环介导等温扩增技术
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环介导等温扩增技术
胡星星 20150511 2015.10.20
主要内容
• • • • 定义 原理 操作步骤 优缺点及
定义
环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是指在等 温(60-65℃)条件下,利用链置换DNA聚 合酶短时间(通常<1h)内进行核酸扩增, 是一种“简便、快速、精确、低价”的基 因扩增方法。 其检测结果可直接肉眼观察白色沉淀 或者绿色荧光,是一种适合现场、基层快 速检测的方法。
原理
扩增启动阶段
循环扩增阶段
延伸循环阶段
扩增启动阶段
FIP F3
(5):有1个环状构造(Fc1末端5’端游离) 的单链
BIP
B3
(8):有2个环状构造(F1末端即3’端游 离和Bc1末端即5’端游离)的单链
循环扩增阶段
• FIP
F1末端延伸至形成一个环状构造(B1末端即3’端游 离);FIP 退火到茎环结构(8)上,引导链置换DNA 合 成反应,产生结构(9)的产物;随后产物(9)的B1末 端即3’ 端自动引导链置换DNA 的合成,生成产物(10) 和茎环结构(8’)(与开始的产物(8)序列互补的);
•
产物(10)和(10’)进入延伸循环步骤,分别 形成(11)和(11’);内部引物又可以(11)和(11’) 作为模板,引导链置换DNA 的合成,使产物的序 列不断延伸、环化、再延伸,最终的产物是一些 具有不同茎长度茎环结构的DNA 和带有许多环的 折叠结构的DNA 的混合物。
LAMP法实验室常规操作步骤
wenku.baidu.com
应用
LAMP 技术因其快速、高效、特异、灵 敏和经济等优点,已经应用于病原菌、寄 生虫、病毒、疾病和转基因产品检测等领 域,并且还将广泛应用于临床诊断、环境 监测、食源安全等领域,具有更为广阔的 发展应用前景。
抽取、提纯样本DNA或RNA
环介导等温扩增技术(LAMP)法扩增
实时浊度检测或目视检测绿色荧光
优缺点
• 优点:灵敏度高(比传统的PCR方法高2~5个数量级); 反应时间短(30~60分钟就能完成反应);临床使用不需 要特殊的仪器(试剂盒研发阶段推荐用实时浊度仪);操 作简单(不论是DNA还是RNA,检测步骤都是需将反应液、 酶和模板混合于反应管中,置于水浴锅或恒温箱中63℃左 右保温30~60分钟,肉眼观察结果)。 • 缺点:灵敏度高,一旦开盖容易形成气溶胶污染,故在 进行试剂盒的研发过程中可采用实时浊度仪,不要把反应 后的反应管打开;引物设计要求比较高,有些疾病的基因 可能不适合使用环介导等温扩增方法。
• BIP
B1末端延伸至形成一个环状构造(F1末端即3’端游 离);BIP 退火到茎环结构(8’)上,引导链置换DNA 合成反应,产生结构(9’)的产物;随后产物(9’)的 F1末端即3’ 端自动引导链置换DNA 的合成,生成产物 (10’)和茎环结构(8),产物( 8 )开始新一轮的循环 扩增。
延伸循环步骤
胡星星 20150511 2015.10.20
主要内容
• • • • 定义 原理 操作步骤 优缺点及
定义
环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是指在等 温(60-65℃)条件下,利用链置换DNA聚 合酶短时间(通常<1h)内进行核酸扩增, 是一种“简便、快速、精确、低价”的基 因扩增方法。 其检测结果可直接肉眼观察白色沉淀 或者绿色荧光,是一种适合现场、基层快 速检测的方法。
原理
扩增启动阶段
循环扩增阶段
延伸循环阶段
扩增启动阶段
FIP F3
(5):有1个环状构造(Fc1末端5’端游离) 的单链
BIP
B3
(8):有2个环状构造(F1末端即3’端游 离和Bc1末端即5’端游离)的单链
循环扩增阶段
• FIP
F1末端延伸至形成一个环状构造(B1末端即3’端游 离);FIP 退火到茎环结构(8)上,引导链置换DNA 合 成反应,产生结构(9)的产物;随后产物(9)的B1末 端即3’ 端自动引导链置换DNA 的合成,生成产物(10) 和茎环结构(8’)(与开始的产物(8)序列互补的);
•
产物(10)和(10’)进入延伸循环步骤,分别 形成(11)和(11’);内部引物又可以(11)和(11’) 作为模板,引导链置换DNA 的合成,使产物的序 列不断延伸、环化、再延伸,最终的产物是一些 具有不同茎长度茎环结构的DNA 和带有许多环的 折叠结构的DNA 的混合物。
LAMP法实验室常规操作步骤
wenku.baidu.com
应用
LAMP 技术因其快速、高效、特异、灵 敏和经济等优点,已经应用于病原菌、寄 生虫、病毒、疾病和转基因产品检测等领 域,并且还将广泛应用于临床诊断、环境 监测、食源安全等领域,具有更为广阔的 发展应用前景。
抽取、提纯样本DNA或RNA
环介导等温扩增技术(LAMP)法扩增
实时浊度检测或目视检测绿色荧光
优缺点
• 优点:灵敏度高(比传统的PCR方法高2~5个数量级); 反应时间短(30~60分钟就能完成反应);临床使用不需 要特殊的仪器(试剂盒研发阶段推荐用实时浊度仪);操 作简单(不论是DNA还是RNA,检测步骤都是需将反应液、 酶和模板混合于反应管中,置于水浴锅或恒温箱中63℃左 右保温30~60分钟,肉眼观察结果)。 • 缺点:灵敏度高,一旦开盖容易形成气溶胶污染,故在 进行试剂盒的研发过程中可采用实时浊度仪,不要把反应 后的反应管打开;引物设计要求比较高,有些疾病的基因 可能不适合使用环介导等温扩增方法。
• BIP
B1末端延伸至形成一个环状构造(F1末端即3’端游 离);BIP 退火到茎环结构(8’)上,引导链置换DNA 合成反应,产生结构(9’)的产物;随后产物(9’)的 F1末端即3’ 端自动引导链置换DNA 的合成,生成产物 (10’)和茎环结构(8),产物( 8 )开始新一轮的循环 扩增。
延伸循环步骤