原核生物的基因调控
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原核生物的基因调控
每个物种都有一套完整的遗传信息。遗传信息存在于DNA分子中,每个细胞都有相同的DNA,也确实是讲,每个细胞中都带有完整的遗传信息。在正常情形下,一个个体的各类细胞差不多上按照一定的规律和一定的时空顺序,关闭一些基因,开启另一些基因,并持续地进行严格的调控,以保证个体的发育得以顺利进行。
基因表达(gene expression)确实是指某一基因指导下的蛋白质合成,蛋白质是基因表达的产物,在生活中并非所有基因都一齐表达,而是有些基因进行表达,形成其基因表达的特异产物,以构成细胞结构或代谢所需要的蛋白质或酶类。然而,有许多基因却被关闭,不进行表达,而要在适当的时候才进行表达。基因作用的调控机理相当复杂,至今仍知之不多。但那个领域是当前遗传学研究的热点,随着功能基因组学的飞速进展,研究的进展相当地快。因此,研究成果多集中在原核生物,对高等生物基因表达的调控机制还了解不多。
尽管一种基因编码一种蛋白质,然而不同蛋白质在细胞中的相对数量差不专门大,随着它们的功能而不同,例如,在E.coli细胞中,从总蛋白的不足0.01%--2%,各种蛋白质变化不定。细胞要使其蛋白质合成达到这种差异,能够有两条途径:
第一条途径是细胞操纵从其DNA模板上转录其特异的mRNA的速度,这是一种最经济的方法,能够免去白费从mRNA合成蛋白质的各种元件和材料。这大致是生物在长期进化过程中自然选择的结果。这种操纵通常称之为转录水平(transcriptional level)的调控。大多数基因表达都属于转录水平的调控。
第二条途径是在mRNA合成后,操纵从mRNA翻译成多肽链的速度,包含一些分子装置咨询题,如与核糖体的结合速度等。这种蛋白质合成或基因表达的操纵称为翻译水平(translational level)的调控。这种调控是较少的。
一、转录水平的调控
单细胞的原核生物对环境条件具有高度的适应性,能够迅速调剂各种基因的表达水平,以适应持续变化的环境条件。原核生物要紧是在转录水平上调控基因的表达。当需要这种产物时,就大量合成这种mRNA,当不需要这种产物时就抑制这种mRNA的转录,确实是让相应的基因不表达。
通常所讲的基因不表达,并不是讲那个基因就完全不转录为mRN A,而是转录的水平专门低,坚持在一个基础水平(本底水平)。
1.正调控(positive regulation)和负调控(negative regulation):诱导物与蛋白质结合形成激活子复合物,激活子复合物与基因启动子DNA 序列结合,激活基因启动转录,称为正调控。阻遏蛋白分子与基因启动子D NA序列结合,阻碍RNA聚合酶的工作,使基因处于关闭状态,称为负调控。
调剂蛋白(regulatory protein)是一些专门蛋白质,它们决定着何时诱导酶或阻遏酶能够合成。每种调剂蛋白阻碍一种或多种专门基因的表达。它们有两种差不多类型:即正调剂蛋白(positive regulator)及负调剂蛋白(neg ative regulator)。这两种调剂能够由调剂它们的基因之相反效应加以区不。
负调剂蛋白或称阻遏蛋白,会使其靶蛋白的合成受到抑制,即不表达,而不管是否需要。阻遏物并非永久能阻止mRNA的合成。否则,它们就将永久抑制其特异蛋白质的合成。许多阻遏物分子能以活性的及无活性的两种形式存在,这要看它们是否与其适当的诱导物或辅阻遏物(corepressor)结合而定,诱导物的结合可使阻遏物失活。例如,当与β-半乳糖苷如乳糖或异乳糖(allolactose,乳糖的代谢物,为天然诱导物)结合时,lac阻遏物即不能与其专一的操纵基因结合。因此,加β半乳糖苷于生长细胞中,以降低lac阻遏蛋白的分子浓度,可使β半乳糖苷酶得以合成。反之,辅阻遏物的结合则将无活性的阻遏物变为有活性的形式。这类突变种称为组成突变种(constitutive mutant)。与此相反,正调剂蛋白是激活蛋白(activator),它的存在对合成所调剂的酶是需要的,因此,激活蛋白存在时被操纵的基因即表达。
2.顺式调控元件和反式调控因子:基因表达的调控差不多上特定的蛋白质分子和特定的DNA序列两个因素相互作用的结果,起调控作用
的DNA序列称为顺式调控元件,如乳糖操纵元中的启动子(p)和操纵子(O),起调控作用的蛋白质分子称为反式调控因子,如乳糖操纵子中调剂基因编码的阻遏蛋白、cAmp-CAP复合物。
在原核生物中,通常是几个作用有关的基因在染色体上串连排列在一起,由同一个调控系统来操纵,如此的一个整体称为一个操纵子。当几种酶参与同一个代谢途径时,往往这几个基因同时被转录为一个多顺反子mRNA。而真核生物基因差不多上转录成单顺反子的,因此真核生物中没有这种调控机制。在原核生物中,关于E.coli乳糖代谢的调控研究得最为清晰,下面以E.coli的乳糖操纵子为例来介绍一样操纵子的调控机制。
3.乳糖操纵子的负调控
在正常情形下,E.coli是以葡萄糖作为碳源的,在没有葡萄糖,只有乳糖存在的条件下,E.coli也能以乳糖为碳源而生存。葡萄糖是单糖,E. coli利用它最为方便和经济。乳糖是双糖,是葡萄糖和半乳糖的复合物。以乳糖为碳源必须先将乳糖分解为葡萄糖和半乳糖,再将半乳糖转化为葡萄糖,这就需要额外的酶。β—半乳糖苷酶,将乳糖分解成半乳糖和葡萄糖;半乳糖渗透酶,关心细菌从培养基中摄取乳糖;半乳糖苷转乙酰酶,作用不明。
在有葡萄糖存在时,细菌体内的这三种酶含量专门低。每个细胞中只有3~5个分子的β—半乳糖昔酶。当培养基中没有葡萄糖而有乳糖存在时,这三种酶的量急剧增加,2~3分钟内即可增加1000倍以上,而且三种酶成比例增加。一旦乳糖用完,在2~3分钟内这三种酶的量又专门快下降到本底水平。
乳糖操纵子模型如下:
注:a、y、z分不为三个结构基因,O 为操纵基因,p为转录的启动子,I[i]为调控基因
i编码一种蛋白质,称为阻遏物。无乳糖存在时,阻遏物与O结合,关闭三个结构基因,使之不能被转录。当有乳糖存在时,乳糖的一种代谢产物——不乳糖,与阻遏物结合,改变阻遏物的构象,使阻遏物从O上解离下来,从而打开三个结构基因(使之得以转录成mRNA)。乳糖用完后,不乳糖的浓度急剧下降,阻遏物不再与不乳糖结合,又与O结合,阻止R NA聚合酶的工作,赶忙关闭结构基因。原核生物中,大多数的基因都被组织在操纵元中,受到类似的调控。
乳糖操纵子模型有三个差不多假定:调剂基因编码的阻遏蛋白是能够在细胞中扩散的反式调控因子,操纵子(O)是调控序列,不编码蛋白质,操纵子(O)是顺式调控元件,邻近受其操纵的结构基因。
4.乳糖操纵子的正调控
在细菌细胞内,ATP在腺苷酸环化酶的作用下转变成环式AMP(c yclic adnosine monophosphate, cAmp)。环式AMP并不直截了当促进lac mRNA的合成,而靠结合在代谢降解物基因激活蛋白(catabolite-gene activato r protein,简称CAP)上起作用。细胞内代谢激活蛋白CAP是一个分子量为4 5kD的二聚体,CAP是cAmp的受体蛋白(cyclic Amp receptor protein, CR