word版信息学试题(答案)

一、名解

1.生物信息学：（狭义）专指应用信息技术储存和分析基因组测序所产生的分子序列及其相关数据的学科；（广义）指生命科学与数学、计算机科学和信息科学等交汇融合所形成的一门交叉学科。

2.人类基因组测序计划：

3基因组学p150：以基因组分析为手段，研究基因组的结构组成、时序表达模式和功能，并提供有关生物物种及其细胞功能的进化信息。

4基因组p150：是指一个生物体、细胞器或病毒的整套基因。

5.比较基因组学p166：是指基因组学与生物信息学的一个重要分支。通过模式生物基因组之间或模式生物基因组与人类基因组之间的比较与鉴别，可以为研究生物进化和分离人类遗传病的候选基因以及预测新的基因功能提供依据。

6功能基因组：表达一定功能的全部基因所组成的DNA序列，包括编码基因和调控基因。功能基因组学：利用结构基因组学研究所得的各种来源的信息，建立与发展各种技术和实验模型来测定基因及基因组非编码序列的生物学功能。

7蛋白质组p179：是指一个基因组中各个基因编码产生的蛋白质的总体，即一个基因组的全部蛋白产物及其表达情况。

8蛋白质组学：指应用各种技术手段来研究蛋白质组的一门新兴科学，其目的是从整体的角度分析细胞内动态变化的蛋白质组成成分、表达水平与修饰状态，了解蛋白质之间的相互作用与联系，揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律。

9功能蛋白质组学：（课件上只能找到功能蛋白质组，即细胞在一定阶段或与某一生理现象相关的所有蛋白）。

10序列对位排列：通过插入间隔的方法使不同长度的序列对齐，达到长度一致。11分子系统树：是表达类群（或序列）间系统发育关系的一种树状图。

12 BLAST搜索p73：是一种基本的局部对位排列搜索工具。

13 SNP p152：即单核酸多态性，是指基因组内特定核苷酸位点上存在两种不同碱基，其中每种在群体中的频率不小于1%。SNP大多数为转换置换。

14 EST p91：即表达序列标签，是从cDNA文库中生成的一些很短的序列（300~500bp)，它们代表在特定组织或发育阶段表达的基因，有时可代表特定的cDNA。

16 基因组作图p155：是确定界标或基因在构成基因组的每条染色体上的位置，以及同条染色体上各个界标或基因之间的相对距离。

17 后基因组时代p3：其标志是大规模基因组分析、蛋白质组分析以及各种数据的比较和整合。

18 电子克隆p98：又称虚拟克隆，其原理是依据大量EST具有相互重叠的性质，通过计算机法获得cDNA全长序列。电子克隆是由一个查询序列开始，依靠EST 数据库在计算机上对EST进行两端延伸，从而获得全长的cDNA序列。

19 遗传连锁图p155：是用遗传模式来描述DNA标记（基因和其他确定DNA 序列）在染色体上的相对位置。

20 物理图谱p156：是标明一些界标（如限制酶切点、单一序列、基因等）在DNA分子或染色体上锁处位置的图，图距以物理长度为单位（如核苷酸对的数目）。

二填空题

1生物信息学的发展大致经历了3个阶段，分别为（前基因组时代）（基因组时代）和（后基因组时代）p2

2后基因组时代的标志性工作是（基因组分析）（蛋白质组分析）以及（各种数据的比较和整合）p3

3前基因组时代的标志性工作是（生物数据库的建立）（检索工具的开发）以及（DNA和蛋白质的序列分析）p2

4基因组时代的标志性工作是（基因寻找和识别）（网络数据库系统的建立）以及（交互界面的开发）p2

5遗传图谱的图距单位是（厘摩）代表（1%）的交换值，物理图谱的图距以（物理长度）为单位p155-156 如果两个遗传标记之间的重组率是1%，则他们之间的遗传距离就是（1cM）

6 人类基因组中大小约（3×109）对核苷酸，含（30000）个基因，人类基因组中编码DNA的序列占（10%），junkDNA占（）p151

7 人类基因组计划的目标是完成四张图，分别是（遗传图谱）（物理图谱）（序列图谱）和（基因图谱）

8 HGP由（六）个国家完成，我国完成了HGP的（1%，即３号染色体上３０００万个碱基）的测序工作。

9蛋白质组分析的关键技术主要有（双向凝胶电泳）和（蛋白质鉴定方法）p183 10国际著名的三大公共核苷酸数据库为（GenBank）（DDBJ）（EMBL）p56

11 Genebank由（NCBI）管理运行，（BLAST）是一种快速检索相似性序列的工具，（Entrez）是一个整合的数据查询系统p56

12最常用的序列相似性查询工具是（BLAST）和（FASTA），两个系统的服务分别由（NCBI）和（EBI）维护p73

13 BLAST系列程序有（序列对位排列）（序列同源性）（相似性记分）和（全局排列）p73

14 NCBI中主要的数据库有（DDBJ ）（EMBL）和（GenBank）？

15基因组浏览的数据库主要有（）和（）？

16蛋白质序列数据库主要有（PIR）和（SWISS-PROT）等，蛋白质结构数据库主要有（PDB）

17生物信息数据库分为（核酸和蛋白质一级结构数据库）（基因组数据库）和（生物大分子三维空间结构数据库）

18生物分子数据库专集每年均在（Nucleic Acids Research）杂志的第一期看出p52

19生物信息学数据常见的数据格式主要有（FASTA）（GenBank）和（SwissProt）等

20生物信息学数据库之间的联系方式有（相似性）和（硬链接）

21真核生物基因内含子一般以（GT）两个基因开始，以（AG）两个基因结束22生物信息学识别基因两种途径为（基因组外显子识别）和（EST策略的基因鉴定）

23人类基因组计划具体任务是建立四张图谱，分别为（遗传图谱）（物理图谱）（序列图谱）和（基因图谱）

24建立人类遗传图谱的关键是要有足够的高度多肽的遗传标记。第一代遗传标