚胎后，可以进行进一步的研究。
例如，可以观察转基因斑马鱼胚胎在不同生理条件下的表型变化。
斑马鱼的原位杂交技术
斑马鱼的原位杂交技术整理人邵明:将特定时期的斑马鱼胚胎在多聚甲醛中C4%4o固定过夜第一天：、洗1PBST2x5min、剥膜2、洗3PBST5min可选步骤蛋白酶处理前的胚胎不处理(: K: 24hpf, 24hpf-的胚胎蛋白酶处理分钟以后的胚胎处理半小时48hpf10ug/ml K15, 48hpf,然后洗PBST3x5min)、C5min4hyb- 65o孵育、C4h（可选步骤: 可将胚胎置于hyb+中-20oC长期储存）5hyb+ 65o孵育、加探针(探针孵育置于冰上65oC10min, 5min, 655oC-孵育过夜65oC先将然后使用).第二天：、回收探针, I2x30min1（探针可以重复使用10次以上）洗液孵育探针的温度、洗液孵育探针的温度2II 1x15min、洗液孵育探针的温度3III 2x30min、室温4MABT 3x5min、封闭液孵育室温5 4h、AP, 4oC (-20oC, 61:2500 Anti DIG-稀释于封闭液中孵育过夜稀释好的抗体保存于可重复使用3次以上。
)第三天、回收抗体1、2MABT 2x30min3、PBST 2x30min、平衡缓冲液左旋咪唑4+0.5mg/ml （60mg/ml左旋咪唑储液稀释120倍）孵育10min、显色液中孵育直到信号足够强为止。
5试剂配方固定液: 4% 多聚甲醛（paraformaldehyde）in 1XPBSWeigh 2 g PFA and dissolve it in 50 ml 1XPBS. (PFA is hard to dissolve.) Incubate the mixture at 65oC for around 2 hours. Shake the mixture during the incubation). After dissolved, the solution is stored at 4oC.10XPBS stock solution: mix 76 g NaCl, 9.9 g Na2HPO4, 3.6g NaH2PO4. Dissolve them in less than 1 liter nanopure water, adjust to pH7.0 and a final volume of 1 liter. Autoclave for 35 minutes to sterilize.130 mM NaCl = 10 X 0.13 X 58.44=76 g NaCl7 mM Na2HPO4 = 10 X 0.007 X 142 = 9.9 g Na2HPO43 mM NaH2PO4 = 10 X 0.003 X 120 = 3.6 g NaH2PO4Paraformaldehyde (PFA) (Mallinckrodt 2621).（注意所用的试剂有没有结晶水）Proteinase K (Sigma P-2308); Stock solution (10 mg/ml = 10 ug/ul): weigh 10 mg proteinase K and dissolve in 1 ml nanopure water. Aliquot 50 ul each and store at -20oC. Thaw at room temperature before usage. Long storage may appear to see white precipitate after thawing. V ortex the tube and make sure the precipitate be mixed evenly.20XSSCFor 1 liter: 1 X 3 mol = 3 X 58.44 =175.3 g NaCl1X 0.3 mol = 0.3 X 294.1 = 88.2 g Na3.Citrate.2H20adjust pH=7 using HCl. autoclave 35 minutes for sterilizeization.（注意所用的试剂有没有结晶水）Yeast RNA: dissolve 50 mg RNA in 1 ml nanopure water (50 mg/ml); store at -20oC肝素（Heparin） (Sigma H3393): dissolve 50 mg heparin in 1 ml nanopure water (50 mg/ml); store at -20oCMAB X 2 liters pH7.5100 mM Maleic acid (Sigma M-0375) = 23.2 g (2 X 0.1 X116.1)150 mM NaCl = 17.5g (2 X 0.15 X 58.44)add solid (? g) to adjust pH=7.5, autoclave for 35 minutes to sterlize.Blocking regent (1096 176, Boehringer Mannheim, now Roche?). 10% stock solution. Weigh 10 g blocking regent and dissolve it in 100 ml MAB, shaking and heating in a microwave oven for 1 minutes (?), autoclave for 25 minutes and then aliquot into 14 ml and store at -20oC.50mg/ml 酵母RNA：称取2g酵母RNA干粉（生工），加入40ml去离子水，超声振荡溶解，-20oC保存。
FISH以及免疫荧光的实验步骤
FISH以及免疫荧光的实验步骤FISH（荧光原位杂交）是一种用于检测DNA或RNA序列的实验技术。
该技术结合了传统原位杂交和荧光显微镜技术，可以在细胞或组织样本中定位、标记和可视化特定的DNA或RNA分子。
下面是一个典型的FISH实验的步骤：1.准备标记探针：选择适当的探针来标记目标DNA或RNA序列。
探针通常是短的DNA或RNA片段，与目标序列互补，可以与其发生特异性杂交。
这些探针可以使用不同的标记物进行标记，如荧光染料或辐射性同位素。
2.样品制备：根据需要，制备细胞悬液或组织切片样品。
细胞悬液可以通过离心细胞，将细胞固定在载玻片上。
组织切片可以使用刮片或切片机获得，然后固定在载玻片上。
3.固定样品：将细胞悬液或组织切片固定在载玻片上，以保持细胞或组织的形态结构。
常用的固定剂包括乙醇、甲醛等。
4. 渗透化处理：使用渗透化剂渗透细胞或组织样品，以增加探针和标记物的进入性能。
常用的渗透化剂包括蛋白酶K和Triton X-100。
5.探针杂交：将标记的探针与样品中的DNA或RNA序列结合。
首先在浓度适宜的探针液中孵育样品，使探针与目标序列发生杂交。
温度和时间取决于探针和目标序列的碱基组成和长度，通常需要在高温下进行，以增加探针与目标序列的特异性。
6.杂交后的冲洗：使用适当的缓冲液冲洗样品，以去除未结合的探针和杂交条件中的非特异性结合。
冲洗通常需要进行多次，以确保特异性结合。
7.荧光染色：如果探针是荧光标记的，在杂交后可以直接进行荧光染色。
将样品浸泡在适当浓度的荧光染料中，以标记目标序列。
染色时间通常较短，一般在15-30分钟左右。
8.荧光显微镜观察：在荧光显微镜下观察和记录标记的目标序列的位置和数量。
使用适当的滤光片来选择和分离目标染色的荧光波长。
利用计算机软件，可以对显微镜下的图像进行分析和处理，以获得更多的信息。
在进行FISH实验时，需要注意一些技术细节和注意事项：1.适当的正向和阴性对照是必要的，以确保实验的准确性和可靠性。
分子生物学实验技术斑马鱼胚胎显微注射实验步骤
斑马鱼胚胎显微注射实验步骤：显微注射是指在显微镜下操作的微量注射技术。
可将细胞的某一部分(如细胞核、细胞质或细胞器)或外源物质(如外源基因、DNA片段、信使核糖核酸、蛋白质等)通过玻璃毛细管拉成的细针，注射到细胞质或细胞核内。
是研究各种生物分子的作用、制作转基因动物、克隆动物等的重要技术。
显微注射应用的范围非常广泛，从辅助（体外）细胞受精技术至分子和细胞基本组分的转运都需使用这一技术，比较典型的是将某些物质注射进细胞中以操作和/或监测某种特定的存活细胞中的基本机体生物化学状态。
这些可以注射进细胞的物质包括有：各种细胞器、激酶、组织化学标志物（比如辣根过氧化物酶或者荧光黄）、蛋白质、代谢物质、微磁头、离子、抗体、基因、分子生物学的mRNA和DNA等等。
运用这一技术，也可以实现用于单个细胞或一组细胞的较少量（皮升至毫升）药剂或药物的精确输送（微灌注），例如药理学的药物检验。
斑马鱼个体小，养殖成本低，能大规模繁殖，胚胎透明，体外发育，肉眼可见，因此斑马鱼胚胎是很好的开展显微注射的材料。
1、主要试剂的配制（1）胚胎培养液的配制称取0.8g NaCl、0.04g KCl、0.00358g Na2HPO4、0.006g KH2PO4、0.144g CaCl2、0.246g MgSO4•7H2O、0.35g NaHCO3、0.06g 青霉素、0.1g 链霉素加入含有800mL 灭菌水的1L烧杯中，搅拌至完全溶解，再用灭菌水定容至1L。
（2）显微注射指示剂的配制称取0.1克酚红溶于5ml灭菌的蒸馏水中，配制成2％的母液。
先用1mm滤膜过滤后，再用0.22mm的滤膜再次过滤，然后储存在-20℃冰箱里备用。
2、显微注射操作（1）注射针头的拉制：装上一根直径为1mm的毛细管，拧紧左右两侧的夹子，做好固定，并使其中间部位对准加热丝。
设定参数为：Heat-600, Pull-55, Velocity-80, Time-10。
斑马鱼胚胎整体原位杂交的protocol
固定收集野生型斑马鱼的卵，在Holfretor水中培养，到达所需要的发育时期时，用蛋白酶去除卵膜，用4%多聚甲醛固定，在4℃保存，二十四小时后用50%甲醇2%多聚甲醛溶液洗，然后换成甲醇，在-20℃ 保存，待用。
（两天和两天以上的胚胎需要用双氧水处理，去处色素。
现在正在使用苯锍脲稀溶液培养，可阻断色素的形成）。
原位杂交第一天重水化和固定1）吸取固定好的胚胎，加入50%甲醇的PBST溶液，放置5分钟。
2）换成30％甲醇的PBST溶液，放置5分钟3）换成PBST溶液，换两次，每次放置5分钟4）用4％多聚甲醛的PBS溶液固定20分钟5）用PBST洗两次，每次放置五分钟，室温。
蛋白酶处理与后固定1）用10ul/ml的蛋白酶K在室温下处理胚胎。
5体节以下的胚胎不处理，5体节到24小时的胚胎处理3分钟，24小时以上的胚胎处理5分钟或者更长。
发育时间越短的胚胎越嫩，可以不用或者少用蛋白酶处理，发育时间长的胚胎就需要用蛋白酶来疏松组织，以便于杂交。
2）用PBST溶液轻洗，在PBST中纺织5分钟。
3）用4％多聚甲醛的PBS溶液固定20分钟，室温。
4）用PBST洗两次，每次放置五分钟，室温。
预杂交1）每个管中加上大约500ulHYB－，55℃水浴5分钟，避免振荡。
2）用等体积的HYB＋取代HYB－。
3）55℃水浴预杂交4 小时以上。
杂交1）去除预杂交的HYB＋，加上100ulHYB＋，加上探针，使探针浓度为1ng/ul..2）55℃ 温浴过夜。
杂交与预杂交的温度可以是55到60℃不等，温度越低，探针结合越好，温度越高，背景越小。
原位杂交第二天吸去探针1）将探针回收，放于－20℃保存2）用50%甲酰胺/2×SSCT溶液，55℃ 洗两次，洗两次，每次1毫升。
3）2×SSC1ml，55℃ 洗15分钟，每次1毫升。
4）0.2×SSC1ml，55℃ 洗两次，每次放置30分钟，每次1毫升。
侦测1）用MABT洗两次，每次五分钟，放在摇床轻轻摇动。
斑马鱼原位杂交实验方案
斑马鱼全胚胎原位杂交技术Form Dr. Kevin第一节原位杂交技术的历史Joseph G. Gall被誉为现代细胞生物学的一位奠基人，他在染色体结构和功能领域作出了杰出贡献，并发明了原位杂交技术（in situ hybridization，ISH）。
自Gall同他的研究生Mary Lou Paudue和Susan Gerbi在1969年利用放射性标记DNA在爪蟾组织切片中检测基因表达后，原位杂交技术逐渐发展为一种能使研究人员在一个染色体上定位并确定出基因和特殊的DNA序列的强大方法，推动了分子生物学的巨大进步。
Kathleen H. Cox于1984年发明了用单链RNA探针进行原位杂交的技术。
ISH技术在斑马鱼中的应用始于Westerfield等利用该技术在斑马鱼切片中检测基因的表达。
同年, Nusslein-Volhard 等将Cox 建立的RNA 原位杂交技术进行了改进, 用地高辛（digoxin）标记的RNA 在斑马鱼胚胎中检测基因表达。
2008 年, Bernard Thisse 等将该技术进一步优化, 使之更敏感, 也提高了基因表达检测的分辨率，我们在这里介绍的整胚原位杂交技术主要参照Thisse实验室2008年版本（Thisse, C. and Thisse, B., 2008, High resolution in situ hybridization on whole-mount zebrafish embryo. Nat. protoc. 3 : 59 –69）。
第二节原位杂交技术的原理原位杂交能在成分复杂的组织中进行单一细胞的研究而不受同一组织中其他成分的影响，因此对于那些细胞数量少且散在于其他组织中的细胞内DNA或RNA研究更为方便；同时由于原位杂交不需要从组织中提取核酸，对于组织中含量极低的靶序列有极高的敏感性，并可完整地保持组织与细胞的形态，更能准确地反映出组织细胞的相互关系及功能状态。
斑马鱼(Danio rerio)胚胎免疫反应:补体基因在早期胚胎以及LPS刺激胚胎中的表达
斑马鱼(Danio rerio)胚胎免疫反应：补体基因在早期胚胎以及LPS刺激胚胎中的表达李宗耀;杨雨佳;张士璀;汲广东【摘要】以模式生物斑马鱼(Danio rerio)为研究对象,使用原位杂交及实时荧光定量PCR方法,对斑马鱼补体基因(C3,C4,C9,Bf1,Bf2,Bf3)及其调节因子(RCA2.1,RCA2.2)在早期胚胎中的时空表达模式及LPS刺激后表达量的变化进行了研究.结果表明,上述基因在胚胎早期(卵裂期至体节期)均为泛表达,从受精后24h至幼鱼阶段特异性表达于肝脏及消化道等器官.对胚胎显微注射LPS后,C3、C9、Bf1、Bf2、Bf3基因在早期胚胎中表达上调,RCA2.1基因表达下调,这与斑马鱼成鱼受到革兰氏阴性菌感染后补体分子(C3,C9,B因子等)的反应类似,表明其参与补体激活途径、溶膜途径及补体调节,提示斑马鱼可在胚胎发育早期构建补体系统,参与急性期反应等免疫反应.【期刊名称】《海洋与湖沼》【年(卷),期】2015(046)006【总页数】7页(P1444-1450)【关键词】补体;斑马鱼;胚胎;LPS;表达模式【作者】李宗耀;杨雨佳;张士璀;汲广东【作者单位】中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所青岛 266003;中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所青岛 266003;中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所青岛 266003;中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所青岛266003【正文语种】中文【中图分类】Q786斑马鱼(Danio rerio)是脊椎动物的模式生物,与大多数鱼类相似,均为体外受精并发育。
在胚胎发育过程中,鱼卵暴露于水中,同水中大量的病原微生物直接接触。
这就引出一个问题,鱼类胚胎在发育过程中是如何保护自身免受外源微生物入侵的？鱼类的特异性免疫于脊椎动物中发育程度较低,免疫球蛋白种类和数量均有限,已有的研究表明,与鱼类特异性免疫相关的基因(Rag2,AID,TCRAC,IgLC-1,mIg,sIg,IgZ和DAB)直到胚胎受精后8天才对LPS诱导有强烈反应(Li et al,2011),说明在胚胎发育早期,特异性免疫尚未成熟,非特异性免疫尤其是补体系统在胚胎发育中的构建对其抵御外界病原体的入侵具有重要的意义。
斑马鱼胚胎吖啶橙
斑马鱼胚胎吖啶橙（Acridine Orange，AO）染色（from 黄春筱师姐）：
1.原理：
吖啶橙（Acridine Orange，AO）是一种核酸选择性染料，它能够掺入DNA分子或者与RNA分子通过静电吸引作用相结合。
掺入了AO染料的DNA分子在525 nm的紫外光照射下，能够激发出绿色荧光。
利用这一原理，AO染料被广泛地用于细胞凋亡的检测。
我们实验中，利用AO染料分别处理24 hpf、48 hpf、72 hpf和96 hpf斑马鱼胚胎，检测注射miR-462/731 Morpholinos的胚胎（MO组）、共注射miR-462/731 Mopholinos和Duplex 的胚胎（挽救组）以及Uninjected Control的胚胎（对照组）的ICM区域（24 hpf）、AGM区域（48hpf）和CHT区域（72hpf-96hpf）的细胞凋亡情况。
2.操作步骤：
2.1 试剂配制：
1)AO染液工作液：
AO染液工作液浓度为5 μg/ml；
首先配制AO贮存液浓度为5 mg/ml，使用时1:1000稀释到工作浓度。
2.2 染色步骤：
1)将斑马鱼胚胎（24hpf，48 hpf，72 hpf，96 hpf）手动剥除卵膜，并用超纯水清洗2次。
2)将斑马鱼胚胎转移到含有5 μg/ml AO染料的培养皿中，28.5°C培养15-30 min（避光）。
3)用新鲜的暴气超纯水（超纯水在28.5°C培养箱中放置一会）替换AO染液，摇床轻摇10 min洗涤胚胎，重复2次。
4)胚胎用0.02% MS-222麻醉后，在荧光显微镜下观察、拍照。
斑马鱼实验报告
2023级医学实验技术专业《细胞生物学实验技术》课程实验报告学号姓名成绩实验16-18 综合实验（具体实验内容）一．实验原理在规定的条件下，使鱼接触含不同浓度受试物的水溶液，以120h为一个实验周期。
期间记录实验鱼的存活率、畸形率、22h、27h自主摆尾、48h心率、72h孵化率、120h体长，以此评估重金属／中药单体的安全浓度范围。
通过鱼类急性毒性试验可以评价受试物对水生生物可能产生的影响，以短期暴露效应表明受试物的毒害性。
鱼类急性毒性试验不仅用于测定化学物质毒性强度、测定水体污染程度、检查废水处理的有效程度，也为制定水质标准、评价环境质量和管理废水排放提供环境依据。
我国可采用的实验鱼有四大养殖淡水鱼（青鱼、草鱼、鲢鱼和鳞鱼）、金鱼、鲫鱼、野生的食蚊鱼、斑马鱼等。
本实验选用斑马鱼作为实验材料。
二．实验器材斑马鱼胚胎，重金属三．实验试剂二甲基亚飙，超纯水，E3培养基（5 mM NaCl 、0.17 mM KCI 、0.33 mM CaCI2、0.3mMMgSO4)四．实验步骤1．暴露浓度配制重金属1、10、100pg/ L2．斑马鱼胚胎培养及暴露取性成熟斑马鱼所产正常胚胎，于受精后2h内在解剖显微镜下观察，随机挑选发育正常处于囊胚期的胚胎约5000颗，重金属不同度组、共暴露5d，对照组为0.01%DMSO( v / v ）或超纯水＋E3培养基暴露，不做任何处理。
每天更换暴露液。
各组斑马鱼胚胎／幼鱼以14h/10h的光暗周期培养于（28.0±0.5)" C 的稳定环境中，实验组暴露至受精后120h。
3．暴露期间观察指标每日定时于倒置显微镜下观察并记录各组斑马鱼各项生长指标，包括胚胎孵化率，畸形率（畸形包括原肠胚终止、脊柱畸形、心包囊水肿等），存活率，22h、27h自主摆尾，48h心率。
4．收样在收集样本当天，检测斑马鱼的体重和体长将斑马鱼仔鱼于0.03%MS-222中麻醉，样本收集于EP 管中，-80℃冷冻保存。
FISH以及免疫荧光的实验步骤
FISH以及免疫荧光的实验步骤FISH（Fluorescence In Situ Hybridization）是一种分子生物学技术，用于在细胞或组织中定位和检测特定的DNA序列。
免疫荧光是一种利用标记有荧光的抗体来检测特定抗原的方法。
以下是FISH和免疫荧光的基本实验步骤。
FISH实验步骤：1.样本准备：首先需要准备要研究的细胞或组织样本。
可以通过细胞培养、组织切片或细胞悬液来准备样本。
2.固定样本：将样本加入含有人工合成的固定剂（如4%的甲醛溶液）中进行固定处理。
固定可以保留细胞和组织的形态结构，并提高探针的渗透性。
3.消解：将样本进行胰蛋白酶等消解处理，以去除细胞或组织内的蛋白质，并增加探针的渗透性。
4.杂交：将探针与样本进行杂交反应。
探针是一段与目标DNA序列互补的DNA分子，通常通过荧光标记或酶标记来进行检测。
样本和探针在适当的温度和缓冲液中进行反应，以使探针与目标DNA序列结合。
5.洗涤：对样本进行一系列的洗涤步骤，以去除未结合的探针和其他非特异性结合物质，提高检测的特异性。
6.反应显色：对样本进行适当的显色反应，使探针的标记物可见。
常用的显色方法包括荧光显微镜、荧光素酶等。
7.观察和分析：用荧光显微镜观察样本，记录和分析目标DNA序列的位置和数量。
可以通过计算光强度或使用图像分析软件进行定量分析。
免疫荧光实验步骤：1.样本准备：准备要研究的细胞或组织样本。
可以通过培养细胞、组织切片或细胞悬液来准备样本。
2.固定样本：将样本加入含有人工合成的固定剂（如4%的甲醛溶液）中进行固定处理，以保留细胞和组织的形态结构。
3. 渗透处理：将样本进行渗透处理，以提高抗体对抗原的反应性。
通常使用非离子性洗涤剂（如Tris-buffered saline-Tween（TBST））或0.1%的Triton X-100等。
4.抗原修复：将样本进行抗原修复处理，以恢复抗原的一般形态，增强抗原的免疫反应。
可以使用高温加热、酶消化或化学处理等方法进行修复。
荧光原位杂交(FISH)实验步骤
FISH（原位杂交）SOP流程------探针直接带荧光标记一、FISH实验步骤1、石蜡切片脱蜡至水：将挑选好的组织切片置于切片架上放入烘箱中65℃烤片2-3h（观察组织周围石蜡是否被熔化流至切片边缘），烤片完成后将组织切片放入脱蜡机中脱蜡。
脱蜡完成后取出切片，进行抗原修复。
2、抗原修复：脱蜡完成后取出切片，进行酶修复。
稍甩净切片上水分，水平放置在孵育盒，用组化笔在组织周围画圈（过程中组织不能干片，组化笔不能碰到组织，否则会损坏组织或使抗体无法孵育到组织；不可用力按压组化笔以免笔内液体流出覆盖组织），蛋白酶K（PK）37度孵育15-20min，修复完后用PBS冲洗，再将玻片置于PBS（PH7.4）中在脱色摇床上晃动洗涤3次，每次5min。
3、固定：甩去残留在片子上的PBS，滴加4%多聚甲醛，室温孵育5min。
用PBS冲洗。
再将玻片置于PBS（PH7.4）中在脱色摇床上晃动洗涤3次，每次5min。
4、预杂交：滴加Hyb buffer（预杂交液）55度避光预杂交2小时。
5、准备探针：将探针原液与Hyb buffer按比例稀释，混合均匀后85℃变性3min,37℃平衡2min。
6、杂交：预杂交结束后，吸去Hyb buffer，滴加平衡后的杂交工作液，切片平放于湿盒内，37-42°C（杂交温度依据探针TM值确定）孵育过夜（湿盒内加少量水防止杂交液蒸发）。
7、洗涤：用1XSSC冲洗，浸泡2min。
（洗涤时间不宜过长，可能会洗掉表达）。
8、DAPI复染细胞核：切片稍甩干后在圈内滴加DAPI染液，避光室温孵育20min。
9、封片：PBS冲掉DAPI，切片稍甩干后用WGA封片剂封片（封片时应避免组织上出现气泡）。
10、镜检拍照：切片于尼康倒置荧光显微镜下观察并采集图像。
（蓝光紫外激发波长330-380nm，发射波长420nm；FITC绿光激发波长465-495nm，发射波长515-555 nm；CY3红光激发波长510-560，发射波长590nm）二、荧光结果判读DAPI染出来的细胞核在紫外的激发下为蓝色，阳性表达为相应荧光素标记的红光或者绿光。
斑马鱼免疫荧光
Wholemount Immunohistochemistry of 0- to 40-h Zebrafish Embryos1Fixation：Fix the embryos in 4% paraformaldehyde for 3 h at room temperature or overnight at 4°C. 20 embryos in each 1.5 mL volume microcentrifuge tube. After fixation, replace the solution with an equivalent volume of PBS (此步骤后胚胎可存放数周，但下次用时要wash5 × 5 min with PBS).2Blocking: Dilute the goat serum to 10% (v/v) in PBT and incubate 20–30 embryos in 0.5 mL of this solution for 1 h at room temperature on a rocking table.3Primary antibody incubation: Remove the blocking solution with a pipet. Dilute the primary antibody in PBT plus 1% goat serum to the appropriate concentration, as recommended by the supplier. Apply the primary antibody in a minimum volume of 100 μL. overnight at 4°C ona rocking table with gentle agitation.4Washing: remove as much of the primary antibody as possible and replace with a large volume of washing solution (PBT). Change the wash three to five times, with at least 15 min for each wash with gentle rocking at room temperature (洗的时间长，背景会降低).5Dilute the secondary antibody：Dilute the secondary antibody in PBT plus 1% goat serum to the appropriate concentration, as recommended by the supplier. overnight at 4°C on a rocking table with gentle agitation. keep the embryos in the dark from this step on to prevent bleaching.6Remove the secondary antibody and wash the embryos in PBT. Change the wash three to five times, with at least 15 min for each wash with gentle rocking at room temperature. Finally transfer the embryos to PBS alone prior to the detection steps. At this point, if fluorescence is used, clear the embryos in graded glycerols and mount in 70% glycerol containing an antibleaching agent such as Citifluor(抗荧光衰退剂) (Agar Scientific Ltd).7Examine use confocal microscope.4%多聚甲醛-0.1mol/L磷酸缓冲液（pH7.3）:配制方法：称取10g多聚甲醛，置于三角烧瓶中，加入125～200ml 0.1mol/L磷酸缓冲液（Phosphate Buffer以下简称PB），加热至60℃左右，持续搅拌（或磁力搅拌）使粉末完全溶解，通常需滴加少许1n NaOH才能使溶液清亮，最后补足0.1mol/L的PB于250ml，充分混匀。
分子生物学实验技术斑马鱼胚胎蛋白WB方案
斑马鱼胚胎蛋白定量实验方案㈠使用液的配置：1.蛋白提取液（Lysis buffer）：0.6ml 1M Tris HCl PH 6.81.0ml 50% Glycerol（甘油）2.0ml 10% SDS6.4ml H2O10 ml Lysis buffer -20℃分装保存备用备注：Lysis buffer使用前需加入1：100的100mM PMSF。
2.上样缓冲液（1XSample buffer）：50mM Tris-HCl pH 6.82% SDS10% Glycerol（甘油）0.02% Bromophenol blue（溴酚蓝）0.7% 2-mercaptoethanol（2-巯基乙醇）3.电泳缓冲液（Running buffer）： 3.0g Tris-base14.4g Glycine（氨基乙酸）10ml 10%SDS加双蒸水至1000ml4.转移缓冲液（Transfer buffer）： 3.0g Tris-base14.4g Glycine（氨基乙酸）200ml Methanol（甲醇）加双蒸水至1000ml5.封闭液(Blocking solution)：称5g脱脂奶粉溶于100ml TBST中。
6.洗涤液（TBST buffer）：20mM Tris-HCl pH7.40.15M NaCl1-5 ml 0.5% TWEEN-20加双蒸水至1000ml㈡斑马鱼胚胎蛋白的提取：1. 取100枚胚胎放入1.5ml EP管中，用灭菌水清洗2次，加入200μl Lysis buffer（预加1% PMSF），匀浆器匀浆，再加入300μl Lysis buffer，votex 1min；将处理后的样品放入沸水中煮8 min，12000g离心5 min，取上清，蛋白样品即位于上清中；提好后的蛋白需立即置于冰上，可以长时期存放于-80℃。
（胚胎可以先冻存于-80℃，以后再提取蛋白，若胚胎数量少，而目的蛋白也少，则可以减少Lysis buffer的加入量。
荧光原位杂交FISH实验步骤与方法
FISH实验步骤一、实验仪器：荧光显微镜:高速离心机：可达12000r/min高压灭菌锅：160℃以上杀菌恒温箱：为杂交提供恒定温度恒温水浴锅照相机（与荧光显微镜配套）：荧光捕捉图片二、试剂的配制：1、0.2mol/ L (pH7.4磷酸缓冲溶液(PB试剂为NaH2P04·2H20和Na2HP04·12H2O。
-----0．2M的NaH2P04溶液: 31.2g NaH2P04·2H20,加蒸馏水1000mL溶解-----0．2M的Na2HP04溶液: 71.632g Na2HP04·12H2O 加蒸馏水至1000ml溶解----0．2M (pH7.4磷酸缓冲溶液(PB : 19ml的NaH2P04溶液和81ml的Na2HP04溶液充分混合高压灭菌，常温保存。
2、0.03 mol/ L磷酸盐缓冲溶液（(PBS）试剂为NaCl和磷酸缓冲溶液PB------0.03MPBS溶液：22.8gNaCl ，150ml磷酸缓冲溶液(PB ，加蒸馏水至1000ml，混匀------0.02 MPBS溶液：取100ml 0.03MPBS溶液至150ml容量瓶中，加蒸馏水稀释至150ml------0.01 MPBS溶液：取50ml 0.03MPBS溶液至150ml容量瓶中，加蒸馏水稀释至150ml高压灭菌，常温保存。
3、4%多聚甲醛溶液（1000ml）（在通风橱内进行操作）-----将略小于2/3体积的水（660ml）加热到50℃，------40g多聚甲醛PFA，边搅拌边加入到水中，继续保持60℃-------1滴2mol/LNaOH溶液，立即澄清，但仍有小颗粒。
-------1/3体积的PBS溶液，-------用Hcl将pH调至7.2，定容，-------用孔径为0.22μm的滤膜过滤，----4℃保存最多保存两天，或者取少量保存在-20℃。
（加热时温度不宜过高，为60℃-65℃，否则PFA容易降解，配置好后应尽快使用，否则固定效果较差）。
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斑马鱼胚胎整体原位免疫荧光实验第一天：
固定：收集斑马鱼胚胎于解剖显微镜下去除绒毛膜，加入4％多聚甲醛（溶于无RNA酶的PBS），4℃固定8h。
然后加入更换新鲜纯甲醇后于－20℃长期保存。
第二天：
洗涤和通透：在室温下，以25％PBST/75％甲醇、50％PBST/50％甲醇、75％PBST/25％甲醇逐级复水，每步3 min，100％PBST洗涤三次，各5 min。
用H2O洗涤1次，5 min
用丙酮通透胚胎1次，7 min（-200C）
用H2O洗涤1次，5 min
用PBST洗涤1次， 5 min
封闭：加入适量封闭液，于室温下放置1.5 h以上。
抗体孵育：更换新鲜封闭液，加入一抗（10μg/ml），置于4℃过夜。
第三天：
清洗：用洗涤液（1% BSA，1% DMSO的PBST溶液）清洗抗体8次，前7次每次15min，第8次2h。
封闭：加入适量封闭液，于室温下放置1.5 h。
抗体孵育：更换新鲜封闭液，加入二抗，置于4℃过夜。
第四天：
清洗：用洗涤液（1% BSA，1% DMSO的PBST溶液）清洗抗体8次，每次15min。
用PBST溶液洗涤胚胎2次，每次5min。