复旦大学基础医学院生物化学与分子生物学专业考研资料758细胞生物学(一)911生物化学(二)补充
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P53基因和蛋白的结构与功能:
一、基因组结构:P53基因位于17号染色体P13,由11个外显子和10个内含子构成。
二、蛋白结构:P53蛋白由393个氨基酸构成;在正常细胞内以同源四聚体的形式存在;含3个主要功能区:①酸性区:由氮末端第1~80位氨基酸残基构成,具有转录活化功能;②核心区:由第102~290位氨基酸残基构成,具有DNA结合功能。
③碱性区:由碳末端第319~393位氨基酸残基构成,具有同源四聚体生成必须的功能结构域。
三、正常生理功能:监视细胞染色体DNA的完整性;当细胞染色体DNA受到损坏时,P53使细胞停滞与G1期,同时参与损伤DNA的修复;如果DNA修复失败,P53启动细胞程序性凋亡,防止损伤细胞发生癌变。
四、P53突变与肿瘤:①发生突变后,P53不但失去本身抑制细胞癌变的功能,同时还使P53获得某些癌基因的功能,受累细胞易于发生恶性转化。
②突变的P53与野生型的P53形成的杂四聚体不具备DNA结合的功能,因而一个等位基因发生突变时,另一正常等位基因也将功能性失活。
锌指结构:由一个α-螺旋和两个反平行的β-折叠三个肽段组成。
形似手指,具有结合Zn2+的功能。
锌指的氮端两个半胱氨酸(Cys)残基,碳端有两个组氨酸(His)残基,这四个残基在空间上形成一个洞穴,恰好容纳一个Zn2+,由于Zn2+可稳定模体中α-螺旋结构,致使此α-螺旋能镶嵌于DNA的大沟中,因此含锌指结构的蛋白质都能与DNA或RNA结合。
钠钾泵的结构特点和转运机制:在细胞膜上能催化ATP水解释放能量,使钠离子和钾离子逆浓度梯度方向进行跨膜运输的酶称为钠钾ATP酶,即钠钾泵。
它是由两个α亚基和两个β亚基组成的四聚体。
α亚基为大亚基,分子量为120KD,是一个多次跨膜的膜整合蛋白,具有ATP酶活性,在膜外表面有两个高亲和钾离子结合位点,胞质面有3个高亲和钠离子结合位点。
β亚基为小亚基,分子量为50KD,是具有组织特异性的糖蛋白,并不直接参与,离子的跨膜运动,但能帮助在内质网新合成α亚基进行折叠。
转运机制:第一步,在细胞膜内侧,钠离子与钠钾ATP酶结合后,激活ATP酶活性,将ATP水解成ADP和高能磷酸根,磷酸根与α亚基上的一个天冬氨酸残基共价结合使其磷酸化,导致酶蛋白构象发生变化,与钠离子结合的部位转向膜外侧,这种磷酸化的酶与钠离子结合能力降低,因而在膜外侧释放钠离子。
第二步,改变构象的ATP酶在膜外有钾离子存在时,对钾离子的亲和力高并与之结合,钾离子与磷酸化的酶结合后促使其去磷酸化,磷酸根很快解离,结果酶的构象恢复原状,与钾离子的亲和力低,将钾离子释放到胞内,完成整个循环。
检测点(check point):细胞中存在一系列为了保证细胞染色体数目完整性及细胞周期正常运转的监控系统,可对细胞周期中发生的重要事件及出现的故障加以检测,只有当这些事件完成和故障修复后,才允许细胞周期进一步运行。
包括未复制-DNA检测点、纺锤体组装检测点、染色体分离检测点和DNA损伤检测点。
未复制-DNA检测点的作用是识别未复制-DNA并抑制MPF激活;纺锤体组装检测点的作用主要是防止纺锤体组装不完全或发生错误的中期细胞进入后期,即使细胞中仅有一个染色单体上的动粒未与纺锤体微管正确相连,也不能进入后期;染色体分离检测点是通过检测发生分离的子代染色体在后期末细胞中的位置,来决定细胞是否退出M期,进入末期,阻止了子代染色体未正确分离前进入末期及进行胞质分裂,保证了子代细胞含有一套完整的染色体;DNA损伤检测点监控DNA损伤的修复,决定细胞周期是否继续进行。
质粒,plasmid:是一种广泛存在于包括细菌、酵母等多种微生物中的、独立于宿主染色体之外的、能自主复制和稳定遗传的DNA分子。
通常为双链环状的超螺旋结构。
可分为严紧型和松弛型。
后者是最常用的克隆载体。
常带有抗性基因,利于筛选。
PCR:即聚合酶链反应。
是在体外对目的DNA进行大量扩增的技术。
当目的基因加热变性成单链后,与另一对特异性引物在退火时进行杂交,在耐热性DNA聚合酶的催化下进行复制,并循环几十次(一般为25~30次)后,使目的DNA得到大量扩增。
其基本原理是DNA的变性、复性及分子杂交。
①反应体系:模板DNA、特异引物、耐热DNA聚合酶、dNTP及Mg2+的缓冲液。
②反应步骤:1.变性:将反应体系加热至95℃,使模板链变性为单链DNA分子。
2.退火:将反应体系温度降至适宜温度(一般比Tm小5℃)使引物和模板链杂交。
3.延伸:将温度升至72℃,DNA聚合酶以dNTP为底物按模板碱基序列合成子链DNA。
以上三个步骤为一个循环,循环几十次(一般为25~30次)后即可达到扩增DNA的目的。
最后可以进行电泳鉴定。
③主要用途:用于目的基因的克隆、基因的体外突变、DNA和RNA的微量分析、DNA测序和基因突变分析。
RT-PCR:是将RNA逆转录反应与PCR联合应用的一种技术。
首先以RNA为模板,在逆转录酶的催化下合成cDNA,再以cDNA为模板通过PCR来扩增目的基因。
细胞周期蛋白(cyclin):是真核细胞中的与细胞周期的调节有关的一类蛋白质,它们能随细胞周期进程周期性的出现及消失,由T.Evans等在1983年首次发现。
每一个细胞周期蛋白激活一个细胞周期蛋白依赖的激酶(Cdk)。
细胞周期蛋白依赖性激酶(Cdk):是一类必须与细胞周期蛋白结合后才具有激酶活性的蛋白激酶,通过磷酸化多种与细胞周期相关的蛋白在细胞周期调控中起关键作用。
着丝粒(centromere):是真核生物细胞在进行有丝分裂(mitosis)和减数分裂(meiosis)时,染色体分离的一种“装置”,也是姐妹染色单体在分开前相互联结的位置,在染色体的形态上表现为主缢痕,由高度重复的异染色质组成。
动粒(kinetochore):是电镜下观察到的,存在于主缢痕两侧特化的圆盘状结构。
由3层蛋白质结构组成,是细胞分裂时纺锤丝动粒微管附着部位。
参与细胞分裂后期染色体向两极的移动。
PKA,即c AMP-依赖性蛋白激酶A:是一种由2个催化亚基C和2个调节亚基R组成的四聚体。
每个R亚基上有2个c AMP结合位点,当c AMP与R亚基结合后,R亚基脱落,游离的C亚基能够使底物蛋白的特定位置的丝氨酸或苏氨酸残基磷酸化。
因其活性受c AMP 调控,故称为c AMP-依赖性蛋白激酶A。
细胞系,cell line:一个由原代培养建立的有特定性质的单克隆细胞,经扩大培养并冻存后得到的可以在体外无限传代培养的、具有生物学特性和培养方法描述的、高度均一的、被学界接受的细胞群。
绝大多数细胞系是肿瘤细胞。
细胞系是细胞生物学研究中最基本工具。
细胞株,Cell Strain:通过选择法或克隆形成法从原代培养物或细胞系中获得具有特殊性质或标志物的培养物称为细胞株。
遗传密码及其特点:DNA或mRNA中的核苷酸序列与蛋白质中氨基酸序列之间的对应关系称为遗传密码。
特点有:①方向性;②连续性;③简并性;④通用性;⑤摆动性。
限制性核酸内切酶,restriction endonuclease,RE:简称限制性内切酶或限制酶;是一类核酸内切酶,能识别双链DNA分子内部的特异位点并裂解磷酸二酯键。
卵磷脂胆固醇酰基转移酶,LCAT:催化HDL表面的卵磷脂2位脂酰基转移至胆固醇3位羟基生成溶血磷脂和胆固醇酯,使位于HDL表面的胆固醇酯化后向HDL内核转移,促使HDL成熟及胆固醇逆向转运。
密码子,coden:从mRNA分子5′末端起的第一个AUG开始,每三个核苷酸为一组构成一个密码子,编码某一种特定的氨基酸或作为蛋白质合成的起始、终止信号,称为三联体密码,也称遗传密码子。
共64个密码子,其中61个密码子编码20种氨基酸。
反密码子,anticodon:是位于tRNA反密码子环上的3个相邻核苷酸序列。
在蛋白质合成过程中,可以通过碱基互补配对原则结合mRNA上的特定密码子,从而帮助tRNA正确装载氨基酸。
SH2domain:存在于一些蛋白质分子中的一个可以识别和结合其他一些蛋白质中的磷酸化酪氨酸模体的结构域,最初在src癌基因家族产物同源的受体酪氨酸激酶中发现,但是与其SH1催化域不同而被命名为SH2结构域。
目的基因:是指已被或欲被分离、改造、扩增和表达的特定基因或DNA片段,能编码某一产物或决定某一性状。
转导作用transduction:当病毒从被感染的细胞(供体)释放出来,再次感染另一细胞(受体)时,发生在供体细胞与受体细胞之间的DNA转移及基因重组即为转导作用。
泛素和泛素化ubiquitination:泛素是一种76个氨基酸残基组成的多肽,因其广泛存在与真核细胞而得名。
泛素介导的蛋白质降解过程首先由泛素与被选择降解的蛋白质形成共价连接,使其标记并被激活,然后被蛋白酶体特异性的识别泛素标记的蛋白质并将其降解,泛素的这种标记作用称为泛素化。
必需脂肪酸(essential fatty acid):一组由植物合成、人体不能合成、必须从食物获得的多价不饱和脂酸。
主要包括亚油酸、亚麻酸和花生四烯酸。
必需氨基酸(essential amino acid):机体必需但不能自身合成,必须由食物提供的氨基酸。
人体一共8种:赖色亮苯异苏甲缬。
siRNA:指人为合成或表达的与m RNA靶序列完全互补特异结合的21到23bp长度双链小干扰RNA分子,可与m RNA靶位点结合引起靶m RNA降解从而抑制靶基因表达,常用于基因功能研究。
基因敲除knock out:靶基因在基因组水平被人为地永久损坏而100%阻断其表达的方法,可用于基因功能研究和构建细胞、动物模型。
抑癌基因anti oncogene:也被称为抗癌基因。
是正常细胞所具有的、能抑制细胞恶性增殖的一类隐性基因。
这类基因编码的蛋白质通常能与转录因子结合,或本身就是转录因子,可作为负调控因子,影响细胞周期相关蛋白的合成及DNA的复制,进而调节细胞周期的进程。
减数分裂,meiosis:发生于有性生殖细胞的成熟过程中,主要特征是DNA复制一次,而细胞分裂两次,因此子代细胞染色体数目比亲代细胞减少一半,而成为仅具有单倍体遗传物质的配子细胞。
有丝分裂mitosis:也称间接分裂。
是高等真核细胞分裂的主要方式,亲代细胞经过复制的染色体被均等分配到两个新细胞中,有利于细胞在遗传上的稳定。
DNA损伤:由自发的或环境的因素引起DNA一级结构的任何异常的改变称为DNA的损伤。
常见的DNA的损伤包括碱基脱落、碱基修饰、交联、链的断裂、重组等。
细胞周期同步化:在一般培养条件下,群体中的细胞处于不同的细胞周期时相之中。
为了研究某一时相细胞的代谢、增殖、基因表达或凋亡,常需采取一些方法使细胞处于细胞周期的同一时相,这就是细胞同步化技术。
细胞运输:小分子和离子的跨膜运输包括简单扩散、离子通道扩散、易化扩散和主动运输;通过胞吞和胞吐作用进行大分子和颗粒物质的运输。
举三个蛋白质分离纯化的技术及原理:盐析、电泳、层析
①盐析:蛋白质在水溶液中的溶解度是由蛋白质周围亲水基团与水形成水化膜的程度,以及蛋白质分子带有电荷的情况决定的。
而当蛋白质在等电点处时,蛋白质不带电,溶解度小,当用中性盐加入蛋白质溶液,中性盐对水分子的亲和力大于蛋白质,于是蛋白质分子周围的水化膜层减弱乃至消失。
同时,中性盐加入蛋白质溶液后,由于离子强度发生改变,蛋白质表面电荷大量被中和,更加导致蛋白溶解度降低,使蛋白质分子之间聚集而沉淀。
②电泳:由于氨基酸带有正电荷或负电荷,蛋白质往往带有净正电荷或净负电荷。
蛋白质在高于或低于其pI的溶液中为带电颗粒,在电场的作用下按照它们净电荷多少和性质、大小及形状不同,能向正极或负极移动,通过蛋白质在电场中的泳动而达到分离各种蛋白质。
③层析:利用混合物中各组分物理化学性质的差异(如吸附力、分子形状及大小、分子亲和力、分配系数等),使各组分在两相(一相为固定的,称为固定相;另一相流过固定相,称为流动相)中的分布程度不同,从而使各组分以不同的速度移动而达到分离的目的。
HDL在体内的代谢情况和其与动脉粥样硬化(AS)的联系:
肝、小肠或CM水解生成的盘状HDL在血浆卵磷脂胆固醇酰基转移酶(LCAT)的催化下,HDL表面的卵磷脂2位脂酰基转移到胆固醇3位的羟基上,生成溶血磷脂和胆固醇酯,此过程中消耗的胆固醇不断从周围细胞膜、CM及VLDL得到补充,生成的胆固醇酯转移到HDL核心,使盘状的HDL膨胀成球状HDL,成熟的HDL可被肝细胞膜上的HDL受体结合并摄入肝细胞,其中胆固醇可用于胆汁酸合称或直接通过胆汁排出体外。
这种将胆固醇从肝外组织转移到肝的过程,称为胆固醇的逆向转运(RCT)。
HDL具有抗AS的作用。
通过上述机制,HDL将肝外组织,包括动脉壁、巨噬细胞等组织细胞中的胆固醇转运到肝并代谢排出体外,降低了动脉壁胆固醇含量,同时还具有抑制LDL氧化的作用等。
在含氧的血液环境中,被氧化的HDL失去抑制LDL氧化的能力,且RCT能力下降,导致其抗AS的作用明显降低。
RNA的空间结构与功能:
1.mRNA的结构与功能:mRNA是单链核酸,其在真核生物中的初级产物称为hnRNA。
大多数真核成熟的mRNA分子具有典型的5′-端的7-甲基鸟嘌呤-三磷酸核苷(m7GpppN)的帽子结构和3′-端的多聚腺苷酸(polyA)尾巴结构。
mRNA的功能是为蛋白质的合成提供模板,分子中带有遗传密码。
mRNA分子中每三个相邻的核苷酸组成一组,在蛋白质翻译合成时代表一个特定的氨基酸、起始信号或终止信号,这种核苷酸三联体称为遗传密码子。
2.tRNA的结构与功能:tRNA的功能是在蛋白质生物合成中作为氨基酸的载体。
其二级结构由于局部双螺旋的形成而表现为“三叶草”形,可分为五个部分:①氨基酸臂:所有tRNA 的3′-末端都是以CCA结束的,可与氨基酸结合而携带氨基酸。
②TψC环:含有假尿嘧啶核苷,正常嘧啶核苷是以杂环上的N-1原子与戊糖C-1′原子连接形成糖苷键,而假尿嘧啶核苷是以杂环上C-5原子与戊糖C-1′原子连接形成糖苷键。
③反密码子环:其反密码环中部的三个核苷酸组成反密码子,在蛋白质生物合成中,tRNA反密码子依靠碱基互补的方式辨认mRNA上相应的密码子,将其所携带的氨基酸运送到正确的位置合成蛋白质。
④双氢尿嘧啶(DHU)环:含稀有碱基双氢尿嘧啶。
⑤可变环:位于TψC环和反密码子环之间。
3.rRNA的结构与功能:rRNA与蛋白质一起构成核糖体,作为蛋白质生物合成的场所。
原核生物的rRNA有三种:5S,16S,23S。
真核生物的rRNA有四种:5S,5.8S,18S,28S。
血浆蛋白的功能:(1)维持血浆的胶体渗透压,(2)维持血浆正常PH,(3)运输作用,(4)免疫作用,(5)催化作用,(6)营养作用,(7)凝血、抗凝血和纤溶作用。
细胞凋亡的生理意义:细胞凋亡是机体维持自身稳定的一种生理机制。
机体通过细胞凋亡清除损伤、衰老和突变的细胞,维持生理平衡。
某些致病因子可使细胞凋亡的基因调控失常,导致细胞凋亡减弱或增强,从而破坏了机体细胞的自稳态,最终导致各种疾病的发生。
细胞凋亡的形态学变化:主要包括细胞皱缩、染色质凝聚、凋亡小体形成和细胞骨架解体等。
其中以细胞核的变化最为显著。
衰老细胞的形态改变
细胞组分;形态变化。
细胞核增大、染色深、核内有包含物。
染色质凝聚、固缩、碎裂、溶解。
质膜粘度增加、流动性降低。
细胞质色素积聚、空泡形成。
线粒体数目减少、体积增大、线粒体DNA突变或丢失。
高尔基体碎裂。
尼氏体消失。
包含物糖原减少、脂肪积聚。
核膜内陷。
细胞凋亡和细胞坏死的比较
比较内容;细胞凋亡;细胞坏死。
起因;生理或病理性;病理性变化或剧烈损伤。
范围;单个散在细胞;大片状组织或成群细胞。
细胞膜;保持完整,一直到形成凋亡小体;破损。
细胞核;固缩,DNA片段化;弥漫性降解。
染色质;凝聚在核膜下呈半月状;呈絮状。
线粒体;自身吞噬;肿胀。
细胞体积;固缩变小;肿胀变大。
凋亡小体;有,被邻近细胞或巨噬细胞吞噬;无,细胞自溶,残余碎片被巨噬细胞
吞噬。
基因组DNA;有控降解;随机降解,电泳图谱呈涂抹状。
基因活动;有基因调控;无基因调控。
自吞噬;常见;缺少。
蛋白质合成;有;无。
微粒体,Microsome:微粒体并不是正常细胞中的某个部分,而应用超速分级分离的方法,从细胞匀浆中分离出直径在100nm左右的球囊状封闭小泡,称为微粒体。
亚线粒体,submitochondrial:用超声波将线粒体破碎,线粒体内膜碎片可自然卷成颗粒朝外的小膜泡,这种小膜泡称为亚线粒体小泡,这些小泡具有电子传递和磷酸化的功能。
磷酸戊糖途径的生理意义:磷酸戊糖途径是Glc在体内氧化分解的另一条重要途径。
代谢反应在胞质中进行,分为两个阶段:一是氧化反应,生成磷酸戊糖、NADPH及CO2;二是非氧化反应,包括一系列基团转移。
磷酸戊糖途径的生理意义在于提供NADPH和5-磷酸核糖。
1.是体内生成NADPH的主要代谢途径。
首先,NADPH是体内许多合成代谢的供氢体,其次,NADPH参与体内羟化反应,此外,NADPH还用于维持GSH的还原性状态,借此保护蛋白质和酶的巯基免遭氧化、维持红细胞膜的完整性。
2.是体内生成5-磷酸核糖的唯一代谢途径:体内合成核苷酸和核酸所需的核糖或脱氧核糖均以5-磷酸核糖的形式提供。
胰岛素降低血糖的机制:胰岛素是体内唯一降血糖的激素,也是唯一促进糖原、脂肪和蛋白质合成的激素。
胰岛素分泌受血糖控制,血糖升高促进胰岛素分泌,血糖降低则胰岛素分泌减少。
胰岛素降血糖的机制:①促进肌、脂肪组织等细胞膜葡萄糖载体将葡萄糖转运如细胞;
②通过增强磷酸二酯酶PDE活性,降低cAMP水平,从而使糖原合酶活性增强、磷酸化酶活性降低,加速糖原合成、抑制糖原分解;③通过激活丙酮酸脱氢酶磷酸酶而使丙酮酸脱氢酶激活,加速丙酮酸氧化成乙酰CoA,从而加快糖的有氧氧化;④抑制肝内糖异生,这是通过抑制PEP羧激酶的合成以及促进氨基酸进入肌组织并合成蛋白质,减少肝糖异生的原料;⑤通过抑制脂肪组织内的HSL,可减缓脂肪动员的速率而促进组织利用Glc。
α-磷酸甘油穿梭:线粒体外的NADH+H+在胞质甘油磷酸脱氢酶催化下,使磷酸二羟丙酮还原生成α-磷酸甘油,后者通过线粒体外膜,再经线粒体内膜近胞质侧的含FAD辅基的磷酸甘油脱氢酶催化生成磷酸二羟丙酮和FADH2。
FADH2直接将2H传递给CoQ进入氧化呼吸链生成1.5分子ATP。
苹果酸穿梭系统:此系统以苹果酸和天冬氨酸为载体,在苹果酸脱氢酶和谷草转氨酶的催化下。
将胞质中NADH的氢原子带入线粒体交给NAD+,再沿NADH氧化呼吸链进行氧化磷酸化。
因此,经此穿梭系统带入一对氢原子可生成3分子ATP。
乙酰CoA的来源和去路:
来源:1、糖的有氧氧化:葡萄糖,→丙酮酸,→乙酰CoA;
2、脂肪酸的β-氧化:脂肪酸,→脂酰CoA,→乙酰CoA;
3、生酮氨基酸、生糖兼生酮氨基酸的分解代谢产生乙酰CoA;
4、酮体的氧化分解。
β-羟丁酸,→乙酰乙酸,→乙酰CoA。
去路:1、进入三羧酸循环被彻底氧化;2、在肝脏合成酮体;3合成脂肪酸和胆固醇;
4、参与乙酰化反应
酮体的生成及利用:酮体是乙酰乙酸、β-羟丁酸和丙酮的总称,是脂肪酸在肝脏中氧化分解所生成的特有的中间产物。
一、生成的部位是干细胞线粒体,原料是脂肪酸在肝细胞线粒体中氧化生成的大量乙酰CoA,关键酶是HMG-CoA合成酶,其过程分三步:
①、2分子乙酰CoA在肝细胞线粒体乙酰乙酰CoA硫解酶催化下,缩合成乙酰乙酰CoA。
②、乙酰乙酰CoA在HMG-CoA合成酶催化下,再与1分子乙酰CoA缩合成HMG CoA。
③、HMG CoA在HMG-CoA裂解酶催化下,生成乙酰乙酸和乙酰CoA。
乙酰乙酸在线粒体内膜β-羟丁酸脱氢酶催化下,被还原成β-羟丁酸;部分乙酰乙酸在乙酰乙酸脱羧酶催化下脱羧生成丙酮。
二、酮体的利用:肝外许多组织有利用酮体的酶,可将丙酮裂解成乙酰CoA,并通过三羧酸循环彻底分解氧化。
利用酮体的酶有两种,即琥珀酰CoA转硫酶(主要存在于心、肾、脑和骨骼肌细胞的线粒体中,不消耗ATP和乙酰乙酸硫激酶(主要存在于心、肾、脑细胞线粒体中,需消耗2分子ATP),过程为:β-羟丁酸→乙酰乙酸→乙酰乙酰CoA→乙酰CoA→
三羧酸循环。
丙酮可经肺排出,也可在一系列酶作用下转变成丙酮酸或乳酸,进而异生成糖。
三、酮体生成的病理生理意义:(1)在正常情况下,酮体是肝脏输出能源的一种形式:由于酮体的分子较小,故被肝外组织氧化利用,成为肝脏向肝外组织输出能源的一种形式。
长期饥饿、糖供应不足时酮体可代替Glc成为脑、肌等组织的主要能源。
(2)正常情况下血中仅含有少量酮体,在饥饿、高脂低糖饮食及糖尿病时,脂肪动员加强,引起血中酮体升高,可导致酮症酸中毒和酮尿。
四、酮体生成的调节:饱食及饥饿的影响、干细胞糖原含量及代谢的影响、丙二酰CoA抑制脂酰CoA进入线粒体。
RNA转录合成的基本过程:
1.识别:RNA聚合酶中的σ因子识别转录起始点,并促使核心酶结合形成全酶复合物。
位于基因上游,与RNA聚合酶识别、结合并起始转录有关的一些DNA顺序称为启动子。
在原核生物中的启动子通常长约60bp,存在两段带共性的顺序,即5'-TTGACA-3'和
5'-TATAATG-3',其中富含TA的顺序被称为Pribnow盒。
真核生物的启动子中也存在一段富含TA的顺序,被称为Hogness盒或TATA盒。
2.起始:RNA聚合酶全酶促使局部双链解开,并催化ATP或GTP与另外一个三磷酸核苷聚合,形成第一个3',5'-磷酸二酯键。
3.延长:σ因子从全酶上脱离,余下的核心酶继续沿DNA链移动,按照碱基互补原则,不断聚合RNA。
4.终止:RNA转录合成的终止机制有两种。
⑴自动终止:模板DNA链在接近转录终止点处存在相连的富含GC和AT的区域,使RNA 转录产物形成寡聚U及发夹形的二级结构,引起RNA聚合酶变构及移动停止,导致RNA 转录的终止。
⑵依赖辅助因子的终止:由终止因子识别特异的终止信号,并促使RNA的释放。
原核生物蛋白质生物合成过程:
1、氨基酸的活化:氨基酸与特异的tRNA由氨基酰-tRNA合成酶催化结合成氨基酰-tRNA。
起始氨基酰-tRNA是fMet-tRNA fMet。
2、肽链合成过程:⑴起始:①核糖体大小亚基分离,准备mRNA和起始氨基酰-tRNA与小亚基结合。
②mRNA在小亚基上定位结合,mRNA起始密码子AUG上游有一段富含嘌呤碱基的序列(如-AGGAGG-),称为S-D序列,能与小亚基的16S RNA3′端一段富含嘧啶碱基的序列(如-UCCUCC-)互补结合。
③fMet-tRNA fMet的结合,fMet-tRNA fMet识别并结合在mRNA起始密码子AUG上。
④核糖体大亚基结合,上述结合了mRNA、fMet-tRNA fMet 的小亚基再与大亚基结合,形成翻译起始复合物。
⑵延长:①进位:与mRNA下一个密码相对应的氨基酰tRNA进入核糖体的A位。
②成肽:在转肽酶的催化下,将P位上的tRNA所携带的甲酰蛋氨酰基或肽酰基转移到A位上的氨基酰-tRNA上,与其α-氨基缩合形成肽键。
P位上已失去蛋氨酰基或肽酰基的tRNA从核糖体上脱落。
③转位:在转位酶的作用下,核糖体向mRNA的3′-端移动一个密码子的距离,使肽酰基tRNA从A体移到P位,mRNA的下一个密码子进入核糖体A位。
重复以上循环过程,使多肽链不断延长。
⑶终止:核糖体沿mRNA链滑动,不断使多肽链延长,直到mRNA上的终止密码子出现在核糖体的A位,由释放因子识别并结合A位,是核糖体构象改变,将转肽酶活性转变为酯酶活性,水解新生肽链与结合在P位的tRNA之间的酯键,释放合成的肽链并通过水解GTP,使核糖体与mRNA分离,tRNA、RF脱落,核糖体解离为大、小亚基。