近交系数的计算
自交的近交系数-概述说明以及解释
自交的近交系数-概述说明以及解释1.引言1.1 概述概述：自交和近交是遗传学领域中重要的概念，它们指的是在繁殖过程中个体内部或者同一物种之间的亲缘关系。
自交指的是两个亲缘关系极为近的个体进行交配，而近交则是指来自同一亲本或亲缘极近的个体进行交配。
自交和近交在生物学研究中有着重要的意义，它们不仅影响到物种的进化和遗传变异，还会对种群的遗传多样性和适应性产生影响。
通过计算自交和近交系数，我们可以更好地了解遗传背景，优化繁殖计划，预防疾病遗传等方面的工作。
本文将详细介绍自交和近交的概念、影响以及近交系数的计算方法，旨在帮助读者更好地理解这一重要的遗传学概念，以及应用于实际研究和繁殖中的意义。
1.2 文章结构文章结构部分将会包括以下内容：1. 引言：介绍自交和近交系数的概念及其重要性。
2. 正文：- 什么是自交和近交：解释自交和近交的概念，以及它们在生物学和遗传学中的作用。
- 自交的影响：探讨自交对种群遗传多样性和适应性的影响，以及可能导致的遗传缺陷。
- 近交系数的计算方法：介绍近交系数的计算方法和其在遗传学研究中的应用。
3. 结论：总结自交和近交系数的重要性，讨论其在实际应用中的潜力，并展望未来的研究方向。
通过这样的结构，读者可以系统地了解自交和近交系数的相关知识，并进一步探讨其在遗传学和生物学领域的重要性和应用前景。
1.3 目的本文的主要目的是探讨自交的近交系数在遗传学研究中的重要性和应用。
通过分析自交和近交对基因型和表型的影响，我们可以更好地理解遗传变异和遗传相关性。
同时，我们也将介绍近交系数的计算方法，帮助读者更深入地理解自交的影响。
通过本文的阐述，希望能够引起更多研究者对自交和近交系数的关注，促进相关领域的发展和进步。
2.正文2.1 什么是自交和近交:自交和近交是遗传学中的两个重要概念，它们都涉及到生物种群内部的遗传交流。
自交是指同一种群中的个体之间进行交配，而近交则是指亲缘关系较近的个体之间进行交配。
第五章 近交系数与亲缘相关系数
∑ (1 2)
Fx =
n1 + n2
。又由于子代从父母那里各得一半的基因，所以父母的同源基因也只有一半传
n1 + n2
给子代，因而构成子代的两个配子间的相关系数即近交系数，等于父母之间相关系数的一半，
1 1 ∑ 2 2
当共同祖先也是近交所生时， 该共同祖先的近交系数也应考虑进去。 这时近交系数的公式 应为：
（5）叔侄相关
r = (1 / 2) 3 + (1 / 2) 3 = 1/ 8 + 1/ 8 = 1/ 4
〇 □
□
O □ r □ 〇
35
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（6）单亲表兄间相关
□ □ □ r 〇
〇 □ □ 〇
r = (1 / 2) 4 + (1 / 2) 4 = 1 / 16 + 1 / 16 = 1/ 8
34
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FD = (1 / 2) 0+1+1 + (1 / 2) 2+1+1 + (1 / 2) 3+1+1 = (1 / 2) 2 + (1 / 2) 4 + (1 / 2) 5 = 0.25 + 0.0625 + 0.3125 = 0.343775
如果共同祖先也无近交系数时，上式便可简化为：
R xy = ∑ 1 2
n
如果 x 与 y 到共同祖先的代数分别为 n1 和 n2， 则以上各式中的 n 可写成 n1+n2， 即 n= n1+n2。 3、亲缘相关系数的算法举例。 例 1：计算右图中的 RSD，RXA，FX。 解：已知 S 为近交个体，故应先求 FS。
fis近交系数
fis近交系数（实用版）目录1.FIS 近交系数的定义2.FIS 近交系数的计算方法3.FIS 近交系数的应用4.FIS 近交系数的局限性正文FIS 近交系数（Federation of Indian Societies consanguinity coefficient）是一种衡量个体之间亲缘关系的指标，主要用于研究印度社会中的近亲婚姻现象。
在印度，近亲婚姻较为普遍，尤其是在某些地区和种姓中，认为近亲婚姻可以维护家族血统的纯净。
然而，这种做法可能导致基因缺陷和遗传疾病的风险增加。
因此，了解和研究 FIS 近交系数具有重要意义。
FIS 近交系数的计算方法是基于概率论和统计学的原理。
具体来说，它通过计算两个个体的基因型概率，来估算他们之间的亲缘关系。
FIS 近交系数的取值范围在 0-1 之间，数值越大表示亲缘关系越近。
当 FIS 近交系数为 1 时，表示两个个体为同卵双胞胎；当 FIS 近交系数为 0 时，表示两个个体没有亲缘关系。
FIS 近交系数在印度社会中有着广泛的应用。
首先，它可以帮助研究者了解印度社会中的近亲婚姻现象，为相关政策的制定提供科学依据。
此外，FIS 近交系数还可以应用于遗传疾病的研究，帮助医生和患者了解疾病的遗传风险，从而采取有效的预防措施。
然而，FIS 近交系数也存在一定的局限性。
首先，它的计算方法基于理想状态下的基因型概率，可能与实际情况存在偏差。
其次，FIS 近交系数只能反映个体之间的亲缘关系，不能完全代表个体的遗传特征。
因此，在实际应用中，需要结合其他遗传学指标和方法，才能更全面地了解个体的遗传信息。
总之，FIS 近交系数作为一种衡量亲缘关系的指标，对于研究印度社会的近亲婚姻现象和遗传疾病具有重要意义。
实习九 近交系数与亲缘系数的计算ppt课件
RxA
(1)N 2
10
示例：仍用上例系谱，计算289号公与 其祖先16号之间的亲缘系数。
从上例系谱可看出，289号与16号之间的亲 缘关系，有两条通径路线，每条通径的代数 都是3，即：
135
90←135←90←16 289←181←49←16
181
49
11
另外，289号公羊还是近交后代，其近交系 数是15.63%，代入公式后则得：
R(289)(16)
[( 1)3 2
(1)3] 2
10 1 1 0.156 4
1 23.25% 1.156
即289号公羊与祖先16号公羊之间的亲缘系 数是23.25%。
12
育种学实验考试 选择指数的制订
13
135
90
135←90→16→49→181 289
108
16
代入公式后则得：
181 49
p(135)
(181)
12 (2)
(
1 2
)4
0.25
0.0625
0.3125
31.25%
8
(2)直系亲缘间的亲缘系数，计算公式为：
RxA
(1)N 1 FA 2 1F x
9
如果共同祖先A和个体X都不是近交所 生，则公式可简化成：
上列（1）式和（2）式，算法结果完全相 同，均可运用。（1）式中的n1+n2，也就等 于（2）式中的N；（1）式括号左上方的1， 也就等（2）式括号前的。计算时，首先通过 系谱，把所给系谱划为箭头式系谱，然后通过 此系谱找出父、母到祖先的代数，然后代入公 式，即可计算。
3
示例：现在289号公羊的横式系谱如下，可 先将其改制成箭头式系谱，然后计算135号和 181号间的亲缘系数。
第5讲-近交系数与亲缘系数-群体与数量遗传学-教课件
6 0.2500 0.5000 0.5000 0.1250 0.1250 0 0.3125 0.0625 0.2813 0.6103 0.4389
7 0.2500 0.5000 0.1250 0.5000 0.1250 0.3125 0 0.0625 0.2813 0.6103 0.4389
8 0.2500 0 0.1250 0.1250 0.5000 0.0625 0.0625 0 0.5000 0.0581 0.2633
11
A2 A2 A1 A2 A1 A2 A2 A
2A1
A1 A1 A1 A1 A1 A1 A2 A1 A1
29
• 每一世代同一基因纯合子的增加概率=近交系数 增量(ΔF)
• t世代群体的近交系数Ft= 同一基因纯合子的概率。
2
0 1.0000 0 0 0 0.5000 0.5000 0 0.5000 0.5000 0.5000
3
0.5000 0 1.0000 0.2500 0.2500 0.5000 0.1250 0.1250 0.0625 0.3125 0.1875
4
0.5000 0 0.2500 1.0000 0.2500 0.1250 0.5000 0.1250 0.0625 0.3125 0.1875
0.25 0 0.5 0.125 0.2703
0 0 0.125 0.5 0.2703
0 0.5 0.5 0.4324
0 0.3125 0.5676
0
0.5676
0.1519625
作业2
利用亲缘协方差表 法计算下列公牛系谱 中所有个体的近亲 系数和两两之间的 亲缘系数。 (建议用Matlab编程)
5
6
动物育种学近交系数和亲缘系数的计算
•区别与联系近交系数：一个个体的两个配子同源相同（identical by descent, IBD ）的概率。
亲缘系数(relationship coefficient)：两个有亲缘关系的个体间的加性基因效应间的相关。
近交系数和亲缘系数的计算dsAA d s SDA A Cov r σσ),(=)(b a P =YX A n n XYF F F r +++=∑+11)1()2/1(21∑+=++)1()2/1(121A n n X F F d s sd X F F r F ++=1121DS XSD F F F r ++=112根据此公式，进行计算两个个体间的加性遗传相关(additivegenetic relationship):是指在它们的基因组中具有同源相同基因的比例，或者说从个体x 的基因组中随机抽取的一个基因在个体y 的基因组中也存在的概率。
用a XY 表示 [])()()()(21d b P c b P d a P c a P =+=+=+=YX A n n XYF F F r +++=∑+11)1()2/1(21a XY 即亲缘系数的分子DS X X X a F 21=4（1）近交系数的计算公式：F X 为个体X 的近交系数；n 1为由该个体的父亲到共同祖先A 的世代数； n 2为由其母亲到A 的世代数； F A 是共同祖先A 的近交系数；Σ则表示当个体的父亲和母亲有多个途径造成亲缘相关时, 则要对由所有途径所造成的近交求和。
∑+=++)1()2/1(121A n n X F F 通径法2014/11/21 5（2）近交系数的计算CXBADE HGI首先，找出A 、B 的共同祖先：I 、G 、E2014/11/216（2）近交系数的计算CXB ADE HGI确定共同祖先的近交系数： 显然I 、G 的近交系数为0， 而F E =0.53=0.125。
2014/11/217（2）近交系数的计算CXBADE HGI确定连接A 和B 的通径链:B←E→C→AB←E→D→A B←E←G→D→AB←E←H←I→G→D→A通径链 共同祖先的近交系数n 1+n 2+1通径链的系数 B←E→C→A 4 B←E→D→A 4 B←E←G→D→A F G =0 5 B←E←H←I→G→D→AF I =07F X = 23/1288•最后，将各通径链的系数累加即得X 的近交系数。
近交系数的计算
近交系数的计算-答案设有下列系谱，试用一般计算公式、共亲系数列表算法以及加性遗传相关算法分别求各个体的近交系数和个体间的亲缘系数。
答：一、近交系数的计算（一）利用近交系数的一般公式计算 1. X 个体（1）父母A 和B 的共同祖先有：C 、D 、F 、H ；它们均为非近交个体(判断一个个体是否为近交个体的依据是看其父母是否有共同祖先，如果双亲只知道一方或均未知则默认其为非近交个体)，因此，F C =0，F D =0，F F =0，F H =0。
（2）找通径链，并计算各通径链的系数，求和计算出F X 通径链共同祖先的近交系数n 1+n 2+1 通径链的系数 A ←C →B A ←D →B A ←C ←F →D →B A ←D ←F →C →B A ←C ←E ←H →G →D →B A ←D ←G ←H →E →C →B F C =0 F D =0 F F =0 F F =0 F H =0 F H =03 3 5 5 7 7F X = 21/642. A 个体（1）父母C 和D 的共同祖先有F 和H ，且F F =0，F H =0。
（2）找通径链，并计算各通径链的系数，求和计算出F A 。
321)(321)(521)(521)(721)(721)(通径链 共同祖先的近交系数 n 1+n 2+1 通径链的系数 C ←F →D A ←E ←F →G →DF F =0 F H =03 5F A = 5/323.B 个体，与A 个体同父同母，因此与A 相同。
F B = 5/32。
4.其余个体C 、D 、E 、F 、G 、H 均为非近交个体，F C =0，F D =0，F E =0，F F =0，F G =0，F H =0。
（二）利用加性遗传相关列表算法1. 将系谱中的个体按照世代从高到低分别从左到右、从上到下排列，并将个体的双亲编号列于个体的上方。
2. 利用公式计算两两个体间的加性遗传相关，并列表。
其中，x 、y 分别表示任意一个个体；x s 、x d 分别表示x 个体的父亲和母亲；y s 、y d 分别表示y 个体的父亲和母亲。
近交系数（计算举例）[整理版]
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近交系数——形成合子的两个配子来自同一共同祖先的概率。
根据通径系数原理，个体x 的近交系数即是形成x 个体的两个配子间的相关系数，用F x 表示。
1211(1)2n n x A F F ++⎡⎤⎛⎫=+⎢⎥ ⎪⎝⎭⎢⎥⎣⎦
∑ 式中，x F 表示个体x 的近交系数；1/2 表示各代遗传结构的半数；
1n 表示父亲到共同祖先的代数；2n 表示母亲到共同祖先的代数；
A F 表示共同祖先自身的近交系数；121n n N ++=为亲本相关通径链中的个体数。
第一代全同胞后代的近交系数应该是：
这样亲本相关通径链为：
S---A---D N=3
S-----C----D N=3
1111111125%22x F ++++⎛⎫⎛⎫=+= ⎪ ⎪⎝⎭⎝⎭
即：（1/2）3×2=1/4=25%
连续二代全同胞交配后代的近交系数应该是：
A B F
X
C E G
X 个体就是连续三代全同胞交配产生的后代。
第一步：寻找共同祖先B 、E 、F 、G
F F ＝F
G =F B ＝F E =0
第二步：寻找通径
共同祖先为B 时：A ←B →C N=2
共同祖先为E 时：A ←E →C N=2
共同祖先为F 时：A ←B ←F →E →C N=4
C←B←F→E→A N=4
供同祖先为G时：A←B←G→E→C N=4
C←B←G→E→A N=4
第二步：计算
F X=1/24+1(1+0)×2+1/24+1(1+0)×2+1/22+1(1+0) +1/22+1(1+0) = 3/8=0.375以此类推。
近交系数资料
近交系数在分子标记辅助育种 中的应用
• 近交系数在分子标记辅助育种中的应用 • 利用分子标记信息计算个体的近交系数 • 为育种提供依据：通过计算近交系数，可以评估个体的遗传风 险和遗传多样性，为育种提供依据 • 提高育种效率：通过分子标记辅助育种，可以快速、准确地计 算近交系数，提高育种效率
03
传关系，从而评估种群的遗传多样性 • 指导遗传育种：近交系数可以指导遗传育种过程中的亲本选择
和杂交组合设计，以提高育种效果 • 评估遗传风险：近交系数可以评估特定个体的遗传风险，如遗
传疾病的发病率等
近交系数的计算方法：基于系谱的公式
基于系谱的近交系数计算方 法
亲本近交系数 （F）：表示个 体与其父母之 间的遗传关系
• 近交系数在鸟类中的变化规律 • 鸟类的一般近交系数较低：由于鸟类的繁殖方式和迁徙习性， 近交系数通常较低 • 不同鸟类之间的近交系数存在差异：近交系数受物种、生态环 境和繁殖方式等多种因素影响
近交系数在植物中的变化规律
• 近交系数在植物中的变化规律 • 植物的一般近交系数较高：由于植物的生命周期和繁殖方式， 近交系数通常较高 • 不同植物之间的近交系数存在差异：近交系数受物种、生态环 境和繁殖方式等多种因素影响
• 利用系谱信息计算个 体的近交系数 • 主要包括亲本近交系 数、兄妹近交系数和半兄 妹近交系数等
• F = （1/2）^n，其中 n为父母之间的代数
兄妹近交系数 （F_s）：表示 个体与其兄妹 之间的遗传关
系
• F_s = （1/2）^n，其 中n为兄妹之间的代数
半兄妹近交系 数（F_h）：表 示个体与其半 兄妹之间的遗
近交系数与遗传多样性的关系
近交系数与遗传多样 性的关系分析
遗传学近亲繁殖系数的简单计算,系谱图近交系数的简单计算
遗传学之八----近亲繁殖系数的简单计算虽然有电脑程式可以应用，只需将照血统书的名字输入数据库，便可以自动计算近亲繁殖系数，但是如果血统书的近亲繁殖比较简单的时候，人手计算也是非常方便。
现在简短的介绍如何利用路径系数path coefficient方法计算近亲繁殖系数。
路径系数方法首先绘画一个“箭头血统书”，在这一个图中每一个体都只出现一次。
箭头从父母指向后代，箭头只可以向下或对角向下。
例1例1：原本的血统书和箭头血统书。
在箭头血统书中，我们找出所有从父母中的一只指向另一只后代，而中间经过其他的猫，而个别的猫不能在路径中出现超过一次。
每一条路径，我们计算有多少猫涉及的数目。
每一条路径对近亲繁殖系数的影响是1/2再以路径中出现的个体数目为次方。
从例1的箭头血统书，我们从每一只父母得出两条路径到达其他的猫：CAD->(1/2)³=1/(2 x 2 x 2)=1/8CBD->(1/2)³=1/(2 x 2 x 2)=1/8近亲繁殖=1/8+1/8=1/4=0.25=25%如果有共同祖先，即：路径折转并再重新向下，我们要考虑是同系繁殖。
（在以上的例子中，两条路径的共同祖先，分别是A和B都被画上了下划线。
）利用路径系数方法计算同系繁殖共同祖先的近亲繁殖系数。
1加共同祖先乘以近亲繁殖系数，再次方在路径上涉及的猫的数目。
因此，如果在这一条路径上出现的个体猫的总数为n，而近亲繁殖系数的共同祖先是F，涉及近亲繁殖系数将会是(1/2)^nx(1+F)。
所有路径的涉及近亲繁殖系数的总和便是近亲繁殖系数。
例2例2:原本的血统书和箭头血统书。
现有的路径是：BDC、BDFEC、BEFDC、BDEC、B EDC、BEC。
共同祖先是D是近交，而他的箭头血统书将会是如此：D的箭头血统书D的近亲繁殖是(1/2)²=1/4。
每一条路径的涉及近亲繁殖系数将会是：Path n F (1/2)^n x(1+F) total BDC 3 1/4 (1/2)³x(1+1/4)=1/8 x 5/4=5/32 =0.15625 BDFEC 5 0 (1/2)^5 x(1+0)=1/32 =0.03125 BEFDC 5 0 (1/2)^5 x(1+0)=1/32 =0.03125 BDEC 4 0 (1/2)^4 x(1+0)=1/16 =0.0625 BEDC 4 0 (1/2)^4 x(1+0)=1/16 =0.0625 BEC 3 0 (1/2)³x(1+0)=1/8 =0.125 近亲繁殖=涉及总和=0.46875=46.875%。
遗传学名词解释解析
遗传学名词解释第二章姐妹染色单体：染色体复制后形成的两条完全一致的染色单体，由着丝粒连接在一起。
着丝粒：染色体内部的特殊结构，是连接两条姐妹染色单体，连接染色体和纺锤体的部位。
动粒：位于着丝粒处的蛋白质复合物，内侧与着丝粒结合，外侧与纺锤体丝结合，发挥桥梁作用。
端粒：染色体末端的结构。
杂合体：基因座上含有两个不同的等位基因的个体。
纯合体：基因座上含有两个相同的等位基因的个体。
回交：杂交的子一代与亲代的交配形式。
测交：杂合个体与纯合隐性个体的交配形式。
性状：生物在形态、结构和生理功能等方面的特征。
显性：杂合子个体表现出来的性状。
隐性：杂合子个体被掩盖的性状。
等位基因：同源染色体相对位置上决定同一性状的两个基因。
表型：生物个体性状的表现型。
基因型：生物个体的基因组成。
孟德尔分离定律：杂合体的一对等位基因在形成配子时互相不影响地分到雌雄配子中去的规律。
孟德尔自由组合定律：非同源色体上的非等位基因在形成配子时，各自独立地分开和组合，在杂交时各种基因型的配子随机结合，形成可以预测比例的表型和基因型的群体。
单基因遗传：由一个基因表达差异引起的性状趋势的遗传方式。
特征：有显隐性关系；后代有可预测的基因型和表型理论比例。
家系：根据遗传亲缘关系绘制出来的家族成员系谱图。
亨廷顿舞蹈病：常染色体显性遗传病。
患者神经系统逐渐退化，神经冲动弥散，动作失调，出现不可控制的颤搐，并能发展成痴呆，甚至死亡。
HD高发于美洲和欧洲，中年发病居多。
囊性纤维化：常染色体隐性遗传病。
外分泌腺的功能紊乱，粘液腺增生，分泌液粘稠，不同器官病变程度不一。
主要见于肺胰及肠道可发生慢性阻塞性肺病胰功能不全及肝硬化。
目前CF患者的平均寿命为37岁。
白种人突变基因的携带频率为3% -10%。
抗维生素D佝偻病：性染色体（X）显性遗传病。
又称原发性低磷酸盐血症性佝偻病、低磷酸盐血症性佝偻病。
患者由于磷酸盐再吸收障碍，肾小管磷重吸收率明显降低，尿磷大量丢失，血磷降低。
近交系数公式
近交系数公式
近交系数是指在同一个家系中，两个个体之间存在血缘关系的概率。
近交系数公式可以用来计算两个个体之间的近交系数。
常用的近交系数公式有三种，分别是F统计量、多项式近交系数和似然比近交系数。
F统计量的计算公式为F=(H0-H1)/H0，其中H0表示两个个体在没有亲缘关系的情况下共享相同基因座的概率，H1表示两个个体在有亲缘关系的情况下共享相同基因座的概率。
多项式近交系数的计算公式为
F=Σ(0.5)^n(2i+j)!/(2i!j!n^(2i+j+1))，其中n表示基因座数量，i和j分别表示两个个体共享相同基因座的数量和不同基因座的数量。
似然比近交系数的计算则是通过比较两种假设的似然比来计算。
其中一种假设是两个个体在没有亲缘关系的情况下共享相同基因座的概率，另一种假设是两个个体在有亲缘关系的情况下共享相同基因座的概率。
似然比近交系数公式较为复杂，需要进行复杂的计算，但相对来说精度更高。
近交系数公式的应用广泛，可用于动物遗传育种、人类遗传疾病研究等领域。
- 1 -。
金华猪个体近交系数的估计方法
·25·
金华猪个体近交系数的估计方法
王燕丽 1 , 徐宁迎 2
(11金华职业技术学院生物工程学院 , 浙江 金华 321007; 21浙江大学动物科学学院 , 浙江 杭州 310000)
摘要 : 采用微卫星标记多重扩增结合荧光标记检测技术 , 对金华猪 Ⅰ系保种群中的 127 头猪 30 个微卫星位点的基因型进行了检测 , 根据检测结 果用 EXCEL 电子表格中数据分析程序对金华猪个体近交系数与微卫星位点基因纯合率间作了相关与回归分析 , 结果两者的相关系数为 01417 8, 达极显著水平 ( P < 0101) , 其回归方程 y^ = 01033 8 + 01206 6 x。根据回归方程估计了 K380、 K117、982200、98263、972288等猪的近交系数 。 关键词 : 金华猪 ; 近交系数 ; 微卫星 ; 基因纯合率 中图分类号 : S82813 文献标识码 : B 文章编号 : 052925130 (2005) 1220025203
01476 2 01458 3 01583 3 01681 8 01523 8 01315 8 015 0155 015 0165 015 01541 7 01416 7 01762 01571 4 01608 7 01529 4 0145 01458 3 0135 01391 3 01333 3 01458 3 0145 01375 015 01705 9 014 01375 01695 7 01526 3 015 01421 1 01333 3 01708 3 01625 01541 7 01590 9 01458 3 01565 2 014 015
如何去寻找新的保种方法保种手段或新的保种途径成了地方猪种保护工作的重点环群体遗传学研究表明假如没有选择迁移的影响近交和遗传漂移是导致基因在群体中消失的主要因素因此如何控制保种群体中的近交降低随机遗传漂移的影响防止基因在小群体中被固定和丢失是关系到保种工作成败的关键近年来随着生物技术的发展可以直接对编码蛋白质或酶的基因进行分析其中最有效的方法之一就是以pcr为基础的微卫星dna多态性检测技术利用微卫星座位对猪个体进行遗传检测统计各个体的等位基因组成计算出各个体的基因纯合率基因杂合度及多态信息含量即可知道个体的近交程度可为地方猪的选种选育提供重要依据
35近交系数的计算(精)
近交系数的计算
• 近交系数是指个体通过双亲从共同祖先得到相同基因的
概率，也可以说是通过近交使后代基因纯合的百分率。 • 一个个体从亲代得到某一相同基因的概率为 ，从祖代 得到相同基因的概率为 ，即每隔一代，从共同祖先得到 相同基因的概率减少 。
近交系数的计算
• 根据这个原理得出近交系数的计算公式：
计算值相加求总和， 为父亲到共同祖先的世代数， 为母 亲到共同祖先的世代，为共同祖先A的近交系数。 • 所谓共同祖先是指在个体系谱中父母双方拥有的同一个 祖先。
近交系数的计算
F • 如果共同祖先不是近交个体，则 =0，上式便可简化为：
A
近交系数的计算
• 以下面系谱为例说明近交系数的计算方法。半同胞交配：
近交系数的计算
• 全同胞交配：这个系谱的共同祖先是1号和2号家畜，个体X的
近交系数应按两条通径计算，共同祖先1号和2号家畜本身都是
非近交个体(图2—12、图2—13。代入公式：
近交系数的计算
• 即全同胞个体X的近交系数为25％。为了便于参考，于下表中表2—7各种类型
根据系谱找出所有共同祖先，一般用x代表某一个体，用s
和D分别代表它的父亲和母亲，用号码或其他符号代表其 余祖先。本系谱只有1号一个共同祖先(图2—10)。
近交系数的计算
• 绘制箭形图：箭头由共同祖先引出，通过各祖先指向父母，归
结于个体x，这一线路叫通径链。在通径链中所遇到的各代祖
先都必须按顺序用箭头相连，不可遗漏或省略。同一祖先到父 母双方可能会出现多个通径链，但是每个祖先在箭形图中只能 出现一次。凡不涉及近交的个体可省略不计(图2—8)．
近交所生子女的近交系数(共同祖先的近交系数等0)
畜牧业概论-家畜遗传育种及繁殖学基础(二)
n
生产实例：牛群中出现一头特别优秀的公牛， 通过与其女儿、或该公牛的子女互配，可保持 其优良血统。
n
常用于品系繁育（系祖建系）
亲缘选配－近交的用途
3.
n
4.
n n
5.
n
n
提高畜群的同质性 随着近交程度的增加，畜群分化明显，当F=1时，畜群分 化为不同品系，品系内基因型完全一致且纯合。 固定优良性状 近交使优良性状基因纯合，以固定优良性状； 固定速度快于同质选配，固定效果优于同质选配。 提供试验动物 近交可产生高度一致的近交系，如近交系小鼠、近交系 猪等， 为医学等研究领域提供试验动物（滇南小耳猪、五指山 猪）。
n
此时，VD + VI 为非加性方差。
几组概念对照表
变异 variation 表型 phenotype 基因型 genetype 表型变异 phenotypic ~ 遗传变异 genetic ~ 效应值 value 表型值 phenotypic ~ 基因型值 genetypic ~ 加性效应 additive effect 显性效应 dominance effect 上位性效应 epitasis effect 方差 variance 表型方差 phenotypic ~ 遗传方差 genetypic ~ 加性方差 additive ~ 显性方差 dominance ~ 上位性方差 epitasis ~ 非加性 nonadditive
第三章 家畜遗传育种及 繁殖学基础（二）
第一节 家畜遗传学基础
p 1、 家畜性别决定和伴性遗传 p 2、 家畜数量性状的遗传 p 3、 杂交与近交
1、家畜性别决定和伴性遗传
一、性别决定的方式
（1）XX-XY型：
n n
roh的近交系数分 -回复
roh的近交系数分-回复什么是近交系数分？简单来说，近交系数分用于衡量种群内个体间的近亲交配程度。
它是一个统计指标，通过计算个体基因座上的杂合度来反映种群内基因的多样性和近交程度。
近交系数分广泛应用于动物和植物学研究中，可以帮助我们了解基因流动、群体遗传结构和物种保护等方面的问题。
为了更好地理解近交系数分，让我们来逐步回答以下几个问题：第一步：如何计算个体基因座的杂合度？个体基因座的杂合度反映了该基因座上的两个等位基因来自不同个体的概率。
杂合度范围从0到1，其中0表示纯合子状态，表示两个等位基因来自同一个个体；1表示完全杂合子状态，表示两个等位基因来自不同个体。
计算个体基因座的杂合度可以使用Hardy-Weinberg方程。
该方程是基于一些假设的，包括大种群、随机交配、没有迁移、没有选择和没有突变等。
通过统计分析观测到的等位基因频率，我们可以计算预期的杂合度，并将观测杂合度与预期杂合度进行比较。
第二步：如何计算个体的近交系数？个体的近交系数可以通过多个基因座的杂合度来计算。
常用的方法是平均近交系数法和全基因组近交系数法。
平均近交系数法基于个体在多个基因座上的杂合度计算近交系数。
它通过计算所有基因座的杂合度平均值来衡量个体的近交程度。
平均近交系数的值范围从0到1，其中0表示无近交，1表示最大近交。
全基因组近交系数法利用所有基因座的杂合度来计算全基因组近交系数。
它可以提供更全面的近交信息，因为它考虑了所有基因座的杂合度而不只是平均值。
第三步：如何解读近交系数分的结果？近交系数分的结果提供了个体或种群的近交程度信息。
较低的近交系数分表示较低的近交程度，表明物种或种群维持着较高的基因多样性。
相反，较高的近交系数分表示较高的近交程度，可能意味着基因多样性较低，这可能导致表现型异常和遗传缺陷。
因此，近交系数分可以用来评估种群的健康状况和物种的遗传变异。
此外，近交系数分还可以用于研究基因流动和群体遗传结构。
通过比较不同个体或种群的近交系数分，我们可以了解基因在种群内的流动性和物种间的遗传差异。
近交系数的名词解释
近交系数的名词解释近交系数是遗传学术语中的一个重要指标，用于衡量遗传物质在种群或个体间的共享程度。
它描述了近亲结合的强度，即亲缘关系的密切程度。
近交系数的大小与基因重复率有关，反映了遗传多样性的程度。
近交系数的计算方法有多种，其中最常用的是所谓的Wright系数。
Wright系数是基于亲缘关系矩阵的一种测度方法，能够比较准确地估计个体间的亲缘关系。
通过比较遗传物质的共享情况，可以得出近交系数的具体数值。
近交系数对于探究物种的遗传多样性以及种群遗传结构的变化具有重要意义。
当近交系数较小时，说明个体间的遗传不相似性较高，种群内的遗传多样性丰富。
而当近交系数较大时，个体间的遗传相似性较高，种群内的遗传多样性会受到压制。
近交系数还可以用来评估育种计划中的亲缘配对，以及注意遗传疾病的传播和控制。
在育种过程中，选择较低的近交系数可以避免遗传缺陷和易感性等不利影响。
此外，对于遗传疾病的研究中，近交系数的计算可以帮助科学家们了解疾病的遗传特征，为疾病的治疗和预防提供一定的参考。
除了育种和疾病控制外，近交系数还在生态学研究方面发挥着重要作用。
通过测量近交系数，可以推测种群的遗传连通性以及迁移的程度。
较低的近交系数意味着种群之间的遗传交流较多，种群间的遗传变异程度较小。
而较高的近交系数则说明不同种群间的遗传交流较少，种群内的遗传变异程度较大。
近年来，随着遗传学研究的深入，近交系数在人类社会中也得到了广泛应用。
例如，在亲属关系鉴定中，可以通过测量近交系数来判断两个个体之间的亲缘关系。
此外，对于一些遗传性疾病的筛查和预防工作来说，近交系数也可以提供重要的参考依据。
总的来说，近交系数是遗传学研究中一个非常重要的指标，它可以反映个体和种群的亲缘关系、遗传多样性以及遗传结构的变化。
通过测量近交系数，我们可以更好地理解生物种群的演化和遗传机制，在育种、疾病控制和生态学研究等领域提供有力的支持。
随着科学技术的不断进步，相信近交系数的应用范围将更加广泛，为人类和自然界的发展带来更大的贡献。
roh的近交系数分 -回复
roh的近交系数分-回复什么是近交系数？近交系数是衡量遗传物质在种群中相互配对程度的一个指标。
它反映了个体间基因的相似度程度，从而影响到群体遗传多样性和适应能力。
为什么要研究近交系数？近交系数的研究对于许多领域都具有重要意义。
在遗传学领域，近交系数可以帮助我们了解基因频率和基因型在种群中的分布情况，从而推测种群的遗传结构和演化。
在畜牧学中，近交系数的研究可以帮助我们评估家禽家畜个体的亲缘关系，以选择合适的配种对象，提高育种效果。
此外，近交系数还与种群的适应能力、遗传疾病的发生等方面密切相关。
如何计算近交系数？近交系数的计算可以采用不同的方法，其中最常用的方法是韦氏系数（Wright's coefficient）和里氏系数（Lynch and Ritland's coefficient）。
韦氏系数是根据个体共享同一亲代可能性进行计算的。
计算公式如下：F = (Ht - Hs) / (He - Hs)其中，F为近交系数，Ht为种群总遗传变异度，Hs为个体间的平均遗传变异度，He为种群间的平均遗传变异度。
里氏系数则是通过对基因型频率进行统计计算的。
计算公式如下：F = (Ho - He) / (1 - He)其中，F为近交系数，Ho为观测到的基因型频率，He为预期的基因型频率。
如何解读近交系数？近交系数的取值范围为0到1之间，数值越高表示近交程度越大。
通常，当近交系数大于0.25时，表示近交程度较高；当近交系数在0.1到0.25之间时，表示近交程度一般；当近交系数小于0.1时，表示近交程度较低。
较高的近交系数可能导致一系列遗传问题，如表现型异常、生育力下降、易感遗传疾病等。
因此，近交系数的研究在动植物的保护和育种中具有重要意义。
如何降低近交系数？为了降低近交系数，从而保持种群的遗传多样性和适应能力，可以采取以下措施：1. 选择合适的配种对象：在育种过程中，选择亲缘关系较远的个体进行交配，以减少近交程度。
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近交系数的计算-答案
设有下列系谱，试用一般计算公式、共亲系数列表算法以及加性遗传相关算法分别求各个体的近交系数和个体间的亲缘系数。
答：
一、近交系数的计算
（一）利用近交系数的一般公式计算 1. X 个体
（1）父母A 和B 的共同祖先有：C 、D 、F 、H ；它们均为非近交个体(判断一个个体是否为近交个体的依据是看其父母是否有共同祖先，如果双亲只知道一方或均未知则默认其为非近交个体)，因此，F C =0，F D =0，F F =0，F H =0。
（2）找通径链，并计算各通径链的系数，求和计算出F X 通径链
共同祖先的近交系数
n 1+n 2+1
通径链的系数 A ←C →B A ←D →B A ←C ←F →D →B A ←D ←F →C →B A ←C ←E ←H →G →D →B A ←D ←G ←H →E →C →B F C =0 F D =0 F F =0 F F =0 F H =0 F H =0 3 3 5 5 7 7
F X = 21/64
2. A 个体
（1）父母C 和D 的共同祖先有F 和H ，且F F =0，F H =0。
（2）找通径链，并计算各通径链的系数，求和计算出F A 。
3
2
1)(3
21)(521)(521)(721)(7
21)(
通径链 共同祖先的近交系数 n 1+n 2+1 通径链的系数 C ←F →D A ←E ←F →G →D
F F =0 F H =0 3 5
F A = 5/32
3.B 个体，与A 个体同父同母，因此与A 相同。
F B = 5/32。
4.其余个体C 、D 、E 、F 、G 、H 均为非近交个体，F C =0，F D =0，F E =0，F F =0，F G =0，F H =0。
（二）利用加性遗传相关列表算法
1. 将系谱中的个体按照世代从高到低分别从左到右、从上到下排列，并将个体的双亲编号列于个体的上方。
2. 利用公式
计算两两个体间的加性遗传相关，并列表。
其中，x 、y 分别表示任意一个个体；x s 、x d 分别表示x 个体的父亲和母亲；y s 、y d 分别表示y 个体的父亲和母亲。
个体间加性遗传相关
X
85/64
3.利用公式
计算每个个体的近交系数：F H = 1 - 1 = 0, F E = 1 - 1 = 0，F G = 1 - 1 = 0=0，F F = 1 - 1 = 0，F C = 1 - 1 = 0，F D = 1 - 1 = 0，F A = 37/32- 1 = 5/32，F B = 37/32- 1 = 5/32，F X = 85/64- 1 = 21/64。
二、亲缘系数的计算
根据个体间加性遗传相关列表中的数据，利用公式
3
2
1)(5
21)(d s x x x a 2
1F =
x
xx F 1a +=)
a +(a 2
1
= a = a d s xy xy yx xy 1
-=XX X
a F
计算两两个体间的亲缘系数。
YY
XX XY XY
a a a r。