四川大学华西医院_病理学2017
临床分子病理实验室二代基因测序检测专家共识
㊃标准与规范㊃ＤＯＩ：１０．３７６０／ｃｍａ．ｊ．ｉｓｓｎ．０５２９⁃５８０７．２０１７．０３．００１基金项目：科技部卫生行业科研专项基金（２０１４０２００１）执笔人：叶丰（四川大学华西医院病理研究室）；吴焕文（中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院病理科）通信作者：梁智勇（中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院病理科，Ｅ⁃ｍａｉｌ：ｌｉａｎｇｚｈｉｙｏｎｇ１２２０＠ｙａｈｏｏ．ｃｏｍ）；步宏（四川大学华西医院病理研究室／病理科，Ｅ⁃ｍａｉｌ：ｈｏｎｇｂｕ＠ｓｃｕ．ｅｄｕ．ｃｎ）临床分子病理实验室二代基因测序检测专家共识‘临床分子病理实验室二代基因测序检测专家共识“编写组 近年二代基因测序（ｎｅｘｔ⁃ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ，ＮＧＳ）技术快速发展，其应用已进展至临床检测，如遗传疾病㊁实体肿瘤㊁血液肿瘤㊁感染性疾病㊁人类白细胞抗原分析及非侵袭性产前筛查等㊂国内外有关学会已出台相关共识与指南以推动其在临床中的应用［１⁃４］㊂中华医学会病理学分会和中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会前期组织病理㊁临床㊁生物信息等专家进行了充分讨论，拟在ＮＧＳ的操作流程㊁数据处理㊁结果解读等方面作规范和建议，以规范ＮＧＳ在分子病理领域的应用㊂临床分子病理实验室ＮＧＳ样本可采用甲醛固定石蜡包埋（ｆｏｒｍａｌｉｎ⁃ｆｉｘｅｄｐａｒａｆｆｉｎ⁃ｅｍｂｅｄｄｅｄ，ＦＦＰＥ）组织㊁新鲜组织㊁各种体液及其上清液㊁体液离心细胞蜡块㊁血浆／血液标本等㊂本共识特色是基于病理评估的组织样本（ＦＦＰＥ组织㊁新鲜组织）而形成的规范㊂测序分析范围基于目前临床需求，本共识着重于目标区域测序（ｐａｎｅｌ）分析的实践㊂随着技术的更新和应用的成熟，本共识将持续更新以满足临床需求㊂一㊁实验室总体要求ＮＧＳ检测实验室的总体设计与要求应参考‘分子病理诊断实验室建设指南（试行）“㊁‘医疗机构临床基因扩增检验实验室工作导则“㊁‘个体化医学检测质量保证指南“㊁‘肿瘤个体化治疗检测技术指南“㊁‘个体化医学检测实验室管理办法“㊁‘测序技术的个体化医学检测应用技术指南（试行）“进行［５⁃７］㊂１．ＮＧＳ检测人员的资质要求：ＮＧＳ检测技术人员应具备临床病理学㊁分子生物学的相关专业大专以上学历，并经过ＮＧＳ技术的理论与技能培训合格，同时具有临检中心‘临床基因扩增实验室技术人员培训合格证“㊂数据分析人员应具有临床医学㊁分子生物学或遗传学知识背景并经生物信息学培训㊂最终报告应由中级或硕士以上具有病理学背景㊁经培训合格的本单位执业医师或者授权签字人（高级职称或医学博士学位）审核㊂２.ＮＧＳ检测实验室的区域设置要求：原则上ＮＧＳ实验室应当有以下分区：样本前处理区㊁试剂储存和准备区㊁样本制备区㊁文库制备区㊁杂交捕获区／多重ＰＣＲ区域（第一扩增区）㊁文库扩增区（第二扩增区）㊁文库检测与质控区㊁测序区㊁数据存贮区㊂各工作区空气及人员流向需要严格按照‘医疗机构临床基因扩增检验实验室工作导则“配置㊂分区可根据实际情况合并，但是在前处理和建库时，血液样本与组织样本分开㊂３．ＮＧＳ检测试剂及项目要求：试剂和测序平台应选择中国食品药品监督管理总局（ＣＦＤＡ）认可产品㊂涉及实验室自配试剂，应该有严格的试剂制备标准操作规程（ＳＯＰ），需经过临床实验室自建项目（ＬＤＴ）验证合格才可使用㊂每个ＮＧＳ检测项目在验证时需要根据建库方法㊁测序平台和分析工具以及不同的突变类型，包括单碱基突变（ｓｉｎｇｌｅｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｖａｒｉａｎｔ，ＳＮＶ）㊁小片段插入或者缺失（Ｉｎｄｅｌ）㊁基因拷贝数变异（ｃｏｐｙｎｕｍｂｅｒｖａｒｉａｔｉｏｎｓ，ＣＮＶ）㊁染色体结构变异（ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌｖａｒｉａｔｉｏｎ，ＳＶ）以及不同的样本类型（如ＦＦＰＥ组织㊁新鲜组织㊁全血㊁胸水等）对特定ｐａｎｅｌ的准确性㊁精确性㊁敏感性㊁特异性等性能参数进行ＬＤＴ验证㊂应该有经过标准品测试的在不同的变异频率（ｍｕｔａｎｔａｌｌｅｌｅｆｒｅｑｕｅｎｃｉｅｓ，ＭＡＦ）下，不同测序深度的灵敏度及特异度数据，确定不同样本的可信的测序深度㊂经验证后，ＳＯＰ发生的任何改动，包括试剂㊁仪器㊁基因项目等都需要重新做验证㊂验证实验结果签名留底备案㊂４．ＮＧＳ检测实验室的质量管理要求：ＮＧＳ检测万方数据主要包括实验操作和生物信息学分析两部分㊂实验操作部分包括样本准备㊁文库制备㊁编码（ｂａｒｃｏｄｉｎｇ）㊁目标区域富集㊁测序等；生物信息学分析部分包括定位（ｍａｐｐｉｎｇ）㊁比对㊁变异识别㊁变异注释㊁变异解读及报告等㊂上述流程均需要建立实验室质量管理体系文件和ＳＯＰ及机器运行和维护ＳＯＰ，具有严格的室内质控措施；定期参加室间质评以及有持续的质量保证和改进计划㊂二㊁ＮＧＳ分析样本㊁基因ｐａｎｅｌ和转运要求ＮＧＳ分析样本类型可采用ＦＦＰＥ组织㊁新鲜组织㊁各种体液及其上清液㊁体液离心细胞蜡块和血浆／血液标本等㊂对于肿瘤体细胞变异初次ＮＧＳ检测应首选经病理评估的组织样本，在此数据基础上的再次检测可选取液体样本动态监测㊂ＮＧＳ检测前需通过病理诊断明确其肿瘤的性质及含量，根据不同肿瘤类型选择合适的基因ｐａｎｅｌ测序［８⁃１１］㊂不同疾病的基因ｐａｎｅｌ列表，必须由临床与检测机构的专家共同决定，在满足临床需求的同时达到最优化的实验设计㊂未经病理评估的基因检测结果不可单独用于分子病理临床诊断目的㊂样本质量对检测结果和分析至关重要，病理医师需要对可评估的样本进一步明确病理诊断，并评价标本有无出血㊁坏死和不利于核酸检测的前处理（例如含ＨＣｌ脱钙液处理），病变细胞（如肿瘤细胞）的总量和比例，避免假阴性㊂组织标本中肿瘤细胞含量建议达到２０％以上，低于此标准可富集后检测［１２］㊂ＮＧＳ检测实验室应对不同类型的样本有采集及处理ＳＯＰ指导㊂对于不同的样本（ＦＦＰＥ组织㊁体液㊁血液等）实验室应有不同的样本运送ＳＯＰ，物流环节（含冷链运输）应有相关运送记录，确保样本运送安全㊁无污染㊁无降解㊂三㊁ＮＧＳ检测流程中的质量标准１．核酸提取及其质量分析：提取的核酸质量是ＮＧＳ检测成功的关键因素，在制备文库前应采用多种方法对核酸质量评估，包括纯度㊁浓度和完整性分析㊂需要根据不同的样本类型制定相应的ＳＯＰ用以鉴定核酸的纯度㊁浓度㊁完整性或降解程度等㊂对应明确接受和拒绝的标准㊂２．文库制备及其质量分析：文库制备方法主要有杂交捕获和扩增子建库，无论采用何种方法制备文库和平台检测，都应对检测基因㊁区域或突变热点进行描述，并建立实验室检测ＳＯＰ㊂建立好文库后上机测序前需对文库进行质量分析㊂每个检测项目应设定其文库质量的要求，明确接受或拒绝的标准㊂３．ＮＧＳ测序仪上机检测及其质量分析：测序主要有检测氢离子释放和荧光信号两大技术平台㊂测序时根据检测样本量和质量要求确定适当的芯片，以保证测序质量和靶区覆盖深度㊂录入样本编号㊁检测内容㊁设定参数等信息，按仪器操作流程进行测序㊂产生的测序数据质量参数要求详见后文㊂４．ＮＧＳ检测中的样本追踪及对照设置：（１）样本追踪：为确保检测过程中样本没有混淆或污染，可选用多个ＳＮＶ位点或其他标签作为样本身份标识（ｓａｍｐｌｅＩＤ），在检测前对每个样本进行ＳＮＶ位点信息的测定，在ＮＧＳ检测后对上述位点进行追踪，证明没有交叉污染㊂（２）阳性对照：应用组合型质控材料，可采用已知突变信息的混合样本，以模拟样本的复杂性㊂实验时同时检测，以确保其检出能力㊂（３）阴性对照：用无核酸或明确无突变的样本作为模板同时进行检测，以确保检测过程中没有污染或非特异性㊂（４）应对方案和替代方法：各个质量控制步骤中如出现异常或失败，实验室应有应对措施或备选方案；对于测序结果质量差或有问题的区域应建立替代方法（如Ｓａｎｇｅｒ测序）㊂四㊁生物信息分析ＮＧＳ数据的生物信息分析可分为两个主要步骤：一是对测序数据进行质控分析及过滤㊂二是对通过质控的序列进行变异位点鉴定分析并注释㊂所用各种生物信息分析软件，都要通过适量标准品测序数据进行验证，证明所用软件及参数可达到临床报告的要求㊂１．ＮＧＳ生物信息分析流程标准：（１）质控分析：为保证分析结果的可靠性，需要对原始的测序数据进行质量控制与过滤㊂测序数据的质量控制主要包含４个方面：质量评估㊁去接头序列㊁去低质量序列㊁去重复序列㊂（２）序列比对：将通过质控后每一条ｒｅａｄ与参考基因组进行比对，回贴到基因组上最佳位置㊂（３）变异鉴定：对每个位点进行变异鉴定㊂在肿瘤ｐａｎｅｌ测序中，主要检测ＳＮＶ和Ｉｎｄｅｌ两种突变类型，参数调整后可分析ＣＮＶ㊂部分ｐａｎｅｌ的设计还可以鉴定染色体易位㊂对于肿瘤ｐａｎｅｌ基因测序数据，鉴定后的变异位点都需要进行该位点可视化查看和确认，如ＴｈｅＩｎｔｅｇｒａｔｉｖｅＧｅｎｏｍｉｃｓＶｉｅｗｅｒ（ＩＧＶ）㊂（４）变异注释：基于通用数据库，对突变基万方数据因位点进行功能注释，详见下文㊂２．ＮＧＳ生物信息分析流程质量管理：实验室应建立生物信息学程序（Ｐｉｐｅｌｉｎｅ）的书面质量管理计划文件㊂必须包含每次运行时监测和评估运行性能的指标和质控参数，以及定期（例如每月㊁每季度）监测的指标和质控参数㊂指标和质控参数可包括但不限于标准品的突变类型及百分比㊂生物信息分析流程建立后，需要采用已知变异类型和变异频率的标准品进行验证，验证其特异度和灵敏度是否达到实验室要求㊂验证结果签名留底备案㊂（１）ＮＧＳ数据存储：实验室需要在生物信息分析过程中对原始数据及最后的结果数据进行标准化存储，并要保存相应的年限以备检查㊂（２）版本可追溯性：每份病例数据分析报告中，生物信息数据分析流程所涉及软件㊁算法㊁参数及数据库的版本必须可溯源㊂（３）异常记录：实验室需要建立一个异常记录文档，用来记录偏离ＮＧＳ生物信息分析标准分析流程的检测㊂３．ＮＧＳ生物信息分析质量指标：原始文件及比对结果文件的质量指标见表１㊂表１原始文件及比对结果文件的质量指标含义参数指标含义单碱基质量评估ｒｅａｄ中每个碱基的质量分数碱基质量中位数每条ｒｅａｄ末端碱基质量明显下降，碱基质量中位数是衡量这段ｒｅａｄ的重要指标重复ｒｅａｄ的百分比重复ｒｅａｄ的百分比是文库复杂度的指示值包含接头序列的ｒｅａｄ数量包含接头序列的ｒｅａｄ总数回贴ｒｅａｄ的百分比回贴到参考基因的ｒｅａｄ百分比目标区域ｒｅａｄ百分比回贴到目标区域的ｒｅａｄ百分比目标区域的平均深度目标区域的平均测序深度目标区域测序均一度目标区域被覆盖到的一致性４．ＮＧＳ数据存储格式标准：为了规范和管理各类数据，各个实验室需按照编号进行数据管理，所有数据按照国际标准格式进行存储㊂必须建立本地变异数据库（用于检验变异真实性）㊂５．ＮＧＳ数据存储传输及共享安全标准：实验室需要制定规章制度以确认测序数据在内部㊁外部存储及传输过程中的安全性和机密性㊂正常人群的变异数据应该共享㊂五㊁ＮＧＳ结果解释及报告１．ＮＧＳ临床报告包含内容：基于高通量测序技术，临床实验室比较容易获取更高通量的临床样本检测数据，不可避免会检测到意义未知的变异位点，在实际工作中会有一定的不确定性㊂但ＮＧＳ的检测报告建议体现以下内容：（１）检测名称，如ＸＸＸ基因变异检测报告㊂（２）患者基本信息：姓名，年龄，性别，住院号，送样医院科室及医师等㊂（３）样本信息：病理号，取材部位，样本类型（ＦＦＰＥ组织㊁新鲜组织㊁血液等）㊁送检日期㊁报告日期等㊂（４）病理信息：肿瘤组织类型㊁位置㊁ＴＮＭ分期㊁细胞含量㊁肿瘤细胞比例㊁特殊说明（出血㊁坏死㊁酸脱钙处理等）㊂（５）检测技术：包含所用基因ｐａｎｅｌ㊁检测平台名称，分析软件版本号等㊂（６）结果列表应包含：基因名称㊁变异在染色体位置㊁变异频率㊁ｃＤＮＡ的Ｇｅｎｂａｎｋ号（ＮＭ开头）及符合人类基因组变异协会（ＨｕｍａｎＧｅｎｏｍｅＶａｒｉａｔｉｏｎＳｏｃｉｅｔｙ，ＨＧＶＳ）书写规范的突变类型㊁编码蛋白Ｇｅｎｂａｎｋ号（ＮＰ开头）及突变类型㊁杂合／纯合状态等㊂（７）临床意义解读和批注：体细胞突变，报告各个肿瘤检测到的变异位点及临床意义㊂胚系突变，对于检测到的变异位点的致病性予以相应的临床解释㊂临床意义解读要客观平实的描述，对于疾病相关性只描述既往研究中的疗效或预测，不能出现使用何种治疗手段或策略的语言㊂（８）若检测失败，应阐述失败原因㊂（９）最终报告应由检测者㊁报告医师或指定审核人联合签发㊂２．基因变异的命名：在描述所检测出的基因变异时要遵循一定的原则和规范，推荐使用人类基因组变异协会命名指南（ｗｗｗ.ｈｇｖｓ.ｏｒｇ）㊂对于遗传病相关基因变异命名，推荐美国医学遗传学学院（ＡｍｅｒｉｃａｎＣｏｌｌｅｇｅｏｆＭｅｄｉｃａｌＧｅｎｅｔｉｃｓａｎｄＧｅｎｏｍｉｃｓ；ｈｔｔｐｓ：／／ｗｗｗ.ａｃｍｇ.ｎｅｔ）的遗传疾病变异分类指导的命名㊁遗传背景说明以及权威文献说明㊂３．临床意义的解读和批注：对于肿瘤体细胞突变，根据突变的类型和已有的报道及指南，基因变异提倡分级的处理方式㊂Ａ级：美国食品药品管理局（ＦＤＡ）或ＣＦＤＡ批准的用药治疗靶点；写入中外诊疗指南有明确诊断／治疗／预后意义的变异㊂在报告中注释该变异位点的临床诊断／治疗／预后意义的权威指南来源㊂Ｂ级：尚未进入诊疗指南，但已经写入该领域的专家共识的变异位点㊂注释时要批注研究报道及专家共识的来源，明确其药物及其临床意义㊁正在开展万方数据的状态等信息㊂Ｃ级：ＦＤＡ或ＣＦＤＡ批准用于其他肿瘤可预测疗效的基因变异，或者正在进行中的临床试验变异位点㊂注释时要批注用于其他肿瘤的权威指南，研究文献及临床试验正在开展的状态等信息㊂Ｄ级：处于学术争议或临床意义不明确的基因变异㊂同一实验室应该有统一的政策用来应对检测过程中出现的临床意义不明变异情况［４］㊂对于以上几种情况在报告的时候注意客观平实地描述检测的结果，在病理报告中不能出现建议使用何种治疗手段或策略的语言㊂对于胚系突变（ｇｅｒｍｌｉｎｅｍｕｔａｔｉｏｎ）检测，除了中外诊疗指南及重要参考文献以外，推荐两个数据库：ＯｎｌｉｎｅＭｅｎｄｅｌｉａｎＩｎｈｅｒｉｔａｎｃｅｉｎＭａｎ（ｈｔｔｐ：／／ｏｍｉｍ.ｏｒｇ／）和美国医学遗传学学院（ｈｔｔｐｓ：／／ｗｗｗ.ａｃｍｇ.ｎｅｔ）的遗传疾病变异分类指导注释临床意义，并附上数据库和参考文献内容㊂遗传注释还可以参考各亚专科的专业数据库进行注释（比如乳腺癌ＢＲＣＡ１／２基因等）㊂４．意义不明位点的处理：由于通量的增加和人种差异，临床肿瘤样本可能发现新的变异位点㊂实验室必须制定相关政策方案用来应对检测过程中出现的临床意义不明变异情况㊂政策可以是一发现变异就报告，但附上说明和意义㊂也可以是不报告这些发现或只报告小部分变异结果，并附上说明和参考文献及数据库㊂但是在报告的备注里一定要声明本实验室的报告规则㊂５．知情同意：建议提供患者手写或在线版的知情书㊂编写组成员（按单位名称汉语拼音字母顺序排列）：北京大学医学部病理学系（张波）；北京医院病理科（王征）；成都军区昆明总医院病理科（杨举伦）；第三军医大学大坪医院病理科（肖华亮）；第三军医大学西南医院病理科（阎晓初）；第四军医大学西京医院病理科（王哲㊁叶菁）；福建省肿瘤医院病理科（陈刚）；复旦大学附属妇产科医院病理科（赵晨燕）；复旦大学附属中山医院病理科（侯英勇）；复旦大学附属肿瘤医院病理科（周晓燕）；复旦大学医学院病理学系（朱虹光）；广东省人民医院病理医学部（刘艳辉）；哈尔滨医科大学附属第一医院病理科（吴鹤）；河南省肿瘤医院病理科（马杰）；华中科技大学同济医学院病理科（段亚琦）；吉林大学第二医院病理科（孙平丽）；江苏省人民医院病理科（张智弘）；解放军总医院病理科（石怀银）；南方医科大学南方医院病理科（梁莉）；南京军区南京总医院病理科（饶秋㊁周晓军）；山东省肿瘤医院病理科（穆殿斌）；山西省肿瘤医院病理科（郗彦凤）；上海交通大学附属胸科医院病理科（张杰）；上海交通大学医学院附属新华医院病理科（王立峰）；上海市肺科医院病理科（武春燕）；首都医科大学宣武医院病理科（滕梁红）；四川大学华西医院病理科／研究室（步宏㊁刘卫平㊁叶丰）；天津医科大学病理学教研室（张丹芳）；西安交通大学附属第一医院病理科（张冠军）；浙江大学医学院病理学系（毛峥嵘）；浙江大学医学院附属第一医院病理科（丁伟）；浙江大学医学院附属邵逸夫医院病理科（许颂霄）；浙江省肿瘤医院病理科（孙文勇）；郑州大学第一附属医院病理科（姜国忠）；中国科学院计算技术研究所（赵屹）；中国医科大学附属第一医院病理科（邱雪杉）；中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院病理科（梁智勇㊁吴焕文）；中国医学科学院肿瘤医院病理科（应建明）；中南大学医学院湘雅医院病理科（周建华）；中山大学附属第一医院病理科（王连唐）；中山大学附属肿瘤医院分子病理室（邵建永）；中山大学肿瘤防治中心科研部（左志向）参考文献［１］ＭａｔｔｈｉｊｓＧ，ＳｏｕｃｈｅＥ，ＡｌｄｅｒｓＭ，ｅｔａｌ．Ｇｕｉｄｅｌｉｎｅｓｆｏｒｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｎｅｘｔ⁃ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ［Ｊ］．ＥｕｒＪＨｕｍＧｅｎｅｔ，２０１６，２４（１）：２⁃５．ＤＯＩ：１０．１０３８／ｅｊｈｇ．２０１５．２２６．［２］ＲｅｈｍＨＬ，ＢａｌｅＳＪ，Ｂａｙｒａｋ⁃ＴｏｙｄｅｍｉｒＰ，ｅｔａｌ．ＡＣＭＧｃｌｉｎｉｃａｌｌａｂｏｒａｔｏｒｙｓｔａｎｄａｒｄｓｆｏｒｎｅｘｔ⁃ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ［Ｊ］．ＧｅｎｅｔＭｅｄ，２０１３，１５（９）：７３３⁃７４７．ＤＯＩ：１０．１０３８／ｇｉｍ．２０１３．９２．［３］ＤｉｅｎｓｔｍａｎｎＲ，ＤｏｎｇＦ，ＢｏｒｇｅｒＤ，ｅｔａｌ．Ｓｔａｎｄａｒｄｉｚｅｄｄｅｃｉｓｉｏｎｓｕｐｐｏｒｔｉｎｎｅｘｔｇｅｎｅｒａｔｉｏｎｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇｒｅｐｏｒｔｓｏｆｓｏｍａｔｉｃｃａｎｃｅｒｖａｒｉａｎｔｓ［Ｊ］．ＭｏｌＯｎｃｏｌ，２０１４，８（５）：８５９⁃８７３．ＤＯＩ：１０．１０１６／ｊ．ｍｏｌｏｎｃ．２０１４．０３．０２１．［４］ＬｉＭＭ，ＤａｔｔｏＭ，ＤｕｎｃａｖａｇｅＥＪ，ｅｔａｌ．Ｓｔａｎｄａｒｄｓａｎｄｇｕｉｄｅｌｉｎｅｓｆｏｒｔｈｅｉｎｔｅｒｐｒｅｔａｔｉｏｎａｎｄｒｅｐｏｒｔｉｎｇｏｆｓｅｑｕｅｎｃｅｖａｒｉａｎｔｓｉｎｃａｎｃｅｒ：ａｊｏｉｎｔｃｏｎｓｅｎｓｕｓｒｅｃｏｍｍｅｎｄａｔｉｏｎｏｆｔｈｅａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎｆｏｒｍｏｌｅｃｕｌａｒｐａｔｈｏｌｏｇｙ，ＡｍｅｒｉｃａｎＳｏｃｉｅｔｙｏｆＣｌｉｎｉｃａｌＯｎｃｏｌｏｇｙ，ａｎｄＣｏｌｌｅｇｅｏｆＡｍｅｒｉｃａｎＰａｔｈｏｌｏｇｉｓｔｓ［Ｊ］．ＪＭｏｌＤｉａｇｎ，２０１７，１９（１）：４⁃２３．ＤＯＩ：１０．１０１６／ｊ．ｊｍｏｌｄｘ．２０１６．１０．００２．［５］中华医学会病理学分会，中国医师协会病理科医师分会，中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会，等．分子病理诊断实验室建设指南（试行）［Ｊ］．中华病理学杂志，２０１５，４４（６）：３６９⁃３７１．ＤＯＩ：１０．３７６０／ｃｍａ．ｊ．ｉｓｓｎ．０５２９⁃５８０７．２０１５．０６．００１．［６］中华人民共和国卫生部．医疗机构临床基因扩增检验实验室管理办法［Ｓ］．２０１０⁃１２⁃０６．［７］中华人民共和国卫生部．肿瘤个体化治疗检测技术指南（试行）［Ｓ］．２０１５⁃７⁃３１．［８］ＢｅｎｓｏｎＡＢ３ｒｄ，ＶｅｎｏｏｋＡＰ，Ｂｅｋａｉｉ⁃ＳａａｂＴ，ｅｔａｌ．Ｒｅｃｔａｌｃａｎｃｅｒ，ｖｅｒｓｉｏｎ２．２０１５［Ｊ］．ＪＮａｔｌＣｏｍｐｒＣａｎｃＮｅｔｗ，２０１５，１３（６）：７１９⁃７２８．［９］ＢｅｎｓｏｎＡＢ３ｒｄ，ＤᶄＡｎｇｅｌｉｃａＭＩ，ＡｂｒａｍｓＴＡ，ｅｔａｌ．Ｈｅｐａｔｏｂｉｌｉａｒｙｃａｎｃｅｒｓ，ｖｅｒｓｉｏｎ２．２０１４［Ｊ］．ＪＮａｔｌＣｏｍｐｒＣａｎｃＮｅｔｗ，２０１４，１２（８）：１１５２⁃１１８２．［１０］ＡｊａｎｉＪＡ，ＤᶄＡｍｉｃｏＴＡ，ＡｌｍｈａｎｎａＫ，ｅｔａｌ．Ｇａｓｔｒｉｃｃａｎｃｅｒ，ｖｅｒｓｉｏｎ３．２０１６，ＮＣＣＮｃｌｉｎｉｃａｌｐｒａｃｔｉｃｅｇｕｉｄｅｌｉｎｅｓｉｎｏｎｃｏｌｏｇｙ［Ｊ］．ＪＮａｔｌＣｏｍｐｒＣａｎｃＮｅｔｗ，２０１６，１４（１０）：１２８６⁃１３１２．［１１］ＢｅｎｓｏｎＡＢ３ｒｄ，ＶｅｎｏｏｋＡＰ，Ｂｅｋａｉｉ⁃ＳａａｂＴ，ｅｔａｌ．Ｃｏｌｏｎｃａｎｃｅｒ，ｖｅｒｓｉｏｎ３．２０１４［Ｊ］．ＪＮａｔｌＣｏｍｐｒＣａｎｃＮｅｔｗ，２０１４，１２（７）：１０２８⁃１０５９．［１２］ＦｒａｍｐｔｏｎＧＭ，ＦｉｃｈｔｅｎｈｏｌｔｚＡ，ＯｔｔｏＧＡ，ｅｔａｌ．ＤｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｎｄｖａｌｉｄａｔｉｏｎｏｆａｃｌｉｎｉｃａｌｃａｎｃｅｒｇｅｎｏｍｉｃｐｒｏｆｉｌｉｎｇｔｅｓｔｂａｓｅｄｏｎｍａｓｓｉｖｅｌｙｐａｒａｌｌｅｌＤＮＡｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ［Ｊ］．ＮａｔＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌ，２０１３，３１（１１）：１０２３⁃１０３１．ＤＯＩ：１０．１０３８／ｎｂｔ．２６９６．（收稿日期：２０１６⁃１０⁃２０）（本文编辑：常秀青）万方数据。
华西临床医学院2020年硕士研究生入学考试初试参考书籍
诊断学基础 《诊断学》人卫社出版，第9版，主编：万学红、卢雪峰
中医内科学 中医内科学，第十版，张伯礼，吴勉华，中国中医药出版社
中医基础理论 中医基础理论，第十版，主编 王键 中国中医药出版社
中医诊断学 中医诊断学，第十版，主编 李灿东，中国中医药出版社
711
中医综合
中药学 中药学，第十版，主编 周祯祥 唐德才，中国中医药出版社
护理学导论 《护理学导论》，第4版.北京：人民卫生出版社,2017年
818
医院管理学 现代医院管理 现代医院管理.李为民.人民卫生出版社.2019年
710 医学技术综合
病理学
1.病理学 第3版 主编：陈杰 周桥 人民卫生出版社 2015年 2.病理学 第9版 主编：步宏 李一雷 人民卫生出版社 2018年 3.病理学学习指导及习题集 主编：周桥 人民卫生出版社 2016年 4.病理学实习指导 主编：张文燕 四川大学出版社 2019年
生理学 生理学，王庭槐，高等教育出版社，2015
四川大学华西临床医学院2020年硕士研究生入学考试初试参考书籍
科目代码 科目名称 考试涉及内容
参考书籍
病理学 生理学
1.病理学 第3版 主编：陈杰 周桥 人民卫生出版社 2015年 2.病理学 第9版 主编：步宏 李一雷 人民卫生出版社 2018年 3.病理学学习指导及习题集 主编：周桥 人民卫生出版社 2016年 4.病理学实习指导 主编：张文燕 四川大学出版社 2019年 生理学，王庭槐，高等教育出版社，2015
1.《生物化学与分子生物学（第九版）》，周春燕、药立波主编，人卫出版社，2018年
709
医学综合
生物化学 2.《生物化学与分子生物学（第三版）》，冯作化、药立波主编，人卫出版社，2015年
四川大学华西临床医学院2017年招生宣传材料
四川大学华西临床医学院2017年招生宣传材料学院简介四川大学华西临床医学院是中国著名的医学学府和高等医学教育的国家级示范基地。
学院起源于1914年私立华西协合大学医科，是中国西部最早授博士学位的学院之一。
在教育部2012年的一级学科整体水平评估中，临床医学排名并列第4，中西医结合排名全国第4，护理学排名全国第2。
师资力量现有在职高级职称专家1113人，包括中国科学院院士1名、973首席科学家3人、长江学者11名、国家自然科学基金杰出青年15名、国家“千人计划”专家50人（含青千36人）、国家“万人计划”专家3人、四川省“千人计划”49人、31人担任国家级学会/协会主委、副主委，192人担任省级学会/协会主委、副主委、国家级教学名师2名、博士导师275名、硕士导师325名。
学科建设拥有临床医学、中西医结合、护理学3个一级学科博士学位授权点；有国家重点学科9个，重点培育学科2个；有国家级各类精品课程19门，国家级双语示范课程1门，国家级特色专业2个；设临床医学博士后流动站10个，有博士学位点39个，硕士学位点41个。
科研实力是中国重要的医学科学研究和技术创新的国家级基地，是国家首批唯一入选的“2011协同创新计划”生物医药类项目的牵头单位；有国家重点实验室1个，部级重点实验室2个，大研究中心8个、医学基础实验室37个、临床研究室14个、科研公共服务平台7个；在中国医学科学院医学信息研究所发布的“中国医院科技影响力排行榜”上，连续3年综合排名全国第一；近5年来，获得国家科技重大专项，自然科学基金等国家计划项目近千项，年均科研项目经费超过二亿元，获各级政府科技奖80余项、专利授权400余项；发表科技论文名列全国医疗机构前茅，其中被SCI和MEDLINE收录和表现不俗科技论文连续多年名列全国第一。
教学基地拥有教学实习床位6000多张（含华西第二医院），学院的临床技能中心是中国规模最大的学生临床技能训练基地，建筑面积1万余平方米，临床技能训练设备设施价值1.2亿元，为学生提供了充分的临床训练、实践和科研训练条件。
膀胱尿路上皮癌的病理诊断进展
膀胱尿路上皮癌的病理诊断进展
龚静;陈铌;周桥
【期刊名称】《现代泌尿外科杂志》
【年(卷),期】2016(21)9
【摘要】近年来在尿路上皮癌的诊断病理学方面取得较大进展,包括对浸润性尿路上皮癌变异型有了更多的认识;一些新的免疫组化标记在病理诊断中得到应用;根据尿路上皮癌常见染色体改变设计的荧光原位杂交探针也已较多地用于尿液细胞样本筛查和复发监测;新的分子标记如microRNAs、TERT基因启动子突变和FGFR3基因突变检测等亦开始用于临床.本文择要介绍上述几方面的进展.
【总页数】6页(P661-666)
【作者】龚静;陈铌;周桥
【作者单位】四川大学华西医院病理科,四川成都610041;四川大学华西医院病理科,四川成都610041;四川大学华西医院病理科,四川成都610041
【正文语种】中文
【中图分类】R365
【相关文献】
1.European Urology:治疗前中性粒细胞-淋巴细胞比例与行根治性膀胱全切术的膀胱尿路上皮癌患者的病理学分级和肿瘤特异性死亡率呈正相关 [J], 吴开杰
2.体素内不相干运动成像(IVIM)对膀胱尿路上皮癌病理分级及侵袭程度的诊断价值[J], 刘俊丽
3.FGFR3、MI及Ki67联合检测在T1期膀胱尿路上皮癌病理分级中的价值研究
[J], 杨建平;李春君;罗文奇;陈肖瑜;黄冬梅;马韵;曾丽霞
4.体素内不相干运动成像(IVIM)对膀胱尿路上皮癌病理分级及侵袭程度的诊断价值[J], 刘俊丽
5.膀胱尿路上皮癌的CT表现及在术前病理分级中的价值 [J], 朱怡鸣;宋彬;雷岩因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
病理学Ⅱ(临床、口腔、基法、医检)
四川大学华西临床医学院病理学教学大纲（临床医学五年制、口腔医学专业、法医、基础医学、医学检验专业适用）病理学教研室2011.7目录课程介绍 (3)病理学总论 (5)一、绪论、适应、细胞组织损伤 (5)二、损伤的修复 (6)三、局部血液循环障碍 (6)四、炎症 (7)五、肿瘤 (8)病理学分论 (9)六、心血管系统疾病 (9)七、呼吸系统疾病 (10)八、消化系统疾病 (11)九、泌尿系统疾病 (11)十、生殖和乳腺疾病....................................................................... 错误！未定义书签。
十一、传染病与寄生虫病................................................................ 错误！未定义书签。
十二、淋巴造血系统疾病................................................................ 错误！未定义书签。
十三、内分泌系统疾病 ................................................................... 错误！未定义书签。
十四、神经系统疾病....................................................................... 错误！未定义书签。
“病理学”课程介绍一、课程基本信息课程名称：病理学Ⅱ(Pathology-Ⅱ)课程号（代码）：502016050课程类别：专业与服务课程群必修课学时：96（讲64，习32）学分：6二、教学团队课程负责人：李甘地，85422698，hxblik@课程秘书：鲁昌立，85423847，lurabbit007@四、教学目的及要求病理学是研究疾病的原因、发病机制和患病机体在疾病发生、发展过程中的形态结构和功能变化的学科。
四川大学病理学试题
一、名词解释（每题1.5分，共15分）再生出血性梗死细胞异型性趋化因子疣状心内膜炎急性重型肝炎镜影细胞肾病综合征流行性脑脊髓膜炎肺肉质变二、判断题（对选A，错选B，每题0.5分共10分）1．动脉粥样硬化主要累及弹力肌型动脉和小动脉B2．心肌纤维化时，心壁厚度必有增加。
3．慢性支气管炎、肺气肿是气道阻塞引起的，与吸烟无关B。
4．消化性溃疡病的穿孔以十二指肠溃疡病比胃溃疡病常见。
5．肝硬化门脉高压的发生主要是由于假小叶形成及肝实质纤维化压迫了小叶下静脉、中央静脉及肝窦，同时伴门静脉与肝静脉的吻合支开放所致。
6．恶性淋巴瘤与淋巴细胞白血病存在重叠，组成一个连续的谱系。
7．急性弥漫性增生性肾小球肾炎的电镜下病变特点是肾小球毛细血管基膜上皮侧有驼峰状致密物。
8．轻微病变性肾小球肾炎与免疫复合物无关。
9．子宫内膜异位症可见于子宫直肠陷窝、腹部手术瘢痕、盆腔淋巴结等。
10．葡萄胎是一种妊娠滋养叶细胞肿瘤，而绒毛膜癌不是滋养叶细胞肿瘤。
B11．由胰岛b细胞发生的胰岛细胞瘤，患者在临床上可有低血糖症状。
12．原发性肺结核的原发灶通常出现在肺尖部和通气较差的部位。
13．伤寒杆菌引起全身单核-吞噬细胞系统的巨噬细胞急性增生，同时伴大量中性粒细胞浸润。
14．组织或细胞培养的结果与其体内过程完全一致。
15．一般而言，幼稚组织比高分化组织的再生能力强。
16．透明血栓又称微血栓，主要由血小板构成。
(主要由嗜酸性同性质纤维蛋白组成)B17．末梢血白细胞计数增加是炎症反应的常见表现，临床上可借此诊断炎症，但在有些炎症末梢血白细胞计数反而减少。
18．脓肿比蜂窝织炎更易扩散。
B19．肿瘤大多数表现为局部肿块，局部肿块并非一定是肿瘤。
B20．阻塞性肺气肿发生的关键环节是小气道（主要是细支气管）炎和肺泡间隔的断裂。
A三、选择题（每题1分，共50分）A型题（请选择1个最佳答案）21．恶性淋巴瘤是CA.原发于单核巨噬细胞系统的肿瘤B.原发于淋巴结内所有细胞的肿瘤C.原发于淋巴结和结外淋巴组织的肿瘤D.原发于淋巴结窦组织细胞的肿瘤E.淋巴结的转移性肿瘤22．引起巨脾的白血病是BA.急性淋巴细胞白血病B.慢性粒细胞白血病C.急性单核细胞白血病D.急性粒细胞白血病E.急性红白血病23．下列因素中哪项与动脉粥样硬化的发生关系最密切？AA.高脂血症B.高血压C.吸烟D.病毒感染E.遗传因素24．脂肪变性的细胞内的脂肪可被下列哪种染色染成红色？BA.刚果红染色B.苏丹Ⅲ染色C.甲基紫染色D.PAS染色E.锇酸染色25．与肝细胞性肝癌的发生关系密切的致癌物是AA.黄曲霉毒素B. 9，10-二甲基苯蒽C.乙萘胺D.联苯胺E. 3，4-苯并芘26．下列哪个疾病属假膜性炎？CA.大叶性肺炎B.小叶性肺炎C.气管白喉D.间质性肺炎E.病毒性肺炎27．支气管扩张症引起肺源性心脏病的原因主要是EA.支气管腺体肥大、增生，黏膜上皮杯状细胞增多B.急、慢性细支气管炎及细支气管周围炎C.支气管壁因炎症而遭破坏D.慢性阻塞性细支气管炎E.肺组织高度纤维化28．淀粉样变性是指间质内有EA.蛋白质蓄积B.黏多糖蓄积C.黏多糖和蛋白质的蓄积D.糖原蓄积E.蛋白质-黏多糖复合物蓄积29．结缔组织、血管壁及细胞内透明变性的共同点是EA.发病机制相似B.肉眼观察形态相似C.组织学形态相似D.后果相似E.全部都是蛋白质蓄积所致30．下列哪项病变能反映小叶性肺炎的本质？CA.浆液性炎B.纤维蛋白性炎C.化脓性炎D.出血性炎E.卡他性炎31．溃疡病穿孔后最严重的后果是DA.穿孔后引起小网膜急性炎B.穿孔后引起胃和十二指肠周围脓肿形成C.穿孔后不与腹壁相通而进入邻近器官D.穿孔后引起急性弥漫性腹膜炎E.穿孔后引起肠粘连32．慢性萎缩性胃炎与慢性浅表性胃炎最确切的区别是DA.黏膜变厚B.病变部位C.炎细胞浸润的深度D.胃固有腺是否出现减少、消失，肠上皮化生等E.以上都不是33．下列哪种肠疾病最可能发生癌变？CA.出血坏死性肠炎B.局限性肠炎C.慢性溃疡性结肠炎D.肠结核E.肠阿米巴病34．急性重型肝炎的病变性质是BA.以门管区渗出为主的炎B.以肝细胞坏死为主的炎C.以肝细胞变性为主的炎D.以肝细胞增生为主的炎E.以门管区间质增生为主的炎35．关于风湿性肉芽肿的叙述，下列哪项是错误的？AA.中心部位多有纤维蛋白B.多发生于心肌间质血管旁C.特征性细胞是Aschoff细胞D.常伴有淋巴细胞、浆细胞浸润E.是风湿病的特征性病变，具有诊断意义36．引起亚急性细菌性心内膜炎的最常见病原体是EA.肠球菌B.铜绿假单胞菌（绿脓杆菌）C.b溶血性链球菌D.金黄色葡萄球菌E.草绿色链球菌37．慢性支气管炎最常见并发症是DA.肺炎B.肺脓肿C.支气管扩张症和肺源性心脏病D.肺气肿和肺源性心脏病E.肺结核和肺源性心脏病38．大脑中动脉分支血栓形成可导致脑组织发生BA.凝固性坏死B.液化性坏死C.干酪样坏死D.脂肪坏死E.干性坏疽39．容易发生出血性梗死的器官是DA.心B.肾C.脑D.肠E.脾40．肝硬化时蜘蛛状血管痣发生的主要原因是EA.门脉压增高，侧支循环形成B.肝功能不全，凝血机制障碍C.低蛋白血症D.血管内压增高E.雌激素增多41．下列哪项是肿瘤？BA.夹层动脉瘤B.血管瘤C.动脉瘤D.创伤性动脉瘤E.室壁瘤42．关于大肠癌的叙述，下列哪项是错误的？A.患者多为老年人，但中青年人发病率在逐渐上升B.患者常有贫血、消瘦、大便习惯改变C.在我国其发病率在消化道癌中仅次于胃癌D.梗阻常见于盲肠及升结肠癌，而降结肠癌及直肠癌往往不发生梗阻症状E.有时出现腹部肿块及肠梗阻症状43．头皮血肿被肉芽组织所取代，这种现象称为BA.肉芽组织形成B.机化C.肉芽肿形成D.结缔组织透明变性E.纤维化44．新月体性肾小球肾炎的主要病变是EA.肾球囊脏层上皮细胞增生B.毛细血管壁纤维蛋白样坏死C.单核细胞渗出于肾球囊内D.中性粒细胞渗出于肾球囊内E.肾球囊壁层上皮细胞增生45．肾盂积水的病变属于A.肾囊肿B.失用性萎缩C.营养不良性萎缩D.压迫性肾萎缩E.以上都是46．乳腺橘皮样外观最常见于DA.小叶原位癌B.典型髓样癌C.管内原位癌D.浸润性导管癌E.浸润性小叶癌47．关于良性畸胎瘤的叙述，下列哪项是错误的？DA.肉眼可见毛发、牙齿等B.囊壁上可见头节C.镜下可有三个胚层的成分D.肿瘤易发生恶性变E.恶变常发生于囊内头节附近48．脓细胞是指变性、坏死的A.淋巴细胞B.浆细胞C.中性粒细胞D.嗜酸粒细胞E.单核-吞噬细胞49．下列哪项没有全身中毒症状？A.迁徙性脓肿B.菌血症C.脓血症（脓毒血症）D.败血症E.毒血症50．下列哪种肿瘤易发生腹腔和盆腔种植？A.子宫绒毛膜癌B.子宫颈癌C.子宫内膜癌D.卵巢胚胎性癌E.卵巢黏液性囊腺癌51．绿色瘤是CA.胆管上皮癌因淤胆所致B.原发性肝细胞癌转移到皮下，分泌胆汁所致C.原始粒细胞在骨组织、骨膜下或软组织中浸润，聚集成肿块D.绒毛膜癌阴道转移性结节E.血管肉瘤出血，产生胆绿蛋白所致52．急性肾小球肾炎是一种A.化脓性炎B.以出血为主的炎C.以变质为主的炎D.以渗出为主的炎E.以增生为主的炎53．关于肾小球肾炎的发病机制，目前认为主要是A.感染直接损伤B.过敏反应C.体液免疫反应D.自身免疫反应E.细胞免疫反应54．下列哪项不是阴茎癌的特点A.常发生于40岁以上的男性B.患者大多有包皮过长C.肉眼常呈菜花状或溃疡状D.组织学上以低分化鳞状细胞癌最多见E.转移发生较早，远处转移少见55．在甲状腺癌中，以哪种类型的发病最多、恶性度最低、5年生存率最高？A.滤泡性癌B.乳头状癌C.髓样癌D.未分化癌E.嗜酸细胞腺癌56．关于毒性甲状腺肿的发病机制，目前认为最可能是A.细菌引起的化脓性炎B.食物中含有致甲状腺肿的物质C.自身免疫反应D.甲状腺异常增生形成的新生物E.土壤和水中缺碘57．克汀病的主要病因是A.缺碘B.发育异常C.免疫异常D.遗传因素E.垂体或下丘脑病变58．以下哪一项不是结核转向愈合时的改变？A.吸收、消散B.钙化C.纤维包裹D.纤维化E.病灶周围出现渗出、继发坏死以及溶解液化59．下列哪项描述符合膜性肾小球肾炎A.肾小球有较多单核细胞及淋巴细胞浸润B.此型与免疫复合物无关C.上皮细胞内有粗大的沉积物D.银染色见基膜形成钉状突起，钉状突起与基膜垂直相连形如梳状E.皮质激素治疗效果较明显60．尿毒症时贫血的主要原因是A.大量血尿B.铁蛋白从尿中丢失C.细胞因子抑制骨髓D.大量蛋白尿E.促红细胞生成素不足61．临床上称为开放性肺结核的是A.原发性肺结核病B.浸润型肺结核病C.局灶型肺结核病D.慢性纤维空洞型肺结核E.肺结核球62．下列哪项关于流行性乙型脑炎的叙述是正确的？A.乙型脑炎病毒为DNA病毒B.多在冬、春季流行C.病变广泛累及整个中枢神经系统灰质D.成人感染乙型脑炎病毒多为显性感染E.神经细胞胞质中常见包涵体形成63．一病人患病已3周，有持续性高热，心率过缓，腹胀，腹泻。
病理科排名
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病理科
医院
平均声誉值
1
复旦大学附属肿瘤医院
10.171
2
北京协和医院
8.961
3
四川大学华西医院
8.618
4
中国人民解放军总医院
5.434
5
北京大学第三医院
5.303
6
中山大学附属第一医院
3.342
7
南方医科大学南方医院
2.987
8
第三军医大学西南医院
2.789
9
华中科技大学同济医学院附属同济医院
2.61810来自第四军医大学西京医院1.947
获提名医院
中国医学科学院肿瘤医院、南京军区南京总医院、中国医科大学附属第一医院、天津医科大学附属肿瘤医院、中南大学湘雅医院、广东省人民医院、第二军医大学长海医院、山东大学齐鲁医院、浙江大学医学院附属第一医院、北京大学人民医院、北京军区总医院、郑州大学第一附属医院
角巩膜缘幼年性黄色肉芽肿1例
球样隆起，呈高回声（图３）。入院诊断：左眼角结膜新生物， 断，组织细胞出现明显的空泡化改变以及杜顿细胞的出现均
双眼屈光不正。于２０１７ 年８ 月９ 日在全麻下行＂左眼角膜、 有助于本病的诊断。由于ＪＸＧ 组织学特点呈时间依赖性，
结膜、巩膜肿物切除＋ 冷冻术＂。术中见：左眼颞侧角膜缘外 早期组织细胞脂质化不明显且典型的杜顿细胞少见，与其他
既往及家族史无特殊。全身检查无异常。眼部检查：视力： 片状浸润，可见少至中等量的嗜酸性胞浆，其中不含或仅含
右眼１． ２，左眼０． ４ ，眼压正常。左眼结膜未见明显充血，角 极少的脂质空泡，细胞核有丝分裂较其他类型活跃，但无异
巩膜缘２ 点至４ 点方位可见一大小约５ｍｍ × ６ｍｍ × ４ｍｍ 黄 型性，核小，呈圆形、卵圆形甚至锯齿形，常包含一个不清晰
必殊滴眼液滴左眼每天４ 次，眼红减轻，肿物进行性增大，左 节，可导致自发性前房出血及继发性青光眼，甚至威胁患者
眼视力无改善。入院前４１ ｄ 于我院门诊就诊。体检：视力： 的视力。角巩膜缘ＪＸＧ 少见，病变可持续向瞳孔区扩大，导
右眼１． ０，左眼０． ６，左眼颞侧结膜血管轻度扩张，结膜实质 致视力下降，也可侵犯眼睑、结膜、视网膜、脉络膜、视神经和
巩膜及角膜缘内侧１． ５ ｍｍ 可见黄白色新生物，质硬，侵及 类型的组织细胞增生症（尤其是ＬＣＨ）难以鉴别，此时则需
角膜基质、巩膜深基质层及表面的结膜，邻近血管充盈扩张。 做免疫组化。ＪＸＧ 免疫组化染色中ＫｉＭ１Ｐ、ＣＤ６８ 通常呈现
术后左眼结膜囊涂典必殊眼膏，单眼加压包扎１ ｄ，局部用典 阳性，而ＣＤ１ａ 和Ｓ１００ 标记呈现阴性。ＬＣＨ 患者Ｓ１００ 及
性占位累及角膜基质约１ ｍｍ，予百力特滴眼液滴左眼每天４ 眼眶等［３，４］。
83例神经母细胞瘤患儿N-myc和ALK基因检测及临床病理分析
83例神经母细胞瘤患儿N-myc和ALK基因检测及临床病理分析王威亚;李金男;吴玮璐;陈敏;李甘地;马志贵【摘要】目的：探讨N-myc和间变性淋巴瘤激酶(ALK)基因拷贝数变化及ALK基因点突变等异常在神经母细胞瘤(NB)中的意义。
方法回顾性分析83例NB患儿的临床病理特点，检测ALK和N-myc基因，根据NB患儿临床分期、组织学分类进行临床病理特征讨论和生存分析。
结果共纳入83例NB患儿，以婴幼儿发病为主。
NB中检测到N-myc基因增多和扩增，ALK基因异常表现为点突变和增多。
17例NB患儿同时存在ALK和N-myc基因异常。
年龄、临床分期和N-myc基因异常是影响NB预后的因子。
结论对NB患儿进行N-myc和ALK基因检测，不仅能判断NB患儿的预后，还能为NB的ALK靶向治疗提供理论基础。
%ObjectivesTo retrospectively analyze the clinicopathological features of neuroblastoma (NB) and investigate the signiifcance of abnormalityofN-myc and anaplastic lymphoma kinase (ALK) gene copy number change as well asALKmu-tations in NB.Methods Eighty-three NB patients were collected and classiifed into different subgroups according to the clinical stage and histology. Fluorescence in situ hybridization (FISH) was performed to detect the abnormalities ofN-mycandALK genes. The extracted DNA was ampliifed by PCR and sequenced to investigate the point mutations of theALK gene. Follow-up data were collected and survival analysis was performed.ResultsFISH detection showed that the aberration ofN-mycgene copy number presented as gain and ampliifcation. The aberration ofALK gene presented as point mutation and gain. It wasshown that 17 cases had the abnormality of bothN-myc andALK gene. Survival analysis showed that the prognostic factors included the clinical stage, age and abnormality ofN-myc genes.ConclusionDetection ofN-myc andALK abnormality in NB would be helpful for evaluating the prognosis and providing theoretical basis forALK target therapy.【期刊名称】《临床儿科杂志》【年(卷),期】2015(000)008【总页数】6页(P720-725)【关键词】神经母细胞瘤;N-myc基因;ALK基因;临床病理分析【作者】王威亚;李金男;吴玮璐;陈敏;李甘地;马志贵【作者单位】四川大学华西医院病理科四川成都 610041;四川大学华西医院病理科四川成都 610041;四川大学华西医院病理科四川成都 610041;四川大学华西医院病理科四川成都 610041;四川大学华西医院病理科四川成都 610041;四川大学华西第二医院儿科血液肿瘤实验室四川成都 610041【正文语种】中文神经母细胞瘤(neuroblastoma，NB)是儿童期最常见的颅外实体性肿瘤，也是婴儿期发病率最高的肿瘤。
数字化切片在口腔组织病理学教学中的应用
数字化切片在口腔组织病理学教学中的应用
耿宁;刘君瑜;汤亚玲;项涛;刘孝宇;王亚;郑巧;陈宇
【期刊名称】《基础医学教育》
【年(卷),期】2017(019)010
【摘要】数字化切片库的建立打破了传统组织切片的局限,将其引入传统的口腔组织病理教学中,应用于从本科教育、住院医师规范化培训到网络教育、继续教育等各个层次的教学,可以充分发挥学生在教学中的主体作用,激发学生的学习热情,提高学生自主学习和创新能力。
【总页数】4页(P783-786)
【作者】耿宁;刘君瑜;汤亚玲;项涛;刘孝宇;王亚;郑巧;陈宇
【作者单位】[1]四川大学华西口腔医院病理科,成都610041;[2]四川大学华西口腔医学院实验教学示范中心;[3]山西医科大学口腔医学系
【正文语种】中文
【中图分类】R36
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1.数字化切片在口腔组织病理学实验教学中的应用 [J], 刘源;王新文;周峻
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3.数字化切片在口腔组织病理学教学中的应用 [J], 耿宁;刘君瑜;汤亚玲;项涛;刘孝宇;王亚;郑巧;陈宇
4.数字化切片在口腔组织病理学实验教学中的应用初探 [J], 宋洋;刘希;吴巍;黄相
道
5.数字化切片在口腔组织病理学实验教学中的应用 [J], 蒲文静
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四川大学华西临床医学院 四川大学华西医院
四川大学华西临床医学院四川大学华西医院
佚名
【期刊名称】《中国卫生事业管理》
【年(卷),期】2005(21)1
【总页数】1页(P1-1)
【关键词】华西医院;临床医学院;社区医疗服务机构;四川
【正文语种】中文
【中图分类】R
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5.四川大学华西临床医学院四川大学华西医院 [J],
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去分化脂肪肉瘤潜在核心基因的生物信息学预测及分析
网络出版时间：２０２１－１－１９１５：３０ 网络出版地址：ｈｔｔｐｓ：／／ｋｎｓ．ｃｎｋｉ．ｎｅｔ／ｋｃｍｓ／ｄｅｔａｉｌ／３４．１０７３．Ｒ．２０２１０１１９．１０５９．００４．ｈｔｍｌ·论 著·去分化脂肪肉瘤潜在核心基因的生物信息学预测及分析胡美娟１，２，周燕燕２，彭 冉１，邱 琰１，周永杰２，杨李波２，包 骥２，步 宏１，２摘要：目的 探讨去分化脂肪肉瘤的潜在核心基因在其恶性生物学行为中的作用。
方法 获取基因表达数据库（ｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓ ｓｉｏｎｏｍｎｉｂｕｓ，ＧＥＯ）数据库中ＧＳＥ２１１２２和ＧＳＥ５２３９０的芯片数据，通过ＧＥＯ２Ｒ筛选差异表达基因，对差异表达基因进行ＧＯ功能、ＫＥＧＧ通路富集分析和蛋白互作分析，并用Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ筛选潜在核心基因。
结果 筛选出６８个差异表达基因（矫正后Ｐ＜０ ０５，｜ＬｏｇＦＣ｜≥２），１０个基因表达上调，５８个基因表达下调；ＧＯ功能富集分析表明，差异表达基因主要参与的生物过程包括代谢和能量通路；ＫＥＧＧ通路富集分析表明，差异表达基因主要参与脂肪细胞因子信号通路、ＡＭＰＫ信号通路、ＰＰＡＲ信号通路和调控脂肪分解信号通路；蛋白互作分析表明，筛选的１０个潜在核心基因为ＬＥＰ、ＡＤＩＰＯＱ、ＳＣＤ、ＰＬＩＮ１、ＬＰＬ、ＣＡＶ１、ＰＮＰＬＡ２、ＬＩＰＥ、ＣＥＢＰＡ和ＣＩＤＥＡ。
结论 潜在核心基因表达下调在去分化脂肪肉瘤的恶性生物学行为中发挥重要作用，为分析去分化脂肪肉瘤的分子机制和治疗靶点奠定基础。
关键词：软组织肿瘤；去分化脂肪肉瘤；差异表达基因；生物信息学；信号通路中图分类号：Ｒ７３８ ６ 文献标志码：Ａ 文章编号：１００１－７３９９（２０２１）０１－０００８－０５ｄｏｉ：１０．１３３１５／ｊ．ｃｎｋｉ．ｃｊｃｅｐ．２０２１．０１．００４接受日期：２０２０－１１－２９基金项目：国家重点研发计划（２０１７ＹＦＣ０１１３９０８）、四川大学华西医院临床研究孵化项目（２０２０ＨＸＦＨ０２９）作者单位：四川大学华西医院１病理科、２病理研究室，成都 ６１００４１作者简介：胡美娟，女，硕士研究生。
非急性心肌梗死患者高敏心肌肌钙蛋白T升高的病因研究
非急性心肌梗死患者高敏心肌肌钙蛋白T升高的病因研究李小玲;干伟;罗薇;丁霏;贺勇;张玫;聂鑫;李贵星【摘要】目的分析非急性心肌梗死 (AMI) 住院患者高敏心肌肌钙蛋白T (hs-cTnT) 升高的病因.方法纳入2017年1-12月该院胸痛且hs-cTnT>100ng/L的住院患者8 743例为研究对象, 收集患者的临床资料和实验室数据, 计算各种病因所占比例及hs-cTnT水平, 分析hs-cTnT增高的病因.结果住院患者hs-cTnT水平升高的病因包括AMI (2 448例, 28.0％) 和非AMI (6 295例, 72.0％) .其中, 非AMI 病因包括冠心病 (1 748例, 20.0％) 、器质性心脏病 (437例, 5.0％) 、肾功能不全(786例, 9.0％) 、脑卒中 (699例, 8.0％) 、感染 (786例, 9.0％) 、慢性阻塞性肺疾病急性发作 (AECOPD) (262例, 3.0％) 、心力衰竭 (524例, 6.0％) 、心肌病(262例, 3.0％) 、糖尿病并发症 (349例, 4.0％) 、术后 (107例, 1.2％) 、严重创伤 (67例, 0.8％) 、主动脉夹层 (77例, 0.9％) 、其他 (184例, 2.1％) .结论 hs-cTnT是心肌细胞损伤的标志物, 在多种非AMI患者中出现水平升高, 临床工作中应分析其具体病因, 从而采取针对性治疗.%Objective To analyze the causes of high-sensitivity cardiac troponin T (hs-cTnT) increase in the inpatients with non-acute myocardial infarction (non-AMI) .Methods A total of 8 743 inpatients with chest pain and hs-cTnT>100 ng/L in West China Hospital from January 2017 to December 2017 served as the study subjects.The clinical data and laboratory data were collected, the proportion of various causes and hscTnT levels were calculated, and the causes of hs-cTnT increase were analyzed.Results The causes of hs-cTnT level increase in hospitalized patients included acute myocardial infarction (AMI, 2 448 cases, 28.0％) and non-AMI (6 295 cases, 72.0％) .Among them, the non-AMI causes included coronary heart disease (1 748 cases, 20.0％) , organic heart disease (437 cases, 5.0％) , renal function insufficiency (786 cases, 9.0％) , stroke (699 cases, 8.0％) , infection (786 cases, 9.0％) , acute exacerbations of chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD, 262 cases, 3.0％) , heart failure (524 cases, 6.0％) , cardiomyopathy (262 cases, 3.0％) , diabetic complications (349 cases, 4.0％) , postoperation (107 cases, 1.2％) , severe trauma (67 cases, 0.8％) , aortic dissection (77 cases, 0.9％) , and others (184 cases, 2.1％) .Conclusion hs-cTnT is a marker of myocardial cell injury and its level is increased in multiple non-AMI.In the clinical work, its specific causes should be analyzed, thus the targeted treatment is adopted.【期刊名称】《检验医学与临床》【年(卷),期】2019(016)003【总页数】4页(P295-298)【关键词】高敏心肌肌钙蛋白T;非急性心肌梗死;病因【作者】李小玲;干伟;罗薇;丁霏;贺勇;张玫;聂鑫;李贵星【作者单位】四川大学华西医院实验医学科,成都 610041;四川大学华西医院实验医学科,成都 610041;四川大学华西医院实验医学科,成都 610041;四川大学华西医院实验医学科,成都 610041;四川大学华西医院实验医学科,成都 610041;四川大学华西医院实验医学科,成都 610041;四川大学华西医院实验医学科,成都 610041;四川大学华西医院实验医学科,成都 610041【正文语种】中文【中图分类】R446肌钙蛋白(Tn)是肌细胞收缩的调节蛋白，在肌肉收缩和舒张过程中起着重要的调节作用。
病理医生缘何遭遇人才荒
病理医生缘何遭遇人才荒作者：来源：《健康必读》2016年第05期在2016年的两会上，儿科医生短缺问题引发广泛关注。
事实上，病理科面临同样甚至更为严重的人才荒，只不过由于病理科医生不直接与患者打交道，供需矛盾没有充分暴露。
但作为诊断基础，病理科的人才短缺影响更为深远。
病理科就是没人来广西壮族自治区来宾市兴宾区人民医院是一家二级医院，2015年8月开业。
该院党支部副书记马如青说，为了吸引人才，政府给予优惠政策，给引进的副高级职称人员45万元安家费，主治医师给5万元。
“现在，各临床科室技术人才基本到位了，就是病理科没人来。
病理医生本来就缺，有一定资历的更不会选择二级医院。
医院的手术室很快就要投入使用，没有病理科，外科的术中冰冻切片就无法完成。
”提到术中冰冻切片，广西贵港市平南县第二人民医院副院长韦献琼也深有感触。
该院病理科成立不到5年，“以前由于没有病理科，医生考虑是恶性肿瘤，需要术中冰冻切片，大多不敢做手术，只好建议患者上转。
术前判断为良性肿瘤，但术后病理是恶性的，患者还得做二次手术”。
韦献琼告诉记者，该院病理科成立后，由于设备投入不足、技术跟不上，且冰冻切片对人员和技术要求较高，本院医生不太敢发报告，只能外聘一位退休医生一周来院一次，需要术中冰冻切片的手术，都要集中到周末进行。
借医改东风，县级医院近年来发展越来越快，去年平南二院门诊量达到40万人次、住院3万人次。
韦献琼说，病理科现在也只有两名医生，其中一名还是新进的。
今年，全院计划招聘40人，结果只招到5人，招来的人也轮不到病理科，因为“临床科室更需要人”。
诊断“三局两胜”影响治疗“病理是医学诊断的金标准。
病理科不发展，医疗质量没有根本保障。
”中华医学会病理学分会侯任主任委员、四川大学华西医院病理科主任步宏教授对记者说，目前一些医院的肿瘤治疗缺乏精准的病理诊断做支撑，未完全落实“没有病理诊断不能开展治疗”的规范。
不能开展神经肌肉活检，成为很多医院神经内科、风湿免疫科诊疗的瓶颈。
华西临床医学院病理学博物馆的建设及作用
【 ｂｔａｔ Ｔ ｅ ａｕｔ ｏ ｅａｔｅ ｔ ｆ ａ ｏ ｇ ｓ Ｃ ｉ ｃｏｌ ｆ ｄ ｉｅｈｖ ｏ Ａ ｓ ｃ 】 ｈ ｃｌ ｆ ｐｒ ｎ ｔ ｌ ｉ Ｗｅｔ ｈｎ Ｓｈ ｏ ｏ Ｍｅｉ ｎ ａｅｃｌ ｒ ｆ ｙ ｄ ｍ ｏｐ ｈ ｏ ｎ ｙ ａ ｃ —
ｌｃｅ ｒ ｈ ｎ ３ ０ ０ ｇ ｏ ｓ ｓ ｅ ｉ ｅ ｓｆ ｒ７ ｅ ｒ．Ｏｎ ｔ ｅ ｂａ ｉ ｆｔ ｅ ｅ ｔｄ ｍｏｅ ｔａ ０ ｒ ｓ ｐ ｃｍ ｎ ｏ ４ ｙ ａ ｓ ｈ ｓｓ ｏ ｈ ｍ，ｔ ｙ ｄ ｃｄ ｏ ｃ ｎ ｔｕ ｔ ｈｅ ｅ ｉｅ ｔ ｏ ｓｒ ｃ ｐ ｔ ｌｇ ａｈｏｏ ｙ ｍｕｓ ｕ ．Ｔｈ ｏ ｓｒ ｃｉｎ ｗｏｋ ｉ ｃｕ ｓ ｈｅ ｓ ｃ ｍｅ ｈｏ ｎｇ ｃａ ｓｏ ｅｍ ｅ ｃ ｎ ｔ ｔ ｒ ｎ ｌｄｅ ｔ ｐｅ ｉ ｎ ｓ ｗｉ ｌｓ ｒｏｍ，ｔｅ ｈ ｓｏ ｉ ａ ｄ ｕ ｏ ｈ ｉｔｒｃ ｎ
【 ｅ ｏｄ 】 Ｐ ｔ ｌｇ； Ｍ ｓｕ Ｋ ｙｗ ｒｓ ａｏ ｙ ｈｏ ｕｅｍ； Ｇ ｏｓｓｅｉｅ ； Ｂｌ ｇａ ｔ ｃｉｇ Ｈ ａ ｈｅｕ ａ ｒｓ ｐｃ ｎ ｍ ｉｎｕｌｅ ｈ ； ｅ ｔ ｄ ｃ— ｉ ａ ｎ ｌ
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四川 大学 华西 医 院建 院 已有 １０多年 的历史 ， Ｉ １ 而华 西病 理前 身 为 １３ 成 立 的华西 协 和 大学病 ９６年
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系统性红斑狼疮合并Sweet综合征一例
系统性红斑狼疮合并Sweet综合征一例发布时间：2021-12-28T07:34:51.518Z 来源：《医师在线》2021年32期作者：李汶峰[导读] 近年来，自身免疫性结缔组织病相关的嗜中性皮病并不少见，但系统性红斑狼疮相关的Sweet综合征鲜有分析报李汶峰成都中医药大学，四川成都610075）摘要：近年来，自身免疫性结缔组织病相关的嗜中性皮病并不少见，但系统性红斑狼疮相关的Sweet综合征鲜有分析报道，其临床症状不尽相同，临床上容易误诊，耽误患者治疗。
故笔者特报道一例系统性红斑狼疮合并Sweet综合征的患者，以襄同道。
关键词：红斑狼疮；Sweet综合征；自身免疫性结缔组织病中图分类号：R758.611．临床资料现病史：患者女，62岁，因“面部、双手臂反复红斑伴灼热感3+年，复发加重1+周”于2020-10-23收住我科。
患者3+年前双手臂出现红色斑片，伴有灼热痒痛感，伴口腔溃疡，自觉发热等不适，患者遂至“达州市中心医院”就诊，查血常规提示“三系减少（具体不详）”，患者要求出院，遂建议患者至上级医院进一步排查三系减少原因。
后患者面颊部开始出现红色斑片，稍高出皮面，伴灼热痒痛明显，遂于“四川大学华西医院”门诊就诊后行皮肤病理活检（2017-07-07）提示:（面部+左前臂）符合Sweet综合征之病理改变（见图1）；图1 SLE合并Sweet综合征患者病理诊断报告骨髓穿刺活检+免疫分型示：骨髓赠生活跃，粒细胞略低占41.5%，红系增高占48%，骨髓造血细胞增生明显低下，FCM分析未见明显异常，骨髓细胞染色体核型分析未见异常；自身免疫抗体谱未见异常；遂诊断为“急性发热性嗜中性皮病”，未予治疗。
后患者至“成都市第二人民医院”门诊就诊，予以“口服甲泼尼龙片30mg抗炎、白芍总苷胶囊抑制免疫、复方甘草酸苷胶囊调节免疫、双嘧达莫片抗血小板聚集”等治疗，服药后患者面部、手臂皮疹逐渐消退，甲泼尼龙逐渐减量至4mg长期维持治疗；期间患者面部红斑时有反复，患者自行增加甲泼尼龙用量（具体不详），皮疹消退后减量；1+周前，患者受凉后出现面部多处红色水肿性斑片，伴有灼热痒痛感，患者遂自行增加甲泼尼龙用量至36mg后面部红斑有所消退；为进一步系统诊治，遂来我院。
乳腺肌样错构瘤
乳腺肌样错构瘤
杨雯娟;魏兵;步宏
【期刊名称】《临床与实验病理学杂志》
【年(卷),期】2014(30)5
【摘要】1临床资料本例读片资料由四川大学华西医院病理科提供，通讯读片编号B3-16。
【总页数】3页(P550-552)
【作者】杨雯娟;魏兵;步宏
【作者单位】四川大学华西医院病理科,成都610041 ;大理学院基础医学院病理学教研室,大理671003;四川大学华西医院病理科,成都610041;四川大学华西医院病理科,成都610041
【正文语种】中文
【中图分类】R736.3
【相关文献】
1.乳腺肌样错构瘤超声表现2例 [J], 王冬梅;杨裕佳;邱逦
2.乳腺恶性叶状肿瘤伴骨肉瘤及肌源性分化的梭形细胞样肉瘤1例 [J], 史建军;张鹏;刘涛;李珂;文庆一;杨明;毕丽荣;李嗣杰
3.乳腺肌样错构瘤临床病理分析及文献复习 [J], 喻林;沈旭霞;杨文涛;徐晓丽;顾雅佳;王朝夫;陆洪芬;盛伟琪;施达仁
4.具有肌上皮分化特征的基底细胞样乳腺癌研究进展 [J], 张帆
5.乳腺肌样错构瘤临床病理分析 [J], 田保玲;高霭峰;杨向红;苏庆华;邱芳
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6.基因芯片技术的原理与应用。
7.急性炎症局部临床表现，简述其病理原因。
8.什么是肿瘤病毒，举一个例子说明病毒在肿瘤形成中的机制。
三、论述题
1.病例分析题：（10分）
风心病房颤瓣膜性心脏病大叶性肺炎这样的题目包括诊断，病理特征累及各系统的表现。
1）病例的诊断（2分）。
四川大学华西医院
2017年攻读博士学位研究生入学考试试题
考试科目：病理学
注意：所有答案一律写在答题纸上，写在试题纸上或其他地方一律不给分。
一、名词解释(共12个，6个英语，6个中文，每个2分):
1.gangrene
2.lobar pneumonia
3.granulation tissue
4.heart failure cell
5.krukenberg tumor
6.Reed-Sterberg cell
7.假膜性炎
8.点突变
瘤抑制基因
10.异位内分泌综合症
11.室壁瘤
12.急性肾炎综合征
二、简答题（每个7分）
1.引起咯血的三种原因，简述其病理变化。
2.化生对机体的影响，举两例。
3.什么是癌前病变，举3个例子。
4.晚期高血压患者心、脑、肾的病理改变。
2）主要病理改变（3分）。
3）该疾病累及其他器官的病理改变（5分）。
2.肝硬化腹水产生机制（10分）