几种蛋白的提取
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(一)小麦种子谷蛋白的提取(检测)
一粒或半粒小麦种子砸碎
加1mL 70%乙醇,振荡30min
13000rpm离心10min,弃上清
沉淀加入1 mL 55%异丙醇,振荡混匀(必要时用解剖针搅匀),65℃水浴30min
13000rpm,10min弃上清
沉淀加入1 mL 55%异丙醇,同上再重复2次(共3次)
加入100μl(根据沉淀的量,适当增减)溶液B(含1%DTT):( 1 mL溶液B加0.01g DTT)65℃水浴30min(间振3-4次)
加入100μl(根据沉淀的量,适当增减)溶液B(含1.4% 4-乙烯基吡啶)1mL溶液B加14μl的4-乙烯基吡啶
65℃水浴30min(间振3-4次)
13000rpm,15min,上清即为谷蛋白溶液
吸取50μl上清,再加60μl 2×loading buffer,-20℃保存
SDS-PAGE上样前样品的处理:
1、取样品,65℃水浴30m in
2、上样量:大胶:12-15μl 小胶:10μl(两侧点样孔若点loading buffer,则条带较平直)
谷蛋白提取相关试剂
1、1M Tris-HCl(pH8.0,500 mL)
称取Tris 60.57g,加350 mL Milli-Q溶解,再加浓HCl调节pH为8.0,最后定容至500mL
2、solutionB
50%异丙醇8% Tris-Hcl(1M, pH8.0)
3、2×SDS loading buffer (100 mL)
1 M Tris-HCl(pH8.0) 8mL
甘油40 mL
SDS:2g
溴酚蓝0.02 g
Milli-Q 补水至100 mL
(二)谷蛋白的提取(for HPLC)
第一步:提取蛋白(同检测提法)
第二步:蛋白沉淀
1.全蛋白:上清加入丙酮(使丙酮含量为60%,如120μl丙酮,80μl样品),-20℃沉淀过夜,13000rpm,10min,沉淀即为全谷蛋白(HMW+LMW),-20℃保存
2. HMW-GS:上清加入丙酮(使丙酮含量为40%,如80μl丙酮,120μl样品),-20℃沉淀过夜,13000rpm,10min,沉淀即为HMW-GS,-20℃保存
3. LMW-GS: 上清加入丙酮(使丙酮含量为40%,如80μl丙酮,120μl样品),-20℃沉淀过夜,13000rpm,10min,取上清,加入丙酮(使丙酮含量为80%,如400μl丙酮,200μl样品(样品中还含有80μl丙酮)),-20℃沉淀过夜,13000rpm,10min,沉淀即为LMW-GS,-20℃保存
第三步:洗蛋白(乙腈有毒,TFA极易挥发,操作在通风橱进行)
1. 13000rpm,10min,弃上清
a. 用1mL无水乙醇洗涤沉淀,混匀涡旋后8000rpm,5min,弃上清
b. 用500μl 0.07%巯基乙醇的丙酮溶液(7μl到10mL,现用现配)(7μl到10mL,现用现配)洗涤沉淀,混匀涡旋后10000rpm,5min,弃上清
2.室温干燥
3.加50μl溶解液(50%乙腈5mL+0.05%TFA5μl+ Milli-Q 5mL)充分混合,溶解为止
(三)种子清球蛋白的提取(for 2DE)
实验之前要提前准备研钵和液氮;预先称0.025gDTT于10mL离心管中
1.样品的研磨转移(为避免转移过程中蛋白损失太多,蛋白提取液可酌情增加)
称取小麦种子0.5g,用液氮研磨至细粉状(约20min)
将研磨放置于通风橱下,加入50μl的PMSF溶液和1mL蛋白提取液
继续研磨至液体,并将之转移到已有DTT的10mL离心管中
用1.5mL蛋白提取液分2-3次洗涤研钵,并转移到10mL离心管中
2.样品的处理(1)
样品涡旋1min 超声波处理(15次,2S, 2S)4ºC放置2h(间振3-4次)
提前30min将4ºC离心机打开
3.样品的处理(2)
4ºC ,13000rpm,15min
取上清再离心4ºC ,12000rpm,5min
取上清,加1.2倍体积Tris-平衡酚(取下层酚液)
冰浴10min
4ºC ,13000rpm,30min
取上清(千万不要取上来下层的物质),4ºC ,13000rpm,20min
取上清,加5倍体积乙酸铵/甲醇溶液,-20 ºC沉淀(至少4h)
4.样品的洗涤
取出样品,4ºC ,13000rpm,10min
沉淀用0.02g DTT/10mL丙酮悬浮(后者提前放入-20ºC预冷),4ºC ,13000rpm,10min 如此洗涤沉淀3次,并将样品分装2mL的小管
将小管放入超净工作台风干,观察到蛋白表面有裂缝时即可将之放入-20 ºC保存。
所用药品:(最好都是进口药品)
1.种子清球蛋白提取液:100mL
Tris: 0.06057g
KCL: 0.7455 g
EDTA.2Na: 0.1861 g
蔗糖:30 g,
用Milli-Q溶解,并定容为100mL
2. PMSF:0.1742g,溶解并定容至10mL, 分装0.5 mL的小管,-20 ºC保存
3.0.1M乙酸铵/甲醇溶液:0.7708g乙酸铵,用甲醇溶解并定容至100mL
4. Tris-平衡酚(现成的试剂)、丙酮、液氮、DTT
PMSF,苯甲基磺酰氯,phenylmethanesulfonyl fluoride剧毒!严重损害呼吸道粘膜、皮肤
(四)醇溶蛋白的提取(for A-PAGE)
1.种子砸碎,称取30mg,加入300μl 70%乙醇,震荡1h
2.封口,4℃冰箱过夜
3.室温,13000rpm 离心20min,
4.取上清,加入等体积A-PAGE专用loading buffer。
(五)醇溶蛋白的提取(for HPLC)(离心均在室温下进行)
0.5g种子,用液氮充分研磨,称取45mg,加入1mL Milli-Q,震荡5min
13000rpm 5min,弃上清。
沉淀加入1mL40%乙醇,用移液器搅匀,震荡45min