分子生物学基础试验

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质粒(plasmid)是一种染色体外的稳定遗传 因子,大小在1-120kb之间,具有双链闭合 环状结构的DNA分子,主要发现于细菌、放线 菌和真菌细胞中。质粒具有自主复制和转录 能力,能使子代细胞保持它们恒定的拷贝数, 可表达它携带的遗传信息。它可独立游离在 细胞质内,也可以整合到细菌染色体中,它 离开宿主的细胞就不能存活,而它控制的许 多生物学功能也是对宿主细胞的补偿。
微量移液器的构造
微量移液器的操作
分离质粒DNA的三个基本步骤:

培养细菌使质粒扩增; 收集和裂解细菌; 分离和纯化质粒DNA。
采用溶菌酶可破坏菌体细胞壁,十二烷基硫酸钠(SDS) 可使细胞壁解,经溶菌酶和阴离子去污剂(SDS)处理 后,细菌染色体DNA缠绕附着在细胞壁碎片上,离心时 易被沉淀出来,而质粒DNA则留在清液中。用乙醇沉淀、 洗涤,可得到质粒DNA。


质粒DNA 的相对分子量一般在 106 - 107范围内,如质粒 pBR322的相对分子质量为 2.8×106,质粒pUC19的相对 分子质量为1.7×106。 在 细 胞 内 , 共 价 闭 环 DNA ( covalently closed circular DNA ,简称 cccDNA )常以超螺旋形式存在。 如果两条链中有一条链发生一处或多处断裂,分子就 能旋转而消除链的张力,这种松弛型的分子叫作开环 DNA(open circular DNA,简称ocDNA)。在电泳时, 同一质粒如以cccDNA形式存在,它比其开环和线状DNA 的泳动速度快,因此在本实验中,自制质粒DNA在电泳 凝胶中呈现3条区带。
质粒在细胞内复制的两种类型


严密控制型(stringent control):质粒只在细胞周期的 一定阶段进行复制,染色体不复制时,它也不复制。每个 细胞内只含有1个或几个质粒分子。 松弛控制型(relaxed control):质粒在整个细胞周期中 随时复制,在细胞里,它有许多拷贝,一般在20个以上。
分子生物学基础实验
指导老师:肖靓
分子生物学基础实验
分子生物学实验技术已成为生物化学及分子生物学 以及相关学科院系教学科研不可缺少的一部分。为 提高学生在分子生物学技术方面的动手能力,分子 生物学实验室主要开设常用而基本的分子生物学实 验技术。它的内容包括质粒 DNA的制备;DNA的重 组;PCR基因扩增等等。
通常大的质粒如F因子等,拷贝数较少,复制受到严格控制。小的质粒,如 ColE Ⅰ质粒(含有产生大肠杆菌素E1基因),拷贝数较多,复制不受严格控 制。在使用蛋白质合成抑制剂-氯霉素时,染色体DNA复制受阻,而松弛型 ColEⅠ质粒继续复制12-16h,由原来20多个拷贝可扩增至1000-3000个拷贝, 此时质粒DNA占总DNA的含量由原来的2%增加到40%-50%。本实验分离提纯 化的质粒pBR322、pUC19就是由ColE Ⅰ衍生的质粒。
作为基因工程的载体必须具备下列条件

是一个复制子,载体有复制点才能使与它结合的外源 基因复制繁殖。 载体在受体细胞中能大量增殖,只有高复制率才能使 外源基因在受体细胞中大量扩增。 载体DNA链上有1到几个限制性内切酶的单一识别与切 割位点,便于外源基因的插入。 载体具有选择性的遗传标记,如有抗四环素基因 (Tcr),抗新霉素基因(Ner)等,以此知道它是否已 进入受体细胞,也可根据这个标记将受体细胞从其他 细胞中分离筛选出来。 细菌质粒具备上述条件,它是基因工程中常用的 载体之一。
高压蒸汽灭菌锅
超净工作台
பைடு நூலகம்
台式高速离心机
恒温摇床
恒温培养箱
试剂
1.溶液Ⅰ( pH8.0G.E.T缓冲液):50 mmol/L葡萄糖,25mmol/LTris-HCl, 10mmol/L EDTA。灭菌后存放。临用前加溶菌酶4mg/mL。 2.溶液Ⅱ: 0.2mol/L NaOH (内含1% SDS),现配现用。 3.溶液Ⅲ( pH4.8乙酸钾溶液):5mol/L乙酸钾60mL、冰乙酸11.5mL、双 蒸馏水28.5mL。 4.酚/氯仿液(V/v=1/1):酚为重蒸酚,配制时,先将氯仿中加入异戊醇,使 其体积比为24:1,然后等量的加入重蒸酚,混匀,并用0.1mol/L TrisHCl (pH7.6)抽提几次以平衡这一混合物,于棕色瓶中存放,并在上面覆 盖等体积的0.01 mol/L Tris-HCl (pH7.6),4℃保存。 5.pH8.0 TE 缓 冲 液 : 10mmol/LTris-HCl 、 1mmol/L EDTA , 其中含 RNA 酶 20μ g/mL。 6.无水乙醇 7.70%乙醇 8. LB培养基
实验要求



上课时间与纪律:严格遵守老师的安排。 实验室内禁止饮食、勿高声谈话、随意 走动。 课前预习、课中认真操作、课后的实验 报告。 妥善保管好每组的实验器具。 实验操作要求人人动手。 值日制度:每天五位同学。
一、 质粒DNA小量制备的实验原理

要把一个有用的外源基因通过基因工程 手段,送进细胞中去进行繁殖和表达, 需要运载工具,携带外源基因进入受体 细胞的这种工具就叫载体( vector )。 载体的设计和应用是DNA体外重组的重要 条件。
二、实验目的与内容

目的:学会使用碱裂解法提取质粒DNA。 内容:细菌培养及菌体的收获、碱裂 解法提取质粒DNA。
三、实验材料和试剂

材料:大肠杆菌E.coli,含pBR322质粒。 仪器: 台式高速离心机、台式小型振荡器、EP 管(1.5mL微量离心管)、加样器(20uL~ lmL)、吸头。
LB培养基的配制

每升含有胰蛋白胨10g,酵母提取物5g, NaCl10g,琼脂糖或琼脂(固体培养基时 用)15g,用NaOH调pH至7.5。
微量移液器(pipetman)的使用

微量移液器是连续可调的,计量和转移 液体的专用仪器,其装有直接读数容量 计,读数由三位拨号数字组成,在移液 容量范围内能连续调节,从上(最大数) 到下(最小数)读取。
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