使用Fragstats 33计算景观格局指数的详细步骤
指数含义
现在景观格局研究普遍采用Fragstats 3.3软件计算格局指数,我在写文章的过程中也使用了这一软件,期间也遇到不少问题,幸得高人指点和自己不断摸索(当时网上鲜有使用方法),终于把数据算出来了,现在把使用过程中遇到的一些问题与方法写出来,希望对后来者有些帮助,在写这个的过程中,参考了一些朋友的意见。
Fragstats 33软件的安装如果你装了arcgis软件,那么Fragstats 3.3可以直接使用。
下载下来的文件解压缩后,双击便可以使用,注意,要保证你的ArcGIS 是运行的状态。
环境变量的设置打开软件后,看你的是“ARCGRID disabled”还是“ARCGRID enabled”,如果是后则,可以直接使用,如果是前者,学要设置环境变量。
步骤:我的电脑->属性->高级->环境变量,在系统变量那里,新建,变量名为path,变量值为X:\ESRI\AV_GIS30\ARCVIEW\BIN32,X为Arcview 安装所在的盘符。
或者是C:\Program Files\ArcGIS\Bin,C为Arcview安装所在的盘符,一般默认安装在C盘上。
这样你的软件就能用了。
数据准备因为这个软件支持的是grid格式的数据,所以需要将手上的coverage、shape文件转换为grid格式的文件,用来运算。
转换可以在Arcview里面进行,或者Arcmap都可以。
以Arcmap为例: A、调出 B、转换为grid:feature to raster如果想要grid按照你所设定的形状进行计算,可以进行裁剪。
且可以保证背景的完整性。
以Arcview为例: ert to Grid来生成。
加载空间分析模块的方法:File->Extensions,选择Spatial Analyst,ok。
属性文件的制定(一般的计算景观格局的就不需要这一步,但是要计算moving widow的话就需要用到了)新建txt文件,格式如下:ClassID , ClassName , Status , isBackground1 , shrubs , true , false2 , conifers , true , false3 , deciduous , true , false4 , other , false , true注意:每个之间用空格键和逗号隔开。
fragstats软件中景观格局指标解读
景观指数英文及简称索引二景观指数英文及简称索引最近整理的Fragstats3.3软件Grid格式下可以计算的景观指数,希望大家共同学习探讨(注:每个景观指数包含的信息依次为英文缩写——英文全称——指标名称——应用尺度——单位)一、面积指标1.Area/Perimeter①AREA(CSD、CPS/LSD、LPS)——Patch Area——斑块面积(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——ha(ha、%) ≥02.Isolation/Proximity①LSIM——Landscape Similarity Index——斑块相似系数——斑块——%3.Area/Density/Edge①CA——Total Class Area——斑块类型面积——类型——ha>0②PLAND(%LAND)——Percentage of Landscape——斑块所占景观面积比例——类型——% [0,100]③TA——Total Landscape Area——景观面积——景观——ha>0④LPI——Largest Patch Index——最大斑块占景观面积比例——类型/景观——%二、密度大小及差异1.Area/Density/Edge①NP——Number of Patches——斑块数量——类型/景观——n ≥1②PD——Patch Density——斑块密度——类型/景观——n/100ha③AREA(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MPS、PSSD、PSCV)——Patch Area (Mean、Standard Deviation、Coefficient of Variation)——斑块大小(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)(斑块平均大小、斑块面积方差、斑块面积均方差)——类型/景观——ha(ha,%,%)④GYRA(同上)——Radius of Gyration——回转半径——类型/景观——m三、边缘指标1.Area/Perimeter①PERIM(CSD、CPS/LSD、LPS)——Patch Perimeter——斑块周长(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——m ≥0②GYRA(同上)——Radius of Gyration——回转半径——斑块——m2.Contrast①EDCON(同上)——Edge Contrast Index——边缘对比度——斑块——%3.Area/Density/Edge①TE——Total Edge——总边缘长度——类型/景观——m②ED——Edge Density——边缘密度——类型/景观——m/ha4.Contrast①CWED——Contrast-Weighted Edge Density——对比度加权边缘密度——类型/景观——m/ha②TECI——Total Edge Contrast Index——总边缘对比度——类型/景观——%③ECI(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MECI、AWMECI)——Edge Contrast Index(Mean Edge Contrast Index、Area-Weighted Mean Contrast Index)——边缘对比度(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)(平均边缘对比度、面积加权平均边缘对比度)——类型/景观——%(%,%)四、形状指标1.Shape①PARA(CSD、CPS/LSD、LPS)——Perimeter Area Ratio——边缘面积比(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——无②SHAPE(同上)——Shape Index——形状指标——斑块——无③FRACT(同上)——Fractal Dimension Index——分维数——斑块——无[1,2]④CRICLE(同上)——Related Circumscribing Circle——相关外接圆——斑块——无⑤CONTIG(同上)——Contiguity Index——聚集指数——斑块——无2.Area/Density/Edge①LSI——Landscape Shape Index——景观形状指数——类型/景观——无②NLSI——Normalize LSI——标准化景观形状指数——类型——无3.Shape①PAFRAC——Perimeter Area Fractal DImension——边缘面积分维——类型/景观——无②PARA(MN、AM、MD、RA、SD、CV)——Perimeter Area Ratio——边缘面积比(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)——类型/景观——无③SHAPE(同上)(MSI、AWMSI)——Shape Index(Mean Shape Index、Area-Weighted Mean Shape Index)——形状指数(平均形状、面积加权的平均形状指标)——类型/景观——无④FRAC(同上)(MPFD、AWMPFD)——Fractal Dimension Index(Mean Patch Fractal Dimension、Area-Weighted Patch Fractal Dimension)——分维数(平均斑块分维数、面积加权的平均斑块分维数)——类型/景观——无[1,2]⑤CRICLE(同上))——Related Circumscribing Circle——相关外接圆——类型/景观——无⑥DLFD——Double Log Fractal Dimension——双对数分维数——类型/景观——无五、核心面积指标1.Core Area①Core(CSD、CPS/LSD、LPS)——Core Area——核心斑块面积(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——ha②NCORE(同上)——Number of Core Area——核心斑块数量——斑块——n ≥1③CAI(同上)——Core Area Index——核心斑块面积比指标——斑块——%2.Core Area①TCA——Total Core Area——核心斑块总面积——类型/景观——ha②CPLAND(C%LAND)——Core Area Percentage of Landscape——核心斑块占景观面积比——类型——%③NDCA——Number of Disjunct Core Area——独立核心斑块数量——类型/景观——n④DCAD——Disjunct Core Area Density——独立核心斑块密度——类型/景观——n/100ha⑤CORE(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MCA1、CASD1、CACV1)——Core Area(Mean Core Area、Core Area Standard Deviation、Core Area Coefficient of Variation)——核心斑块面积(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)(平均核心斑块面积、核心斑块面积方差、核心斑块面积均方差)——类型/景观——ha(ha,ha,%)⑥DCA(同上)(MCA2、CASD2、CACV2)——Disjunct Core Area——独立核心斑块面积(平均独立核心斑块面积、独立核心斑块面积方差、独立核心面积均方差)——类型/景观——ha(ha,ha,%)⑦CAI(同上)(MCAI)——Core Area Index(Mean Core Area Index)——核心斑块指标(平均核心斑块指标)——类型/景观——%六、邻近度指标1.Isolation/Proximity①PROXIM(CSD、CPS/LSD、LPS)——Proximity Index——邻近度(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——无②SIMI(同上)——Similarity Index——相似度——斑块——无③ENN(同上)——Euclidean Nearest Neighbor Index——欧几里得最邻近距离——斑块——m2.Isolation/Proximity①PROXIM(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MPI)——Proximity Index(Mean Proximity Index)——邻近度(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)(平均邻近度指标)——类型/景观——%(%) ≥0②SIMI(同上)——Similarity Index——相似度——类型/景观——无③ENN(同上)(MNN、NNSD、NNCV)——Euclidean Nearest NeighborIndex(Mean Euclidean Nearest-Neighbor Index、Euclidean Nearest-Neighbor Index Standard Deviation、Euclidean Nearest-Neighbor Index Coefficient of Variation)——欧几里得最邻近距离(平均最近距离、最邻近距离方差、最邻近距离标准差)——类型/景观——m(m,m,%) >0七、多样性1.Diversity①PR——Patch Richness——斑块多度(景观丰度)——景观——n ≥1②PRD——Patch Richness Density——斑块多度密度——景观——n/100ha③RPR——Relative Patch Richness——相对斑块多度——景观——%④SHDI——Shannon's Diversity Index——香农多样性指标——景观——无⑤SIDI——Simpson's Diversity Index——Simpson多样性指标——景观——无⑥MSHDI——Modified Simpson's Diversity Index——修正Simpson多样性指标——景观——无⑦SHEI——Shannon's Evenness Index——香农均匀度指标——景观——无[0,1]⑧SIEI——Simpson's Evenness Index——Simpson均匀度指标——景观——无⑨MSIEI——Modified Simpson's Evenness Index——修正Simpson均匀度指标——景观——无八、聚散性1.Contagion/Interspersion①CLUMPY——Clumpiness——丛生度——类型——%②PLADJ——Proportion of Like Adjacency——相似毗邻百分比——类型/景观——% (0,100]③AI——Aggregation Index——聚集度指数——类型/景观——% (0,100]④IJI——Interspersion Juxtaposition Index——散布于并列指数——类型/景观——% (0,100]⑤DIVISION——Landscape Division Index——景观分割度——类型/景观——% (0,100]⑥SPLIT——Splitting Index——分离度指数——类型/景观——% (0,100]⑦MESH——Effective Mesh Size——有效粒度尺寸——景观——% (0,100]2.Connectivity①COHESION——Patch Cohesion Index——斑块结合度——类型/景观——% (0,100]②CONNECT——Connectance Index——连接性指数——类型/景观——% (0,100]3.Contagion/Interspersion①CONTAG——Contagion Index——蔓延度指数——景观——% (0,100](注:以上仅为参考,具体仍需查阅专业文献)三各种景观指数的生态学含义1.拼块类型面积(CA),单位:ha,范围:CA>0公式描述:CA等于某一斑块类型中所有斑块的面积之和(m2),除以10000后转化为公顷(ha);即某斑块类型的总面积。
Fragstats使用方法及景观指数生态学含义
F r a g s t a t s使用方法及景观指数生态学含义-CAL-FENGHAI.-(YICAI)-Company One1Fragstats 使用方法及景观指数生态学含义Fragstats 33软件的安装如果你装了arcgis软件,那么Fragstats 可以直接使用。
下载下来的文件解压缩后,双击便可以使用,注意,要保证你的ArcGIS是运行的状态。
环境变量的设置打开软件后,看你的是“ARCGRID disabled”还是“ARCGRID enabled”,如果是后则,可以直接使用,如果是前者,学要设置环境变量。
步骤:我的电脑->属性->高级->环境变量,在系统变量那里,新建,变量名为path,变量值为X:ESRIAV_GIS30ARCVIEWBIN32,X为Arcview安装所在的盘符。
或者是C:Program FilesArcGISBin,C为Arcview安装所在的盘符,一般默认安装在C盘上。
这样你的软件就能用了。
数据准备因为这个软件支持的是grid格式的数据,所以需要将手上的coverage、shape文件转换为grid格式的文件,用来运算。
转换可以在Arcview里面进行,或者Arcmap都可以。
以Arcmap为例: A、调出 B、转换为grid:feature to raster如果想要grid按照你所设定的形状进行计算,可以进行裁剪。
且可以保证背景的完整性。
以Arcview为例: ert to Grid来生成。
加载空间分析模块的方法:File->Extensions,选择Spatial Analyst,ok。
属性文件的制定新建txt文件,格式如下:ClassID , ClassName , Status , isBackground1 , shrubs , true , false2 , conifers , true , false3 , deciduous , true , false4 , other , false , true注意:每个之间用空格键和逗号隔开。
Fragstats使用说明
Fragstats使用说明Fragstats 使用说明现在景观格局研究普遍采用Fragstats 3.3软件计算格局指数我在写文章的过程中也使用了这一软件期间也遇到不少问题幸得高人指点和自己不断摸索当时网上鲜有使用方法终于把数据算出来了现在把使用过程中遇到的一些问题与方法写出来希望对后来者有些帮助在写这个的过程中参考了一些朋友的意见。
Fragstats 33软件的安装如果你装了arcgis软件那么Fragstats 3.3可以直接使用。
下载下来的文件解压缩后双击便可以使用注意要保证你的ArcGIS是运行的状态。
环境变量的设置打开软件后看你的是―ARCGRID disabled‖还是―ARCGRID enabled‖如果是后则可以直接使用如果是前者学要设置环境变量。
步骤我的电脑-gt 属性-gt高级-gt环境变量在系统变量那里新建变量名为path变量值为X:ESRIAV_GIS30ARCVIEWBIN32X为Arcview安装所在的盘符。
或者是C:Program FilesArcGISBinC为Arcview 安装所在的盘符一般默认安装在C盘上。
这样你的软件就能用了。
数据准备因为这个软件支持的是grid格式的数据所以需要将手上的coverage、shape文件转换为grid格式的文件用来运算。
转换可以在Arcview里面进行或者Arcmap都可以。
以Arcmap为例A、调出B、转换为gridfeature to raster 如果想要grid按照你所设定的形状进行计算可以进行裁剪。
且可以保证背景的完整性。
以Arcview为例ert to Grid来生成。
加载空间分析模块的方法File-gtExtensions选择SpatialAnalystok。
属性文件的制定新建txt文件格式如下ClassID ClassName Status isBackground 1 shrubs true false 2 conifers true false 3 deciduous true false 4 other false true 注意每个之间用空格键和逗号隔开。
Fragstats 使用说明
现在景观格局研究普遍采用Fragstats3.3软件计算格局指数,我在写文章的过程中也使用了这一软件,期间也遇到不少问题,幸得高人指点和自己不断摸索(当时网上鲜有使用方法),终于把数据算出来了,现在把使用过程中遇到的一些问题与方法写出来,希望对后来者有些帮助,在写这个的过程中,参考了一些朋友的意见。
Fragstats 33软件的安装如果你装了arcgis软件,那么Fragstats 3.3可以直接使用。
下载下来的文件解压缩后,双击便可以使用,注意,要保证你的ArcGIS是运行的状态。
环境变量的设置打开软件后,看你的是“ARCGRID disabled”还是“ARCGRID enabled”,如果是后则,可以直接使用,如果是前者,学要设置环境变量。
步骤:我的电脑->属性->高级->环境变量,在系统变量那里,新建,变量名为path,变量值为X:\ESRI\AV_GIS30\ARCVIEW\BIN32,X为Arcview安装所在的盘符。
或者是C:\Program Files\ArcGIS\Bin,C为Arcview安装所在的盘符,一般默认安装在C盘上。
这样你的软件就能用了。
数据准备因为这个软件支持的是grid格式的数据,所以需要将手上的coverage、shape文件转换为grid格式的文件,用来运算。
转换可以在Arcview里面进行,或者Arcmap都可以。
以Arcmap 为例:A、调出B、转换为grid:feature to raster如果想要grid按照你所设定的形状进行计算,可以进行裁剪。
且可以保证背景的完整性。
以Arcview为例:ert to Grid来生成。
加载空间分析模块的方法:File->Extensions,选择Spatial Analyst,ok。
属性文件的制定新建txt文件,格式如下:ClassID , ClassName , Status , isBackground1 , shrubs , true , false2 , conifers , true , false3 , deciduous , true , false4 , other , false , true注意:每个之间用空格键和逗号隔开。
Fragstats3.3使用方法及景观指数生态学含义
Fragstats3.3使用方法及景观指数生态学含义现在景观格局研究普遍采用Fragstats3.3软件计算格局指数,我在写文章的过程中也使用了这一软件,期间也遇到不少问题,幸得高人指点和自己不断摸索(当时网上鲜有使用方法),终于把数据算出来了,现在把使用过程中遇到的一些问题与方法写出来,希望对后来者有些帮助,在写这个的过程中,参考了一些朋友的意见。
Fragstats 33软件的安装如果你装了arcgi s软件,那么Fragstats 3.3可以直接使用。
下载下来的文件解压缩后,双击便可以使用,注意,要保证你的ArcGIS 是运行的状态。
环境变量的设置打开软件后,看你的是“ARCGRID disabled”还是“ARCGRID enabled”,如果是后则,可以直接使用,如果是前者,学要设置环境变量。
步骤:我的电脑->属性->高级->环境变量,在系统变量那里,新建,变量名为path,变量值为X:\ESRI\AV_GIS30\ARCVIEW\BIN32,X为Arcview安装所在的盘符。
或者是C:\Program Files\ArcGIS\Bin,C为Arcview安装所在的盘符,一般默认安装在C盘上。
这样你的软件就能用了。
数据准备因为这个软件支持的是grid格式的数据,所以需要将手上的coverage、shape文件转换为grid格式的文件,用来运算。
转换可以在Arcview里面进行,或者Arcmap都可以。
以Arcmap为例:A、调出B、转换为grid:feature to raster如果想要grid按照你所设定的形状进行计算,可以进行裁剪。
且可以保证背景的完整性。
以Arcview为例:ert to Grid来生成。
加载空间分析模块的方法:File->Extensions,选择Spatial Analyst,ok。
属性文件的制定新建txt文件,格式如下:ClassID , ClassName , Status , isBackground1 , shrubs , true , false2 , conifers , true , false3 , deciduous , true , false4 , other , false , true注意:每个之间用空格键和逗号隔开。
Fragstats3.3景观指数含义
Fragstats 3.3 使用方法及景观指数生态学含义(偶尔伪技术一下)来源:帅莱的日志Fragstats 3.3 软件的安装如果你装了arcgis软件,那么Fragstats 3.3可以直接使用。
下载下来的文件解压缩后,双击便可以使用,注意,要保证你的ArcGIS是运行的状态。
环境变量的设置打开软件后,看你的是“ ARCGRIDdisabled ”还是“ ARCGRIISnabled ",如果是后则,可以直接使用,如果是前者,学要设置环境变量。
步骤:我的电脑-> 属性-> 高级-> 环境变量,在系统变量那里,新建,变量名为path,变量值为X:\ESRI\AV_GIS30\ARCVIEW\BIN32,X为Arcview 安装所在的盘符。
或者是C:\Program Files\ArcGIS\Bin ,C为Arcview安装所在的盘符,一般默认安装在C盘上。
这样你的软件就能用了。
数据准备因为这个软件支持的是grid格式的数据,所以需要将手上的coverage、shape文件转换为grid格式的文件,用来运算。
转换可以在Arcview里面进行,或者Arcmap都可以。
以Arcmap为例:A、调出B、转换为grid : feature to raster如果想要grid按照你所设定的形状进行计算,可以进行裁剪。
且可以保证背景的完整性。
以Arcview为例:ert to Grid 来生成。
加载空间分析模块的方法:File->Extensions ,选择Spatial Analyst ,ok。
属性文件的制定新建txt文件,格式如下:ClassID , ClassName , Status , isBackground1 , shrubs , true , false2 , conifers , true , false3 , deciduous , true , false4 , other , false , true注意:每个之间用空格键和逗号隔开。
Fragstats软件中各生态环境景观指数详述
1、指数的选择:Fragstats/select patch(class、land)metrics指数一共有三个级别,path、class、landscape三个级别。
不同级别对应不同的指数,对应着不同的生态学意义。
所以选择指数的时候,一定要清楚所选择的指数对应的级别。
2、整理的Fragstats中可以计算的景观指数注:每个景观指数包含的信息依次为英文缩写——英文全称——指标名称——应用尺度——单位一、面积指标1.Area/Perimeter①AREA(AREA-CSD、AREA-CPS、AREA-LS、AREA-LPS)—Patch Area——斑块面积(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——ha(ha、%) ≥0;2.Isolation/Proximity①LSIM—Landscape Similarity Index—斑块相似系数—斑块—%;3.Area/Density/Edge①CA——Total Class Area——斑块类型面积——类型——ha>0;②PLAND(%LAND)——Percentage of Landscape——斑块所占景观面积比例——类型——% [0,100];③TA——Total Landscape Area——景观面积——景观—ha>0;④LPI——Largest Patch Index—最大斑块指数—类型/景观—%;二、密度大小及差异1.Area/Density/Edge①NP——Number of Patches——斑块数量——类型/景观——n ≥1;②PD——Patch Density——斑块密度——类型/景观——n/100ha;③AREA(AREA-MN、AREA-AM、AREA-MD、AREA-RA、AREA-SD、AREA-CV)(MPS、PSSD、PSCV)——Patch Area(Patch Area Mean / Mean Patch Size、Patch Area Standard Deviation / Patch Size Standard Deviation、Patch Area Coefficient of Variation / Patch Size Coefficient of Variation)——斑块面积(平均斑块面积、面积加权平均斑块面积、斑块面积中值、斑块面积范围、斑块面积标准差、斑块面积变异系数)(平均斑块面积、斑块面积标准差、斑块面积变异系数)——类型/景观——ha(ha,%,%);④GYRA(同上)—Radius of Gyration—回旋半径—类型/景观—m;三、边缘指标1.Area/Perimeter①PERIM(CSD、CPS/LSD、LPS)——Patch Perimeter——斑块周长(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)—斑块—m ≥0;②GYRA(同上)——Radius of Gyration——回旋半径—斑块—m;2.Contrast①EDCON(同上)——Edge Contrast Index—边缘对比度—斑块—%;3.Area/Density/Edge①TE——Total Edge——总边界长度——类型/景观——m;②ED——Edge Density——边缘密度——类型/景观——m/ha;4.Contrast①CWED——Contrast-Weighted Edge Density——对比度加权边缘密度——类型/景观——m/ha;②TECI—Total Edge Contrast Index—总边缘对比度—类型/景观—%;③ECI(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MECI、AWMECI)——Edge Contrast Index(Mean Edge Contrast Index、Area-Weighted Mean Contrast Index)——边缘对比度(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、变异系数)(平均边缘对比度、面积加权平均边缘对比度)——类型/景观——%(%,%);四、形状指标1.Shape①PARA(CSD、CPS/LSD、LPS)——Perimeter Area Ratio——周长面积比(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)—斑块—无;②SHAPE(同上)——Shape Index——形状指标——斑块——无;③FRACT(同上)——Fractal Dimension Index—分维数—斑块—无;④CRICLE(同上)——Related Circumscribing Circle—近圆形形状指数——斑块——无;⑤CONTIG(同上)——Contiguity Index——邻近指数——斑块——无;2.Area/Density/Edge①LSI—Landscape Shape Index—景观形状指数—类型/景观—无;②NLSI——Normalize LSI——归一化景观形状指数—类型—无;3.Shape①PAFRAC——Perimeter Area Fractal Dimension——周长面积分维——类型/景观——无;②PARA(MN、AM、MD、RA、SD、CV)——Perimeter Area Ratio——周长面积比(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、变异系数)——类型/景观——无;③SHAPE(同上)(MSI、AWMSI)——Shape Index(Mean Shape Index、Area-Weighted Mean Shape Index)——形状指数(平均形状、面积加权的平均形状指标)——类型/景观——无;④FRAC(同上)(MPFD、AWMPFD)—Fractal Dimension Index(Mean Patch Fractal Dimension、Area-Weighted Patch Fractal Dimension)—分维数(平均斑块分维数、面积加权的平均斑块分维数)—类型/景观—无;⑤CRICLE(同上))——Related Circumscribing Circle——近圆形状指数——类型/景观——无;⑥DLFD——Double Log Fractal Dimension——双对数分维数——类型/景观——无;五、核心面积指标1.CoreArea①Core(CSD、CPS/LSD、LPS)——Core Area——核心斑块面积(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——ha;②NCORE(同上)—Number of Core Area—核心斑块数量—斑块—n ≥1;③CAI(同上)—Core Area Index—核心斑块面积比指标—斑块—%;2.Core Area①TCA——Total Core Area——核心斑块总面积—类型/景观—ha;②CPLAND(C%LAND)—Core Area Percentage of Landscape—核心斑块占景观面积比——类型——% ;③NDCA——Number of Disjunct Core Area——独立核心斑块数量——类型/景观——n;④DCAD——Disjunct Core Area Density——独立核心斑块密度——类型/景观——n/100ha;⑤CORE(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MCA1、CASD1、CACV1) —Core Area(Mean Core Area、Core Area Standard Deviation、Core Area Coefficient of Variation)—核心斑块面积(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、变异系数)(平均核心斑块面积、核心斑块面积方差、核心斑块面积变异系数)——类型/景观——ha(ha,ha,%);⑥DCA(同上)(MCA2、CASD2、CACV2)—Disjunct Core Area——独立核心斑块面积(平均独立核心斑块面积、独立核心斑块面积方差、独立核心面积变异系数)——类型/景观——ha(ha,ha,%);⑦CAI(同上)(MCAI)——Core Area Index(Mean Core Area Index)—核心斑块面积比指标(平均核心斑块指标)——类型/景观—%;六、邻近度指标1.Isolation/Proximity①PROXIM(CSD、CPS/LSD、LPS)——Proximity Index—邻近指数(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)—斑块—无;②SIMI(同上)——Similarity Index——相似度——斑块——无;③ENN(同上)——Euclidean Nearest Neighbor Index——欧氏邻近距离——斑块——m;2.Isolation/Proximity①PROXIM(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MPI) ——Proximity Index(Mean Proximity Index)——邻近指数(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、变异系数)(平均邻近指数)——类型/景观——%(%) ≥0;②SIMI(同上)——Similarity Index——相似度——类型/景观—无;③ENN(同上)(MNN、NNSD、NNCV)——Euclidean Nearest Neighbor Index(Mean Euclidean Nearest-Neighbor Index、Euclidean Nearest-Neighbor Index Standard Deviation、Euclidean Nearest-Neighbor Index Coefficient of V ariation)——欧氏邻近距离(平均欧氏邻近距离、欧氏邻近距离方差、欧氏邻近距离变异系数)——类型/景观——m(m,m,%) >0;七、多样性1.Diversity①PR——Patch Richness——斑块多度(丰富度)——景观——n ≥1;②PRD——Patch Richness Densit——斑块丰富度—景观—n/100ha;③RPR——Relative Patch Richness——相对丰富度——景观—%;④SHDI—Shannon's Diversity Index—香农多样性指数—景观—无;⑤SIDI——Simpson's Diversity Index——Simpson多样性指数——景观——无;⑥MSHDI——Modified Simpson's Diversity Index—修正Simpson 多样性指数——景观——无;⑦SHEI——Shannon's Evenness Index——香农均匀度指数—景观—无[0,1];⑧SIEI——Simpson's Evenness Index——Simpson均匀度指数——景观——无;⑨MSIEI——Modified Simpson's Evenness Index——修正Simpson 均匀度指数——景观——无;八、聚散性1.Contagion/Interspersion①CLUMPY——Clumpiness——丛生度——类型——%;②PLADJ——Proportion of Like Adjacency——相似邻近比例——类型/景观——% (0,100];③AI——Aggregation Index——聚合度—类型/景观—% (0,100];④IJI——Interspersion Juxtaposition Index——散布与并列指数——类型/景观——% (0,100];⑤DIVISION——Landscape Division Index——景观分裂指数——类型/景观——% (0,100];⑥SPLIT——Splitting Index——分离度—类型/景观—% (0,100];⑦MESH——Effective Mesh Size——有效粒度面积——景观——% (0,100];2.Connectivity①COHESION——Patch Cohesion Index——整体性(斑块凝聚度)——类型/景观——% (0,100] ;②CONNECT—Connectance Index——连接度——类型/景观——% (0,100];3.Contagion/Interspersion①CONTAG——Contagion Index—蔓延度——景观——% (0,100];。
fragstats软件中景观格局指标解读
景观指数英文及简称索引二景观指数英文及简称索引最近整理的Fragstats3.3软件Grid格式下可以计算的景观指数,希望大家共同学习探讨(注:每个景观指数包含的信息依次为英文缩写——英文全称——指标名称——应用尺度——单位)一、面积指标1.Area/Perimeter①AREA(CSD、CPS/LSD、LPS)——Patch Area——斑块面积(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——ha(ha、%) ≥02.Isolation/Proximity①LSIM——Landscape Similarity Index——斑块相似系数——斑块——%3.Area/Density/Edge①CA——Total Class Area——斑块类型面积——类型——ha>0②PLAND(%LAND)——Percentage of Landscape——斑块所占景观面积比例——类型——% [0,100]③TA——Total Landscape Area——景观面积——景观——ha>0④LPI——Largest Patch Index——最大斑块占景观面积比例——类型/景观——%二、密度大小及差异1.Area/Density/Edge①NP——Number of Patches——斑块数量——类型/景观——n ≥1②PD——Patch Density——斑块密度——类型/景观——n/100ha③AREA(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MPS、PSSD、PSCV)——Patch Area (Mean、Standard Deviation、Coefficient of Variation)——斑块大小(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)(斑块平均大小、斑块面积方差、斑块面积均方差)——类型/景观——ha(ha,%,%)④GYRA(同上)——Radius of Gyration——回转半径——类型/景观——m三、边缘指标1.Area/Perimeter①PERIM(CSD、CPS/LSD、LPS)——Patch Perimeter——斑块周长(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——m ≥0②GYRA(同上)——Radius of Gyration——回转半径——斑块——m2.Contrast①EDCON(同上)——Edge Contrast Index——边缘对比度——斑块——%3.Area/Density/Edge①TE——Total Edge——总边缘长度——类型/景观——m②ED——Edge Density——边缘密度——类型/景观——m/ha4.Contrast①CWED——Contrast-Weighted Edge Density——对比度加权边缘密度——类型/景观——m/ha②TECI——Total Edge Contrast Index——总边缘对比度——类型/景观——%③ECI(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MECI、AWMECI)——Edge Contrast Index(Mean Edge Contrast Index、Area-Weighted Mean Contrast Index)——边缘对比度(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)(平均边缘对比度、面积加权平均边缘对比度)——类型/景观——%(%,%)四、形状指标1.Shape①PARA(CSD、CPS/LSD、LPS)——Perimeter Area Ratio——边缘面积比(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——无②SHAPE(同上)——Shape Index——形状指标——斑块——无③FRACT(同上)——Fractal Dimension Index——分维数——斑块——无[1,2]④CRICLE(同上)——Related Circumscribing Circle——相关外接圆——斑块——无⑤CONTIG(同上)——Contiguity Index——聚集指数——斑块——无2.Area/Density/Edge①LSI——Landscape Shape Index——景观形状指数——类型/景观——无②NLSI——Normalize LSI——标准化景观形状指数——类型——无3.Shape①PAFRAC——Perimeter Area Fractal DImension——边缘面积分维——类型/景观——无②PARA(MN、AM、MD、RA、SD、CV)——Perimeter Area Ratio——边缘面积比(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)——类型/景观——无③SHAPE(同上)(MSI、AWMSI)——Shape Index(Mean Shape Index、Area-Weighted Mean Shape Index)——形状指数(平均形状、面积加权的平均形状指标)——类型/景观——无④FRAC(同上)(MPFD、AWMPFD)——Fractal Dimension Index(Mean Patch Fractal Dimension、Area-Weighted Patch Fractal Dimension)——分维数(平均斑块分维数、面积加权的平均斑块分维数)——类型/景观——无[1,2]⑤CRICLE(同上))——Related Circumscribing Circle——相关外接圆——类型/景观——无⑥DLFD——Double Log Fractal Dimension——双对数分维数——类型/景观——无五、核心面积指标1.Core Area①Core(CSD、CPS/LSD、LPS)——Core Area——核心斑块面积(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——ha②NCORE(同上)——Number of Core Area——核心斑块数量——斑块——n ≥1③CAI(同上)——Core Area Index——核心斑块面积比指标——斑块——%2.Core Area①TCA——Total Core Area——核心斑块总面积——类型/景观——ha②CPLAND(C%LAND)——Core Area Percentage of Landscape——核心斑块占景观面积比——类型——%③NDCA——Number of Disjunct Core Area——独立核心斑块数量——类型/景观——n④DCAD——Disjunct Core Area Density——独立核心斑块密度——类型/景观——n/100ha⑤CORE(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MCA1、CASD1、CACV1)——Core Area(Mean Core Area、Core Area Standard Deviation、Core Area Coefficient of Variation)——核心斑块面积(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)(平均核心斑块面积、核心斑块面积方差、核心斑块面积均方差)——类型/景观——ha(ha,ha,%)⑥DCA(同上)(MCA2、CASD2、CACV2)——Disjunct Core Area——独立核心斑块面积(平均独立核心斑块面积、独立核心斑块面积方差、独立核心面积均方差)——类型/景观——ha(ha,ha,%)⑦CAI(同上)(MCAI)——Core Area Index(Mean Core Area Index)——核心斑块指标(平均核心斑块指标)——类型/景观——%六、邻近度指标1.Isolation/Proximity①PROXIM(CSD、CPS/LSD、LPS)——Proximity Index——邻近度(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——无②SIMI(同上)——Similarity Index——相似度——斑块——无③ENN(同上)——Euclidean Nearest Neighbor Index——欧几里得最邻近距离——斑块——m2.Isolation/Proximity①PROXIM(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MPI)——Proximity Index(Mean Proximity Index)——邻近度(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)(平均邻近度指标)——类型/景观——%(%) ≥0②SIMI(同上)——Similarity Index——相似度——类型/景观——无③ENN(同上)(MNN、NNSD、NNCV)——Euclidean Nearest NeighborIndex(Mean Euclidean Nearest-Neighbor Index、Euclidean Nearest-Neighbor Index Standard Deviation、Euclidean Nearest-Neighbor Index Coefficient of Variation)——欧几里得最邻近距离(平均最近距离、最邻近距离方差、最邻近距离标准差)——类型/景观——m(m,m,%) >0七、多样性1.Diversity①PR——Patch Richness——斑块多度(景观丰度)——景观——n ≥1②PRD——Patch Richness Density——斑块多度密度——景观——n/100ha③RPR——Relative Patch Richness——相对斑块多度——景观——%④SHDI——Shannon's Diversity Index——香农多样性指标——景观——无⑤SIDI——Simpson's Diversity Index——Simpson多样性指标——景观——无⑥MSHDI——Modified Simpson's Diversity Index——修正Simpson多样性指标——景观——无⑦SHEI——Shannon's Evenness Index——香农均匀度指标——景观——无[0,1]⑧SIEI——Simpson's Evenness Index——Simpson均匀度指标——景观——无⑨MSIEI——Modified Simpson's Evenness Index——修正Simpson均匀度指标——景观——无八、聚散性1.Contagion/Interspersion①CLUMPY——Clumpiness——丛生度——类型——%②PLADJ——Proportion of Like Adjacency——相似毗邻百分比——类型/景观——% (0,100]③AI——Aggregation Index——聚集度指数——类型/景观——% (0,100]④IJI——Interspersion Juxtaposition Index——散布于并列指数——类型/景观——% (0,100]⑤DIVISION——Landscape Division Index——景观分割度——类型/景观——% (0,100]⑥SPLIT——Splitting Index——分离度指数——类型/景观——% (0,100]⑦MESH——Effective Mesh Size——有效粒度尺寸——景观——% (0,100]2.Connectivity①COHESION——Patch Cohesion Index——斑块结合度——类型/景观——% (0,100]②CONNECT——Connectance Index——连接性指数——类型/景观——% (0,100]3.Contagion/Interspersion①CONTAG——Contagion Index——蔓延度指数——景观——% (0,100](注:以上仅为参考,具体仍需查阅专业文献)三各种景观指数的生态学含义1.拼块类型面积(CA),单位:ha,范围:CA>0公式描述:CA等于某一斑块类型中所有斑块的面积之和(m2),除以10000后转化为公顷(ha);即某斑块类型的总面积。
使用Fragstats3.3软件进行景观格局分析
15,保存运算结果:
选择保存 路径,保 存结果用 记事本打 开。
9,数据导入 双击景观格局分析软件Fragstats3.3, 打开软件
注意是ArcGrid disabled 还是ArcGrid enabled, 如果是后者 证明这个软件可以正 常使用,前者的话则 需要另外设置。
如果是ArcGrid disabled的话,则需要进行环境变量设 置,具体方法如下:
Fragstats3.3软件使用须知
• 困惑将近一个星期的遥感分类图导入 Fragstats3.3软件问题今天终于解决,这一个 星期备受煎熬,内心受到很大考验,心情 颇为复杂,在刘常青师弟和胡老师的帮助 下,这个问题终于得以解决,现在把主要 步骤介绍下。
遥感图像分类介绍 1,非监督分类,得到初始分类图 (分类数一般为目标数2倍以上。如 右图)
至此,遥感图像分类工作基本上结束。接下来的工 作便是格式转换和数据导入.
6,在Arcgis中添加去除分析图(Eliminate)
7.把Eliminate图层转为多边形要素图层
在ArcToolbox 中转换工具 Conversion Tool)中,双 击Raster to Polygon,把 栅格转为多 边形要素图 层。
2,分类重编码recode,合并同类项, 注意添加Class names,一般不用汉字。
3,聚类统计clump。
4,去除分析Eliminate,注意选择最 小象元项,一般要根据研究情况决 定取多大值。
5,接下来便是打开Eliminate图像,打开图像属性,添加 属性名称add class name,一般不用汉字.
10,Fragstats3.3参数设置: Fragstats菜单栏选择Run ParaБайду номын сангаасeters
fragstats软件中景观格局指标解读
景观指数英文及简称索引二景观指数英文及简称索引最近整理的F ragst ats3.3软件Gri d格式下可以计算的景观指数,希望大家共同学习探讨(注:每个景观指数包含的信息依次为英文缩写——英文全称——指标名称——应用尺度——单位)一、面积指标1.Area/Perime ter①AREA(CSD、CPS/LSD、LPS)——PatchArea——斑块面积(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——ha(ha、%)≥02.Isolat ion/Proxim ity①LSIM——Landsc ape Simila rityIndex——斑块相似系数——斑块——%3.Area/Densit y/Edge①CA——TotalClassArea——斑块类型面积——类型——ha>0②PLAND(%LAND)——Percen tageof Landsc ape——斑块所占景观面积比例——类型——% [0,100]③TA——TotalLandsc ape Area——景观面积——景观——ha>0④LPI——Larges t PatchIndex——最大斑块占景观面积比例——类型/景观——%二、密度大小及差异1.Area/Densit y/Edge①NP——Number of Patche s——斑块数量——类型/景观——n≥1②PD——PatchDensit y——斑块密度——类型/景观——n/100ha③AREA(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MPS、PSSD、PSCV)——PatchArea (Mean、Standa rd Deviat ion、Coeffi cient of Variat ion)——斑块大小(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)(斑块平均大小、斑块面积方差、斑块面积均方差)——类型/景观——ha(ha,%,%)④GYRA(同上)——Radius of Gyrati on——回转半径——类型/景观——m三、边缘指标1.Area/Perime ter①PERIM(CSD、CPS/LSD、LPS)——PatchPerime ter——斑块周长(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——m≥0②GYRA(同上)——Radius of Gyrati on——回转半径——斑块——m2.Contra st①EDCON(同上)——Edge Contra st Index——边缘对比度——斑块——%3.Area/Densit y/Edge①TE——TotalEdge——总边缘长度——类型/景观——m②ED——Edge Densit y——边缘密度——类型/景观——m/ha4.Contra st①CWED——Contra st-Weight ed Edge Densit y——对比度加权边缘密度——类型/景观——m/ha②TECI——TotalEdge Contra st Index——总边缘对比度——类型/景观——%③ECI(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MECI、AWMECI)——Edge Contra st Index(Mean Edge Contra st Index、Area-Weight ed Mean Contra st Index)——边缘对比度(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)(平均边缘对比度、面积加权平均边缘对比度)——类型/景观——%(%,%)四、形状指标1.Shape①PARA(CSD、CPS/LSD、LPS)——Perime ter Area Ratio——边缘面积比(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——无②SHAPE(同上)——ShapeIndex——形状指标——斑块——无③FRACT(同上)——Fracta l Dimens ion Index——分维数——斑块——无[1,2]④CRICLE(同上)——Relate d Circum scrib ing Circle——相关外接圆——斑块——无⑤CONTIG(同上)——Contig uityIndex——聚集指数——斑块——无2.Area/Densit y/Edge①LSI——Landsc ape ShapeIndex——景观形状指数——类型/景观——无②NLSI——Normal ize LSI——标准化景观形状指数——类型——无3.Shape①PAFRAC——Perime ter Area Fracta l DImens ion——边缘面积分维——类型/景观——无②PARA(MN、AM、MD、RA、SD、CV)——Perime ter Area Ratio——边缘面积比(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)——类型/景观——无③SHAPE(同上)(MSI、AWMSI)——ShapeIndex(Mean ShapeIndex、Area-Weight ed Mean ShapeIndex)——形状指数(平均形状、面积加权的平均形状指标)——类型/景观——无④FRAC(同上)(MPFD、AWMPFD)——Fracta l Dimens ion Index(Mean PatchFracta l Dimens ion、Area-Weight ed PatchFracta l Dimens ion)——分维数(平均斑块分维数、面积加权的平均斑块分维数)——类型/景观——无[1,2]⑤CRICLE(同上))——Relate d Circum scrib ing Circle——相关外接圆——类型/景观——无⑥DLFD——Double Log Fracta l Dimens ion——双对数分维数——类型/景观——无五、核心面积指标1.Core Area①Core(CSD、CPS/LSD、LPS)——Core Area——核心斑块面积(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——ha②NCORE(同上)——Number of Core Area——核心斑块数量——斑块——n ≥1③CAI(同上)——Core Area Index——核心斑块面积比指标——斑块——%2.Core Area①TCA——TotalCore Area——核心斑块总面积——类型/景观——ha②CPLAND(C%LAND)——Core Area Percen tageof Landsc ape——核心斑块占景观面积比——类型——%③NDCA——Number of Disjun ct Core Area——独立核心斑块数量——类型/景观——n④DCAD——Disjun ct Core Area Densit y——独立核心斑块密度——类型/景观——n/100ha⑤CORE(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MCA1、CASD1、CACV1)——Core Area(Mean Core Area、Core Area Standa rd Deviat ion、Core Area Coeffi cient of Variat ion)——核心斑块面积(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)(平均核心斑块面积、核心斑块面积方差、核心斑块面积均方差)——类型/景观——ha(ha,ha,%)⑥DCA(同上)(MCA2、CASD2、CACV2)——Disjun ct Core Area——独立核心斑块面积(平均独立核心斑块面积、独立核心斑块面积方差、独立核心面积均方差)——类型/景观——ha(ha,ha,%)⑦CAI(同上)(MCAI)——Core Area Index(Mean Core Area Index)——核心斑块指标(平均核心斑块指标)——类型/景观——%六、邻近度指标1.Isolat ion/Proxim ity①PROXIM(CSD、CPS/LSD、LPS)——Proxim ity Index——邻近度(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——无②SIMI(同上)——Simila rityIndex——相似度——斑块——无③ENN(同上)——Euclid ean Neares t Neighb or Index——欧几里得最邻近距离——斑块——m2.Isolat ion/Proxim ity①PROXIM(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MPI)——Proxim ity Index(Mean Proxim ity Index)——邻近度(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)(平均邻近度指标)——类型/景观——%(%)≥0②SIMI(同上)——Simila rityIndex——相似度——类型/景观——无③ENN(同上)(MNN、NNSD、NNCV)——Euclid ean Neares t Neighb orIndex(Mean Euclid ean Neares t-Neighb or Index、Euclid ean Neares t-Neighb or IndexStanda rd Deviat ion、Euclid ean Neares t-Neighb or IndexCoeffi cient of Variat ion)——欧几里得最邻近距离(平均最近距离、最邻近距离方差、最邻近距离标准差)——类型/景观——m(m,m,%) >0七、多样性1.Divers ity①PR——PatchRichne ss——斑块多度(景观丰度)——景观——n≥1②PRD——PatchRichne ss Densit y——斑块多度密度——景观——n/100ha③RPR——Relati ve PatchRichne ss——相对斑块多度——景观——%④SHDI——Shanno n's Divers ity Index——香农多样性指标——景观——无⑤SIDI——Simpso n's Divers ity Index——Simpso n多样性指标——景观——无⑥MSHDI——Modifi ed Simpso n's Divers ity Index——修正Simp son多样性指标——景观——无⑦SHEI——Shanno n's Evenne ss Index——香农均匀度指标——景观——无[0,1]⑧SIEI——Simpso n's Evenne ss Index——Simpso n均匀度指标——景观——无⑨MSIEI——Modifi ed Simpso n's Evenne ss Index——修正Simp son均匀度指标——景观——无八、聚散性1.Contag ion/Inters persi on①CLUMPY——Clumpi ness——丛生度——类型——%②PLADJ——Propor tionof Like Adjace ncy——相似毗邻百分比——类型/景观——% (0,100]③AI——Aggreg ation Index——聚集度指数——类型/景观——% (0,100]④IJI——Inters persi on Juxtap ositi on Index——散布于并列指数——类型/景观——% (0,100]⑤DIVISI ON——Landsc ape Divisi on Index——景观分割度——类型/景观——% (0,100]⑥SPLIT——Splitt ing Index——分离度指数——类型/景观——% (0,100]⑦MESH——Effect ive Mesh Size——有效粒度尺寸——景观——% (0,100]2.Connec tivit y①COHESI ON——PatchCohesi on Index——斑块结合度——类型/景观——% (0,100]②CONNEC T——Connec tance Index——连接性指数——类型/景观——% (0,100]3.Contag ion/Inters persi on①CONTAG——Contag ion Index——蔓延度指数——景观——% (0,100](注:以上仅为参考,具体仍需查阅专业文献)三各种景观指数的生态学含义1.拼块类型面积(CA),单位:ha,范围:CA>0公式描述:CA等于某一斑块类型中所有斑块的面积之和(m2),除以10000后转化为公顷(ha);即某斑块类型的总面积。
Fragstats批量计算景观指数
Fragstats批量计算景观指数Fragstats批量计算景观指数1. 读出⽂件夹中所有tifimport oscFileNumber = 0dir = r"D:\Work\otherWork\wyh\7_33_TIFF"for root, dirs, files in os.walk(dir): #遍历该⽂件夹for file in files: #遍历刚获得的⽂件名files(filename, extension) = os.path.splitext(file) #将⽂件名拆分为⽂件名与后缀if (extension == '.tif'): #判断该后缀是否为.c⽂件cFileNumber= cFileNumber+1 #记录.c⽂件的个数为对应⽂件号print(cFileNumber, os.path.join(root,filename)+".tif") #输出⽂件号以及对应的路径加⽂件名file_write_obj = open("dest.txt", 'a')var = os.path.join(root,filename)+".tif,x,999,x,x,1,x,IDF_GeoTIFF" # 注意修改背景像元值file_write_obj.writelines(var)file_write_obj.write('\n')file_write_obj.close())⽣成⽂件dest.txt,将后缀改为.fbt2. 在frastats中批量导⼊点击导⼊3. 导⼊成功,选择相应的景观指数进⾏计算4. 导出计算结果5. 结果导⼊Excel进⾏处理。
Fragstats 使用说明
Fragstats 使用说明现在景观格局研究普遍采用Fragstats 3.3软件计算格局指数我在写文章的过程中也使用了这一软件期间也遇到不少问题幸得高人指点和自己不断摸索当时网上鲜有使用方法终于把数据算出来了现在把使用过程中遇到的一些问题与方法写出来希望对后来者有些帮助在写这个的过程中参考了一些朋友的意见。
Fragstats 33软件的安装如果你装了arcgis软件那么Fragstats 3.3可以直接使用。
下载下来的文件解压缩后双击便可以使用注意要保证你的ArcGIS是运行的状态。
环境变量的设置打开软件后看你的是―ARCGRID disabled‖还是―ARCGRID enabled‖如果是后则可以直接使用如果是前者学要设置环境变量。
步骤我的电脑-gt属性-gt高级-gt环境变量在系统变量那里新建变量名为path变量值为X:ESRIAV_GIS30ARCVIEWBIN32X为Arcview安装所在的盘符。
或者是C:Program FilesArcGISBinC为Arcview 安装所在的盘符一般默认安装在C盘上。
这样你的软件就能用了。
数据准备因为这个软件支持的是grid格式的数据所以需要将手上的coverage、shape文件转换为grid格式的文件用来运算。
转换可以在Arcview里面进行或者Arcmap都可以。
以Arcmap为例A、调出B、转换为gridfeature to raster 如果想要grid按照你所设定的形状进行计算可以进行裁剪。
且可以保证背景的完整性。
以Arcview为例ert to Grid来生成。
加载空间分析模块的方法File-gtExtensions选择SpatialAnalystok。
属性文件的制定新建txt文件格式如下ClassID ClassName Status isBackground 1 shrubs true false 2 conifers true false 3 deciduous true false 4 other false true 注意每个之间用空格键和逗号隔开。
使用Fragstats 3.3计算景观格局指数的详细步骤
使用Fragstats 3.3计算景观格局指数的详细步骤应用Fragstats 3.3 计算景观格局指数的步骤1、根据研究目的确定需要计算的景观格局指数,并列表明确其生态意义。
假设本文在斑块水平选取以下指数:斑块数目(NP)、平均斑块面积(MPS)、聚集度(AI)、最大斑块指数(LPI)、斑块所占景观面积比例(PLAND)、面积加权平均形状指数(AWMSI) 在景观水平选取以上指数外(不含PLAND),还选择香农多样性指数(SHDI)、香农均匀度指数(SHEI)。
本文所选指数见表1(表格自行设定,不一定按此类型)水平景观指数香农多样性指数(SHDI) 景观香农均匀度指数(SHEI)Shannon’s evenness index 指数全称Shannon’s div ersity index生态含义反映景观中各斑块类型的复杂性和变异性反映景观中各斑块在面积上分布的不均匀程度,当值趋于1时,说明各斑块类型在景观中分布均匀值的大小与破碎度之间呈正相关性描述景观粒度,一定意义上揭示景观破碎化程度反映景观中不同斑块类型的非随机性或聚集程度某一景观类型最大斑块占整个景Largest patch index Percentage of landscape types Area-weighted mean patch shape index观面积的比例.有助于确定景观规模或优势类型等反映景观中每种斑块类型的丰富度反映景观中各斑块的变异性.值越大,说明斑块形状越复杂0斑块数目 (NP) 平均斑块面积 (MPS) 聚集度斑块类型 (AI) 最大斑块指数 (LPI) 斑块所占景观面积比例(PLAND) 面积加权平均形状指数(AWMSI) Number of patches Mean patch area Aggregation index NP≥1 MPS>0 0AWMSI≥1 2、用ArcView 3.3将Coverage数据转成Grid格式(因为fragstats3.3只识别grid格式。
fragstats软件中景观格局指标解读
景观指数英文及简称索引二景观指数英文及简称索引最近整理的Fragstats3.3软件Grid格式下可以计算的景观指数,希望大家共同学习探讨(注:每个景观指数包含的信息依次为英文缩写——英文全称——指标名称——应用尺度——单位)一、面积指标1.Area/Perimeter①AREA(CSD、CPS/LSD、LPS)——Patch Area——斑块面积(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——ha(ha、%) ≥02.Isolation/Proximity①LSIM——Landscape Similarity Index——斑块相似系数——斑块——%3.Area/Density/Edge①CA——Total Class Area——斑块类型面积——类型——ha>0②PLAND(%LAND)——Percentage of Landscape——斑块所占景观面积比例——类型——% [0,100]③TA——Total Landscape Area——景观面积——景观——ha>0④LPI——Largest Patch Index——最大斑块占景观面积比例——类型/景观——%二、密度大小及差异1.Area/Density/Edge①NP——Number of Patches——斑块数量——类型/景观——n ≥1②PD——Patch Density——斑块密度——类型/景观——n/100ha③AREA(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MPS、PSSD、PSCV)——Patch Area (Mean、Standard Deviation、Coefficient of Variation)——斑块大小(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)(斑块平均大小、斑块面积方差、斑块面积均方差)——类型/景观——ha(ha,%,%)④GYRA(同上)——Radius of Gyration——回转半径——类型/景观——m三、边缘指标1.Area/Perimeter①PERIM(CSD、CPS/LSD、LPS)——Patch Perimeter——斑块周长(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——m ≥0②GYRA(同上)——Radius of Gyration——回转半径——斑块——m2.Contrast①EDCON(同上)——Edge Contrast Index——边缘对比度——斑块——%3.Area/Density/Edge①TE——Total Edge——总边缘长度——类型/景观——m②ED——Edge Density——边缘密度——类型/景观——m/ha4.Contrast①CWED——Contrast-Weighted Edge Density——对比度加权边缘密度——类型/景观——m/ha②TECI——Total Edge Contrast Index——总边缘对比度——类型/景观——%③ECI(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MECI、AWMECI)——Edge Contrast Index(Mean Edge Contrast Index、Area-Weighted Mean Contrast Index)——边缘对比度(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)(平均边缘对比度、面积加权平均边缘对比度)——类型/景观——%(%,%)四、形状指标1.Shape①PARA(CSD、CPS/LSD、LPS)——Perimeter Area Ratio——边缘面积比(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——无②SHAPE(同上)——Shape Index——形状指标——斑块——无③FRACT(同上)——Fractal Dimension Index——分维数——斑块——无[1,2]④CRICLE(同上)——Related Circumscribing Circle——相关外接圆——斑块——无⑤CONTIG(同上)——Contiguity Index——聚集指数——斑块——无2.Area/Density/Edge①LSI——Landscape Shape Index——景观形状指数——类型/景观——无②NLSI——Normalize LSI——标准化景观形状指数——类型——无3.Shape①PAFRAC——Perimeter Area Fractal DImension——边缘面积分维——类型/景观——无②PARA(MN、AM、MD、RA、SD、CV)——Perimeter Area Ratio——边缘面积比(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)——类型/景观——无③SHAPE(同上)(MSI、AWMSI)——Shape Index(Mean Shape Index、Area-Weighted Mean Shape Index)——形状指数(平均形状、面积加权的平均形状指标)——类型/景观——无④FRAC(同上)(MPFD、AWMPFD)——Fractal Dimension Index(Mean Patch Fractal Dimension、Area-Weighted Patch Fractal Dimension)——分维数(平均斑块分维数、面积加权的平均斑块分维数)——类型/景观——无[1,2]⑤CRICLE(同上))——Related Circumscribing Circle——相关外接圆——类型/景观——无⑥DLFD——Double Log Fractal Dimension——双对数分维数——类型/景观——无五、核心面积指标1.Core Area①Core(CSD、CPS/LSD、LPS)——Core Area——核心斑块面积(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——ha②NCORE(同上)——Number of Core Area——核心斑块数量——斑块——n ≥1③CAI(同上)——Core Area Index——核心斑块面积比指标——斑块——%2.Core Area①TCA——Total Core Area——核心斑块总面积——类型/景观——ha②CPLAND(C%LAND)——Core Area Percentage of Landscape——核心斑块占景观面积比——类型——%③NDCA——Number of Disjunct Core Area——独立核心斑块数量——类型/景观——n④DCAD——Disjunct Core Area Density——独立核心斑块密度——类型/景观——n/100ha⑤CORE(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MCA1、CASD1、CACV1)——Core Area(Mean Core Area、Core Area Standard Deviation、Core Area Coefficient of Variation)——核心斑块面积(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)(平均核心斑块面积、核心斑块面积方差、核心斑块面积均方差)——类型/景观——ha(ha,ha,%)⑥DCA(同上)(MCA2、CASD2、CACV2)——Disjunct Core Area——独立核心斑块面积(平均独立核心斑块面积、独立核心斑块面积方差、独立核心面积均方差)——类型/景观——ha(ha,ha,%)⑦CAI(同上)(MCAI)——Core Area Index(Mean Core Area Index)——核心斑块指标(平均核心斑块指标)——类型/景观——%六、邻近度指标1.Isolation/Proximity①PROXIM(CSD、CPS/LSD、LPS)——Proximity Index——邻近度(类型水平方差、百分比/景观水平方差、百分比)——斑块——无②SIMI(同上)——Similarity Index——相似度——斑块——无③ENN(同上)——Euclidean Nearest Neighbor Index——欧几里得最邻近距离——斑块——m2.Isolation/Proximity①PROXIM(MN、AM、MD、RA、SD、CV)(MPI)——Proximity Index(Mean Proximity Index)——邻近度(平均、面积加权平均、中值、变化范围、方差、均方差)(平均邻近度指标)——类型/景观——%(%) ≥0②SIMI(同上)——Similarity Index——相似度——类型/景观——无③ENN(同上)(MNN、NNSD、NNCV)——Euclidean Nearest NeighborIndex(Mean Euclidean Nearest-Neighbor Index、Euclidean Nearest-Neighbor Index Standard Deviation、Euclidean Nearest-Neighbor Index Coefficient of Variation)——欧几里得最邻近距离(平均最近距离、最邻近距离方差、最邻近距离标准差)——类型/景观——m(m,m,%) >0七、多样性1.Diversity①PR——Patch Richness——斑块多度(景观丰度)——景观——n ≥1②PRD——Patch Richness Density——斑块多度密度——景观——n/100ha③RPR——Relative Patch Richness——相对斑块多度——景观——%④SHDI——Shannon's Diversity Index——香农多样性指标——景观——无⑤SIDI——Simpson's Diversity Index——Simpson多样性指标——景观——无⑥MSHDI——Modified Simpson's Diversity Index——修正Simpson多样性指标——景观——无⑦SHEI——Shannon's Evenness Index——香农均匀度指标——景观——无[0,1]⑧SIEI——Simpson's Evenness Index——Simpson均匀度指标——景观——无⑨MSIEI——Modified Simpson's Evenness Index——修正Simpson均匀度指标——景观——无八、聚散性1.Contagion/Interspersion①CLUMPY——Clumpiness——丛生度——类型——%②PLADJ——Proportion of Like Adjacency——相似毗邻百分比——类型/景观——% (0,100]③AI——Aggregation Index——聚集度指数——类型/景观——% (0,100]④IJI——Interspersion Juxtaposition Index——散布于并列指数——类型/景观——% (0,100]⑤DIVISION——Landscape Division Index——景观分割度——类型/景观——% (0,100]⑥SPLIT——Splitting Index——分离度指数——类型/景观——% (0,100]⑦MESH——Effective Mesh Size——有效粒度尺寸——景观——% (0,100]2.Connectivity①COHESION——Patch Cohesion Index——斑块结合度——类型/景观——% (0,100]②CONNECT——Connectance Index——连接性指数——类型/景观——% (0,100]3.Contagion/Interspersion①CONTAG——Contagion Index——蔓延度指数——景观——% (0,100](注:以上仅为参考,具体仍需查阅专业文献)三各种景观指数的生态学含义1.拼块类型面积(CA),单位:ha,范围:CA>0公式描述:CA等于某一斑块类型中所有斑块的面积之和(m2),除以10000后转化为公顷(ha);即某斑块类型的总面积。
景观生态学研究软件fragstats操作办法剖析
Bowse results
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பைடு நூலகம்
选择斑块类型水平上的参数操作过程 1
选择斑块类型水平上的参数操作过程 2
必选指标:
• • • • • 斑块数量、面积 斑块密度(PD) 最大斑块指数(LPI) 平均最临近距离(ENN_MN) 聚集度(AI)
指数运算:Fragstats
Execute
Execute之后出现的界面
查看运算结果:Tools
景观格局软件Fragstats简介
——以Fragstats 3.3 为例
进入界面
操作步骤1:
Fragstats
Set Run Parameters
(1)选择输入文件的格式类型
(2)打开需要分析的文件
其他格式的设定
格式设定完成,单击OK后的界面
选择斑块水平上的参数操作过程 1
选择斑块水平上的参数操作过程 2
fragstats 操作
选择斑块水平上的参数操作过程 选择斑块水平上的参数操作过程 1 斑块水平
选择斑块水平上的参数操作过程 选择斑块水平上的参数操作过程 2 斑块水平
选择斑块类型水平上的参数操作过程 1 选择斑块类型水平上的参数操作过程 斑块类型水平
选择斑块类型水平上的参数操作过程 选择斑块类型水平上的参数操作过程 2 斑块类型水平
景观格局软件FrΒιβλιοθήκη gstats简介 简介 景观格局软件
——以Fragstats 3.3 为例 以
进入界面
操作步骤1: 操作步骤 :
Fragstats
Set Run Parameters
(1)选择输入文件的格式类型 )
(2)打开需要分析的文件 )
其他格式的设定
格式设定完成,单击 格式设定完成,单击OK后的界面 后的界面
必选指标: 必选指标:
• • • • • 斑块数量、面积 斑块密度(PD) 最大斑块指数(LPI) 平均最临近距离(ENN_MN) 聚集度(AI)
指数运算: 指数运算:Fragstats
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应用Fragstats 3、3 计算景观格局指数的步骤
1、根据研究目的确定需要计算的景观格局指数,并列表明确其生态意义。
假设
本文在斑块水平选取以下指数:
斑块数目(NP)、平均斑块面积(MPS)、聚集度(AI)、最大斑块指数(LPI)、斑块
水
平
景观指数指数全称生态含义取值范围
景观香农多样性
指数(SHDI)
Shannon’s diversity
index
反映景观中各斑块类型的复杂性
与变异性
SHDI≥0
香农均匀度
指数(SHEI)
Shannon’s evenness
index
反映景观中各斑块在面积上分布
的不均匀程度,当值趋于1时,说明
各斑块类型在景观中分布均匀
0≤SHEI≤1
斑块类型斑块数目
(NP)
Number of patches
值的大小与破碎度之间呈正相关
性
NP≥1
平均斑块面积
(MPS)
Mean patch area
描述景观粒度,一定意义上揭示景
观破碎化程度
MPS>0
聚集度
(AI)
Aggregation index
反映景观中不同斑块类型的非随
机性或聚集程度
0<AI≤100
最大斑块指数
(LPI)
Largest patch index
某一景观类型最大斑块占整个景
观面积的比例、有助于确定景观规
模或优势类型等
0<LPI≤100
斑块所占景观
面积比例(PLAND)
Percentage of
landscape types
反映景观中每种斑块类型的丰富
度
0<PLAND≤100
面积加权平均形状
指数(AWMSI)
Area-weighted
mean patch shape
index
反映景观中各斑块的变异性、值越
大,说明斑块形状越复杂
AWMSI≥1
2、用ArcView
3、3将Coverage数据转成Grid格式(因为fragstats3、3只识别
grid格式。
试过用ArcMap转换,再计算指数,结果失败了,欢迎后来者继续探讨如何用ArcMap转换为可用数据。
)
1)打开ArcView 3、3,添加Coverage数据File Extentions 选中
Spatial Analyst,OK
2) Theme Convert to Grid 选择存储路径并命名文件OK “Output
Grid Extent”可选默认“Output Grid Cell Size”选As Specified Below “Cell Size”自行设定OK“Pick field for cell values”选择TYPE,OK
3、设置类属性文件class、fdc
1) 打开一个记事本,首行输入引号内的内容
“ClassID ,ClassName ,Status ,isBackground”,两两之间用空格或英文半角的逗号隔开,也可用空格逗号(此处采用空格逗号形式)
2) 另起一行输入,以景观类型名称(因为前面的grid就是选择了TYPE)为重点,一类一行,务必输入所有类型,全部输完如下
注意:最后一行就是必须要有的,把所有的类型输完后,必输入最后一行:类型为其她用地,状态为f,背景为t。
3) 保存class、txt文件,将拓展名改为、fdc
4、用Fragstats 3、3计算指数
1) 打开Fragstats 3、3 设置运行参数:Fragstats Set Run Parameters,出现如下对话框,按图示步骤进行设置即可。
(斑块邻近规则选择4邻就是因为有些指数计算仅限于4邻)
2) 选择指数并计算:Fragstats Select Class Metrics
“确定”,然后选择景观水平的指数:Fragstats Select Land Metrics
“确定”,然后“执行”
查瞧运行结果并保存
5、找到指数计算结果的文件classLPISs(自定义),打开并把结果输入Excel表格,
以便制图或制表。