细胞转染技术-宋晓萍
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在质粒提取过程中,由于机械力、酸碱度、试剂等的原因,可能使质 粒DNA链发生断裂。所以,多数 质粒粗提取物中含有三种构型的质粒:
共价闭合环状DNA(超螺旋 ): 质粒的两条链没有断裂; 开环DNA: 质粒的一条链断裂;松弛的环状分子; 线形DNA: 质粒的两条链均断裂;线性分子
ErbB2 ErbB2 ErbB2
6. 质粒未全部溶解(尤其质粒较大时) :洗脱溶解质粒时,可适当加温或延长 溶解时间。 7. 乙醇残留:漂洗液洗涤后应离心尽量去除残留液体,再加入洗脱缓冲液。 8. 洗脱液加入位置不正确:洗脱液应加在硅胶膜中心部位以确保洗脱液会完 全覆盖硅胶膜的表面达到最大洗脱效率。 9. 洗脱液不合适:DNA只在低盐溶液中才能被洗脱,如洗脱缓冲液或水。 洗脱效率还取决于pH值,最大洗脱效率在pH7.0-8.5间。当用水洗脱时确 保其pH值在此范围内,如果pH过低可能导致洗脱量低。洗脱时将灭菌蒸 馏水或洗脱缓冲液加热至60℃后使用,有利于提高洗脱效率。 10. 洗脱体积太小:随着洗脱体积的增大回收率增高,但产品浓度降低。 11. 洗脱时间过短:洗脱时间对回收率也会有一定影响。洗脱时放置1min可 达到较好的效果。
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质粒提取扩增
质粒是细胞内的一种环状的小分子DNA,是进行DNA重组的常用载体。 将细菌质粒转化到大肠杆菌中,然后从大肠杆菌中收获大量质粒的过程。
1、质粒的转化
——将质粒 DNA 导入细菌的过程 感受态细菌细胞在 CaCl 2 低渗溶液中膨胀为球状(感受态细菌的制备, 略)。质粒 DNA 与 CaCl 2 形成抗 DNase 羟基 - 磷酸钙复合物黏附于 细菌表面,经 42℃ 短时间热冲击处理,促进细胞吸收 DNA 复合物。在 丰富培养基上生长数小时后,球状细胞复原并分裂增殖。被转化的细菌 中,外源基因得到表达。 BL21(DE3)一般用于外源基因的原核表达, DH5a,TG1和HB2151一般用于重组质粒的克隆和扩增 TG1长得慢,菌落较小,转化效率高,用于普通的克隆测序, BL21(DE3)长的快,菌落较大,转化效率低点,主要用于原核表达。
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稳定转染
1. 转染前一天铺板:5.0-8.0×104细胞接种在24孔板上,0.5ml正常培养基。 2. 24h后的细胞融合达到70%-90%的密度。 3. 转染: (1)50ul无血清培养基(Opti-MEM)+20pmol siRNA(或0.8ugDNA), 柔和混匀,室温孵育5min (2) 50ul无血清培养基+1ul lipo2000(DNA+2ul lipo2000)柔和混匀,室 温孵育5min。 (3)将DNA加入Lipo2000中,轻柔混匀,室温孵育20min 4.将24孔板中的正常培养基换为无血清的培养基(Opti-MEM)1.9ml。 5.将100ulsiRNA/Lipo2000(DNA/Lipo2000)复合物混匀逐滴加入孔中,轻 轻摇匀。 6.4-6h后,换培养基(全培),48-72小时监测转染水平。 7. 加相应的抗生素筛选,一般是转染48小时后加入抗生素。挑出单后就可 以用维持浓度,一般是筛选浓度的1/2
15,000bp 10,000bp 7,500bp 5,000bp
常见问题及解决方案
Q1:原先测序鉴定没有问题的细菌,37℃摇菌后发现质粒大小或序列出现异常?
这种情况出现的几率较小,常出现在较大质粒或比较特殊的序列中。 解决办法: 1. 降低培养温度,在20~25℃下培养,或室温培养可明显减少发生概率。 2. 使用一些特殊菌株,如Sure菌株,它缺失了一些重组酶,如rec类等,使 得质粒复制更加稳定。 3. 质粒抽提有一个酶切不完全的原因就是溶液Ⅱ中的NaOH浓度过高造成的
转染细胞的稳定筛选
1. 确定抗生素作用的最佳浓度: 不同的 细胞株 对各种抗生素有不同 的敏感性,因此在筛选前要做预试验,确定抗生素对所选择细胞的最低作用 浓度. ①提前 24 小时在 96 孔板或 24 孔板中接种细胞 8 孔,接种量以第二天长 成 25%单层为宜,置 CO2 孵箱中 37℃培养过夜. ②将培养液换成含抗生素的培养基, 抗生素浓度按梯度递增0,(50, 100, 200, 400, 600, 800 和1000μ g/ml). ③培养 10-14 天以绝大部分(>90%) 细胞死亡 浓度为准, 筛选稳定表 达克隆时可比该浓度适当提高一个级别,维持时使用筛选浓度的一半. 2. 转染 48-72 小时后按 1: 10 的比例将转染细胞在 6 孔板中传代,换为 含预试验中 确定的抗生素浓度的选择培养基.在6 孔板内可见单个细胞, 继续培养可见单个 细胞分裂 繁殖形成单个抗性集落.
感受态细菌细胞 TG1 DH5a
特点 长得慢,菌落较小,转化效率高, E.coli DH5a在使用pUC系列质粒载体 转化时,可与载体编码的β-半乳糖 苷酶氨基端实现α-互补。可用于蓝 白斑筛选鉴别重组菌株。
用途 用于普通的克隆测序 常用于分子克隆、质粒 提取和蛋白质表达。
BL21(DE3)
该菌株用于高效表达克隆于含有噬菌 一般用于外源基因的原 体T7启动子的表达载体(如pET系列) 核表达 的基因。T7噬菌体RNA聚合酶位于λ 噬菌体DE3区,该区整合于BL21的染 色体上。该菌适合表达非毒性蛋白。 长的快,菌落较大,转化效率低点。
脂质体介导转染
脂质体转染的原理基于电荷吸引原理,先形成脂质体-DNA复合物,散布在细 胞周围,然后通过细胞的内吞作用,将目的基因导入细胞内。
转染试剂的选择
1. promega公司
Promega转染试剂产品适合于人HeLa,Hep G2,293,K562,Jurkat;猴COS7,CV-1;小鼠NIH3T3;仓鼠BHK,CHO;大鼠PC12;昆虫S19等等细胞系的 RNAi转染。
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1 2 3
转染方法
瞬时转染 稳定转染 逆转录病毒转染
转染前细胞培养
细胞培养用品 96孔板 48孔板 24孔板 12孔板 6孔板 35mm 60mm 细胞培养用品 96孔板 24孔板 12孔板 表面积(mm2/孔) 50 100 200 401 962 962 2827 siRNA/DNA 5pmol/0.2μg 20pmol/0.8μg 40pmol/1.6μg 细胞密度 1.5×104-5.0×104 3.0×104-1.0×105 8.0×104-2.0×105 1.6×105-4.0×105 3.0×105-8.0×105 3.0×105-8.0×105 1.0×106-2.5×106 培养基终体积 100μl 500μl 1.0ml 培养基(μl/孔) 100μl 200μl 500μl 1.0ml 2.0ml 2.0ml 6.0ml
3. 挑选单克隆. ①滤纸片法:用消毒的 5x5mm 滤纸片浸过胰酶,将滤纸片贴在 单细 胞 集落上 10-15 秒,取出粘附有细胞的滤纸片放于 24 孔板中继续加 压培养. 细胞在 24 孔板中长满后转入 25cm2 培养瓶中,长满后再转 入 75cm2 培养瓶中培养. ②有限稀释法:将细胞消化下来后做连续的 10 倍稀释(10-2-1010),将每一稀释度的细胞滴加到 96孔板中培养,7- 10天后,选择单 个克隆生长的孔再一次进行克隆. 4. ELISA或 Westernblot检测单克隆细胞中外源蛋白的表达情况由 于不同克隆的 表达水平存在差异因此可同时挑选多个克隆选择表达 量最高的克隆传代并保种.
细胞转染技术
汇报人:宋晓萍 2015.5.9
目录
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基本原理 质粒提取扩增 转染方法 影响转染实验的因素 常见问题及解决方案
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细胞转染——
基本原理
将外源分子如DNA,RNA等导入真核细胞的技术。
研究内容:研究和控制真核细胞基因功能 应 用:基因功能、调控基因表达、突变分析和蛋白质生产等生物 学试验
瞬时转染
稳定转染
外源 DNA 既可以整合到宿主染色体中,也可能作为一种游 离体(episome)存在。尽管线性 DNA 比超螺旋 DNA 转 入量低但整合率高。外源 DNA 整合到染色体中概率很小, 大约 1/104 转染细胞能整合,通常需要通过一些选择性标 记,如来氨丙基转移酶(APH;新霉素抗性基因),潮霉 素 B 磷酸转移酶(HPH),胸苷激酶(TK)等反复筛选, 得到稳定转染的同源细胞系。
2. Invitrogen公司 Lipofetamine2000,适合于Hela,BHK,HEK,COS-7,PC12,NIH3T3等各种 常用细胞系的RNAi转染。 3. 转染FAQs: 脂质体复合物与贴壁细胞的接触机会比悬浮细胞高出很多倍,所以,脂 质体转染时悬浮细胞的转染效率要明显低于贴壁细胞。 悬浮细胞是用的电穿孔法。
Q2:未提出质粒或质粒得率较低,如何解决?
1. 大肠杆菌老化,细菌发生溶菌,可减少培养时间或者试试平板培养, 2. 质粒拷贝数低,质粒抽提过程很大程度上是受细菌生长情况决定的,刚 活化的菌比负80℃保存菌种所培养出来的菌液状态好,保存久的菌株可 能会造成质粒浓度低,质粒丢失等不明原因。 3. 菌体中无质粒,质粒丢失。每次接种时应接种单菌落。另外,检查抗生 素使用浓度是否正确。判断生长的菌液是否正常,可以用肉眼观察,在 光线明亮处摇荡新鲜培养液,如果菌液呈漂絮状,情况很好。如果呈泥 水状,即看不到絮状,则可能提不出好的质粒,或者没有质粒。 4. 碱裂解不充分,菌液不宜生长太浓,摇床速度不宜过高。 5. 吸附柱过载:
该菌株在使用pUC系列质粒载体进行 分子克隆、质粒提取和 DNA转化或用M13 phage载体进行转 蛋白质表达。 染时,由于载体DNA产生的LacZa多肽 和JM09编码的LacZΔM15进行α-互补, 从而显示β-半乳糖苷酶活性,由此 很容易鉴别重组体菌株
JM109
质粒的转化具体方法省略…… NOTE: I. 不同的感受态细菌转化效率不同,选择合适的E.coli II. 1ng的cccDNA就可使50ul的感受态细胞饱和,DNA量过多会降低转化 效率。 III. 转化时为提高转化效率,质粒加入E.coli培养1h后可离心弃上清后用剩 余的菌液涂布。
Lipo2000(siRNA/DNA) 0.25μl/0.5μl 1μl/2μl 2μl/4μl
6孔板
35mm 60mm
100pmol/4.0μg
100pmol/4.0μg 600pmol/8.0μg
2.0ml
2.0ml 5.0ml
5μl/10μl
5μl/10μl 10μl/20μl
推荐的DNA:Lipo2000=1:0.5-1:5(ug:ul) siRNA:Lipo2000=1:0.01-1:0.1(pmol:ul)
2、质粒的提取扩增
I. 细菌铺板:加入抗生素(终浓度是50ug/ml-100Hale Waihona Puke Baidug/ml) II. 挑选菌落:从LB培养基上挑选菌落备用 III. 细菌培养:37摄氏度培养箱中以180rpm摇动12~14h,使大肠杆菌 繁殖 IV. 碱裂解抽提:采用细胞裂解的方式,从含目标质粒的大肠杆菌菌液 中将质粒提取出来
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瞬时转染
1. 转染前一天铺板:5.0-8.0×104细胞接种在24孔板上,0.5ml正常培养基。 2. 24h后的细胞融合达到70%-90%的密度。 3. 转染: (1)50ul无血清培养基(Opti-MEM)+20pmol siRNA(或0.8ugDNA), 柔和混匀,室温孵育5min (2) 50ul无血清培养基+1ul lipo2000(DNA+2ul lipo2000)柔和混匀,室 温孵育5min。 (3)将DNA加入Lipo2000中,轻柔混匀,室温孵育20min 4.将24孔板中的正常培养基换为无血清的培养基(Opti-MEM)1.9ml。 5.将100ulsiRNA/Lipo2000(DNA/Lipo2000)复合物混匀逐滴加入孔中,轻 轻摇匀。 6.4-6h后,换培养基(全培),48-72小时监测转染水平。 7. 转染效率: • 绿色荧光蛋白看荧光 • mRNA水平,48h后收样品,做PCR • 蛋白水平,72h后收蛋白,做WB。
常规转染技术
外源 DNA/RNA 不整合到宿主染色体中,因此一个宿主细 胞中可存在多个拷贝数,产生高水平的表达,但通常只持 续几天,多用于启动子和其它调控元件的分析。一般来说, 超螺旋质粒 DNA 转染效率较高,在转染后 24-72 小时内 (依赖于各种不同的构建)分析结果, 常常用到一些报告 系统如荧光蛋白,β 半乳糖苷酶等来帮助检测。