基因组文库和cDNA文库的比较

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材料影响
cDNA文库能反映 mRNA信息,但 不能直接获得基 因的内含子序列 和基因编码区外 大量的调控序列 信息。需要基因
组文库。
cDNA文库中,高 丰度mRNA的
cDNA克隆,所占 比例较高,分离基
因容易;低丰度 mRNA的cDNA克 隆,所占比例较低,
分离基因困难;
感谢聆听!
THANK YOU!
03 cDNA文库优点
复杂性低、筛选
假阳性概率低。
简易。其克隆子
基因组克隆子
数为基因组文库
复杂,假阳性
的十分之一。
概率高。
真核生物克隆序 列直接应用于基 因工程,基因组 文库不能。
以mRNA为原料, 研究RNA病毒的基 因组结构和基因克 隆分离。
03 基因组文库优点
基因组文库含有 全部基因,
cDNA文库只含有 全部蛋白质编码 的结构基因且受
01 文库构建(真核)
酵母人工染色体
c.构建酵母人工染色体型基因组文库
02
基因组文库
概念 文库制备
02 概念
cDNA文库:以mRNA为模板, 经反转录酶催化,在体外反转录 成cDNA,与适当的载体连接后 转化受体菌,则每个细菌含有一 段cDNA,并能繁殖扩增,这样 包含着细胞全部mRNA信息的 cDNA克隆集合称为该组织细胞 的cDNA文库。
基因组文库和cDNA文库的比较
目录
CONTENTS
01 基因组文库 02 cDNA文库 03 两者比较
01
基因组文库
概念 文库构建(原核) 文库构建(真核)
01 概念
基因组文库:某种生物基因组的 全部遗传信息通过克隆载体贮存 在一个受体菌的群体中,这个受 体菌群体就是该种生物的基因组 文库。
公式:N=ln(1-P)/ln(1-f), 实际克隆子数应为2N~3N或更大。
01 文库构建(原核)
制备基因组DNA并片段化
物理学方法:机械类或超声波等 生物化学方法:限制酶部分切割
筛选鉴定基因组文库
百度文库
DNA片段与载体重组连接
原核生物基因组较小,一般采用质粒载体 或λ载体。
重组DNA导入受体菌细胞并扩增
01 文库构建(真核)
真核生物和原核生物基因组 文库构建的原理和过程基本 相似,方法有异(原核采用 质粒载体或λ载体)。下面 介绍三种方法:
a.构建 λ噬菌体型基因组文库
01 文库构建(真核)
由于筛选困难、重组效率低、文 库不易贮存,Cosmid使用不如λ 噬菌体载体普遍。
b.构建 Cosmid基因组文库
公式:N=ln(1-P)/ln(1-f)
02 文库构建
细胞总RNA的制备及mRNA的分离
包括mRNA、tRNA、rRNA
cDNA第一条链的合成
oligo引导合成法、随机引物引导合成法
双链cDNA的合成
四种常用方法
cDNA与载体的连接和噬菌体颗粒的包 装及转染或质粒的转化
02 文库构建
oligo 引 导 合 成 第 一 链
02 文库构建
双 链
DNA
合 成 方 法
大肠杆菌 RNaseH酶 降解取代法
Oligo寡聚 引物引导法
PCR法
固相支持物 法
02 文库构建
大 肠 杆 菌
RNaseH
酶 降 解 取 代 法
02 文库构建
Oligo
寡 聚 引 物 引 导 法
02 文库构建
PCR法
03
比较
cDNA文库优点 基因组文库优点
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