肿瘤基因突变检测
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肿瘤基因突变检测
癌症是一类难以预防的疾病,中晚期癌症治愈的可能性又很小,而早期癌症的治愈率可达65%以上,有些肿瘤可达90%以上,因此,战胜癌症的关键是早期发现癌症。由于癌症早期常无特殊症状,甚至毫无症状,故癌症的早期发现、早期诊断主要是通过定期健康体检和人群筛查完成。目前筛查癌症的方法主要是通过化验血肿瘤指标及B超、CT、MRI、PET-CT 等检查,但这些方法的敏感性和特异性均不高,发现有异常时往往已是中晚期。
17种常见高发肿瘤,包括乳腺癌(breast cancer)、结肠癌(colorectalcancer)、子宫癌(endometrial cancer)、脑胶质瘤(glioma)、白血病(leukemia)、肺癌(lungcancer)、淋巴癌(lymphoma)、成神经管细胞瘤(medulloblastoma)、黑色素癌(melanoma)、间皮瘤(mesothelioma) 、多性骨髓瘤(multiple myeloma) 、卵巢癌(ovarian cancer)、胰腺癌(pancreatic cancer) 、真性红细胞增多(polycythemia vera) 、前列腺癌(prostatecancer) 、肾细胞癌(renal cell cancer)和恶性内瘤(sarcoma),其发病机制涉及与多种肿瘤发生共同相关的肿瘤易感基因群介导的分子改变,参与了肿瘤发生的早期分子事件。系统寻找和探讨它们在肿瘤发生发展过程中的遗传学变异,对阐明肿瘤早期发生机制及寻找肿瘤早期预警、早期诊断和早期治疗的分子靶标都具有重要的现实意义。利用高通量分子测序技术平台,可同时开展多个肿瘤基因突变检测项目,如EGFR、K-RAS 、N-RAS、B-RAF、PI3K 、p53、p16、BRCA1、
BRCA2等。
K-RAS 基因(K-ras,p21)突变检测
KRAS基因(K-ras,p21)检测是目前医生了解大肠癌患者癌基因状况最直接、最有效的方法,通过检测不仅可以深入了解癌基因的情况,更重要的是筛选出针对抗表皮生长因子受体靶向药物治疗有效的大肠癌患者,帮助医生选择对肿瘤病人最有效的治疗方法。
RAS基因家族与人类肿瘤相关的基因有三种——HRAS、KRAS和NRAS,分别定位在11、12和1号染色体上。在RAS基因中,KRAS对人类癌症影响最大,正常时,它能控制调控细胞生长的路径;发生异常时,则导致细胞持续生长,并阻止细胞自我毁灭,不能产生正常RAS蛋白,使细胞内信号传导紊乱,细胞增殖失控而癌变。
原癌基因(K-ras)突变发生于多种癌症,例如结肠癌、肺癌、甲状腺癌、胰腺癌、胆
K-RAS 的异常激活有关,参与EGFR信号传导通路。结直肠癌患者中K-RAS 基因的突变率约为35-40%, 而且90%的突变发生在12、13位密码子,可导致p21-ras蛋白的生长信号的异常变化。该基因是TKI治疗的靶分子,携带有K-RAS基因突变的患者对TKI治疗不敏感。过度的生长信号可刺激细胞生长和增殖从而导致了癌症的发生。
K-ras基因检测(K-ras,p21)临床意义: 检测K-ras基因突变是深入了解癌基因的情况,了解各种癌症的发展预后,放化疗疗效的重要指标。⑴ K-ras基因突变发生在肿瘤恶变的早
期,并且原发灶和转移灶的K-ras基因高度保持一致,一般认为,K-ras基因状态不会因治疗而发生变化。⑵ K-ras基因突变见于20%的非小细胞肺癌(NSCLC),其中肺腺癌占30%~50%。大肠癌患者K-ras突变率为30%~35%。
【检测位点】
ID 突变外显子碱基变化 Cosmic
Gly12Asp 12 GGT>GAT 521
Gly12Val 12 GGT>GTT 520
Gly12Ser 12 GGT>AGT 517
Gly12Cys 12 GGT>TGT 516
Gly12Ala 12 GGT>GCT 522
Gly12Arg 12 GGT>CGT 518
Gly13Asp 13 GGC>GAC 532
BRAF V600E基因突变检测
BRAF是一种癌基因,它编码一种丝/苏氨酸特异性激酶,是RAS/RAF/MEK/ ERK/MAPK通路重要的转导因子,参与调控细胞内多种生物学事件,如细胞生长、分化和凋亡等。研究表明,在多种人类恶性肿瘤中,如恶性黑色素瘤、结直肠癌、肺癌、甲状腺癌、肝癌及胰腺癌等均存在不同比例的BRAF基因突变,约66%恶性黑色素瘤和15%的结肠癌中BRAF基因存在体细胞错义突变。大约80-90%的BRAF基因突变发生在exon15的1799核苷酸上,T突变为A,导致其编码的谷氨酸由缬氨酸取代(V600E)。目前认为,V600E突变可模拟T599和S602两个位点的磷酸化过程,从而使BRAF蛋白异常激活。BRAF突变状态与多种肿瘤的发生、发展及临床结局有关。随着BRAF 突变研究的深入,可望为阐明肿瘤发生的分子机制,寻找新的治疗途径与靶点提供思路。
BRAF基因突变作为乳头状甲状腺癌(PTC)发生的驱动性突变,已经成为PTC 细针穿刺细胞学标本诊断和病情预后的一个重要指标。BRAF 基因突变率在PTC 中高达44%,具有很好的诊断意义。BRAF 基因突变阳性的甲状腺癌病人较突变阴性病人预后不良。在黑色素瘤的治疗方面,针对BRAF基因突变所研发的新型靶向药物威罗菲尼(Vemurafenib)对BRAF基因V600E 突变的患者疗效显著。在结直肠癌中,BRAF基因突变的患者对EGFR 靶向药物可能存在原发耐药,因此,美国国家癌症综合治疗联盟(NCCN)《结直肠癌临床实践指南》(2013)建议,在使用爱必妥(Cetuximab)或帕尼单抗(Panitumumab)等靶向药物时,对KRAS 基因野生型患者进一步检测BRAF 基因状态。
威罗菲尼(Zelboraf, vemuragenib, PLX 4032)获准用于治疗不可手术且经FDA批准的BRAF V600E突变检测呈阳性的转移性黑色素瘤患者。在批准该药的同时,FDA还同时批准了用于黑色素瘤患者相应突变检测的BRAF V600E突变检测。临床研究发现,EGFR信号通路中的BRAF基因V600E突变的病人对EGFR单抗原发耐药。因此,推荐肿瘤患者接受EGFR靶向药物治疗前,进行BRAF基因V600E突变的检测。而且,2011年版《NCCN结直肠癌临床实践指南》中明确指出结直肠癌患者应进行BRAF基因V600E突变的检测,如果患者存在V600E突变时,一线治疗进展后使用抗EGFR单抗治疗是无效的。BRAF基因突变检测能提高临床治疗的针对性,指导靶向药物的合理使用,避免无效或治疗不当造成的病人病情延误,降低治疗风险。
有研究证明,在野生型KRAS肿瘤当中,发生BRAF V600E突变的个体,对Panitumumab/帕尼单抗和Cetuximab/西妥昔单抗完全不反应,而没发生BRAF突变的野生型个体,32%有反应,68%没反应。这提示今后重点检测BRAF的突变可为今后结肠癌临床用药给予指导,BRAF基因突