基因多态性与疾病发生遗传易感性深圳优秀课件
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SNP所表现的多态性可以只涉及到单个碱基的变异，这种变 异可由单个碱基的转换(transition，嘌呤>嘌呤或嘧啶>嘧啶) 或颠换(transversion，嘌呤<—>嘧啶)所引起，也可由碱基的 插入或缺失所致。但通常所说的SNP并不包括后两种情况。
单Leabharlann Baidu苷酸多态性
理论上，SNPs可以分二、三和四等位基因，但人类一 般为二等位基因（biallelic）。二等位基因有4种不同类 型，包括1种转换C>T (G>A)和3种颠换C>A (G>T)、 C>G (G>C)、T>A (A>T)。四种SNPs类型在人类中的发 生频率不同，最常见的为C>T (G>A)转换，约占2/3，其 它3种类型发生的频率相同。之所以转换几率高，可能 是因为CpG二核苷酸上的胞嘧啶残基是人类基因组中最 易发生突变的位点，其中大多数是甲基化的，可自发地 脱去氨基而形成胸腺嘧啶。
单核苷酸多态性
人类基因组中大约估计每个基因有2个常见的错义突变 在公共数据库中至少有500万个SNPs。 仅有少量（可能为50,000–250,000）SNPs在一定程度上（小到中等
度）能反映与疾病发生危险相关的表型。 根据SNP在基因中的位置，可分为基因编码区SNPs（Coding-region
SNPs，cSNPs）、基因周边SNPs（Perigenic SNPs，pSNPs）以及 基因间SNPs（Intergenic SNPs，iSNPs）等三类。 SNPs在基因组中的分布十分广泛，但不同的区域出现的频率不同。 人类单碱基等位基因十分稳定。 人类SNPs大部分(85%)是共有的。
单核苷酸多态性
单核苷酸多态性
Example of an SNP comprising a G>A substitution Electropherograms produced by fluorescence-based sequencing using an ABI 3700 showing the genomic DNA from an individual homozygous for G at the site of the SNP (a) and an individual homozygous for A (b). The base substitution is denoted by an arrow.
3. 基因多态性与基因转录调控 Gene Polymorphism and Regulation of Gene Transcription
4. 展望 Future Prospects
DNA Structure
基因突变
基因突变（mutation)：由于DNA碱基对的置换、插入或 缺失而引起的基因结构的变化，亦称点突变。
基因多态性与疾病发生遗传易感 性深圳
基因多态性 与疾病发生遗传易感性
Gene Polymorphism and Genetic Susceptibility to Disease
提纲
1. 单核苷酸多态性 Single Nucleotide Polymorphism
2. 基因多态性与疾病发生遗传易感性 Gene Polymorphism and Genetic Susceptibility to Disease
SNPs分布区域：
63% Intronic（内含子） 24% Locus region（基因座区） 11% Untranslated region（非翻译区） 1% Nonsynonymous（nsSNPs，错义SNPs） 1% Synonymous（同义SNPs） <1% Splice site（剪接位点） <1% Unknown coding variant（不明编码变异）
基因突变
根据遗传信息的改变方式，基因突变又可以分为同义突变、错义 突变和无义突变三种类型：
同义突变：DNA的一个碱基对的改变并不会影响它所编码的蛋白 质的氨基酸序列，这是因为改变后的密码子和改变前的密码子是简 并密码子，它们编码同一种氨基酸，这种基因突变称为同义突变。
错义突变：由于一对或几对碱基对的改变而使决定某一氨基酸的密 码子变为决定另一种氨基酸的密码子的基因突变叫错义突变。这种 基因突变有可能使它所编码的蛋白质部分或完全失活。
无义突变：由于一对或几对碱基对的改变而使决定某一氨基酸的密 码子变成一个终止密码子的基因突变叫无义突变。
单核苷酸多态性
单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNPs）： 是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列 多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种，占所有已 知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在，平均 每500-1000个碱基对中就有1个，人类30亿碱基中大约有1000 万个SNPs。
单核苷酸多态性
人类基因组SNPs研究所揭示的人种、人群和个体之间DNA 序列的差异以及这些差异所表现的意义将对疾病的诊断、 治疗和预防带来革命性的变化。
SNPs应用 多基因病和复杂性疾病如人类肿瘤、糖尿病、自身免疫性疾病、 老 年 性 痴 呆 等 的 遗 传 连 锁 分 析 (linkage analysis) 及 关 联 分 析 (association analysis)，用于疾病易感基因定位和克隆。 “药物基因组学”(pharmacogenomics)研究中用于揭示人群中不 同个体对不同药物的敏感性差异的根本原因。 法医研究的罪犯身份的鉴别、亲子鉴定等。 在器官移植中供体和受体间的配对选择。 研究人类起源、进化和群体遗传学特征。
根据基因结构的改变方式，基因突变可分为碱基置换突 变和移码突变两种类型：
碱基置换突变：由一个错误的碱基对替代一个正确的碱基对的 突变叫碱基置换突变。碱基替换过程只改变被替换碱基的那个 密码子，也就是说每一次碱基替换只改变一个密码子，不会涉 及到其他的密码子。
移码突变：基因中插入或者缺失一个或几个碱基对，使DNA的 阅读框架（读码框）发生改变，导致插入或缺失部位之后的所 有密码子都跟着发生变化，结果产生一种异常的多肽链。
单Leabharlann Baidu苷酸多态性
理论上，SNPs可以分二、三和四等位基因，但人类一 般为二等位基因（biallelic）。二等位基因有4种不同类 型，包括1种转换C>T (G>A)和3种颠换C>A (G>T)、 C>G (G>C)、T>A (A>T)。四种SNPs类型在人类中的发 生频率不同，最常见的为C>T (G>A)转换，约占2/3，其 它3种类型发生的频率相同。之所以转换几率高，可能 是因为CpG二核苷酸上的胞嘧啶残基是人类基因组中最 易发生突变的位点，其中大多数是甲基化的，可自发地 脱去氨基而形成胸腺嘧啶。
单核苷酸多态性
人类基因组中大约估计每个基因有2个常见的错义突变 在公共数据库中至少有500万个SNPs。 仅有少量（可能为50,000–250,000）SNPs在一定程度上（小到中等
度）能反映与疾病发生危险相关的表型。 根据SNP在基因中的位置，可分为基因编码区SNPs（Coding-region
SNPs，cSNPs）、基因周边SNPs（Perigenic SNPs，pSNPs）以及 基因间SNPs（Intergenic SNPs，iSNPs）等三类。 SNPs在基因组中的分布十分广泛，但不同的区域出现的频率不同。 人类单碱基等位基因十分稳定。 人类SNPs大部分(85%)是共有的。
单核苷酸多态性
单核苷酸多态性
Example of an SNP comprising a G>A substitution Electropherograms produced by fluorescence-based sequencing using an ABI 3700 showing the genomic DNA from an individual homozygous for G at the site of the SNP (a) and an individual homozygous for A (b). The base substitution is denoted by an arrow.
3. 基因多态性与基因转录调控 Gene Polymorphism and Regulation of Gene Transcription
4. 展望 Future Prospects
DNA Structure
基因突变
基因突变（mutation)：由于DNA碱基对的置换、插入或 缺失而引起的基因结构的变化，亦称点突变。
基因多态性与疾病发生遗传易感 性深圳
基因多态性 与疾病发生遗传易感性
Gene Polymorphism and Genetic Susceptibility to Disease
提纲
1. 单核苷酸多态性 Single Nucleotide Polymorphism
2. 基因多态性与疾病发生遗传易感性 Gene Polymorphism and Genetic Susceptibility to Disease
SNPs分布区域：
63% Intronic（内含子） 24% Locus region（基因座区） 11% Untranslated region（非翻译区） 1% Nonsynonymous（nsSNPs，错义SNPs） 1% Synonymous（同义SNPs） <1% Splice site（剪接位点） <1% Unknown coding variant（不明编码变异）
基因突变
根据遗传信息的改变方式，基因突变又可以分为同义突变、错义 突变和无义突变三种类型：
同义突变：DNA的一个碱基对的改变并不会影响它所编码的蛋白 质的氨基酸序列，这是因为改变后的密码子和改变前的密码子是简 并密码子，它们编码同一种氨基酸，这种基因突变称为同义突变。
错义突变：由于一对或几对碱基对的改变而使决定某一氨基酸的密 码子变为决定另一种氨基酸的密码子的基因突变叫错义突变。这种 基因突变有可能使它所编码的蛋白质部分或完全失活。
无义突变：由于一对或几对碱基对的改变而使决定某一氨基酸的密 码子变成一个终止密码子的基因突变叫无义突变。
单核苷酸多态性
单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNPs）： 是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列 多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种，占所有已 知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在，平均 每500-1000个碱基对中就有1个，人类30亿碱基中大约有1000 万个SNPs。
单核苷酸多态性
人类基因组SNPs研究所揭示的人种、人群和个体之间DNA 序列的差异以及这些差异所表现的意义将对疾病的诊断、 治疗和预防带来革命性的变化。
SNPs应用 多基因病和复杂性疾病如人类肿瘤、糖尿病、自身免疫性疾病、 老 年 性 痴 呆 等 的 遗 传 连 锁 分 析 (linkage analysis) 及 关 联 分 析 (association analysis)，用于疾病易感基因定位和克隆。 “药物基因组学”(pharmacogenomics)研究中用于揭示人群中不 同个体对不同药物的敏感性差异的根本原因。 法医研究的罪犯身份的鉴别、亲子鉴定等。 在器官移植中供体和受体间的配对选择。 研究人类起源、进化和群体遗传学特征。
根据基因结构的改变方式，基因突变可分为碱基置换突 变和移码突变两种类型：
碱基置换突变：由一个错误的碱基对替代一个正确的碱基对的 突变叫碱基置换突变。碱基替换过程只改变被替换碱基的那个 密码子，也就是说每一次碱基替换只改变一个密码子，不会涉 及到其他的密码子。
移码突变：基因中插入或者缺失一个或几个碱基对，使DNA的 阅读框架（读码框）发生改变，导致插入或缺失部位之后的所 有密码子都跟着发生变化，结果产生一种异常的多肽链。