第十一章 动物基因组学基础

动物基因组学在家畜育种中的应用
基因诊断 标记辅助导入 地方品种种质特性研究

动物功能基因组学与比较基因组学
功能基因组学（Functional genomics） 比较基因组学（comparative genomics）


动物基因组学及人类基因组计划
1985年率先提出的，旨在阐明人类基因组30亿 个碱基对的序列，发现所有人类基因并搞清其 在染色体上的位置，破译人类全部遗传信息， 使人类第一次在分子水平上全面地认识自我。 1990年正式启动，这一价值30亿美元的计划的 目标是，为30亿个碱基对构成的人类基因组精 确测序，从而最终弄清楚每种基因制造的蛋白 质及其作用。 2000年6月26日是人类历史上值得纪念的一天。 来自科技部和中国科学院的消息说，人类基因 组的工作草图已经绘制完毕并于今天向全世界 公布 。

生化遗传标记(biochemical genetic marker)
– 在同一动物个体中具有相同功能的蛋白质存在两
种以上的变异体； – 蛋白质多态性

分子遗传标记（Molecular genetic marker）
分子遗传标记

Байду номын сангаас

1、限制性片段长度多态性标记（RFLP） 2、串联重复序列标记（TRS） （1）小卫星：（Minisatellite DNA） （2）微卫星：（Microsatellite DNA, MS） 3、随机扩增多态性DNA标记（RAPD） 4、线粒体DNA标记（mtDNA） 5、扩增片段长度多态性标记（AFLP） 6、单核苷酸多态性标记（SNP）
质量性状的基因定位方法

家系分析法（pedigree analysis）
– 对性染色体连锁的基因十分有效

遗传重组值定位法
– 两点测交法 – 三点测交法
细胞学定位与体细胞定位 物理学定位

数量性状的基因定位

主效基因（Major gene）
– 某一基因位点的等位基因对某一数量性状的效应
具有足够大的效应。
第11章 动物基因组学基础
内 容
动物遗传标记 基因图谱
基因定位方法
动物基因组学
第一节 动物遗传标记
遗传标记
– 能够用以区别生物个体或群体及其特定基因
型、并能够稳定遗传的物质标志。 – 形态学标记（morphological marker）

能够用肉眼识别和观察、明显显示遗传多样性的 外观性状。 毛色、角形、冠形、耳形、体型、外貌
– 细胞遗传标记（cytological genetic marker） 染色体核型、带型和数量特征的变异等 反映了染色体在结构和数量上的遗传多态性
动物遗传标记的发展

免疫遗传标记（immunogenetical marker）
– 以动物的免疫学特征为标记，红白细胞抗原，
Swine leucocyte antigen, SLA
遗传标记在动物遗传育种中的应用



1、 2、 3、 4、 5、 6、 7、
动物种质资源的遗传评估、保护和利用 个体及亲缘关系的鉴定 基因定位与遗传图谱的构建 标记辅助选择（ MAS） 杂种优势预测 遗传监测 抗病育种
第二节 基因图谱
基因图谱的概念 连锁图谱的构建 物理图谱

基因图谱
基因位点在染色体上的线性排列顺序及它们之 间的相对距离 物理图谱（physical map）、遗传图谱 （genetic map）、表达图谱（expression map）、转录图谱（translation map） 物理图谱

– 用细胞和分子遗传学原位杂交的方法和体细胞杂交
的方法建立的； – 基因位点间的距离用碱基对或千碱基对表示。

分析方法
– – – –
双回交的χ2检验 两基因位点F2群体的χ2检验 直接分析法 多位点连锁分析
物理图谱
将基因或遗传标记定位在某一染色体或
染色体的某一特定区域上。 构建方法
– 分离染色体
– 体细胞杂交
第三节 基因定位方法

基因定位（gene location）是用一定的方 法将基因确定到染色体的实际位置。这 是现代遗传学的重要研究内容之一。将 不同的基因确定于染色体的具体位置之 后，即可绘制出基因图（gene map）。

检测：
– 多峰分布 – 有选择的回交 – 非正态分布 – 综合分离分析
数量性状的基因定位
候选基因法（candidate
gene
approach）
第四节 动物基因组学

Genomics:
– 以基因组分析为手段，研究基因组的结构组
成、时序表达模式和功能，提供有关物种及 细胞功能的进化信息。
人类基因组计划 动物基因组计划

遗传图谱
– 通过连锁分析的方法建立的，也称为连锁图谱
（linkage map） – 基因位点间的距离用厘摩（cM）表示。
连锁图谱的构建

参考家系（reference family）
– 用于构建连锁图谱的动物群体，也称为作图
群体 – 构建方法：

高繁殖力动物：回交，F2代杂种互交 低繁殖力动物：系谱清楚的半同胞家系