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核苷酸片段。 Eco RⅠ 5´- CCGAATTCG 3´- GGCTTAAGC
4、重组DNA导入受菌体
将重组DNA或其他外源DNA导入宿主细胞的常用方法:
转化、感染、转染、显微注射、电穿孔等。 转化(transformation):是指将重组质粒DNA导入受体细胞。
转染( transfection):将重组噬菌体 DNA 直接引入受体细 胞的过程。 转导(transduction):重组噬菌体DNA分子,在体外经过包 装成具有感染能力的噬菌体颗粒,再以此噬菌体为载体,将 重组DNA导入受体细胞内的过程,也称为感染(infection)。
4、具备一个或多个限制性内切酶的单一识别点(多 克隆位 点,MCS)。 5、具有较高的遗传稳定性。
3、常用载体
质粒DNA、噬菌体DNA、病毒DNA、酵母DNA
这些载体均需经人工构建,除去致病基因,并赋 予一些新的功能:如有利于进行筛选的标志基因、单一 的限制酶切点等。
1、质粒(plasmid): 质粒为细菌染色体之外一些能独立复制并保持稳 定遗传的复制子。结构上,它是一种双链闭合环状的 DNA分子。
↓
克隆基因的表达
1、 制备目的基因
(1)化学合成: 已知目的基因的核苷酸序列或根据基因产物的氨基酸序 列推导出相应基因DNA碱基序列。 目前使用DNA合成仪合成的片段长度有限,一般用于小 分子活性多肽基因的合成,较长的链则须分段合成,然后用
连接酶加以连接。
(2)构建基因组DNA文库:
将某种生物细胞的整个基 因组DNA用物理或酶学的方法 切割成预期大小的片断,并将 所有这些片断都与适当的载体 连接,引入相应的宿主细胞中 保存和扩增。 理论上讲,这些重组载体 上带有了该生物体的全部基
生物体,获得所需的遗传性
状或表达出所需要的产物。
修改遗传信息的第二步: 怎样将需要的信息导入到细胞?
重组质粒DNA转化微生物
化学转化法
电转化法 基因枪转化法
化学转化法的特点 适用微生物较少 效率较高
电转化法的特点 适用微生物多 效率高 死亡率高
基因枪转化法的特点 适用微生物较少 效率较高
革兰氏阳性菌的转化 一般需要制备原生质体
5、末端转移酶 催化单脱氧核苷酸转移到DNA3`-端羟基上。
应用:探针标记,标记测序以及制备人工黏性末端。 6、T4多聚核苷酸激酶 催化多聚核苷酸5ˊ羟基末端磷酸化。
用途:⑴放射性标记DNA的5`端
⑵使缺少5`-磷酸基的DNA磷酸化用于连接反应。 7、S1核酸酶 单链核酸内切酶,降解单链DNA或RNA。
图1
同 源 重 组 原 理 图 示
单交换
双交换
图2
同源重组引起的基因敲除—ES细胞
构建与靶基因同源 (10~15kb)的载体 技 术 路 线 外显子插有新霉素抗 性基因 (neor)作为 正选择
疱疹病毒胸苷激酶 (HSV-tk)基因作为 负选择
将重组体导入ES细胞,体外培养
neor 和HSV-tk作双重筛选 显微注射 回交得到X被敲除的动物 表型分析
Leabharlann Baidu
1978年Nobel生理或医学奖
1.定义:能识别双链DNA分子中某特定的核苷酸序列,并
在识别序列内或附近切割DNA双链结构的一类核
酸内切酶(在核酸分子链的内部制造切口的酶)。
2.来源:原核生物
3.分类:根据结构、作用特点不同,分为三类。 Ⅰ型酶、Ⅲ型酶:
具有限制切割与甲基化修饰活性。Ⅰ型和Ⅲ型酶都没
CELLECTIS S.A. NASDAQ
2015.11.18 DNA剪切技术治疗1岁女童获成功
基因组编辑技术简介
Genome Editing
2015.11.22 HuangCH @ J208
修改遗传信息的第一步: 按我们的设计来重组DNA
第一节
基 本 概 念
重组DNA技术:
是指在基因水平上,将目
5、重组体的筛选与鉴定
筛选是指通过某些特定方法,从被转 化的细胞群体或基因文库中,鉴别出真正 的阳性重组子的过程。
方法: (一)根据遗传表型进行筛选的方法 (1)抗生素抗性筛选 (2)β-半乳糖苷酶系统筛选 (二)根据重组子结构特征进行筛选的方法
(一)根据遗传表型进行筛选的方法 (1)抗生素抗性筛选:
4、碱性磷酸酶
去除DNA、RNA、dNTP和NTP 5ˊ端的磷酸根。
(1)5’端标记 (2)制备载体时,用碱性磷酸酶处理后,可防止载体自身 连接,提高重组效率。 碱性磷酸酶有细菌碱性磷酸酶(BAP)和牛小肠碱性磷酸 酶(CIP)。CIP能在 1% SDS溶液中68 ℃加热15 min而 失活,故CIP较为常用。
EcoRⅠ+ Bg lⅡ 双酶切
AATTC G A TCTAG
AATTC G GATCT A
Eco RⅠ+ Bg lⅡ 双酶切
+
AATTC G
A TCTAG
T4 DNA连接酶
GAATTC CTTAAG AGATCT TCTAGA
重组体
(4)同聚物加尾连接:
(5)人工接头连接:
接头是指含有某些
限制性内切酶切点的寡
第四节
重组DNA技术常用载体
一、定义
是指能携带目的基因进入宿主细胞进行扩增和表达的
一类DNA分子。
分类: 克隆载体:用于在宿主细胞中克隆和扩增外
源DNA片段。
表达载体:用于在宿主细胞中获得外源基因 表达产物。
二、特点
1、具备复制能力。 2、具备一个或多个筛选标志。
3、具备较多拷贝数,易从宿主细胞中分离纯化。
真菌的转化 一般需要制备原生质体
植物遗传转化方法和技术
根癌农杆菌介导的植物转基因
图10-1 农杆菌侵染伤口的模式图
基因枪介导法
电转化法 PEG转化法 花粉管通道法
动物遗传转化方法和技术
原核显微注射法 胚胎干细胞介导法 病毒载体法
基因重组/敲除的概念及简史
1980年代初,ES细胞分离和体外培养成功奠 定了基因重组/敲除的技术基础 1985年首次证实了哺乳动物细胞中同源重组 的存在奠定了基因重组/敲除的理论基础 1987年,Thompsson et al首次建立了完整的ES 细胞基因敲除的小鼠模型 在随后的时间里基因敲除技术得到了进一步 发展和完善
大多数载体均带有抗生素抗性基因 a.构建重组体时,保留了抗性基因活性,所转化的细胞
就能在含此种抗生素的培养基中生长,未转化的细胞
则不能生长。 b.插入失活法:外源基因插入到一个抗性基因位点,使
此种抗生素抗性消失,重组体转化的细菌不能在含有
这种抗生素的培养基中生长。
抗 生插 素入 抗失 性活 筛法 选
是感染细菌的一类病毒 ,寄生于细菌中,并能溶解 细菌细胞,故称噬菌体。
噬 菌 体 生 活 周 期
3、酵母
酵母人工染色体(YAC):用于大片段DNA的克隆。
4、病毒
第五节
重组DNA技术
基本步骤
目的基因的获取
↓
克隆载体的选择
↓
目的基因与载体 连接成重组DNA
↓
重组DNA导入受体菌
↓
重组体的筛选
1980年Nobel化学奖
2、Boyer-Cohen实验-第一个取得基因工程成功 1973年构建双重抗药性重组质粒 1973年是基因工程诞生的元年
第三节
工具酶
1、
“基因剪刀”-限制性核酸内切酶
Werner Arber 理论预见限制酶
Hamilton O. Smith 得到第一个限制酶
Daniel Nathans 用限制酶切得SV40 DNA片断
因,称为基因文库。
(3)构建cDNA文库:
(4)聚合酶链反应(PCR)
已知目的基因的基因序列,用PCR从基因组 DNA中获得目的基因,或用逆转录PCR方法直接 从mRNA获得特定基因的cDNA。
(5)直接用限制性内切酶切取、分离: 对一些物理图谱已经确定,背景资料 清楚的原核生物、噬菌体及病毒等基因组, 可直接用限制性内切酶消化后,通过分离获 得目的基因。
有多大的实用价值。 Ⅱ型酶: 应用广泛,能在DNA分子内部的特异位点,识别和切 割双链DNA,其切割位点的序列可知、固定。 通常所说的限制性内切酶就是指Ⅱ型酶。
4.识别和切割位点:
识别位点:即为Ⅱ型酶识别的特殊DNA序列
通常是4~8个碱基对、具有回文序列的DNA片段 5’ – G A A T T C - 3’ 3’ – C T T A A G - 5’
pBR322质粒载体
①相对分子质量小,长度为4.3kb。
②含有氨苄青霉素和四环素的抗性 基因(Ampr和Tetr)。
③有24种限制性内切酶位点。
④有一个复制起始点(ori)及与 DNA复制有关的序列,赋予该质粒 复制子特性。 ⑤为松弛型复制子。
2、噬菌体(bacteriophage,phage)
存活的ES细胞
图 示
ZFN 技术原理
锌指核酸酶(Zinc-finger nucleases, ZFN)是人工改造的限制性核酸内 切酶,利用不同的锌指结构识别特异DNA序列,利用核酸酶切断靶DNA。
• 锌指结构中每一个α螺旋可以特异识别 3-4个碱基; • 人工设计识别特异DNA序列的α螺旋采 用如上的通用序列,通过改变其中7个 X来实现识别不同的三联体碱基, TGEK是多个螺旋间的连接序列; • 构建成对人工锌指结构域和FokI融合 蛋白(ZFN)可以在指定区域切断 DNA双链。
。
① 5`突出粘性末端
② 3`突出粘性末端
③ 平头(钝性末端)
5ˊ突出黏性末端(EcoRⅠ): 5ˊ-G↓AATTC-3ˊ
3ˊ-CTTAA↑G-5ˊ
5ˊ-G
3ˊ-CTTAA
+
AATTC-3ˊ
G-5ˊ
3ˊ突出黏性末端(PstⅠ): 5ˊ-CTGCA↓G-3ˊ 5ˊ-CTGCA 3ˊ-G↑ACGTC-5ˊ 3ˊ-G
( )
(2) β-半乳糖苷酶系统筛选
(二)根据重组子结构特征进行筛选的方法 (1)快速裂解菌落并鉴定分子大小 (2)内切酶酶切图谱鉴定
(3)分子杂交
(4)PCR
(5)核酸序列测定
小结:
(1)分离:提取和获得目的基因和载体
(2)切割:分别对目的基因和载体DNA
酶切; (3)连接:目的基因与载体连接,形成 新的重组 DNA分子; (4)转化:用重组DNA分子转化受体细 胞; (5)筛选:筛选转化成功的细胞克隆 (6)表达:培养获得外源基因的细胞或
基因敲除的原理
① ② ③
RNAi 基因突变
同源重组
RNAi引起基因敲除的机制
同源重组引起的基因敲除
同源重组进行的基因敲除是通常意义上 的基因敲除 适用范围:适用的细胞既可以是原核细 胞,也可以是真核细胞; 原理(应用DNA同源重组原理):通过外源 载体和内源靶位点相同的核苷酸序列之 间的同源重组,使外源DNA定点整合到靶 细胞的特定的基因座上
2、克隆载体的选择和构建
用于基因组文库构建的载体通常选装载量较大的λ噬菌体 和黏性质粒; cDNA文库和克隆较小DNA片段通常选pUC系列质粒; 待测DNA序列使用M13噬菌体。
3、目的基因与载体的连 接
⑴粘性末端连接:
由同一种限制酶切 割或不同的限制酶切割 形成互补的黏性末端。 经退火后,由DNA连接 酶连接。
的DNA在体外重组于能自我复制 的载体DNA分子上,然后将重组 DNA导入宿主细胞中进行增生, 以获得大量的目的DNA片段,或 以此为基础,通过基因的诱导 表达,得到大量相应蛋白质产 物的过程。 又称为分子克隆技术或基 因工程技术
第二节
重组DNA技术的发展史
基因工程的诞生
1、Berg的开创性实验-第一个实现DNA重组 猴病毒SV40的DNA+λ噬菌体的DNA
(2)平端连接:
平端 DNA片段可以在T4 DNA连接酶的
作用
下相连接,但连接效率较低。为提高连接
效率,
所用的ATP及T4 DNA连接酶的浓度比粘性末 端 连接要高些。
(3)定向连接:
Eco RⅠ切割位点 Bg lⅡ切割位点
GAATTC CTTAAG AGATCT TCTAGA
GAATTC CTTAAG AGATCT TCTAGA
ACG-OH TACTTAA-P P-AATTCGT OH-GCA
-ACGAATTCGT-TGCTTAAGCA
3、DNA聚合酶
具有5`→3`聚合活性、5`→3`外切酶活性、3`→5`外 切酶活性。
可用于合成双链cDNA分子或片断连接,探针制备,序
列分析等。
耐热DNA聚合酶 最适反应温度为75~80℃ 具有5ˊ→3ˊ外切酶活性,不具有3ˊ→5ˊ外切酶活性
G-3ˊ
+
ACGTC-5ˊ
平端缺口(钝性末端)( SmaⅠ) 5ˊ-CCC↓GGG-3ˊ 3ˊ-GGG↑CCC-5ˊ 5ˊ-CCC 3ˊ-GGG
+
GGG-3ˊ CCC-5ˊ
切割方式:对dsDNA 2条链同时切割产生3种不同缺口
2、DNA连接酶
催化DNA中相邻的5ˊ端磷酸基和3ˊ-OH末端之间形成 3ˊ→5ˊ磷酸二酯键。 大肠杆菌连接酶,只能连接粘性末端,T4噬菌体连接酶不 但能连接粘性末端, 还能连接齐平末端。
4、重组DNA导入受菌体
将重组DNA或其他外源DNA导入宿主细胞的常用方法:
转化、感染、转染、显微注射、电穿孔等。 转化(transformation):是指将重组质粒DNA导入受体细胞。
转染( transfection):将重组噬菌体 DNA 直接引入受体细 胞的过程。 转导(transduction):重组噬菌体DNA分子,在体外经过包 装成具有感染能力的噬菌体颗粒,再以此噬菌体为载体,将 重组DNA导入受体细胞内的过程,也称为感染(infection)。
4、具备一个或多个限制性内切酶的单一识别点(多 克隆位 点,MCS)。 5、具有较高的遗传稳定性。
3、常用载体
质粒DNA、噬菌体DNA、病毒DNA、酵母DNA
这些载体均需经人工构建,除去致病基因,并赋 予一些新的功能:如有利于进行筛选的标志基因、单一 的限制酶切点等。
1、质粒(plasmid): 质粒为细菌染色体之外一些能独立复制并保持稳 定遗传的复制子。结构上,它是一种双链闭合环状的 DNA分子。
↓
克隆基因的表达
1、 制备目的基因
(1)化学合成: 已知目的基因的核苷酸序列或根据基因产物的氨基酸序 列推导出相应基因DNA碱基序列。 目前使用DNA合成仪合成的片段长度有限,一般用于小 分子活性多肽基因的合成,较长的链则须分段合成,然后用
连接酶加以连接。
(2)构建基因组DNA文库:
将某种生物细胞的整个基 因组DNA用物理或酶学的方法 切割成预期大小的片断,并将 所有这些片断都与适当的载体 连接,引入相应的宿主细胞中 保存和扩增。 理论上讲,这些重组载体 上带有了该生物体的全部基
生物体,获得所需的遗传性
状或表达出所需要的产物。
修改遗传信息的第二步: 怎样将需要的信息导入到细胞?
重组质粒DNA转化微生物
化学转化法
电转化法 基因枪转化法
化学转化法的特点 适用微生物较少 效率较高
电转化法的特点 适用微生物多 效率高 死亡率高
基因枪转化法的特点 适用微生物较少 效率较高
革兰氏阳性菌的转化 一般需要制备原生质体
5、末端转移酶 催化单脱氧核苷酸转移到DNA3`-端羟基上。
应用:探针标记,标记测序以及制备人工黏性末端。 6、T4多聚核苷酸激酶 催化多聚核苷酸5ˊ羟基末端磷酸化。
用途:⑴放射性标记DNA的5`端
⑵使缺少5`-磷酸基的DNA磷酸化用于连接反应。 7、S1核酸酶 单链核酸内切酶,降解单链DNA或RNA。
图1
同 源 重 组 原 理 图 示
单交换
双交换
图2
同源重组引起的基因敲除—ES细胞
构建与靶基因同源 (10~15kb)的载体 技 术 路 线 外显子插有新霉素抗 性基因 (neor)作为 正选择
疱疹病毒胸苷激酶 (HSV-tk)基因作为 负选择
将重组体导入ES细胞,体外培养
neor 和HSV-tk作双重筛选 显微注射 回交得到X被敲除的动物 表型分析
Leabharlann Baidu
1978年Nobel生理或医学奖
1.定义:能识别双链DNA分子中某特定的核苷酸序列,并
在识别序列内或附近切割DNA双链结构的一类核
酸内切酶(在核酸分子链的内部制造切口的酶)。
2.来源:原核生物
3.分类:根据结构、作用特点不同,分为三类。 Ⅰ型酶、Ⅲ型酶:
具有限制切割与甲基化修饰活性。Ⅰ型和Ⅲ型酶都没
CELLECTIS S.A. NASDAQ
2015.11.18 DNA剪切技术治疗1岁女童获成功
基因组编辑技术简介
Genome Editing
2015.11.22 HuangCH @ J208
修改遗传信息的第一步: 按我们的设计来重组DNA
第一节
基 本 概 念
重组DNA技术:
是指在基因水平上,将目
5、重组体的筛选与鉴定
筛选是指通过某些特定方法,从被转 化的细胞群体或基因文库中,鉴别出真正 的阳性重组子的过程。
方法: (一)根据遗传表型进行筛选的方法 (1)抗生素抗性筛选 (2)β-半乳糖苷酶系统筛选 (二)根据重组子结构特征进行筛选的方法
(一)根据遗传表型进行筛选的方法 (1)抗生素抗性筛选:
4、碱性磷酸酶
去除DNA、RNA、dNTP和NTP 5ˊ端的磷酸根。
(1)5’端标记 (2)制备载体时,用碱性磷酸酶处理后,可防止载体自身 连接,提高重组效率。 碱性磷酸酶有细菌碱性磷酸酶(BAP)和牛小肠碱性磷酸 酶(CIP)。CIP能在 1% SDS溶液中68 ℃加热15 min而 失活,故CIP较为常用。
EcoRⅠ+ Bg lⅡ 双酶切
AATTC G A TCTAG
AATTC G GATCT A
Eco RⅠ+ Bg lⅡ 双酶切
+
AATTC G
A TCTAG
T4 DNA连接酶
GAATTC CTTAAG AGATCT TCTAGA
重组体
(4)同聚物加尾连接:
(5)人工接头连接:
接头是指含有某些
限制性内切酶切点的寡
第四节
重组DNA技术常用载体
一、定义
是指能携带目的基因进入宿主细胞进行扩增和表达的
一类DNA分子。
分类: 克隆载体:用于在宿主细胞中克隆和扩增外
源DNA片段。
表达载体:用于在宿主细胞中获得外源基因 表达产物。
二、特点
1、具备复制能力。 2、具备一个或多个筛选标志。
3、具备较多拷贝数,易从宿主细胞中分离纯化。
真菌的转化 一般需要制备原生质体
植物遗传转化方法和技术
根癌农杆菌介导的植物转基因
图10-1 农杆菌侵染伤口的模式图
基因枪介导法
电转化法 PEG转化法 花粉管通道法
动物遗传转化方法和技术
原核显微注射法 胚胎干细胞介导法 病毒载体法
基因重组/敲除的概念及简史
1980年代初,ES细胞分离和体外培养成功奠 定了基因重组/敲除的技术基础 1985年首次证实了哺乳动物细胞中同源重组 的存在奠定了基因重组/敲除的理论基础 1987年,Thompsson et al首次建立了完整的ES 细胞基因敲除的小鼠模型 在随后的时间里基因敲除技术得到了进一步 发展和完善
大多数载体均带有抗生素抗性基因 a.构建重组体时,保留了抗性基因活性,所转化的细胞
就能在含此种抗生素的培养基中生长,未转化的细胞
则不能生长。 b.插入失活法:外源基因插入到一个抗性基因位点,使
此种抗生素抗性消失,重组体转化的细菌不能在含有
这种抗生素的培养基中生长。
抗 生插 素入 抗失 性活 筛法 选
是感染细菌的一类病毒 ,寄生于细菌中,并能溶解 细菌细胞,故称噬菌体。
噬 菌 体 生 活 周 期
3、酵母
酵母人工染色体(YAC):用于大片段DNA的克隆。
4、病毒
第五节
重组DNA技术
基本步骤
目的基因的获取
↓
克隆载体的选择
↓
目的基因与载体 连接成重组DNA
↓
重组DNA导入受体菌
↓
重组体的筛选
1980年Nobel化学奖
2、Boyer-Cohen实验-第一个取得基因工程成功 1973年构建双重抗药性重组质粒 1973年是基因工程诞生的元年
第三节
工具酶
1、
“基因剪刀”-限制性核酸内切酶
Werner Arber 理论预见限制酶
Hamilton O. Smith 得到第一个限制酶
Daniel Nathans 用限制酶切得SV40 DNA片断
因,称为基因文库。
(3)构建cDNA文库:
(4)聚合酶链反应(PCR)
已知目的基因的基因序列,用PCR从基因组 DNA中获得目的基因,或用逆转录PCR方法直接 从mRNA获得特定基因的cDNA。
(5)直接用限制性内切酶切取、分离: 对一些物理图谱已经确定,背景资料 清楚的原核生物、噬菌体及病毒等基因组, 可直接用限制性内切酶消化后,通过分离获 得目的基因。
有多大的实用价值。 Ⅱ型酶: 应用广泛,能在DNA分子内部的特异位点,识别和切 割双链DNA,其切割位点的序列可知、固定。 通常所说的限制性内切酶就是指Ⅱ型酶。
4.识别和切割位点:
识别位点:即为Ⅱ型酶识别的特殊DNA序列
通常是4~8个碱基对、具有回文序列的DNA片段 5’ – G A A T T C - 3’ 3’ – C T T A A G - 5’
pBR322质粒载体
①相对分子质量小,长度为4.3kb。
②含有氨苄青霉素和四环素的抗性 基因(Ampr和Tetr)。
③有24种限制性内切酶位点。
④有一个复制起始点(ori)及与 DNA复制有关的序列,赋予该质粒 复制子特性。 ⑤为松弛型复制子。
2、噬菌体(bacteriophage,phage)
存活的ES细胞
图 示
ZFN 技术原理
锌指核酸酶(Zinc-finger nucleases, ZFN)是人工改造的限制性核酸内 切酶,利用不同的锌指结构识别特异DNA序列,利用核酸酶切断靶DNA。
• 锌指结构中每一个α螺旋可以特异识别 3-4个碱基; • 人工设计识别特异DNA序列的α螺旋采 用如上的通用序列,通过改变其中7个 X来实现识别不同的三联体碱基, TGEK是多个螺旋间的连接序列; • 构建成对人工锌指结构域和FokI融合 蛋白(ZFN)可以在指定区域切断 DNA双链。
。
① 5`突出粘性末端
② 3`突出粘性末端
③ 平头(钝性末端)
5ˊ突出黏性末端(EcoRⅠ): 5ˊ-G↓AATTC-3ˊ
3ˊ-CTTAA↑G-5ˊ
5ˊ-G
3ˊ-CTTAA
+
AATTC-3ˊ
G-5ˊ
3ˊ突出黏性末端(PstⅠ): 5ˊ-CTGCA↓G-3ˊ 5ˊ-CTGCA 3ˊ-G↑ACGTC-5ˊ 3ˊ-G
( )
(2) β-半乳糖苷酶系统筛选
(二)根据重组子结构特征进行筛选的方法 (1)快速裂解菌落并鉴定分子大小 (2)内切酶酶切图谱鉴定
(3)分子杂交
(4)PCR
(5)核酸序列测定
小结:
(1)分离:提取和获得目的基因和载体
(2)切割:分别对目的基因和载体DNA
酶切; (3)连接:目的基因与载体连接,形成 新的重组 DNA分子; (4)转化:用重组DNA分子转化受体细 胞; (5)筛选:筛选转化成功的细胞克隆 (6)表达:培养获得外源基因的细胞或
基因敲除的原理
① ② ③
RNAi 基因突变
同源重组
RNAi引起基因敲除的机制
同源重组引起的基因敲除
同源重组进行的基因敲除是通常意义上 的基因敲除 适用范围:适用的细胞既可以是原核细 胞,也可以是真核细胞; 原理(应用DNA同源重组原理):通过外源 载体和内源靶位点相同的核苷酸序列之 间的同源重组,使外源DNA定点整合到靶 细胞的特定的基因座上
2、克隆载体的选择和构建
用于基因组文库构建的载体通常选装载量较大的λ噬菌体 和黏性质粒; cDNA文库和克隆较小DNA片段通常选pUC系列质粒; 待测DNA序列使用M13噬菌体。
3、目的基因与载体的连 接
⑴粘性末端连接:
由同一种限制酶切 割或不同的限制酶切割 形成互补的黏性末端。 经退火后,由DNA连接 酶连接。
的DNA在体外重组于能自我复制 的载体DNA分子上,然后将重组 DNA导入宿主细胞中进行增生, 以获得大量的目的DNA片段,或 以此为基础,通过基因的诱导 表达,得到大量相应蛋白质产 物的过程。 又称为分子克隆技术或基 因工程技术
第二节
重组DNA技术的发展史
基因工程的诞生
1、Berg的开创性实验-第一个实现DNA重组 猴病毒SV40的DNA+λ噬菌体的DNA
(2)平端连接:
平端 DNA片段可以在T4 DNA连接酶的
作用
下相连接,但连接效率较低。为提高连接
效率,
所用的ATP及T4 DNA连接酶的浓度比粘性末 端 连接要高些。
(3)定向连接:
Eco RⅠ切割位点 Bg lⅡ切割位点
GAATTC CTTAAG AGATCT TCTAGA
GAATTC CTTAAG AGATCT TCTAGA
ACG-OH TACTTAA-P P-AATTCGT OH-GCA
-ACGAATTCGT-TGCTTAAGCA
3、DNA聚合酶
具有5`→3`聚合活性、5`→3`外切酶活性、3`→5`外 切酶活性。
可用于合成双链cDNA分子或片断连接,探针制备,序
列分析等。
耐热DNA聚合酶 最适反应温度为75~80℃ 具有5ˊ→3ˊ外切酶活性,不具有3ˊ→5ˊ外切酶活性
G-3ˊ
+
ACGTC-5ˊ
平端缺口(钝性末端)( SmaⅠ) 5ˊ-CCC↓GGG-3ˊ 3ˊ-GGG↑CCC-5ˊ 5ˊ-CCC 3ˊ-GGG
+
GGG-3ˊ CCC-5ˊ
切割方式:对dsDNA 2条链同时切割产生3种不同缺口
2、DNA连接酶
催化DNA中相邻的5ˊ端磷酸基和3ˊ-OH末端之间形成 3ˊ→5ˊ磷酸二酯键。 大肠杆菌连接酶,只能连接粘性末端,T4噬菌体连接酶不 但能连接粘性末端, 还能连接齐平末端。