pubmed使用介绍资料

合集下载
  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

PubMed简介——是什么?
Entrez可以检索的数据库:

Books 出版社提供之数字生医图书与医生参考书籍数据库 Cancer Chromosomes 美国国立癌症研究所的Mitelman Database of Chromosome Aberrations in Cancer数据库里已经整合好的cytogenetic、 临床与文献相关数据 Conserved Domain Database(CDD),蛋白质功能区块保留序列数据库 3D Domains,蛋白质功能区块立体结构数据 Gene,包含许多物种的基因数据库 Genome,包含超过800种物种的基因组数据库 GENSAT,小鼠中枢神经系统基因表现图谱 GEO Datasets,基因表现实验与生物芯片数值结果数据 GEO Profiles,基因表现图谱 HomoloGene,同源基因批注数据库 Journals,期刊文献(包含PubMed) MeSH,医学主题词数据库 NCBI Web Site,所有NCBI网页 NLM Catalog,美国国立医学图书馆馆藏书目、期刊、视听数据目录 Nucleotide sequence database,核酸序列数据库(包含GenBank、RefSeq 和PDB等三大序列数据库)
文摘型数据库PubMed 检索方法与技巧
翁蕾鸣 北京大学医学图书馆信息咨询部
主要内容
PubMed简介——是什么? PubMed特色服务——能干什么? PubMed检索方法——怎么用? 其他辅助功能
PubMed简介——是什么?



创建机构:美国国家医学图书馆下设的美国 生物技术信息中心(NCBI) 1996年1月开始向全球开放 特色:免费、收录广、内容全、检索途径多、 检索体系完备、 文摘库,部分文献还可在网 上直接免费获得全文。 http://pubmed.gov
BLAST 序列相似搜索程序,还可作为鉴别基因和遗传特点的手段。 在小于15秒的时间内对整个DNA数据库执行序列搜索。 附加软件工具 开放阅读框寻觅器(ORF Finder),电子PCR,序列提 交工具Sequin和BankIt。所有的NCBI数据库和软件工具可以 从HTTP或FTP来获得。

http://pubmed.cn/ (汉化)
英文检索
PubMed简介——是什么?
新版PubMed首页 特色: 简洁、清新 检索速度较快
PubMed简介——是什么?

PubMed数据范围

数据类型:期刊论文、综述以及与其他数 据资源链接。 特点:


免费提供题录和文摘 提供与原文的网址链接(部分免费获取) 提供检索词自动转换匹配 操作简便、快捷
PubMed简介——是什么?
MEDLINE:[pubmed-indexed for medline]
数据来源
Publisher-Supplied Citations:出 版商提供的电子文献 [PubMed-as supplied by Publisher]。 In Process Citations:每天收录, 尚未经规范处理的数据。 [pubmed-in process]
PubMed简介——是什么?

NCBI目前提供的生物信息资源主要分 为 生物数据库 生物信息工具
PubMed简介——是什么?

生物数据库 永久数据的大的组织体 结合计算机软件执行更新、查询与存取数据 的功能。 容易取得信息并且只取得回答特殊生物问题 的信息 Entrez: NCBI的数据库搜寻与存取系统,可 用来获取单一数据库或许多数据库的整合数 据。 目前,NCBI提供的公开(Open Access)数据 库包括如下:
PubMed简介——是什么?
PubMed简介——是什么?

NCBI目前提供的生物信息资源主要分 为 生物数据库 生物信息工具
PubMed简介——是什么?
Entrez 一个整合的访问序列,定位,分类和结构数据的搜索和检索 系统。 整合的数据库包括核酸序列,蛋白序列,大分子结构,全基 因组,和通过PubMed检索的MEDLINE。 可以检索相关的序列,结构和参考文献。
PubMed简介——是什么?

NCBI (National Center for Biotechnology Information,美国国立生物技术信息中心) 目前国际上几个重要分子生物信息网站之一 成立的原因:已故的参议院议员Claude Pepper发现 计算信息处理方法对生物医学研究的重要性 1988年11月4日成立 是National Institutes of Health(NIH 美国国立卫 生研究院)底下的National Library of Medicine( NLM 美国国立医学图书馆)的部门之一 NIH目前是全世界最大的生物医学研究单位。
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ PubMed简介——是什么?
Entrez可以检索的数据库:




Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM),人类遗传疾病相关文献数 据库 PopSet,族群演化分析相关研究资料 Protein sequence database,蛋白质序列数据库(包含Swiss-Prot、 PIR、PRF、PDB等数据库与从GenBank、RefSeq核酸序列转译之蛋白质 序列资料) PubChem BioAssay,化学成分之生物活性筛选资料 PubChem Compound,小分子化学物质结构 PubChem Substance,具生物活性之化学物质筛选数据 PubMed,科学文献报导数据库 PubMed Central,科学文献数字全文数据库 Site Search,可搜寻NCBI的网页与FTP SNP,单点核酸多样性数据库(dbSNP) Structure,分子模型数据(MMDB) Taxonomy,以核酸或蛋白质为基础的分类学信息 UniGene,人类unique基因序列数据库 UniSTS,unique序列卷标地址数据库
相关文档
最新文档