基因突变的检测方法

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临床常用基因突变及融合基因检查方法

临床常用基因突变及融合基因检查方法

临床常用基因突变及融合基因检查方法1. 引言1.1 基因突变及融合基因检查的重要性基因突变及融合基因检查在临床诊断中起着至关重要的作用。

基因突变是导致遗传性疾病和癌症等疾病发生的主要原因之一,通过检测基因突变可以及早发现患者的疾病风险,为个体化治疗提供重要依据。

而融合基因则是某些癌症的特征之一,对于癌症的诊断、治疗和预后判断有着重要意义。

通过基因突变及融合基因检查,可以精准地了解患者疾病的发展过程、临床表现和预后;可以帮助医生选择最适合患者的治疗方案,避免不必要的试错;可以帮助患者及时接受个体化治疗,提高治疗效果和生存率。

基因突变及融合基因检查已经成为临床诊断和治疗的重要辅助手段,对改善患者生活质量和延长患者生存时间起着至关重要的作用。

随着检测技术的不断发展和完善,基因突变及融合基因检查的精准性和灵敏度将进一步提高,有望为临床诊断和治疗带来更多的突破。

加强对基因突变及融合基因检查的研究和应用,对于提高临床诊断的准确性和治疗的有效性具有重要的意义。

1.2 临床常用的基因突变检查方法临床常用的基因突变检查方法主要包括Sanger测序技术、下一代测序技术和PCR技术。

Sanger测序技术是一种经典的测序方法,通过测序反应得出DNA序列,适用于短序列的测序。

尽管这种方法已有一定历史,但仍然被广泛应用于临床基因检测中。

下一代测序技术则是近年来发展起来的新一代测序技术,具有高通量、高效率和低成本的特点,可以同时测序多个样本,广泛用于基因组学研究和个性化医疗中。

PCR技术也是一种常用的基因突变检查方法,通过扩增特定DNA 片段进行检测,具有高灵敏度和特异性,适用于检测患者的基因突变状态。

这些基因突变检查方法在临床诊断中发挥着重要作用,为医生提供了准确的基因信息,指导临床治疗方案的制定。

1.3 临床常用的融合基因检查方法临床常用的融合基因检查方法主要包括荧光原位杂交(FISH)、反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和基因组定序。

临床常用基因突变及融合基因检查方法

临床常用基因突变及融合基因检查方法

临床常用基因突变及融合基因检查方法全文共四篇示例,供读者参考第一篇示例:临床常用基因突变及融合基因检查方法随着基因组学和分子生物学的发展,基因检测技术在临床诊断中的应用日益广泛。

基因突变和融合基因是许多疾病的发生和发展的关键因素,因此对其检测越来越受到重视。

本文将介绍一些临床常用的基因突变及融合基因检查方法,希望能够帮助读者更深入了解这一领域的知识。

1. PCR技术PCR技术是一种常用的基因检测方法,通过扩增特定基因片段,可以检测到基因的突变。

PCR技术具有高灵敏度和高特异性的优点,可以快速、准确地检测基因突变。

在临床诊断中,PCR技术经常用于检测与疾病相关的基因突变,如遗传性疾病、肿瘤等。

2. 高通量测序技术高通量测序技术是目前最流行的基因检测技术之一,可以同时测序大量基因,并快速高效地识别突变。

高通量测序技术具有高灵敏度、高准确性和高通量的优点,可以帮助医生更准确地诊断疾病,并指导个体化治疗方案的制定。

3. 质谱技术质谱技术是一种基于质量-电荷比的物质分析技术,可以用于检测DNA、RNA等生物分子。

质谱技术具有高灵敏度、高分辨率和高准确性的优点,可以用于检测基因突变、基因表达水平等,对于肿瘤的早期诊断和治疗、药物敏感性的评估等方面具有重要的意义。

1. FISH技术FISH技术是一种常用的融合基因检测方法,通过用荧光染料标记特定基因,可以直接观察到基因的融合情况。

FISH技术具有高分辨率、高灵敏度和高特异性的优点,可以帮助医生准确诊断某些特定的融合基因相关的疾病,如慢性髓性白血病、胃肠道间质瘤等。

在临床实践中,基因突变和融合基因的检测对于疾病诊断、治疗和预后评估具有重要的意义。

随着基因检测技术的不断发展和完善,相信在未来会有更多更高效、更精准的检测方法出现,为临床诊断和治疗带来更多的帮助和改善。

希望本文能为读者对基因突变及融合基因检查方法有更深入的了解和认识。

第二篇示例:临床常用基因突变及融合基因检查方法基因突变是指基因组中的某个基因发生了突变,使其序列发生了改变,导致基因的功能发生变化或失去功能。

基因突变检测技术简介

基因突变检测技术简介

基因突变检测技术简介基因突变检测技术是一种用于检测个体基因组中突变的方法。

基因突变是指基因序列发生的变异,可分为点突变、插入和缺失等多种类型。

这些突变可能与遗传性疾病、癌症等疾病的发生有关。

基因突变检测技术的发展,为疾病治疗和预防提供了重要依据。

现今,基因突变检测技术主要应用在两个领域:遗传病筛查和肿瘤突变检测。

在遗传病筛查中,基因突变检测技术广泛应用于新生儿筛查和遗传咨询。

新生儿筛查旨在在婴儿出生后尽早发现可治疗的遗传病。

通过分析婴儿的基因组,可以及早识别出导致遗传性疾病的突变基因,从而及时采取干预措施。

遗传咨询是指向具备遗传病风险的个体提供遗传咨询,帮助他们了解潜在风险,并制定适当的生育计划和预防措施。

基因突变检测技术可通过对个体基因组进行测序,发现其中存在的潜在疾病风险基因,从而提供个性化的遗传咨询。

在肿瘤突变检测领域,基因突变检测技术具有重要的意义。

肿瘤是基因突变导致的一类疾病,通过检测肿瘤细胞中的突变基因,可以实现肿瘤的早期诊断、分型、分级以及预后评估。

同时,肿瘤突变检测还可以指导个体化治疗的选择。

以肺癌为例,肺癌患者的基因突变情况会影响对特定药物的敏感性,通过检测突变基因,可以选择最有效的药物治疗方案,提高治疗效果。

目前,常用的基因突变检测技术包括PCR、Sanger测序、下一代测序(NGS)等。

PCR(聚合酶链式反应)技术是一种高度敏感的突变检测方法。

利用PCR技术可以扩增目标基因或特定片段,通过检测扩增产物的变异位点,确定是否存在突变。

PCR技术具有高度特异性和敏感性的优点,广泛应用于突变的快速检测。

Sanger测序是一种经典且广泛应用的突变检测技术。

该技术通过测序反应逐个回顾目标片段的碱基序列。

当一个碱基被修饰时,会生成特定的信号,从而识别突变位点。

Sanger测序技术具有较高的准确性和可靠性,是突变检测的金标准技术。

下一代测序(NGS)是一种高通量测序技术,已逐渐成为基因突变检测的主流技术。

基因突变的检测方法

基因突变的检测方法

基因突变的检测方法基因突变是指细胞中一些基因序列发生改变,影响了基因的正常功能。

这些突变可以是单个碱基的改变、插入或删除,也可以是基因内或基因间区域的结构改变。

基因突变可能是遗传的,也可能是后天的,是导致许多疾病的重要原因之一、因此,对基因突变进行准确的检测和分析对于预防、诊断和治疗疾病具有重要意义。

目前,常见的基因突变的检测方法主要有以下几种:1.直接测序法:直接测序法是一种最常用、最可靠的基因突变检测方法。

通过DNA测序技术,可以准确地检测出基因序列的每个碱基,从而发现可能存在的突变。

这种方法可以检测到单个碱基的点突变、小片段的插入或缺失等突变。

2.聚合酶链式反应(PCR):PCR是一种常用于扩增基因片段的方法,可以将DNA样本中的目标基因片段扩增到足够的数量,以便进行突变的分析。

PCR可以用于检测点突变、大片段缺失和插入等突变。

此外,PCR还可以与其他技术(例如限制性酶切、序列特异性引物放大、测序等)结合使用,增加突变检测的灵敏性和准确性。

3.变性梅毒凝胶电泳(DGGE):DGGE是一种分析DNA序列异质性的方法。

通过在电泳过程中使用梯度浓度的变性剂,可以将DNA样本中具有不同序列的片段分离开来。

通过比较样品与对照的DGGE图谱,可以检测到突变的存在和类型。

4.基因芯片技术:基因芯片技术是一种高通量基因突变检测方法。

基因芯片上携带了大量不同的探针,可以同时检测一系列基因的突变状态。

这种方法适用于筛查大规模的基因突变。

5.网络测序技术:网络测序技术是一种新兴的基因突变检测方法。

通过将DNA样本测序后上传至云端服务器,利用高效的计算机算法和庞大的数据库,可以分析和鉴定样本中的突变。

这种方法可以快速准确地检测大规模基因突变,适用于临床中的个性化医疗。

虽然以上列举了几种常见的基因突变检测方法,但需要注意的是,每种方法都有其优缺点,并且适用于不同类型的突变鉴定。

在实际应用中,常常需要结合多种方法进行综合分析和鉴定,以提高突变检测的准确性和可靠性。

人pole基因突变的新型测定方法及试剂与流程

人pole基因突变的新型测定方法及试剂与流程

人pole基因突变的新型测定方法及试剂与流程【原创版4篇】《人pole基因突变的新型测定方法及试剂与流程》篇1目前,关于人pole 基因突变的新型测定方法、试剂及流程尚处于研究阶段。

pole 基因突变与多种疾病相关,如癌症、自身免疫性疾病等。

然而,现有的检测方法在灵敏度、特异性和精确度等方面仍有待提高。

因此,研究人员正在努力开发更先进、高效的检测方法。

在新型测定方法的研究中,可能包括以下几种技术:1. 高通量测序(NGS):通过检测基因组DNA 序列,发现pole 基因的突变。

这种方法具有高灵敏度和高通量,可同时检测多个样本。

2. 基因芯片:利用基因芯片对pole 基因进行检测,具有快速、简便、高灵敏度等优点。

3. 质谱分析:通过质谱分析技术,检测pole 基因突变导致的蛋白质表达异常。

这种方法具有高精度,但操作较为复杂。

试剂方面,可能包括:1. 核酸提取试剂盒:从样本中提取DNA,进行后续检测。

2. 聚合酶链反应(PCR)试剂盒:对pole 基因的特定区域进行扩增,以便进行后续检测。

3. 基因测序试剂盒:用于对pole 基因进行高通量测序。

检测流程可能包括以下步骤:1. 收集样本:获取患者血液、组织等样本。

2. 核酸提取:使用核酸提取试剂盒从样本中提取DNA。

3. PCR 扩增:使用PCR 试剂盒对pole 基因的特定区域进行扩增。

4. 高通量测序:将扩增后的DNA 进行高通量测序,发现pole 基因突变。

5. 数据分析:对测序结果进行生物信息学分析,确认pole 基因突变的类型和位点。

6. 质谱分析:对突变导致的蛋白质表达异常进行质谱分析,以进一步确认突变的功能影响。

7. 结果解读:根据检测结果,为患者提供诊断和治疗建议。

《人pole基因突变的新型测定方法及试剂与流程》篇2目前,关于人pole 基因突变的新型测定方法及试剂尚处于研究阶段。

然而,已经出现了一些用于检测基因突变的常见方法,例如Sanger 测序、高通量测序(如NGS)等。

用PCR技术检测DNA样品中的基因突变

用PCR技术检测DNA样品中的基因突变

用PCR技术检测DNA样品中的基因突变PCR(聚合酶链式反应)技术可以用于检测DNA样品中的基因突变,该技术是通过扩增DNA序列来检测其中的变异位点。

以下是PCR技术检测DNA样品中的基因突变的步骤:1.根据要检测的基因,设计引物:设计两个特异性引物,这两个引物的序列应该都位于基因中的靶位点的上下游,并且应该没有其他类似的DNA序列。

2.DNA样品的提取:从细胞或组织中提取DNA样品。

提取DNA的方法可以使用商业DNA提取试剂盒或自制方法,比如苛性钠/SDS法、碱裂解法等。

3.PCR反应:将DNA样品与引物、核苷酸、聚合酶和缓冲液混合,进行PCR反应。

PCR反应包括一系列不同的温度循环,包括变性、退火和延伸步骤。

在变性步骤中,DNA双链分离成两个单链。

在退火步骤中,引物与目标DNA序列结合。

在延伸步骤中,聚合酶使用核苷酸作为原料,以引物为模板合成DNA链。

4.突变检测:PCR反应产生的DNA产物经过凝胶电泳分离,然后进行染色,目的是可视化PCR扩增的DNA片段。

此外,可以使用各种技术,例如限制性片段长度多态性(RFLP)分析、聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)、聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)和DNA测序来检测基因突变。

总之,PCR技术是一种快速、敏感和特异的检测DNA样品中基因突变的方法。

这种技术可以应用于各种实验室和临床应用中,包括分子诊断、个性化治疗和基因工程等领域。

再写一个RNA干扰(RNAi)技术在研究基因表达调控中的应用RNA干扰技术是一种基于RNA分子间相互作用的生物技术,可以用于调节和研究基因表达。

该技术通常利用siRNA(小干扰RNA)或shRNA(短发夹RNA)的能力来抑制基因转录和/或转录后的RNA 分解。

RNA干扰技术在研究基因表达调控方面有许多应用,以下是其中的一些:1.基因静默:RNA干扰技术可通过siRNA或shRNA,抑制目标基因的表达,从而研究该基因的生物学功能。

肿瘤细胞基因突变的快速检测技术

肿瘤细胞基因突变的快速检测技术

肿瘤细胞基因突变的快速检测技术肿瘤是一种常见的疾病,它的形成涉及到基因突变,而快速准确地检测肿瘤细胞的基因突变对于肿瘤的治疗和预后具有重要意义。

在近些年,肿瘤细胞基因突变的快速检测技术不断发展,可以通过多种方法进行检测,如下文所述。

首先介绍的是PCR(聚合酶链反应)技术。

PCR技术是一种将DNA扩增的方法,它能对肿瘤细胞中的基因进行快速检测。

PCR 技术是通过特殊的酶,将DNA链的两端不断进一步复制,从而形成大量的DNA分子。

在PCR技术中,我们可以将特定的一段DNA序列扩增,从而检测基因突变。

这种方法可快速准确地检测出肿瘤细胞基因的突变情况。

其次是基于Nanopore技术的检测方法。

Nanopore技术是新兴出现的一种基于纳米孔的单分子检测技术。

Nanopore技术可以将试样分成很小的单元,然后通过纳米孔通道测量样品中不同的成分。

在肿瘤细胞的基因检测上,Nanopore技术可以实现对具有高度变异的基因区域进行快速检测,从而提高肿瘤检测的准确率。

另一种方法是利用NGS(下一代测序)技术。

NGS技术是一种高通量DNA测序方法,可以将该样品DNA中的所有序列片段同时测序并得到数据。

在肿瘤细胞检测中,该技术可将基因突变的信息与参考基因库进行比对,从而快速准确地发现肿瘤细胞中的基因突变。

通过NGS技术分析,医生可以精准地针对患者的病情,进行个性化的治疗方案设计。

最后,基于电泳的检测技术也是一种常见方法。

在肿瘤细胞基因突变的快速检测方面,电泳技术可以识别DNA序列中的单核苷酸变异(简称SNV)或结构变异(简称SV)。

电泳技术基于电极原理,可以将DNA序列按碱基组成的大小不同进行分离,从而实现来自临床样本和细胞系的SNV和SV基因检测。

总之,随着技术的不断进步和发展,对肿瘤细胞基因突变的快速检测成为了一种非常重要的手段。

无论是PCR技术,还是Nanopore技术、NGS技术或电泳技术,都提供了精准、灵敏、可靠的检测手段,在临床肿瘤治疗中起到了重要作用。

基因突变检测内容

基因突变检测内容

基因突变检测内容介绍基因突变检测是一种通过分析个体基因组中的突变,来了解个体是否携带有害突变或遗传疾病的方法。

本文将详细探讨基因突变检测的相关内容,包括检测方法、应用领域、优势和限制等,旨在帮助读者全面了解基因突变检测的重要性和应用前景。

一、基因突变检测方法基因突变检测有多种方法,包括单倍型分析、酶切位点变异分析、测序技术和PCR扩增等。

这些方法根据突变类型和检测需求的不同,选择不同的策略来进行基因突变分析。

1. 单倍型分析单倍型分析是通过检测个体基因组上的特定位点的单倍型(allele)来确定基因型。

常用的单倍型分析方法包括限制性片段长度多态性(RFLP)和序列特定引物扩增(SSP)。

这些方法通常用于检测单个核苷酸多态性(SNPs)或小片段的插入/缺失等突变。

2. 酶切位点变异分析酶切位点变异分析是通过检测特定基因上的酶切位点是否发生变异来判断个体是否存在突变。

这种方法常用于检测大片段插入/缺失和染色体重排等结构变异。

在此方法中,关键是选择合适的酶切位点和适当的酶切酶进行检测。

3. 测序技术测序技术是最常用的基因突变检测方法之一。

通过对整个基因组或特定基因进行测序,可以检测到基因组中所有可能的突变类型。

目前,常用的测序技术包括Sanger测序、下一代测序(NGS)和单分子测序等。

4. PCR扩增PCR扩增是一种常用的突变检测方法,通过特定序列的扩增来检测基因组中的突变。

PCR扩增可以用于检测单个核苷酸多态性、小片段插入/缺失以及基因的重复序列等突变。

此外,PCR扩增也可用于基因组的特定区域富集,以便后续测序分析。

二、基因突变检测的应用领域基因突变检测在医学、生物学和遗传学等领域有着广泛的应用。

下面将分别探讨其在这些领域中的具体应用。

1. 医学应用基因突变检测在医学中的应用非常广泛。

它可以用于遗传性疾病的诊断和预测。

通过检测个体基因组中与特定疾病相关的突变,可以及早发现患者的病情并制定相应的治疗方案。

基因突变的检测

基因突变的检测

基因突变的检测基因突变是指基因序列发生变化的现象,它可以导致生物体在遗传信息传递过程中产生异常,进而影响其生长、发育和健康状况。

随着科技的进步,基因突变的检测方法也不断发展,为人类健康提供了更准确、可靠的诊断手段。

一、基因突变的检测方法及原理1. 水平梯度凝胶电泳法水平梯度凝胶电泳法是一种常用的基因突变检测技术。

它基于突变基因片段的长度,利用凝胶电泳的原理,通过电泳的迁移速度来判断基因是否发生突变。

2. 荧光定量PCR技术荧光定量PCR技术结合了PCR扩增和荧光探针技术,可用于检测基因的突变。

该方法通过特定的引物和探针,能够实现对特定基因片段的扩增和检测,并结合荧光信号的强度来判断基因是否突变。

3. Sanger测序技术Sanger测序技术是一种传统的基因测序方法。

通过引物与待测样品中的DNA片段结合,使DNA合成反应开始,经过一系列处理,最终可以获得DNA序列。

这种方法可用于检测基因序列是否存在突变。

4. 高通量测序技术高通量测序技术是近年来发展起来的一种先进的基因检测方法。

该技术基于平台设备,能够实现大规模的DNA测序,从而快速、高效地检测基因序列中的突变。

二、基因突变检测的应用领域1. 遗传性疾病的诊断与预防许多遗传性疾病与基因突变密切相关。

通过对患者基因进行检测,可以准确判断疾病是否与基因突变有关,并为患者提供个体化的治疗方案和预防措施。

2. 肿瘤基因突变的筛查肿瘤的发生与基因突变密切相关,因此对肿瘤基因突变的筛查对于早期诊断和治疗是非常重要的。

基因突变检测技术的快速发展,为肿瘤的防治提供了有力的支持。

3. 个体化药物治疗在临床应用中,个体化药物治疗已经成为一种趋势。

通过检测患者的基因突变,可以了解对不同药物的代谢情况,从而为患者量身定制药物治疗方案,提高治疗效果,减少副作用。

三、基因突变检测的挑战与展望1. 数据分析与解读基因突变检测过程产生的大量数据需要进行准确的分析和解读,这对于研究人员和临床医生具有挑战性。

基因组学研究中的突变检测与分析实验报告

基因组学研究中的突变检测与分析实验报告

基因组学研究中的突变检测与分析实验报告【引言】基因组学研究是一个重要的领域,通过研究DNA序列中的突变信息,我们可以了解到基因突变对人类健康以及疾病发生的影响。

本实验旨在讨论基因组学研究中突变检测与分析的方法和实验结果。

【实验方法】1. DNA样本提取:我们从10名志愿者手部采集细胞样本,并使用DNA提取试剂盒按照说明书提取DNA。

2. PCR扩增:通过聚合酶链式反应(PCR)扩增目标基因区域。

我们设计了一对引物来选择性扩增我们感兴趣的基因区域。

PCR条件设置为:初始变性(95℃,5分钟),循环反应(95℃,30秒;56℃,30秒;72℃,30秒),最终延长(72℃,10分钟)。

3. 凝胶电泳:将PCR反应产物与DNA分子量标准物质一同加载到1%琼脂糖凝胶中进行电泳,以观察扩增产物的大小和纯度。

【结果与讨论】我们成功提取了10名志愿者的DNA样本,并进行了PCR扩增反应。

经凝胶电泳分析,我们发现所有样本均得到了预期大小约为500bp的PCR产物,说明PCR反应成功。

这也意味着我们成功地选择性扩增了我们感兴趣的基因区域。

在进一步的突变检测与分析中,我们采用了两种常见的方法:Sanger测序和Next Generation Sequencing(NGS)。

1. Sanger测序:我们从PCR产物中选择了5名志愿者的样本进行Sanger测序。

通过测序分析,我们检测到了一名志愿者的样本中存在一个已知的多态性突变,这与该志愿者的个人医疗史相符。

该突变是一种单核酸多态性(SNP),在基因座位的一对碱基上存在不同的碱基对。

我们对此突变进行了进一步的调查,并发现它与某种常见疾病的发生有关。

2. Next Generation Sequencing(NGS):我们选取了另外5名志愿者的样本进行NGS分析。

NGS是一种高通量测序技术,可以快速检测大量的突变信息。

通过NGS分析,我们发现了每位志愿者不同的突变谱系,包括单核酸多态性(SNPs)、插入、缺失和结构变异等。

检验科常见遗传性疾病检测方法

检验科常见遗传性疾病检测方法

检验科常见遗传性疾病检测方法遗传性疾病是指由遗传因素引起的疾病,它们可由异常基因或染色体异常所引起,包括单基因遗传病、染色体异常病和多因素遗传病等。

近年来,随着遗传学和分子生物学的不断发展,检验科常见遗传性疾病的检测方法也得到了极大的改善和突破。

本文将介绍几种常见的遗传性疾病检测方法。

一、基因突变检测方法基因突变是许多遗传性疾病的主要病因之一,准确检测基因突变对于早期预防、确诊和治疗具有重要意义。

常见的基因突变检测方法包括聚合酶链式反应(PCR)、限制性片段长度多态性分析(RFLP)、序列特异性引物扩增(SSP)和全基因组测序等。

这些方法通过检测基因的突变位点来确定是否携带异常基因,从而判断个体是否患有相关遗传性疾病。

二、染色体核型分析染色体异常是导致许多染色体异常病的重要原因。

染色体核型分析可以通过染色体的数量和结构来判断个体是否存在染色体异常。

目前常用的染色体核型分析方法包括常规染色体分析、高分辨率染色体分析和荧光原位杂交(FISH)等。

这些方法可以检测到染色体数目变异、核型异常和染色体片段的丢失或重复等异常情况,对于染色体异常病的确诊和预防具有重要意义。

三、蛋白质检测方法蛋白质是构成生物体的重要组成部分,许多遗传性疾病与蛋白质的合成、稳定性和功能异常有关。

蛋白质检测是一种常见的遗传性疾病检测方法,常用的蛋白质检测技术包括免疫印迹、质谱分析和酶联免疫吸附实验等。

通过检测特定蛋白质的表达水平和功能异常来判断个体是否患有相关遗传性疾病。

四、基因组学检测方法基因组学是研究个体所有基因组的学科,它通过全基因组测序、基因组关联分析和基因组编辑等技术,对遗传性疾病的发生机制和预测进行全面深入的研究。

基因组学检测方法已经成为了检测科学研究和临床医学中不可或缺的手段。

通过对个体基因组的全面分析,可以发现与遗传性疾病相关的新基因和突变位点,为疾病的预防、治疗和个体化医疗提供重要依据。

总结:随着科技的发展和进步,检验科常见遗传性疾病的检测方法也在不断更新和完善。

基因突变知识点总结

基因突变知识点总结

基因突变知识点总结基因突变是指在生物体的基因组中发生的突发性变异。

突变可能是由于DNA序列的改变、插入、删除或重排引起的。

它们对生物体的遗传物质产生了重要的影响,并且在进化和遗传疾病的研究中具有重要意义。

本文将对基因突变的一些关键知识点进行总结。

一、基因突变类型1. 点突变:指单个核苷酸的改变,包括错义突变、无义突变和同义突变。

错义突变是指导致氨基酸改变的突变,可能对蛋白质结构和功能产生重要影响。

无义突变则导致产生无效的早终止密码子,使蛋白质无法正常合成。

同义突变是指改变了DNA序列,但没有改变氨基酸序列。

2. 编码区突变:发生在基因的编码区,可能影响蛋白质的结构和功能。

这种突变可以导致单个蛋白质变体的产生,对生物体的表型产生重要影响。

3. 非编码区突变:发生在基因的非编码区,如启动子、增强子、剪接位点等。

这些突变可能导致基因的表达水平的改变,进而影响蛋白质的合成。

4. 染色体结构变异:这些变异包括插入、缺失和倒位等,是染色体上较大范围的突变。

染色体结构变异可能导致某些基因的重排,影响其表达水平。

二、基因突变的影响1. 遗传疾病:某些突变可以导致遗传疾病的发生。

例如,囊性纤维化是由导致蛋白质功能异常的突变引起的,该突变使得粘液在呼吸道和消化道中异常黏稠,影响器官的正常功能。

2. 进化:基因突变是进化过程中的重要因素。

突变可以导致新的基因型和表型的产生,并且在自然选择中起到关键作用。

有利突变有助于个体在环境中生存和繁殖,从而使其传递给后代。

3. 药物抗性:基因突变可能引起对药物治疗的耐药性。

某些基因的突变可以影响药物在体内的代谢和吸收,从而导致药物无效或变得不再适合治疗。

三、基因突变的检测方法1. 基因测序:基因测序是检测基因突变的主要方法之一。

通过测序技术,可以获得DNA序列信息,并发现其中的突变。

2. 多态性标记分析:多态性标记是指基因组中存在多种等位基因的位点。

通过分析这些多态性标记,可以间接检测基因突变。

检测基因突变的分子生物学方法

检测基因突变的分子生物学方法

检测基因突变的分子生物学方法
基因突变是继承性疾病和癌症等复杂疾病的主要原因之一。

因此,检测和识别基因突变是非常重要的。

分子生物学方法是检测基因突变的一种有效方法。

首先,聚合酶链反应(PCR)可以扩增目标基因片段,从而使基因
突变易于检测。

PCR可以使用单个引物或多个引物。

单个引物PCR用于检测点突变。

多个引物PCR用于检测插入或缺失突变,或者用于检测特定的基因组变异。

PCR产品可以通过测序或其他分析技术进行分析。

其次,测序技术是检测基因突变的常用方法。

Sanger测序是最
常用的测序方法。

它可以检测单个核苷酸突变和小片段缺失或插入。

新一代测序技术(NGS)可以检测大片段的基因组变异和复合突变。

NGS 需要高分辨率的生物信息学分析,这需要专业的计算机软件和硬件。

此外,单碱基多态性(SNP)分析也可以用于检测基因突变。

SNP
是常见的基因组变异,通常不会引起疾病,但它们可以用于确定遗传基因型并识别复杂疾病中的易感基因。

SNP可以使用PCR和测序技术检测。

综上所述,分子生物学方法是检测基因突变的有效方法之一。

在选择适当的技术和分析方法时,需要考虑到检测的目的、样品数量、分辨率和成本等因素。

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arms-pcr原理

arms-pcr原理

arms-pcr原理ARMS-PCR(Amplification Refractory Mutation System PCR)是一种检测和鉴定基因突变的方法。

它是通过PCR(聚合酶链式反应)技术来实现的。

ARMS-PCR技术的原理是利用引物的选择性扩增来检测目标序列中的突变位点。

ARMS-PCR的原理基于引物的选择性扩增。

在ARMS-PCR中,通常使用两对引物,一对用于扩增野生型基因序列,另一对用于扩增突变型基因序列。

这两对引物分别包含与野生型和突变型基因序列相匹配的引物。

当PCR反应进行时,如果样本中存在野生型基因,只有野生型引物才能与之匹配并进行扩增;反之,如果样本中存在突变型基因,只有突变型引物才能与之匹配并进行扩增。

ARMS-PCR的步骤如下:1. 设计引物:根据目标序列中的突变位点,设计一对与野生型基因序列完全匹配的引物,以及一对与突变型基因序列完全匹配的引物。

2. PCR反应:将待测样本DNA与引物一起添加到PCR反应体系中,进行PCR反应。

反应条件包括一般的PCR条件,如特定的温度和时间。

3. 扩增产物分析:将PCR反应产物进行电泳分析。

由于野生型引物只与野生型基因序列匹配,突变型引物只与突变型基因序列匹配,所以只有匹配的引物才能扩增出特定大小的产物。

通过分析电泳结果,可以判断样本中是否存在突变。

ARMS-PCR技术具有以下优点:1. 高度特异性:ARMS-PCR利用引物的选择性扩增,只有匹配的引物才能扩增出产物,因此具有高度特异性。

2. 高灵敏度:ARMS-PCR可以检测到极低水平的基因突变,因此对于一些低频突变的检测非常有优势。

3. 简单快速:ARMS-PCR只需要进行一次PCR反应即可完成检测,操作简单、快速。

4. 成本低廉:ARMS-PCR所需的试剂和仪器设备较为简单,成本较低。

ARMS-PCR技术在医学和生物学研究中具有广泛的应用。

例如,在临床诊断中,ARMS-PCR可用于检测患者是否携带某些致病基因突变,从而为疾病的预测和治疗提供依据。

基因突变的检测方法

基因突变的检测方法

基因突变的检测方法基因突变的检测方法基因突变的研已成为当今生命科学研究的热点之一,检测方法也随之迅速发展。

人类细胞癌基因的突变类型已如上所述,对于基因突变的检测,1985以前,利用Southern印迹法,可以筛选出基因的缺失、插入和移码重组等突变形式。

对于用该法法不能检测的突变,只能应用复杂费时的DNA序列测定分析法。

多聚酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)技术是突变研究中的最重大进展,使基因突变检测技术有了长足的发展,目前几乎所有的基因突变检测的分子诊断技术都是建立于PCR的基础之上,并且由PCR衍生出的新方法不断出现,目前已达二十余种,自动化程度也愈来愈高,分析时间大大缩短,分析结果的准确性也有很大很提高。

其中包括单链构象多态性(single-strand comformational polymorphism,SSCP)和异源双链分析法(heteroduplex analysis,HA)。

下面分别介绍几种PCR衍生技术及经典突变检测方法,可根据检测目的和实验室条件选择时参考。

PCR-SSCP法PCR-SSCP法是在非这性聚丙烯酰胺凝胶上,短的单链DNA和RNA分子依其大街基序列不同而形成不同构象,一个碱基的改变将影响其构象而导致其在凝胶上的移动速度改变。

其基本原理为单链DNA在中性条件下会形成二级结构,这种二级结构依赖于其碱基组成,即使一个碱基的不同,也会形成不同的二级结构而出刺同的迁移率。

由于该法简单快速,因而被广泛用于未知基因突变的检测。

用PCR-SSCP法检测小于200bp的PCR产物时,突变检出率可达70%-95%,片段大于400bp时,检出率仅为50%左右,该法可能会存在1%的假阳性率。

应用PCR-SSCP法应注意电泳的最佳条件,一般突变类型对检测的灵敏度无大的影响,同时该法不能测定突变的准确位点,还需通过序列分析来确定。

Sarkar等认为对于大于200bp的片段,用其RNA分子来做SSCP会提高其录敏度。

基因突变研究和进化分析方法

基因突变研究和进化分析方法

基因突变研究和进化分析方法引言:基因突变是生物进化中的重要驱动力,它对物种的适应性和生存能力产生了巨大的影响。

研究和进化分析基因突变的方法对于深入理解生物进化过程和物种适应性的形成具有重要意义。

本文将介绍基因突变的研究方法和进化分析方法,涵盖了突变检测、突变分析和进化树构建等方面。

一、基因突变检测方法1. PCR法聚合酶链反应(PCR)是一种常用的基因突变检测方法。

通过PCR技术,可以扩增目标基因片段,然后对扩增产物进行Sanger测序,从而检测和鉴定基因突变。

2. 整体基因组测序法整体基因组测序(WGS)是一种全面且高通量的基因突变检测方法。

通过对整个基因组进行测序,可以同时检测各种类型的突变,如单核苷酸变异、插入、缺失等,并且可以发现新的变异位点。

3. 筛选性测序法筛选性测序(targeted sequencing)是一种针对特定基因区域进行测序的方法。

这种方法可以提高突变检测的灵敏性和特异性,并且可以更快、更经济地获得突变信息。

二、基因突变分析方法1. 危害预测和功能分析基因突变的功能分析是理解突变对基因表达和蛋白质功能的影响的重要方法。

基因突变的危害预测通过计算突变对蛋白质稳定性、结构和功能的影响来评估突变的功能性。

2. 突变频率分析突变频率分析可以帮助确定哪些突变是司机突变(对肿瘤发生和发展具有关键作用的突变)或者是副突变(在肿瘤中存在但没有核心作用的突变)。

3. 突变效应预测突变效应预测可以评估基因突变对蛋白质结构和功能的重要影响。

这些方法可以预测突变对蛋白质稳定性、配体结合亲和力、结构稳定性等的影响。

三、进化树的构建方法1. 相似性比较方法相似性比较方法是构建进化树的经典方法之一。

通过比较不同物种或个体的基因序列或蛋白质序列的相似性,来推断它们之间的亲缘关系和进化关系。

2. 分子钟法分子钟法是一种基于基因或蛋白质序列的演化速率和进化模型来推测物种之间的进化时间的方法。

通过此方法,可以构建物种之间的进化树,并推断它们之间的进化时间。

第八章基因突变监测

第八章基因突变监测

可以预计,在 21世纪,新的高灵敏度、高检测密度、高输出量的突变 检测技术将使遗传性和非遗传性的基因突变的鉴定成为现实。基因治疗的 成功将根本性的改变医疗实践,分子医学的新时代已经来临。

结:
1.基因突变扫描方法有哪些?其基本程序是什么? 2.简述序列分析的大体步骤?
(二)突变诊断方法 1. 序列分析 第一代序列分析技术:以凝胶电泳为基础 第二代的技术包括高压毛细管电泳、超薄电泳和共振离子化光谱分析。 这些方法可使分析速度提高一个数量级。 第三代方法包括流氏细胞光度术对单个标记的碱基进行荧光检测。用 扫描隧道或原子力显微镜直接读出 DNA 序列。对 DNA 进行序列质谱 分析。用杂交法进行序列分析等。这些方法将使序列分析的效率提高 几个数量级,但是,实验方法需要不断成熟与完善。 DNA序列分析方法既是一种突变扫描方法,更是一种突变诊断方法。 对未知的突变来说,必须通过序列分析类鉴定突变的类型和位置。
第八章 基因突变的检测
方法与进展
(一) 突变扫描方法 1. 单链构象多样分析法(SSCP) 其原理在于在非变性条件下一个单链DNA分子会依据其碱基序 列而形成独特的构象。一个单一碱基变化就会引起其构象的改变。 因此,当这两个分子同时在非变性条件下电泳时,他们会出现在 不同的位置,从而区分开来。由于DNA是双链分子,在电泳图谱 上就会出现两条正常带和两条突变带。
一些与疾病相关的基因探针在不断地出现,在不久的将来会有更大容量的基 因探针问世。
随着疾病基因的不断发现,今后的研究将不再局限于确定单个基因产 物对一两个基因的调控,而是要了解一个基因及其突变体在细胞水平上对 所有基因表达的影响。只有通过这样的实验研究才能全面确定一个突变基 因如何在细胞内改变基因表达的标志,从而引起细胞分裂的失控(癌症), 细胞坏死(衰老),细胞代谢的紊乱等等。为了达到这个目的,一些新技 术在不断涌现,如DNA微型组合技术就是 将寡聚核苷酸或cDNA片段固定 到玻璃片上,然后用DNA杂交来观察其基因转录情况。另一种大规模分析 基因转录的方法称为基因表达的系列分析法(SAGE)。其原理是用两个 内切酶将每一个cDNA缩短成10-14各碱基的序列标签,然后用DNA连接酶 连接这些小的标签。在PCR扩增和酶切后,再将这些序列标签连接起来, 通过克隆和序列分析来鉴定基因表达。(详见相关文献)

检测基因点突变的方法

检测基因点突变的方法

检测基因点突变的方法
检测基因点突变的方法有多种,常见的方法包括:
1. PCR扩增法:PCR是一种分子生物学技术,可用于扩增DNA片段。

在检测基因点突变时,可根据已知的突变位点设计适当的引物,通过PCR扩增得到目标基因的片段,然后对扩增产物进行测序,以检测该位点是否发生了突变。

2. 基因芯片技术:基因芯片是一种高通量检测技术,可以同时检测上千个基因位点。

在检测基因点突变时,将待检测样本中的DNA片段杂交到含有数千个不同基因探针的芯片上,经过染色体成像和数据分析,可以得出样本中每个位点的基因型。

3. NGS技术:全称为“下一代测序技术”,是一种高通量测序技术。

NGS可以快速、准确地测序整个基因组或特定基因区域,从而检测基因点突变。

4. Sanger测序法:Sanger测序法是一种传统的测序技术,通过反复扩增、合成和分离DNA 片段来确定DNA序列。

在检测基因点突变时,可以使用Sanger测序法对目标基因的特定区域进行测序,从而检测该区域是否发生了突变。

总之,以上方法都有其优缺点,选择合适的方法需要考虑到样本数量、检测精度、成本等多个因素。

mk突变检验原理

mk突变检验原理

mk突变检验原理MK突变检验原理是一种用于检测基因突变的分子生物学技术。

它基于PCR扩增技术和DNA测序技术,可以快速、准确地检测出基因中的突变。

本文将从MK突变检验的原理、应用和优缺点等方面进行阐述。

一、MK突变检验的原理MK突变检验是一种基于PCR扩增技术的突变检测方法。

它利用PCR扩增目标基因的片段,然后通过DNA测序技术来确定突变的存在与否。

具体步骤如下:1. 样品处理:首先,需要从样品中提取出目标基因的DNA。

常用的提取方法包括酚/氯仿法、盐法和商业化的DNA提取试剂盒等。

2. PCR扩增:将提取的DNA作为模板,利用特异性引物在PCR反应中扩增出目标基因的片段。

引物的设计需要根据目标基因的序列进行合理选择,以确保扩增的特异性和效率。

3. PCR产物纯化:将PCR反应产物进行纯化,去除杂质和未反应的引物、引物二聚体等。

4. DNA测序:将纯化的PCR产物送至测序机构进行DNA测序,获得目标基因片段的序列信息。

5. 数据分析:通过比对测序结果与参考序列,分析目标基因中是否存在突变。

常用的序列比对软件有BLAST、CLUSTAL等。

二、MK突变检验的应用MK突变检验可以广泛应用于基因突变的检测和分析。

以下是一些常见的应用场景:1. 遗传病筛查:MK突变检验可以用于遗传病的筛查,帮助确定致病基因的突变类型和位置。

通过检测突变基因可以帮助家庭了解遗传病的风险,进行遗传咨询和生殖选择。

2. 药物敏感性检测:MK突变检验可以用于检测肿瘤细胞中的突变基因,帮助确定肿瘤对某些药物的敏感性。

这对于个体化药物治疗的选择具有重要意义。

3. 病原体检测:MK突变检验可以应用于病原体的检测,帮助确定病原体的种类和毒力因子的变异情况。

这对于疾病的防控和诊断具有重要意义。

4. 基因编辑验证:MK突变检验可以用于验证基因编辑技术的效果。

通过检测编辑后的基因序列,可以判断是否成功实现了目标基因的修饰。

三、MK突变检验的优缺点MK突变检验作为一种常用的突变检测技术,具有以下优点:1. 高灵敏度:MK突变检验可以检测到非常低浓度的突变基因,对于突变的敏感性较高。

基因编码中的突变检测技术

基因编码中的突变检测技术

基因编码中的突变检测技术随着基因技术的日益发展,人类越来越了解自身的基因组,这对于人类健康、疾病预防和治疗方面起到了重大作用。

然而,基因组的突变是遗传疾病和癌症等疾病的主要原因之一,因此,有效地检测基因组中的突变对于诊断和治疗疾病非常重要。

基因突变是一种基因组序列的变化,包括单基因的突变、染色体结构的突变和染色体数目的突变。

单基因突变是指基因组序列中单个核苷酸的变化,而染色体结构突变则是指染色体不完整或损坏。

染色体数目突变则是指染色体数目增加或缺失。

因此,一些基因编码中的突变检测技术的发展,可以更准确地识别和定位这些变化。

在基因编码中,突变检测技术有多种方法。

包括聚合酶链反应(PCR)、测序(Sanger测序和高通量测序)、电泳、基因芯片等。

PCR技术是一种通过放大DNA特定区域的技术。

PCR技术可以在特定的温度和热循环下放大一段DNA序列,并检测导致突变的变异。

然而,PCR技术只能检测已知的基因片段,不适用于整个基因组的检测。

Sanger测序是一种在DNA序列中检测突变的基础方法。

这种技术通过酶切或PCR扩增特定DNA片段,并用荧光染料标记,然后用DNA分离和测序技术来确定DNA序列。

虽然Sanger测序技术已经被广泛应用于基本研究和临床诊断,但它需要大量时间和人力,并且适用于单个基因的检测。

高通量测序技术是一种以较快的速度对大量DNA序列进行检测的方法。

高通量测序技术可以在较短时间内检测大量的基因序列,因为它可以同时读取多个序列,并检测突变。

然而,高通量测序技术虽然可以检测突变,但需要对数据进行处理和解释,并且检测的成本也较高。

除此之外,电泳和基因芯片也是常用的检测基因编码中的突变的技术。

其中,电泳是一种用于检测DNA和RNA序列长度的技术,可以检测DNA序列的碎片和分子量。

基因芯片则是一种通过分析DNA序列上的单核苷酸多态性(SNP)来检测突变的技术,因为SNP在不同个体中的变异率很高。

总之,基因编码中的突变检测技术可以在基本研究和临床诊断等方面发挥关键作用。

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基因突变的检测方法基因突变的检测方法基因突变的研已成为当今生命科学研究的热点之一,检测方法也随之迅速发展。

人类细胞癌基因的突变类型已如上所述,对于基因突变的检测,1985以前,利用Southern印迹法,可以筛选出基因的缺失、插入和移码重组等突变形式。

对于用该法法不能检测的突变,只能应用复杂费时的DNA序列测定分析法。

多聚酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)技术是突变研究中的最重大进展,使基因突变检测技术有了长足的发展,目前几乎所有的基因突变检测的分子诊断技术都是建立于PCR的基础之上,并且由PCR衍生出的新方法不断出现,目前已达二十余种,自动化程度也愈来愈高,分析时间大大缩短,分析结果的准确性也有很大很提高。

其中包括单链构象多态性(single-strand comformational polymorphism,SSCP)和异源双链分析法(heteroduplex analysis,HA)。

下面分别介绍几种PCR衍生技术及经典突变检测方法,可根据检测目的和实验室条件选择时参考。

PCR-SSCP法 PCR-SSCP法是在非这性聚丙烯酰胺凝胶上,短的单链DNA和RNA分子依其大街基序列不同而形成不同构象,一个碱基的改变将影响其构象而导致其在凝胶上的移动速度改变。

其基本原理为单链DNA在中性条件下会形成二级结构,这种二级结构依赖于其碱基组成,即使一个碱基的不同,也会形成不同的二级结构而出刺同的迁移率。

由于该法简单快速,因而被广泛用于未知基因突变的检测。

用PCR-SSCP法检测小于200bp的PCR产物时,突变检出率可达70%-95%,片段大于400bp时,检出率仅为50%左右,该法可能会存在1%的假阳性率。

应用PCR-SSCP法应注意电泳的最佳条件,一般突变类型对检测的灵敏度无大的影响,同时该法不能测定突变的准确位点,还需通过序列分析来确定。

Sarkar等认为对于大于200bp的片段,用其RNA分子来做SSCP会提高其录敏度。

应用PCR-SSCP检测点突变已见报道于人类大部分的肿瘤组织或细胞,如乳腺癌、食管癌、肺癌、胃癌、肝癌、胰腺癌等。

检测的基因包括多种癌基因及抑癌基因,也是检测抑癌基因p53突变最常用的方法,仅检测第5-8外显子即可发现85%以上的p53基因突变。

由于该法简便快速,特别适合大样本基因突变研究的筛选工作。

异源双链分析法(HA) HA法直接在变性凝胶上分离杂交的突变型一野生型DNA双链。

由于突变和野生型DNA形成的异源杂合双链DNA在其错配处会形成一突起,在非变性凝胶中电泳时,会产生与相应的同源双DNA不同的迁移率。

该法与SSCP相似,所不同的是SSCP分离的是单链DNA,HA法分离的是双链DNA,也只适合于小片段的分析。

但HA对一些不能用SSCP 检出的突变有互补作用,两者结合使用,可使突变检出率提高到近100%。

突变体富集PCR法(mutant-enriched PCR)本法的基本原理是利用ras基因家族某个密码子部位存在已知的限制性内切酶位点,如K-ras基因第12密码子的BstNI位点,第13密古巴子有BgⅠⅡ位点。

用链续二次的巢式PCR来扩增包括K-ras第12、13密码子的DNA片段,在两次扩增反应之间用相应的内切酶消化扩增的DNA片段,野生型因被酶切而不能进入第二次PCR扩增,而突变型则能完整进入第二次PCR扩增并得到产物的富集。

变性梯度凝胶电泳法(denaturing gradinent electrophoresis,DGGE) DGGE法分析PCR 产物,如果突变发生在最先解链的DNA区域,检出率可达100%,检测片段可达1kb,最适围为100bp-500bp。

基本原理基于当双链DNA在变性梯度凝胶中进行到与DNA变性湿度一致的凝胶位置时,DNA发生部分解链,电泳适移率下降,当解链的DNA链中有一个碱基改变时,会在不同的时间发生解链,因影响电泳速度变化的程而被分离。

由于本法是利用温度和梯度凝胶迁移率来检测,需要一套专用的电泳装置,合成的PCR引物最好在5`末端加一段40bp-50bp的GC夹,以利于检测发生于高熔点区的突变。

在DGGE的基础上,又发展了用湿度梯度代替化学变性剂的TGGE法(温度梯度凝胶电泳temperature gradient gelelectrophoresis,TGGE)。

DGGE和TGGE均有商品化的电泳装置,该法一经建立,操作也较简便,适合于大样本的检测筛选。

化学切割错配法(chemical cleavage of mismatch,CCM)CCM为在Maxam-Gilbert测序法的基础上发展的一项检测突变的技术,其检测突变的准确性可与DNA测序相仿。

其基本原理为将待测含DNA片段与相应的野生型DNA片段或DNA和RNA片段混俣变性杂交,在异源杂合的双链核酸分子中,错配的C能被羟胺或哌啶切割,错配的T能被四氧化饿切割,经变性凝胶电泳即可确定是否存在突变。

该法检出率很高,也是检片段最长的方法,已有报功检测了1.7kb片段,如果同时对正、反义链进行分析,检出率可达100%。

应用荧光检测系统可增强敏感度,可检测到10个细胞中的1个突变细胞。

该法中的化学试剂有毒,又发展了碳二亚胺检测法(catodiimide,CDI),CDI为无毒物质,也可检测大片段DNA的点突变。

等位基因特异性寡核苷酸分析法(allele-specific oligonucleotide,ASO) ASO为一种以杂交为基础对已知突变的检测技术。

以PCR和ASO相结合,设计一段20bp左右的寡核苷酸片段,其中包含了发生突变的部位,以此为探针,与固定在膜上的经PCR拉增的样品DNA杂交。

可以用各种突变类型的寡核苷酸探针,同时以野生型探针为对照,如出现阳性杂交带,则表运河样品中存在与该ASO探针相应的点突变,ASO需严格控制杂交条件和设置标准对照避免假阳性和假阴性。

目前已有商品化的检测盒检测部分癌基因ASO突变。

DNA芯片技术(DNA chip) DNA芯片技术是90年代后发展的一项DNA分析新技术,它集合了集成电路计算机、激光共聚焦扫描、荧光标记探针和DNA合成等先进技术。

可用于基因定位、DNA测序、物理图谱和遗传图谱的构建等。

在基因突变检测方面DNA芯片也有广阔的前景,其基本原理为将许多已知序列的寡核苷酸DNA排列在1块集成电路板上,彼此之间重叠1个碱基,并覆盖全部所需检测的基因,将荧光标记的正常DNA和突变DNA发别与2块DNA 芯片杂交,由于至少存在1个碱基的差异,正常和突变的DNA将会得到不同的杂交图谱,经过共聚集显微镜分别检测两种DNA分子产生的荧光信号,即可确定是否存在突变,该方法快速简单、片动化程度高,具有很大的发展潜力,将在基因突变检测中心发挥非常重要的作用。

连接酶链反应(ligase chain reaction,LCR)与其他核酸扩增技术比较,其最大特点为可准确区分基因序列中单个基因突变,由Landegree于1988年首次应用于镰刀奖细胞贫血的分子诊断。

LCR是以DNA连接酶将某一DNA链的5`-磷酸与另一相邻链3`-羟基连接为基础,应用两对互补的引物,双链DNA经加热变性后,两对引物分别与模板复性,若完全互补,则在连接酶的作用下,使相邻两引物的5`-磷酸与3`-羟基形成磷酸二酯二酯键而连接,前一次的连接产物又作为下一次循环反应的模板,如果配对的碱基存在突变则不能连接和扩增。

LCR产物检测最初是通过这32p标记上游引物3`未端,经变性凝胶电泳分离后放射自显影加以鉴定,其检测敏感性达到200个靶分子。

也可设计1个横跨两引物的检测探针,用它与LCR产物进行杂交检测。

近年有应用荧光素、地高辛等非核素标记方法。

Batt在1994年发展了一种更为简的方法,好微孔板夹心杂交法。

由于LCR的快速、特蛋和敏感的特性,以及能检测单个碱基突变的能力,因此被应用于肿瘤基因突变的分子诊断,并与PCR结合用以提高其敏感性。

等位基因特异性扩增法(Allele-specific amplification,ASA)ASA于1989年建立,是PCR 技术应用的发展,也称扩增阻碍突变系统(amplification refractory mutation system,ARMS)、等位基因特性PCR(allele-specific PCR,ASPCR)等,用于对已知突变基因进行检测。

该法通过设计两个5`端引物,一个与正常DNA互补,一个与突变DNA互补,对于纯合性突变,分别加入这两种引物及3`端引物进行两个平行PCR,吸有与突变DNA完互补的引物才可延伸并得到PCR扩增产物。

如果错配位于引物的3`端则导致PCR不能延伸,则称为ARMS。

ARMS和ASPCR借鉴多重PCR原理,可在同一系统中同时检测两种或多种等位基因突变位点。

ASA法的检出率依赖于反应条件的优化和可能发生的引物与靶DNA有氏配时错配延伸,特别是当错配碱基为G:T时,这时可通过调整实验条件如引物靶DNA,Taq DNA 聚合酶的浓度等来得高瓜在特异性。

在反应体系中加入甲酰胺也可减少非特异性扩增。

还可通过在引物3`端的第二个碱基引入一个错配碱基,使之与模板之间形成双重错配以阻止错误延伸。

RNA酶A切割法(RNase A cleavage)在一定条件下,氨基源双链核酸分子RNA:RNA或RNA:DNA中的错配碱基可被RNaseA切割,切割产物可通过变性凝胶电泳分离。

当RNA探针上错配的碱基为嘌呤时,RNaseA在错配处的切割效率很低,甚至不切割,而当错配碱基为嘧啶时,则其切割效率较高。

故如果仅分析被检DNA的一个条链,突变检出率只有30%,如同时分析正义和反义二条链,检出率可达70%。

该法需要制备RNA探针,增加了操作的复杂性,但可用于1-2kb的大片段进行检测,并能确定突变位点。

于这些优越性,它仍被作为一种经典方法用于对未知突变进行分析。

染色体原位杂交(In situ hybridization of chromosome)染色体发现距今已有150多年的历史,染色体检测被广泛用于动、植物及人类的细胞遗传学研究,随着染色体分技术和分子生物学技术的发展。

染色体研究范围也不断扩大,特别是用于肿瘤分子诊断。

肿瘤细胞的染色体变化是一非常普遍的现象,可分为原发和继发两类。

在肿瘤形成的生物学基础方面,原发性的染色体变化与引起肿瘤的直接原因有关,肿瘤细胞中可以发现各种形式的染色体畸变,如缺失、重复、易位、重排、单体断裂及核内复制等;继发性变化主要是肿瘤细胞核型的改变。

染色体的检测对于肿瘤的诊断、鉴别诊断、生物学行为判别等方面都重要意义。

染色体的检测方法进展很快,检测的精确率也不断提高,这里主要介绍荧光原位杂交和PRINS 法。

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