R软件作图命令汇总情况

setwd( )：设定R软件当前工作目录。

getwd( )：查看R软件当前工作目录。

list.files( ): 查看当前目录下文件。

file.show( ): 显示文件。

file.access( ): 查看文件是否可读可写。

file.create( ): 创建一个文件。例如：file.create(“D:/lesong.xls”). dir.create( ): 创建一个目录。例如：dir.create(D:/lesong).

file.remove( ):删除一个文件。

File.choose( ):选择一个文件。

读数据函数read.table( )主要参数解释：

read.table(file, header = FALSE, sep = "", quote = ""'",

dec = ".", s, s,

as.is = !stringsAsFactors,

na.strings = "NA", colClasses = NA, nrows = -1,

skip = 0, s = TRUE, fill

= !blank.lines.skip,

strip.white = FALSE, blank.lines.skip = TRUE,

comment.char = "#",

allowEscapes = FALSE, flush = FALSE,

stringsAsFactors = default.stringsAsFactors(),

fileEncoding = "", encoding = "unknown") header:逻辑参数。指定是否文件第一行为变量名。

na.strings:指定缺失文字。

skip:指定读数据跳过的行数。

nrows:指定数据读入最大的行数。

dec：指定小数点记号。

sep：指定数据分割字符。

s与s:赋予数据行名和列名。

读入数据其他相关函数：

readLines():按行读入数据文件。类似perl读数据方式。

scan( ):将数据读作一行向量形式。

read.delim("educ_scores.txt"):读入文本文件(制表符分隔)。

read.csv("educ_scores1.csv")：读入CSV(逗号分割)。

readBin( ):读入二进制数据。

readChar( ):读入字符型数据。

attach( ): 把数据框的变量链接到内存中.

一般作图函数plot（）主要参数解释：

plot(x, y = NULL, type = "p", xlim = NULL, ylim = NULL,

log = "", main = NULL, sub = NULL, xlab = NULL, ylab = NULL,

ann = par("ann"), axes = TRUE, frame.plot = axes,

panel.first = NULL, st = NULL, asp = NA, ...)

type:设置图形类型。具体为：

type=“p“点图

type=“l“线图

type=“b“点和线

type=“c“去掉点只有线段

type=“o“线穿过点

type=“h“从各点到x轴的垂线段

type=“s“基于左侧值的阶段图

type=“S“基于右侧值的阶段图

type=“n“只有轴，没有具体图形

xlim和ylim:设置图形x轴与y轴的范围。比如xlim(0,30).

log：数据取对数。

main:设置图形的上标题。比如说：main=”Genomics analysis”

sub: 设置图形的小标题。比如说：sub=”another title”.

ann: 逻辑参数。设置是否将系统默认的图形标签显示出来。比如：ann=F. lty: 设置线的类型。比如：lty=4.

xlab和ylab：设置x轴与y轴的lable。比如xlab=”sample one”. frame.plot:逻辑参数。设置图形是否输出外框。比如：frame.plot=F. axes:逻辑参数。设置图形是否显示x轴和y轴。比如：axes=F.

asp:设置图形屏幕高宽比（y/x）.

lwd:设置线条的粗细。比如：lwd=4.

bg:设置数据点的填充颜色。比如：bg=”pink”.

col:设置数据点的外圈颜色。比如：col=”blue”.

cex:设置数据点的大小。比如：cex=2.7。

pch:设置数据点的形状。具体为：

∙pch=19: solid circle,

∙pch=20: bullet (smaller solid circle, 2/3 the size of 19), ∙pch=21: filled circle,

∙pch=22: filled square,

∙pch=23: filled diamond,

∙pch=24: filled triangle point-up,

∙pch=25: filled triangle point down.

add：逻辑参数。设置图形是否重合。

font.main与font.sub：设置上标题和小标题的字体格式。

col.main与col.sub :设置上标题和小标题的字体颜色。

实例演习：

使用给定数据（testfile.txt）用R软件作出以下图形并保存为PDF格式和jpg格式。

参考程序：

setwd('E:/')

file=read.table('testfile.txt')

attach(file)

jpeg(file='plot one.jpg')

plot(V1,V2,type='l',xlim=c(30,75),frame.plot=F,lwd=2,

xlab='横坐标 ',ylab='纵坐标' ,main='PLOT

ONE',sub='2010/3/12',