单晶衍射仪

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高压电流 计算机 衍射仪结构示意图 高压发生器
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光源系统
主要包括高压发生器和 光管 主要包括高压发生器和X-光管,前者 高压发生器和 光管, 高压电流, 负责提供高压电流 负责提供高压电流,如果使用封闭式 X-光管,一般电压为 光管, 光管 一般电压为40-50kV,电流为 电流为 20-40mA。由于 光管在工作过程中 。由于X-光管在工作过程中 需要冷却,因此X-光管需要外接水循 需要冷却,因此 光管需要外接水循 环冷却系统, 降低阳极靶的温度。 环冷却系统,以降低阳极靶的温度。
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因此,假如晶体稳定,一般建议收集半球以上的 衍射数据。在一般设置下,面探测器可以记录到 θmax ≈ 30˚的衍射数据(MoKα 光源) ,只须 在还原数据时输入分辨率(或衍射角)的最低值, 即可以得到相应的衍射数据。由于记录衍射图片 的原始数据需要占据大量的空间(每幅衍射数据 大小为 1 Mb) ,在还原数据后,一般将删除原 始的衍射照片,因此,建议在还原数据时,尽量 还原所有的数据(θ ≥ 30˚),解结构时,再根据 具体衍射数据的质量确定最高的衍射角数值。
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【5】曝光时间 】
并非曝光时间(exposure time)越长、获得的衍射数 据质量越好(不考虑相应增加的机时) 。 原因是 (1) 曝光时间增加,衍射点强度的标准不确定度也 会增加; (2)对于衍射能力很强的晶体,过长的曝光时间可 能会引起衍射点强度超过探测器的动态范围,从而引 起系统误差; (3)对于对 X 射线吸收较强的晶体,过长的曝光时 间会影响吸收校正的效果;过长的曝光时间还会引起 晶体的放射性衰变。
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Thank you! !
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测角器系统
与载晶台和探测器直接相连, 与载晶台和探测器直接相连,用于控 直接相连 制晶体和探测器的空间取向。 制晶体和探测器的空间取向。如果使 用点探测器系统, 用点探测器系统,则测角器系统为传 统四圆设置;如果使用面探测器系统, 统四圆设置;如果使用面探测器系统, 则测角器系统可以为三圆设置,其中χ 则测角器系统可以为三圆设置,其中χ 圆被固定。 圆被固定。
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控制仪器的计算机功能包括控 控制仪器的计算机功能包括控 制测角器系统和探测器的机械 制测角器系统和探测器的机械 运动、快门的开关、 运动、快门的开关、收集和记 录测角器系统的各种数据、探 录测角器系统的各种数据、 测器的强度数据以及数据的处 理等。 理等。
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二、面探测器衍射仪的原理 装有面探测器的衍射仪原本用于蛋白 质大分子晶体的测量。它记录的方法 类似于照相法 照相法,每次测量一幅含有很 照相法 多衍射点的图像,利用电子技术,直 接将图像转化为数字数据 将图像转化为数字数据。因此,它 将图像转化为数字数据 , 可以看成将照相法的电子数字化。 可以看成将照相法的电子数字化。
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面探测器衍射仪的原理
A.电荷耦合器件探测器(charge A.电荷耦合器件探测器(charge coupled 电荷耦合器件探测器 detector,简称CCD).常用于 简称CCD).常用于小分子 device detector,简称CCD).常用于小分子 晶体衍射, 晶体衍射,衍射仪的探测器含有薄膜磷光 材料,被衍射X射线激活后,磷光材料发射可 被衍射X射线激活后, 见荧光.磷光材料通过光学纤维直接与CCD 见荧光.磷光材料通过光学纤维直接与CCD 芯片藕连,从而这些荧光可以经过电子器件, 芯片藕连,从而这些荧光可以经过电子器件, 快速(通常不到1S) 1S)转化为衍射强度相应的 快速(通常不到1S)转化为衍射强度相应的 数字信号,供计算机直接处理. 数字信号,供计算机直接处理.
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面探测器衍射仪
汇报人: 汇报人:梁春燕 汇报时间:2011.11.02 汇报时间:
一、面探测器衍射仪
主要包括 光源系统 测角器系统(goniometer) 测角器系统 探测器系统 计算机 四大部分.
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低温系统 水冷却器
液氮
探测器
晶体
冷却水
测角器
准直器、单色器
快门
X光管 光
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面探测器收集数据必须考虑的可变参数: 面探测器收集数据必须考虑的可变参数
(1)晶体与探测器间的距离 )晶体与探测器间的距离d
(2)扫描角度 ) (3)准直器与晶体的大小 ) (4)曝光时间 ) (5) 收集数据的范围
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【1】晶体与探测器间的距离 d 】
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【3】准直器与晶体的大小 】
面探衍射仪一般情况下选用 0.5 mm 的准直 器。 因此,太大的晶体可以采用切割的方法进 行改造,尤其是对于吸收较强的晶体(如 金属有机物,这些晶体的衍射能力也比较 强) ,更应该尽可能选用体积小(0.2-0.3 mm) 、但外观尺寸均衡的晶体以减少吸 收效应。
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我们的经验是:对于晶体大小在 0.3 mm以 上、含有金属的化合物,曝光时间控制在 5-10 秒;对于小晶体、具有大晶胞的晶体 和衍射能力较弱的有机化合物晶体,曝光 时间为 20-30 秒,更长的曝光时间并没有 明显提高衍射数据的质量,此时,应该尝 试生长大的晶体,或者在低温、使用较强 的光源(转靶、同步辐射源)收集数据。
在面探衍射仪中晶体与探测器之间的距离可以在 一定的范围内移动,原因是面探测器原先主要是 用于收集蛋白质等生物大分子的衍射数据,由于
对于小分子晶体 d 值在45-55 mm之间可以 小分子晶体, 小分子晶体 满足大部分要求。 每次调整 d 值后,都必须进行相关的校正
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巨大的晶胞,假如 d 太小,衍射点将会重 。 叠,探测器背景噪音也会增加。但是 d 值 也不能太大,否则,记录到的衍射点强度 将会降低。
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【4】收集数据的范围 】
面探测器可以轻而易举地收集大量的富余 衍射点,即收集等效衍射点或同个衍射点 被反复收集多次。软件可以自动设置收集 1/4、1/2 和全球衍射点,具有正交以上对 称性的晶格只需要收集 1/4球衍射数据就足 够了,但是,多余的衍射点往往能够提高 衍射数据的质量,尤其是可以得到较好的 吸收校正结果,
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衍射几何 晶体中由原子组成的点阵在三维空 晶体中由原子组成的点阵在三维空 间呈有序排列,因此, 间呈有序排列,因此,类同于光线与 光栅的作用, 光栅的作用,晶体能对波长与晶格间 距相若的射线相互作用, 距相若的射线相互作用,产生相干现 射线照射到晶体上, 象,X 射线照射到晶体上,就会产生 衍射效应(diffraction)。 衍射效应 。
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2)面探测器衍射仪的原理 面探测器衍射仪的原理
晶体安放的方法与四圆衍射仪的情况十分相似. 晶体安放的方法与四圆衍射仪的情况十分相似.面 探系统的最大优点 最大优点: 探系统的最大优点: 只要原始的测量数据还保存着, 只要原始的测量数据还保存着,即便取向矩阵出 了差错,程序可以重新计算一次, 了差错,程序可以重新计算一次,以获得正确的 取向矩阵和晶胞参数, 取向矩阵和晶胞参数,重新对衍射数据进行指标 化,以获得一套正确的数据。相反,如果使用四 以获得一套正确的数据。相反, 圆衍射仪,则必须从头开始, 圆衍射仪,则必须从头开始,重新找出正确的取 向矩阵、晶胞等数据,然后重新收集一整套数据! 向矩阵、晶胞等数据,然后重新收集一整套数据!
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X射线的产生有两种机理 射线的产生有两种机理 第一种是电子冲击阳极物质时,部分能量
转换成波长连续的射线,即所谓“白色”X 射线。 第二种是高速电子把阳极材料中原子内层 电子激发,再由激发态跃迁到内层所发射 的特定波长X射线,它不仅具有很大的强度, 而且其谱峰很窄,称为特征X射线。 通常用于单晶衍射实验的X射线由钼靶或 铜靶产生
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B.成像板探测器 成像板探测器(image plate detector, 简 成像板探测器 探测器) 称IP探测器 探测器 IP探测器也是一种面探测器 它的成像板 探测器也是一种面探测器,它的成像板 探测器也是一种面探测器 掺杂了Eu3+离子的 BaClF磷 表面镀有一层掺杂了 表面镀有一层掺杂了 离子的 磷 光材料.这种材料能把与 这种材料能把与X射线量子相关的 光材料 这种材料能把与 射线量子相关的 信息储存为短期发光中心 然后进入” 短期发光中心.然后进入 信息储存为短期发光中心 然后进入”读数 阶段” 通常为几分钟 通常为几分钟),成像板在激光束的 阶段”(通常为几分钟 成像板在激光束的 扫描下,这些 光中心重新被激发为可见光量 扫描下 这些 光中心重新被激发为可见光量 子,通过光电子倍增器件转化并被记录为数 通过光电子倍增器件转化并被记录为数 化的强度数据. 字 化的强度数据
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相邻衍射波的 光程差Fra Baidu bibliotek: 光程差为: Δa = acosθa0 + acosθa
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入射X射线与晶胞参数为a、b和c的晶体作用 式中波长λ的系 时,产生衍射的条件为: 数 hkl就叫做衍 射指标,必须为 acosθa0 + acosθa = hλ 整数,也就是不 能连续变化 bcosθb0 + bcosθb = kλ ccosθc0 + ccosθc = lλ 这就是三维劳埃方程,它是晶体产生衍射的严 格条件。
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【2】扫描角度 】
通常来讲,扫描角度越小,数据质量越好,超过 1˚以上的扫描数据一般解不出结构。 因此,通过增大扫描角度加快衍射数据收集速度 的做法并不可取。但是太小的扫描角度会大大增 大大增 加数据收集的时间和储存数据所需的计算机空间。 一般建议采用的扫描角度是 0.2-0.3˚(控制软件的 扫描角度是 缺省值为 0.3˚)。 假如采用低于 0.2˚的扫描角度, 必须注意曝光时间不要超过 20 秒描角度,
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