基因表达调控PPT课件

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第八章真核基因表达调控ppt课件

第八章真核基因表达调控ppt课件
Κ型和λ型轻链的恒定区和可变区的氨基酸序列是 不同的。
在小鼠中,95%的抗体轻链是κ型,而人类抗体 轻链中,κ型和λ型各占50%左右。
人类基因组中免疫球蛋白基因主要片段的数
免疫球蛋白重链基因片段重排与组织特异性表达
酵母交配型转换
8.1.4 DNA甲基化与基因调控
A. DNA的甲基化 DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、
启动区DNA分子上的甲基化密度与基因转录受 抑制的程度密切相关。对于弱启动子来说,稀少的 甲基化就能使其完全失去转录活性。当这一类启动 子被增强时(带有增强子),即使不去甲基化也可 以恢复其转录活性。若进一步提高甲基化密度,即 使增强后的启动子仍无转录活性。
P295, Fig. 8-15
C. DNA甲基化与X染色体失活
A、螺旋-转折-螺旋(helix-turn-helix, H-T-H) 结构。这一类蛋白质分子中有至少两个α螺旋,中 间由短侧链氨基酸残基形成“转折”,近羧基端的 α螺旋中氨基酸残基的替换会影响该蛋白质在DNA 双螺旋大沟中的结合。
同源域蛋白通过其第三个螺旋与双链DNA的大沟 相结合,其N端的多余臂部分则与DNA的小沟相
选择性剪接
➢ 原始转录产物可通过不同的剪接方式,得到不同 的mRNA,并翻译成不同蛋白质; ➢有些基因选择了不同的启动子,或者选择了不同的 多聚(A)位点而使原始转录物具有不同的二级结构, 产生不同的mRNA分子,但翻译成相同蛋白质。 ➢同一基因的转录产物由于不同的剪接方式形成不同 mRNA的过程称为选择性剪接。
本章主要内容提要
1.真核生物的基因结构与转录活性; 2.真核基因转录机器的主要组成; 3.蛋白质磷酸化对基因转录的调控; 4.蛋白质乙酰化对基因表达的影响; 5.激素与热激蛋白对基因表达的影响; 6.其他水平上的表达调控。

生物化学》ppt课件14.第十四章-基因表达调控

生物化学》ppt课件14.第十四章-基因表达调控
操纵子(operon)是原核生物中几个功能相关的 结构基因成簇串联排列组成的一个基因表达的协 同单位。操纵子的本质是DNA序列。
1.操纵子的结构与功能
一个操纵子=调节序列+启动序列+操纵序列+编码序列
⑴调节序列(inhibitor,I):编码一种阻遏蛋白(repressor) 。 ⑵启动序列(promoter,P):结合RNA聚合酶,启动转录。 ⑶操纵序列(operator,O):阻遏蛋白的结合位点。 ⑷编码序列(coding sequence):编码功能性蛋白,2~6个。
第一节 基因表达调控的 概念和原理
(Concept and principle: Regulation of Gene Expression)
一、基因表达调控的概念
(一)基因表达(gene expression) 是指基因经过
转录、翻译,产生具有特异生物学功能的蛋白 质分子的过程。
(二)基因表达的时间性及空间性
转录激活域
谷氨酰胺富含域 脯氨酸富含域
蛋白质-蛋白质结合域 (二聚化结构域)
1.同源结构域
2.锌指
3.碱C
H
C
Cys
H
His
其他氨基酸
(四)真核生物基因表达调控模式
1.真核生物基因表达调控较复杂,除转录起始阶段 受到调节外,在转录后水平、翻译水平及翻译后水平 等均受调控。
2.真核RNA聚合酶Ⅱ在转录因子帮助下,形成的 转录起始复合物。
白 因 子 , 决 定 三 种 RNA(mRNA 、 tRNA 及 rRNA)转录的类别。
2.特异转录因子(special transcription factors) 为个别基因转录所必需,决定该基因的时

真核生物的基因表达调控ppt(共59张PPT)

真核生物的基因表达调控ppt(共59张PPT)

在转录水平上的基因表达调控
真核生物的蛋白质基因的转录除了启动子、RNA聚合酶II和基础转录因 子以外,还需要其它顺式作用元件和反式作用因子的参与。 参与基因表达调控的主要顺式作用元件有:增强子、沉默子、绝缘 子和各种反应元件;参与基因表达调控的反式作用因子也称为转录 因子,它们包括激活蛋白、辅激活蛋白、阻遏蛋白和辅阻遏蛋白。 激活蛋白与增强子结合激活基因的表达,而阻遏蛋白与沉默子结合 ,抑制基因的表达,某些转录因子既可以作为激活蛋白也可以作为 阻遏蛋白其作用,究竟是起何种作用取决于被调节的基因。辅激活 蛋白缺乏DNA结合位点,但它们能够通过蛋白质与蛋白质的相互作 用而行使功能,作用方式包括:招募其它转录因子和携带修饰酶( 如激酶或乙酰基转移酶)到转录复合物而刺激激活蛋白的活性;辅 阻遏蛋白也缺乏DNA结合位点,但同样通过蛋白质与蛋白质的相互 作用而起作用,作用机理包括:掩盖激活蛋白的激活位点、作为负 别构效应物和携带去修饰酶去中和修饰酶(如磷酸酶或组蛋白去乙 酰基酶)的活性。
真核生物与原核生物在 调控机制上的主要差异
调控的原因:原核生物基因表达调节的目的是为了更有效 和更经济地对环境的变化做出反应,而多细胞真核生物基 因表达调节的主要目的是细胞分化,它需要在不同的生长 时期和不同的发育阶段具有不同的基因表达样式; 调控的层次:原核生物基因表达调控主要集中在转录水平 ,但真核生物基因表达的转录后水平调节与其在转录水平 上的调节各占“半壁江山”,而某些调控层次是真核生物特有 的,比如染色质水平、RNA后加工水平和mRNA运输等;
调控的手段:原核生物绝大多数的基因组织成操纵子,但真核 生物一般无操纵子结构。
在染色质水平上的基因调控
原核生物的DNA绝大多数处于完全暴露和可接近的状态,而真核生物 DNA大部分被遮挡并组织成染色质。因此,原核生物DNA转录的“默认 状态”是开放,其调控机制主要是通过阻遏蛋白进行的负调控,而真核生 物DNA转录的“默认状态”是关闭,其调控机制主要是通过激活蛋白进行 的正调控。 染色质的结构是一种动态可变的结构,其结构的变化能直接影响到基因 的表达。已有众多证据表明,一个基因在表达前后,其所在位置的染色 质结构会发生重塑或重建。由于染色质的组成单位是核小体,因此,染 色质结构的改变是从核小体的变化开始的,而核小体的变化是从组蛋白 的共价修饰和去修饰开始的。

分子生物学原核生物基因表达调控ppt课件

分子生物学原核生物基因表达调控ppt课件
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一、原核基因表达调控环节
1、转录水平上的调控
(transcriptional regulation)
2、转录后水平上的调控
(post-transcriptional regulation)
① mRNA加工成熟水平上的调控 ② 翻译水平上的调控
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二、操纵子学说
1、操纵子模型的提出 1961年,Monod和Jacob提出 获1965年诺贝尔生理学和医学奖
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③ 操纵基因是DNA上的一小段序列(仅为26bp), 是阻遏物的结合位点。
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RNA聚合酶结合部位
阻遏物结合部位
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操纵位点的回文序列
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④当阻遏物与操纵基因结合时,lac mRNA的转 录起始受到抑制。
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未诱导:结构基因被阻遏
阻遏物 四聚体
LacI P O
lacZ
lacY
lacA
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酶合成的诱导操纵子模型
调节基因
操纵基因
结构基因
阻遏蛋白
调节基因
操纵基因
结构基因
诱导物
如果某种物质能够促使
阻遏蛋白
mRNA
细菌产生酶来分解它,
这种物质就是诱导物。
诱导物
酶蛋白
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• 可阻遏调节:基因平时是开启的,处在产生蛋白质 或酶的工作过程中,由于一些特殊代谢物或化合物 的积累而将其关闭,阻遏了基因的表达。 例:色氨酸操纵子 合成代谢蛋白的基因
1、根据操纵子对调节蛋白(阻遏蛋白或激活蛋白) 的应答,可分为: 正转录调控 负转录调控
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调节基因
操纵基因
结构基因
激活蛋白 阻遏蛋白
正转录调控 负转录调控
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全球第一例中国人标准基因组序列图谱的一部分
基因表达
是基因转录及翻译的过程,即:生成具有生物学 功能产物的过程。
(激活)
基因表达调控
(功能及形态表型)
控制基因表达的调节机制,细胞或生物体在接受 内外环境信号刺激时或适应环境变化的过程中在
基因表达水平做出应答的分子机制。
例如:人类基因组含2-2.5万个编码基因,在某一特定时 期或生长阶段,只有一小部分基因处于表达状态。
① 真核基因组比原核基因组大得多 ② 原核基因组的大部分序列都为编码基因,而哺
乳 类 基 因 组 中 只 有 10% 的 序 列 编 码 蛋 白 质 、 rRNA、tRNA等,其余90%的序列,包括大量 的重复序列功能至今还不清楚,可能参与调控 ③ 真核生物编码蛋白质的基因是不连续的,转录 后需要剪接去除内含子,这就增加了基因表达 调控的层次
④ 原核生物的基因编码序列在操纵子中,多顺反子 mRNA使得几个功能相关的基因自然协调控制; 而真核生物则是一个结构基因转录生成一条 mRNA , 即 mRNA 是 单 顺 反 子 ( monocistron ) ,许多功能相关的蛋白、即使是一种蛋白的不同 亚基也将涉及到多个基因的协调表达
⑤ 真核生物DNA在细胞核内与多种蛋白质结合构 成染色质,这种复杂的结构直接影响着基因表 达;
整理
❖ 掌握操纵子的概念。 ❖ 掌握乳糖操纵子的结构,阻遏蛋白的负性调
节,CAP的正性调节,协调调节。 ❖ 了解原核基因表达转录终止阶段的调控机制。 ❖ 了解原核基因表达翻译水平的调控。
第四节
真核基因表达调节
Regulation of Gene Expression in Eukaryote
一、真核细胞基因表达的特点
➢ 共有序列决定启动序列的转录活性大小。
2.操纵元件
❖ 操纵元件是一段能被特异阻遏蛋白识别和结 合的DNA序列。
调节序列
编码序列
其他调节基因
启动子 操纵元件 (promoter) (operator)
阻遏蛋白
3.调节基因
调节基因(regulatory gene)编码能够与操纵 序列或其它调节元件结合的调控蛋白,可以分为 三类:特异因子、阻遏蛋白和激活蛋白。
二、基因表达具有时间特异性和空间特异性
时间特异性 (阶段特异性)
基因表达按一定的时间顺序发生 例:霍乱弧菌 44种上调,193种受抑制
AFP基因 胎儿肝细胞表达活跃 成人很低
空间特异性
(组织或细胞特异性)
多细胞生物个体在某一特定生长发育阶段,同一基因在 不同的组织器官表达不同 例:胰岛素基因 胰岛B细胞,
遏表达的概念。 ❖ 了解基因表达调控的多层次和复杂性。
第二节
原核基因表达调控
Regulation of Gene Expression in Prokaryote
原核生物基因组结构特点
原核生物基因组是具有超螺旋结构的闭合环状DNA分子
① 基因组中很少有重复序列; ② 编码蛋白质的结构基因为连续编码,且多为单
⑥ 真核生物的遗传信息不仅存在于核DNA上,还 存在线粒体DNA上,核内基因与线粒体基因的 表达调控既相互独立而又需要协调。
➢真核生物基因表达的多层次复杂调控
二、染色质结构与真核基因表达密切相关
(一)转录活化的染色质对核酸酶极为敏感
➢活性染色质 (active chromatin) 具有转录活性的染色质
❖ 多顺反子(polycistron):mRNA分子携带了 几个多肽链的编码信息
1.启动子
➢ 启动子是RNA聚合酶和各种调控蛋白作用的部位, 是决定基因表达效率的关键元件。
➢ 各种原核基因启动序列特定区域内,通常在转录 起始点上游-10及-35区域存在一些相似序列,称 为共有序列。
➢ E.coli及一些细菌启动序列的共有序列在-10区域 是TATAAT,在-35区域为TTGACA
❖ 富含赖氨酸的H1组蛋白含量降低 ❖ H2A-H2B组蛋白二聚体的不稳定性增加,
从核小体中置换出来。 ❖ H3、H4可发生乙酰化、磷酸化及泛素化
修饰,核小体结构变的松弛和不稳定,核 小体对DNA亲和力下降,易于转录。
组蛋白修饰对染色质结构与功能的影响
组蛋白 H3 H3 H3 H3 H3 H3 H3 H4 H4 H4 H4 H4
β -半乳糖苷酶
-1,6糖苷键 异乳糖
乳糖
有乳糖存在时
2、CAP的正性调节
+ + + + 转录
DNA
CAP P O Z Y A
CAP CAP CAP CAP 无葡萄糖,cAMP浓度高时
CAP
有葡萄糖,cAMP浓度低时
3.协调调节
※当阻遏蛋白封闭转录时,CAP对该系统不能 发挥作用;
※如无CAP存在,即使没有阻遏蛋白与操纵序 列结合,操纵子仍无(低)转录活性。
三、原核生物具有不同的转录终止 调节机制
(一)依赖Rho因子的转录终止
常见于噬菌体中,结构特点不清楚。
(二)不依赖Rho因子的转录终止
终止子结构特点:
➢ 两段富含GC的反向重复序列,中间间隔 若干核苷酸;
➢ 下游含一系列T序列。
四、原核生物在翻译水平受到 多个环节的调节
(一)蛋白质分子结合于启动序列或启动 序列周围进行自我调节
基因表达调控
•虽然存在于多细胞生物体内的每个体细胞的遗传信息 是相同的 ,但每个细胞(蛋白质)生物学功能呈现多样 化、显著的差异。 ——为什么?
外界的信息
感知
细胞内的 信号转导
基因的表达呈开 放或增强,有些 则成关闭或下降
特定信号的刺激
第一节
基因表达调控的基本概念
Basic Conceptions of Gene Expression Regulation
➢ 调节蛋白结合mRNA靶位点,阻止核蛋白体 识别翻译起始区,从而阻断翻译。
➢ 调节蛋白一般作用于自身mRNA,抑制自身 的合成,称自我控制(autogenous control)。
(二)反义RNA结合mRNA翻译起始部位互 补序列对翻译进行调节
细菌中含有与特定mRNA翻译起始部 位 互 补 的 RNA , 通 过 与 mRNA 杂 交 阻 断 30S小亚基对起始密码子的识别及与SD序 列的结合,抑制翻译起始。这种调节称为 反义控制(antisense control)。
肌浆蛋白 胶原纤维而非纤维细胞。
三、基因表达的方式及调节存在很大的差异
基本(或组成性)表达
有些基因产物对生命全过程都是必需的或必不可
少的。这类基因在一个生物个体的几乎所有细胞
中持续表达,通常被称为
管家基因
例如:三羧酸循环是一中枢代谢途径,催化该 途径各阶段反应的酶的编码基因就属管家基因
适应性表达
激活 激活 防止Lys-9的甲基化 端粒沉默
装配 装配 核小体装配 Fly X激活
➢ 组蛋白修饰对于基因表达影响的机制也包括 两种相互包容的理论。即:组蛋白的修饰直 接影响染色质或核小体的结构,以及化学修 饰征集了其他调控基因转录的蛋白质,为其 他功能分子与组蛋白结合搭建了一个平台。 这些理论构成了“组蛋白密码”的假说。
例:某一代谢途径的相关酶 (糖原合成与分解)
四、基因表达调控呈现多层次和复杂性
基因表达的多水平调控
基因激活等
蛋白质翻译
转录起始
(microRNA)
转录后加工 mRNA降解
调控点
翻译后加工修饰 及蛋白质降解
转录水平的调控是基因表达 的最主要和重要的调控步骤
五、基因表达调控为生物体生长、 发育所必需
➢超敏位点(hypersensitive site) 当染色质活化后,常出现一些对核酸酶
(如DNase I)高度敏感的位点
(二) 转录活化染色质的组蛋白发生改变
组蛋白结构及其化学修饰
(a)组蛋白与DNA组成的核小体;(b)组蛋白的氨基端伸出核 小体,形 成组蛋白尾巴;(c)四种组蛋白组成的八聚体
转录活跃区域染色体的组蛋白特点:
1.适应环境、维持生长和增殖
例如: (1)G↑→细菌利用G酶增加,其他的糖代谢相关酶关闭; (2)乳糖↑、G↓→乳糖代谢相关酶编码基因表达; (3)饮酒→醇氧化酶基因表达→醇氧化酶活性↑。
2.维持细胞分化与个体发育
当某种基因缺陷或表达异常时,则会出现相应组织或器 官的发育异常。
整理
❖ 掌握基因表达的概念。 ❖ 了解基因表达的时间特异性和空间特异性。 ❖ 熟悉管家基因、基因组成性表达、诱导和阻
(三) CpG岛甲基化水平降低
➢ CpG岛(CpG island) :甲基化胞嘧啶在基因组中并 不是均匀分布,有些成簇的非甲基化CG存在于整个 基 因 组 中 , 人 们 将 这 些 GC 含 量 可 达 60% , 长 度 为 300-3000bp 的 区 段 。 ( 60% 基 因 启 动 子 含 CpG 岛 , 管家基因甲基化较低)
单纯乳糖存在时,细菌利用乳糖作碳源; 若有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在时,细 菌首先利用葡萄糖。
葡萄糖对 lac 操纵子的阻遏作用称分解代 谢阻遏(catabolic repression)。
低乳糖时
葡萄糖低 cAMP浓度高
O
葡萄糖高 cAMP浓度低
O
高乳糖时
RNA-pol
O
mRNA
O
图18-3 CAP、阻遏蛋白、cAMP和诱导剂对lac操纵子的调节
氨基酸残基位点 Lys-4 Lys-9 Lys-9 Lys-9 Ser-10 Lys-14 Lys-79 Arg-3 Lys-5 Lys-12 Lys-16 Lys-16
修饰类型 甲基化 甲基化 甲基化 乙酰化 磷酸化 乙酰化 甲基化 甲基化 乙酰化 乙酰化 乙酰化 乙酰化
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