生物化学
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第一章.生物化学绪论
1.生命的生物化学定义:生命系统包含储藏遗传信息的核酸和调节代谢的酶蛋白。但
是已知某种病毒生物却无核酸(朊病毒)。
2.生命(生物体)的基本特征:
(1)细胞是生物的基本组成单位(病毒除外)。
( 2 ) 新陈代谢、生长和运动是生命的基本功能。
( 3 )生命通过繁殖而延续,DNA是生物遗传的基本物质。
(4)生物具有个体发育和系统进化的历史。
( 5 )生物对外界可产生应激反应和自我调节,对环境有适应性。
3.化学是在原子、分子水平上,研究物质的组成,结构、性质和变化规律的一门基础
自然科学。生物化学就是生命的化学。
4.生物化学:运用化学的原理和方法,研究生物体的物质组成和生命过程中的化学变化,进而深入揭示生命活动的化学本质的一门科学。
5.生命体的元素组成:在地球上存在的92种天然元素中,只有28种元素在生物体内
被发现。
第一类元素:包括C、H、O和N四种元素,是组成生命体最基本的元素。这四种元素约占了生物体总质量的99%以上。
第二类元素:包括S、P、Cl、Ca、K、Na和Mg。这类元素也是组成生命体的基本元素。
第三类元素:包括Fe、Cu、Co、Mn和Zn。是生物体内存在的主要少量元素。
第四类元素:包括Al、As、B、Br、Cr、F、Ga、I、Mo、Se、Si等。偶然存在的元素。
6.生命分子是碳的化合物:生命有机体的化学是围绕着碳骨架组织起来的。生物分子
中共价连接的碳原子可以形成线状的、分支的或环状的结构。
7.生物(生命)分子是生物体和生命现象的结构基础和功能基础,是生物化学研究的
基本对象。
生物分子的主要类型包括:多糖、聚脂、核酸和蛋白质等生物大分子。
维生素、辅酶、激素、核苷酸和氨基酸等小分子。
8 .生物大分子的结构与功能:研究生物分子的结构和功能之间的关系,代表了现代生
物化学与分子生物学发展的方向。
9.生物化学的内容:
静态生物化学:研究生物有机体的化学组成、结构、性质和功能。
动态生物化学:研究生命现象的物质代谢、能量代谢与代谢调节。
研究生物体的信息代谢。
运用生物化学原理和方法,为农业、工业、医药卫生、环境保护等服务,开拓富有经
济价值的生物资源(酶制剂、药品、食品添加剂、杀虫剂……)。
10.生物化学学科热点:基因组学、蛋白质组学、克隆(组织、器官和个体)。
第二章.水
1.水的生物功能-----生命之母。
2.生物体中水的作用
介质:支持分子间相互作用;溶剂:生物体和细胞中营养、代谢物、荷尔蒙的分配;
体温调节器;润滑剂;结构支撑剂:保持细胞形状;外力缓冲:如保护大脑。
3.人体中水的存在形式及生理功能
自由水(95%以上):细胞中游离态的水,可以自由流动。
结合水(约4.5%):细胞中与其他化合物结合的水,是细胞的组成成分。
4.水分子的极性:共用电子对明显靠近氧原子一侧,导致氧原子附近形成负电荷中心,氢原子附近形成正电荷中心,这种现象称为水分子的极性。
5.水溶液的浓度:广义的浓度定义是:水溶液中的溶质相对于溶液或溶剂的相对量。
近年来多采用的是:一定体积的溶液中溶质的“物质的量”。
6. 溶解度:一定温度和压力下溶质在一定量溶剂中形成饱和溶液时,被溶解的溶质的量。按相平衡的角度,把溶液分为:不饱和溶液、饱和溶液、过饱和溶液。
7.气体溶解定律(享利定律):在一定温度下,一定体积的液体中所溶解的气体质量
与该气体的分压成正比。数学表达式:p=K x (K——享利常数) 。
8.相似相溶原理:(1) 溶质分子与溶剂分子的结构越相似,相互溶解越容易; (2) 溶质分子的分子间作用力与溶剂分子间作用力越相似,越易互溶。
9.酸碱理论:能在水溶液中电离出氢离子(H+)的含氢化合物称为酸,如:HCl、HNO3、H2SO4、H3PO4。能在水溶液中电离出氢氧根离子(OH )的氢氧化物称为碱,如:NaOH、KOH、Mg(OH)2。 100%电离:强酸强碱;部分电离:弱酸弱碱。
10.溶液渗透压:所谓溶液渗透压,简单的说,是指溶液中溶质微粒对水的吸引力。溶液渗透压的大小取决于单位体积溶液中溶质微粒的数目:溶质微粒越多,即溶液浓度越高,对水的吸引力越大,溶液渗透压越高。
第三章.核酸化学基础
1.核素实质是一种核糖核蛋白复合体。
2.核酸以核苷酸为基本结构单位,按照一定的排列顺序,以3‘,5’-磷酸二酯键相连接,并通过折叠、卷曲形成具有特定生物学功能的线形或环形多聚核苷酸。核酸是生命遗传信息的携带者和传递者。
3.核酸的种类和分布
种类(RNA、DNA):核糖核酸(ribonucleic acid-RNA)、脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid- DNA)。
分布:
4.DNA是主要的遗传物质。
RNA的功能:参与(控制)蛋白质的合成rRNA(75-80%)、tRNA(10-15%)、 mRNA(2-5%);遗传物质;具有生物催化剂功能;调节功能:如 miRNA,siRNA等。
5.核酸的元素组成
基本元素:C H O N P。核酸的元素组成有两个特点:一是一般不含S;二是 P含量较多,并且恒定(9%-10%)。
6. 核酸的分子组成
核酸(DNA和RNA)是一种线性(或环状)多聚核苷酸,它的基本结构单元是核苷酸。
核苷酸本身由核苷和磷酸组成。
而核苷则由戊糖和碱基形成。
7.核酸的分子结构
DNA的分子结构:DNA的一级结构指DNA分子中多个脱氧核苷酸的排列顺序。即数目庞大的四种碱基的排列顺序。DNA的二级结构指DNA的双螺旋结构。
RNA的分子结构:RNA的一级结构即核苷酸顺序。RNA的高级结构指单链RNA分子中,部分区域也能形成双螺旋结构(类似A-DNA双螺旋结构),不能形成双螺旋的部分,则形成突环。在RNA的双螺旋结构中,碱基的配对情况不象DNA中严格。G 除了可
以和C 配对外,也可以和U 配对。G-U 配对形成的氢键较弱。
第四章.DNA的复制
1. 半保留复制机制
2. 复制起点和方向
无论原核生物还是真核生物,DNA的复制是从固定起始点以双向等速的方式进行复制。
3. Okazaki(冈崎)片段
冈崎片段,相对比较短的DNA链(大约1000核苷酸残基),是在DNA的滞后链的不连续合成期间生成的片段。
4. DNA复制的几种模式
双向复制(Bidirectional) 形 (大肠杆菌等细菌DNA) 线性染色体(真核细胞)
单向复制(Unidirectional)D型(病毒DNA)滚环式(噬菌体DNA)。
5.DNA复制相关酶
DNA聚合酶、A复制中形成的链状分子(catenanes) 需要拓扑酶来帮助解离。